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高分辨率的“受激發(fā)射顯微鏡”(Super-resolutionmicroscopy)Imagingchromophoreswithundetectablefluorescencebystimulatedemissionmicroscopy
要在衍射極限之外成像(比如說(shuō)為了觀測(cè)細(xì)胞中的微小結(jié)構(gòu)),研究人員迄今為止必需依賴于用熒光發(fā)色團(tuán)對(duì)成像目標(biāo)進(jìn)行標(biāo)記,或依賴于不利用熒光、但靈敏度也要差得多的其他顯微鏡技術(shù)?,F(xiàn)在,來(lái)自哈佛大學(xué)化學(xué)與化學(xué)生物學(xué)系的一個(gè)小組開(kāi)發(fā)出了另外一種技術(shù),被稱為“受激發(fā)射顯微鏡”,它結(jié)合了以前用在其他多光子顯微鏡中的實(shí)驗(yàn)技術(shù)。該方法的靈敏度在包括無(wú)標(biāo)記微管成像和用一個(gè)“chromogenicreporter”來(lái)監(jiān)測(cè)lacZ基因表達(dá)的應(yīng)用中得到展示。該方法的靈敏度比吸收方法高幾個(gè)數(shù)量級(jí),不受樣品中其他發(fā)色團(tuán)的干擾,而且適用于三維切片觀測(cè)。重要的是,所有分子都是“受激發(fā)射顯微鏡”的潛在觀測(cè)目標(biāo),所以它可用來(lái)對(duì)不發(fā)熒光的物質(zhì)進(jìn)行成像觀測(cè),如血紅蛋白,這些物質(zhì)以前用超高分辨率的顯微鏡無(wú)法觀測(cè)。(Letterp.1105;News&Views)
現(xiàn)在是1頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三第十二章細(xì)胞核THECELLNUCLEUS現(xiàn)在是2頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三1781年Trontana發(fā)現(xiàn)于魚(yú)類細(xì)胞;1831年,Brown發(fā)現(xiàn)于植物。大?。褐参?~4μm,動(dòng)物10μm。正常細(xì)胞核質(zhì)比NP≈0.5,分裂期細(xì)胞NP>0.5,衰老細(xì)胞NP<0.5。現(xiàn)在是3頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三形狀:圓形,胚乳(網(wǎng)狀)、蝶類絲腺(分支狀)。位置:細(xì)胞中央,成熟植物細(xì)胞的邊緣。數(shù)目:通常一個(gè),成熟的篩管和哺乳動(dòng)物紅細(xì)胞(0)、肝細(xì)胞、心肌細(xì)胞(1-2)、破骨細(xì)胞(6~50)、骨骼肌細(xì)胞(數(shù)百)、植物氈絨層細(xì)胞(2~4)。現(xiàn)在是4頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三Nucleusstructure結(jié)構(gòu):①核被膜、②核仁、③核基質(zhì)、④染色質(zhì)、⑤核纖層。功能:①遺傳、②發(fā)育。現(xiàn)在是5頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三第一節(jié)核被膜
Nuclearenvelope現(xiàn)在是6頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三一、核被膜是雙層膜結(jié)構(gòu)外核膜:來(lái)源于內(nèi)質(zhì)網(wǎng),附有核糖體。核周隙:寬20~40nm,與ER腔相通。核纖層:內(nèi)核膜內(nèi)表面的纖維網(wǎng)絡(luò),支持核膜,并與染色質(zhì)、核骨架相連?,F(xiàn)在是7頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三Thenuclearenvelope現(xiàn)在是8頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三核纖層由核纖肽構(gòu)成,屬IF,分A、B兩型。作用:1.保持核的形態(tài):2.參與染色質(zhì)和核的組裝:M期核纖層被磷酸化,核膜解體。B型核纖肽與核膜殘余小泡結(jié)合,A型溶于胞質(zhì)。分裂末期,核纖肽去磷酸化重新組裝,介導(dǎo)核膜重建。現(xiàn)在是9頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三Thestructureoflamin現(xiàn)在是10頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三Lamins現(xiàn)在是11頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三現(xiàn)在是12頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三二、核孔是物質(zhì)運(yùn)輸?shù)耐ǖ?/p>
由至少50種不同的pr構(gòu)成,稱為核孔復(fù)合體(nuclearporecomplex,NPC)。一般哺乳動(dòng)物細(xì)胞約3000個(gè)核孔。電鏡下觀察核孔呈圓形或八角形,一般認(rèn)為其結(jié)構(gòu)如fish-trap。現(xiàn)在是13頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三Cytoplasmicface
cytoplasmicparticles現(xiàn)在是14頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三Nuclearface
