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文檔簡介
核糖體與核酶詳解演示文稿第一頁,共四十七頁。1優(yōu)選核糖體與核酶第二頁,共四十七頁。2核糖體的形態(tài)結(jié)構(gòu)第三頁,共四十七頁。36.1Ribosomestructure
◆核糖體(ribosome)是細(xì)胞內(nèi)一種核糖核蛋白顆粒(ribonucleoproteinpartical),是細(xì)胞內(nèi)合成蛋白質(zhì)的細(xì)胞器?!艉颂求w的主要成分是核糖體RNA(rRNA),占60%,蛋白質(zhì)(r蛋白質(zhì)),占40%。第四頁,共四十七頁。46.1.1核糖體的類型細(xì)胞有兩種主要類型的核糖體:◆原核細(xì)胞的核糖體:沉降系數(shù)為70S,分子量為2.5x106,由50S和30S兩個(gè)亞基組成?!粽婧思?xì)胞的核糖體:6,由60S和40S兩個(gè)亞基組成。第五頁,共四十七頁。5核糖體的大小亞基第六頁,共四十七頁。6Mg2+濃度對大小亞基的聚合和解離的影響:◆70S核糖體在Mg2+的濃度小于1mm/L的溶液中易解離;◆當(dāng)Mg2+濃度大于10mm/L,兩個(gè)核糖體通常形成100S的二聚體。
第七頁,共四十七頁。7各種來源的核糖體亞基組成
來源完整核糖體核糖體亞基核糖體RNAs
細(xì)胞質(zhì)80S60S(大亞基)28S,5.8S,5S(真核生物)40S(小亞基)18S細(xì)胞質(zhì)70S50S(大亞基)23S,5S(原核生物)30S(小亞基)16S線粒體55-60S45S(大亞基)16S(哺乳動(dòng)物)35S(小亞基)12S線粒體75S53S(大亞基)21S (酵母)35S(小亞基)14S線粒體78S60S(大亞基)26S(高等植物)45S(小亞基)18S,5S葉綠體70S50S(大亞基)23S30S(小亞基)16S,5S 第八頁,共四十七頁。8核糖體的化學(xué)組成第九頁,共四十七頁。96.2核糖體的生物發(fā)生
(Biogenesis)◆在細(xì)胞內(nèi),核糖體是自我裝配的?!粽婧思?xì)胞和原核細(xì)胞的核糖體合成和裝配過程各不相同。
◆核糖體的生物發(fā)生包括蛋白質(zhì)和rRNA的合成、核糖體亞基的組裝。第十頁,共四十七頁。10
6.2.1核糖體基因rRNA基因的擴(kuò)增1.在染色體上增加rRNA基因的拷貝數(shù)●細(xì)菌的E.coli的基因組中有7套rRNA基因;●典型的真核生物細(xì)胞含有幾百到幾千個(gè)18S、5.8S和28SrRNA基因的拷貝;●5SrRNA基因的拷貝數(shù)多達(dá)50000個(gè)。第十一頁,共四十七頁。112.TheselectiveamplificationofrDNA
●概念:●AmphibianoocytesrRNAgeneamplification
基因擴(kuò)增是通過形成幾千個(gè)核進(jìn)行的,每個(gè)核里含有幾百拷貝的編碼18S、5.8S和28S的rRNA基因,最后卵母細(xì)胞中的這些rRNA基因的拷貝數(shù)幾乎達(dá)到50萬個(gè)。第十二頁,共四十七頁。12
●卵母細(xì)胞中rRNA基因擴(kuò)增機(jī)制
滾環(huán)復(fù)制(rollingcirclereplication)
卵母細(xì)胞中rRNA基因擴(kuò)增的機(jī)制,有人認(rèn)為歸因于從染色體上分離出來的環(huán)狀DNA分子,這種環(huán)狀DNA中含有rRNA基因。由于環(huán)狀DNA能夠通過滾環(huán)復(fù)制的方式進(jìn)行復(fù)制,因而能夠產(chǎn)生大量的rRNA基因。第十三頁,共四十七頁。1318S、5.8S和28SrRNA基因的轉(zhuǎn)錄和加工◆組織:●18S、5.8S和28SrRNA基因?yàn)橐唤M串聯(lián)在一起,人基因組中,分布在13、14、15、21、225條染色體上。人的均有rRNA基因。在間期核中,所有這5條染色體rRNA基因附著的區(qū)域,集合在一起,形成一個(gè)核仁?!?S的rRNA基因則位于另一條染色體上。分布在人類的1號染色體上,24000個(gè)拷貝。第十四頁,共四十七頁。14◆轉(zhuǎn)錄●18S、5.8S和28SrRNA基因首先轉(zhuǎn)錄成一個(gè)45S前rRNA;●不同種的生物,pre-rRNA的長度范圍在34S~45S之間;●在轉(zhuǎn)錄單位中除了三個(gè)rRNA基因外,還包括一些間隔區(qū);●RNA聚合酶I
