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文檔簡介
蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解翻譯過程2蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解第一節(jié)遺傳密碼mRNA分子上以5’→3’方向,從AUG開始每三個連續(xù)的核苷酸組成一個密碼子,四種堿基可以組成43計64種密碼子。這些密碼不僅代表了20種氨基酸,還決定了翻譯過程的起始與終止位置。每種氨基酸至少有一種密碼子,最多的有6種密碼子。這種代表遺傳信息的三聯(lián)體稱為密碼子,或三聯(lián)體密碼子。3蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解遺傳密碼4蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解遺傳密碼子的特點:
(1)起始碼與終止碼
mRNA5’末端的AUG(少數(shù)GUG)是起始密碼,對應(yīng)肽鏈的第一個氨基酸(蛋氨酸)的位置,因此原、真核生物合成的第一個氨基酸都是蛋氨酸;UAA,UAG,UGA是肽鏈成的終止密碼,不代表任何氨基酸,它們單獨或共同存在于mRNA3’末端。因此翻譯是沿著mRNA分子5′→3′方向進行的。5蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解(2)密碼的通用性與例外
生命世界從低等到高等,都使用一套密碼,密碼表在生物界是通用的。但不同的生物中,不同codon使用頻率不同。例外:真核生物線粒體的密碼子。如人線體中,UGA→色氨酸(非終止密碼子),AGA、AGG→終止密碼子(非Arg)。6蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解(3)簡并性與防錯一種氨基酸有幾組密碼子,或者幾組密碼子代表一種氨基酸的現(xiàn)象稱為密碼子的簡并性。
--第三位堿基決定對應(yīng)于同種氨基酸的不同密碼子稱為同義密碼子。只有色氨酸和蛋氨酸只有一個密碼子。7蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解(4)不重疊,無逗號
兩個密碼子之間沒有任何核苷酸隔開,因此從起始碼AUG開始,三個堿基代表一個氨基酸,這就構(gòu)成了一個連續(xù)不斷的讀碼框,直至終止碼。如果在讀碼框中間插入或缺失一個堿基就會造成移碼突變,引起突變位點下游氨基酸排列的錯誤。8蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解密碼子的特點
從5’開始,三聯(lián)體密碼。有起始碼與終止碼之分,無標點,不重疊,簡并性、搖擺性、通用性與防錯系統(tǒng)。9蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解第二節(jié)蛋白質(zhì)合成的主要物質(zhì)
(一)合成原料-20種基本氨基酸;(二)mRNA是合成蛋白質(zhì)的直接模板;(三)tRNA是氨基酸的運載工具;(四)核糖體是蛋白質(zhì)的合成場所;(五)多種蛋白因子參與蛋白合成過程起始因子;延伸因子;釋放因子10蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解二、tRNA轉(zhuǎn)運氨基酸到mRNA模板
反密碼子的擺動性11蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解反密碼子與密碼子配對時
的搖擺現(xiàn)象密碼子的第3個堿基與反密碼子的第1個堿基配對,兩者配對并不嚴格,反密碼的第1位堿基常出現(xiàn)次黃嘌呤I,與A、C、U結(jié)合,這是最常見的擺動現(xiàn)象。反密碼第1位堿基
ACGUI密碼第3位堿基
UGC,UA,GA,C,U12蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解四、核糖體
核糖體是蛋白質(zhì)合成的場所,由大、小兩個亞基組成,需結(jié)構(gòu)完整才能發(fā)揮功能。在體內(nèi)可游離或與mRNA以串狀形式存在。真核生物的核糖體還可與細胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)結(jié)合,形成粗糙內(nèi)質(zhì)網(wǎng)。成份:rRNA和幾十種蛋白質(zhì)。13蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解原核生物核糖體組成真核生物核糖體組成14蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解核糖體的功能區(qū)mRNA、
