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分子生物學(xué)專業(yè):生物工程主講教師:陳秀麗(bio_teacher@)MolecularBiologyCourseThereplicationofDNAMolecularBiologyCourse第五講DNA的復(fù)制

一、DNA的復(fù)制二、RNA的反轉(zhuǎn)錄三、DNA的轉(zhuǎn)座MolecularBiologyCourse

脫氧核糖核酸(DNA)是生物界遺傳的主要物質(zhì)基礎(chǔ)。生物有機(jī)體的遺傳特征以密碼的形式編碼在DNA分子上,表現(xiàn)為特定的核苷酸排列順序-即遺傳信息。在細(xì)胞分裂前通過DNA的復(fù)制,將遺傳信息由親代傳遞給子代。在后代的個體發(fā)育過程中,遺傳信息自DNA轉(zhuǎn)錄給RNA,并指導(dǎo)蛋白質(zhì)的合成,以執(zhí)行各種生命功能。使后代表現(xiàn)出與親代相似的遺傳性狀,這種遺傳信息的傳遞方向,是從DNA到RNA再到蛋白質(zhì),即所謂的生物學(xué)“中心法則”。80年代以后,在某些致癌RNA病毒中發(fā)現(xiàn)遺傳信息也存在于RNA分子中,由RNA通過逆轉(zhuǎn)錄的方式將遺傳信息傳遞給DNA。這個中心法則加入了新的內(nèi)容。這也就是我們前面提到過的,目前被生物界認(rèn)可的遺傳信息傳遞的中心法則。

MolecularBiologyCourse

復(fù)制轉(zhuǎn)錄反轉(zhuǎn)錄翻譯DNARNAPRO生理功能遺傳信息傳遞的中心法則MolecularBiologyCourse第五講DNA的復(fù)制(一)、DNA的復(fù)制(二)、復(fù)制的起始階段(三)、DNA復(fù)制的延長階段以及參與的酶和蛋白質(zhì)分子

(四)、DNA復(fù)制的終止階段(五)、復(fù)制的幾種主要方式(六)、真核生物復(fù)制MolecularBiologyCourseDNA復(fù)制(theReplicationofDNA

)親代雙鏈DNA分子在DNA聚合酶的作用下,分別以每單鏈DNA分子為模板,聚合與自身堿基可以互補(bǔ)配對的游離的dNTP,合成出兩條與親代DNA分子完全相同的子代DNA分子的過程。

MolecularBiologyCourse(一)、DNA的復(fù)制

1、DNA半保留復(fù)制的機(jī)理2、DNA的半不連續(xù)復(fù)制

MolecularBiologyCourse1、DNA半保留復(fù)制的機(jī)理

Semi-Conservation

ReplicationDNA作為遺傳物質(zhì)的基本特點(diǎn)就是在細(xì)胞分裂前進(jìn)行準(zhǔn)確的自我復(fù)制,使DNA的量成倍增加,這是細(xì)胞分裂的物質(zhì)基礎(chǔ)。1953年Watson和Crick提出DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型,模型指出,DNA分子由兩條多核苷酸鏈組成,兩條鏈的堿基配對規(guī)則:G只能與C配對,A只能與T配對,以氫鍵相連,所以兩條鏈?zhǔn)腔パa(bǔ)的,一條鏈上的核苷酸排列順序決定了另一條鏈上的核苷酸排列順序。就是說,DNA分子的每一條鏈都含有合成它的互補(bǔ)鏈所需的全部信息。

MolecularBiologyCourse這就說明DNA的復(fù)制是由原來存在的分子為模板來合成新的鏈。曾經(jīng)有許多關(guān)于DNA復(fù)制方式的學(xué)說,包括半保留復(fù)制,全保留復(fù)制以及分散復(fù)制等。Watson和Crick在提出DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型時就推測,DNA在復(fù)制時首先兩條鏈之間的氫鍵斷裂開,然后以每一條鏈分別做模板各自合成一條新的DNA鏈,這樣新合成的子代DNA分子中一條鏈來自親代DNA,另一條鏈?zhǔn)切潞铣傻?,這種復(fù)制方式為半保留復(fù)制。MolecularBiologyCourseThreereplicationhypotheses1958年Maselson和Stahl利用氮標(biāo)記技術(shù)在大腸桿菌中首次證實了DNA的半保留復(fù)制。他們將大腸桿菌放在含有N15標(biāo)記的培養(yǎng)基中培養(yǎng),得到N15-DNA。然后將細(xì)菌轉(zhuǎn)移到含有N14標(biāo)記的培養(yǎng)基中進(jìn)行培養(yǎng),在培養(yǎng)不同代數(shù)時,收集細(xì)菌,裂解細(xì)胞,用氯化銫密度梯度離心法觀察DNA所處的位置。由于N15標(biāo)記的DNA的密度比普通DNA的密度大,在氯化銫密度梯度離心時,兩種密度不同的DNA分布在不同的區(qū)帶。

