第二章細(xì)胞內(nèi)生物分子相互作用概述

第二章細(xì)胞內(nèi)生物分子

相互作用概述

蛋白質(zhì)——氨基酸核酸——核苷酸多糖——單糖脂類(lèi)——單脂無(wú)論是原核生物還是真核生物，對(duì)一個(gè)生命個(gè)體來(lái)講，均由蛋白質(zhì)、核酸、糖類(lèi)、脂類(lèi)等生物大分子和一些小分子化合物及無(wú)機(jī)鹽等這些化學(xué)成分共同組成。生物大分子生物大分子的功能：生物體是由生物大分子等有機(jī)物構(gòu)成的；生物體能與環(huán)境不斷地交換物質(zhì)與能量；所有生物大分子共同存在于細(xì)胞環(huán)境中；生物體能進(jìn)行自我更新。細(xì)胞細(xì)胞器官（真核細(xì)胞）超大分子組裝體生物大分子構(gòu)件分子代謝物前體元素CHONPSH2OCO2NH3

丙酮酸檸檬酸蘋(píng)果酸草酰乙酸氨基酸核苷酸單糖脂肪酸蛋白質(zhì)核酸多糖脂核糖體膜染色質(zhì)微管核線(xiàn)粒體葉綠體高爾基體生物物質(zhì)的組成層次核酸：是核苷酸的多聚體DNA（脫氧核糖核酸）：由脫氧核糖、堿基（A、G、C、T）、磷酸形成的5’-脫氧核苷酸構(gòu)成.RNA（核糖核酸）：由核糖、堿基（A、G、C、U）、磷酸形成的5’-核苷酸構(gòu)成。在DNA和RNA分子中，核苷酸之間以3’，5’-磷酸二酯鍵連接形成長(zhǎng)鏈大分子。核酸分子都有游離的5’端和游離3’端。磷酸二酯鍵：一個(gè)核苷酸的5’-磷酸和另一個(gè)核苷酸的3’-OH形成磷酸酯鍵而共價(jià)連接第一節(jié)生物大分子概述55333-5磷酸二酯鍵基本結(jié)構(gòu)——雙螺旋結(jié)構(gòu)（基本要點(diǎn)）：

A：大溝，小溝B：堿基配對(duì)：A=T，GCC：反向平行：暗示DNA復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的分子機(jī)制高級(jí)結(jié)構(gòu)：

單核苷酸形成的二級(jí)結(jié)構(gòu)：發(fā)夾結(jié)構(gòu)

反向重復(fù)序列（回文序列）

蛋白質(zhì)：是氨基酸以肽鍵連接而成的聚合體一級(jí)結(jié)構(gòu)

氨基酸的a-羧基與下一個(gè)氨基酸a-氨基縮合形成肽鍵，從N-端到C-端的氨基酸順序即為多肽的一級(jí)結(jié)構(gòu)。二級(jí)結(jié)構(gòu)

C—N鍵具有部分雙鍵性質(zhì)，使得C=O與N=H四原子形成剛性的肽鍵單元平面，肽鍵單元間以氫鍵相連，多肽鏈在空間折疊形成二級(jí)結(jié)構(gòu)，常見(jiàn)的有a-螺旋和β-折疊。三級(jí)結(jié)構(gòu)

二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)一步折疊形成多肽的三級(jí)結(jié)構(gòu)。親水基團(tuán)位于蛋白質(zhì)外側(cè)，疏水基團(tuán)埋在內(nèi)側(cè)，氫鍵、鹽鍵、范德華力和疏水力維持結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定。分子伴侶幫助蛋白質(zhì)正確折疊。四級(jí)結(jié)構(gòu)

由多條多肽鏈（亞基）構(gòu)成的寡聚蛋白，穩(wěn)定三級(jí)結(jié)構(gòu)的力量可將亞基維系在一起構(gòu)成蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)。血紅蛋白結(jié)構(gòu)圖多糖：（是由多個(gè)單糖分子縮合而成的）是糖或糖的衍生物的多聚體，許多碳原子之間產(chǎn)生共價(jià)鍵所形成的糖單位與兩個(gè)以上的其他糖單位連接在一起形成大分子。脂類(lèi)：是一大類(lèi)化學(xué)結(jié)構(gòu)上不同的物質(zhì)，如脂肪、脂肪酸、磷脂、鞘磷脂和膽固醇等，但他們都具有不溶于水，易溶于乙醚、氯仿等脂溶性的共同特征。生物大分子間相互作用的化學(xué)力生物大分子的基本結(jié)構(gòu)通過(guò)共價(jià)鍵聚合而成，而其生物學(xué)功能是通過(guò)相互作用、協(xié)調(diào)進(jìn)行而實(shí)現(xiàn)的。生物大分子的相互作用主要表現(xiàn)在：DNA與蛋白質(zhì)之間；RNA與蛋白質(zhì)之間；蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)之間。作用力有：氫鍵疏水相互作用