P、A、E位點;轉(zhuǎn)肽酶、各種因子位點15蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解(1)mRNA結(jié)合位點:在大、小亞基的接觸面上。靠30s小亞基頭部中的16SrRNA3’端與mRNAAUG之前的一段序列(SD序列)互補;(2)P位點:又叫肽酰基位點。結(jié)合延伸的多肽酰tRNA;(3)A位點也稱氨?;稽c。結(jié)合新進入的氨酰tRNA。(4)E位點:結(jié)合空載的tRNA(5)轉(zhuǎn)肽酶活性部位:位于P位和A位的連接處。(6)結(jié)合參與蛋白質(zhì)合成的起始因子IF、延長因子EF和終止因子或釋放因子RF。16蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解第三節(jié)蛋白質(zhì)合成機制
蛋白質(zhì)的合成亦稱翻譯,mRNA→氨基酸。方向:5’→3’,N端→C端。原核生物與真核生物的蛋白質(zhì)合成過程中有很多的區(qū)別,真核生物過程更復雜。蛋白質(zhì)生物合成可分為五個階段,氨基酸的活化、多肽鏈合成的起始、肽鏈的延長、肽鏈的終止和釋放、蛋白質(zhì)合成后的加工修飾。17蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解一、氨基酸的活化→氨酰tRNA氨基酸在摻入多肽鏈之前必須先活化以獲得額外能量?;罨陌被幔ò滨MP)再與其特異的tRNA結(jié)合形成氨酰tRNA。在氨酰-tRNA合成酶催化下進行。18蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解氨基酸活化成氨酰tRNA消耗兩個ATP19蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解氨酰-tRNA合成酶的特性①催化反應(yīng)的專一性。該酶至少有兩個識別位點,既識別氨基酸,又能識別轉(zhuǎn)運該氨基酸的一個或多個tRNA。對tRNA專一性極高。每種氨基酸都有2-6種各自特異的tRNA,它們之間的特異性是靠氨酰tRNA合成酶來識別的。
②校正功能。可水解錯配的氨酰-tRNA。20蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解蛋氨酰tRNA啟動蛋白質(zhì)合成轉(zhuǎn)運蛋氨酸的tRNA有兩種:①tRNAiMet:特異識別mRNA上起始密碼子AUG,摻入第一個氨基酸,啟動蛋白合成;
②tRNA
Met:與mRNA中間的AUG配對,在肽鏈延伸中摻入Met。蛋氨酸的活化形式:①起始位置:Met-tRNAiMet(原核fMet-tRNAiMet)②中間位置:Met-tRNAMet21蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解22蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解原核細胞蛋氨酰tRNA甲酰化原核細胞中起始氨基酸活化后,還要甲?;?。真核細胞沒有此過程。
FH4供給甲基Met-tRNAi
fMet-tRNAi
甲?;?/p>
23蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解二、大腸桿菌中肽鏈合成的起始
(1)起始信號SD序列:位于起始AUG上游10個堿基處一段富含嘌呤的序列。這段序列正好與30S小亞基中的16SrRNA3’端一部分序列互補,因此SD序列也叫做核糖體結(jié)合序列。這種互補就意味著核糖體能選擇mRNA上AUG的正確位置來起始肽鏈的合成。24蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解25蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解(2)起始復合物的形成:
30S起始復合物→70S起始復合物。在起始因子IF1,2,3和GTP參與下,fMet-tRNAf識別mRNA的起始密碼子AUG,與30S結(jié)合成30S起始復合物;50S與30S起始復合物結(jié)合生成70S-mRNA-fMet-tRNAf復合物,并釋放各種起始因子。此時fMet-tRNAf占據(jù)著P位點,A位則空著。26蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解70S起始復合物30S起始復合物27蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解三、多肽鏈的延長
在多肽鏈上每增加一個氨基酸都需要經(jīng)過進位,轉(zhuǎn)肽和移位三個步驟。(1)進位:為密碼子所規(guī)定的氨酰tRNA結(jié)合到核糖體的A位,稱為進位。需延伸因子EF-Tu、EF-Ts和GTP參與。28蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解(2)轉(zhuǎn)肽(肽鍵的形成):P位上的肽酰tRNA提供α-COOH基,和新進入的Aa的α-NH2形成肽鍵,從而使P位上的肽連接到A位氨基酸的氨基上。新合成的肽酰tRNA處于A位。23SRNA催化。