MolecularBiologyCourse

實驗結(jié)果表明:在全部由N15標(biāo)記的培養(yǎng)基中得到的N15-DNA顯示為一條重密度帶,位于離心管的管底。當(dāng)轉(zhuǎn)入N14標(biāo)記的培養(yǎng)基中繁殖后第一代,得到了一條中密度帶,這是N15-DNA和N14-DNA的雜交分子。第二代有中密度帶及低密度帶兩個區(qū)帶,這表明它們分別為N14-DNA分子

和N14-N15-DNA雜合分子。隨著以后在N14培養(yǎng)基中培養(yǎng)代數(shù)的增加,低密度帶增強(qiáng),而中密度帶逐漸減弱,離心結(jié)束從管底到管口,CsCL溶液密度,不同重量的DNA分子就停留在于其相當(dāng)?shù)腃sCL密度處,在紫外光可以看到DNA分子形成的區(qū)帶。MolecularBiologyCourse為了證實第一代雜交分子確實是一半N15-DNA一半N14-DNA:將這種雜交分子經(jīng)加熱變性,對于變性前后的DNA分別進(jìn)行CsCL密度梯度離心。結(jié)果變性前的雜交分子為一條中密度帶,變性后則分為兩條區(qū)帶,即重密度帶(N15-DNA)和低密度帶(N14-DNA)。它們的實驗只有用半保留復(fù)制的理論才能得到圓滿的解釋。

MolecularBiologyCourse(CsClgradientcentrifuge)

N15

N14DNASemi-ConservationReplicationM.MeselsonandF.W.Stahl,Sciences44:675,1958.1、DNA半保留復(fù)制的證據(jù)MolecularBiologyCourse

模板:能提供合成一條互補(bǔ)鏈所需要精確信息的核酸鏈。

MolecularBiologyCourse2、DNA的半不連續(xù)復(fù)制

(semi-discontinuouseplication)

在體內(nèi),DNA的兩條鏈都能作為模板,同時合成出兩條新的互補(bǔ)鏈。由于DNA分子的兩條鏈?zhǔn)欠聪蚱叫械?,一條鏈的走向為5'-3',另一條鏈為3'-5'。但是所有已知DNA聚合酶的合成方向都是5'-3',而不是3'-5'。這就很難說明,DNA在復(fù)制時,兩條鏈如何能夠同時作為模板合成其互補(bǔ)鏈。為了解釋這一現(xiàn)象,日本學(xué)者崗崎提出了半不連續(xù)復(fù)制模型。。

MolecularBiologyCourse3‘5‘3‘5‘OK!How?5‘3‘5‘3‘1968年,崗崎用3H-脫氧胸苷短時間標(biāo)記大腸桿菌,提取DNA,變性后用超離心法得到了許多3H標(biāo)記的,后人稱為崗崎片斷的DNA。延長標(biāo)記時間后,崗崎片度可轉(zhuǎn)變?yōu)槌墒斓腄NA鏈,因此,這些片斷必然是復(fù)制過程的中間產(chǎn)物。MolecularBiologyCourse但是岡崎等最初不能確定DNA鏈的不連續(xù)只發(fā)生在一條鏈上還是兩條鏈都如此。對崗崎片斷進(jìn)行測定,結(jié)果測得的數(shù)據(jù)遠(yuǎn)超過新合成DNA的一半,似乎兩條鏈都是不連續(xù)的。后來發(fā)現(xiàn),這是由于尿嘧啶代替胸腺嘧啶摻入DNA造成的。DNA中的尿嘧啶可被尿嘧啶-DNA-糖苷酶切除,隨后該處的磷酸二脂鍵斷裂,一些核苷酸被水解,造成一個缺口,最后缺口空隙被填補(bǔ)和修復(fù),在此過程中也會產(chǎn)生一些類似崗崎片斷的DNA片斷。MolecularBiologyCoursedUTP:dTTP=1:300incell

---A-------T--------G--------C----AUGUdutgenedUTPase少數(shù)dUTP

DNA中不能有U?---A-------T----突變頻率=1/1200!?---A------A---

---U---------Ungase

ungU尿嘧啶-N-糖基酶UUdenaturedumpfragment~1200base~Okazakifragment●

ung–dumpfragmentlonger●dut

dumpfragmentshorterAA當(dāng)用缺乏糖苷酶的大腸桿菌變異株(ung-進(jìn)行實驗時,尿嘧啶不再被切除。)此時,新合成的DNA有一半放射性標(biāo)記出現(xiàn)于崗崎片斷中,另一股直接進(jìn)入大的片斷。由此可見,當(dāng)DNA復(fù)制時,一條鏈?zhǔn)沁B續(xù)的,另一條鏈?zhǔn)遣贿B續(xù)的,因此稱為半不連續(xù)復(fù)制(semi-discontinuousreplication)

。MolecularBiologyCourse前導(dǎo)鏈(leadingstrand):以復(fù)制叉向前移動的方向為標(biāo)準(zhǔn),一條模板鏈?zhǔn)?‘-5’走向,在其上DNA能以5‘-3’方向連續(xù)合成,稱為前導(dǎo)鏈。

