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第四、五、六章遺傳信息傳遞4.1
DNA復(fù)制概述4.2原核生物和真核生物DNA的復(fù)制特點(diǎn)4.3
DNA的損傷與修復(fù)4.4基因突變4.5DNA重組4.6
DNA的轉(zhuǎn)座4.7真核生物中的轉(zhuǎn)座子4.1DNA復(fù)制概述原核生物每個(gè)細(xì)胞只含有一條染色體;真核生物每個(gè)細(xì)胞常含有多條染色體。在細(xì)胞增殖周期的一定階段,整個(gè)染色體組都將發(fā)生精確的復(fù)制,隨后以染色體為單位把復(fù)制的基因組通過(guò)細(xì)胞分裂分配到兩個(gè)子代細(xì)胞中去。染色體DNA的復(fù)制與細(xì)胞分裂之間存在著密切的聯(lián)系。關(guān)于染色體復(fù)制與細(xì)胞分裂的協(xié)同作用,目前有兩個(gè)假說(shuō)。一個(gè)假說(shuō)認(rèn)為,細(xì)胞開(kāi)始分裂前,染色體復(fù)制一圈后,細(xì)胞等了一段時(shí)間,也許在染色體復(fù)制過(guò)程中產(chǎn)生某種信號(hào),激發(fā)了細(xì)胞分裂,但這種信號(hào)至今也沒(méi)有得到證明;第二種假說(shuō)認(rèn)為,染色體在復(fù)制一圈后細(xì)胞迅速開(kāi)始分裂,如果染色體在復(fù)制過(guò)程中出現(xiàn)了某種差錯(cuò),復(fù)制就要延遲,在染色體完成復(fù)制以前,細(xì)胞不會(huì)分裂。按照第二種假說(shuō),只要染色體復(fù)制成功,兩個(gè)子細(xì)胞就應(yīng)該各獲得一條完整的染色體DNA。染色體外的遺傳因子,包括細(xì)菌的質(zhì)粒、真核生物的細(xì)胞器以及細(xì)胞內(nèi)共生或寄生的生物DNA。它們的復(fù)制或是受染色體復(fù)制的控制,而與染色體復(fù)制同步;或是不受其控制,在細(xì)胞增殖周期中隨時(shí)進(jìn)行復(fù)制。質(zhì)粒在細(xì)胞內(nèi)的復(fù)制一般有兩種類(lèi)型:控制型(Stringentcontrol)和松馳控制型(Relaxedcontrol)。前者只在細(xì)胞周期的一定階段進(jìn)行復(fù)制,當(dāng)染色體不復(fù)制時(shí),它也不能復(fù)制,通常每個(gè)細(xì)胞內(nèi)只含有1個(gè)或幾個(gè)質(zhì)粒分子,如F因子。后者的質(zhì)粒在整個(gè)細(xì)胞周期中隨時(shí)可以復(fù)制,在每個(gè)細(xì)胞中有許多拷貝,一般在20個(gè)以上,如ColE1質(zhì)粒。在使用蛋白質(zhì)合成抑制劑-氯霉素時(shí),細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)合成、染色體DNA復(fù)制和細(xì)胞分裂均受到抑制。緊密型質(zhì)粒復(fù)制停止,而松馳型質(zhì)粒繼續(xù)復(fù)制,質(zhì)??截悢?shù)可由原來(lái)20多個(gè)擴(kuò)增至1000-3000個(gè),此時(shí)質(zhì)粒DNA占總DNA的含量可由原來(lái)的2%增加至40-50%。同一復(fù)制系統(tǒng)的不同質(zhì)粒不能在同一宿主細(xì)胞中共同存在,當(dāng)兩種質(zhì)粒同時(shí)導(dǎo)入同一細(xì)胞時(shí),它們?cè)趶?fù)制及隨后分配到子細(xì)胞的過(guò)程中彼此競(jìng)爭(zhēng)。在一些細(xì)胞中,一種質(zhì)粒占優(yōu)勢(shì),而在另一些細(xì)胞中另一種質(zhì)粒卻占上風(fēng)。