蛋白質(zhì)的酶促降解和氨基酸的代謝

當(dāng)前1頁，總共74頁。2.蛋白酶的種類和專一性（結(jié)構(gòu)特征）編號(hào)名稱作用特征實(shí)例3、4、2、13、4、2、2絲氨酸蛋白酶類(serinepritelnase)活性中心含Ser3、4、2、33、4、2、4半胱氨酸蛋白酶類(Thiolpritelnase)活性中心含Cys天冬氨酸蛋白酶類[carboxyl(asid)pritelnase]活性中心含Asp,最適pH在5以下金屬蛋白酶類(metallopritelnase)活性中心含有Zn2+、

Mg2+等金屬胰凝乳蛋白酶胰蛋白酶凝血酶木瓜蛋白酶無花果蛋白酶菠蘿酶胃蛋白酶凝乳酶枯草桿菌蛋白酶嗜熱菌蛋白酶當(dāng)前2頁，總共74頁。3.消化道內(nèi)幾種蛋白酶的專一性（Phe.Tyr.Trp）（Arg.Lys）（脂肪族）胰凝乳蛋白酶胃蛋白酶彈性蛋白酶羧肽酶胰蛋白酶氨肽酶羧肽酶（Phe.Trp）當(dāng)前3頁，總共74頁。二、細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)降解1.細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)降解的意義①基因突變、生物合成誤差、自發(fā)變性、自由基破壞以及環(huán)境脅迫和疾病均可導(dǎo)致反常蛋白的產(chǎn)生，其中有些可以重新恢復(fù)成正常蛋白。②短壽命蛋白雖然不到總蛋白的10％，但卻包括許多代謝途徑的限速酶，控制細(xì)胞周期和細(xì)胞分化、細(xì)胞增殖的蛋白質(zhì)，調(diào)節(jié)基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子等，具有十分重要的生理功能。由于它們的半壽期很短，便于通過基因表達(dá)和降解對(duì)其含量進(jìn)行精確、快速的調(diào)控。另外，生長發(fā)育及細(xì)胞分化過程中代謝途徑的改變，也涉及到酶蛋白的降解。③維持體內(nèi)氨基酸代謝庫。④防御機(jī)制組成部分。⑤蛋白質(zhì)前體的裂解加工。另外，為了有效地利用轉(zhuǎn)基因技術(shù)生產(chǎn)有價(jià)值的蛋白質(zhì)，也需要了解細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)降解機(jī)制，以免這些外來蛋白被轉(zhuǎn)基因生物破壞。當(dāng)前4頁，總共74頁。2.胞內(nèi)蛋白質(zhì)降解系統(tǒng)參與細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)降解的蛋白酶大致可分為兩類：一類是相對(duì)分子質(zhì)量較小、專一性較低、催化過程不需要ATP的蛋白酶和肽酶；另一類是高分子量的多酶復(fù)合物，對(duì)底物蛋白有高度選擇性，催化蛋白質(zhì)水解不僅需消耗ATP而且受到嚴(yán)密的調(diào)控。當(dāng)前5頁，總共74頁。細(xì)胞質(zhì)內(nèi)有兩個(gè)最重要的蛋白質(zhì)降解系統(tǒng)：溶酶體系統(tǒng)包括多種在酸性pH下活化的小分子量蛋白酶，因此又稱為酸性系統(tǒng)，主要水解長壽命蛋白質(zhì)和外來蛋白；泛肽系統(tǒng)則在pH＝7.2的胞液中起作用，因此又稱為堿性系統(tǒng)，主要水解短壽命蛋白和反常蛋白。當(dāng)前6頁，總共74頁。3.蛋白質(zhì)降解的泛肽途徑E1-S-E1-SHE2-S-E1-SHE2-SHE2-SHATPAMP+PPiE3多泛肽化蛋白ATP26S蛋白酶體20S蛋白酶體ATP19S調(diào)節(jié)亞基去折疊水解E1：泛肽激活酶E2：泛肽載體蛋白