滯后鏈(laggingstrand):另一條模板鏈?zhǔn)?‘-3’走向,在其上DNA也是從5‘-3’方向合成,但是與復(fù)制叉移動的方向相反,所以隨著復(fù)制叉的移動,形成許多不連續(xù)的片斷,最后完成一條完整的DNA鏈,這條鏈稱為滯后鏈。MolecularBiologyCourseDNA的半不連續(xù)復(fù)制MolecularBiologyCourseDNA復(fù)制的過程可以人為地劃分成3個階段:第一階段為DNA復(fù)制的起始階段,這個階段包括起始點(diǎn),復(fù)制方向以及引發(fā)體的形成;第二階段為DNA鏈的延長,包括前導(dǎo)鏈及隨從鏈的形成和切除RNA引物后填補(bǔ)空缺及連接岡崎片段;第三階段為DNA復(fù)制的終止階段。DNA復(fù)制的整個過程中需要30多種酶及蛋白質(zhì)分子參加,我們將在DNA復(fù)制的各個階段著重介紹它們的作用。MolecularBiologyCourse(二)、復(fù)制的起始階段

1、復(fù)制的起點(diǎn)2、復(fù)制的方向3、復(fù)制的速度

4、DNA復(fù)制起始引發(fā)體的形成及所參與的酶和蛋白質(zhì)

MolecularBiologyCourse1、復(fù)制的起點(diǎn)

(originofreplication)很多實驗都表明:復(fù)制是從DNA分子上的特定部位開始的,這一部位叫做復(fù)制起始點(diǎn)常用ori或o表示。細(xì)胞中的DNA復(fù)制一經(jīng)開始就會連續(xù)復(fù)制下去,直至完成細(xì)胞中全部基因組DNA的復(fù)制。復(fù)制子(Thereplicon

):DNA復(fù)制從起始點(diǎn)開始直到終點(diǎn)為止,每個這樣的DNA單位稱為復(fù)制子或復(fù)制單元。MolecularBiologyCourse在原核生物中,每個DNA分子只有一個復(fù)制起點(diǎn),因而只有一個復(fù)制子。而在真核生物中,DNA的復(fù)制是從許多起始點(diǎn)同時開始的,所以每個DNA分子上有許多個復(fù)制子。MolecularBiologyCourseDNA復(fù)制起始點(diǎn)有結(jié)構(gòu)上的特殊性。例如:大腸桿菌染色體DNA復(fù)制起始點(diǎn)Oric由422個核苷酸組成,其中有9個核苷酸或13個核苷酸組成的保守序列,這些部位是大腸桿菌中DnaA蛋白識別的位置,大腸桿菌染色體DNA是環(huán)狀雙鏈DNA。DNA是環(huán)狀雙鏈DNA,它的復(fù)制是典型的θ型復(fù)制。從一個起點(diǎn)開始,同時向兩個方向進(jìn)行復(fù)制,當(dāng)兩個復(fù)制方向相遇時,復(fù)制就停止。MolecularBiologyCourse二、復(fù)制的起始階段MolecularBiologyCourse

復(fù)制叉(replicationfork):DNA分子中正在進(jìn)行復(fù)制的分叉部位。它由兩條親代鏈及在其上新合成的子鏈構(gòu)成。

大多數(shù)生物體內(nèi)DNA的復(fù)制都是從復(fù)制起點(diǎn)開始以雙向等速形式進(jìn)行。少數(shù)為雙向不等速或單向方式進(jìn)行復(fù)制。復(fù)制叉2、復(fù)制的方向(1)、定點(diǎn)開始雙向復(fù)制(2)、定點(diǎn)開始單向復(fù)制(3)、兩點(diǎn)開始單向復(fù)制MolecularBiologyCourse(1)、定點(diǎn)開始雙向復(fù)制這是原核生物和真核生物DNA復(fù)制最主要的形式,從一個特定位點(diǎn)解鏈,沿著兩個相反的方向各生長出兩條鏈。MolecularBiologyCourse1、復(fù)制子(2)、定點(diǎn)開始單向復(fù)制質(zhì)粒colE1是個典型的例子,復(fù)制從一個起始點(diǎn)開始,以同一方向生長出兩條鏈,形成一個復(fù)制叉。MolecularBiologyCourse(3)、兩點(diǎn)開始單向復(fù)制(3)、兩點(diǎn)開始單向復(fù)制

腺病毒DNA的復(fù)制是從2個起點(diǎn)開始的,形成2個復(fù)制叉,各以一個單一方向復(fù)制出一條新鏈。MolecularBiologyCourse(3)、兩點(diǎn)開始單向復(fù)制MolecularBiologyCourse(3)、兩點(diǎn)開始單向復(fù)制MolecularBiologyCourse3、復(fù)制的速度有雙向等速的,也有雙向不等速的。MolecularBiologyCourse4、DNA復(fù)制起始引發(fā)體的

形成及所參與的酶和蛋白質(zhì)

