現(xiàn)代生物學(xué)大實(shí)驗(yàn)本科生課件_第1頁(yè)
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質(zhì)粒DNA的提取、擴(kuò)增和鑒定實(shí)驗(yàn)?zāi)康膶W(xué)習(xí)質(zhì)粒的相關(guān)基本知識(shí);掌握堿裂解法提取質(zhì)粒DNA的原理和方法。質(zhì)粒(Plasmid)是一種染色體外的穩(wěn)定遺傳因子,大小從1-200kb不等,為雙鏈、閉環(huán)的DNA分子,并以超螺旋狀態(tài)存在于宿主的細(xì)胞質(zhì)中。質(zhì)粒主要發(fā)現(xiàn)于細(xì)菌、放線菌和真菌細(xì)胞中,它具有自主復(fù)制和轉(zhuǎn)錄能力,能在子代細(xì)胞中保持恒定的拷貝數(shù),并表達(dá)所攜帶的遺傳信息。質(zhì)粒的存在使宿主具有一些額外的特性,如對(duì)抗生素的抗性等。常見的天然質(zhì)粒有F質(zhì)粒(又稱F因子或性質(zhì)粒)、R質(zhì)粒和Col質(zhì)粒。

質(zhì)粒在細(xì)胞內(nèi)的復(fù)制一般有兩種類型:

緊密控制型(Stringentcontrol)

松馳控制型(Relaxedcontrol)

前者只在細(xì)胞周期的一定階段進(jìn)行復(fù)制,當(dāng)染色體不復(fù)制時(shí),它也不能復(fù)制,通常每個(gè)細(xì)胞內(nèi)只含有1個(gè)或幾個(gè)質(zhì)粒,如F因子。后者的質(zhì)粒在整個(gè)細(xì)胞周期中隨時(shí)可以復(fù)制,在每個(gè)細(xì)胞中有許多拷貝,一般在20個(gè)以上,如Col質(zhì)粒。一個(gè)理想的質(zhì)粒克隆載體應(yīng)具有的特性:(1)分子量?。唬?)多拷貝、松馳控制型;(3)具有多種常用的限制性內(nèi)切酶的單酶切位點(diǎn),即多克隆位點(diǎn)(MCS,multiplecloningsites);(4)能插入較大的外源DNA片段;(5)具有容易操作的檢測(cè)表型。如抗生素抗性、a-互補(bǔ)顯色反應(yīng)(藍(lán)白斑篩選)常用的質(zhì)粒載體大小一般在1kb至10kb之間,克隆載體如:pGEM-T、pUCm-T和pBluescript(簡(jiǎn)稱pBS)等,表達(dá)載體如:p1300質(zhì)粒等質(zhì)粒載體是在天然質(zhì)粒的基礎(chǔ)上為適應(yīng)實(shí)驗(yàn)室操作而進(jìn)行人工構(gòu)建的。常用的質(zhì)粒載體可以分為克隆載體和表達(dá)載體pBluescriptII儀器、試劑和材料

1、設(shè)備:恒溫培養(yǎng)箱、恒溫?fù)u床、臺(tái)式離心機(jī)、超凈工作臺(tái)、PCR儀、高壓滅菌鍋、瓊脂糖凝膠電泳及分析系統(tǒng)等。2、試劑:Tris、EDTA、SDS、含質(zhì)粒大腸桿菌、瓊脂糖、溴化乙錠、DNAmarker等。超凈工作臺(tái)制冰機(jī)高速冷凍離心機(jī)水平電泳裝置

利用凝膠成像系統(tǒng)進(jìn)行檢測(cè)質(zhì)粒DNA提取的實(shí)驗(yàn)原理利用染色體DNA與質(zhì)粒DNA的變性與復(fù)性的差異而達(dá)到分離的目的。在堿變性條件下,細(xì)菌在NaOH和SDS溶液中裂解,蛋白質(zhì)和DNA發(fā)生變性,但是染色體DNA的氫鍵斷裂,雙螺旋解開而變性,質(zhì)粒DNA氫鍵也大部分?jǐn)嗔?,雙螺旋也有部分解開,但共價(jià)閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)的兩條互補(bǔ)鏈不會(huì)完全分離。實(shí)驗(yàn)原理當(dāng)pH=4.8的乙酸鉀將其pH調(diào)到中性時(shí),變性的質(zhì)粒DNA又恢復(fù)到原來(lái)的構(gòu)型,而染色體DNA不能復(fù)性,形成纏繞的致密網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。同時(shí),在反應(yīng)體系中變性的蛋白質(zhì)會(huì)形成大量沉淀以及十二烷基磺酸鉀沉淀,染色體DNA會(huì)進(jìn)一步纏繞在這些沉淀上。離心后,染色體DNA與蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物等一起沉淀下來(lái)而被除去,質(zhì)粒DNA留在上清里。(1)取液體培養(yǎng)菌液10mL置離心管中,10000r/min離心10min去掉上清液。加入150μL的GET緩沖液,充分混勻,在室溫下放置10min。