E3：泛肽-蛋白質(zhì)連接酶泛肽當(dāng)前7頁，總共74頁。第二節(jié)氨基酸的分解與轉(zhuǎn)化

一、氨基酸的來源與去路二、氨基酸的脫氨基作用三、氨基酸的脫羧基作用四、氨基酸降解產(chǎn)物的去向五、由氨基酸衍生的其他化合物當(dāng)前8頁，總共74頁。一、氨基酸的來源和去路

當(dāng)前9頁，總共74頁。二、氨基酸的脫氨基作用

4、非氧化脫氨基作用5、脫酰胺基作用1、氧化脫氨基作用

2、轉(zhuǎn)氨基作用3、聯(lián)合脫氨基作用當(dāng)前10頁，總共74頁。1、氧化脫氨基作用氨基酸在酶的催化下脫去氨基生成相應(yīng)的α-酮酸的過程稱為氧化脫氨基作用。主要有以下兩種類型：

α-氨基酸

氨基酸氧化酶（FAD、FMN）α-酮酸

R-CH-COO-

NH+3

|

R-C-COO-+NH3O||H2O+O2H2O2

L-谷氨酸脫氫酶+H2O+NH3NAD(P)+NAD(P)H+H+COOHCH2CH2C=OCOOHCOOHCH2CH2CHNH2COOH谷氨酸α-酮戊二酸當(dāng)前11頁，總共74頁。2、轉(zhuǎn)氨基作用

α-氨基酸1

R1-CH-COO-

NH+3

|α-酮酸1

R1-C-COO-O||

R2-C-COO-O||α-酮酸2

R2-CH-COO-

NH+3

|α-氨基酸2轉(zhuǎn)氨酶（輔酶：磷酸吡哆醛）在轉(zhuǎn)氨酶的催化下，α-氨基酸的氨基轉(zhuǎn)移到α-酮酸的酮基碳原子上，結(jié)果原來的α-氨基酸生成相應(yīng)的α-酮酸，而原來的α-酮酸則形成了相應(yīng)的α-氨基酸，這種作用稱為轉(zhuǎn)氨基作用或氨基移換作用。當(dāng)前12頁，總共74頁。

要點(diǎn)：①反應(yīng)可逆。②體內(nèi)除Lys、Gly、Thr、Pro和羥脯氨酸外，大多數(shù)氨基酸都可進(jìn)行轉(zhuǎn)氨基作用。③轉(zhuǎn)氨酶均以磷酸吡哆醛為輔酶。磷酸吡哆醛是VB6的衍生物。反應(yīng)中起傳遞氨基的作用。當(dāng)前13頁，總共74頁。谷丙轉(zhuǎn)氨酶和谷草轉(zhuǎn)氨酶谷丙轉(zhuǎn)氨酶（GPT）谷草轉(zhuǎn)氨酶(GOT)當(dāng)前14頁，總共74頁。磷酸吡哆醛的作用機(jī)理當(dāng)前15頁，總共74頁。3、聯(lián)合脫氨基作用

（1）概念（2）類型a、轉(zhuǎn)氨酶與L-谷氨酸脫氫酶作用相偶聯(lián)b、轉(zhuǎn)氨基作用與嘌呤核苷酸循環(huán)相偶聯(lián)

轉(zhuǎn)氨基作用和氧化脫氨基作用聯(lián)合進(jìn)行的脫氨基作用方式。當(dāng)前16頁，總共74頁。轉(zhuǎn)氨酶與L-谷氨酸脫氫酶作用相偶聯(lián)轉(zhuǎn)氨酶L-谷氨酸脫氫酶H20+NAD(P)+NH3+NAD(P)Hα-酮酸α-氨基酸α-酮戊二酸L-谷氨酸當(dāng)前17頁，總共74頁。轉(zhuǎn)氨基作用與嘌呤核苷酸循環(huán)相偶聯(lián)

α-氨基酸α-酮酸α-酮戊二酸谷氨酸草酰乙酸天冬氨酸腺苷酰琥珀酸蘋果酸延胡索酸腺苷酸次黃苷酸當(dāng)前18頁，總共74頁。4、非氧化脫氨基作用（1）還原脫氨基作用當(dāng)前19頁，總共74頁。（2）脫水脫氨基作用(脫水酶以磷酸吡哆醛為輔酶)（3）由解氨酶催化的脫氨基作用（光照可激活酶）當(dāng)前20頁，總共74頁。5.脫酰胺基作用當(dāng)前21頁，總共74頁。三、氨基酸的脫羧基作用

