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I鴨疫里默氏桿菌病診斷技術(shù)規(guī)程范圍本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了鴨疫里默氏桿菌病的臨床診斷、細(xì)菌分離、病原核酸檢測(cè)和綜合判定的技術(shù)要求。本標(biāo)準(zhǔn)適用于鴨疫里默氏桿菌病的診斷與檢測(cè)。規(guī)范性引用文件下列文件對(duì)于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅注日期的版本適用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。GB4789.28食品安全國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)食品微生物學(xué)檢驗(yàn)培養(yǎng)基和試劑的質(zhì)量要求GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法GB19489實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求NY/T541獸醫(yī)診斷樣品采集、保存與運(yùn)輸技術(shù)規(guī)范臨床診斷流行病學(xué)該病一年四季均可發(fā)生,鴨、鵝、野生水禽和火雞均可發(fā)病,1周齡~8周齡鴨高度敏感,5周齡以下死亡較快,較大的鴨可能存活時(shí)間較長(zhǎng),該病在種鴨中少見。臨床癥狀最急性型很少出現(xiàn)明顯癥狀即突然死亡。急性型常見于2周齡~3周齡的雛鴨,病程1日~3日?;鉴喚癯劣?、嗜睡、厭食、離群、不愿走動(dòng)或行動(dòng)遲緩,眼鼻分泌物增多,患鴨呼吸困難、縮頸或以喙抵地,瀕死期出現(xiàn)神經(jīng)癥狀呈角弓反張、抽搐等。慢性型常見于4周齡~7周齡鴨,病程可達(dá)一周以上。主要表現(xiàn)為精神沉郁、厭食、腿軟弱無力、不愿走動(dòng)、伏臥或呈犬坐姿勢(shì),共濟(jì)失調(diào)、痙攣性點(diǎn)頭或頭左右搖擺,難以維持軀體平衡,部分病例頭頸歪斜,當(dāng)遇到驚擾時(shí)呈轉(zhuǎn)圈運(yùn)動(dòng)或倒退,部分患鴨跛行。感染后存活的鴨往往生長(zhǎng)遲緩。病理變化特征性病變?yōu)椴∷励啙{膜出現(xiàn)廣泛性的纖維素性滲出,包括心包炎、氣囊炎和肝周炎。慢性病例可見腦炎。判定標(biāo)準(zhǔn)若發(fā)病鴨符合3.1流行病學(xué)特征、3.2臨床癥狀和3.3病理變化,可判為鴨疫里默氏桿菌病疑似病例,應(yīng)進(jìn)行細(xì)菌分離和核酸檢測(cè)確診。實(shí)驗(yàn)室診斷除非另有規(guī)定,實(shí)驗(yàn)室診斷所用化學(xué)試劑均為分析純;試驗(yàn)用水符合GB/T6682二級(jí)水的規(guī)定;實(shí)驗(yàn)室生物安全要求按照GB19489執(zhí)行。細(xì)菌分離儀器和設(shè)備生物安全柜。CO2培養(yǎng)箱。顯微鏡。試劑或材料血清X脂平板(見附錄A.1)。麥康凱X脂平板(見附錄A.2)。革蘭氏染色液。瑞氏染色液。操作步驟取樣按NY/T541要求無菌采集發(fā)病鴨的肝臟或腦(有典型纖維素性滲出時(shí)采集肝臟,有神經(jīng)癥狀時(shí)采集腦)。分離培養(yǎng)將接種環(huán)伸入組織內(nèi)部,然后劃線接種于血清X脂平板和麥康凱X脂平板,平板的配制根據(jù)根據(jù)GB
4789.28的規(guī)定進(jìn)行操作,含5%~10%CO2的37℃培養(yǎng)箱或燭缸中培養(yǎng)24h~48h。挑取符合描述的典型菌落,劃線接種于血清X脂平板進(jìn)行純化培養(yǎng)。菌落形態(tài)在血清X脂平板培養(yǎng)基上見有濕潤(rùn)、呈露滴樣、圓形隆起、表面光滑、邊緣整齊的菌落,直徑為1
