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核酸的生物化學(xué)南
開
大
學(xué)
喬
文
濤2011-4-20
衛(wèi)生局培訓(xùn)班P
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.學(xué)習(xí)目的--核酸是生命活動(dòng)最重要的物質(zhì)基礎(chǔ)。--核酸研究是生命科學(xué)各個(gè)學(xué)科在分子水平上闡明生命現(xiàn)象最活躍的分支。--本課程通過(guò)化學(xué)和生物學(xué)兩方面介紹核酸的化學(xué)結(jié)構(gòu)特征、性質(zhì)與他們行使重要功能(遺傳信息的貯存,傳遞和生物大分子間相互作用等)之間的關(guān)系。以此為基,更好地理解和掌握本次培訓(xùn)介紹的新進(jìn)展、新方法。P
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.學(xué)習(xí)內(nèi)容n
概述n
化學(xué)結(jié)構(gòu)與性質(zhì)雙螺旋結(jié)構(gòu)
堿基配對(duì)
變性與復(fù)性n
生物學(xué)功能遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)
信息傳遞n
生物合成復(fù)制
轉(zhuǎn)錄P
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.第一節(jié)
核酸概述一.核酸研究的起始二.
核酸的生物學(xué)重要性三.
核酸的功能與分類P
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.核酸的發(fā)現(xiàn)和研究史中的重要事件n
1869年
Miescher發(fā)現(xiàn)核素
特點(diǎn):磷含量很高n
1944年
Avery提出遺傳物質(zhì)是DNA,而非蛋白質(zhì)n
1953年
Watson和Crick提出DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)n
20世紀(jì)70年代
DNA重組技術(shù)出現(xiàn)n
1983年
PCR技術(shù)誕生P
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.核酸的生物學(xué)重要性n
生物的特征
由大分子組成n
核酸
決定蛋白質(zhì)的合成n
蛋白質(zhì)
實(shí)現(xiàn)生物功能n
多糖、脂質(zhì)復(fù)合物
由酶催化合成,增加蛋白結(jié)構(gòu)與功能的多樣性P
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.核酸的功能n
DNA是主要的遺傳物質(zhì)堿基序列包含遺傳信息n
RNA參與蛋白質(zhì)的生物合成遺傳信息從DNA到蛋白質(zhì)的中間傳遞體RNA病毒的遺傳信息載體此外,RNA具有多種功能:轉(zhuǎn)錄后加工修飾,基因表達(dá)調(diào)控及細(xì)胞功能調(diào)控,生物催化,遺傳信息的加工與進(jìn)化P
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.核酸的分類脫氧核糖核酸—DNA:主要存在于細(xì)胞核或核區(qū)細(xì)胞質(zhì)中主要存在于線粒體核糖核酸—RNA:主要存在于細(xì)胞質(zhì)細(xì)胞核中有少量存在病毒
:僅含一種核酸,以此分為DNA病毒和RNA病毒。P
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.第二節(jié)
核酸的分子組成n
元素:C、H、O、N、PP為核酸的特征性元素,含量約為核酸的9-10%,因此可根據(jù)組織的P含量估測(cè)核酸含量。n
基本結(jié)構(gòu)單位―核苷酸:
水解產(chǎn)物P
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.核苷酸的組成戊糖
核糖:RNA脫氧核糖:DNA核苷磷酸核苷酸含氮堿
嘌呤堿
腺嘌呤
A鳥嘌呤
GDNARNA共有嘧啶堿
胞嘧啶
C胸腺嘧啶
TDNARNA尿嘧啶
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.核酸組分的結(jié)構(gòu)式—含氮堿基嘌呤堿(A,G)嘧啶堿(T/U,C)U無(wú)CH3P
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.核酸組分的結(jié)構(gòu)式—戊糖結(jié)構(gòu)式脫氧核糖:
-H→核糖:-OHP
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.核酸組分的結(jié)構(gòu)式—核苷結(jié)構(gòu)式:以脫氧腺苷(A)為例核苷:戊糖和堿基間形成糖苷鍵,縮合后生成的化合物。P