(1)、DNA雙螺旋解旋(2)、引發(fā)體的形成

MolecularBiologyCourse(1)、DNA雙螺旋解旋

DNA在復(fù)制時,其雙鏈?zhǔn)紫冉忾_,形成復(fù)制叉。現(xiàn)在已經(jīng)發(fā)現(xiàn)一些酶和蛋白質(zhì)能使DNA雙鏈變得易于解開,或者可以使超螺旋分子松弛。1)、單鏈結(jié)合蛋白(SSB)

2)、

DNA解鏈酶(DNAhelicase)

3)、DNA的解鏈過程

MolecularBiologyCourse單鏈結(jié)合蛋白(SSB)

其作用是保證解鏈酶解開的單鏈在復(fù)制完成前保持單鏈結(jié)構(gòu),它以四聚體形式存在于復(fù)制叉處,待單鏈復(fù)制后才掉下,重新循環(huán).MolecularBiologyCourseDNA解鏈酶(DNAhelicase)DNA解鏈酶能通過水解ATP獲得能量來解開雙鏈DNA。它分解ATP的活性依賴于單鏈DNA的存在。如果雙鏈DNA中有單鏈末端或切口,則DNA解鏈酶可以首先結(jié)合在這一部分,然后逐步向雙鏈方向移動。大部分DNA解鏈酶可沿滯后鏈模板的5’-3’方向并隨著復(fù)制叉的前進(jìn)而移動,只有另一種解鏈酶(Rep蛋白)是沿著前導(dǎo)鏈模板的3’-5’方向移動。因此推測Rep蛋白和特定DNA解鏈酶分別在DNA的兩條鏈上協(xié)同作用,解開雙鏈DNA。

MolecularBiologyCourseDNAhelicasesDNA的解鏈過程

DNA在未復(fù)制前處于超螺旋結(jié)構(gòu),首先在拓?fù)洚悩?gòu)酶的作用下解開負(fù)超螺旋,并與解鏈酶共同作用,在復(fù)制起點(diǎn)處解開雙鏈。在解鏈過程中除了解鏈酶,還有一些特異蛋白,如DnaA,一旦局部解開雙鏈,就必需有SSB蛋白來穩(wěn)定解開的單鏈,以保證局部不會恢復(fù)成雙鏈。接著由引發(fā)酶等組成的引發(fā)體會馬上作用于兩條單鏈DNA。不論前導(dǎo)鏈還是滯后鏈都需要一段RNA引物以開始子鏈DNA的合成。MolecularBiologyCourse(2)、引發(fā)體(primosome)的形成DNA復(fù)制起始的關(guān)鍵步驟是前導(dǎo)鏈DNA的合成,一旦前導(dǎo)鏈DNA的聚合作用開始,隨從鏈DNA的合成也隨著開始。由于前導(dǎo)鏈的合成是連續(xù)進(jìn)行的,所以它的起始只要有一段RNA引物,DNA聚合酶就能以此為起點(diǎn),一直合成下去,相對簡單。而隨從鏈的合成是不連續(xù)進(jìn)行的,所以引發(fā)階段比較復(fù)雜。大腸桿菌的引發(fā)前體由DnaB、DnaC和單鏈結(jié)合蛋白組成。MolecularBiologyCourse(2)、引發(fā)體的形成1)、引物酶2)、引發(fā)體MolecularBiologyCourse引物酶(primase)它是一種特殊的RNA聚合酶,可催化短片段RNA的合成,即引物的合成。引物:是短RNA片段,一般十幾個至數(shù)十個核苷酸不等,它能與單鏈DNA配對,并且提供了一個自由的3’-OH末端,該末端提供了由DNA聚合酶催化形成DNA分子第一個磷酸二脂鍵的位置。MolecularBiologyCourseDNA聚合酶需要一個3-OH末端以起始復(fù)制(primase)MolecularBiologyCourse引發(fā)體引發(fā)體由6種蛋白質(zhì)n,n’,n’’,DnaB、C和I共同組成,只有這6種蛋白質(zhì)結(jié)合在一起并與引發(fā)酶進(jìn)一步組裝成引發(fā)體才能發(fā)揮其功效。引發(fā)體像火車頭一樣在滯后鏈分叉的方向上漿進(jìn),并在模板上斷斷續(xù)續(xù)的引發(fā)生成滯后鏈的引物RNA短鏈,再由DNA聚合酶三作用合成DNA,直至遇到下一個引物或崗崎片斷為止。MolecularBiologyCoursePrimosome(consistsofsixproteins)

PriA(dualrole)displaceSSBfromS.SDNAandhelicase

DnaT

requiredatpreprimingstage

DnaBiscentralcomponent,actionwithDnaC

DnaC

iscentralcomponent,actionwithDnaBPriB

functionisunknown

PriC

functionisunknownDnaGprimasereplisome(2)、引發(fā)體的形成MolecularBiologyCourse(三)、DNA復(fù)制的延長