1、概念

氨基酸在脫羧酶的作用下脫掉羧基生成相應(yīng)的一級(jí)胺類化合物的作用。脫羧酶的輔酶為磷酸吡哆醛。直接脫羧胺羥化脫羧羥胺

2、類型:當(dāng)前22頁，總共74頁。直接脫羧基作用當(dāng)前23頁，總共74頁。羥化脫羧基作用酪氨酸酶是一種含銅酶。多巴進(jìn)一步氧化后形成聚合物黑素。在植物體內(nèi)，由多巴和多巴胺可形成生物堿。當(dāng)前24頁，總共74頁。四、氨基酸降解產(chǎn)物的去向（一）氨的代謝轉(zhuǎn)變（二）鳥氨酸循環(huán)（尿素循環(huán)）（三）-酮酸的代謝轉(zhuǎn)變當(dāng)前25頁，總共74頁。（一）、氨的代謝轉(zhuǎn)變1、重新生成氨基酸雖然通過脫氨基作用產(chǎn)生的氨再用來合成氨基酸時(shí)并不能增加氨基酸的數(shù)量，但卻能改變氨基酸的種類。2、谷氨酰胺和天冬酰氨的生成生成酰胺的形式既是生物體貯藏和運(yùn)輸氨的主要方式，也是解除氨毒的一條主要途徑。3.生成銨鹽保持細(xì)胞內(nèi)正常的PH當(dāng)前26頁，總共74頁。（二）、尿素循環(huán)（1）概念（2）總反應(yīng)和過程在排尿動(dòng)物體內(nèi)由NH3合成尿素是在肝臟中通過一個(gè)循環(huán)機(jī)制完成的，這一個(gè)循環(huán)稱為尿素循環(huán)。NH3+CO2+3ATP+天冬氨酸+2H2ONH2-CO-NH2+

