化能異養(yǎng)型微生物代謝中的能量形式轉換

化能異養(yǎng)型微生物代謝中的能量形式轉換第1頁/共68頁2023/3/82化能異養(yǎng)型微生物利用化學能源，并以有機化合物為主要碳源和能源進行生命活動?；瘜W能源物質作為能源化合物參與生物氧化，從而獲得可以直接支持生命活動（支撐生命）的代謝能。第2頁/共68頁2023/3/832.4.1氧化還原對及其氧化還原電位

2.4.2電子載體與高能（磷酸）鍵載體

2.4.3生物學體系中的能量耦合

2.4.4與呼吸、發(fā)酵對應的代謝能轉換

機制第3頁/共68頁2023/3/842.4.1氧化還原對及其

氧化還原電位

第4頁/共68頁2023/3/852.4.1.1溶質標準狀況的規(guī)定2.4.1.2生化反應前后自由能的變化2.4.1.3氧化還原電位的測定及標準

狀況的規(guī)定第5頁/共68頁2023/3/86氧化還原系統(tǒng)中成對的氧化物和還原物被稱為氧化還原對（redoxcouple），又稱為電極對，其通式為：氧化型/還原型。

例如：

NAD+／NADH+H+

Fe3+／Fe2+。

第6頁/共68頁2023/3/87在氧化還原電極對之間有電子轉移的趨勢，它們的還原電位（或稱電極電位）就是衡量這種電子轉移（獲得電子）的趨勢的物理量，記作“E”。在物理化學標準狀況下電極對的還原電位，叫標準還原電位，記作E0。在生物化學標準狀態(tài)下電極對的還原電位記作E0′，叫生化標準還原電位。所謂標準還原電位，是根據(jù)下述溶質的標準狀況的參考標準來定義的。第7頁/共68頁2023/3/882.4.1.1溶質標準狀況的規(guī)定第8頁/共68頁2023/3/89在生物系統(tǒng)中，溶質標準狀況有它的特殊性，因為生化反應通常在接近中性pH的稀水溶液中進行。已對生物系統(tǒng)的標準狀況作如下參考規(guī)定：第9頁/共68頁2023/3/810①水的標準狀況規(guī)定為純液體的標準狀況。因而，水的濃度（或活度）取作1，盡管實際上水的摩爾濃度為55.5mol/L。

②氫離子的活度規(guī)定為對應于在生理pH條件（pH7）的活度，而不是化學標準狀態(tài)規(guī)定的pH0（氫離子活度為1）的活度。第10頁/共68頁2023/3/811③能經(jīng)歷酸堿反應的化合物的標準狀況規(guī)定為其天然存在的離子混合物在pH7的條件下的總濃度。這樣做的好處在于，通常測量一個化合物的總濃度比測量其一種離子的濃度要更容易些。然而，因為酸或堿的離子組成隨pH值而變化，用總濃度計算標準自由能時，只能采用pH7時的濃度。第11頁/共68頁2023/3/812

使用上述參考規(guī)定時，標準自由能變化一般用符號ΔG0′（生化標準狀況下自由能的變化）來表示，這里加上撇號“′”，以區(qū)別于物理化學標準狀況下自由能的變化ΔG0。由于自由能變化與所規(guī)定的參考狀況無關，所以參考狀況是可以人為選擇的。第12頁/共68頁2023/3/813

然而，在用公式表示水和質子對自由能變化的影響時，規(guī)定這參考狀況是很重要的，如果用生化標準狀況作參照，水的濃度可以從公式中省去。類似地，如果反應在pH7條件下進行，則質子濃度不必包括在公式中（如果反應在pH值不等于7的情況下進行，質子濃度應當取與10-7有關的值，即應當以“[H+]/10-7”的方式出現(xiàn)）。第13頁/共68頁2023/3/8142.4.1.2生化反應前后自由能的變化第14頁/共68頁2023/3/815

在活細胞內的反應條件是恒溫、恒壓的條件。在恒溫、恒壓條件下，各類化學反應能否自發(fā)進行，取決于自由能的變化“ΔG′”的值（反應的ΔG′與變化的途徑無關）。

當ΔG′＜0時，反應能自發(fā)進行，并能放出自由能量；

當ΔG′＝0時，反應已達到平衡；

當ΔG′＞0時，反應不能自發(fā)進行，必須“注入”代謝能才能進行。

第15頁/共68頁2023/3/816生物體內的反應在恒溫、恒壓下進行，反應的自由能變化是：

ΔG′=G′終態(tài)－′G始態(tài)