當(dāng)細(xì)胞生長(zhǎng)幾代后,占少數(shù)的質(zhì)粒將會(huì)丟失,因而在細(xì)胞后代中只有兩種質(zhì)粒的一種,這種現(xiàn)象稱(chēng)質(zhì)粒的不相容性(Incompatibility)。但利用不同復(fù)制系統(tǒng)的質(zhì)粒則可以穩(wěn)定地共存于同一宿主細(xì)胞中。DNA是遺傳信息的載體,在合成DNA時(shí),決定其結(jié)構(gòu)特異性的遺傳信息只能來(lái)自其本身,因此,必須以原來(lái)存在的分子模板來(lái)合成新的分子。生命的遺傳實(shí)際上是染色體DNA自我復(fù)制的結(jié)果。染色體DNA的自我復(fù)制是半保留復(fù)制,以親代DNA分子為模板合成子代DNA。細(xì)胞分裂時(shí),通過(guò)DNA準(zhǔn)確地自我復(fù)制(self-replication),親代細(xì)胞所含的遺傳信息就原原本本地傳送到子代細(xì)胞。親代DNA以自身分子為模板合成新的新的互補(bǔ)鏈,每個(gè)子代分子的一條鏈來(lái)自親代DNA,另一條鏈則是新合成的,這種方式稱(chēng)為半保留復(fù)制。4.2原核生物和真核生物DNA的復(fù)制特點(diǎn)4.2.1原核生物DNA的復(fù)制過(guò)程4.2.2原核與真核生物DNA的復(fù)制異同4.3DNA的損傷與修復(fù)由于染色體DNA在生命過(guò)程中占有至高無(wú)上的地位,DNA復(fù)制的準(zhǔn)確性以及DNA日常保養(yǎng)中的損傷修復(fù)有著特別重要的意義。4.3.1DNA損傷:指在生命過(guò)程中DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)發(fā)生的任何改變。單個(gè)堿基改變雙螺旋結(jié)構(gòu)的異常扭曲(鏈內(nèi)T二聚體、單鏈缺口、凸起等)4.3.1.1DNA分子自發(fā)性損傷
復(fù)制過(guò)程中的損傷指堿基配對(duì)時(shí)產(chǎn)生的誤差,經(jīng)過(guò)DNA聚合酶“矯正”和單鏈結(jié)合蛋白等綜合校對(duì)因素作用下仍未被矯正的DNA的損傷?;プ儺悩?gòu)指DNA分子中四種堿基自發(fā)地使氫原子改變位置,產(chǎn)生互變異構(gòu)體,進(jìn)一步使堿基配對(duì)的方式發(fā)生改變,這樣在復(fù)制后的子鏈上就可能出現(xiàn)錯(cuò)誤。A------A’------CA—T就變成G—CA—I—C(非T)下一輪C—G導(dǎo)致AT—GC引起突變C—U–A(非G)下一輪A—T導(dǎo)致GC—AT引起突變
脫氨作用亞硝酸鹽C—U–A(非G)下一輪A—T導(dǎo)致GC—AT引起突變
活性氧引起的誘變活性氧為氧分子電子數(shù)大于O2的O2可與
C、A配對(duì),DNA聚合酶不能矯正其錯(cuò)誤,造成GC—TA。4.3.1.2物理因素引起的損傷
紫外線(UV)照射引起的DNA損傷主要是形成嘧啶二聚體。
ATTCGAGTTAGCTAAGCTCAATCG4.3.1.3化學(xué)因素引起的損傷烷化劑對(duì)DNA的損傷當(dāng)烷化劑和DNA作用時(shí),可以將烷基加到核酸的堿基上去。結(jié)果是形成鏈內(nèi)或鏈間鉸鏈。
堿基類(lèi)似物對(duì)DNA的損傷是一類(lèi)結(jié)構(gòu)與堿基相似的人工化合物,5-BU與U結(jié)構(gòu)類(lèi)似,酮式能與A配對(duì),烯醇式能與G配對(duì)。結(jié)果引起A-T----G-C轉(zhuǎn)變。4.3.2DNA的修復(fù)修復(fù)是生物機(jī)體細(xì)胞在長(zhǎng)期進(jìn)化中形成的一種保護(hù)功能,在遺傳信息傳遞的穩(wěn)定性方面具有重要作用。