(2)加入200μL新配置的0.2mol/LNaOH,1%SDS。加蓋,顛倒2~3次使之混勻。冰上放置5min。SDS能使細(xì)胞膜裂解,并使蛋白質(zhì)變性。質(zhì)粒DNA的提取步驟(3)加150μL冷卻的乙酸鉀溶液,加蓋后顛倒數(shù)次混勻,冰上放置15min。10000r/min離心5min,上清液倒入另一離心管中。乙酸鉀能沉淀SDS和SDS與蛋白質(zhì)的復(fù)合物。在冰上放置15min是為了使沉淀完全。(4)向上清液中加入等體積酚/氯仿,震蕩混勻,10000r/min離心2min,將上清液轉(zhuǎn)移至新的離心管中。

(5)向上清液中加入2倍體積無(wú)水乙醇,混勻,室溫放置2min。離心5min,倒去上清乙醇溶液,將離心管倒扣在吸水紙上,吸干液體,然后加入50μL的TE緩沖液保存。PCR原理SampledenaturatationPrimerannealingPrimerextensionPCR

productPCR反應(yīng)曲線標(biāo)準(zhǔn)的PCR反應(yīng)體系10×擴(kuò)增緩沖液10ul

4種dNTP混合物各200umol/L

引物10~100pmol

模板DNA0.1~2ug

TaqDNA聚合酶2.5u

Mg2+1.5mmol/L

加雙或三蒸水至100ulPCR反應(yīng)五要素引物(primer)

酶(TaqDNApolymerase)

dNTP

(dATP,dGTP,dCTP,dTTP)模板(template)Mg2+(magnesium)引物引物是PCR特異性反應(yīng)的關(guān)鍵PCR產(chǎn)物的特異性取決于引物與模板DNA互補(bǔ)的程度理論上,只要知道任何一段模板DNA序列,就能按其設(shè)計(jì)互補(bǔ)的寡核苷酸鏈做引物,用PCR就可將模板DNA在體外大量擴(kuò)增引物設(shè)計(jì)的原則(一)①引物長(zhǎng)度:

15-30bp,常用為20mer左右引物的有效長(zhǎng)度不能大于38mer,否則最適延伸溫度會(huì)超過(guò)TaqDNA聚合酶的最適溫度(74℃),不能保證PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的特異性②引物擴(kuò)增跨度:以500bp為宜特定條件下可擴(kuò)增長(zhǎng)至10kb的片段③引物堿基:G+C含量以40-60%為宜G+C太少擴(kuò)增效果不佳,G+C過(guò)多易出現(xiàn)非特異條帶ATGC最好隨機(jī)分布,避免5個(gè)以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列引物設(shè)計(jì)的原則(二)④避免引物內(nèi)部出現(xiàn)二級(jí)結(jié)構(gòu)避免兩條引物間互補(bǔ),特別是3’端的互補(bǔ),否則會(huì)形成引物二聚體,產(chǎn)生非特異性的擴(kuò)增條帶⑤引物3’端的堿基要求嚴(yán)格配對(duì)

特別是最末及倒數(shù)第二個(gè)堿基,以避免因末端堿基不配對(duì)而導(dǎo)致PCR失?、抟镏杏谢蚰芗由虾线m的酶切位點(diǎn)被擴(kuò)增的靶序列最好有適宜的酶切位點(diǎn),這對(duì)酶切分析或分子克隆很有好處引物設(shè)計(jì)的原則(三)⑦引物的特異性:引物應(yīng)與核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)的其它序列無(wú)明顯同源性⑧引物量:每條引物的濃度0.1~1umol或10~100pmol,以最低引物量產(chǎn)生所需要的結(jié)果為好引物濃度偏高會(huì)引起錯(cuò)配和非特異性擴(kuò)增,且可增加引物之間形成二聚體的機(jī)會(huì)酶及其濃度目前有兩種TaqDNA聚合酶供應(yīng)天然酶:從棲熱水生桿菌中提純基因工程酶:大腸菌合成一個(gè)典型的PCR反應(yīng)約需酶量2.5U(指總反應(yīng)體積為100ul時(shí))濃度過(guò)高可引起非特異性擴(kuò)增,濃度過(guò)低則合成產(chǎn)物量減少dNTP

的質(zhì)量與濃度dNTP的質(zhì)量與濃度和PCR擴(kuò)增效率有密切關(guān)系dNTP呈顆粒狀,保存不當(dāng)易變性失活dNTP溶液呈酸性,使用時(shí)應(yīng)配成高濃度后,以1MNaOH或1MTris-HCl的緩沖液將其pH調(diào)節(jié)到7.0~7.5,小量分裝,-20℃冰凍保存。多次凍融會(huì)使dNTP降解在PCR反應(yīng)中,dNTP應(yīng)為50~200umol/L,尤其是注意4種dNTP的濃度要相等(等摩爾配制),如其中任何一種濃度不同于其它幾種時(shí)(偏高或偏低),就會(huì)引起錯(cuò)配。濃度過(guò)低又會(huì)降低PCR產(chǎn)物的產(chǎn)量dNTP