階段以及參與的酶和蛋白質(zhì)分子

1、DNA聚合反應(yīng)和DNA酶2、與超螺旋松馳有關(guān)的酶:MolecularBiologyCourseDNA的復(fù)制DNA的復(fù)制實際上就是以DNA為模板,在DNA聚合酶的作用下,將有力的四種脫氧單核苷酸(dATP,dGTP,dCTP,dTTP,簡寫為dNTP)聚合成DNA的過程。這是一個非常復(fù)雜的酶促反應(yīng),需要許多酶和蛋白質(zhì)參與,現(xiàn)在分別敘述它們在DNA復(fù)制中作用。MolecularBiologyCourseSubstratesrequiredforDNAsynthesis+n1dATPn4dTTPn3dCTP+n2dGTP++DNA+Mg2+DNA聚合酶DNAdAMPdTMPdCMPdGMP(n1+n2+n3+n4)PPiMolecularBiologyCourse1、DNA聚合反應(yīng)和DNA酶1957年,Arthurkornberg首次在大腸桿菌中發(fā)現(xiàn)DNA聚合酶I,簡寫為DNApolI。后來又相繼發(fā)現(xiàn)了DNA聚合酶II和DNA聚合酶III。實驗證明大腸桿菌中DNA復(fù)制的主要過程靠DNApolIII,而DNApolI和

DNApolII在DNA錯配的修正和修復(fù)中起作用。MolecularBiologyCourse這種酶的共同性質(zhì)是:

①需要DNA模板,因此這類酶又稱為依賴DNA的DNA聚合酶。②需要RNA或DNA作為引物,即DNA聚合酶不能從頭催化DNA的起始。③催化dNTP加到生長中的DNA鏈的3‘-OH末端,因而DNA的合成方向是5’-3’④三種DNA聚合酶都是多功能酶,它們在DNA復(fù)制和修復(fù)過程的不同階段發(fā)揮作用。MolecularBiologyCourse1、DNA聚合反應(yīng)和DNA酶(1)、原核生物DNA聚合酶(2)、真核生物DNA聚合酶MolecularBiologyCourse(1)、原核生物DNA聚合酶1)、DNA合酶I2)、DNA合酶Ⅱ3)、DNA合酶ⅢMolecularBiologyCourse1)、DNA合酶I

DNApolI是由一條多肽鏈組成,分子量為109KD。酶分子中含有一個Zn2+,是聚合活性必須的。A、DNA聚合酶的5’-3’聚合活性

B、DNA聚合酶的3‘→5’外切酶活性──校對作用

C、DNA聚合酶的5'→3'外切酶活性──切除修復(fù)作用MolecularBiologyCourseMolecularBiologyCourseA、DNA聚合酶的5’-3’聚合活性

這是DNA聚合酶最主要的活性,在引物RNA3‘-OH末端,以dNTP為底物,按模板DNA上的指令由DNApolⅠ逐個將核苷酸加上去,就是DNApolⅠ的聚合作用。酶的專一性主要表現(xiàn)為新進(jìn)入的脫氧核苷酸必須與模板DNA配對時才有催化作用。dNTP進(jìn)入結(jié)合位點(diǎn)后,可能使酶的構(gòu)象發(fā)生變化,促進(jìn)3‘-OH與5’-PO4結(jié)合生成磷酸二酯鍵。若是錯誤的核苷酸進(jìn)入結(jié)合位點(diǎn),則不能與模板配對,無法改變酶的構(gòu)象而被3'-5'外切酶活性位點(diǎn)所識別并切除之。MolecularBiologyCourse1)、DNA合酶I

MolecularBiologyCourseB、DNA聚合酶的3‘→5’外切酶活性──校對作用

這種酶活性的主要功能是從3‘→5’方向識別和切除不配對的DNA生長鏈末端的核苷酸。這種功能稱為校對功能,這是保證聚合作用的正確性不可缺少的,因此,對于DNA復(fù)制中極高的保真性至關(guān)重要。MolecularBiologyCourse1)、DNA合酶I

MolecularBiologyCourseMolecularBiologyCourseC、DNA聚合酶的5‘→3’外切酶活性──切除修復(fù)作用5‘→3’外切酶活性就是從5‘→3’方向水解DNA生長鏈前方的DNA鏈,主要產(chǎn)生5‘-脫氧核苷酸。這種酶活性只對DNA上配對部份(雙鏈)磷酸二酯鍵有切割活力作用,方向是5‘→3’。每次能切除10個核苷酸,而且DNA的聚合作用能刺激5‘→3’外切酶活力達(dá)10倍以上。因此,這種酶活性在DNA損傷的修復(fù)中可能起著重要作用。對岡崎片段5'末端DNA引物的去除依賴此種外切酶活性。MolecularBiologyCourseDNApolI的5'→3'聚合活性和5'→3'外切酶活性協(xié)同作用,可以使DNA一條鏈上的切口從5'→3'方向移動,這種反應(yīng)叫做缺刻平移,利用此反應(yīng)可在體外對DNA片段進(jìn)行放射性P標(biāo)記制成探針,進(jìn)行核酸的分子雜交實驗。MolecularBiologyCourse1)、DNA合酶I