切除修復(fù)錯(cuò)配修復(fù)直接修復(fù)重組修復(fù)易錯(cuò)修復(fù)和SOS應(yīng)急反應(yīng)4.3.2.1切除修復(fù)4.3.2.1.1堿基切除修復(fù)所有細(xì)胞中都帶有能識(shí)別受損核酸位點(diǎn)的*糖苷水解酶,它能特異性切除受損核苷酸上的N-β-糖苷鍵,在DNA鏈上形成去嘌呤或去嘧啶位點(diǎn)(AP位點(diǎn))。DNA分子中一旦產(chǎn)生了AP位點(diǎn),*AP核酸內(nèi)切酶就會(huì)把受損核苷酸的糖苷-磷酸鍵切開(kāi),并移去包括AP位點(diǎn)核苷酸在內(nèi)的小片段DNA,由DNA聚合酶I合成新的片段,最終由*DNA連接酶把兩者連成新的被修復(fù)的DNA鏈→堿基切除修復(fù)(base-excisionrepair)。4.3.2.1.1核苷酸切除修復(fù)當(dāng)DNA鏈上相應(yīng)位置的核苷酸發(fā)生損傷,導(dǎo)致雙鏈之間無(wú)法形成氫鍵,則由核苷酸切除修復(fù)(nucleotide-excisionrepair)系統(tǒng)負(fù)責(zé)修復(fù)。損傷發(fā)生后,首先由DNA切割酶(exci-nuclease)在己損傷的核苷酸5’和3’位分別切開(kāi)磷酸糖苷鍵,產(chǎn)生一個(gè)由12~13個(gè)核苷酸(原核生物)或27~29個(gè)核苷酸(人類(lèi)或其他高等真核生物)的小片段,移去小片段后由DNA聚合酶Ⅰ(原核)或ε(真核)合成新的片段,并由DNA連接酶完成修復(fù)中的最后一道工序。4.3.2.2錯(cuò)配修復(fù)(mismatchrepair)錯(cuò)配修復(fù)可以將DNA子鏈中的錯(cuò)配幾乎完全能被修復(fù)。該系統(tǒng)識(shí)別母鏈靠Dam甲基化酶,它能使位于5’GATC序列中A的N6位甲基化。一旦復(fù)制叉通過(guò)復(fù)制起始位點(diǎn),母鏈就會(huì)在開(kāi)始DNA合成前的一小點(diǎn)時(shí)間(幾秒鐘至幾分鐘)內(nèi)被甲基化。此后,只要兩條DNA鏈上堿基配對(duì)出現(xiàn)錯(cuò)誤,錯(cuò)配修復(fù)系統(tǒng)就會(huì)根據(jù)“保存母鏈,修正子鏈”的原則,找出錯(cuò)誤堿基所在的DNA鏈,并在對(duì)應(yīng)于母鏈甲基化腺苷酸上游G的5'位置切開(kāi)子鏈。4.3.2.3直接修復(fù)(directrepair)生物體內(nèi)還存在多種DNA損傷以后直接修復(fù)(directrepair),不需要切除堿基或核苷酸的機(jī)制。兩個(gè)例子:1、在DNA光解酶(Photolyase)的作用下把在光下或經(jīng)紫外光照射形成的環(huán)丁烷胸腺嘧啶二體及6-4光化物(6-4photoproduct)還原成為單體的過(guò)程。2、生物體內(nèi)還廣泛存在著使06-甲基鳥(niǎo)嘌呤脫甲基化的甲基轉(zhuǎn)移酶,以防止形成G-T配對(duì)。4.3.2.4重組修復(fù)(recombinationrepair)
切除修復(fù)發(fā)生在下一輪DNA復(fù)制前,又稱(chēng)復(fù)制前修復(fù)。肌體細(xì)胞對(duì)在復(fù)制起始時(shí)尚未修復(fù)的DNA損傷部位可以先復(fù)制再修復(fù),這種方式稱(chēng)為重組修復(fù)。
這個(gè)過(guò)程發(fā)生在復(fù)制后,又稱(chēng)復(fù)制后修復(fù)。復(fù)制重組再合成重組修復(fù)機(jī)制的缺陷,有可能導(dǎo)致腫瘤發(fā)生。已經(jīng)發(fā)現(xiàn),婦女Brca1和Brca2兩個(gè)基因如果有缺陷,發(fā)生乳腺癌的概率為80%。