能與Mg2+結(jié)合,使游離的Mg2+濃度降低模板(靶基因,targetgene)模板核酸的量與純化程度,是PCR成敗與否的關(guān)鍵環(huán)節(jié)之一傳統(tǒng)的DNA純化方法通常采用SDS和蛋白酶K來(lái)消化處理標(biāo)本SDS的主要功能是:溶解細(xì)胞膜上的脂類與蛋白質(zhì),因而溶解膜蛋白而破壞細(xì)胞膜,并解離細(xì)胞中的核蛋白,SDS還能與蛋白質(zhì)結(jié)合而沉淀蛋白酶K能水解消化蛋白質(zhì),特別是與DNA結(jié)合的組蛋白,再用有機(jī)溶劑酚與氯仿抽提掉蛋白質(zhì)和其它細(xì)胞組份,用乙醇或異丙醇沉淀核酸模板(靶基因,targetgene)提取的核酸即可作為模板用于PCR反應(yīng)一般臨床檢測(cè)標(biāo)本,可采用快速簡(jiǎn)便的方法溶解細(xì)胞,裂解病原體,消化除去染色體的蛋白質(zhì)使靶基因游離,直接用于PCR擴(kuò)增RNA模板提取一般采用異硫氰酸胍或蛋白酶K法,要防止RNase降解RNAMg2+濃度Mg2+對(duì)PCR擴(kuò)增的特異性和產(chǎn)量有顯著的影響在一般的

PCR反應(yīng)中,各種NTP濃度為200umol/L時(shí),Mg2+濃度為1.5~2.0mmol/L為宜Mg2+濃度過(guò)高,反應(yīng)特異性降低,出現(xiàn)非特異擴(kuò)增,濃度過(guò)低會(huì)降低TaqDNA聚合酶的活性,使反應(yīng)產(chǎn)物減少PCR反應(yīng)條件的選擇PCR反應(yīng)條件:溫度時(shí)間循環(huán)次數(shù)溫度與時(shí)間的設(shè)置:設(shè)置變性-退火-延伸三個(gè)溫度點(diǎn)標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)中采用三溫度點(diǎn)法,雙鏈DNA在90~95℃變性,再迅速冷卻至40~60℃,引物退火并結(jié)合到靶序列上,然后快速升溫至70~75℃,在TaqDNA聚合酶的作用下,使引物鏈沿模板延伸對(duì)于較短靶基因(長(zhǎng)度為100~300bp時(shí))可采用二溫度點(diǎn)法,將退火與延伸溫度合二為一,一般采用94℃變性,65℃左右退火與延伸①變性溫度與時(shí)間:變性溫度低,解鏈不完全是導(dǎo)致PCR失敗的最主要原因一般93℃~94℃lmin足以使模板DNA變性若低于93℃則需延長(zhǎng)時(shí)間但溫度不能過(guò)高,因?yàn)楦邷丨h(huán)境對(duì)酶的活性有影響。此步若不能使靶基因模板或PCR產(chǎn)物完全變性,就會(huì)導(dǎo)致PCR失敗

②退火(復(fù)性)溫度與時(shí)間:退火溫度是影響PCR特異性的較重要因素變性后溫度快速冷卻至40℃~60℃,可使引物和模板發(fā)生結(jié)合。由于模板DNA比引物復(fù)雜得多,引物和模板之間的碰撞結(jié)合機(jī)會(huì)遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于模板互補(bǔ)鏈之間的碰撞退火溫度與時(shí)間,取決于引物的長(zhǎng)度、堿基組成及其濃度,還有靶基序列的長(zhǎng)度對(duì)于20個(gè)核苷酸,G+C含量約50%的引物,55℃為選擇最適退火溫度的起點(diǎn)較為理想引物的復(fù)性溫度

通過(guò)以下公式幫助選擇合適的溫度:Tm值(解鏈溫度)=4(G+C)+2(A+T)復(fù)性溫度=Tm值-(5~10℃)在Tm值允許范圍內(nèi),選擇較高的復(fù)性溫度可大大減少引物和模板間的非特異性結(jié)合,提高PCR反應(yīng)的特異性復(fù)性時(shí)間一般為30~60sec,足以使引物與模板之間完全結(jié)合③延伸溫度與時(shí)間:TaqDNA聚合酶的生物學(xué)活性:

70~80℃150核苷酸/S/酶分子

70℃60核苷酸/S/酶分子

55℃24核苷酸/S/酶分子

高于90℃時(shí),DNA合成幾乎不能進(jìn)行③延伸溫度與時(shí)間:延伸溫度:一般選擇在70~75℃之間常用溫度為72℃過(guò)高的延伸溫度不利于引物和模板的結(jié)合。延伸反應(yīng)時(shí)間:根據(jù)待擴(kuò)增片段長(zhǎng)度而定1Kb以內(nèi)的DNA片段,延伸時(shí)間1min(足夠)3~4kb的靶序列需3~4min擴(kuò)增10Kb需延伸至15min延伸進(jìn)間過(guò)長(zhǎng)會(huì)導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增對(duì)低濃度模板的擴(kuò)增,延伸時(shí)間要稍長(zhǎng)些循環(huán)次數(shù)循環(huán)次數(shù)決定PCR擴(kuò)增程度循環(huán)次數(shù)主要取決于模板DNA的濃度循環(huán)次數(shù):選在30~40次之間循環(huán)次數(shù)越多,非特異性產(chǎn)物的量亦隨之增多PCR反應(yīng)特點(diǎn)特異性強(qiáng)靈敏度高簡(jiǎn)便、快速對(duì)標(biāo)本的純度要求低1.按照如下體積向PCR管中按順序加入各試劑并混勻:

