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2023/2/61醫(yī)學文獻數據庫

MEDLINEIE6.0以下版本，應用火狐瀏覽器

（下載網址及軟件）2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室22023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室3一、數據庫概況（一）編制單位：美國國立醫(yī)學圖書館(NLM)。（二）收錄學科內容：主要收錄生物醫(yī)學、衛(wèi)生保健以及生命科學相關文獻。包括行為科學、健康專業(yè)所需要的化學、生物工藝學，基礎研究和臨床、護理、公共衛(wèi)生、衛(wèi)生政策發(fā)展或相關教育活動的內容。2000年起增加了生物、環(huán)境科學、海洋生物、植物和動物學、生物物理學和生物化學等生命科學方面的研究內容。2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室5二、MEDLINE的檢索平臺廣域網免費平臺：NCBI-PubMed（含非MEDLINE數據）2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室6校園網內可用平臺（IP控制）：OvidSP（含非MEDLINE數據）WebofKnowledgeEBSCOOCLCFirstSearch二、MEDLINE的檢索平臺2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室7校園網內可用平臺的Medline2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室9（一）開發(fā)機構：NCBI（美國國立生物技術信息中心）

NCBI的任務:

建立基于計算機信息處理的分子生物學、生物化學、遺傳學知識的自動存儲和分析系統(tǒng)，并開展相關先進方法的研究。促進生物技術研究者和醫(yī)藥治療人員對數據庫和軟件的使用。促進全世界范圍內生物技術信息收集的合作。一、PubMed簡介2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室10NCBI網站2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室11NCBI提供的數據庫檢索大分子生物學數據獲取GenBank,EMBL等數據庫的核酸序列；獲取Swiss-port,PIR,PRF,PDB等蛋白質序列，從核酸序列翻譯到蛋白質的序列；獲取基因和染色體圖譜；蛋白質三維結構數據及大分子模式（MMDB）等其他生物信息數據庫檢索。PubMed等文獻數據。2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室13MDENLINEIndexed 1966toprensent的MEDLINE已標引數據，有MeSH字段和摘要，每條記錄標有：[PubMed-indexedforMEDNLINE]

OldMDENLINE 1949-1965年間的MEDLINE數據，無MeSH字段和摘要，每條記錄標有：[PubMed-OLDMDENLINEforPre1966]

（三）PubMed收錄數據2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室14MDENLINEInprocess

最新的MDENLINE處理中數據，未標引，無MeSH字段。每條記錄標有：[PubMed-inprocess]。Publisher-Supplied

出版商提供的電子文獻題錄，每條記錄標有: [PubMed-assuppliedbypublisher]，分為兩類：

MEDLINE收錄，逐步轉為InProcess,Indexed狀態(tài)。

NotMEDLINE：PubMed收錄，MDELINE不收錄，一直標注[PubMed-assuppliedbypublisher]或[PubMed]（三）PubMed收錄數據2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室15二、PubMed的檢索功能基本檢索輸入框檢索限制高級檢索檢索指南檢索工具：特定文獻檢索臨床查詢專題查詢其他資源：規(guī)范詞數據庫期刊數據庫臨床試驗等個人空間2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室17檢索欄可輸入布爾邏輯運算式：如：OmeprazoleAND(analogsORderivatives)字段限定符：[]，空格按詞組匹配如：Stemcelltransplantation[ti]（空格=詞組運算）如：Omeprazole[ti]pharmacology[ti]（空格=“and”運算）三、PubMed基本檢索規(guī)則2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室18字段限定

stemcelltransplantation[ti]2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室192023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室19stemcell[ti]ANDtransplantation[ti]比空格多檢出400篇2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室21著者檢索：姓全稱在前，名首字母在后，[au]。 如:smithab[au]“paulsene”[au]三、PubMed基本檢索規(guī)則邏輯運算式輸入：PaulsenE撰寫的蘆薈治療牛皮癬的文章2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室22刊名檢索：全稱或MEDLINE認可的標準縮寫,[so]