mm~2mm,顏色為灰白色;而麥康凱X脂平板上無菌落生長(zhǎng)。挑選單個(gè)典型菌落進(jìn)行革蘭氏染色和瑞氏染色,并鏡檢。革蘭氏陰性,為無鞭毛、不運(yùn)動(dòng)、不形成芽胞的小桿菌。單個(gè)、成雙或呈短鏈狀排列,菌體形態(tài)除桿狀外,部分呈橢圓形,偶見呈長(zhǎng)絲狀。細(xì)菌大小寬為0.2μm~0.5μm,長(zhǎng)為1μm~5μm,呈絲狀的菌體可長(zhǎng)達(dá)11μm~24μm。瑞氏染色可見大多數(shù)菌體呈兩極著染。結(jié)果判定分離的細(xì)菌如同時(shí)符合和,可判定為疑似鴨疫里默氏桿菌。病原核酸檢測(cè)PCR方法儀器和設(shè)備高速冷凍離心機(jī)。PCR擴(kuò)增儀。電泳儀。紫外分析儀。微量加樣器:0.5μL~10μL;2μL~20μL;20μL~200μL;100μL~1000μL。試劑或材料陰性質(zhì)控。陽性質(zhì)控(滅活細(xì)菌培養(yǎng)物)。蛋白酶K。PBS(附錄B.1)。TE(附錄B.2)。SDS(附錄B.3)。X脂糖凝膠(附錄B.4)。TAE電泳液(附錄B.5)。樣品處理及核酸提取組織樣品無菌取疑似鴨疫里默氏桿菌病的肝臟、脾臟等臟器組織1.0g~5.0g,按10%(g/mL)加入PBS,研磨勻漿。-20℃保存?zhèn)溆?。?00μL組織勻漿液加入400μLTE中充分混勻,再加終濃度為1%的SDS和100μg/mL的蛋白酶K,置56℃水浴消化2h,冷至室溫后用酚及氯仿各抽提兩次,無水乙醇沉淀,75%乙醇洗滌,最后用40μLDEPC水溶解DNA,作為PCR模板,或保存于-20℃?;蛘哂蒙唐坊腄NA提取試劑盒提取DNA。菌落樣品挑取4.1.3.2可疑菌落,加到含20μL滅菌去離子水的PCR離心管中,壓緊管蓋,煮沸10min,再冰浴10min后離心取上清作為PCR模板樣品?;蛘哂蒙唐坊腄NA提取試劑盒提取DNA。引物根據(jù)GenBank中發(fā)表的鴨疫里黙氏桿菌16sRNA基因序列設(shè)計(jì)引物,擴(kuò)增片段大小為475bp。上游引物RA-001F:5’-TTAGATAGTTGGTGAGGTAA-3’。下游引物RA-002R:5’-ATCGGTGTTCTGAGTAAT-3’。PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系反應(yīng)體系為25μL,配制見表1。PCR反應(yīng)體系配制PCR反應(yīng)體系中各成分每個(gè)樣品反應(yīng)組分用量/μL10×PCRbuffer2.52.5mmol/LdNTP2.010μmol/L引物F0.510μmol/L引物R0.55U/μLTaqE0.5模板1.0無RNA酶去離子水18.0總體積25.0反應(yīng)程序采用以下反應(yīng)程序進(jìn)行擴(kuò)增:第一階段:95℃5min;第二階段:95℃30s,56℃30s,72℃40s,共進(jìn)行30個(gè)循環(huán);第三階段:72℃10min。PCR擴(kuò)增也可使用商品化的PCR試劑盒,按說明書要求操作。電泳反應(yīng)結(jié)束后取10.0μLPCR產(chǎn)物與1.0μL10×上樣緩沖液混合,加到1%X脂糖凝膠板的加樣孔中,同時(shí)設(shè)DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)參照,以5V/cm電壓進(jìn)行電泳20min~40min,在凝膠成像儀上觀察結(jié)果。結(jié)果判定試驗(yàn)成立的條件在陽性質(zhì)控出現(xiàn)一條大小475bp的單一條帶,同時(shí)陰性質(zhì)控?zé)o此條帶的情況下,檢測(cè)結(jié)果成立。結(jié)果的判定被檢樣品出現(xiàn)與陽性質(zhì)控同樣大小的條帶時(shí),判為陽性;被檢樣品未出現(xiàn)與陽性質(zhì)控同樣大小的條帶時(shí),判為陰性。如果陰、陽性質(zhì)控結(jié)果不成立,則全部樣品應(yīng)該重做。參見附錄C。實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法儀器和設(shè)備實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)儀。