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文檔簡介
蛋白質(zhì)合成與分選-《細胞生物學(xué)》筆記
?第一節(jié)核糖體
?一.核糖體的基本類型與化學(xué)組成
?(一)定義
?核糖體(ribosome)是一種核糖核蛋白顆粒(ribonuncleoproteinparticle),幾乎存
在于一切原核與真核細胞內(nèi)(除極少數(shù)高度分化的細胞外),是細胞內(nèi)合成蛋
白質(zhì)的沒有膜包被的細胞器,其功能是依照mRNA上攜帶的遺傳信息,高
效精確地將氨基酸合成為蛋白質(zhì)多肽鏈。
?(二)類型
?1.原核細胞核糖體(70S的核糖體)
?2.真核細胞核糖體(80S的核糖體)
?3.真核與原核核糖體成分比較
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?(三)化學(xué)組成
?1.大小
?(1)原核生物:直徑為20~25nm。
?(2)真核生物:直徑為25~30nm。
?2.特征
?(1)不規(guī)則顆粒狀結(jié)構(gòu);
?(2)無膜包被;
?(3)由大小兩個亞基(subunit)構(gòu)成,但大小亞基常常游離于細胞質(zhì)中,
只有當(dāng)以mRNA為模板合成蛋白質(zhì)時,大小亞基才結(jié)合在一起,肽鏈合
成終止后,大小亞基解離。
?3.主要成分
?①蛋白質(zhì)(r蛋白),存在于核糖體表面,約占40%;
?②RNA(rRNA):存三于核糖體內(nèi)部,約占60%。
?二.核糖體的結(jié)構(gòu)
?對核糖體高分辨率的X射線衍射圖譜分析表明:
?(1)每個核糖體含有4個RNA分子的結(jié)合位點:其中1個mRNA結(jié)合位點,3
個tRNA結(jié)合位點(A位點(aminoacylsite)、P位點(peptidylsite)和E位點
(exitsite))。這些位點橫跨核糖體大小亞基結(jié)合面。
?(2)在核糖體大小亞基結(jié)合面,特別是mRNA和tRNA結(jié)合處,無蛋白質(zhì)分布。
這也意味著在核糖體起源之初可能僅由RNA組成。
1
?(3)催化肽鍵形成的活性位點由RNA組成。
?(4)大多數(shù)核糖體蛋白有一個球形結(jié)構(gòu)域和伸展的尾部,球形結(jié)構(gòu)域分布于核
糖體表面,而其伸展的多肽鏈尾部則伸入核糖體內(nèi)折疊的rRNA分子中。
?三.核糖體蛋白與rRNA的功能
?(一)與蛋白質(zhì)合成有關(guān)的結(jié)合位點與催化位點:
?(1)與mRNA的結(jié)合位點:原核生物,16SrRNA的3'端與mRNA的Shine-
Dalgamo序列(SD序列)結(jié)合:真核生物,識別mRNA5'端的甲基化帽子的翻
譯起始因子。
?(2)A位點:與新進入的氨酰tRNA的結(jié)合位點-一氨?;稽c。
?(3)P位點:與延伸中的肽酰tRNA的結(jié)合位點——肽?;稽c。
?(4)E位點:tRNA離開核糖體前的結(jié)合位點。
?(5)與肽酰tRNA從A位點轉(zhuǎn)移到P位點有關(guān)的轉(zhuǎn)移酶(即延伸因子EF-G)的
結(jié)合位點。
?(6)與蛋白質(zhì)合成有關(guān)的其他起始因子(IF)、延伸因子(EF)和終止因子(RF)的
結(jié)合位點。
?(7)肽酰轉(zhuǎn)移酶的催化位點(核糖體中最主要的活性部位;肽酰轉(zhuǎn)移酶是核糖
體大亞基rRNA,活性位點位于23SrRNA結(jié)構(gòu)域V的中間環(huán))。
?①rRNA是起主要作用的結(jié)構(gòu)成分,主要功能有:
?具有肽酰轉(zhuǎn)移酶的活性:
?為tRNA提供結(jié)合位點(A位點、P位點和E位點);
?為多種蛋白質(zhì)合成因子提供結(jié)合位點;
?在蛋白質(zhì)合成起始時參與同mRNA選擇性地結(jié)合,以及在肽鏈的延伸
中與mRNA結(jié)合;
?核糖體大小亞單位的結(jié)合、校正閱讀(proofreading)、無意義鏈或框架
漂移的校正、以及抗菌素的作用等都與rRNA有關(guān)。
?②推測r蛋白質(zhì)的主要功能有:
?對rRNA折疊成有功能的三維結(jié)構(gòu)是十分重要的;
?在蛋白質(zhì)合成中,某些r蛋白可能對核糖體的構(gòu)象起“微調(diào)”作用;