MolecularBiologyCourse1)、DNA合酶I

MolecularBiologyCourse2)、DNA合酶Ⅱ

此酶分子量為120KD,每個細(xì)胞約有100個酶分子,但活性只有DNapolⅠ的5%?;钚?′→3′聚合活性3′→5′外切活性而沒有5′→3′外切活性,它的作用可能與DNA損傷修復(fù)有關(guān)。MolecularBiologyCourse3)、DNA合酶Ⅲ

這是在DNA復(fù)制過程中起主要作用的聚合酶,它是由一個多亞基組成的蛋白質(zhì)分子,其分子量>600kDa整個酶分子形成一個不對稱的二聚體,每個大腸桿菌細(xì)胞中只有1000個酶分子,但催化dNTP參入DNA鏈的速率卻是最快的,約為9000核苷酸/每分鐘/每個酶分子。這也證明DNapolⅢ是DNA復(fù)制過程中主要發(fā)揮作用的酶。在大腸桿菌染色體DNA進(jìn)行復(fù)制時,DNA聚合酶Ⅲ全酶并不是單獨(dú)起作用的,而是與引發(fā)體等構(gòu)成一個復(fù)制體(replisome)。MolecularBiologyCourse3)、DNA合酶Ⅲ

由于復(fù)制體的存在,先導(dǎo)鏈和隨從鏈可以同時復(fù)制。DNapolⅢ是由多亞基組成的不對稱二聚體,它可能同時負(fù)責(zé)先導(dǎo)鏈和隨從鏈的復(fù)制。MolecularBiologyCourse隨著DNApolⅢ向前移動,先導(dǎo)鏈的合成逐漸延長的同時,崗崎片段也在不斷延長。當(dāng)崗崎片段合成到前一個片段的5′端時,這岡崎片段就釋放出來,由于復(fù)制叉向前移動又可將另一部分隨從鏈的模板置換出來,由引發(fā)體合成新的引物,然后進(jìn)行新的崗崎片段的合成。由此模型不難看出:隨從鏈的合成需要周期性的引發(fā),因此其合成進(jìn)度總是與前導(dǎo)鏈相差一個崗崎片段的長度。MolecularBiologyCourse崗崎片段完成后,其5′端的RNA引物由DNapolⅠ的5′→3′外切酶活性切除,由此造成的空隙再由DNApolⅠ的5′→3′聚合活性催化dNTP得到填補(bǔ)。所以DNA的復(fù)制是在DNapolⅢ和DNApolⅠ互相配合下完成的。MolecularBiologyCourse原核DNA聚合酶(E.coli)聚合酶Ⅰ聚合酶Ⅱ聚合酶Ⅲ5′→3′聚合酶活性3′→5′外切酶活性5′→3′外切酶活性作用+++DNA損傷的修復(fù)和岡崎片段之間間隙的填補(bǔ),實踐上其產(chǎn)生的“缺口平移”(nicktrans-lation)技術(shù)也用于分子雜交時的核酸分子探針的標(biāo)記++-DNA的修復(fù)++-DNA復(fù)制中子鏈的延長,為主導(dǎo)聚合酶MolecularBiologyCourse(2)、真核生物DNA聚合酶1)、DNA聚合酶α2)、DNA聚合酶β3)、DNA聚合酶γMolecularBiologyCourse2)、DNA聚合酶β

它能以人工合成的多聚脫氧核糖核苷酸為模板,而以適當(dāng)?shù)墓丫勖撗鹾颂呛怂徭湠橐锖铣蒁NA。此酶活性水平穩(wěn)定,可能主要在DNA損傷的修復(fù)中起作用。1)、DNA聚合酶α是真核生物的復(fù)制酶,它在細(xì)胞內(nèi)的活性變化與DNA復(fù)制有明顯的平行關(guān)系,在細(xì)胞分裂的S期達(dá)到高峰。MolecularBiologyCourse3)、DNA聚合酶γ

它能有效利用人工合成的多聚核糖核酸作為模板,以脫氧核糖核酸鏈為引物合成DNA,但不是反轉(zhuǎn)錄酶。它在分裂細(xì)胞中的活性有明顯的變化,細(xì)胞進(jìn)入S期后,它活性升高2倍,然后回到正常水平。它可能在分裂細(xì)胞DNA復(fù)制調(diào)控方面起作用。MolecularBiologyCourse2、與超螺旋松馳有關(guān)的酶

DNA復(fù)制從起始點(diǎn)開始向一個方向復(fù)制時,局部的DNA雙鏈必須打開,主要靠解鏈酶的作用,打開后的單鏈還需要單鏈結(jié)合蛋白與其結(jié)合,在復(fù)制叉向前移動時造成其前方DNA分子所產(chǎn)生的正超螺旋,必須由拓?fù)洚悩?gòu)酶來解決。下面分別介紹它們的作用。MolecularBiologyCourse拓?fù)洚悩?gòu)酶(topoisomerase)是一類改變DNA拓?fù)湫再|(zhì)的酶。在體外可催化DNA的各種拓?fù)洚悩?gòu)化反應(yīng)。而在生物體內(nèi)它們可能參與DNA的復(fù)制與轉(zhuǎn)錄。在DNA復(fù)制時,復(fù)制叉行進(jìn)的前方DNA分子部分產(chǎn)生有正超螺旋,拓?fù)涿缚伤神Y超螺旋,有利于復(fù)制叉的前進(jìn)及DNA的合成。DNA復(fù)制完成后,拓?fù)涿赣挚蓪NA分子引入超螺旋,使DNA纏繞、折疊,壓縮以形成染色質(zhì)。

