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文檔簡(jiǎn)介
分子生物學(xué)常用檢測(cè)技術(shù)詳解演示文稿當(dāng)前1頁(yè),總共25頁(yè)。優(yōu)選分子生物學(xué)常用檢測(cè)技術(shù)當(dāng)前2頁(yè),總共25頁(yè)。DNA—四種核苷酸(A-T-C-G)組成的多聚骨架所有組成DNA的核苷酸dATP,dTTP,dCTP,dGTP都由三種成分組成:1)一個(gè)2’-脫氧核糖(戊糖)2)一個(gè)含氮堿基嘌呤:A\G嘧啶:T/C3)三個(gè)磷酸基團(tuán)各單個(gè)核苷酸由5’和3’-碳形成的磷酸二酯鍵連接在一起當(dāng)前3頁(yè),總共25頁(yè)。變性、復(fù)性、退火和淬火當(dāng)前4頁(yè),總共25頁(yè)。基因當(dāng)前5頁(yè),總共25頁(yè)。分子生物學(xué)常用技術(shù)
PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))核酸分子雜交基因芯片技術(shù)(biochip)DNA測(cè)序(DNAsequencing)DNA重組技術(shù)(DNArecombination)當(dāng)前6頁(yè),總共25頁(yè)。
一、聚合酶鏈反應(yīng)
(PolymeraseChainReaction,PCR)體外基因擴(kuò)增技術(shù)
特異性強(qiáng)靈敏度高操作簡(jiǎn)單、省時(shí)對(duì)待檢原始材料質(zhì)量要求低高效率的基因擴(kuò)增技術(shù)當(dāng)前7頁(yè),總共25頁(yè)。(一)PCR原理原理雙鏈DNA變性
退火鏈延伸
(膜板)
(雙鏈分成單鏈)
(膜板與引物雜交)
(DNA合成)不斷重復(fù)當(dāng)前8頁(yè),總共25頁(yè)。PCR反應(yīng)體系Mg2+Mn2+dCTPdGTPdTTPdATPTaq
DNA聚合酶模板引物
和或和(二)PCR反應(yīng)的設(shè)計(jì)及影響因素當(dāng)前9頁(yè),總共25頁(yè)。PCR的種類熒光定量PCR通用引物PCR多重PCR巢式PCRRT-PCR原位PCR免疫PCR……當(dāng)前10頁(yè),總共25頁(yè)。TaqMan探針reverseprimerRQforwardprimer3'3'5'5'3'5'5'1.PolymerisationprobeRQ3'3'5'5'3'5'5'2.StranddisplacementQ3'3'5'5'3'5'5'3.CleavageR3'5'5'3'5'5'4.PolymerisationcompletedQRR=ReporterQ=Quencher3'熒光定量PCR當(dāng)前11頁(yè),總共25頁(yè)。定量PCR的數(shù)學(xué)原理PCR理論方程N(yùn)=N0x(1+E)nN:擴(kuò)增數(shù)量N0:起始模板數(shù)量E:擴(kuò)增效率N:循環(huán)數(shù)
Log[DNA]循環(huán)數(shù)線性增長(zhǎng)期Linear平臺(tái)期Plateauy=
N0(1+e)n指數(shù)增長(zhǎng)期Geometric當(dāng)前12頁(yè),總共25頁(yè)。定量PCR的數(shù)學(xué)原理Rn(熒光強(qiáng)度)循環(huán)數(shù)CycleNumber指數(shù)增長(zhǎng)期平臺(tái)期CT=-klogN0+bCt