10XPCR反應(yīng)緩沖液2.5μL25mmol/LMgCl22.0μL

10mmol/LdNTP1.0μL10μmol/L引物11.0μL10μmol/L引物21.0μL

質(zhì)粒DNA1.0μLTaq0.1μL(5U)

水補(bǔ)充至25.0μL操作步驟PCR技術(shù)的基本過(guò)程模板DNAdNTP

引物Buffer預(yù)變性模板DNAdNTP

引物BufferTaqDNA聚合酶94oC5’

基本過(guò)程PCR技術(shù)的基本過(guò)程Taq酶模板DNAdNTP

引物Buffer循環(huán)儀94℃55℃72℃Taq酶模板DNAdNTP

引物Buffer72℃7min循環(huán)25次反應(yīng)完成后,將反應(yīng)液與凝膠電泳緩沖液按比例混勻,上樣電泳。操作步驟瓊脂糖凝膠電泳瓊脂糖凝膠電泳法凝膠電泳是分離和純化DNA片段最常用的技術(shù)。根據(jù)制備凝膠的材料:

瓊脂糖電泳凝膠電泳聚丙烯酰胺電泳一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/p>

掌握瓊脂糖凝膠電泳分離DNA的原理和方法DNA分子在堿性緩沖液中帶負(fù)電荷,在外加電場(chǎng)作用下向正極泳動(dòng)。DNA分子在瓊脂糖凝膠中泳動(dòng)時(shí),有電荷效應(yīng)與分子篩效應(yīng)。不同DNA的分子量大小及構(gòu)型不同,電泳時(shí)的泳動(dòng)率就不同,從而分出不同的區(qū)帶。二、實(shí)驗(yàn)原理瓊脂糖是一種天然聚合長(zhǎng)鏈狀分子,可以形成具有剛性的濾孔,凝膠孔徑的大小決定于瓊脂糖的濃度。瓊脂糖凝膠電泳法分離DNA,主要是利用分子篩效應(yīng),遷移速度與分子量的對(duì)數(shù)值成反比關(guān)系。因而就可依據(jù)DNA分子的大小使其分離。該過(guò)程可以通過(guò)把分子量標(biāo)準(zhǔn)參照物和樣品一起進(jìn)行電泳而得到檢測(cè)。溴化乙錠(EB)為扁平狀分子,在紫外光照射下發(fā)射熒光。EB可與DNA分子形成EB-DNA復(fù)合物,其熒光強(qiáng)度與DNA的含量成正比。據(jù)此可粗略估計(jì)樣品DNA濃度。

注意事項(xiàng):EB是致癌物質(zhì),切勿用手接觸,更不要污染環(huán)境。實(shí)驗(yàn)過(guò)程中操作要保持安靜、鎮(zhèn)定,注意樣品不能混樣,實(shí)驗(yàn)材料、器具及藥品

實(shí)驗(yàn)中提取的質(zhì)粒樣品。

電泳儀,電泳槽,電子天平,移液器,槍頭,微波爐,紫外透射檢測(cè)儀等。

瓊脂糖,1XTAE電泳緩沖液,溴化乙錠(EB),10X載樣緩沖液

實(shí)驗(yàn)步驟

⑴0.5g

瓊脂糖加入50ml1×TAE電泳緩沖液中,搖勻。在微波爐中加熱至瓊脂糖完全溶解。⑵用膠帶將制膠板兩端封好,插入適當(dāng)梳子,將溶解的瓊脂糖中加入0.5mlEB(約50℃)倒入,室溫冷卻凝固。⑶充分凝固后撕掉兩端的膠布,將凝膠置入電泳槽中,加1×TAE電泳緩沖液至液面覆蓋凝膠1-2mm,小心垂直向上拔出梳子。⑷用移液器吸取4μl

樣品溶解液,混勻后,小心加入點(diǎn)樣孔。

⑸打開電源開關(guān),調(diào)節(jié)電壓至3-5V/cm,可見到溴酚藍(lán)條帶由負(fù)極向正極移動(dòng),電泳約40min-60min。(6)將凝膠置于凝膠成像系統(tǒng)中,打開紫外燈,可見到發(fā)出熒光的DNA條帶。質(zhì)粒DNA應(yīng)呈現(xiàn)二或三條不同構(gòu)型的條帶,這時(shí)表明所提樣品較純。溴酚藍(lán)前的熒光區(qū)是樣品中存有的RNA雜質(zhì)。若質(zhì)粒DNA樣品在遷移率小的地方還有熒光條帶,表明質(zhì)粒DNA樣品中有細(xì)菌的染色體DNA污染。(1)瓊脂糖含液體量大,可達(dá)98-99%,近似自由電泳,但是樣品的擴(kuò)散度比自由電泳小。(2)電泳速度快。(3)透明而不吸收紫外線,可以直接用紫外檢測(cè)儀作定量測(cè)定。(4)樣品易回收,常用于制備。瓊脂糖電泳的優(yōu)點(diǎn)配制多大濃度的瓊脂糖凝膠,要根據(jù)被檢的DNA分子大小來(lái)確定。