如果反應系統(tǒng)處于平衡狀態(tài)，上式可進一步化為：

ΔG′=ΔG0′+RTlnKeq′

第16頁/共68頁2023/3/817

當系統(tǒng)達到熱力學平衡（ΔG′=0），則有：

ΔG0′=-RTlnKeq′

R是摩爾氣體常數(shù)8.314

[J·（mol°K）-1]，平衡常數(shù)Keq′可以測得的，因此可以從該反應的Keq′值及絕對溫度T，來推算ΔG0′。當然ΔG0′的值也可以通過查表獲得。第17頁/共68頁2023/3/8182.4.1.3氧化還原電位的測定

及標準狀況的規(guī)定

第18頁/共68頁2023/3/819

在測量電極對的還原電位時，常用氫電極作為標準電極，并要求樣品半電池的氧化物、還原物對子的溶質的濃度均為lmol·L-1；對參比半電池為氫電極的情況來說，H+

濃度為lmol·L-1（pH值為0）；H2為latm。指定氫電極的標準還原電位E0為零，因此，兩個半電池的電位差即為樣品對子的標準還原電位。

第19頁/共68頁2023/3/820為了使電極對的還原電位數(shù)據(jù)有可比性，必須對溶質的標準狀況作上述嚴格的規(guī)定。下表列出了若干在生物學上比較重要的氧化還原對子的E0′值。E0′是在pH7.0和25℃條件下，相對于標準氫半電池的生化標準還原電位的測定值。第20頁/共68頁2023/3/821第21頁/共68頁2023/3/822可以預見，在生化標準狀況下，表中任何指定的氧化還原對，傾向于還原任何列在它下面的氧化還原對，其相對位置是它們之間氧化還原熱力學自發(fā)性的度量。第22頁/共68頁2023/3/823在生物體中，氧化還原反應的標準自由能變化（ΔG0′）實際上是與兩個氧化還原對之間的標準還原電位之差（ΔE0′）成線性關系的。兩者的關系可用下式表示：

ΔG0′=-nFΔE0′

式中，n為電子傳遞數(shù)目，F(xiàn)為法拉第常數(shù)（9.6485×104C／mo1），ΔE0′

為電子受體的E0′減去電子供體的E0′所得之差值。第23頁/共68頁2023/3/8242.4.2電子載體與高能

（磷酸）鍵載體第24頁/共68頁2023/3/8252.4.2.1電子載體與氫載體

2.4.2.2高能（磷酸）鍵載體及能量偶聯(lián)第25頁/共68頁2023/3/8262.4.2.1電子載體與氫載體

電子載體廣義地包括脫氫酶的輔酶和電子傳遞鏈的全體成員。廣義的電子載體又可以分為氫載體和電子載體。第26頁/共68頁2023/3/827脫氫酶的輔酶NAD+

實際上是氫負離子（hydrideion，即一個質子和一對電子）的載體；黃素蛋白和CoQ

實際上是氫原子（一個質子和一個電子）的載體，它們均可稱為氫載體。

鐵硫蛋白（Fe-S-P）和細胞色素是狹義的電子載體。第27頁/共68頁2023/3/828這些載體的氧化型和各自的還原型配對，組成各自的氧化還原電極對。例如：NAD+／NADH+H+、FAD/FADH2、CoQ/CoQH2和Fe3+／Fe2+等。第28頁/共68頁2023/3/8292.4.2.2高能（磷酸）鍵載體

及能量偶聯(lián)

第29頁/共68頁2023/3/830根據(jù)熱力學第二定律，當反應體系的ΔG＞0時反應不能自發(fā)進行，若要進行，必須提供足夠的、可以被反應體系利用的能量。在細胞中，這種可以利用的能量只能來源于放能反應所釋放的自由能，而且只有當放能反應提供的自由能大于該需能反應所需的自由能時，反應才能進行。第30頁/共68頁2023/3/831生物學中定義：由放能反應提供自由能，用以驅動需能反應的過程，被稱為放能反應與需能反應之間能量的偶聯(lián)。

第31頁/共68頁2023/3/832然而，在生物體內，放能反應不能與需能反應直接發(fā)生偶聯(lián)，必須借助能量載體才能將放能反應所釋放的自由能的一部分（生物可直接利用的能量）提供給需能反應，從而驅動需能反應。大自然已選擇5′-三磷酸腺嘌呤核苷（ATP）作為生物可直接利用的能量的載體。我們把這種細胞可直接利用的能量叫做代謝能。

