病毒學(xué)第三章病毒分類(lèi)及命名

關(guān)于病毒學(xué)第三章病毒分類(lèi)及命名第一頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日本章重點(diǎn)1.病毒分類(lèi)機(jī)構(gòu)2.病毒分類(lèi)原則3.病毒的分類(lèi)系統(tǒng)第二頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日1961年以前，這個(gè)時(shí)期是各自研究領(lǐng)域的科學(xué)家提出或建立一些分類(lèi)系統(tǒng)，進(jìn)展緩慢，缺乏國(guó)際間的協(xié)作。1962-1966年，建立了國(guó)際病毒學(xué)命名委員會(huì)（InternationalCommitteeonNomenclatureofViruses,ICNV）1966-1970年，Wildy任國(guó)際病毒學(xué)命名委員會(huì)主席期間，組織國(guó)際間協(xié)作，發(fā)表了ICNV的第一次報(bào)告。1971-現(xiàn)在，病毒分類(lèi)與命名的工作得到了鞏固和發(fā)展，國(guó)際病毒學(xué)命名委員會(huì)更名為國(guó)際病毒學(xué)分類(lèi)委員會(huì)（InternationalCommitteeonTaxonomyofViruses,ICTV）第一節(jié)病毒分類(lèi)與命名的沿革第三頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日一、1961年以前

各研究領(lǐng)域獨(dú)立進(jìn)行病毒分類(lèi)與命名（一）植物病毒分類(lèi)

Johnson和Hoggan（1935）：1、病毒的傳播方式及昆蟲(chóng)介體

2、自然的寄主范圍及鑒別寄主

3、在活體外的存活期

4、致死溫度

5、癥狀特點(diǎn)第四頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日（二）動(dòng)物病毒分類(lèi)法第五頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日第六頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日第七頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日第八頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日二、1962-1966年

1966年在莫斯科舉行的第九屆國(guó)際微生物學(xué)代表會(huì)議上，成立國(guó)際病毒命名委員會(huì)（InternationalCommitteeonNomenclatureofViruses;ICNV）。下設(shè)4個(gè)小組委員會(huì)：動(dòng)物病毒小組委員會(huì)植物病毒小組委員會(huì)無(wú)脊椎動(dòng)物病毒小組委員會(huì)噬菌體小組委員會(huì)第九頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日

1963年國(guó)際微生物命名委員會(huì)病毒分會(huì)根據(jù)安德魯斯(Andrewes)提出的分類(lèi)建議提出了新的8項(xiàng)分類(lèi)原則：

①核酸的類(lèi)型、結(jié)構(gòu)和分子量；

②病毒粒子的形狀和大??；

③病毒粒子的結(jié)構(gòu)；

④病毒粒子對(duì)乙醚、氯仿等脂溶劑的敏感性；

⑤血清學(xué)性質(zhì)和抗原關(guān)系；

⑥病毒在細(xì)胞培養(yǎng)上的繁殖特性；

⑦對(duì)除脂溶劑以外的理化因子的敏感性；

⑧流行病學(xué)的特征。

第十頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日三、1966-1970年

1970年8月，在第十屆國(guó)際微生物學(xué)代表大會(huì)上，報(bào)告了國(guó)際病毒命名委員會(huì)的第一次報(bào)告。將當(dāng)時(shí)了解得比較清楚的500多種病毒分為RNA和DNA病毒兩大類(lèi)，描述并劃定了43個(gè)屬及其成員。其中動(dòng)物病毒22個(gè)屬，還確定了兩個(gè)科，乳多空病毒科和細(xì)小病毒科；植物病毒15個(gè)組群；細(xì)菌病毒分成6個(gè)組群。第十一頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日四、1971-現(xiàn)在1973年5月，在倫敦召開(kāi)的ICNV執(zhí)行委員會(huì)上，國(guó)際病毒命名委員會(huì)改為國(guó)際病毒分類(lèi)委員會(huì)（InternationalCommitteeonTaxonomyofViruses,ICTV）。1995年國(guó)際病毒分類(lèi)委員會(huì)第六次報(bào)告中，植物病毒不再采用組、亞組，而統(tǒng)一采用科、屬、種的分類(lèi)系統(tǒng)。同時(shí)將病毒分為3大類(lèi)：DNA病毒、DNA及RNA反轉(zhuǎn)錄病毒、RNA病毒。第十二頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日2005年，國(guó)際病毒分類(lèi)委員會(huì)發(fā)布了第八次病毒分類(lèi)報(bào)告。在這個(gè)長(zhǎng)達(dá)1259頁(yè)的報(bào)告中，將目前ICTV所承認(rèn)的5450多個(gè)病毒歸屬為3個(gè)目、73個(gè)科、11個(gè)亞科、289個(gè)屬、1950多個(gè)種。在亞病毒感染因子下設(shè)類(lèi)病毒、衛(wèi)星體和朊毒，其中類(lèi)病毒有2個(gè)科、7個(gè)屬；衛(wèi)星病毒有2個(gè)亞組，衛(wèi)星核酸有3個(gè)亞組；朊毒分為哺乳動(dòng)物朊毒和真菌朊毒。第十三頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日