MolecularBiologyCourse(四)、DNA復(fù)制的終止階段DNA在復(fù)制過程中,合成出的前導(dǎo)鏈為一條連續(xù)的長鏈。隨從鏈則是由合成出許多相鄰的片段,在連接酶的催化下,連接成為一條長鏈。連接作用是在連接酶催化下進(jìn)行的。MolecularBiologyCourse連接酶(ligase)的作用是催化相鄰的DNA片段以3′、5′-磷酸二酯鍵相連接。連接反應(yīng)中的能量來自ATP(或NAD+)。連接酶先與ATP作用,以共價鍵相連生成E-AMP中間體。中間體即與一個DNA片段的5′-磷酸相連接形成E-AMP-5′-DNA。然后再與另一個DNA片段的3′-OHH末端作用,E和AMP脫下,兩個DNA片段以3′、5′磷酸二酯鍵相連接。隨從鏈的各個DNA片段就是這樣連接成一條DNA長鏈。

MolecularBiologyCourse已有研究證明大腸桿菌染色體DNA有復(fù)制終止位點(diǎn)此處可以結(jié)合一種特異的蛋白質(zhì)分子叫做Tus,這個蛋白質(zhì)可能是通過阻止解鏈酶(Helicase)的解鏈活性而終止復(fù)制的。詳細(xì)的機(jī)制還不完全清楚。DNA復(fù)制完成后,靠拓?fù)涿笇NA分子引入超螺旋結(jié)構(gòu)。

MolecularBiologyCourse(五)、復(fù)制的幾種主要方式1、線狀DNA雙鏈的復(fù)制;2、環(huán)狀DNA雙鏈的復(fù)制:1)型復(fù)制;2)滾環(huán)型復(fù)制;3)D-環(huán)型;MolecularBiologyCourse1、線狀DNA雙鏈的復(fù)制線狀雙鏈DNA上復(fù)制叉生長方式有單一起始點(diǎn)或多個起始點(diǎn),在此形成復(fù)制眼,從復(fù)制眼開始復(fù)制叉可以單向(如腺病毒)及雙向(如T7)。真核生物都為多復(fù)制眼起始的雙向復(fù)制。MolecularBiologyCourse2、環(huán)形DNA雙鏈的復(fù)制-型大腸桿菌DNA環(huán)狀分子半保留復(fù)制的中間產(chǎn)物就是

型。復(fù)制的起點(diǎn)涉及到DNA雙鏈的解旋和松開,形成兩個方向相反的復(fù)制叉。復(fù)制從ori開始以順時針和逆時針雙向進(jìn)行時,復(fù)制的中間產(chǎn)物在電鏡下表現(xiàn)為型。MolecularBiologyCourse2、環(huán)形DNA雙鏈的復(fù)制-滾環(huán)型環(huán)形DNA雙鏈復(fù)制的一種,為單向復(fù)制。復(fù)制過程中,首先形成共價閉環(huán)的雙鏈分子(RF型),然后其正鏈由一核酸內(nèi)切酶在特定位置切開,游離出3‘羥基和5’磷酸基。5‘磷酸末端在酶的作用下固著在細(xì)胞膜上,隨后在DNA聚合酶的作用下,以環(huán)狀負(fù)鏈為模板,從正鏈的3’羥基末端加入脫氧核苷酸,使鏈不斷延長,通過滾環(huán)形成新的正鏈。MolecularBiologyCourse2、環(huán)形DNA雙鏈的復(fù)制-D環(huán)型單向復(fù)制:雙鏈環(huán)在固定點(diǎn)進(jìn)行復(fù)制,但兩條鏈的合成高度不對稱,一條鏈先復(fù)制,另一條鏈保持單鏈而被取代,在電鏡下呈D環(huán)形狀。待一條鏈復(fù)制到一定程度,露出另一條鏈的復(fù)制起點(diǎn),另一條鏈才開始復(fù)制。這表明:兩條鏈的復(fù)制起點(diǎn)并不總在同一點(diǎn)上,當(dāng)兩條鏈的起點(diǎn)分開一定距離時就產(chǎn)生D-環(huán)復(fù)制。MolecularBiologyCourse(六)、真核生物DNA的復(fù)制

