基礎(chǔ)生物化學(xué) 復(fù)習(xí)總結(jié)課件

生物化學(xué)——研究生命的化學(xué)本質(zhì)物質(zhì)基礎(chǔ)（代謝）功能有機小分子、無機離子生物大分子（多糖、脂、核酸、蛋白酶）組成——元素組成、結(jié)構(gòu)組成分布——胞內(nèi)、胞外結(jié)構(gòu)——一級（化學(xué)）結(jié)構(gòu)高級（空間）結(jié)構(gòu)性質(zhì)——一般化學(xué)性質(zhì)、光學(xué)性質(zhì)物理化學(xué)性質(zhì)生物學(xué)活性（變性、復(fù)性）

物質(zhì)代謝（同化、異化）代謝途徑（分解、合成）——物質(zhì)能量衍替代謝調(diào)控（限速酶）基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010核酸（5'→3'）磷酸堿基（Py/Pu）(2'-脫氧)核糖(稀有)核苷A/G/C/T（U）核苷酸核酸(A\B\Z型）DNA3',5'-磷酸二酯鍵

甲酸鹽、

CO2Gly、Gln

Asp、Ser

氨甲酰磷酸復(fù)制

逆轉(zhuǎn)錄（逆轉(zhuǎn)錄酶）不對稱轉(zhuǎn)錄（RNA聚合酶）自我復(fù)制（RNA復(fù)制酶）半不連續(xù)復(fù)制半保留復(fù)制DNA聚合酶原：ⅠⅡⅢⅣⅤ

真：αεθ(核心)PRPP

原：α2ββ‘ω(核心）σ真：ⅢⅠ

Ⅱ胞質(zhì)溶膠細胞核/細胞器RNA（mRNArRNAtRNA）堿基分解在三個水平上核苷酸轉(zhuǎn)化在不同磷酸水平上核酸酶基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010核酸DNAmRNAtRNArRNA組成dNTP（AGCT）NTP（AGCU）分布（主）細胞核（類核、葉綠體、線粒體、病毒）細胞質(zhì)為主（核糖體）、細胞核次（病毒）化學(xué)結(jié)構(gòu)3，5磷酸二酯鍵連接而成的核苷酸鏈（5→3）5-帽子、3-polyADHUΨ5S、16S、23S(原核）

5S、5.8S、18S、28S二級結(jié)構(gòu)雙螺旋（B\A\Z）局部螺旋+突環(huán)三葉草型

局部螺旋+突環(huán)三級結(jié)構(gòu)

超螺旋

超螺旋

倒L型

超螺旋超分子復(fù)合物

染色體（病毒）

核糖體（病毒）化學(xué)性質(zhì)

白色纖維狀固體

白色粉末，水溶，有機醇沉淀光學(xué)性質(zhì)OD260（dsDNA>ssDNA>RNA>poly(d)NTP變性復(fù)性

增色效應(yīng)、減色效應(yīng)、Tm（熱變性）、分子雜交電化學(xué)

電泳(p-)基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010核苷酸代謝從頭合成補救途徑Ser:環(huán)外CH3Gln:環(huán)外NH2PRPP基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010原核生物(大腸桿菌)真核生物

復(fù)制DNA聚合酶IIIIII染色體環(huán)形，單點雙向復(fù)制一次復(fù)制完成前可起始下一次無特殊的末端復(fù)制DNA聚合酶全酶染色體線形，多點雙向復(fù)制不能同時多次起始復(fù)制組裝核小體端粒復(fù)制轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄和翻譯幾乎同步RNA聚合酶α2ββ'σ啟動子（-35區(qū)和-10區(qū)）轉(zhuǎn)錄后加工較簡單（切、加、修飾）調(diào)控簡單，負調(diào)控為主區(qū)域化分開RNA聚合酶IIIIII啟動子（-75區(qū)和-25區(qū)）轉(zhuǎn)錄后加工復(fù)雜（切、接、加、修飾）調(diào)控復(fù)雜，正調(diào)控為主翻譯核糖體較小而簡單（30S+50S=70S）起始氨基酸fMet多順反子SD序列(翻譯起始)起始因子較少，延伸和終止因子較多核糖體大而復(fù)雜（40S+60S=80S）起始氨基酸Met單順反子5'-帽子結(jié)構(gòu)起始因子多，延伸和終止因子少線粒體和葉綠體合成類似原核生物基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010蛋白質(zhì)化學(xué)組成CHON（16%）PS結(jié)構(gòu)組成

氨基酸（蛋白質(zhì)氨基酸）化學(xué)結(jié)構(gòu)