4.3.2.5易錯(cuò)修復(fù)和SOS應(yīng)急反應(yīng)許多能造成DNA損傷或抑制DNA復(fù)制的過(guò)程能引起一系列復(fù)雜的誘導(dǎo)效應(yīng),這種效應(yīng)稱(chēng)為應(yīng)急反應(yīng)(SOSresponse)。SOS包括誘導(dǎo)DNA損傷修復(fù)、誘變效應(yīng)、細(xì)胞分裂的抑制以及溶源性細(xì)菌釋放噬菌體等,細(xì)胞癌變也與SOS反應(yīng)有關(guān)。SOS反應(yīng)是細(xì)胞DNA受到損傷或復(fù)制系統(tǒng)受到抑制的緊急情況下,細(xì)胞為求生存而產(chǎn)生的一種應(yīng)急措施。SOS反應(yīng)誘導(dǎo)的修復(fù)系統(tǒng)包括:避免差錯(cuò)的修復(fù)(errorfreerepair)和易產(chǎn)生差錯(cuò)的修復(fù)(errorpronerepair)兩類(lèi)。錯(cuò)配修復(fù)、直接修復(fù)、切除修復(fù)和重組修復(fù)都能夠識(shí)別DNA的損傷部位或錯(cuò)配堿基而加以消除,在這些修復(fù)過(guò)程中不引入錯(cuò)誤堿基,屬于避免差錯(cuò)的修復(fù)。由于SOS反應(yīng)還能誘導(dǎo)產(chǎn)生缺乏校對(duì)功能的DNA聚合酶,所以在DNA鏈的損傷部位即使出現(xiàn)不配對(duì)堿基,復(fù)制也能繼續(xù)進(jìn)行,以保證細(xì)胞的存活,叫易產(chǎn)差錯(cuò)的修復(fù)。SOS反應(yīng)可誘導(dǎo)產(chǎn)生DNA聚合酶Ⅳ和Ⅴ,它們不具有3’核酸外切酶的校正功能,但在DNA鏈的損傷部位即使出現(xiàn)不配對(duì)的堿基,仍然能催化核苷酸的聚合,使復(fù)制繼續(xù)進(jìn)行,這種情況下允許錯(cuò)配可增加細(xì)胞存活的機(jī)會(huì)。SOS反應(yīng)可使細(xì)菌細(xì)胞的分裂受到抑制,結(jié)果形成絲狀體。其生理意義是在DNA復(fù)制受到阻礙的情況下避免因細(xì)胞分裂而產(chǎn)生不含DNA的細(xì)胞,或者使細(xì)胞有更多進(jìn)行重組和修復(fù)的機(jī)會(huì)。SOS反應(yīng)廣泛存在于原核和真核生物,它是生物體在不利環(huán)境中求得生存的一種基本功能。主要包括兩方面的內(nèi)容:①DNA的修復(fù);②導(dǎo)致變異。4.4基因突變作為遺傳物質(zhì)的DNA有三個(gè)主要功能:①通過(guò)復(fù)制和分裂將遺傳物質(zhì)由親代傳給子代;②通過(guò)轉(zhuǎn)錄使遺傳信息在子代得以表達(dá);③通過(guò)變異在自然選擇中獲得新的遺傳信息。基因突變(mutation):是在基因內(nèi)的遺傳物質(zhì)發(fā)生可遺傳的結(jié)構(gòu)和數(shù)量的變化,通常產(chǎn)生一定的表型。廣義的突變包括染色體畸變和基因突變。遺傳重組也導(dǎo)致可遺傳的變異,因此,染色體畸變、基因突變、遺傳重組是可遺傳變異的基礎(chǔ)。4.4.1基因突變的類(lèi)型1、堿基對(duì)置換:指DNA錯(cuò)配對(duì)堿基在復(fù)制后被固定下來(lái),由原來(lái)的一個(gè)堿基對(duì)被另一個(gè)堿基對(duì)所取代,又稱(chēng)為點(diǎn)突變。堿基對(duì)置換有轉(zhuǎn)換和顛換兩種。2、插入突變:指在基因的序列中插入了一個(gè)堿基或一段外來(lái)DNA導(dǎo)致的突變。包括同義突變、錯(cuò)義突變和無(wú)意突變。突變熱點(diǎn):是指DNA分子上任意位點(diǎn)發(fā)生突變的頻率并不相等,在某些位點(diǎn)發(fā)生突變的頻率遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于其平均數(shù),成為突變熱點(diǎn)。4.4.2誘變劑的作用在自然條件下發(fā)生的突變稱(chēng)為自發(fā)突變。自發(fā)突變的頻率很低,約10-10左右。能夠提高突變率的物理或化學(xué)因子稱(chēng)為誘變劑(mutagen)。①堿基類(lèi)似物:5-BU與T結(jié)構(gòu)相似;②堿基修飾劑:亞硝酸;③嵌合染料(EB);④紫外線和電離輻射4.4.3基因突變的主要后果生物功能喪失獲得新功能癌癥發(fā)生
