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食工基因工程的基本技術(shù)第1頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月技術(shù)4DNA重組技術(shù)技術(shù)6
基因文庫(kù)構(gòu)建技術(shù)5核酸雜交技術(shù)第2頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月技術(shù)4DNA重組技術(shù)(一)基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ)(二)基因工程的載體系統(tǒng)(三)連接、轉(zhuǎn)化與重組子鑒定第3頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月(一)基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ)基因工程常用工具酶主要包括如下:1、限制性內(nèi)切酶3、連接酶2、DNA聚合酶4、其它修飾酶第4頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月定義:指能識(shí)別特定的DNA序列并在一定的條件下可在識(shí)別位置或附近對(duì)DNA進(jìn)行切割的酶。1、限制性內(nèi)切酶(restrictionendonuclase)第5頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月限制性內(nèi)切酶的種類ⅠⅡⅢ限制性活性+++甲基化酶活性+-+DNA識(shí)別序列+++切割特異性隨機(jī)專一
切割位點(diǎn)距識(shí)別位點(diǎn)10-25bP對(duì)ATP依賴性+-+對(duì)Mg2+依賴性+++蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)3種不同亞基單一成分2種不同的亞基
第6頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月限制性核酸內(nèi)切酶的命名命名規(guī)則:寄主菌屬名的第1個(gè)字母+種名的前兩個(gè)字母+菌株或菌型代號(hào)(大寫(xiě))+空白+發(fā)現(xiàn)序列(羅馬數(shù)字)例子:
EcoRⅠ(E:屬名;co:種名;R:株;Ⅰ:發(fā)現(xiàn)次序)第7頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月屬名種名菌株Haemophilusinfluenzaed
嗜血流感桿菌d株H
in
dHin
dIII同一菌株中所含的多個(gè)不同的限制性核酸內(nèi)切酶。例子注意斜體哦!第8頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月
Ⅱ型酶的特性:(1)識(shí)別序列:4-8堿基的特異序列,通常具有回文結(jié)構(gòu):如EcoRI:GGCCAATTTTAA第9頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月B、平頭末端(bluntend):
切割點(diǎn)位于識(shí)別位點(diǎn)的中間,切斷的DNA片斷具有平齊的末端(2)、切割方式:A、粘性末端(stickyend):
兩條DNA鏈上的切割點(diǎn)不一致,切斷的DNA片斷的末端上含有一條多個(gè)核苷酸的單鏈,包括5’端凸出和3’端凸出。產(chǎn)生兩種切割方式:第10頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月1)、產(chǎn)生
5’端凸出粘性(如EcoRI切點(diǎn))CTTAAGGAATTC5’--3’
3’--5’
CTTAAG
GAATTC
5’--3’
3’--5’
①產(chǎn)生粘性末端第11頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月2)、產(chǎn)生3‘粘性末末端:如PstI5’--3’
3’--5’
CTGCAG
GACGTC
CTGCAG
GACGTC
5’--3’
3’--5’
第12頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月②產(chǎn)生平末端:TTTAAAAAATTT
TTT
AAA
AAA
TTTCCCGGGGGGCCC5′3′5′5′CCCGGGGGGCCC3′3′5′3′DraISmaI第13頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月(3)同裂酶:①完全同裂酶:識(shí)別位點(diǎn)和切點(diǎn)完全相同。如HindⅢ
和HsuI。HindⅢ5’-AAGCTT-3’3’-TTCGAA-5’
HsuI5’-AAGCTT-3’3’-TTCGAA-5’