2ADP+

AMP+2PPi+延胡索酸當(dāng)前27頁，總共74頁。鳥氨酸循環(huán)氨基酸谷氨酸谷氨酸氨甲酰磷酸鳥氨酸瓜氨酸瓜氨酸精氨琥珀酸鳥氨酸精氨酸延胡索酸草酰乙酸氨基酸谷氨酸-酮戊二酸天冬氨酸ATPAMP+PPiH2O2ATP+CO2+NH3+H2O2ADP+2Pi基質(zhì)線粒體胞液NH2-C-NH2O尿素當(dāng)前28頁，總共74頁。尿素循環(huán)氨基酸谷氨酸谷氨酸氨甲酰磷酸鳥氨酸瓜氨酸瓜氨酸精氨琥珀酸鳥氨酸精氨酸延胡索酸草酰乙酸氨基酸谷氨酸-酮戊二酸天冬氨酸2ADP+Pi2ATP+CO2+NH3+H2O1細(xì)胞溶液線粒體NH2-C-NH2O尿素-酮戊二酸-酮戊二酸H2N-C-PO2345當(dāng)前29頁，總共74頁。植物體含有脲酶，尤其是在豆科植物種子中脲酶活性較大，能專一地催化尿素水解并放出氨，反應(yīng)式如下：當(dāng)前30頁，總共74頁。（三）、氨基酸碳骨架的轉(zhuǎn)化途徑1、再氨基化生成氨基酸2、轉(zhuǎn)變成糖或脂肪生糖氨基酸可降解為：丙酮酸、草酰乙酸、α-酮戊二酸、琥珀酰CoA和延胡索酸等糖代謝中間物。生酮氨基酸，在體內(nèi)能轉(zhuǎn)變?yōu)橥w．經(jīng)脂肪酸途徑代謝,其分解產(chǎn)物為乙酰coA或乙酰乙酸。純粹生酮：亮氨酸既生酮也生糖：異亮氨酸、賴氨酸、苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸純粹生糖：其它14種氨基酸的。3、氧化供能生成CO2和H2O當(dāng)前31頁，總共74頁。氨基酸碳骨架進(jìn)入三羧酸循環(huán)的途徑草酰乙酸磷酸烯醇式丙酮酸-酮戊二酸天冬氨酸天冬酰氨丙酮酸延胡索酸琥珀酰CoA乙酰CoA乙酰乙酰CoA苯丙氨酸酪氨酸亮氨酸賴氨酸色氨酸丙氨酸蘇氨酸甘氨酸絲氨酸半胱氨酸谷氨酸谷氨酰胺精氨酸組氨酸脯氨酸異亮氨酸亮氨酸纈氨酸苯丙氨酸酪氨酸異亮氨酸甲硫氨酸纈氨酸葡萄糖檸檬酸當(dāng)前32頁，總共74頁。當(dāng)前33頁，總共74頁。琥珀酰CoA延胡索酸草酰乙酸α-酮戊二酸檸檬酸乙酰CoA丙酮酸PEP磷酸丙糖葡萄糖或糖原糖α-磷酸甘油脂肪酸脂肪甘油三酯乙酰乙酰CoA丙氨酸半胱氨酸絲氨酸蘇氨酸色氨酸異亮氨酸亮氨酸色氨酸天冬氨酸天冬酰胺苯丙氨酸酪氨酸異亮氨酸蛋氨酸絲氨酸蘇氨酸纈氨酸酮體亮氨酸賴氨酸酪氨酸色氨酸苯丙氨酸谷氨酸精氨酸谷氨酰胺組氨酸纈氨酸CO2CO2氨基酸、糖及脂肪代謝的聯(lián)系TAC當(dāng)前34頁，總共74頁。五、由氨基酸衍生的其他化合物1、多胺多胺是生物體在代謝過程中產(chǎn)生的具有生物活性的低分子量的脂肪含氮堿。多胺的功能：①多胺的積累可增加細(xì)胞間滲透物質(zhì)濃度，調(diào)節(jié)水分丟失：②腐胺可作為細(xì)胞pH緩沖劑，也可能有助于H+或其它陽離子通過質(zhì)膜；③更重要的是多胺可抑制RNase和蛋白酶活性，這兩種酶與各種脅迫對(duì)細(xì)胞引起的傷害與衰老有密切關(guān)系。因此，多胺能保護(hù)質(zhì)膜和原生質(zhì)免于自發(fā)的或外界傷害引起的分解破壞。當(dāng)前35頁，總共74頁。2、生氰糖苷生氰糖苷是植物特有的含N化合物，其是α-羥基腈的碳水化合物的衍生物，也叫氰醇的糖苷。許多植物都能合成產(chǎn)生氫氰酸的生氰糖苷。在活植物中，由于這種生氰糖苷和能催化它們水解的酶在空間上被分隔開來．所以，對(duì)植物并無毒害作用。當(dāng)前36頁，總共74頁。3、生物堿