肽鍵連接而成的氨基酸鏈（N→C）二級結(jié)構(gòu)α-螺旋β-轉(zhuǎn)角β-折疊無軌卷曲（鏈內(nèi)/間氫鍵）超二級結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)域三級結(jié)構(gòu)

亞基、單體蛋白（側(cè)鏈基團次級鍵）四級結(jié)構(gòu)

寡聚蛋白（如別構(gòu)酶）化學(xué)性質(zhì)

兩性解離（等電點、等離子點）光學(xué)性質(zhì)OD280（Trp、Tyr、Phe）物理化學(xué)

膠體（水化層、電荷作用）顯色反應(yīng)

茚三酮反應(yīng)雙縮脲反應(yīng)Sanger反應(yīng)Edaman反應(yīng)沉淀反應(yīng)

破壞水化層（鹽析、脫水劑）、電中和（鹽析、重鹽、生物堿）變性復(fù)性

變性——次級鍵破壞，肽鍵正常電化學(xué)

變性電泳（pH—pI）、變性電泳（SDS）測序肽鏈數(shù)確定—肽鏈分離—末端測定—專一裂解—片段純化測序—末端重疊基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010蛋白（N→C）氨基酸多肽鏈氨基酸、核糖體、mRNA、tRNA、輔助因子（Mg2+、IF、EF、RF）氨基酸活化終止和釋放延伸合成起始翻譯后加工運輸?shù)鞍譔H3氨同化轉(zhuǎn)氨基作用氨基酸轉(zhuǎn)化[Glu氨甲酰磷酸]生物固氮NO3還原含N有機物分解合成氨基酸銨鹽酰胺尿素酮酸氧化分解、生成氨基酸或糖和脂氨基酸脫氨、糖分解、植物光呼吸Pyr——Ala族乙醛酸、PGA——Ser族草酰乙酸/延胡索酸——Asp族α-酮戊二酸——Glu族Ru5P——HisE4p、PEP——芳香族氨基酸/肽段切除特征序列添加共價修飾折疊［一碳轉(zhuǎn)移］脫氨基（氧化＼轉(zhuǎn)氨＼聯(lián)合＼非氧化＼脫酰胺）胺（羥化／直接）脫羧基基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010（ATP—AMP）（GTP）（GTP）基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010核酸和蛋白的比較基本結(jié)構(gòu)單位

核苷酸

氨基酸一級結(jié)構(gòu)及其

5?→3?N→C作用力

3,5-磷酸二酯鍵肽鍵二級結(jié)構(gòu)極其

BAZα-螺旋β-折疊β-轉(zhuǎn)角無規(guī)卷曲穩(wěn)定的作用力

堿基堆積力

氫鍵氫鍵離子鍵高級結(jié)構(gòu)及其超螺旋三、四級結(jié)構(gòu)作用力氫鍵次級鍵（鹽鍵氫鍵二硫鍵疏水作用）

紫外吸收堿基共軛雙鍵芳香族共軛雙鍵（TrpTyrPhe）

260nm280nm

變性二級結(jié)構(gòu)破壞，雙螺旋變單鏈

空間結(jié)構(gòu)（包括二級）破壞合成細胞核（真核）細胞液

核酸蛋白基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010高[H+]低[H+]ADPATPNADHFADH22H+2H+2H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+H+e-e-e-e-H2ONADH/FADH2H+H+H+ADPATPA~PBATPADPK+K+K+K+Na+Na+Na+Na+魚藤酮抗霉素ACO寡霉素DNB纈胺霉素短桿菌肽XXH+K+生物氧化H+eH+e基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010解偶聯(lián)劑離子載體抑制劑電子傳遞連抑制劑氧化磷酸化抑制劑基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010氧、轉(zhuǎn)、水、裂、異、合基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010酶分布胞內(nèi)酶（區(qū)域化）、胞外酶催化特性降低活化能縮短熱力學(xué)反應(yīng)到達平衡點時間，作用雙向性，反應(yīng)前后質(zhì)量不變高效性、專一性、條件溫和、易失活、可調(diào)控、需輔助因子（生物催化劑）專一性結(jié)構(gòu)專一（絕對、相對（鍵、基團））、立體異構(gòu)專一（旋光、幾何/順反）分類按化學(xué)組成（單純酶、結(jié)合酶）、按分子結(jié)構(gòu)（單體酶、寡聚酶、多酶復(fù)合體）按反應(yīng)性質(zhì)（氧、轉(zhuǎn)、水、裂、異、合）結(jié)構(gòu)全酶=酶蛋白（必需基團—活性中心—結(jié)合部位+催化部位）+輔助因子作用機理