4.5DNA的重組DNA分子內(nèi)或分子間發(fā)生遺傳信息的重新組合,成為遺傳重組或基因重組。重組產(chǎn)物稱(chēng)為重組體DNA(recombinantDNA)。真核生物基因組間重組多發(fā)生在減數(shù)分裂時(shí)同源染色體之間的交換。細(xì)菌及噬菌體的基因組為單倍體,來(lái)自不同親代兩組DNA之間可通過(guò)多種形式進(jìn)行遺傳重組。有了突變和重組,才能產(chǎn)生遺傳變異,然后才有遺傳漂變和自然選擇,才有進(jìn)化。所以,遺傳變異是生物進(jìn)化的基礎(chǔ)。遺傳變異的根本原因是突變。然而突變的機(jī)率很低,且多數(shù)是有害的。如果生物只有突變沒(méi)有重組,在積累具有選擇優(yōu)勢(shì)突變的同時(shí)不可避免地積累許多難以擺脫的不利突變。有利突變隨不利突變一起被淘汰,新的優(yōu)良基因就不可能出現(xiàn)。DNA重組對(duì)生物進(jìn)化起著關(guān)鍵性的作用。4.5.1同源重組同源重組(homologousrecombination):由兩條同源區(qū)的DNA分子,通過(guò)配對(duì)、鏈斷裂和再連接,而產(chǎn)生的片段間交換的過(guò)程。Holliday模型詳見(jiàn)書(shū)本圖和遺傳學(xué)教材4.5.2細(xì)菌的基因轉(zhuǎn)移與重組細(xì)菌的基因轉(zhuǎn)移主要有四種機(jī)制:接合(conjugation)、轉(zhuǎn)化(transformation)、轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction)和細(xì)胞融合(cellfusion)。①細(xì)菌的接合細(xì)菌的細(xì)胞相互接觸時(shí)遺傳信息可由一個(gè)細(xì)胞轉(zhuǎn)移到另一細(xì)胞,稱(chēng)為接合作用。供體細(xì)胞為雄性,受體為雌性。通過(guò)接合而轉(zhuǎn)移DNA的能力由接合質(zhì)粒提供,與接合功能有關(guān)的蛋白質(zhì)均由接合質(zhì)粒所編碼。能夠促使染色體基因轉(zhuǎn)移的接合質(zhì)粒稱(chēng)為致育因子(fertilityfactor,F(xiàn)因子)。大腸桿菌F因子是雙鏈閉環(huán)的大質(zhì)粒,總長(zhǎng)約100kb,復(fù)制起點(diǎn)為oriV。F因子可以在細(xì)胞內(nèi)游離存在(F+),也可以整合到宿主染色體內(nèi)(Hfr)。整合F因子的大腸桿菌菌株具有較高頻率的重組(high-frequencyrecombination),稱(chēng)為Hfr菌株。F因子可以整合在染色體不同位置,由此而得到不同的Hfr菌株。②細(xì)菌的遺傳轉(zhuǎn)化遺傳轉(zhuǎn)化(genetictransformation)是指細(xì)菌品系由于吸收了外源DNA而發(fā)生遺傳性狀的改變現(xiàn)象。感受態(tài)細(xì)胞(competentcell):受體細(xì)胞經(jīng)過(guò)一些特殊方法(如電擊、CaCl2)處理后,細(xì)胞膜的通透性發(fā)生了暫時(shí)性改變,成為能允許外源DNA分子進(jìn)入的狀態(tài)。③細(xì)菌的轉(zhuǎn)導(dǎo)轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction):是通過(guò)噬菌體將基因從供體轉(zhuǎn)移到受體細(xì)胞的過(guò)程。