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文檔簡介
第一頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五****分子雜交****分子生物學(xué)中用于檢測生物樣本中是否含有特定的生物分子(探針)的一門技術(shù)。第二頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五分子雜交原理及流程圖樣品制備電泳雜交轉(zhuǎn)膜結(jié)果顯示探針制備第三頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五***分子雜交分類***?SouthernBlotDNA雜交?NorthernBlotRNA雜交?WesternBlot蛋白質(zhì)雜交?原位雜交第四頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五****樣品制備****?DNA純化?RNA純化第五頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五****探針制備****第六頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五隨機引物法合成高特異活性的DNA探針——NEBLot?Kit特點:*活性高:≥109dpm/ug*標(biāo)記效率高:可用于5ng-2ug的模板DNA量模板量第七頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五用途基因文庫篩選Southern雜交Northern雜交原位雜交第八頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五隨機引物法雙鏈DNA探針合成標(biāo)記優(yōu)化技術(shù)DECAprimeTMIIRandomPrimingDNALabelingKit優(yōu)化技術(shù):*高純度無外切酶活性的Klenow酶提高了標(biāo)記效率
10分鐘完成反應(yīng)*改進的標(biāo)記動力學(xué)增加了探針產(chǎn)量對低純度及低濃度模板也能通過延長反應(yīng)時間達到目的*獨特的Decamer溶液提高引物-模板復(fù)合物穩(wěn)定性減少引物雙體形成,提高了靈敏度*標(biāo)記靈活:提供dATP和dCTP兩種標(biāo)記緩沖液第九頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五特異性單鏈DNA探針合成標(biāo)記優(yōu)化技術(shù)Prime-A-ProbeTMStrandSpecificDNAProbeSynthesisKit活性大于4×cpm/ug109第十頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五合成高特異性全長RNA探針的最佳選擇——MAXIscriptTM
體外轉(zhuǎn)錄試劑盒特點:*可合成長達2kb的RNA*產(chǎn)量可達2-4ug/ul
同位素標(biāo)記可達109cpm/ug*對應(yīng)不同的啟動子有不同的試劑盒可供選擇*同位素或非放標(biāo)記均可第十一頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五第十二頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五多次洗脫反復(fù)雜交探針制備技術(shù)——Strip-EZTMSystem專門為需要在同一張膜上反復(fù)標(biāo)記檢測不同信號的用戶設(shè)計,提供非常溫和的雜交信號洗脫條件,提高膜的使用壽命達通常的三倍左右。
工作原理合成探針的同時摻入經(jīng)過修飾的dNTP(修飾不影響雜交特性)雜交檢測后將膜浸入探針降解緩沖液中將探針降解68℃溫和洗脫適用于:Northern\Southern\dot/slot及相關(guān)雜交第十三頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五Strip-EZTMRNA探針合成Strip-EZTMRNAProbeSynthesis&RemovalKit特點:*靈敏度高比隨機引物法DNA探針靈敏10倍以上*溫和洗脫,提高膜壽命*不同啟動子有不同試劑盒*同位素和非放標(biāo)記均可第十四頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五第十五頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五效果比較第十六頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五PCR法Strip-EZTMDNA探針的合成Strip-EZTMPCRStripableDNAProbeSynthesis&RemovalKit