第32頁/共68頁2023/3/833高能磷酸酯鍵普通磷酸酯鍵第33頁/共68頁2023/3/834

在生命活動過程中，生物體不斷地消耗ATP，同時也不斷再生ATP，因此ATP的轉運、使用和再生是生物最重要的生理過程。

第34頁/共68頁2023/3/8352.4.3生物學體系中

的能量耦合

第35頁/共68頁2023/3/836在化能異養(yǎng)型微生物中，能源化合物被氧化時放出的化學能主要通過以下3種機制轉換成生物可以直接利用的能量——代謝能。

第36頁/共68頁2023/3/8372.4.3.1直接化學耦合

2.4.3.2電耦合

2.4.3.3還原當量耦合第37頁/共68頁2023/3/8382.4.3.1直接化學耦合

第38頁/共68頁2023/3/839直接化學耦合指的是代謝中間化合物參與的底物水平磷酸化的過程。也就是代謝中間化合物（如1,3-2P-GA、PEP、ScCoA和乙酰磷酸等高能磷酸化合物）的高能磷酸鍵的水解反應與ADP或GDP的磷酸化反應直接耦合。借助于對應的酶的催化作用，在酶的底物的水平上發(fā)生磷酸化作用，形成特殊的高能化合物（ATP、GTP）的過程。第39頁/共68頁2023/3/840這類代謝中間化合物，也就是前面所謂酶的底物，包括酵解途徑中由脫氫酶催化的反應生成的1,3-2P-GA，由烯醇化酶催化生成的PEP，TCA環(huán)中由α-KG脫氫酶催化生成的ScCoA，以及PK途徑中的由磷酸酮解酶（phosphoketolase）裂解酮糖生成的乙酰磷酸等高能化合物。這些高能（磷酸）化合物在對應的酶（1,3-2P-GA對應于3-P-GA激酶，PEP對應于PYR激酶）的催化下將ADP磷酸化成ATP。第40頁/共68頁2023/3/8412.4.3.2電耦合第41頁/共68頁2023/3/842

電耦合是指以質子運動勢Δp為媒介，借助電子傳遞鏈和ATP酶，將ATP的使用（ATP→ADP）與ATP的再生（ADP→ATP）耦合起來。詳見本章2.4.4。第42頁/共68頁2023/3/8432.4.3.3還原當量耦合

⑴還原當量，⑵還原當量耦合第43頁/共68頁2023/3/844⑴還原當量

討論還原當量耦合問題，首先必須弄清什么叫還原當量。

生物化學將相當于一個電子或一個氫原子的還原力的量叫做一個還原當量。本課程為了說明問題的方便，將相當于一對電子或一個氫負離子（hydrideion）的還原力的量叫做一個還原當量。第44頁/共68頁2023/3/845所謂氫負離子是指[H∶]-，即[H++2e-]-，也就是一個質子和一對電子。

NADH是NAD+[H∶]-

的簡寫。

第45頁/共68頁2023/3/846

因此，NAD+是氫負離子的載體，也就是一對電子和一個質子的載體，當然也是一對電子的載體。脫氫酶的輔酶NAD+作為一對電子（即還原當量）的載體，其氧化型是空載的，其還原型攜帶了還原當量的，所以也有人把還原型輔酶當作還原當量，或把它稱為還原力。就像我們把ATP稱為代謝能，而實際上ATP是代謝能的載體一樣。第46頁/共68頁2023/3/847發(fā)生生物氧化時，還原性化合物（還原劑）脫氫（氧化）而釋放出“氫”（有些書上標寫為“2H”），這個“氫”實際上是1對電子和2個質子，這2個質子有時結合在輔酶或輔基上，有時其中一個質子存在于溶液中，因此有：