生物堿是一類堿性的植物次生代謝產(chǎn)物，很多有藥理作用。真生物堿：具有含氮雜環(huán)的生物堿原生物堿：沒有含氮雜環(huán)的生物堿。絕大多數(shù)生物堿的生物合成前體物質(zhì)是氨基酸。生物堿的功能：1.植物體內(nèi)的生物堿能作為防止它種生物危害的保護(hù)劑或威懾劑，從而具有重要的生態(tài)學(xué)功能。2.它可以作為生長調(diào)節(jié)劑，特別是作為種子萌發(fā)的抑制劑；3.由于生物堿大都具有螯合能力，在細(xì)胞內(nèi)可幫助維持離子平衡；4.生物堿能作為植物的含氮分泌物；5.它們可作為植物體內(nèi)貯存氮的化合物。當(dāng)前37頁，總共74頁。4、由氨基酸衍生的植物激素和動(dòng)物激素高等植物體內(nèi)由氨基酸衍生的植物激素主要是生長素類和乙烯。高等動(dòng)物激素多數(shù)為多肽和蛋白質(zhì)類，但有一些由氨基酸衍生來。當(dāng)前38頁，總共74頁。5、由氨基酸衍生的輔酶生物體內(nèi)的許多輔酶或輔基都具有核苷酸和含氮雜環(huán)的分子結(jié)構(gòu)。這些核苷酸和含氮雜環(huán)又大都由氨基酸衍生或作為前體物質(zhì)合成。6、卟啉類色素的生成生物體內(nèi)重要的卟啉衍生物是與鐵或鎂螯合形成的金屬卟啉。鐵卟啉類色素生物合成的前體物質(zhì)是甘氨酸和琥珀酰輔酶A。鎂卟啉類合成的前體是谷氨酸。當(dāng)前39頁，總共74頁。7、木質(zhì)素的生物合成木質(zhì)素是一類化合物的集合名稱，并不是一種特定的物質(zhì)。木質(zhì)素的結(jié)構(gòu)單位香豆醇、松柏醇和芥子醇等，其常以糖苷形式儲(chǔ)存，一旦需要合成木質(zhì)素，它們便從糖苷中釋放出來自發(fā)地進(jìn)行聚合反應(yīng)以形成木質(zhì)素分子。由于這種聚合過程不是酶促反應(yīng)，各種游離基的聚合又是隨機(jī)的，這就使得木質(zhì)素分子的結(jié)構(gòu)非常復(fù)雜。8、兒茶酚類和黑色素植物體內(nèi)的酚類化合物包括簡單的酚、酚酸、酚丙烷、丹寧、木脂素、黑色素類和木質(zhì)素。常見的酚有對(duì)羥基醌、兒茶酚、間苯三酚等。動(dòng)物體內(nèi)的黑素，一般稱為真黑素，因?yàn)閯?dòng)物黑素含有氮，而植物體的兒茶酚黑素不含氮。動(dòng)物黑素是由酪氨酸的衍生物吲哚—5，6—醌聚合形成的。當(dāng)前40頁，總共74頁。第三節(jié)自然界的氮素循環(huán)硝酸鹽亞硝酸NH3生物固氮工業(yè)固氮固氮生物動(dòng)植物硝酸鹽還原大氣固氮大氣氮素巖漿源的固定氮火成巖反硝化作用氧化亞氮蛋白質(zhì)入地下水動(dòng)植物廢物死的有機(jī)體當(dāng)前41頁，總共74頁。第四節(jié)生物固氮的生物化學(xué)一、生物固氮的概念生物固氮是微生物、藻類和與高等植物共生的微生物通過自身的固氮酶復(fù)合物把分子氮變成氨的過程。

自然界通過生物固氮的量且可達(dá)每年1011kg，約占地球上的固氮量的60％，閃電和紫外輻射固定氮約15％，其余為工業(yè)固氮。6e-當(dāng)前42頁，總共74頁。二、固氮生物的類型1．自生固氮微生物是指獨(dú)立生活時(shí)能使氣態(tài)氮固定為NH3的少數(shù)微生物。它們固氮有兩種方式：第一種方式是利用光能還原氮?dú)?。如魚腥藻、念球藻，固氮過程與還原CO2類似。藍(lán)藻固氮是在異型細(xì)胞里進(jìn)行，因?yàn)楣痰^程要求無氧條件。另一些微生物如紅螺菌、紅色極毛桿菌、綠桿菌等也能利用光能從硫、硫化物、氫或有機(jī)物取得電子進(jìn)行固氮。第二種方式是利用化學(xué)能固氮。如好氣性固氮菌、貝氏固氮菌及厭氣的巴斯德梭菌和克氏桿菌等。