識(shí)別序列相同,切割位點(diǎn)有些相同,有些不同。第14頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月XmaI5’-CCCGGG-3’3’-GGGCCC-5’
SmaI5’-CCCGGG-3’3’-GGGCCC-5’
識(shí)別位點(diǎn)相同,但切點(diǎn)不同。如XmaI和
SmaI。②不完全同裂酶:第15頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月來(lái)源不同,識(shí)別的序列不同,但能切出相同的粘性末端,連接后不能被相關(guān)的酶同時(shí)切割。如BamHI、BglⅡ、XhoⅡ等。(4)同尾酶(Isocaudamers)5’-GGATCC-3’3’-CCTAGG-5’
BamHI5’-AGATCT-3’3’-TCTAGA-5’
BglⅡ5’-UGATCY-3’3’-YCTAGU-5’Xho
ⅡU代表嘌呤;Y代表嘧啶。第16頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月限制性內(nèi)切酶活性單位U
:
限制性內(nèi)切酶的識(shí)別和酶切活性一般在一定的溫度、離子強(qiáng)度、pH等條件下才表現(xiàn)最佳切割能力和位點(diǎn)的專一性。
限制性內(nèi)切酶活性:
在建議使用Buffer、溫度下,在20uL反應(yīng)體系中1小時(shí)使1μg入DNA完全酶切所需的酶。第17頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月星活性(staractivity):
在非最適合的條件下酶的識(shí)別特異性降低,產(chǎn)生非特異性帶,這種活性稱星活性。限制性內(nèi)切酶在使用中,使用不當(dāng),會(huì)出現(xiàn)所謂的星活性。注意了??!第18頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月DNA中的雜質(zhì)如蛋白質(zhì)、酚、氯仿、乙醇、SDS、EDTA等都會(huì)影響酶的活性。1).DNA的純度
影響限制性內(nèi)切酶活性的因素2).DNA的甲基化程度
dam甲基化酶(修飾GATC中的A);dcm甲基化酶(修飾CCA/TGG的C)。第19頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月3).溫度
不同的限制性內(nèi)切酶的最適反應(yīng)溫度不同。大多數(shù)是37oC,少數(shù)要求40-65oC。是影響限制酶活性的重要因素。4).緩沖液(Buffer)商品化的限制酶一般都帶有專用緩沖液。MgCl2、NaCl/KCl:
提供Mg2+和離子強(qiáng)度;Tris-HCl:
維持pH;二硫蘇糖醇(DTT):保持酶穩(wěn)定性;牛血清白蛋白BSA等:有助于酶的穩(wěn)定;β-巰基乙醇:保持酶的穩(wěn)定性,防止酶失活。第20頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月用時(shí)在冰上操作;取酶用干燥、滅菌、新的槍頭酶用量不能超過(guò)酶切總體積的10%;多種酶進(jìn)行酶切時(shí),先低鹽后高鹽緩沖液;關(guān)心小貼士告訴你使用時(shí)注意事項(xiàng):第21頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月2、連接酶(Ligase)連接酶種類:DNA連接酶和RNA連接酶DNA連接酶:
T4DNA連接酶和大腸桿菌連接酶DNA連接酶功能:
間斷修復(fù)
連接作用第22頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月1)大腸桿菌連接酶只能連接粘性末端。2)T4噬菌體的連接酶不但能連接粘性末端,還能連接齊平末端。(1)、兩種連接酶連接特點(diǎn)。DNA連接酶:第23頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月(1)必須是兩條雙鏈DNA。(2)DNA3’端有游離的-OH,
5’端有一個(gè)磷酸基團(tuán)(P)。(3)需要能量動(dòng)物或噬菌體中:ATP大腸桿菌中:
NAD+(2).連接條件第24頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月
效率:粘性末端>平端(100倍);
5,突出>3,突出;
平端:HaeIII>AluI>HinCII>SmaI1)連接所用的目的片段的狀態(tài):(3)、影響連接效果的因素:第25頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月
ATP:反復(fù)凍熔,ATP活性降低,ATP溶解度不高,連接緩沖液宜分裝;單價(jià)離子:150-200mMNaCl,提高連接效果;
PEG:5%以下可以提高連接效率連接效果最好在37℃,但形成的互補(bǔ)不穩(wěn)定;最佳連接溫度:12-16℃,較好的連接效果,互補(bǔ)又較穩(wěn)定;2)連接溫度:3)反應(yīng)液中的成分:第26頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月目的或作用:4)插入片段與載體的濃度比例