瓊脂糖凝膠濃度與線性DNA分辨范圍

開環(huán)(部分解鏈)閉環(huán)(螺旋)閉環(huán)(超螺旋)質(zhì)粒DNA1、學(xué)習(xí)酶的純化方法,酶蛋白分離提純的原理。2、學(xué)習(xí)掌握細(xì)胞破壁、有機(jī)溶劑分級(jí)和離子交換柱層析技術(shù)。本實(shí)驗(yàn)可以為大家提供一個(gè)較全面的實(shí)踐機(jī)會(huì),學(xué)習(xí)如何提取純化、分析鑒定一種酶,并對(duì)這種酶的性質(zhì),尤其是動(dòng)力學(xué)性質(zhì)作初步的研究。酵母蔗糖酶的提取及其性質(zhì)研究

實(shí)驗(yàn)原理酶是生物體內(nèi)具有催化功能的蛋白質(zhì),可據(jù)酶蛋白的結(jié)構(gòu)和性質(zhì)選擇分離提純條件和含量測(cè)定方法。酶分離提純的總目標(biāo)是提高純度(或比活力)及收率;依據(jù)在溶液中的性質(zhì)(分子大小、溶解度、電荷、吸附等)進(jìn)行分離;胞內(nèi)酶的分離提純步驟:選材、破壁、提取、分離、純化、測(cè)活、保存;用測(cè)定酶活力的方法跟蹤酶的去向、衡量酶提純的程度和得率。酶促反應(yīng)的動(dòng)力學(xué)(反應(yīng)速度及影響因素):1)底物濃度對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響2)酶濃度對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響3)pH值對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響4)溫度對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響5)激活劑、抑制劑對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響.自1860年Bertholet從啤酒酵母(Sacchacomyces

Cerevisiae)中發(fā)現(xiàn)了蔗糖酶以來(lái),它已被廣泛地進(jìn)行了研究。蔗糖酶(invertase)(β-D-呋喃果糖苷果糖水解酶)(EC.3.2.1.26)特異地催化非還原糖中的β-呋喃果糖糖苷鍵水解,具有相對(duì)專一性。不僅能催化蔗糖水解生成葡萄糖和果糖,也能催化棉子糖水解,生成蜜二糖和果糖。

實(shí)驗(yàn)原理

本實(shí)驗(yàn)提取啤酒酵母中的蔗糖酶。該酶以兩種形式存在于酵母細(xì)胞膜的外側(cè)和內(nèi)側(cè),在細(xì)胞膜外細(xì)胞壁中的稱之為外蔗糖酶,其活力占蔗糖酶活力的大部分,是含有50%糖成分的糖蛋白。在細(xì)胞膜內(nèi)側(cè)細(xì)胞質(zhì)中的稱之為內(nèi)蔗糖酶,含有少量的糖。兩種酶的蛋白質(zhì)部分均為雙亞基,二聚體,兩種形式的酶的氨基酸組成不同,外酶每個(gè)亞基比內(nèi)酶多兩個(gè)氨基酸,Ser和Met,它們的分子量也不同,外酶約為27萬(wàn)(或22萬(wàn),與酵母的來(lái)源有關(guān)),內(nèi)酶約為13.5萬(wàn)。盡管這兩種酶在組成上有較大的差別,但其底物專一性和動(dòng)力學(xué)性質(zhì)仍十分相似,因此,本實(shí)驗(yàn)未區(qū)分內(nèi)酶與外酶,而且由于內(nèi)酶含量很少,極難提取,本實(shí)驗(yàn)提取純化的主要是外酶。名稱MW糖含量亞基為蔗糖的Km為棉子糖的KmpI