basketinnercomplex現(xiàn)在是15頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三TheNuclearPore現(xiàn)在是16頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三三、通過(guò)核孔的物質(zhì)運(yùn)輸與信號(hào)序列有關(guān)核定位信號(hào)(NLS):引導(dǎo)蛋白進(jìn)入細(xì)胞核,受體為importin,4-8個(gè)氨基酸組成,含Pro、Lys和Arg。完成核輸入后不被切除。第一個(gè)被確定的NLS是病毒SV40的T抗原,其NLS為:Pro-Pro-Lys-Lys-Lys-Arg-Lys-Val現(xiàn)在是17頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三核輸出信號(hào)(NES),引導(dǎo)RNP輸出細(xì)胞核,受體為exportin。Ran蛋白,屬G蛋白,調(diào)節(jié)貨物復(fù)合體的解體或形成。蛋白輸入過(guò)程參見(jiàn)下圖:現(xiàn)在是18頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三ProcessofNuclearImport現(xiàn)在是19頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三ColloidalgoldlabeledNucleoplasminweretransportedintonucleus.Mitochondrion現(xiàn)在是20頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三第二節(jié)染色體1848年,Hofmeister發(fā)現(xiàn)于鴨跖草的小孢子母細(xì)胞。1879年,F(xiàn)lemming提出Chromatin。1888年,Waldeyer提出Chromosome?,F(xiàn)在是21頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三一、染色質(zhì)的化學(xué)組成組成:DNA、組蛋白、非組蛋白、少量RNA。比例:1:1:(1-1.5):0.05?,F(xiàn)在是22頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三(一)DNA3種序列:①單一序列;②中度重復(fù)序列(101~5);③高度重復(fù)序列(>105)。3種構(gòu)像:①B-DNA、②Z-DNA、③A-DNA。3種基本元素:①自主復(fù)制序列(ARS);②著絲粒序列(CEN);③端粒序列(TEL)。YAC與BAC:含上述3種成分,用于轉(zhuǎn)基因?,F(xiàn)在是23頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三THREE
DNA
CONFORMATIONS現(xiàn)在是24頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三主要特征螺旋類型ABZ螺旋直徑螺旋方向螺旋值/bpbp/每圈螺旋垂直升距/bp螺旋軸位置大溝小溝23A右手+34.7o11.02.56A位于大溝,不穿過(guò)堿基對(duì)窄而深寬而淺19A右手+34.6o10.43.38A穿過(guò)堿基對(duì)寬而深窄而淺12A左手-30o12.05.71A位于小溝,不穿過(guò)堿基對(duì)平坦窄而深現(xiàn)在是25頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三THREEKEYREGIONSOFACHROMOSOME現(xiàn)在是26頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三(二)組蛋白帶正電荷,含Arg,Lys,屬堿性蛋白,共5種,分為:核心組蛋白(corehistone):H2A、H2B、H3、H4;連接組蛋白(linkerhistone):H1?,F(xiàn)在是27頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三結(jié)構(gòu):高度保守,尤其是H4。核心組蛋白由球形部和尾部構(gòu)成,球形部借Arg與磷酸二脂骨架間的靜電作用使DNA分子纏繞在組蛋白核心上,形成核小體,尾部含有大量Arg和Lys,為轉(zhuǎn)譯后修飾的部位。H1多樣性,具有屬和組織特異性?,F(xiàn)在是28頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三(三)非組蛋白序列特異性DNA結(jié)合蛋白。特性:帶負(fù)電,屬酸性蛋白。整個(gè)細(xì)胞周期都合成,組蛋白只在S期合成。能識(shí)別特異DNA序列,結(jié)合籍氫鍵和離子鍵。功能:幫助DNA折疊、復(fù)制;調(diào)節(jié)基因表達(dá)?,F(xiàn)在是29頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三二、從DNA到染色體核小體(nucleosome):一種串珠狀結(jié)構(gòu),由核心顆粒和連結(jié)線DNA兩部分組成,通過(guò)酶消化實(shí)驗(yàn)建立。核小體單位包括約200bp的DNA、一個(gè)組蛋白核心和一個(gè)H1?,F(xiàn)在是30頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三由H2A、H2B、H3、H4各兩分子形成八聚體,構(gòu)成核心顆粒;DNA分子以左手螺旋纏繞在核心顆粒表面,每圈80bp,共1.75圈,約146bp,兩端被H1鎖合;相鄰核心顆粒之間為一段60bp的連接線DNA。
