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文檔簡介

向GenBank批量上傳序列的方法Qin1.利用DNAstar的editSeq制作待序列的FASTA文檔：待上傳序列刪減至合適長度后，將待上傳序列全部打開隨后點(diǎn)擊File-exportasone，保存文件格式為：*.fas，將待上傳序列全部歸至一個(gè)FASTA文檔。注意序列命名：2.在GenBank的SubmissionTools里，下載序列信息編輯軟件Sequin。網(wǎng)址：/Sequin/（下圖中點(diǎn)擊Instructions下載軟件）注意打開安裝文件后，程序會(huì)自動(dòng)安裝在安裝包所在的文件夾。3.打開Sequin，點(diǎn)擊StartNewSubmission。導(dǎo)入之后，輸入序列ID（序號(hào)ID相當(dāng)于編號(hào)，可以自由命名，只要各個(gè)序列的ID不一致即可。在這里以病人編號(hào)作為序列ID）：導(dǎo)入序列成功后，顯示各個(gè)序列信息如下：點(diǎn)擊SequencingMethod，將測(cè)序方法輸入：選擇上傳序列的用途：病毒類型：編輯每條序列的信息：點(diǎn)擊ImportSourceTable可以導(dǎo)入模板，點(diǎn)擊ExportThisTable可以輸出模板備用。選擇核酸類型，序列內(nèi)容后，點(diǎn)擊OpenRecordViewer。添加每條序列的信息，包括編碼區(qū)重復(fù)區(qū)RNA結(jié)構(gòu)等等。雙擊相關(guān)信息可進(jìn)行修改，點(diǎn)擊Annotate添加相關(guān)信息。檢查信息是否有誤（也可以點(diǎn)擊Search里的Validate檢測(cè)是否有明顯錯(cuò)誤）：有些錯(cuò)誤是可以忽略的，如上傳的序列為CDS序列，那么軟件報(bào)錯(cuò)”序列無終止子”時(shí)可忽略。隨后，點(diǎn)擊Done保存待上傳序列：注意此時(shí)保存的文件包含所有序列信息，因此只需保存一次即可。12.將保存好的文件作為郵件附件，發(fā)送

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