如：Journalofinvestigativedermatology[so] Jinvestdermatol[so]三、PubMed基本檢索規(guī)則輸入刊名檢索發(fā)表在該刊上的文獻（限定出處字段SO）2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室23PubMed記錄字段說明文摘第一著者單位地址出版商提供文獻識別號著者群版權說明參考評論文獻合著者文獻參考評論定稿版校樣版輸入日期輸入完成日期電子出版日期2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室25最后修訂日期規(guī)范詞表詞規(guī)范詞確立日期系統(tǒng)組織的文摘版權擁有者題錄提供機構的識別號病史相關與原始記錄其他關鍵詞提供其他關鍵詞的機構數據提供者機構文章總頁數出版商提供數據時間期刊出版國數據庫文獻編號2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室26作為主題詞的個人姓名出版狀態(tài)文獻類型出版模式（紙張或電子）參考文獻數已撤回的文獻酶或化學物質代碼正在撤消中的文章初版文獻修訂和再版的文章子專題文檔太空署提供的數據二次文獻數據庫以及文章討論的分子序列訪問號原文來源引用了病例的文獻內部處理代碼標準期刊縮寫文獻標題翻譯標題更新文獻文獻正在更新期刊卷號2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室29自動轉換匹配檢索詞： 對常用醫(yī)學名詞自動在規(guī)范詞索引（主題詞、副主題詞、物質名稱）中轉換、并在所有記錄字段中匹配。

如：tonguecancer"tongueneoplasms"[MeSHTerms]OR("tongue"[AllFields]AND"neoplasms"[AllFields])OR"tongueneoplasms"[AllFields]OR("tongue"[AllFields]AND"cancer"[AllFields])OR"tonguecancer"[AllFields]三、PubMed基本檢索規(guī)則2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室30結果顯示頁右側Details顯示系統(tǒng)自動匹配轉換的檢索詞2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室31自動轉換匹配檢索詞：

如：hypertensiontherapy

Details: ("hypertension"[MeSHTerms]OR "hypertension"[AllFields])AND ("therapy"[Subheading]OR"therapy"[AllFields]OR"therapeutics"[MeSHTerms]OR"therapeutics"[AllFields])三、PubMed基本檢索規(guī)則2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室32四、PubMed檢索限制：LimitsPubMed主頁、結果顯示頁、高級檢索界面均有Limits鏈接。2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室33全文、免費全文、摘要限定出版日期限定文獻類型限定語種限定研究對象人/動物限定性別限定年齡限定各種專題的子數據庫限定2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室34五、PubMed高級檢索功能一個網頁中集多種功能于一體基本檢索檢索細節(jié)檢索式編制檢索歷史其他檢索資源檢索詞索引結果預覽2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室35SearchBuilder（檢索式編制）：檢索框中只能輸入檢索詞，不能輸入檢索式。多個字段檢索要分多次輸入。SearchHistory（檢索歷史）：檢索歷史中顯示歷次檢索式、時間和檢出篇數。可組配檢索式，如：#1OR#2，#1ANDchild點擊編號可對檢索式進行刪除、保存等操作。Preview（結果預覽）：在History中快速顯示檢索式與檢出篇數Details（檢索詞匹配細節(jié)）：顯示轉換規(guī)范詞及運算的詳細過程，可確定規(guī)范詞五、PubMed高級檢索規(guī)則2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室36六、PubMed其他資源1.MeshDatabase（規(guī)范化主題詞表）功能：確定規(guī)范化主題詞查看主題詞詞義注釋、樹狀結構表選擇副主題詞、擴展下位主題詞、指定主要主題詞進入途徑：MeSHDatabase鏈接：PubMed主頁，AdvancedSearch界面MeSH選項：基本檢索框前Search下拉菜單的2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室37進入MeSH2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室38MeSH詞檢索例1：2006-10年關于舌根癌藥物治療的文獻。課題分析：舌根癌的不同表達形式（OR）：

tonguebasecancer、 cancer/carcinoma/tumoroftonguebase、 cancerofthebaseoftongue…藥物治療的不同表達形式（OR）：