④細(xì)菌的細(xì)胞融合由細(xì)胞質(zhì)膜融合導(dǎo)致的基因轉(zhuǎn)移和重組。在實(shí)驗(yàn)室中用溶菌酶除去細(xì)菌細(xì)胞壁的肽聚糖,使其成為原生質(zhì)體,可人工促進(jìn)原生質(zhì)體融合,由此使兩菌株的DNA發(fā)生廣泛的重組。4.6DNA的轉(zhuǎn)座轉(zhuǎn)座子(transposon):是在基因組中可以移動(dòng)的一段DNA序列。一個(gè)轉(zhuǎn)座子由基因組的一個(gè)位置轉(zhuǎn)移到另一個(gè)位置的過(guò)程稱(chēng)為轉(zhuǎn)座或移位(transposition)。本質(zhì)是由轉(zhuǎn)座子(可移位因子)介導(dǎo)的遺傳物質(zhì)重排現(xiàn)象。轉(zhuǎn)座子是一些較短的DNA序列,可以轉(zhuǎn)移到細(xì)胞基因組的任何位置。由于它不需要序列間具有同源性,也不是位點(diǎn)特異性的,所以轉(zhuǎn)座作用又被稱(chēng)為異常重組。與DNA的同源重組相比,轉(zhuǎn)座作用發(fā)生的頻率要低得多。轉(zhuǎn)座作用能說(shuō)明在細(xì)菌中發(fā)現(xiàn)的許多基因缺失或倒轉(zhuǎn)現(xiàn)象,而且它常被用于構(gòu)建新的突變體。轉(zhuǎn)座作用的特點(diǎn)①能從基因組的一個(gè)位點(diǎn)轉(zhuǎn)移到另一個(gè)位點(diǎn)(又稱(chēng)跳躍基因);②不以獨(dú)立形式存在;③轉(zhuǎn)座子編碼自身的轉(zhuǎn)座酶;④轉(zhuǎn)座的頻率很低;⑤轉(zhuǎn)座作用可引起基因表達(dá)內(nèi)容的改變甚至失活。轉(zhuǎn)座可分為復(fù)制性和非復(fù)制性?xún)纱箢?lèi)。在復(fù)制性轉(zhuǎn)座中,整個(gè)轉(zhuǎn)座子被復(fù)制,所移動(dòng)和轉(zhuǎn)位的是原轉(zhuǎn)座子的拷貝。轉(zhuǎn)座酶和解離酶分別作用于原始轉(zhuǎn)座子和復(fù)制轉(zhuǎn)座子。
在非復(fù)制性轉(zhuǎn)座中,原始轉(zhuǎn)座子作為一個(gè)可移動(dòng)的實(shí)體直接被移位。4.6.1轉(zhuǎn)座子的分類(lèi)和結(jié)構(gòu)特征轉(zhuǎn)座子(transposon,Tn):是存在于染色體DNA上可自主位移(非復(fù)制性)和復(fù)制(復(fù)制性)的基本單位。1、IS序列最簡(jiǎn)單的轉(zhuǎn)座子只含有與轉(zhuǎn)座有關(guān)的酶基因,不含有任何宿主基因(包括抗藥性基因),常被稱(chēng)為插入序列(insertionalSequence,IS)。
IS序列都是可以獨(dú)立存在的單元,帶有介導(dǎo)自身移動(dòng)的蛋白。轉(zhuǎn)座子常常被定位到特定的基因中,造成該基因突變??茖W(xué)上用標(biāo)準(zhǔn)命名法對(duì)這些突變進(jìn)行編號(hào),如λ::IS1表示有一個(gè)IS1的序列插入到噬菌體λ基因組內(nèi)。表2-13IS序列的結(jié)構(gòu)特征比較長(zhǎng)度/bp兩端倒置重復(fù)區(qū)/bp靶位點(diǎn)正向重復(fù)區(qū)/bp靶位點(diǎn)IS1IS2IS4IS5IS10RIS50RIS90376813271428119513291531105723411816229189511或124999隨機(jī)有熱點(diǎn)AAAN20TTT有熱點(diǎn)NGCTNAGCN有熱點(diǎn)未知它們都是很小的DNA片段(約lkb),末端具有倒置重復(fù)序列,轉(zhuǎn)座時(shí)往往復(fù)制宿主靶位點(diǎn)一小段(4~15bp)DNA,形成位于IS序列兩端的正向重復(fù)區(qū)。