臺(tái)式高速冷凍離心機(jī)。渦旋振蕩器??烧{(diào)移液器:0.5μL~10μL;2μL~20μL;20μL~200μL;100μL~1000μL。無RNA酶的熒光定量PCR管。試劑或材料陰性質(zhì)控。陽性質(zhì)控(滅活細(xì)菌培養(yǎng)物)。蛋白酶K。SDS。實(shí)時(shí)熒光定量PCR試劑盒。樣品處理及核酸提取組織樣品參見4.2.1.3.1。菌落樣品參見4.2.1.3.2。引物根據(jù)GenBank中發(fā)表的鴨疫里黙氏桿菌16sRNA基因序列設(shè)計(jì)引物,擴(kuò)增片段大小為190bp。上游引物RA-003F:5’-GCTGGAATGAGTAGTGTAG-3’。下游引物RA-004R:5’-GCTTAGTCTCTGAACCATATAG-3’。熒光定量PCR反應(yīng)體系采用20μL反應(yīng)體系,組成見表2。熒光PCR反應(yīng)體系配制反應(yīng)體系中各成分每個(gè)樣品反應(yīng)組分用量/μL2×SYBRPremix10.010μmol/L引物P31.010μmol/L引物P41.0模板2.0無RNA酶去離子水6.0總體積20.0反應(yīng)程序采用以下反應(yīng)程序進(jìn)行擴(kuò)增:第一階段:95℃2min;第二階段:95℃20s,57℃1min,共進(jìn)行40個(gè)循環(huán),57℃時(shí)收集熒光。反應(yīng)結(jié)束后根據(jù)分析軟件得出的Ct值和擴(kuò)增曲線來判XX果。結(jié)果判定試驗(yàn)成立的條件閾值設(shè)定原則根據(jù)儀器噪聲情況進(jìn)行調(diào)整,以閾值線剛好超過正常陰性樣品擴(kuò)增曲線的最高點(diǎn)為準(zhǔn)。陰性質(zhì)控的檢測(cè)結(jié)果應(yīng)無特異性擴(kuò)增;陽性質(zhì)控的Ct值應(yīng)<28.0,則試驗(yàn)成立。結(jié)果的判定當(dāng)被檢樣品Ct值≤30且出現(xiàn)典型擴(kuò)增曲線時(shí),判為陽性;當(dāng)被檢樣品無Ct值或者Ct值≥35時(shí),判為陰性;當(dāng)被檢樣品在30<Ct值<35時(shí)判為可疑,需重做,再次檢測(cè)結(jié)果的Ct值<35,且出現(xiàn)典型擴(kuò)增曲線,則可判為陽性,否則判為陰性。結(jié)果判定見附錄E。綜合判定符合3.4臨床診斷規(guī)定的疑似病例經(jīng)4.2.1和4.2.2中的任一方法檢測(cè),結(jié)果為陽性者,可判定為鴨疫里默氏桿菌病。
(規(guī)范性附錄)
試劑的配制PBS(0.01mol/L,pH7.2)氯化鈉8.00g氯化鉀0.2mL磷酸二氫鉀0.2mL磷酸氫二鈉2.89g硫柳汞0.1g去離子水加至1000mL100kPa15min滅菌,置4℃冰箱保存?zhèn)溆谩?0×TE羥基甲基氨基甲烷(Tris)12.11g乙二胺四乙酸二鈉3.72g水800mLHCl調(diào)PH至8.0水加至1000mL100kPa15min滅菌后備用。20%SDS十二烷基硫酸鈉20g水80mLHCl調(diào)PH至7.2水加至100mL1.0%X脂糖凝膠X脂糖1.0g1×TAE電泳緩沖液加至100mL加熱完全融化,待冷至50℃~60℃時(shí),加Goodview溶液5μL,搖勻,倒入電泳板上,凝固后取下梳子,備用。50×TAE緩沖液羥基甲基氨基甲烷(Tris)242.0g冰乙酸57.1mL0.5mol/L乙二胺四乙酸二鈉溶液(PH8.0)27.5mL滅菌去離子水加至1000mL2℃~8℃保存。
(規(guī)范性附錄)
培養(yǎng)基的配制血清培養(yǎng)基X脂牛肉膏 0.5g蛋白胨 1.0g氯化鈉 0.5gX脂粉 1.0g去離子水加至100mL,100kPa20min滅菌,待冷卻到50℃~60℃時(shí)加入5mL無菌雞血清。置4℃
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