。第十五頁,共四十七頁。15不同種生物的前體rRNA
生物pre-rRNA的沉降系數(shù)
果蠅34S 裂殖酵母37S煙草38S 蛙40S雞45S鼠45S人45S 第十六頁,共四十七頁。16rRNA的前體轉(zhuǎn)錄物第十七頁,共四十七頁。17前體rRNA的加工與修飾:◆將45S的前體rRNA加工成成熟的18S、5.8S和28SrRNA;◆甲基化修飾:甲基化的主要部位在核糖第二位羥基上。第十八頁,共四十七頁。1845SrRNA前體的加工第十九頁,共四十七頁。19◆在前體rRNA加工過程中,rRNA的甲基化可能起指導(dǎo)作用:●實(shí)驗(yàn)證明在前體rRNA被甲基化的部位在加工過程中并未被切除,而是一直保持到成熟的rRNA中;●另外還發(fā)現(xiàn)如果人為地阻斷前體rRNA的甲基化,前體rRNA的加工也被阻斷;●推測前體rRNA的甲基化對rRNA的加工具有指導(dǎo)作用。第二十頁,共四十七頁。205SrRNA的加工與修飾:◆真核生物的5SrRNA基因與其他3種rRNA基因不在同一條染色體上,它是由核仁以外的染色體基因轉(zhuǎn)錄的;在核仁裝配;基因數(shù)量多?!?SrRNA基因是由RNA聚合酶III轉(zhuǎn)錄的,原始轉(zhuǎn)錄物的5’端與成熟的5SrRNA的5’端完全相同,3’端通常含有多余的核苷酸,在加工時(shí)要被切除。第二十一頁,共四十七頁。215SrRNA基因第二十二頁,共四十七頁。22◆RNA聚合酶III通常是與位于轉(zhuǎn)錄部分內(nèi)的啟動(dòng)子結(jié)合,而不是與轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)上游的啟動(dòng)子結(jié)合,內(nèi)部啟動(dòng)子。內(nèi)部啟動(dòng)子的實(shí)驗(yàn)證明:第二十三頁,共四十七頁。23原核生物rRNA基因◆原核與真核生物的rRNA基因在組織結(jié)構(gòu)上的差異:●重復(fù)頻率:如E.coli,只重復(fù)了7次;●細(xì)菌的5SrRNA與16SrRNA、23SrRNA基因只組成一個(gè)轉(zhuǎn)錄單位,在染色體上的排列順序是∶16S-23S-5S。第二十四頁,共四十七頁。24◆核酸酶RNaseⅢ將16S-23S-5SrRNA前體切割成單體;◆細(xì)菌中的rRNA轉(zhuǎn)錄單位除了三種rRNA外,同時(shí)有幾種tRNA分子。第二十五頁,共四十七頁。25原核生物rRNA前體的加工第二十六頁,共四十七頁。266.2.2核糖體的裝配核糖體是一種自組裝(self-assembly)的結(jié)構(gòu)。原核生物核糖體亞基的裝配在細(xì)胞質(zhì);真核生物核糖體亞基的裝配地點(diǎn)在細(xì)胞核核仁部位。原核生物核糖體的裝配◆rRNA和蛋白質(zhì)的裝配關(guān)系:
組成核糖體的蛋白質(zhì)和rRNA在大小亞基中均有一定的空間排布和先后順序。第二十七頁,共四十七頁。27核糖體RNA的位置關(guān)系第二十八頁,共四十七頁。28
核糖體在組裝過程中,某些蛋白質(zhì)必須首先結(jié)合到rRNA上,其他蛋白才能組長上去即表現(xiàn)出先后層次。根據(jù)同rRNA結(jié)合的順序,將核糖體蛋白分為兩種:第二十九頁,共四十七頁。29◆初級結(jié)合蛋白(primarybindingprotein)
這些蛋白質(zhì)直接同rRNA結(jié)合,其中同16SrRNA結(jié)合的初級蛋白有14種,它們是:S3,S4,S17,S20,S6,S15,S8,S18,S9,S11,S12,S13,S7,S1。同5SrRNA結(jié)合的有11種。◆次級結(jié)合蛋白(secondarybindingprotein)