離子鍵范德化引力二硫鍵配位鍵生物大分子的自我組裝生物大分子的自我組裝指線(xiàn)性多肽鏈和核酸鏈伸長(zhǎng)的線(xiàn)性結(jié)構(gòu)，依照一定的方式折疊或盤(pán)繞成有序的形態(tài)結(jié)構(gòu)，并通過(guò)次級(jí)鍵維持該結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定，或進(jìn)一步折疊并盤(pán)繞形成更高級(jí)結(jié)構(gòu)，即超二級(jí)和三級(jí)空間結(jié)構(gòu)，從而表現(xiàn)出自身的功能，同時(shí)這種分子還可以作為亞單位和亞分子和其他類(lèi)生物分子通過(guò)次級(jí)鍵形成更高級(jí)結(jié)構(gòu)即四級(jí)結(jié)構(gòu)，如血紅蛋白，多酶復(fù)合物，核酸與蛋白質(zhì)形成的復(fù)合物等。生物大分子的自我組裝多肽鏈、核酸鏈折疊盤(pán)繞二級(jí)結(jié)構(gòu)折疊盤(pán)繞三級(jí)結(jié)構(gòu)/超二級(jí)結(jié)構(gòu)分子內(nèi)組合生物類(lèi)分子四級(jí)結(jié)構(gòu)（血紅蛋白）功能類(lèi)似的分子的組裝——cAMP-CAP與DNA序

列識(shí)別并結(jié)合同類(lèi)生物分子的組裝——微管與微絲異類(lèi)生物分子組裝——蛋白質(zhì)與核酸（核糖體）原纖維煙草花葉病毒粒子（TMV）的自我裝配煙草花葉病毒在正常生理?xiàng)l件下，34個(gè)蛋白質(zhì)亞基聚集形成20S雙盤(pán)結(jié)構(gòu)，RNA嵌入雙盤(pán)結(jié)構(gòu)，形成裝配起始復(fù)合物，后蛋白質(zhì)亞基才逐個(gè)加入，完成RNA的包裝，最后形成病毒顆粒。生物大分子的相互作用核酸與蛋白質(zhì)的相互作用染色質(zhì)：是DNA與小分子的堿性蛋白質(zhì)組成的，組蛋白使DNA在染色體中緊密堆積在一起，并中和DNA磷酸-戊糖骨架負(fù)電荷的排斥力。阻遏蛋白Cro對(duì)λ噬菌體DNA的結(jié)合：Cro蛋白是大腸桿菌噬菌體產(chǎn)生的阻遏蛋白，它可以識(shí)別并結(jié)合DNA上一段專(zhuān)一序列，是一個(gè)重要的調(diào)節(jié)蛋白，并且二者的結(jié)合是由于它們的結(jié)構(gòu)特征，同時(shí)Cro蛋白的結(jié)合保護(hù)了其他蛋白質(zhì)與DNA作用的特定位點(diǎn)。Cro蛋白以二聚體形式與DNA螺旋結(jié)合ε.coli的CAP蛋白與ε.coliDNA的某一調(diào)控位點(diǎn)相結(jié)合：

大部分被特異性蛋白識(shí)別結(jié)合的序列都具有一定的對(duì)稱(chēng)性，而且許多順序特異性的DNA結(jié)合蛋白是多亞基蛋白，它們形成對(duì)稱(chēng)性的排列，這種排列有助于識(shí)別對(duì)稱(chēng)序列；另外蛋白質(zhì)的α螺旋通常位于DNA螺旋的大溝中，是DNA-蛋白質(zhì)相互作用的一個(gè)普遍特征。蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)的相互作用—多亞基形式的組合多亞基體系具有的特點(diǎn)：可減少蛋白質(zhì)合成過(guò)程中隨機(jī)錯(cuò)誤對(duì)蛋白質(zhì)活性的影響對(duì)DNA的利用來(lái)說(shuō)，多亞基較為經(jīng)濟(jì)多亞基蛋白質(zhì)的活性能夠很有效和很迅速的被開(kāi)啟和關(guān)閉—酶的活性調(diào)節(jié)糖與蛋白質(zhì)的相互作用糖蛋白：是蛋白質(zhì)與寡糖鏈通過(guò)糖苷鍵連接成的產(chǎn)物，寡糖鏈由多種單糖構(gòu)成，每一個(gè)單糖具有半縮醛羥基和一個(gè)以上的醇羥基，單糖間可通過(guò)不同苷鍵連接。糖蛋白中的糖肽連接類(lèi)型：在糖蛋白中僅有一種糖殘基與天冬酰胺相連，即N-乙酰--D-葡糖胺，生成的鍵是4-N-(2-乙酰氨基-2-脫氧--D-吡喃葡糖基)-L-天冬酰胺，這種連接方式有時(shí)稱(chēng)為N（或Asn）連接型糖鏈或N-聚糖。糖基或糖鏈的還原端與蛋白質(zhì)肽鏈中的Ser、Thr或羥賴(lài)氨酸羥基中的氧原子相連稱(chēng)為O-連接糖鏈。蛋白聚糖：主要存在于人或者動(dòng)物的皮膚、軟骨、角膜等部位的結(jié)締組織中。軟骨蛋白聚糖是由硫酸角質(zhì)素和硫酸軟骨素與核心蛋白共價(jià)結(jié)合在一起形成蛋白聚糖單體，由蛋白聚糖單體、連接蛋白和透明質(zhì)酸形成蛋白聚糖聚集體。脂與蛋白質(zhì)的相互作用脂蛋白是由脂質(zhì)和蛋白質(zhì)相互作用的復(fù)合物，脂與蛋白質(zhì)的結(jié)合可以通過(guò)蛋白質(zhì)Ser、Thr上的羥基與脂質(zhì)上羧基形成酯鍵，或蛋白質(zhì)上的-SH與脂質(zhì)上的羧基形成硫酯鍵。血漿酯蛋白結(jié)構(gòu)研究生物大分子的方法離心技術(shù)分離生物