第十微生物的分類和鑒定

第十微生物的分類和鑒定第1頁(yè)，共11頁(yè)，2023年，2月20日，星期二第一節(jié) 通用分類單元種以上的系統(tǒng)分類單元界Kingdom門Phylum（或Division）——亞門綱Class——亞綱

——超目 目Order——亞目 科Family——亞科

——族

——亞族 屬Genus

種Species第2頁(yè)，共11頁(yè)，2023年，2月20日，星期二種的概念定義：種是一個(gè)基本分類單位，是一大群表型特征高度相似、親緣關(guān)系極其接近、與同屬內(nèi)其他種有明顯差異的菌株的總稱。在微生物中，一個(gè)種只能用該種內(nèi)的一個(gè)典型菌株作為具體標(biāo)本，它就是該種的模式種。新種：sp.nov.或nov.sp.，新被鑒定的種發(fā)表時(shí)應(yīng)在其學(xué)名后標(biāo)上sp.nov.的符號(hào)，新種發(fā)表前應(yīng)將其模式菌株的培養(yǎng)物存放在一個(gè)永久性的保藏機(jī)構(gòu)，并應(yīng)允許人們從中取得。第3頁(yè)，共11頁(yè)，2023年，2月20日，星期二微生物的學(xué)名命名：菌種的科學(xué)名稱。菌種的學(xué)名是按照《國(guó)際細(xì)菌命名法規(guī)》命名的國(guó)際學(xué)術(shù)界公認(rèn)，并通用的名稱。命名原則：學(xué)名=屬名+種的加詞+（首次定名人）+現(xiàn)名定名人和鮮明定名年份規(guī)定與常識(shí)：屬名應(yīng)大寫首字母、單數(shù)、可以組合外而成。種的加詞代表一個(gè)種的次要特征，首字小寫第4頁(yè)，共11頁(yè)，2023年，2月20日，星期二亞種以下的分類單元亞種（subspeciers）：種的進(jìn)一步細(xì)分，一般指其某一民而穩(wěn)定的特征與模式中不同的種常在種名、署名的加詞后寫上subsp.然后再寫具體亞種的加詞；變種（variety）：容易引起混亂；型form：使用中用型作為后綴；表示細(xì)菌菌株，現(xiàn)已作廢；類群（group）：沒有分類地位非正式地指定一組具有某些共同性狀的生物；菌株（strain）：表示任何由一個(gè)獨(dú)立分離的單細(xì)胞繁殖而成的純種群體極其一切后代；實(shí)際上是一個(gè)微生物達(dá)到遺傳性純的標(biāo)志。小種（race）：涵義較亂，在不同分支學(xué)科中由不同涵義；相（phase）：自然界存在的微生物交互變異的一定階段；態(tài)（state）：通常指微生物的菌落變異狀態(tài)。第5頁(yè)，共11頁(yè)，2023年，2月20日，星期二第二節(jié) 微生物在自然界的地位生物的界級(jí)分類學(xué)說(shuō)：是在認(rèn)識(shí)發(fā)展過程中存在的對(duì)生物分類的不同階段的不同觀點(diǎn)。如：二界系統(tǒng)、三界系統(tǒng)、四界系統(tǒng)、五界系統(tǒng)、六界系統(tǒng)和三原界系統(tǒng)三原界系統(tǒng)是1978年由R.H.Whittaker和L.Margulis提出的。所有生物存在一個(gè)共同祖先，由它分三條進(jìn)化路線，就形成了三個(gè)原界：古細(xì)菌原界（Archaebacter）、真細(xì)菌原界、真核生物原界提出了內(nèi)共生學(xué)說(shuō)，主要是Margulis的貢獻(xiàn)第6頁(yè)，共11頁(yè)，2023年，2月20日，星期二三原界系統(tǒng)示意圖第7頁(yè)，共11頁(yè)，2023年，2月20日，星期二第三節(jié) 各大類微生物的分類系統(tǒng)綱要原核生物分類系統(tǒng)綱要——伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)真菌界分類系統(tǒng)很多，各國(guó)采用不同的系統(tǒng)，比較混亂。近年來(lái)為較多人接受的是Ainsworth的綱要。第8頁(yè)，共11頁(yè)，2023年，2月20日，星期二第四節(jié) 微生物的鑒定主要步驟：純化、測(cè)定一系列必要的指標(biāo)、查找權(quán)威性鑒定手冊(cè)鑒定技術(shù)的不同水平：細(xì)胞的形態(tài)和習(xí)性：形態(tài)特征、運(yùn)動(dòng)、酶反應(yīng)、營(yíng)養(yǎng)要求及生長(zhǎng)條件等細(xì)胞組分水平：細(xì)胞壁成分、氨基酸庫(kù)、脂類、醌類、光合色素等的分析蛋白質(zhì)水平：氨基酸序列分析、凝膠電泳和血清學(xué)反應(yīng)等基因或DNA水平：核酸分子雜交、（G+C）mol%、轉(zhuǎn)化和轉(zhuǎn)導(dǎo)、16SrRNA寡核苷酸族分分析、DNA或RNA核苷酸序列分析等第9頁(yè)，共11頁(yè)，2023年，2月20日，星期二數(shù)值分類法即統(tǒng)計(jì)分類法，在200年前M.Adanson（1727~1806，法國(guó)植物學(xué)家）發(fā)表的分類原理基礎(chǔ)上結(jié)合現(xiàn)代計(jì)算機(jī)技術(shù)發(fā)展而來(lái)的。主要觀點(diǎn)：在一個(gè)分類群中，其所含信息量越大，即分類所依據(jù)的性狀越多，其分類效果也越好；順序建立自然分類單元時(shí)，每個(gè)性狀都是等權(quán)的；任何兩分類實(shí)體間的整體相似性，都是由每一對(duì)的相似性計(jì)算而來(lái)的；能夠由類群間相似性的差異識(shí)別不同的分類實(shí)體；如果給予有關(guān)進(jìn)化途徑和機(jī)制的某些假定，可以從組群的分類學(xué)結(jié)構(gòu)或從性狀相關(guān)上作出種系發(fā)生的推論；分類學(xué)應(yīng)作為一門經(jīng)驗(yàn)科學(xué)來(lái)看待和實(shí)踐；數(shù)值分類學(xué)是以表象相似性為基礎(chǔ)的。第10頁(yè)，共11頁(yè)，2023年，2月20日，星期二數(shù)值分類的