1、真核生物與原核生物DNA復(fù)制的區(qū)別2、端粒和端粒酶MolecularBiologyCourse(六)、真核生物DNA的復(fù)制

1、真核生物與原核生物DNA復(fù)制的區(qū)別(1)、真核生物有多個復(fù)制起點(diǎn)(2)、真核生物的染色體在全部完成之前,各個起點(diǎn)上DNA的復(fù)制不能再開始,而快速生長的原核生物種,復(fù)制起點(diǎn)上可以連續(xù)開始新的DNA復(fù)制,表現(xiàn)為雖只有一個復(fù)制單元,但可以有多個復(fù)制叉。MolecularBiologyCourse(六)、真核生物DNA的復(fù)制

2、端粒和端粒酶1)、端粒2)、端粒酶3)、端粒與衰老4)、端粒酶與腫瘤MolecularBiologyCourse2、端粒和端粒酶MolecularBiologyCourse端粒端粒:真核生物線性染色體3末端的一種特殊結(jié)構(gòu)。核苷酸重復(fù)序列富含G,和端粒結(jié)合蛋白組成核蛋白復(fù)合物。人的DNA端粒含有TTAGGG重復(fù)序列,長度5~15kb。作用:A保護(hù)染色體末端免于化學(xué)修飾或核酸酶降解;B解決染色體復(fù)制時末端丟失問題端粒酶能將端粒加到DNA末端的核糖核蛋白復(fù)合物,由多條肽鏈與一個RNA分子組成,端粒酶的蛋白質(zhì)組分具有模板和逆轉(zhuǎn)錄酶的作用,但其逆轉(zhuǎn)錄酶活性只限于應(yīng)用端粒酶特異的RNA作為模板。MolecularBiologyCourse端粒酶MolecularBiologyCourse端粒與衰老

實驗:在無端粒酶活性的成纖維細(xì)胞中表達(dá)端粒酶時,端粒的縮短和細(xì)胞的衰老都受到抑制。結(jié)論:細(xì)胞的衰老是由端粒驅(qū)動的。體外培養(yǎng)的細(xì)胞端粒的長度隨細(xì)胞逐代相傳而縮短,丟失到一定程度便失去對染色體的保護(hù)作用。細(xì)胞隨之發(fā)生衰老和死亡。MolecularBiologyCourse端粒與衰老可把端??闯梢幻骁姡肆5拈L度是鐘上的刻度,記載了細(xì)胞分裂的次數(shù),稱為“端粒鐘”,或有絲分裂鐘或“生命的時鐘”,可通過測定端粒的長度預(yù)測細(xì)胞的壽命。胚胎細(xì)胞和生殖細(xì)胞端粒的長度并不隨細(xì)胞分裂次數(shù)的增加而縮短,具有無限的分裂能力,原因在于端粒酶的存在。MolecularBiologyCourse端粒與腫瘤人體內(nèi)除了生殖細(xì)胞和少數(shù)一些體細(xì)胞如淋巴細(xì)胞等細(xì)胞外,絕大多數(shù)體細(xì)胞中無法檢測到端粒酶的活性,而在多數(shù)腫瘤細(xì)胞中能檢測到端粒酶的活性。腫瘤的端粒長度很短,其繼續(xù)縮短導(dǎo)致染色體融合、細(xì)胞死亡,而端粒酶的激活可以維持端粒的長度,維持腫瘤的繼續(xù)分裂、增殖。端粒酶的表達(dá)可能是腫瘤形成和發(fā)展的共同途徑。MolecularBiologyCourse端粒酶與惡性腫瘤之間有相關(guān)性使之在腫瘤的診斷和治療上有望成為新的靶目標(biāo)??梢酝ㄟ^各種途徑抑制端粒酶的活性有效抑制大多數(shù)腫瘤的生長,而對正常細(xì)胞沒有影響。MolecularBiologyCourse二、逆轉(zhuǎn)錄酶(一)、逆轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn)(二)、逆轉(zhuǎn)錄酶的性質(zhì)(三)、逆轉(zhuǎn)錄酶的功能(四)、逆轉(zhuǎn)錄酶的基因組復(fù)制(五)、逆轉(zhuǎn)錄酶的生物學(xué)意義MolecularBiologyCourse(一)、逆轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn)1964年,Temin發(fā)現(xiàn)Rous肉瘤病毒等RNA病毒所造成的感染可被DNA合成抑制劑遏制。表明:RNA腫瘤病毒的RNA復(fù)制過程中要合成DNA。Temin又發(fā)現(xiàn)放線菌素D能抑制致癌RNA病毒的復(fù)制,但不能抑制一般RNA病毒的復(fù)制。表明:轉(zhuǎn)錄對于RNA病毒增殖是必需的。MolecularBiologyCourseTemin提出前病毒假說:原病毒DNA是RNA腫瘤病毒在復(fù)制和致癌中的中間物。1970年,Temin在Rouse肉瘤病毒、Baltimore在白血病病毒中發(fā)現(xiàn)逆轉(zhuǎn)錄酶。MolecularBiologyCourse(二)、逆轉(zhuǎn)錄酶的性質(zhì)

它是由α亞基和β亞基組成,含有鋅離子;

DNA合成反應(yīng)要求有模板和引物;以四種脫氧核苷三磷酸為底物;DNA合成方向也為5’-3’;

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