第八次報(bào)告的特點(diǎn):1、進(jìn)一步明確了“種”作為病毒分類(lèi)系統(tǒng)中的最小分類(lèi)階元，在每一個(gè)確定種下面列出了至少一個(gè)、至多幾十個(gè)不同的分離物以及它們?cè)贕enBank上的登錄號(hào)。2、增加了許多反映病毒基因序列同源性關(guān)系的系統(tǒng)樹(shù)圖。3、將原子分辨率的粒子三維結(jié)構(gòu)插入到相應(yīng)的科或?qū)僦?，使讀者對(duì)病毒粒子空間結(jié)構(gòu)有更詳細(xì)的了解。第十四頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日

有關(guān)病毒分類(lèi)的論文及信息在ICTV的官方期刊“Archives[a:kaivz]

ofVirology”發(fā)表，1990年前“Intervirology”是其官方期刊。

第十五頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日第二節(jié)病毒的命名（一）一般規(guī)則（1）病毒分類(lèi)和命名應(yīng)該是國(guó)際性的，并且普遍適用于所有的病毒。

（2）國(guó)際病毒分類(lèi)系統(tǒng)采用目（order）、科(family)、亞科(subfamily)、屬(genus)、種(species)、分類(lèi)階元。

（3）ICTV不負(fù)責(zé)病毒種以下的分類(lèi)和命名，病毒種以下的血清型、基因型、毒力株、變異株和分離株的名稱(chēng)由公認(rèn)的國(guó)際專(zhuān)家小組確定。第十六頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日

（4）人工產(chǎn)生的病毒和實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建的雜種病毒在病毒分類(lèi)上不予考慮，其分類(lèi)由公認(rèn)的國(guó)際專(zhuān)家小組負(fù)責(zé)。

（5）只有在病毒代表種的特性得到了充分了解和在公開(kāi)出版物上進(jìn)行過(guò)描述，才能確定建立一個(gè)分類(lèi)階元，以便與其他類(lèi)似的分類(lèi)階元相區(qū)別。

（6）當(dāng)病毒有明確的科、而分屬未確定時(shí)，這一病毒種在分類(lèi)學(xué)上稱(chēng)為該科的未確定種（unassignedspecies）。