?在核糖體的結(jié)合位點上甚至可能在催化作用中,核糖體蛋白與rRNA共
同行使功能。
?第二節(jié)多核糖體與蛋白質(zhì)的合成
?一.多核糖體
?1.概念
?核糖體在細胞內(nèi)并不是單個獨立地執(zhí)行功能,而是由多個甚至幾十個核糖體
串連在一條mRNA分子上高效地進行肽鏈的合成,這種具有特殊功能與形態(tài)
結(jié)構(gòu)的核糖體與mRNA的聚合體稱為多聚核糖體(polyribosome或polysome)。
2
?2.生物學(xué)意義
?細胞內(nèi)各種多肽的合成,不論其分子量的大小或是mRNA的長短如何,單位時
間內(nèi)所合肽分子數(shù)目都大體相等,以多聚核糖體的形式進行多肽合成,可大大
提高多肽合成的速度。mRNA在一定的時間和條件下將發(fā)生降解,以多聚核
糖體的形式進行多肽合成,對mRNA的利用及對其濃度的調(diào)控更為經(jīng)濟和有
效。
?二.蛋白質(zhì)的合成
?(一)肽鏈的起始
?1.30S小亞基與mRNA的結(jié)合
?2.第一個氨酰tRNA進入核糖體
?3.完整起始復(fù)合物的裝配
?(二)肽鏈的延伸
?1.氯酰tRNA在核糖體A位點的入位
?2.肽鍵的形成
?3.轉(zhuǎn)位
?4.tRNA的釋放
?(三)肽鏈的終止
?第三節(jié)細胞內(nèi)蛋白質(zhì)的分選
?一.蛋白質(zhì)分選proteinsorting
?(一)定義
?絕大多數(shù)蛋白質(zhì)都是由核基因編碼或在游離的核糖體上合成或在糙面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)
膜結(jié)合的核糖體上合成。合成完畢后,再通過不同的途徑轉(zhuǎn)運到細胞的特定
部位,并裝配成結(jié)構(gòu)與功能的復(fù)合體,參與組裝細胞結(jié)構(gòu),發(fā)揮其生物學(xué)功
能,這一過程稱為蛋白質(zhì)靶向轉(zhuǎn)運proteintargeting或蛋白質(zhì)分選。
?二.信號假說與蛋白質(zhì)分選信號
?(一)信號肽假說
?1.發(fā)現(xiàn)
?1972年,C.Milstein等發(fā)現(xiàn)在骨髓瘤細胞中提取的免疫球蛋白的N端栗
比分泌到細胞外的免疫球蛋白分子N端的氨基酸序列多出若干。
?2.內(nèi)容
?分泌性蛋白N端序列作為信號肽(signalpeptide),指導(dǎo)分泌性蛋白到內(nèi)質(zhì)
網(wǎng)膜上合成,然后在信號肽引導(dǎo)下蛋白質(zhì)邊合成邊通過移位子蛋白復(fù)合
體進入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔,在蛋白合成結(jié)束之前信號肽被切除。
?(二)蛋白質(zhì)分選信號(信號肽+信號識別顆粒+受體+移位子協(xié)同完成)
?1.指導(dǎo)因子:蛋白質(zhì)N-端的信號肽(signalpeptide)
3
?信號肽位于蛋白質(zhì)N端,一般含有16~26個氨基酸殘基,包括疏水核心
區(qū)、信號肽的C端和N端3部分。
?2.信號識別顆粒(signalrecognitionparticle,SRP)-----核糖核蛋白復(fù)合體
?SRP是核糖核蛋白復(fù)合體,由6種蛋白和300nt核昔酸組成,存在于細胞
質(zhì)基質(zhì)中,可與新生肽序列和核糖體大亞基結(jié)合,又可與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上
SRP受體結(jié)合。
?3.信號識別顆粒的受體(SRPreceptor,又稱停泊蛋白dockingprotein,DP)------
內(nèi)質(zhì)網(wǎng)整合膜蛋白
?SPR而受體是內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上的整合蛋白,由a和0亞基組成。
?4.起始轉(zhuǎn)移序列startransfersequence
?蛋白質(zhì)氨基末端的信號序列除作為信號被SRP識別外,還具有起始穿膜轉(zhuǎn)
移的作用。
?5.停止轉(zhuǎn)移序列
?(1)定義:
