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文檔簡介
血清蛋白質(zhì)聚丙烯酰胺凝膠圓盤電泳1第1頁/共18頁【實驗原理】盤狀電泳是在垂直的玻璃管內(nèi),利用不連續(xù)的凝膠孔徑、緩沖液的組成和pH系統(tǒng)進行的電泳。被分離的樣品區(qū)呈圓盤狀。不連續(xù)盤狀電泳應(yīng)用了三個物理效應(yīng):樣品濃縮效應(yīng)、凝膠的分子篩效應(yīng)和一般電泳分離的電荷效應(yīng)。具體原理見本章理論部分。采用該技術(shù)可分離得到血清蛋白質(zhì)的12~30個部分。第2頁/共17頁第2頁/共18頁圓盤電泳
聚丙烯酰胺是由丙烯酰胺和交聯(lián)劑亞甲基雙丙烯酰胺在催化劑作用下,聚合交聯(lián)而成,具有網(wǎng)狀立體結(jié)構(gòu)的凝膠,并以此為支持物在垂直的玻璃管中進行電泳,電泳分離的區(qū)帶類似圓盤狀故命名為圓盤電泳。第3頁/共17頁第3頁/共18頁實驗結(jié)果第4頁/共17頁第4頁/共18頁
聚丙烯酰胺凝膠電泳可分為連續(xù)電泳和不連續(xù)電泳兩類
連續(xù)電泳指整個電泳系統(tǒng)中所用緩沖液,pH值和凝膠網(wǎng)孔的孔徑都是相同的。不連續(xù)電泳是指在電泳系統(tǒng)中采用了兩種或兩種以上的緩沖液,pH值和孔徑。不連續(xù)圓盤電泳的凝膠管中置有兩種不同的凝膠層:濃縮膠、分離膠。能使稀的樣品在電泳過程中濃縮成層,從而提高分辨能力。第5頁/共17頁第5頁/共18頁
由于凝膠層的不連續(xù)性,蛋白質(zhì)分子在大孔與小孔凝膠中受到的阻力不同,移動速度由快變慢,在界面處就會使樣品濃縮,區(qū)帶變窄。濃縮膠
為大孔膠,凝膠濃度2.5%,用光聚合法制備,有防對流作用。樣品在其中濃縮。分離膠為小孔膠,凝膠濃度7%,一般采用化學(xué)聚合法制備。樣品在其中進行電泳和分子篩分離。也有防對流作用。第6頁/共17頁第6頁/共18頁【器材和試劑】器材:電泳儀、圓盤電泳槽、微量加樣器、注射器、50ml小燒杯試劑:分離膠緩沖液(pH8.9):取三羥甲基氨基甲烷(Tris)18.2g,加入1mol/LHCl24.0ml,再加蒸餾水至100ml,4℃保存。30%單體交聯(lián)劑:稱取丙烯酰胺30.0g與甲叉雙丙烯酰胺0.8g,加蒸餾水至100ml。催化劑:10%過硫酸銨(AP),臨用前現(xiàn)配。加速劑:取四甲基乙二胺(TEMED)1ml加蒸餾水稀釋到10ml。濃縮膠緩沖液(pH6.7):取5.98gTris,用1mol/LHCl48.0ml,再加蒸餾水至100l,4℃保存。電機緩沖液(pH8.3):取28.8g甘氨酸,6.0gTris,分別溶解后,加蒸餾水到100ml,臨用前10倍稀釋即為電極緩沖液工作液。第7頁/共17頁第7頁/共18頁上樣緩沖液:取溴酚藍0.05g,加蒸餾水溶解后,家30ml甘油,加濃縮膠緩沖液25ml,再定容至100ml。固定液:取三氯乙酸12.50g,加蒸餾水至100ml。考馬斯亮藍R250染色液:城區(qū)1.25g考馬斯亮藍R250,溶解于227ml甲醇中,加蒸餾水227ml,加冰醋酸46ml。脫色液:甲醇:冰乙酸:水按3:1:6的比例混合。