載體DNA與外源DNA的分子摩爾比通常為1﹕3左右,甚至1﹕10或更高。增加插入片段與載體的接觸機(jī)會(huì),減少載體自我連接的現(xiàn)象。第27頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月?依賴DNA的聚合酶:DNA聚合酶I?依賴RNA的DNA聚合酶:逆轉(zhuǎn)錄酶?不依賴DNA的聚合酶:末端轉(zhuǎn)移酶2、DNA聚合酶(Polymerase)(1)DNA聚合酶類型:第28頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月(2)基因工程中常用的DNA聚合酶1)、大腸桿菌DNA聚合酶2)、Klenowfragment
3)、T7DNA聚合酶4)、T4DNA聚合酶
5)、修飾過(guò)的T7DNA聚合酶6)、逆轉(zhuǎn)錄酶7)、TaqDNA聚合酶第29頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月基本性質(zhì):
5‘→3‘的DNA聚合酶活性;
5‘→3‘的核酸外切酶活性;
3‘→5‘的核酸外切酶活性。1)、大腸桿菌DNA聚合酶I(DNApolI)第30頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月Klenow酶的來(lái)源:
—大腸桿菌DNA聚合酶I經(jīng)枯草桿菌蛋白酶處理,獲得N端三分之二的大肽段,即為Klenow酶。Klenow酶的基本性質(zhì):
5‘→3‘的DNA聚合酶活性
3‘→5‘的核酸外切酶活性2)、大腸桿菌DNA聚合酶I大片段(Klenow)第31頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月3)、T4、T7-DNA聚合酶基本特性:均具有5‘→3‘的DNA聚合酶活性,3‘→5‘的核酸外切酶活性T4聚合酶3‘→5‘的核酸外切酶活性強(qiáng),而T7聚合酶5‘→3‘的DNA聚合酶活性第32頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月依賴于RNA的DNA聚合酶,最主要用途,以mRNA為模板合成cDNA3’AAAAAAAAAAAA5’TTTTTTTTTTTTT5’mRNA3’cDNA3’AAAAAAAAAAAA5’TTTTTTTTTTT5’mRNAoligo(dT)12-18反轉(zhuǎn)錄酶Mg2+dNTP4)、反轉(zhuǎn)錄酶第33頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月5)、TaqDNA聚合酶
特點(diǎn):
分離自水生棲熱菌,分子量為94,000,最適反應(yīng)溫度75℃,對(duì)95℃高溫具良好穩(wěn)定性,該酶不存在3’→5’外切酶活性。用途:
主要用于DNA的體外擴(kuò)增(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))第34頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月(3)DNA聚合酶的用途:DNA片斷探針的標(biāo)記DNA分子的體外合成DNA分子的體外突變DNA分子的序列分析DNA分子的修復(fù)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)第35頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月4、其它修飾酶堿性磷酸酶:功能為去除DNA或RNA5‘-末端的磷酸反應(yīng),包括:
?來(lái)自小牛胸腺的堿性磷酸酶(CIP)
?來(lái)自大腸桿菌的堿性磷酸酶(BAP)磷酸激酶:在DNA、RNA的5‘-OH上加磷酸,常用于探針標(biāo)記其它酶:核酸外切酶III、VII、S1核酸酶、RNaseA、DNaseⅠ第36頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月(二)基因工程的載體系統(tǒng)第37頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月載體的功能:運(yùn)送外源基因高效轉(zhuǎn)入受體細(xì)胞;為外源基因提供復(fù)制能力或整合能力;為外源基因的擴(kuò)增或表達(dá)提供必要的條件。第38頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月具有針對(duì)受體細(xì)胞的親緣性或親和性(可轉(zhuǎn)移性);具有合適的篩選標(biāo)記;具有較高的外源DNA的載裝能力;具有多克隆位點(diǎn)(MCS);具有與特定受體細(xì)胞相適應(yīng)的復(fù)制位點(diǎn)或整合位點(diǎn)。載體應(yīng)具備的條件:第39頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月