催化機理——降低活化能理論基礎(chǔ)——中間產(chǎn)物學(xué)說與底物作用方式——鎖鑰學(xué)說、誘導(dǎo)契合學(xué)說高效催化機理——鄰近定向、張力變形、酸堿催化、共價催化、微環(huán)境酶活調(diào)節(jié)酶原激活（本質(zhì)）、別構(gòu)酶、同工酶、誘導(dǎo)酶（化學(xué)修飾、聚合/解聚）影響酶活性的因素底物濃度（米氏方程、米氏常數(shù)—雙倒數(shù)作圖法）、溫度和pH（最適值）激活劑和抑制劑（不可逆、可逆（非競爭性、競爭性、反競爭性））酶活測定酶活力（U、Kat）、比活力、轉(zhuǎn)換數(shù)其他維生素和輔酶、核酶基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010S氧化脫羧、非氧化分子重排己糖磷酸化磷酸己糖裂解丙酮酸生成基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010CHOCH2CH2CH2CH2CH2OHCH2O-PCH2CH2CH2CH2CH2O-PCH3CH2COOHCOOHCH2CH3GlcPGAPyrCH3（CH3）CHOHCOOH乳酸CH3（CH3）CH2OH乙醇+CO2乙酰CoA+CO2CH3（CH3）CO~SCoACO-COOHCH2-COOH草酰乙酸CH2COOHCO-COOHCH2-COOH檸檬酸CO-COOHCH2-COOHCO2CO2糖分解代謝中碳原子去向基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010G6P蔗糖UDPGPiG1P淀粉/糖原ADPG/UDPG（肝臟/油料種子萌發(fā)）細胞質(zhì)基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010

脂肪乙酰CoA脂肪類脂（磷脂）脂肪酸合成酶系甘油脂肪酸脂肪酸活化轉(zhuǎn)運α、β、ω-氧化脫氫水合脫氫硫解還原（烯脂酰ACP脫水酶）脫水（羥脂酰ACP脫水酶）還原（酮脂酰ACP還原酶）縮合（β-酮脂酰ACP合酶）丙二酸單酰CoA乙酰CoA羧化酶胺衍生物脂肪鏈合成乙酰CoA羧化乙酰CoA轉(zhuǎn)運基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010從頭合成——胞質(zhì)溶膠/質(zhì)體Β-氧化——線粒體/乙醛酸體基質(zhì)基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010代謝調(diào)節(jié)神經(jīng)系統(tǒng)調(diào)節(jié)激素調(diào)節(jié)細胞水平調(diào)節(jié)酶水平調(diào)節(jié)（最基本的調(diào)節(jié)）

數(shù)量調(diào)節(jié)（粗調(diào)）——酶的合成和降解：乳糖操縱子活性調(diào)節(jié)（微調(diào)）——酶原激活共價修飾（級聯(lián)放大）：（去）磷酸化變構(gòu)調(diào)節(jié)（前饋激活、反饋抑制—單價、二價）：標(biāo)兵酶聚合/解聚輔因子調(diào)節(jié)（能荷調(diào)節(jié)、金屬離子、NADH/NAD）定位調(diào)節(jié)——區(qū)域化調(diào)節(jié)基因：阻遏蛋白操縱子——啟動子+操縱基因+結(jié)構(gòu)基因誘導(dǎo)物（乳糖）、輔阻遏物（Trp）代謝網(wǎng)絡(luò)——關(guān)鍵中間產(chǎn)物：6-PG、Pyr、乙酰CoA四級調(diào)節(jié)：順序反饋抑制協(xié)同反饋抑制積累反饋抑制同工酶反饋抑制基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)20101、物質(zhì):從來源、組成、性質(zhì)和生物學(xué)功能描述

核酸——雜交分子、限制（性內(nèi)切）酶、核（酸構(gòu)成）酶、性/平齊末端粘岡崎片段、先導(dǎo)鏈和滯后鏈、Klenow片段

蛋白——簡單/結(jié)合/寡聚球蛋白、必需氨基酸、遺傳密碼、反密碼子同義密碼子、同工受體tRNA

酶——單純/結(jié)合酶、單體酶、寡聚酶、多酶復(fù)合體、變構(gòu)酶、同工酶誘導(dǎo)酶和組成酶、端粒酶生物氧化——生物氧化、高能（磷酸）化合物脂——酮體代謝調(diào)節(jié)——限速酶/標(biāo)兵酶、信號肽名詞解釋基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)20102、結(jié)構(gòu):從組成規(guī)律、空間分布特點、維持穩(wěn)定的因素及功能等描述