現(xiàn)在是31頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三在低鹽親水介質(zhì)中展開(kāi)的染色質(zhì),示串珠狀的核小體(JA,Gall1981)現(xiàn)在是32頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三通過(guò)核小體長(zhǎng)度壓縮7倍,形成11nm纖維。電鏡下觀察用溫和方法分離的染色質(zhì)是直徑30nm的纖維,有兩種解釋:①由核小體螺旋化形成,每6個(gè)核小體繞一圈,長(zhǎng)度壓縮6倍;②由核小體纖維Z字形折疊而成,長(zhǎng)度壓縮40倍?,F(xiàn)在是33頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三現(xiàn)在是34頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三solenoid現(xiàn)在是35頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三對(duì)更高級(jí)染色體包裝方式,至今尚不明確。目前多認(rèn)為30nm的纖維折疊為一系列的環(huán)(loop)結(jié)合在核骨架上(或稱染色體骨架),結(jié)合點(diǎn)是富含AT的區(qū)域?,F(xiàn)在是36頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三ChromatinPacking現(xiàn)在是37頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三ChromatinPacking現(xiàn)在是38頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三Nucleoidspreadwith2longaxesmadeupofbundlesoffibres現(xiàn)在是39頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三Radialloopsofchromatininundisruptedchromosomes現(xiàn)在是40頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三humanchromosome2現(xiàn)在是41頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三三、異染色質(zhì)和常染色質(zhì)常染色質(zhì)是具有轉(zhuǎn)錄活性的染色質(zhì),結(jié)構(gòu)疏松,電子密度低。異染色質(zhì)的特點(diǎn):①凝縮狀態(tài),無(wú)轉(zhuǎn)錄活性、是遺傳惰性區(qū)。②在細(xì)胞周期中表現(xiàn)為晚復(fù)制、早凝縮。③分為兩類:結(jié)構(gòu)異染色質(zhì)、兼性異染色質(zhì)現(xiàn)在是42頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三雌性哺乳動(dòng)物細(xì)胞中一條異固縮化的X染色體。人胚胎發(fā)育16天后出現(xiàn)巴氏小體。barrbody巴氏小體現(xiàn)在是43頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三四、染色體一、染色體相關(guān)的術(shù)語(yǔ)現(xiàn)在是44頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三核仁組織區(qū)(NORs)構(gòu)成核仁,位于染色體的次縊痕區(qū),但并非所有的次縊痕都是NORs。現(xiàn)在是45頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三Howanucleolusisorganized現(xiàn)在是46頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三端粒(telomere):由高度重復(fù)的短序列組成。作用:維持染色體穩(wěn)定性。起細(xì)胞分裂計(jì)時(shí)器的作用。DNA每復(fù)制一次端粒減少50~100bp。現(xiàn)在是47頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三(二)染色體的數(shù)目性細(xì)胞染色體為單倍體,用n表示;體細(xì)胞為2倍體,以2n表示,還有一些物種的染色體成倍增加成為4n、6n、8n等,稱為多倍體。染色體的數(shù)目因物種而異。現(xiàn)在是48頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三(三)著絲粒的結(jié)構(gòu)著絲粒(centromere)和著絲點(diǎn)(kinetochore)是兩個(gè)不同的概念。著絲粒包含3個(gè)結(jié)構(gòu)域:1.著絲點(diǎn)結(jié)構(gòu)域(kinetochoredomain)位于著絲粒的表面,包括三層板狀結(jié)構(gòu)和圍繞外層的纖維冠(fibrouscorona)?,F(xiàn)在是49頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三2.中央結(jié)構(gòu)域位于著絲粒結(jié)構(gòu)域的下方,含α衛(wèi)星DNA。3.配對(duì)結(jié)構(gòu)域位于著絲粒內(nèi)層,中期連結(jié)染色單體。4.著絲點(diǎn)蛋白用ACAs發(fā)現(xiàn)的著絲粒蛋白主要有6種(CENPA-F)現(xiàn)在是50頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三OPinterzoneIP現(xiàn)在是51頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三SatelliteDNA(FISHimage)現(xiàn)在是52頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三ProteinsassociatedwiththecentromerehavebeenidentifiedusingantibodiesfromsclerodermapatientsCENPproteinsCENP-A
centromere-specifichistoneCENP-B
bindscentraldomainsatelliteDNACENP-C
bindskinetochoreCENP-D
bindskinetochoreCENP-E
kinesin-likemotor,involvedinchromatidsegregationCENP-F