基因工程中常用的載體(vector)主要包括質(zhì)粒(plasmid)、噬菌體(phage)和病毒(virus)三大類。這些載體均需經(jīng)人工構(gòu)建,除去致病基因,并賦予一些新的功能,如有利于進(jìn)行篩選的標(biāo)志基因、單一的限制酶切點(diǎn)等。
第40頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月一、質(zhì)粒質(zhì)粒的基本特征:(1)質(zhì)粒的自主復(fù)制性質(zhì)——質(zhì)粒能利用寄主細(xì)胞的DNA復(fù)制系統(tǒng)進(jìn)行自主復(fù)制。
?嚴(yán)緊型:1-3拷貝
?松弛型:10-60拷貝
是存在于天然細(xì)菌體內(nèi)的一種獨(dú)立于細(xì)菌染色體之外的雙鏈環(huán)狀DNA,具有獨(dú)立復(fù)制的能力,通常帶有細(xì)菌的抗藥基因。第41頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月(2)質(zhì)粒的不相容性●定義:任何兩種含有相似復(fù)制子結(jié)構(gòu)的不同質(zhì)粒,不能同時(shí)存在于一個(gè)細(xì)胞中,這種現(xiàn)象稱為質(zhì)粒的不相容性?!穹肿訖C(jī)理:兩種含有相似復(fù)制子結(jié)構(gòu)的不同質(zhì)粒,在復(fù)制同時(shí)受到同一種拷貝數(shù)控制系統(tǒng)的干擾,致使兩種質(zhì)粒的最終拷貝數(shù)不同,其中拷貝數(shù)多的質(zhì)粒在以后的細(xì)胞分裂周期中更具優(yōu)勢(shì)。第42頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月(3)質(zhì)粒的可轉(zhuǎn)移性,如F、Col、R質(zhì)粒等(4)攜帶特殊的遺傳標(biāo)記:
?物質(zhì)抗性:如抗生素、重金屬離子
?物質(zhì)合成:如細(xì)菌毒素、有機(jī)堿第43頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月抗生素基因:blaorampr:抗氨芐青霉素catoramlr:抗綠霉素kanorkanr:抗卡那霉素strorstrr:抗鏈霉素tetortetr:抗四環(huán)素第44頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月第45頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月二、噬菌體載體——(bacteriumphage)噬菌體-細(xì)菌病毒,由核酸和蛋白質(zhì)外殼組成;噬菌體類型:溫和型和烈性兩種第46頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月1、噬菌體載體屬溫和型噬菌體;具有COS黏性末端;類型分為:替換型和插入型;
替換型載體-可插入12-25KB的片段
插入型載體-可克隆小于10KB的片段第47頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月2、柯斯質(zhì)粒(Cosmid)是一種帶有黏性末端位點(diǎn)的質(zhì)粒構(gòu)建:是一種以噬菌體為基礎(chǔ)為克隆大片段而設(shè)計(jì)并和質(zhì)粒共同構(gòu)建的雜合載體,具有噬菌體的COS位點(diǎn)和質(zhì)粒的復(fù)制子,具有噬菌體和質(zhì)粒的雙重特征。第48頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月第49頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月柯斯質(zhì)粒載體的特征:1、具有噬菌體的特點(diǎn):具有COS位點(diǎn)-體外包裝成噬菌體顆粒環(huán)化,不形成噬菌斑2、具有質(zhì)粒載體的特點(diǎn):在寄主內(nèi)復(fù)制和具抗生素抗性基因。3、克隆能力強(qiáng):40-50KB第50頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月三、人工染色體載體類型BAC:bacterialartificialchromosomes
,細(xì)菌人工染色體YAC:yeastartificialchromosome,酵母人工染色體TAC:transferartificialchromosome,可轉(zhuǎn)化人工染色體第51頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月oriS基因和repE基因是載體復(fù)制所必需第52頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月第53頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月(三)連接、轉(zhuǎn)化與重組子鑒定3、轉(zhuǎn)化子的篩選和鑒定(檢)重組DNA技術(shù)的操作過(guò)程:1、DNA的體外切割與連接2、重組DNA分子的轉(zhuǎn)化和擴(kuò)增(轉(zhuǎn)、增)第54頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月1、DNA連接過(guò)程:思考題:具有不同的粘性末端的DNA如何連接?