核酸——一級結(jié)構(gòu)、B型DNA、質(zhì)粒、斷裂（不連續(xù)）基因內(nèi)含子和外顯子、啟動子和終止子

蛋白——一級結(jié)構(gòu)到四級結(jié)構(gòu)、肽單位（平面）、α-螺旋亞基、SD序列、多核糖體

酶——全酶、輔酶/基、活性中心、必需基團生物氧化——電子傳遞鏈代謝調(diào)節(jié)——操縱子

基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)20103、變化/過程及調(diào)節(jié):

核酸——增/減色效應(yīng)、變/復(fù)性、分子雜交、半保留/半不連續(xù)復(fù)制、逆轉(zhuǎn)錄

蛋白——別構(gòu)效應(yīng)、鹽溶和鹽析、透析、轉(zhuǎn)/聯(lián)合脫氨基作用、翻譯

酶——可逆抑制和不可逆抑制、競爭/非競爭性抑制、酸堿催化和共價催化生物氧化——能荷調(diào)節(jié)、底物水平/電子傳遞鏈氧化磷酸化、解偶聯(lián)

糖——糖異生、EMP、TCA、PPP

脂——β-氧化、檸檬酸穿梭、乙醛酸循環(huán)代謝調(diào)節(jié)——前饋激活、反饋抑制、酶原激活

基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)20104、性質(zhì)和規(guī)律:

核酸——中心法則生物氧化——化學(xué)滲透學(xué)說酶——誘導(dǎo)契合學(xué)說、中間產(chǎn)物學(xué)說

基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)20105、單位:

核酸——熔解溫度（Tm）蛋白——等電點（pI）酶——活力單位（U/Kat）、比活力、轉(zhuǎn)換數(shù)生物氧化——能荷、磷氧比

基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)20101、氨基酸縮寫2、稀有核苷、核苷酸和核酸縮寫

PuPydTTPcAMPdTTPDHUm7GψCmIMPmRNArRNAmtDNActDNAds/ssDNAdsDNAcDNAsnRNAhnRNAtRNAmtRNAf3、重要的輔因子和載體

NAD（H）NADP（H）FAD（H2）

TPPFMN（H2）THFA（FH4）CoASHGSH/GSSGCytaa3CoQU/A/GDPGACPBCCP(P)APSSAMPRPPIF/EF/RFCAP4、重要的單位

TmpI5、重要的代謝途徑和催化酶

EMPTCAPPP/HMSETCR/Q/D酶FASLDHATCase

6、重要的物質(zhì)和專有名詞

PEPPITCDNPSSBMetfMet符號基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)20101、組成和分布元素組成、基本組分、不同種類的細胞定位2、分類按結(jié)構(gòu)組成、按基團性質(zhì)、按營養(yǎng)結(jié)構(gòu)、按產(chǎn)物種類

3、結(jié)構(gòu)不同結(jié)構(gòu)層次、不同結(jié)構(gòu)單元、維持結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的因素4、性質(zhì)解離（極性）、旋光性、光吸收、溶解性（沉淀）、變性和復(fù)性、顯色簡并、配對能力一、靜態(tài)：核酸、蛋白、酶、糖、脂單知識點基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)20101、代謝途徑的細胞定位：分解和合成2、代謝途徑的分類和階段：電子傳遞、EMP/TCA/HMS/糖異生、β氧化/從頭合成

分支代謝途徑、共同代謝途徑、補救途徑(草酰乙酸回補、核苷酸合成）例：蛋白質(zhì)合成——AA活化、多肽鏈合成起始、延伸、終止和釋放、后加工3、代謝途徑的重要中間代謝產(chǎn)物、關(guān)鍵反應(yīng)和酶

高能化合物特殊性質(zhì)代謝物共同代謝物關(guān)鍵步驟限速酶

4、代謝物的代謝方式：如ADP磷酸化、脫氨/羧基、DNA損傷修復(fù)5、代謝物的來源和去向6、能量變化：ATPGTPNADHNADPHFADH2

二、動態(tài)：核酸、蛋白、糖、脂單知識點基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010

核酸——熔解溫度（Tm）、不對稱比率（A+T/G+C）蛋白——含氮量推蛋白含量（16%）、等電點（pI=pKa+pKb/2）酶——比活力、Km

生物氧化——能荷（ATP+0.5ADP/ATP+ADP+AMP）、磷氧比代謝調(diào)節(jié)——積累抑制效應(yīng)[A+（1-A）XB]

1、單位/含量/效應(yīng)換算計算基礎(chǔ)生物化學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)2010

糖——EMP（1Glc→2Pyr）有氧：+8/6ATP（2NADH+2ATP）；無氧：+2ATP

發(fā)酵（1Glc→2乙醇/乳酸）：+2ATP