第8頁/共17頁第8頁/共18頁【操作方法】凝膠柱的準(zhǔn)備加樣(血清樣品12μL、上樣緩沖液12μL)電泳(2~3mA/管)剝膠固定、染色及漂洗第9頁/共17頁第9頁/共18頁【思考題】聚丙烯酰胺凝膠不聚合的主要原因是什么?如何克服?1忘記加催化基過硫酸銨,或者過硫酸銨失效,最好現(xiàn)配現(xiàn)用;2忘記加加速劑TEMED;3溶液的pH不對,偏酸性。4溫度過低過硫酸銨-TEMED(四甲基乙二胺)系統(tǒng):在Acr和Bis的溶液中放入這個催化系統(tǒng)后,過硫酸銨[(NH4)2S2O8]產(chǎn)生出游離氧原子使單體成為具有游離基的狀態(tài),從而發(fā)生聚合作用。聚合的初速度和過硫酸銨濃度的平方根成正比。這種催化系統(tǒng)需要在堿性條件下進行。例如,在pH8.8條件下7%的丙烯酰胺溶液30分鐘就能聚合完畢;在pH4.3時聚合很慢,要90分鐘才能完成。溫度與聚合的快慢成正比。常在室溫下就很快聚合,溫度升高聚合更快。如將混合后的凝膠溶液放在近0℃的地方,就能延緩聚合。一般來講,溫度過低,有氧分子或不純物質(zhì)存在時都能延緩凝膠的聚合。為了防止溶液中氣泡含有氧分子而妨礙聚合,在合前須將溶液分別抽氣,然后再混合。第10頁/共17頁第10頁/共18頁濃縮膠為何能濃縮樣品?濃縮膠的作用原理不連續(xù)緩沖系統(tǒng)的主要優(yōu)點之一是可以使用稀樣品。這是因為在樣品進入分離膠以前,先經(jīng)過大孔徑濃縮膠的遷移作用而被濃縮至一極窄的區(qū)帶。其作用原理是在緩沖系統(tǒng)中的弱酸,如甘氨酸,在接近其pKa的pH值時,任何時候都只有一部分分子帶負電。如樣品和濃縮膠均用pH6.7的Tris-HCI緩沖液,電極液用Tris-甘氨酸緩沖液。此時,甘氨酸很少解離,其有效泳動率很低,而氯離子卻有很高的泳動率,蛋白質(zhì)分子的泳動率介于氯離子和甘氨酸之間。一旦加上電壓,作為先導(dǎo)離子的氯離子和作為尾隨離子的甘氨酸離子分離開來,并在其后面留下一個導(dǎo)電性較低的區(qū)帶。由于導(dǎo)電性與電場強度成反比,這一區(qū)帶便獲得較高的電壓梯度,并加速甘氨酸的泳動,使其趕上氯離子,建立起甘氨酸和氯離子的電壓梯度和泳動率乘積的相等的穩(wěn)定態(tài),使這些帶電顆粒以相同速度泳動,兩種離子之間具有明顯的邊界。當(dāng)甘氨酸、氯離子界面通過樣品進入濃縮膠時,在移動界面前有一低電壓梯度,在界面后有一高電壓梯度。第11頁/共17頁第11頁/共18頁由于在移動界面前的蛋白質(zhì)泳動速度比氯離子低,因此氯離子能迅速越過。移動界面后的蛋白質(zhì)處于較高的電壓梯度中,其泳動速度比甘氨酸快。因此,移動的界面將蛋白質(zhì)分子堆積到一起,濃縮為一狹窄的區(qū)帶。蛋白質(zhì)在移動界面中的濃縮作用僅取決于樣品和濃縮膠中的Tris-HCI的濃度,而與樣品中蛋白質(zhì)的最初濃度無關(guān)。由于濃縮膠為大孔凝膠,故對樣品沒有分子篩作用。移動的界面到達濃縮膠和分離膠的界面時,凝膠的pH值明顯增加,并導(dǎo)致甘氨酸的大量解離。此時甘氨酸的有效泳動率增加,使它越過蛋白質(zhì)并直接在氯離子后移動。同時由于凝膠孔徑變小,使蛋白質(zhì)分子的遷移率減小。于是蛋白質(zhì)分子在均一的電壓梯度和pH值中泳動,并根據(jù)其固有的帶電性和分子大小進行分離。