這些蛋白質(zhì)不直接同rRNA結(jié)合,而是同初級結(jié)合蛋結(jié)合。它們是:S10,S16,S2,S6,S21,S14,S19。第三十頁,共四十七頁。30核糖體結(jié)合蛋白第三十一頁,共四十七頁。31真核生物核糖體裝配模型◆80S前體顆粒形成
●45SrRNA+5SrRNA+蛋白質(zhì)●45SrRNA41SrRNA◆大小亞基前體形成:●大:32SrRNA和5SrRNA●小:20S的前體rRNA;◆小亞基成熟與運(yùn)送:20SrRNA18SrRNA◆大亞基成熟與運(yùn)送32SrRNA28SrRNA+5.8SrRNA+5SrRNA
編碼核糖體亞基的蛋白質(zhì)基因轉(zhuǎn)錄后在細(xì)胞核中加工成熟,隨即運(yùn)送到細(xì)胞質(zhì)中合成蛋白質(zhì),再將合成的蛋白質(zhì)運(yùn)回細(xì)胞核核仁裝配。第三十二頁,共四十七頁。32核糖體的合成與裝配第三十三頁,共四十七頁。33核糖體的功能位點(diǎn)6.3核糖體的功能第三十四頁,共四十七頁。34真核與原核mRNA的差異第三十五頁,共四十七頁。35SD(Shine-Dalgarno)sequence第三十六頁,共四十七頁。36多聚核糖體第三十七頁,共四十七頁。376.4核酶Ribozyme與反義RNA◆核酶:AnenzymeinwhichRNAratherthanproteinisresponsibleforcatalyticactivity.◆與蛋白質(zhì)酶相比,核酶的催化效率較低,是一種較為原始的催化酶?!舴戳xRNA是指與mRNA互補(bǔ)的RNA分子。是正鏈DNA的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。I、II、III類。第三十八頁,共四十七頁。38核酶的發(fā)現(xiàn)◆幾個(gè)基本概念●間隔序列(spacesequence)●內(nèi)含子(intron)●外顯子(exon)第三十九頁,共四十七頁。39◆發(fā)現(xiàn)
●1980s●ThomasCech等●研究四膜蟲的26SrRNA前體加工●發(fā)現(xiàn):26SrRNA前體可進(jìn)行自剪切(self-splicing)◆證明●26SrRNA基因克隆●無細(xì)胞系統(tǒng)中轉(zhuǎn)錄●研究26SrRNA的前體分子剪切第四十頁,共四十七頁。4050S核糖體中23SrRNA核酶活性◆起因:肽酰轉(zhuǎn)移酶(peptidyltransferase)◆發(fā)現(xiàn)者:HarryNoller等,1992年◆實(shí)驗(yàn)過程:●破壞50S亞基核糖體蛋白質(zhì)蛋白酶K、SDS、苯酚等●破壞rRNA核酸酶處理50S亞基核糖體◆結(jié)論:
具有肽酰轉(zhuǎn)移酶的活性分子是23SrRNA。第四十一頁,共四十七頁。41●即從pre-mRNA中切除內(nèi)含子●剪接發(fā)生在細(xì)胞核中●加工成熟的mRNA被運(yùn)送到細(xì)胞質(zhì)。6.4.1核剪接(nuclearsplicing)第四十二頁,共四十七頁。42●GU-AG規(guī)則:P256●剪接體(Spliceosomes):在剪接過程中形成的剪接復(fù)合物稱為剪接體,剪接體的主要組成是:蛋白質(zhì)和小分子的核RNA(snRNA)(100~300bp).例如:U1,U2,U4,U5和U6.●套索的形成和釋放。
核剪接的作用機(jī)制
第四十三頁,共四十七頁。43核剪接第四十四頁,共四十七頁。44●結(jié)構(gòu)特點(diǎn):內(nèi)含子轉(zhuǎn)錄后可以形成9個(gè)由堿基配對形成的特定二級結(jié)構(gòu),分別命名為P1至P9,P1和P7是保守的?!裥枰坞x的鳥苷●存在的細(xì)胞器:核、線粒體、葉綠體●基因:前體rRNA、mRNA和tRNA6.4.2I組內(nèi)含子剪
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