當(dāng)前43頁，總共74頁。2共生固氮微生物如與豆科植物共生固氮的根瘤菌，其專一性強(qiáng)，不同的菌株只能感染一定的植物，形成共生的根瘤。在根瘤中植物為固氮菌提供碳源，而細(xì)菌利用植物提供的能源固氮，為植物提供氮源，形成一個(gè)很好的互利共生體系。當(dāng)前44頁，總共74頁。三、固氮酶復(fù)合物生物固氮過程由固氮酶復(fù)合物完成。1.固氮酶復(fù)合物由兩種蛋白組分構(gòu)成：還原酶，它提供具有高還原勢(shì)的電子；二聚體、含F(xiàn)e和S，形成[Fe4S4]簇固氮酶，它利用還原酶提供的高能電子還原N2成NH4+。四聚體（α2β2），含Mo、Fe和S當(dāng)前45頁，總共74頁。2.作用機(jī)理：3.生物固氮的總反應(yīng)式：當(dāng)前46頁，總共74頁。四、生物固氮所需的條件①充分的ATP供應(yīng)。豌豆根系固氮細(xì)菌消耗植株ATP產(chǎn)量的近五分之一；②需要很強(qiáng)的還原劑。高還原勢(shì)電子來自還原型鐵氧還蛋白，其是光合鏈的電子載體。鐵氧還蛋白的再生或來自光合作用，或來自氧化過程；③需要厭氧環(huán)境，固氮酶對(duì)氧十分敏感，只有在嚴(yán)格的厭氧條件下才能固氮。豆紅蛋白當(dāng)前47頁，總共74頁。五、固氮過程的氫代謝1．固氮酶的放氫反應(yīng)固氮的同時(shí)還原氫，這一反應(yīng)需要ATP，CO不能抑制。2．氫酶的放氫反應(yīng)氫酶也是一種鐵硫蛋白，這一反應(yīng)不需要ATP，受CO抑制。3.吸氫酶催化H2的氧化作用產(chǎn)物為H2O．并伴有ATP生成，反應(yīng)受KCN抑制。當(dāng)前48頁，總共74頁。第五節(jié)硝酸還原作用硝酸還原作用的化學(xué)本質(zhì)植物體內(nèi)由硝酸還原成氨的總反應(yīng)式如下:NH+4NO-32e-6e-硝酸還原酶亞硝酸還原酶NO-2當(dāng)前49頁，總共74頁。一、硝酸還原酶（硝酸鹽和光照可誘導(dǎo)其活性）a、鐵氧還蛋白——硝酸還原酶b、NAD(P)H-硝酸還原酶+++NO-3H2O2Fd還原態(tài)2H+NO-22Fd氧化態(tài)+++++H2ONAD(P)HH+NO-2NAD(P)+NO3-當(dāng)前50頁，總共74頁。二、亞硝酸還原酶2H2Oa、鐵氧還蛋白——亞硝酸還原酶NO-2+6Fd還原態(tài)+8H+NH+4+6Fd氧化態(tài)+2H2Ob、NAD(P)H——亞硝酸還原酶NO-2+3NAD(P)H++NH+4+3NAD(P)++5H+調(diào)控：光照對(duì)亞硝酸還原有促進(jìn)作用當(dāng)植物缺鐵時(shí)，亞硝酸的還原即受阻。亞硝酸還原時(shí)需要氧，因而在厭氧條件下，亞硝酸的還原會(huì)受到阻礙。當(dāng)前51頁，總共74頁。第六節(jié)氨的同化一、谷氨酸合成1.谷氨酰胺合成酶谷氨酰胺合成酶催化谷氨酸和氨反應(yīng)形成谷氨酰胺，此酶對(duì)NH3有高親和性，完成反應(yīng)還需ATP水解提供的能量。形成谷氨酰胺既是氨同化的一種方式，又可消除過高氨濃度帶來的毒害，還可作為氨的供體，用于谷氨酸的合成。可見，在谷氨酰胺合成酶和谷氨酸合酶的共同作用下，可由一分子氨和一分子—酮戊二酸凈合成一分子谷氨酸。當(dāng)前52頁，總共74頁。當(dāng)前53頁，總共74頁。2、谷氨酸脫氫酶

谷氨酸脫氫酶存在于所有生物體內(nèi)．但對(duì)氨同化來說，谷氨酸脫氫酶的作用不甚重要，它主要參與氨基酸的降解代謝。當(dāng)前54頁，總共74頁。二、氨甲酰磷酸

同化氨的另一途徑是氨甲酰磷酸的形成。在植物體內(nèi)，氨甲酰磷酸中的氨基來自谷氨酰胺而不是氨。氨甲酰激酶催化的反應(yīng)：氨甲酰磷酸合成酶催化的反應(yīng)：當(dāng)前55頁，總共74頁。第七節(jié)氨基酸的生物合成一、氨基酸