（7）與規(guī)則2各分類(lèi)階元相關(guān)聯(lián)，并得到ICTV批準(zhǔn)的名稱(chēng)是唯一可以接受的。第十七頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日（二）關(guān)于分類(lèi)單元的命名規(guī)定在分類(lèi)單元和病毒的命名中不遵循優(yōu)先律。在提出新的分類(lèi)單元時(shí)不使用人名。在提出新名稱(chēng)時(shí)，不使用下標(biāo)、上標(biāo)、連字符、斜線(xiàn)和希臘字母。新名稱(chēng)不應(yīng)與已通過(guò)的名稱(chēng)重復(fù)。病毒名稱(chēng)由ICTV認(rèn)定，其命名與細(xì)菌不同，不再采用拉丁文雙名法，而是采用英文或英語(yǔ)化的拉丁文，只用單名。目、科、亞科、屬分別用拉丁文后綴“-virales”、“-viridae”、“-virinae”和“-virus”，并采用斜體。第十八頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日（三）關(guān)于種的規(guī)定一個(gè)病毒種應(yīng)是一類(lèi)具有多種共同特征的病毒，并組成一個(gè)正在復(fù)制的世代譜系，且在生態(tài)位中占有特定的位置。1、病毒種應(yīng)當(dāng)是群體，是類(lèi)別。2、病毒種所共有的特征不是一種而是多種。3、病毒種是演化譜系中某時(shí)期的一分子。4、病毒種應(yīng)當(dāng)占據(jù)某特定生態(tài)位。第十九頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日一新種不能確定，或不能將這一新種確定到已設(shè)立的屬中時(shí)，新種將作為暫定種。種名必須賦予種恰如其分的鑒別特征。第二十頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日（四）關(guān)于屬的規(guī)則屬是具有某些共同特征的種。屬名應(yīng)是一個(gè)以“---virus”結(jié)尾的單詞。Lyssavirus（狂犬病毒屬）T4likeviruses（T4樣病毒屬）通過(guò)一個(gè)新屬名的同時(shí)，必須承認(rèn)一個(gè)代表種。第二十一頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日鑒定一個(gè)種的歸屬時(shí)，有用的特征基因組序列相關(guān)性天然寄主范圍細(xì)胞和組織的趨向性致病性和細(xì)胞病理學(xué)傳播方法病毒蛋白的抗原性第二十二頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日（五）關(guān)于亞科的規(guī)則亞科是一群具有某些共同特征的屬，這一分類(lèi)單元只在需要解決復(fù)雜等級(jí)結(jié)構(gòu)問(wèn)題時(shí)才使用亞科。亞科名應(yīng)是一個(gè)以“---virinae”結(jié)尾的單詞。Parvovirinae（細(xì)小病毒亞科）第二十三頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日（六）關(guān)于科的規(guī)則科是一群具有某些共同特征的屬（不管這些屬是否組成了亞科）科名應(yīng)是一個(gè)以“---viridae”結(jié)尾的單詞。Parvoviridae（細(xì)小病毒科）第二十四頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日區(qū)分屬或科毒粒形態(tài)基因組結(jié)構(gòu)復(fù)制方法結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白的數(shù)目和大小第二十五頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日（七）關(guān)于目的規(guī)則目是一群具有某些共同特征的科。ICTV對(duì)病毒目的建立持謹(jǐn)慎態(tài)度，僅限于已有足夠的證據(jù)說(shuō)明其系統(tǒng)演化的相關(guān)性的病毒科。目名應(yīng)是一個(gè)以“---virales”結(jié)尾的單詞。有尾噬菌體目（Caudovirales）單分子負(fù)鏈RNA病毒目（Mononegavirales）成套病毒目（Nidovirales）第二十六頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日（八）關(guān)于亞病毒因子的規(guī)則

類(lèi)病毒有關(guān)病毒的分類(lèi)規(guī)則，適用于類(lèi)病毒的分類(lèi)。類(lèi)病毒的分類(lèi)單元的規(guī)范詞尾是：種“viroid”、屬“viroid”、亞科“viroinae”、科“viroidae”。其他亞病毒因子衛(wèi)星體和朊病毒不按病毒分類(lèi)，采用任意分類(lèi)（arbitraryclassification）

，這種任意分類(lèi)對(duì)專(zhuān)門(mén)領(lǐng)域的研究工作者似乎是有用的。第二十七頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日（九）關(guān)于書(shū)寫(xiě)的規(guī)則在規(guī)范的分類(lèi)學(xué)慣例，病毒目、科、亞科、屬的認(rèn)可名稱(chēng)，均用斜體印刷，名稱(chēng)的第一個(gè)字母需大寫(xiě)。Adenoviridae(腺病毒科)種的名稱(chēng)用斜體印刷，第一個(gè)詞的首字母需大寫(xiě)，除專(zhuān)有名詞或?qū)Ｓ忻~的一部分之外，其他詞首字母一律不大寫(xiě)。Humanimmunodeficiencyvirus1(人免疫缺陷病毒1型)第二十八頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日規(guī)范的慣例，各分類(lèi)單元正式的描述是