NAD++2H→NADH+H+

（其中一個質子和一對電子結合在輔酶分子上，一個質子存在于溶液中）；

FAD+2H→FADH2

（兩個質子和一對電子都結合在輔基上）。第47頁/共68頁2023/3/848

AMP

FMN

FADH

FADH

2

FAD

圖4-23

FAD+2H→

FADH2（這兩個質子結合在輔基分子上）

第48頁/共68頁2023/3/849圖4-24

NAD++2H→

NADH+H+

（其中一個質子和一對電子結合在輔酶分子上，一個質子存在于溶液中）

[H﹕]ˉ

來自水相

NAD(P)+

NAD(P)H第49頁/共68頁2023/3/850

⑵還原當量耦合

還原當量耦合一般是指：直接接受還原性化合物（還原劑）脫下的電子而形成的還原型輔酶或輔基，直接與細胞內不同的氧化還原反應相耦合。

第50頁/共68頁2023/3/851在生物氧化過程中，還原性化合物的降解通常涉及它們自身被氧化，這就要求氧化型輔酶或輔基作為直接的電子受體參與反應；另一方面，微生物細胞內存在著許多需還原的過程，要求有還原型的輔酶或輔基作為直接的電子供體參與反應。第51頁/共68頁2023/3/852一些重要的輔酶，如煙酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD），其氧化型NAD+可作為直接的電子受體，其還原型NADH可作為直接的電子供體，因此能將這些氧化反應和還原反應偶聯(lián)起來。如GA-3-P脫氫時生成的NADH與乙醇脫氫酶催化的反應相耦合，將乙醛還原成乙醇；另一個重要的輔酶NADP（煙酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸），其還原形式NADPH主要與還原性合成反應相耦合。第52頁/共68頁2023/3/853

NAD+是一些常見的脫氫酶的輔酶，如乳酸脫氫酶，丙酮酸脫氫酶、α-酮戊二酸脫氫酶、蘋果酸脫氫酶；NADP+是另一些常見的脫氫酶的輔酶G-6-P脫氫酶，6-P-GA脫氫酶、異檸檬酸脫氫酶、α-磷酸甘油脫氫酶等。第53頁/共68頁2023/3/854FAD和FMN是一些氧化還原酶（脫氫酶）的輔基，這些酶因為有FAD或FMN作輔基而稱黃素蛋白。以FAD為輔基的酶有琥珀酸脫氫酶，脂酰CoA脫氫酶等；以FMN（或FAD）為輔基的酶有L-氨基酸氧化酶，電子傳遞鏈的成員中也有以FMN（或FAD）為輔基的蛋白質，如NADH脫氫酶。第54頁/共68頁2023/3/855盡管大多數(shù)脫氫酶（氧化酶）所催化的反應是有專一性的，但這種共同的氧化還原耦合機制，允許不同的酶催化的脫氫（氧化）反應為同一個還原反應提供還原當量，允許同一個脫氫（氧化）反應為許多其他還原反應提供還原當量。第55頁/共68頁2023/3/8562.4.4與呼吸、發(fā)酵對應的

代謝能轉換機制第56頁/共68頁2023/3/857為了說明問題方便，以微生物對葡萄糖的降解代謝為例，來說明與呼吸、發(fā)酵對應的代謝能轉換機制。葡萄糖的降解可分成3個階段。第57頁/共68頁2023/3/858第一階段是指葡萄糖進入細胞，在胞內以葡萄糖、葡萄糖磷酸酯或葡萄糖酸的磷酸酯的形式出現(xiàn)。

第二階段是微生物細胞經(jīng)酵解途徑，將葡萄糖或磷酸葡萄糖降解到處于3C水平的丙酮酸。這個階段不但通過底物水平磷酸化生成ATP，而且向細胞質釋放還原當量。

第三階段是丙酮酸繼續(xù)代謝和代謝產(chǎn)物的分泌。這是區(qū)分葡萄糖的氧化性代謝與發(fā)酵性代謝的關鍵性階段。第58頁/共68頁2023/3/859

如果丙酮酸或由丙酮酸繼續(xù)代謝而生成的可用作還原當量吸收劑的化合物（如乙醛）吸收第二階段釋放的還原當量，生成相應的還原產(chǎn)物（如乙醇）。這時微生物細胞進行發(fā)酵性代謝。這個過程因這些還原產(chǎn)物的分泌而得以進行。第59頁/共68頁2023/3/860如果遺傳與環(huán)境條件許可，丙酮酸相對容易地經(jīng)TCA環(huán)降解，最終可被氧化降解成二氧化碳；第二階段（酵解）及第三階段所釋放的還原當量則被電子傳遞鏈吸收并傳遞給外源的最終電子受體。這時微生物細胞進行氧化性代謝。第60頁/共68頁2023/3/861葡萄糖的氧化性降解代謝與發(fā)酵性降解代謝兩者最基本的區(qū)別在于：氧化性降解代謝除了可以與發(fā)酵性降解代謝一樣通過底物水平磷酸化形成ATP外，還經(jīng)電子傳遞磷酸化產(chǎn)生更多的ATP，從而允許微生物有更高的生物合成速率及更高的細胞得率(細胞對葡萄糖的轉化率)。第61頁/共68頁2023/3/8622.4.4.1與呼吸相對應的代謝能轉換機制

2.3.4.2與發(fā)酵相對應的代謝能轉換機制第62頁/共68頁2023/3