為什么要在樣品中加少許溴酚藍和一定濃度的甘油?溴酚藍呈藍色,而蛋白質(zhì)是白色,在SDS-凝膠中不明顯,再次,溴酚藍的相對分子量比蛋白質(zhì)(絕大部分)小,電泳時速度比蛋白質(zhì)稍快,因此可用作指示,當(dāng)溴酚藍到達電泳槽底部(可看藍色調(diào)帶),則電泳結(jié)束。第12頁/共17頁第12頁/共18頁若無溴酚藍,不好蛋白質(zhì)電泳到槽底的時間。如果所有的蛋白質(zhì)都電泳到了底部,就沒有區(qū)別出其移動速度(對應(yīng)于相對分子質(zhì)量)?!咀⒁馐马棥緼cr和Bis都是神經(jīng)性毒劑,對皮膚有刺激作用、但在形成凝膠后則無毒,操作時應(yīng)盡量避免接觸皮膚,并注意洗手。蛋白加樣量要合適。加樣量太少,條帶不清晰;加樣量太多則泳道超載,條帶過寬而重疊,甚至覆蓋至相鄰泳道。第13頁/共17頁第13頁/共18頁過硫酸銨的主要作用是提供自由基引發(fā)丙烯酰胺和雙丙烯酰胺的聚合反應(yīng),故一定要新鮮,貯存過久的過硫酸銨商品不能使用。此外,10%過硫酸銨必須現(xiàn)用現(xiàn)配,4℃冰箱貯存不超過48h。灌制凝膠時,應(yīng)避免產(chǎn)生汽泡,因為汽泡會影響電泳分離效果。剛灌注分離膠混合溶液后,應(yīng)在分離膠液面上加1~2cm高的水層,以阻隔空氣。膠液面上加水層時要特別小心,緩緩疊加,以免沖壞凝膠的膠面。第14頁/共17頁第14頁/共18頁電極緩沖液中甘氨酸的作用1.緩沖液會與所分離的樣品接觸,加入甘氨酸為細胞組份和各種提取液提供更接近的天然環(huán)境。
2.電解時緩沖液溫度較高,而Tris受溫度影響pH變化較大,甘氨酸可以起到緩沖作用。
3.甘氨酸與樣品的濃縮效應(yīng)有關(guān),它參與形成緩沖體系離子成分與PH值的不連續(xù)性。在不連續(xù)電泳系統(tǒng)中,含有電極緩沖液(Tris-HCl,PH8.3)、濃縮膠緩沖液(Tris-HCl,PH6.8)、分離膠緩沖液(Tris-HCl,PH8.8);兩種凝膠的孔徑也各不相同。在濃縮膠中,緩沖液中的HCl幾乎全解離為Cl-,電極中的甘氨酸(PI=6.0,PKa=9.7)只有很少解離,酸性蛋白質(zhì)也可解離出質(zhì)子。這些離子電泳時都向正極移動:Cl-速度最快(快離子),蛋白質(zhì)次之,甘氨酸負離子最慢(慢離子)。由于Cl-很快超過蛋白質(zhì)離子,因此在其后形成一個電導(dǎo)較低,電位梯度較陡的區(qū)域,該區(qū)電位梯度最高,是在電泳過程中形成的電位梯度的不連續(xù)性導(dǎo)致蛋白質(zhì)和甘氨酸離子加快移動,結(jié)果使蛋白質(zhì)在進入分離膠前被濃縮成極窄的區(qū)帶,有利于提高電泳的分辨率。當(dāng)進入PH=8.9的分離膠時,甘氨酸解離度增大,速度超過蛋白質(zhì),所以,Cl-與甘氨酸負離子繼續(xù)前進,蛋白質(zhì)大分子留在后面,從而分成多個區(qū)帶。第15頁/共17頁第15頁/共18頁凝膠中的蛋白區(qū)帶比較少且不清晰可能的原因最可能的是樣品中蛋白含量少濃度低,染色脫色的配方效果不好,比
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