(Cyclethreshold)值:是指每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號(hào)到達(dá)設(shè)定域值(threshold)時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)。當(dāng)前13頁(yè),總共25頁(yè)。PCR的臨床應(yīng)用對(duì)病原微生物核酸進(jìn)行快速檢測(cè)彌補(bǔ)免疫檢測(cè)的缺陷縮短診斷的窗口期(如HBV,HIV)用于藥物療效監(jiān)測(cè)和評(píng)估用于腫瘤基因表達(dá)方面的研究用于遺傳病的診斷當(dāng)前14頁(yè),總共25頁(yè)。項(xiàng)目標(biāo)本采集HBV無(wú)菌注射器抽取2毫升靜脈血或其它體液注入無(wú)菌試管或抗凝管。HCVEB1.鼻咽拭子或體液標(biāo)本。2.也可取抗凝血標(biāo)本,但一般不推薦。CMV1.尿液:中段晨尿20ml于加蓋試管。其他體液標(biāo)本或咽拭子。也可取抗凝血標(biāo)本,但一般不推薦。TB1.痰液:患者深部咳痰1~3ml于無(wú)菌加蓋試管。2.其他組織標(biāo)本:留于無(wú)菌試管。3.也可取抗凝血標(biāo)本,但一般不推薦。MP呼吸道病毒
咽拭子樣本采集要求當(dāng)前15頁(yè),總共25頁(yè)。項(xiàng)目標(biāo)本采集所需容器CT男性:尿道分泌物:細(xì)小棉拭子伸入尿道約2~4厘米,旋轉(zhuǎn)數(shù)圈取出分泌物(應(yīng)略帶粘膜)。前列腺液、精液。女性:陰道分泌物:用無(wú)菌生理鹽水洗去宮頸外分泌物,再用無(wú)菌棉拭子插入宮頸內(nèi),停5秒后旋動(dòng)棉拭子采取分泌物。尿道分泌物:同上一次性無(wú)菌帶蓋的試管。NGUUTPHPVHSV當(dāng)前16頁(yè),總共25頁(yè)。二、核酸分子雜交根據(jù)核酸變性和復(fù)性的原理,不同來(lái)源的變性單鏈核酸分子在合適的條件下,通過(guò)堿基互補(bǔ)形成雙鏈雜交體的過(guò)程稱為核酸分子雜交(molecularhybridization)。當(dāng)前17頁(yè),總共25頁(yè)。1、遺傳病的診斷2、病原體的鑒定3、癌基因突變的檢測(cè)4、組織配型5、親子鑒定核酸分子雜交的臨床應(yīng)用當(dāng)前18頁(yè),總共25頁(yè)。三、基因芯片技術(shù)基質(zhì)材料分,有尼龍膜、玻璃片、塑料、硅膠晶片、微型磁珠等。當(dāng)前19頁(yè),總共25頁(yè)。
用點(diǎn)樣法固定在玻璃板上的DNA探針陣列原位合成法在玻璃等硬質(zhì)表面上直接合成的寡核苷酸探針陣列當(dāng)前20頁(yè),總共25頁(yè)。基因芯片技術(shù)的應(yīng)用1、藥物篩選和新藥開(kāi)發(fā)2、疾病診斷3、環(huán)境保護(hù)4、司法5、現(xiàn)代農(nóng)業(yè)當(dāng)前21頁(yè),總共25頁(yè)。四、測(cè)序技術(shù)CTTGATCTTCAGGTAGGCCTGAATCCT(一)一代測(cè)序技術(shù)當(dāng)前22頁(yè),總共25頁(yè)。(二)二代測(cè)序技術(shù)Illumina公司的Solexa和Hiseq應(yīng)該說(shuō)是目前全球使用量最大的第二代測(cè)序機(jī)器,這兩個(gè)系列的技術(shù)核心原理是相同的。Illumina/SolexaGenomeAnalyzer測(cè)序的基本原理是邊合成邊測(cè)序。在Sanger等測(cè)序方法的基礎(chǔ)上,通過(guò)技術(shù)創(chuàng)新,用不同顏色的熒光標(biāo)記四種不同的dNTP,當(dāng)DNA聚合酶合成互補(bǔ)鏈時(shí),每添加一種dNTP就會(huì)釋放出不同的熒光,根據(jù)捕捉的熒光信號(hào)并經(jīng)過(guò)特定的計(jì)算機(jī)軟件處理,從而獲得待測(cè)DNA的序列信息。當(dāng)前23頁(yè),總共25頁(yè)。當(dāng)前24頁(yè),總共25頁(yè)。技術(shù)特點(diǎn)比較第一代測(cè)序技術(shù)的主要特
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