最適pH穩(wěn)定pH最適溫度外酶27萬(wàn)50%雙26mM150mM5.04.93.0-7.560℃內(nèi)酶13.5萬(wàn)<3%雙25mM150mM5.04.56.0-9.060℃實(shí)驗(yàn)中,用測(cè)定生成還原糖(葡萄糖和果糖)的量來(lái)測(cè)定蔗糖水解的速度,在給定的實(shí)驗(yàn)條件下,每分鐘水解底物的量定為蔗糖酶的活力單位。比活力為每毫克蛋白質(zhì)的活力單位數(shù)。兩種酶的性質(zhì)對(duì)照表如下:一、蔗糖酶的提取與部分純化二、離子交換柱層析純化蔗糖酶三、蔗糖酶各級(jí)分活性及蛋白質(zhì)含量的測(cè)定本實(shí)驗(yàn)分三個(gè)方面實(shí)驗(yàn):細(xì)胞破壁的幾種方法1、高速組織搗碎:將材料配成稀糊狀液,放置于筒內(nèi)約1/3體積,蓋緊筒蓋,將調(diào)速器先撥至最慢處,開動(dòng)開關(guān)后,逐步加速至所需速度。2、玻璃勻漿器勻漿:先將剪碎的組織置于管中,再套入研桿來(lái)回研磨,上下移動(dòng),即可將細(xì)胞研碎,此法細(xì)胞破碎程度比高速組織搗碎機(jī)為高,適用于量少和動(dòng)物臟器組織。3、反復(fù)凍融法:將細(xì)胞在-20度以下冰凍,室溫融解,反復(fù)幾次,由于細(xì)胞內(nèi)冰粒形成和剩余細(xì)胞液的鹽濃度增高引起溶脹,使細(xì)胞結(jié)構(gòu)破碎。4、超聲波處理法:用一定功率的超聲波處理細(xì)胞懸液,使細(xì)胞急劇震蕩破裂,此法多適用于微生物材料。5、化學(xué)處理法:有些動(dòng)物細(xì)胞,例如腫瘤細(xì)胞可采用十二烷基磺酸鈉(SDS)、去氧膽酸鈉等細(xì)胞膜破壞,細(xì)菌細(xì)胞壁較厚,可采用溶菌酶處理效果更好。6、有機(jī)溶劑沉淀法:即向水溶液中加入一定量的親水性的有機(jī)溶劑可降低溶質(zhì)的溶解度使其沉淀被析出。(一)蔗糖酶的提取與部分純化(1)準(zhǔn)備一個(gè)冰浴,將研缽穩(wěn)妥放入冰浴中。(2)稱取3g干啤酒酵母,稱20mg蝸牛酶及適量(約3g)二氧化硅,放入研缽中。二氧化硅要預(yù)先研細(xì)。(3)量取預(yù)冷的甲苯6ml+6ml緩慢加入酵母中,邊加邊研磨成糊狀,約需40分鐘。研磨時(shí)用顯微鏡檢查研磨的效果,至酵母細(xì)胞大部分研碎。(4)緩慢加入預(yù)冷的20ml去離子水,每次加2ml左右,邊加邊研磨,至少用20分鐘。以便將蔗糖酶充分轉(zhuǎn)入水相。(5)將混合物轉(zhuǎn)入兩個(gè)離心管中,平衡后,用高速冷凍離心機(jī)離心,4℃,5000rpm,15min。如果中間白色的脂肪層厚,說(shuō)明研磨效果良好。用滴管吸出上層有機(jī)相。

(6)用滴管小心地取出脂肪層下面的水相,轉(zhuǎn)入另一個(gè)清潔的離心管中。操作步驟4℃,5000rpm,離心15min。(7)將上清液轉(zhuǎn)入量筒,量出體積,留出1.5ml測(cè)定酶活力及蛋白含量。剩余部分轉(zhuǎn)入清潔離心管中。(8)用廣泛pH試紙檢查清液pH,用1M乙酸將pH調(diào)至5.0,稱為“粗級(jí)分I”。2.熱處理

(1)預(yù)先將恒溫水浴調(diào)到50℃,將盛有粗級(jí)分I的離心管穩(wěn)妥地放入水浴中,50℃下保溫30分鐘,在保溫過(guò)程中不斷輕搖離心管。(2)取出離心管,于冰浴中迅速冷卻,用4℃,5000rpm,離心15min。(3)將上清液轉(zhuǎn)入量筒,量出體積,留出1.5ml測(cè)定酶活力及蛋白質(zhì)含量(稱為“熱級(jí)分II”)。3.乙醇沉淀

將熱級(jí)分II轉(zhuǎn)入小燒杯中,放入冰鹽?。](méi)有水的碎冰撒入少量食鹽),逐滴加入等體積預(yù)冷至-20℃的95%乙醇,同時(shí)輕輕攪拌,共需30分鐘,再在冰鹽浴中放置10分鐘,以沉淀完全。于4℃,5000rpm,離心15min,傾去上清,并風(fēng)干,沉淀保存于離心管中,蓋上蓋子,然后將其放入冰箱中冷凍保存(稱為“醇級(jí)分Ⅲ”)。離子交換層析

離子交換層析技術(shù)是以離子交換纖維素或以離子交換葡聚糖凝膠為固定相,以蛋白質(zhì)等樣品為移動(dòng)相,分離和提純蛋白質(zhì)、核酸、酶、激素和多糖等的一項(xiàng)技術(shù)。

在纖維素與葡聚糖分子上結(jié)合有一定的離子基團(tuán),當(dāng)結(jié)合陽(yáng)離子基團(tuán)時(shí),可換出陰離子,則稱為陰離子交換劑。如二乙氨乙基(Dicthylaminoethyl,DEAE)纖維素。在纖維素上結(jié)合了DEAE,含有帶正電荷的陽(yáng)離子纖維素—O—C6H14NH+,它的反離子為陰離子(如Cl-等),可與帶負(fù)電荷的蛋白質(zhì)陰離子進(jìn)行交換。當(dāng)結(jié)合陰離子基團(tuán)時(shí),可置換陽(yáng)離子,稱為陽(yáng)離子交換劑,如羧甲基(Carboxymethy,CM)纖維素。纖維素分子上帶有負(fù)電荷的陰離子(纖維素-O-CH2-COO-),其反離子為陽(yáng)離子(如Na+等),可與帶正電荷蛋白質(zhì)陽(yáng)離子進(jìn)行交換。溶液的pH值與蛋白質(zhì)等電點(diǎn)相同時(shí),靜電荷為0,當(dāng)溶液pH值大于蛋白質(zhì)等電點(diǎn)時(shí),則羧基游離,蛋白質(zhì)帶負(fù)電荷。反之,溶液的pH值小于蛋白質(zhì)等電點(diǎn)時(shí),則氨基電離,蛋白質(zhì)帶正電荷。溶液的pH值距蛋白質(zhì)等電點(diǎn)越遠(yuǎn),蛋白質(zhì)的電荷越多。反之則越少。