第55頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月思考:DNA連接后接下來(lái)再干什么?第56頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月2、重組DNA分子的轉(zhuǎn)化和擴(kuò)增(轉(zhuǎn)、增)(1)轉(zhuǎn)化的方法A、Ca2+誘導(dǎo)的完整細(xì)菌細(xì)胞的轉(zhuǎn)化(化學(xué)法)B、電穿孔轉(zhuǎn)化第57頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月A、化學(xué)法(CaCl2法):(2)轉(zhuǎn)化的原理與技術(shù)轉(zhuǎn)化原理:是Ca2+與細(xì)菌外膜磷脂在低溫下形成液晶結(jié)構(gòu),后者經(jīng)熱脈沖發(fā)生收縮作用,使細(xì)胞膜出現(xiàn)空隙,質(zhì)?;駾NA重組分子便可進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)(感受態(tài)細(xì)胞)。第58頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月
轉(zhuǎn)化原理:將待轉(zhuǎn)化的質(zhì)粒或DNA重組連接液加在電穿孔轉(zhuǎn)化儀的樣品池中,兩極施加高壓電場(chǎng),在強(qiáng)大電場(chǎng)的作用下,細(xì)菌細(xì)胞壁和細(xì)胞膜產(chǎn)生縫隙,質(zhì)粒或DNA重組分子便可進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)。B、電穿孔轉(zhuǎn)化:第59頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月(3)、轉(zhuǎn)化率定義另一表述:每微克載體DNA轉(zhuǎn)化后,獲得的克隆數(shù)(在篩選時(shí),未接納載體或重組子受體細(xì)胞不長(zhǎng))。定義:每微克載體DNA在最佳轉(zhuǎn)化條件下進(jìn)入受體細(xì)胞的分子數(shù)。第60頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月影響轉(zhuǎn)化率的主要影響因素:載體本身的性質(zhì)及其空間構(gòu)象:超螺旋構(gòu)象轉(zhuǎn)化率最高;插入片段的大?。翰迦肫卧酱螅D(zhuǎn)化效率越低;受體細(xì)胞的類型及預(yù)處理;轉(zhuǎn)化方法:電擊法高于化學(xué)法。第61頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月3、轉(zhuǎn)化子的篩選和鑒定
——進(jìn)行選擇的目的:
借助各種篩選和鑒定方法區(qū)分轉(zhuǎn)化子與非轉(zhuǎn)化子、重組子與非重組子、目的重組子與非目的重組子。第62頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月
從總體上看,重組體分子的選擇與鑒定方法基本上可以分為如下幾個(gè)類型:(3)基于外源基因產(chǎn)物檢測(cè)法(1)基于載體遺傳標(biāo)記檢測(cè)法(2)基于克隆DNA序列檢測(cè)法第63頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月(1)、基于載體遺傳標(biāo)記檢測(cè)抗藥性篩選法;顯色篩選法。營(yíng)養(yǎng)缺陷型篩選法;根據(jù)載體遺傳標(biāo)記特點(diǎn),可細(xì)分為:第64頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月ROPROISalIBamHITcrPvuIPstIPstIEcoRIClaIHindIIIHindIIBalIAprpBR3224363bpori抗藥性篩選法:抗藥類型:氨芐青霉素卡那霉素四環(huán)素氯霉素鏈霉素第65頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月顯色篩選法:第66頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月限制性酶切圖譜法;菌落(噬菌斑)原位雜交法;
DNA序列分析法。