(3)移位(Translocation):肽酰tRNA又進入P位,空載tRNA進入E位。重復進位、轉(zhuǎn)肽、移位,肽鏈沿N→C方向延伸。29蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解30蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解31蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解四、翻譯的終止及肽鏈的釋放
當肽鏈延伸到終止密碼子時,沒有任何tRNA與之對應(yīng),故A位空出,釋放因子RF識別終止密碼子,進入A位,使肽酰轉(zhuǎn)移酶變?yōu)樗饷富钚?,釋放出肽鏈和tRNA。生物體為了加強終止,通常設(shè)置了兩個以上并排的終止密碼。所以要合成含n個AA殘基的肽鏈,mRNA至少含有3n+6個核苷酸。
32蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解34蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解多聚核糖體上述只是單個核糖體的翻譯過程,事實上在細胞內(nèi)一條mRNA鏈上結(jié)合著多個核糖體,甚至可多到幾百個。第一個核糖體翻譯移動一定距離后,第二個核糖體又在mRNA的起始部位結(jié)合。兩個核糖體之間有一定的長度間隔,每個核糖體都獨立完成一條多肽鏈的合成,所以這種多核糖體可以在一條mRNA鏈上同時合成多條相同的多肽鏈,這就大大提高了翻譯的效率。35蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解系列核糖體同時翻譯同一條mRNA36蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解37蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解真核生物蛋白質(zhì)的合成核糖體不同:原核70S(50+30),真核80S(60+40)起始Aa不同:原核是fMet,真核是Met起始機制不同:原核SD序列,真核5’端帽子。起始復合物的形成過程不同。真核生物過程更復雜,需要的因子更多。38蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解五、蛋白質(zhì)合成的抑制劑抗生素直接抑制蛋白質(zhì)合成:原核:氯霉素、四環(huán)素、鏈霉素、新霉素、卡拉霉素、紅霉素、真核:亞胺環(huán)己酮、白喉毒素嘌呤霉素(628)對原核、真核均有抑制作用。39蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解與DNA模板作用與RNA聚合酶作用原核生物真核生物放線菌素D--插入dG*dC間低濃度--(-)RNA延長高濃度--(-)RNA起始
(-)DNA復制利福平/利福霉素和RNA聚合酶β亞基結(jié)合--(-)轉(zhuǎn)錄起始/延伸α鵝膏蕈堿--(-)RNA聚合酶Ⅱ間接抑制40蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解第四節(jié)蛋白的運輸?shù)鞍踪|(zhì)的合成部位在核糖體,合成后去向有三個:①保留在胞漿;②進入細胞核、線粒體或其它細胞器;③分泌到細胞外??缒み\輸:②③去向需越過不同的膜結(jié)構(gòu)。信號肽決定了肽的走向。靶向運輸:蛋白質(zhì)合成后,定向到達其執(zhí)行功能的目的地點。41蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解信號肽:絕大多數(shù)越膜蛋白的N端約有15-30個以疏水氨基酸為主的N端信號序列。共有特征:①N端堿性Aa;②中間15~30個疏水氨基酸;③C端有信號肽酶切位點。42蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解第五節(jié)加工修飾多肽移位到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)后,在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的小腔上被修飾。修飾作用包括切去信號肽,形成二硫鍵,使線性多肽呈獻一定空間結(jié)構(gòu)及糖基化作用。在高爾基體中,糖蛋白的寡糖核進一步修飾,并將多肽分類輸送到各處。43蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解加工修飾切除信號肽糖基化44蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識講解蛋白質(zhì)翻譯后的折疊
大多數(shù)蛋白質(zhì)翻譯后要進行不同形式的加工修飾,并折疊成一定形狀才有活性。蛋白質(zhì)分子的氨基酸序列沒有改變,只是其高級結(jié)構(gòu)或者說構(gòu)象改變引起的疾病,那就是所謂“構(gòu)象病”,或稱“折疊病”,如瘋牛病、老年性癡呆癥、家族性高膽固醇癥、家族性淀粉樣蛋白癥、某些腫瘤、白內(nèi)障等等。對蛋白質(zhì)折疊機
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