?肽鏈中還存在某些序列與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜具有很強的親合力而結(jié)合在脂雙層
之中,能阻止肽鏈進入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔,使其成為跨膜蛋白質(zhì),稱為停止轉(zhuǎn)移序
列。
?(2)分類
?①內(nèi)在停止轉(zhuǎn)移錨定序列(internalstop-transferanchorsequence,STA)
?②內(nèi)在信號錨定序列(internalsignalanchorsequence,SA)
?6.移位子translocon
?粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上的核糖體結(jié)合蛋白是移位子,這類蛋白對核糖體有高度
親和力,可與核糖體大亞基結(jié)合。
(三)信號肽與共翻譯轉(zhuǎn)運
?分泌性蛋白在信號肽引導(dǎo)下邊翻譯邊跨膜轉(zhuǎn)運的過程稱為共翻譯轉(zhuǎn)運
(cotranslationaltranslocation)。
?1.分泌性蛋白的共翻譯轉(zhuǎn)運過程
?1—2.分泌蛋白合成起始,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)靶向信號序列合成,并被游離的SRP識
別;
4
?3.SRP與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上的受體結(jié)合,引導(dǎo)核糖體-新生肽復(fù)合物附著到內(nèi)質(zhì)
網(wǎng)膜上;
?4.核糖體/新生肽與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜的移位子結(jié)合,伴隨GTP水解,SRP與相應(yīng)
受體解離,返回細胞質(zhì)基質(zhì)中重復(fù)使用,肽鏈又開始延伸,通過移位子
以神環(huán)的形式進入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔;
?5.新生肽鏈的信號序列被信肽酶切除;
?6.新生肽鏈繼續(xù)延伸,直至多肽鏈的合成結(jié)束;
?7—8.蛋白質(zhì)進入腔內(nèi)并折疊。
?2.整合膜蛋白的合成
?I、II、III型均為一次跨膜a螺旋,IV型為多次跨膜蛋白。(起始轉(zhuǎn)移
序列和終止轉(zhuǎn)移序列的數(shù)目決定多肽跨膜次數(shù))
?(1)I型蛋白
?①含有一個被切割的N端內(nèi)質(zhì)網(wǎng)信號序列;
?②通過STA錨定在膜上;
?③N端親水區(qū)位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔面,C端親水區(qū)位于細胞質(zhì)基質(zhì)面;
?④如LDL受體、流感HA、胰島素受體、生長素受體。
?(2)n型蛋白
?①不含有可切割的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)信號序列;
?②通過SA錨定在膜上;
?③N端親水區(qū)位于細胞質(zhì)基質(zhì)側(cè),C端親水區(qū)位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔面;
?④如無唾液酸糖蛋百受體、轉(zhuǎn)鐵蛋白受體、高爾基半乳糖苛轉(zhuǎn)移
酶、高爾基唾液酸轉(zhuǎn)移酶。
?(3)in型蛋白
?①不含有可切割的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)信號序列;
?②通過SA錨定在膜上;
5
?③N端親水區(qū)位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔面,C端親水區(qū)位于細胞質(zhì)基質(zhì)面;含
有一個疏水的跨膜片段,鄰近N端親水區(qū);
?④如細胞色素P450;
?(4)IV型蛋白
?①含有2個或多個跨膜妹段,又稱多次跨膜蛋白;
?②如G蛋白偶聯(lián)受體、葡糖轉(zhuǎn)運蛋白、電壓門控Ca2+通道、ABC
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