PCR擴(kuò)增法(2)根據(jù)克隆DNA序列檢測(cè)第67頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月ROPROISalIBamHITcrPvuIPstIPstIEcoRIClaIHindIIIHindIIBalIAprpBR3224363bpori限制性酶切圖譜法第68頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月DNA序列分析法。Sanger雙脫氧法第69頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月(3)基于插入外源基因表達(dá)產(chǎn)物檢測(cè):免疫化學(xué)檢測(cè)法:聚丙烯酰胺凝膠電泳法。包括抗體測(cè)定法(如ELISA法)、免疫沉淀法前提條件:克隆基因在宿主細(xì)胞內(nèi)表達(dá)第70頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月在瓊脂培養(yǎng)基中加入目標(biāo)蛋白的特異性抗體,目的重組子菌落會(huì)分泌出目標(biāo)蛋白,后者與特異性抗體發(fā)生免疫沉淀反應(yīng),在菌落周圍形成白色的圓斑。免疫化學(xué)檢測(cè)--免疫沉淀鑒定:第71頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月免疫化學(xué)檢測(cè)--ELISA法第72頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月
聚丙烯酰胺凝膠電泳法。第73頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月技術(shù)5核酸雜交技術(shù)(Nucleicacidhybridization)第74頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月
互補(bǔ)的核苷酸序列通過(guò)Waltson-Crick堿基配對(duì)形成穩(wěn)定的雜合雙鏈DNA分子、DNA-RNA分子的過(guò)程稱為雜交。一、核酸分子雜交的定義第75頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月二、核酸雜交類型Southern雜交:Northern雜交:Western雜交:菌落原位雜交:主要類型:DNARNA蛋白質(zhì)DNA探針DNADNA抗體DNA被檢測(cè)對(duì)象其它:原位雜交:FISH、GISH
斑點(diǎn)(dot)雜交和狹槽(slot)雜交。
第76頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月三、雜交三要素1、探針(DNA、RNA或抗體)包括探針的來(lái)源和標(biāo)記2、被檢測(cè)的對(duì)象(DNA、RNA或蛋白質(zhì))包括被檢測(cè)樣品的分離準(zhǔn)備3、雜交膜
--硝酸纖維素濾膜、尼龍膜和Whatman541濾紙第77頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月1、探針§1、探針的分類按核酸分子的不同:可分為DNA探針和RNA探針根據(jù)標(biāo)記物的不同:可分放射性標(biāo)記探針和非放射性標(biāo)記探針;§2、探針的標(biāo)記方法雙鏈DNA探針標(biāo)記主要方法:
A、切口平移法
B、隨機(jī)引物合成法第78頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月DNA聚合酶Ⅰ:合成DNA鏈作用A、切口平移法AGDNA酶Ⅰ打開(kāi)缺口作用DNA聚合酶Ⅰ涉及的相關(guān)酶:DNA酶Ⅰ:打缺口作用B、隨機(jī)引物合成法§原理:是使寡核苷酸引物與DNA模板結(jié)合,在
Klenow酶的作用下,合成DNA探針。第79頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月四、Southern雜交
第80頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月1、Southern雜交操作步驟:(1)用限制性內(nèi)切酶酶切DNA,經(jīng)凝膠電泳分離各酶切片段;(2)轉(zhuǎn)膜:將DNA片段轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素濾膜或尼龍膜上;轉(zhuǎn)膜方式:毛細(xì)管轉(zhuǎn)移法、真空印跡法、電轉(zhuǎn)移法。
(6)自顯影檢查目的DNA所在的位置。(3)預(yù)雜交:封阻濾膜上非特異性位點(diǎn);(4)雜交:讓探針與同源DNA片段特異性結(jié)合;(5)洗脫:去除非特異性結(jié)合的探針;第81頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月2、
Southern雜交影響因子分析1)、目的DNA在總DNA中所占的比例3)、轉(zhuǎn)移到濾膜上的DNA量2)、探針的大小和標(biāo)記效率4)、探針與靶DNA的同源性第82頁(yè),課件共91頁(yè),創(chuàng)作于2023年2月
3、Southern雜交的目的與用途§目的:用來(lái)檢測(cè)被研究DNA中(包括經(jīng)限制性內(nèi)切酶切割后的DNA片段或PC
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