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.核酸組分的結(jié)構(gòu)式—核苷酸的結(jié)構(gòu)式:以腺苷(A)為例磷脂鍵P
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.第三節(jié)
核酸的分子結(jié)構(gòu)n
核酸單鏈的形成--核苷酸的連接n
DNA的分子結(jié)構(gòu)一級(jí)結(jié)構(gòu):A、G、C、T排列順序,
功能:蘊(yùn)含遺傳信息二級(jí)結(jié)構(gòu):雙螺旋結(jié)構(gòu)
,A-T、G-C配對(duì),復(fù)制基礎(chǔ)三級(jí)結(jié)構(gòu):超螺旋結(jié)構(gòu),核小體等n
RNA的分子結(jié)構(gòu)A、G、C、U組成單鏈結(jié)構(gòu),不同RNA結(jié)構(gòu)各異P
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.一級(jí)結(jié)構(gòu):多核苷酸鏈單核苷酸戊糖C-5’的磷酸與另一單核苷酸戊糖C-3’以磷酸二酯鍵連接而成。骨架:磷酸和戊糖具有方向性編碼鏈5’→3’核酸排列順序?yàn)楹塑账嵝蛄凶畛S帽硎痉?’
CGAAT
3’P
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.一級(jí)結(jié)構(gòu)的特點(diǎn)n
堿基組成
幾乎全部為A、T、G、Cn
長(zhǎng)度表示
單鏈
nt
雙鏈
bp
kbn
特點(diǎn)
所有DNA中[A]=[T]
[C]=[G][A]/[T]=[C]/[G][A]+[G]=[T]+[C][A]+[C]
=[T]+[G]DNA堿基組成具有種屬特異性DNA堿基組成不具有組織和器官特一性個(gè)體中堿基組成恒定P
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.DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)--雙螺旋結(jié)構(gòu)1.右手雙螺旋結(jié)構(gòu)2.骨架:磷酸和戊糖
位于鏈的外側(cè)3.堿基互補(bǔ):A-T,G-C
環(huán)面平行位于雙螺旋的內(nèi)側(cè)4.雙鏈反向平行P
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.DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)—雙螺旋結(jié)構(gòu)20AP
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.DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)—堿基配對(duì)兩個(gè)氫鍵三個(gè)氫鍵G-C配對(duì)較A-T配對(duì)穩(wěn)定,
G-C%高則Tm較高P
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.DNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)n
超螺旋:
環(huán)狀DNA盤旋、扭曲形成細(xì)菌基因組、線粒體、葉綠體n
核小體:DNA+組蛋白真核生物的基因組DNAP
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.核小體的結(jié)構(gòu)DNA雙鏈1?圈
146bp組蛋白八聚體:H2A,H2B,H3,H4各兩分子P
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.RNA的結(jié)構(gòu)n
rRNA
p12n
mRNA
轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物真核細(xì)胞mRNA成熟需加帽:m7Gppp加尾:poly(A):RT-PCR三聯(lián)體密碼子:決定氨基酸種類起始密碼子
AUG中止密碼子
UAG,UAA,UGAn
tRNA
三葉草結(jié)構(gòu)氨基酸臂結(jié)合氨基酸殘基反密碼子環(huán)上帶有反密碼子,與mRNA上密碼子互補(bǔ)P
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.第四節(jié)
核酸的理化性質(zhì)n
酸堿性質(zhì)
—電泳分離和沉淀純化n
高分子性質(zhì)—
超速離心和凝膠過(guò)濾n
紫外吸收—鑒定純度和定量n
變性和復(fù)性—
PCR的基礎(chǔ)注:
RNA—易降解,注意防止RNA酶污染P
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.變性與復(fù)性1條件:極端pH、加熱2變性:氫鍵斷裂