特點:*模板多樣:克隆序列、cDNA、PCR產(chǎn)物*不對稱PCR技術(shù),產(chǎn)物大多為單鏈DNA探針*靈敏度高,比隨機引物法高3-5倍*提供除模板、標(biāo)記物、Taq酶外所有合成探針及洗膜試劑,包括M13正反向及T7引物第十七頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五結(jié)果比較第十八頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五cDNAdsDNAssDNAssRNAOligonucleotidessRNAssDNAdsDNAOligonucleotideProbeType第十九頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五****標(biāo)記類型****?放射性同位素標(biāo)記:靈敏度高,成本低但操作不便,標(biāo)記效率不太穩(wěn)定,壽命受半衰期限制?非放射性標(biāo)記(地高辛、生物素、熒光素等):安全,標(biāo)記穩(wěn)定,探針壽命較長但靈敏度較低,背景較高,成本高第二十頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五非放射性雜交系統(tǒng)BrightStarTMPsoralen-BiotinNonisotopiclabelingKit&BioDetectTMNonisotopicDetectionKit第二十一頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五靈敏度最高的非放檢測系統(tǒng)之一——BioDetectTMNonisotopicDetectionKit
采用的化學(xué)發(fā)光劑CDP-Star為發(fā)光最強、發(fā)光時間最長的化學(xué)發(fā)光底物之一,靈敏度與同位素相當(dāng)。*曝光10-30分鐘相當(dāng)于32P壓片1-2天*發(fā)光時間穩(wěn)定持續(xù)2天,發(fā)光峰值無明顯下降允許反復(fù)多次壓片*背景很低第二十二頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五第二十三頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五Phototope?化學(xué)發(fā)光系統(tǒng)NEBlot?Phototope?Kit&Phototope?-StarChemiluminescentDetectionKitNorthern雜交Southern雜交Phage文庫篩選菌落及質(zhì)粒文庫篩選用途第二十四頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五原位雜交及檢測試劑盒mRNAlocator-HybTMInSituHybridizationKitmRNAlocator-BiotinTMmRNAInSituDetectionKit6小時完成雜交RNasecure保證無RNase污染高效靈敏的NBT/BCIP-生物素探針顯色檢測提供對照第二十五頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五改良的Northern雜交技術(shù)——Ambion公司的Northern雜交系列第二十六頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五完整的Northern雜交試劑盒
包括從瓊脂糖、上樣、配膠、電泳、轉(zhuǎn)移緩沖液到雜交、洗膜液,除RNase、膜、Marker的全套試劑。簡便、無污染、背景低、分辨率高;同位素、非放標(biāo)記均可第二十七頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五第二十八頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五雜交用瓊脂糖及聚丙烯酰氨凝膠——電泳膠專業(yè)廠家:BMA公司Agarose&PAGE預(yù)制膠
Reliantgelsystem
ReliantRNAgelsystem
PAGErPrecastgels第二十九頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五NEB公司各種規(guī)格的優(yōu)質(zhì)DNA/RNA/ProteinMWMarkersProteinMarker,BroadRange(2-212kDa)PrestainedProteinMarker,BroadRange(6-175kDa)HRPProteinMarkerDetectionPack第三十頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五世界標(biāo)準(zhǔn)雜交膜——Schleicher&Schuell公司產(chǎn)品*Protran?硝酸纖維素膜*Optitran?BA-S加強型硝酸纖維素膜*Nytran?尼龍膜*Nytran?SuPerCharge高負(fù)荷正電荷尼龍膜
單位面積所帶正電荷是普通膜的3倍大大降低了背景及非特異性結(jié)合膜孔徑、表面均一性、對稱毒度、潔凈度好第三十一頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五分析基因差異表達的預(yù)制雜交膜熱點領(lǐng)域中基因的cDNA點陣各種來源的mRNA第三十二頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五CLONTECH公司的高效雜交液——ExpressHybHybridizationSolution特點:通過升高雜交溫度并使用修飾的雜交液不僅將雜交時間由傳統(tǒng)的12-24小時減為1-2小時,還大大降低了非放標(biāo)記檢測的背景。特別適用于Northern雜交檢測低拷貝RNA和
Southern雜交檢測單拷貝基因第三十三頁,共三十四頁,編輯于2023年,星期五新型方便的除RNase試劑RNaseZAPRNaseDecontaminationSolution
一種能完全去除玻璃、塑料表面RNase污染的噴霧劑ElectroZap
還可除電極及pH計等表面的RNaseRNAsecure
比傳統(tǒng)的DEPC使用安全、簡便無須滅菌等后續(xù)處理,不
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