bindskinetochoreINCENPproteinsINCENP-A sisterchromatidassociationINCENP-B sisterchromatidassociationCentromericproteins
現(xiàn)在是53頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三(四)核型與帶型1.核型:物種中期染色體特征的總和(染色體數(shù)目、大小、形態(tài))。2.帶型:染色體經(jīng)理化因素處理后染色,呈現(xiàn)穩(wěn)定的帶紋(band)。分帶技術(shù)分兩類:一類是產(chǎn)生的染色帶分布在整過(guò)染色體的長(zhǎng)度上如:Q、G和R帶,另一類是局部性的顯帶,如C、Cd、T和N帶?,F(xiàn)在是54頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三現(xiàn)在是55頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三現(xiàn)在是56頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三現(xiàn)在是57頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三現(xiàn)在是58頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三(五)幾類的特殊的染色體1.多線染色體:Balbiani(1881)發(fā)現(xiàn)于搖蚊幼蟲(chóng)唾腺細(xì)胞,特點(diǎn):①體積巨大,是由于核內(nèi)有絲分裂的結(jié)果;②多線性;③體細(xì)胞聯(lián)會(huì);④橫帶紋;⑤膨突和環(huán)。在幼蟲(chóng)發(fā)育的某個(gè)階段,多線染色體的某些帶區(qū)疏松膨大,形成膨突(puff),或巴氏環(huán)(Balbianiring)。用H3-UdR處理細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)膨突被標(biāo)記,說(shuō)明膨突是基因活躍轉(zhuǎn)錄的區(qū)域?,F(xiàn)在是59頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三Polytenechromosomes現(xiàn)在是60頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三2.燈刷染色體見(jiàn)于魚(yú)類、兩棲類、爬行類雙線期卵母細(xì)胞,雙線期是卵黃合成的旺盛期。染色體主軸兩側(cè)有側(cè)環(huán),狀如燈刷,故名。側(cè)環(huán)是轉(zhuǎn)錄活躍的區(qū)域。3.B染色體Randolph(1928)把生物的正常染色體叫做A染色體,把形態(tài)和行為不同為A染色體的超數(shù)染色體稱B染色體?,F(xiàn)在是61頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三(六)間期染色體非隨機(jī)分布,不同染色體具有各自的分布域,稱為染色體域(chromosometerritory)。基因密度高的染色體(如19號(hào))分布于核中心,基因密度低的(如18號(hào))分布于核的周邊區(qū)域。同一染色體上,活動(dòng)染色質(zhì)可能位于細(xì)胞核的中心、遠(yuǎn)著絲點(diǎn)區(qū)域、或形成疏松的環(huán)狀結(jié)構(gòu)?,F(xiàn)在是62頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三(a)12號(hào)染色體紅色;14號(hào)黃色;15號(hào)綠色,(注意同源染色體的分布);(b,c)12號(hào)染色體綠色,14號(hào)紅色
,15號(hào)藍(lán)色;(d)染色體域模式圖小鼠淋巴細(xì)胞染色體的空間分布(LA.Parada和TMisteli2002)現(xiàn)在是63頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三第三節(jié)核仁間期細(xì)胞核內(nèi)呈圓球形的結(jié)構(gòu),一般1~2個(gè)。功能是轉(zhuǎn)錄rRNA和組裝核糖體亞單位。蛋白合成旺盛和分裂增殖較快的細(xì)胞有較大和較多的核仁,反之核仁很小或缺如。核仁在分裂前期消失,末期又重新出現(xiàn)。現(xiàn)在是64頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三一、核仁形態(tài)①纖維中心:是致密纖維包圍的低電子密度的圓形結(jié)構(gòu),主要成分為RNA聚合酶和rDNA。②致密纖維組分:呈環(huán)形或半月形包圍FC,由致密纖維構(gòu)成,是新合成的RNP。③顆粒組分:由直徑15-20nm的顆粒構(gòu)成,是不同加工階段的RNP?,F(xiàn)在是65頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三Nucleolus現(xiàn)在是66頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三(一)結(jié)構(gòu)含40%蛋白、60%RNA,2亞單位構(gòu)成。分為70S和80S兩類。大小亞單位只在合成蛋白時(shí)結(jié)合在一起,合成終止后解離。多個(gè)核糖體結(jié)合在一條mRNA上,稱多聚核糖體。二、核糖體ribosome現(xiàn)在是67頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三核糖體的組成現(xiàn)在是68頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三ProteinSynthesis現(xiàn)在是69頁(yè)\一共有77頁(yè)\編輯于星期三(二)核糖體組裝rDNA為重復(fù)基因,人體細(xì)胞中約有200個(gè)拷貝,rDNA沒(méi)有組蛋白核心,
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