…Reovirideae(科),…Phytoreovirus(屬),…Woundtumorvirus（種）呼腸孤病毒科，植物呼腸孤病毒屬，傷瘤病毒未通過(guò)或暫定的名稱(chēng)均印成標(biāo)準(zhǔn)體，并在西文中綴以-like字樣。T1-likeviruses(T1樣噬菌體屬)第二十九頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日第三節(jié)病毒的分類(lèi)原理及依據(jù)穩(wěn)定性：是指病毒名稱(chēng)及其隸屬關(guān)系一旦確定下來(lái)，就應(yīng)該盡可能的保留。

實(shí)用性：是指病毒分類(lèi)體制應(yīng)該對(duì)病毒學(xué)研究領(lǐng)域是有用的。

認(rèn)可性：是指病毒分類(lèi)階元和名稱(chēng)應(yīng)該為病毒學(xué)研究者樂(lè)意接受和使用，所以，認(rèn)可性也是實(shí)用性的必然結(jié)果。

靈活性：是指病毒分類(lèi)階元可以依據(jù)某些新發(fā)現(xiàn)而進(jìn)行重新修訂和再確定。第三十頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日

依據(jù)：主要以病毒粒子特性、抗原性質(zhì)和病毒生物學(xué)特性等作為依據(jù)。病毒粒子特性：①病毒形態(tài)：如大小、形狀、包膜和包膜突起的有無(wú)，衣殼結(jié)構(gòu)及其對(duì)稱(chēng)性;②病毒生理生化和物理性質(zhì)：如分子量，沉降系數(shù)，浮力密度，病毒粒子在不同pH、溫度、Mg2+、Mn2+、變性劑、輻射中的穩(wěn)定性；③病毒基因組，如基因組大小、核酸類(lèi)型、單雙鏈、線(xiàn)狀或環(huán)狀，正負(fù)鏈，G+C所占的比例、核苷酸序列等；第三十一頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日④病毒蛋白，如結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白的數(shù)量、大小以及功能和活性，氨基酸序列等⑤病毒脂類(lèi)含量和特性；⑥碳水化合物含量和特性；⑦病毒基因組組成和復(fù)制。第三十二頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日病毒抗原性質(zhì)：

包括病毒血清學(xué)性質(zhì)與其抗原的關(guān)系。病毒生物學(xué)特性：

包括病毒天然的宿主范圍；

病毒在自然狀態(tài)下的傳播與媒介體的關(guān)系；

病毒的地理分布，致病機(jī)理，組織嗜親性；

病毒引起的病理和組織病理學(xué)特點(diǎn)。第三十三頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日第四節(jié)病毒分類(lèi)系統(tǒng)國(guó)際病毒分類(lèi)委員會(huì)第七次報(bào)告（1999）認(rèn)可病毒4000種，設(shè)有3個(gè)病毒目。第三十四頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日將所有已知的病毒根據(jù)核酸類(lèi)型分為：DNA病毒——單股DNA病毒，DNA病毒——雙股DNA病毒，DNA與RNA反轉(zhuǎn)錄病毒，RNA病毒——雙股RNA病毒，RNA病毒——正單鏈RNA病毒，RNA病毒——負(fù)單鏈RNA病毒，裸露RNA病毒（真菌病毒，+ssRNA與其編碼的RNA依賴(lài)的RNA聚合酶結(jié)合在一起，存在于細(xì)胞質(zhì)中）類(lèi)病毒（亞病毒因子）第三十五頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日第三十六頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日第三十七頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日第三十八頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日第三十九頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日第8次報(bào)告動(dòng)物病毒新增4個(gè)科線(xiàn)頭病毒科（Nimaviridae）白斑病毒屬（Whispovirus）白斑綜合征病毒Ⅰ型（WhitespotsyndranevirusⅠ

）雙順?lè)醋硬《究疲―icistroviridae）桃拉綜合征病毒（TSV）桿狀套病毒科（Romviridae）黃頭病毒（YHV）蕪菁黃花葉病毒科（Tymoviridae）第四十頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日第四十一頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日第四十二頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月28日第四十三頁(yè)，共六十二頁(yè)，2022年，8月2