2、復(fù)合型轉(zhuǎn)座子復(fù)合型轉(zhuǎn)座子(compositetransposon):是一類(lèi)除了轉(zhuǎn)座酶基因之外,還帶有抗藥性基因(或其他宿主基因)的轉(zhuǎn)座子。因結(jié)構(gòu)大而復(fù)雜,故稱(chēng)為復(fù)合轉(zhuǎn)座子。其兩翼往往是兩個(gè)相同或高度同源的IS序列,表明IS序列插入到某個(gè)功能基因兩端時(shí)就可能產(chǎn)生復(fù)合轉(zhuǎn)座子(圖2-32)。Ⅰ型:圖2-32一旦形成復(fù)合轉(zhuǎn)座子,IS序列就不能再單獨(dú)移動(dòng),因?yàn)樗鼈兊墓δ鼙恍揎椓?,只有作為?fù)合體移動(dòng)。
Ⅱ型主要指TnA家族:沒(méi)有IS序列、體積龐大(5000bp以上)、帶有3個(gè)基因,其中一個(gè)編碼β-內(nèi)酰胺酶(AmpR),另兩個(gè)則是轉(zhuǎn)座作用所必須的。這類(lèi)轉(zhuǎn)座子兩翼帶有38bp的倒置重復(fù)序列。復(fù)合型轉(zhuǎn)座子的特點(diǎn)①末端反向重復(fù)序列,為轉(zhuǎn)座酶所必須;②中間的開(kāi)放閱讀框架(ORF)作為標(biāo)記基因;③轉(zhuǎn)位后靶位點(diǎn)成為正向重復(fù)序列。4.6.2轉(zhuǎn)座作用的機(jī)制轉(zhuǎn)座時(shí)發(fā)生的插入作用的普遍特征是受體分子中有一段很短的(3~l2bp)、被稱(chēng)為靶序列的DNA會(huì)被復(fù)制,使插入的轉(zhuǎn)座子位于兩個(gè)重復(fù)的靶序列之間。對(duì)于一個(gè)特定的轉(zhuǎn)座子來(lái)說(shuō),它所復(fù)制的靶序列長(zhǎng)度是一樣的,如IS1兩翼總有9個(gè)堿基對(duì)的靶序列,而Tn3兩端總有5bp的靶序列。靶序列的復(fù)制起源于特定內(nèi)切酶所造成的粘性DNA末端。4.6.3轉(zhuǎn)座作用的遺傳學(xué)效應(yīng)(1)轉(zhuǎn)座引起插入突變各種IS、Tn都可以引起插入突變。如果插入位于某操縱子的前半部分,就可能造成極性突變,導(dǎo)致該操縱子后半部分結(jié)構(gòu)基因表達(dá)失活;(2)轉(zhuǎn)座產(chǎn)生新的基因如果轉(zhuǎn)座子上帶有抗藥性基因,它一方面造成靶DNA序列上的插入突變,同時(shí)也使這個(gè)位點(diǎn)產(chǎn)生抗藥性;
(3)影響插入位置鄰近基因的表達(dá),使宿主表型改變;(4)轉(zhuǎn)座產(chǎn)生的染色體畸變;若同源重組發(fā)生在兩個(gè)正向重復(fù)轉(zhuǎn)座區(qū)之間,就導(dǎo)致宿主染色體DNA缺失;若重組發(fā)生在兩個(gè)反向重復(fù)轉(zhuǎn)座區(qū)之間,則引起染色體DNA倒位。(5)轉(zhuǎn)座引起的生物進(jìn)化由于轉(zhuǎn)座作用,使一些原來(lái)在染色體上相距甚遠(yuǎn)的基因組合到一起,構(gòu)建成一個(gè)操縱子或表達(dá)單元,可能產(chǎn)生一些具有新的生物學(xué)功能的基因和新的蛋白質(zhì)分子。4.7真核生物中的轉(zhuǎn)座子早在20世紀(jì)初,遺傳學(xué)家就已發(fā)現(xiàn)玉米中存在決定體細(xì)胞變異的控制因子(controllingelement),事實(shí)上就是轉(zhuǎn)座子。20世紀(jì)40年代,BarbaraMcClintock在美國(guó)康奈爾大學(xué)和冷泉港實(shí)驗(yàn)室所進(jìn)行的開(kāi)創(chuàng)性工作,打破了孟德?tīng)栮P(guān)于基因固定排列于染色體上的概念,在當(dāng)時(shí)幾乎不能被科學(xué)界所接受,直到
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