在適當(dāng)?shù)柠}濃度下,溶液的pH值高于等電點(diǎn)時(shí),蛋白質(zhì)被陰離子交換劑所吸附;當(dāng)溶液的pH值低于等電點(diǎn)時(shí),蛋白質(zhì)被陽(yáng)離子交換劑所吸附。由于各種蛋白質(zhì)所帶的電荷不同。它們與交換劑的結(jié)合程度也不同,只要溶液pH值發(fā)生改變,就會(huì)直接影響到蛋白質(zhì)與交換劑的吸附,從而可能把不同的蛋白質(zhì)逐個(gè)分離開來(lái)。交換劑對(duì)膠體離子(如蛋白質(zhì))和無(wú)機(jī)鹽離子(如NaCl)都具有交換吸附的能力,當(dāng)兩者同時(shí)存在于一個(gè)層析過(guò)程中,則產(chǎn)生競(jìng)爭(zhēng)性的交換吸附。當(dāng)Cl-的濃度大時(shí),蛋白質(zhì)不容易被吸附,吸附后也易于被洗脫,當(dāng)Cl-濃度小時(shí),蛋白質(zhì)易被吸附,吸附后也不容易被洗脫。因此,在離子交換層析中,一般采用兩種方法達(dá)到分離蛋白質(zhì)的目的。一種是增加洗脫液的離子強(qiáng)度,一種是改變洗脫液的pH值。pH值增高時(shí),抑制蛋白質(zhì)陽(yáng)離子化,隨之對(duì)陽(yáng)離子交換劑的吸附力減弱。pH值降低時(shí),抑制蛋白質(zhì)陰離子化,隨之降低了蛋白質(zhì)對(duì)陰離子交換劑的吸附。當(dāng)使用陰離子交換劑時(shí),增加鹽離子,則降低pH值。當(dāng)使用陽(yáng)離子交換劑時(shí),增加鹽離子濃度,則升高溶液pH值。離子交換劑使用前一般要進(jìn)行處理。干粉狀的離子交換劑首先要進(jìn)行膨化,將干粉在水中充分溶脹,以使離子交換劑顆粒的孔隙增大,具有交換活性的電荷基團(tuán)充分暴露出來(lái)。而后用水懸浮去除雜質(zhì)和細(xì)小顆粒。再用酸堿分別浸泡,每一種試劑處理后要用水洗至中性,再用另一種試劑處理,最后再用水洗至中性,這是為了進(jìn)一步去除雜質(zhì),并使離子交換劑帶上需要的平衡離子。市售的離子交換劑中通常陽(yáng)離子交換劑為Na型(即平衡離子是Na離子),陰離子交換劑為Cl型,因?yàn)橥ǔ_@樣比較穩(wěn)定。處理時(shí)一般陽(yáng)離子交換劑最后用堿處理,陰離子交換劑最后用酸處理。常用的酸是HCl,堿是NaOH或再加一定的NaCl,這樣處理后陽(yáng)離子交換劑為Na型,陰離子交換劑為Cl型。使用的酸堿濃度一般小于0.5mol/L,浸泡時(shí)間一般30min。處理時(shí)應(yīng)注意酸堿濃度不宜過(guò)高、處理時(shí)間不宜過(guò)長(zhǎng)、溫度不宜過(guò)高,以免離子交換劑被破壞。另外要注意的是離子交換劑使用前要排除氣泡,否則會(huì)影響分離效果。柱上操作⑴交換劑裝柱最簡(jiǎn)單的交換層析柱可用堿式滴定管代替。處理過(guò)的樹脂放入燒杯,加少量水邊攪拌邊倒入保持垂直的層析管中,使樹脂緩慢沉降。交換劑在柱內(nèi)必須分布均勻。

⑵上樣向?qū)游鲋鶅?nèi)傾入樣品液⑶洗脫與收集

不同樣品選用的洗脫液不同。原則是用一種比吸著物質(zhì)更活潑的離子,把吸著物交換出來(lái)。由于被吸著的物質(zhì)往往不是我們所要求的單一物質(zhì),因此除了正確選擇洗脫液外還采控制流速和分布收集的方法來(lái)獲得所需的單一物質(zhì)。離子交換柱層析純化蔗糖酶操作步驟1.離子交換劑的處理:稱取1.5克DEAE纖維素(DE-23)干粉,加入0.5MNaOH溶液(約50ml),輕輕攪拌,浸泡至少0.5小時(shí)(不超過(guò)1小時(shí)),用玻璃砂漏斗抽濾,并用去離子水洗至近中性,抽干后,放入小燒杯中,加50ml0.5MHCl,攪勻,浸泡0.5小時(shí),同上,用去離子水洗至近中性,再用0.5MNaOH重復(fù)處理一次,用去離子水洗至近中性后,抽干備用。(因DEAE纖維素昂貴,用后務(wù)必回收)。實(shí)際操作時(shí),通常纖維素是已浸泡過(guò)回收的,按“堿→鹽”的順序洗即可(0.5MNaOH,1MNaCl溶液處理),然后水洗至中性。最后保存在20%的酒精溶液中。2.裝柱與平衡:

先將層析柱垂直裝好,在燒杯內(nèi)用0.02mol/LpH7.3Tris-HCl緩沖液洗纖維素幾次,用滴管吸取燒杯底部大顆粒的纖維素裝柱,然后用此緩沖液洗柱至流出液的電導(dǎo)率與緩沖液相同或接近時(shí)即可上樣。(一般洗2-3個(gè)柱體積)3.上樣與洗脫:上樣前先準(zhǔn)備好梯度洗脫液,本實(shí)驗(yàn)采用30ml0.02MpH7.3的Tris-HCl緩沖液和30ml含0.2MNaCl的0.02mol/LpH7.3的Tris-HCl緩沖液,進(jìn)行線性梯度洗脫。取兩個(gè)相同直徑的50ml量杯,一個(gè)裝30ml含NaCl的高離子強(qiáng)度溶液,另一個(gè)裝入30ml低離子強(qiáng)度溶液,放在磁力攪拌器上,在低離子強(qiáng)度溶液的量杯內(nèi)放入一個(gè)小攪拌子,使兩杯溶液形成連通,注意兩個(gè)杯要放妥善,切勿使一杯高、一杯低。

用5ml0.02MpH7.3的Tris-HCl緩沖液充分溶解醇級(jí)分Ⅲ,若溶液混濁,則用小試管,4000rpm離心除去不溶物。取1.5ml上清液(即醇級(jí)分Ⅲ樣品,留待下一個(gè)實(shí)驗(yàn)測(cè)酶活力及蛋白含量),將剩余的3.5ml清液小心地加到層析柱上,不要擾動(dòng)柱床,注意要從上樣開始使用部分收集器收集,每管3.0ml/10min。上樣后用緩沖液洗兩次,然后再用約20ml緩沖液洗去柱中未吸附的蛋白質(zhì),至A280降到0.1以下,夾住層析柱出口,將恒流泵入口的細(xì)塑料導(dǎo)管放入不含NaCl的低離子強(qiáng)度溶液的小燒杯中,接好層析柱,打開磁力攪拌器,放開層析柱出口,開始梯度洗脫,連續(xù)收集洗脫液,兩個(gè)小燒杯中的洗脫液用盡后,為洗脫充分,也可將所配制的剩余30ml高離子強(qiáng)度洗脫液倒入小燒杯繼續(xù)洗脫,控制流速3.0ml/10min。

測(cè)定每管洗脫液的A280光吸收值,合并活性最高的2-3管,量出總體積,此即“柱級(jí)分IV”。注意:從上樣開始收集,可能有兩個(gè)活性峰,梯度洗脫開始前的第一個(gè)峰是未吸附物,本實(shí)驗(yàn)取用梯度洗脫開始后洗下來(lái)的活性峰。各級(jí)分蛋白質(zhì)含量的測(cè)定

采用考馬斯亮蘭染料法(Bradford法)的微量法測(cè)定蛋白質(zhì)含量,參見實(shí)驗(yàn)-“蛋白質(zhì)含量的測(cè)定法”。各級(jí)分先要仔細(xì)尋找和試測(cè)出合適的稀釋倍數(shù),并詳細(xì)記錄稀釋倍數(shù)的計(jì)算(使用移液管和量筒稀釋)。下列稀釋倍數(shù)僅供參考:粗級(jí)分I:10~50倍熱級(jí)分II:10~50倍醇級(jí)分III:10~50倍柱級(jí)分IV:不稀釋12345待測(cè)樣品標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)溶液(ml)00.020.040.060.080.1雙蒸水ml0.10.080.060.040.020考馬斯亮藍(lán)ml555555A595蛋白質(zhì)含量的測(cè)定標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)濃度:1mg/ml蔗糖酶各級(jí)分活性的測(cè)定

測(cè)定蔗糖酶活性的方法有許多種,如費(fèi)林試劑法、Nelson’s試劑法、水楊酸試劑法等,本實(shí)驗(yàn)先使用費(fèi)林試劑法,以后測(cè)米氏常數(shù)Km和最大反應(yīng)速度Vmax時(shí)再用Nelson’s試劑法。費(fèi)林試劑法靈敏度較高,但數(shù)據(jù)波動(dòng)較大,因?yàn)榉磻?yīng)后溶液的顏色隨時(shí)間會(huì)有變化,因此加樣和測(cè)定光吸收值時(shí)最好能計(jì)時(shí)。其原理是在酸性條件下,蔗糖酶催化蔗糖水解,生成一分子葡萄糖和一分子果糖。這些具有還原性的糖與堿性銅試劑混合加熱后被氧化,二價(jià)銅被還原成棕紅色氧化亞銅沉淀,氧化亞銅與磷鉬酸作用,生成蘭色溶液,其蘭色深度與還原糖的量成正比,于650nm測(cè)定光吸收值。級(jí)分I、II、III蔗糖酶活性測(cè)定用去離子水代替稀釋各級(jí)分酶液,試測(cè)出測(cè)酶活合適的稀釋倍數(shù):I:1000~10000倍

II:

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