雙螺旋解開,但共價(jià)鍵不斷裂3高(增)色效應(yīng)4融解溫度Tm:A260為最大值的50%5Tm與G+C%、長(zhǎng)度成正比P
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.變性與復(fù)性變性一定條件可逆退火:熱變性DNA緩慢冷卻,雙鏈恢復(fù)的過(guò)程。復(fù)性:變性核酸經(jīng)退火恢復(fù)原狀的過(guò)程。低(減)色效應(yīng)雜交:不同來(lái)源的核酸分子之間,形成雜化雙鏈。探針:標(biāo)記的已知序列單鏈核酸可用于基因診斷。P
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.第五節(jié)
DNA的生物合成n
概念:生物體內(nèi)通過(guò)酶促反應(yīng)合成DNA分子的過(guò)程。n
方式:
復(fù)制合成
DNA→DNA反轉(zhuǎn)錄合成
RNA→DNA修復(fù)合成P
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.DNA的半保留復(fù)制以兩條親代DNA每一條為模板,在DNA聚合酶催化下,按堿基配對(duì)原則,合成子代DNA的過(guò)程。P
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.DNA的復(fù)制合成n
復(fù)制方式:p18雙起點(diǎn)、單方向單起點(diǎn)、單方向單起點(diǎn)、雙方向n
多種酶和蛋白質(zhì)因子參與
p19DNA聚合酶
功能以親代DNA為模板,以dNTP為底物,按堿基配對(duì)原則,催化合成子代DNA。Taq酶:耐熱DNA聚合酶P
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.復(fù)制過(guò)程1.
螺旋的松弛與解鏈
DNA
Topo與解鏈(旋)酶2.
RNA前體的合成
引發(fā)酶、引發(fā)前體3.
鏈的延長(zhǎng)
DNApol
dNTP
合成先導(dǎo)鏈和隨從鏈(岡崎片斷)4.
終止
核酸酶水解RNA引物,連接酶連接各片斷P
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.反轉(zhuǎn)錄合成n
以RNA為模板合成DNA的過(guò)程
p24n
反轉(zhuǎn)錄酶催化
來(lái)源于反轉(zhuǎn)錄病毒催化活性:1RNA為模板合成DNA2RNA水解3DNA為模板合成DNA以mRNA為模板,合成cDNA,構(gòu)建cDNA文庫(kù)。P
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.修復(fù)合成n
多種原因可引起DNA的損傷點(diǎn)突變、缺失突變、插入突變、置換突變n
生物體內(nèi)的DNA修復(fù)系統(tǒng)可修復(fù)損傷n
修復(fù)過(guò)程是一系列酶促反應(yīng)切除修復(fù)、重組修復(fù)、SOS修復(fù)P
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.切除修復(fù)1切斷
核酸內(nèi)切酶2修復(fù)合成
DNA聚合酶3切除
II類解旋酶4連接
DNA連接酶P
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.第六節(jié)
RNA的生物合成n
概念生物體內(nèi)通過(guò)酶促反應(yīng)合成RNA分子的過(guò)程。n
方式
轉(zhuǎn)錄合成
DNA→RNA復(fù)制合成
RNA→RNA僅見于某些RNA病毒n
轉(zhuǎn)錄后加工P
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.轉(zhuǎn)錄P
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.轉(zhuǎn)
錄n
體系構(gòu)成DNA模板、NTP、RNA聚合酶一些蛋白質(zhì)因子和無(wú)機(jī)離子n
過(guò)程
起始—延長(zhǎng)—終止n
轉(zhuǎn)錄后加工P
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.真核生物基因結(jié)構(gòu)及mRNA前體的加工轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)
翻譯起始點(diǎn)結(jié)構(gòu)基因啟動(dòng)序列終止密碼子終止信號(hào)上游調(diào)節(jié)序列轉(zhuǎn)錄
RNA聚合酶IImRNA前體轉(zhuǎn)錄后加工成熟mRNA
m7GpppAAAnAOHP
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