drugtherapy/treat/treatment兩個概念之間：舌根癌AND藥物治療2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室39輸入檢索詞，查找規(guī)范詞未匹配到規(guī)范詞改用上級概念“舌癌”匹配2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室40只查重點論述的文獻2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室41輸入舌根的自由詞檢索式，進行AND運算。2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室42初步結果，未限定年份2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室432023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室44設定的限制2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室45輸入(tonguebase[ti]AND(cancer*[ti]ORcarcinoma*[ti]ORtumor*[ti]))AND(therapyORtreatORtreatment)自由詞檢索最新文獻2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室462023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室47加工中，無MeSH詞2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室48比MeSH多3篇2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室49排序方式選擇Abstract格式提供全文鏈接、規(guī)范詞等信息2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室50點擊標題顯示文摘增強格式文獻歸類功能免費全文鏈接2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室51文摘增強格式相關論文MeSH詞、物質名、文獻類型等信息LinkOut外部資源鏈接全文鏈接，我校訂購的數據庫可鏈全文，需在校園網內設免費代理相關的網上免費醫(yī)學指南信息全文鏈接2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室522023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室53輸出方式選擇2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室54輸出方式選擇（sendto）File：保存檢索結果為文本文件Clipboard剪貼板，多次檢索，可暫存每次檢索需下載的記錄，最后一起保存。最多允許存儲500條，保留8小時。Email:通過郵件發(fā)送Collections：將檢索結果存到MyNCBI中Order：全文傳遞服務，需帳號、收費。2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室542023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室55訂閱最新結果點擊后點“XML”按鈕2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室56需IE7.0以上版本2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室57定期點擊鏈接，接收課題最新相關論文2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室58MeSH詞檢索例2：2003-09年期間關于霉酚酸酯治療腎衰竭療效觀察的文獻。課題分析：MeSH匹配規(guī)范詞：mycophenolatemofetilMeSH匹配規(guī)范詞：

renalfailure,treatmentefficacy（AND）匹配副主題詞：

drugtherapy2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室59補充概念（規(guī)范詞）：MeSH主題詞未涵蓋的藥物、物質名稱、疾病名、方案。無副主題詞選項2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室602023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室612023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室622023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室632023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室64MeSH檢索的優(yōu)點查全同義詞:

如：renal/kidneyfailure;tonguecancer/tumor…查全子概念:

如：chronic/acutekidneyfailure,ATN2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室65查全子概念：自動擴展檢索下位詞勾選后不擴展下位詞樹形結構上位詞MeSH檢索的優(yōu)點查全同義詞2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室66MeSH檢索的優(yōu)點根據樹形結構調整檢索詞縮?。翰粩U展下位詞，或選用某個下位詞；擴大：選用上位詞，或選用多個同位詞；了解同一概念的同義詞、近義詞，供自由詞檢索參考款目詞：規(guī)范詞所替代的不同表達形式的自由詞2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室67MeSH檢索的優(yōu)點提高文獻相關度標有MeSH詞的都是文章的主題，篩去非主題的文章MajorTopicHeadings（加權，重點論述的主題）帶*的是文獻重點論述的主題2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室68MeSH檢索的缺陷人工標引費時，近6個月左右的論文還未標MeSH詞（InProcess），用MeSH會漏檢。Medline不收錄的文獻，Suppliedbypublisher的文獻，不標MeSH詞。新詞、一些很專指的概念沒有對應的規(guī)范詞。如：SARS（03年詞表中沒有），舌根癌查上述類型的文獻需結合自由詞檢索2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室69六、PubMed其他資源2.JournalsinNCBIDatabase（期刊信息庫）通過輸入刊名全稱或縮寫、ISSN號等瀏覽期刊出版社等詳細信息。提供期刊：在PMC中的免費全文鏈接相關的其他期刊……2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室70輸入待檢期刊名期刊詳細信息全文等鏈接2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室71

GoPubmed文獻分析2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室72GoPubmed——文獻分析工具GoPubMed是德國Transinsight公司和德國德累斯頓大學合作開發(fā)，對PubMed檢索結果進行篩選、分析的工具。智能搜索、交互式篩選找出重要論文。2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室73GoPubMed的功能包括生物醫(yī)學所有概念及其語義關系GO基因詞庫MeSH主題詞表PRO蛋白質詞庫2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室74

GoPubMed可以告訴我們4W

WhatWhoWhereWhen2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室752023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室76自動顯示備選主題詞鼠標移動至主題詞可顯示注解、同義詞等2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室77最近檢索歷史2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室78四個“W”查看發(fā)表文獻最多的作者2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室79著者關系圖2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室802023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室81案例分析H1N1流感的研究進展利用GoPubMed查找相關文獻，并了解以下四個“W”：What，Who，Where，When；了解涉及甲流病毒研究的文章；查找中國（不含省港澳）關于甲流病毒的研究文章2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室82輸入規(guī)則同PubMed2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室83分析功能2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室84時間分析國家分析2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室85城市分析刊物分析2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室86地區(qū)分布圖2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室87主題分析作者分析2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室88研究人員關系網線條越多，線形越多，地位越重要2023/2/6復旦大學圖書館文獻檢索教研室89課題發(fā)展趨勢2023/