《ubmed使用指南》課件

PubMed使用指南南京中醫(yī)藥大學文獻檢索教研室郝桂榮1精選課件ppt主要內(nèi)容一、PubMed概況二、PubMed數(shù)據(jù)來源三、PubMed主頁介紹四、PubMed檢索方法五、PubMed的檢索結(jié)果處理2精選課件pptPubMed概況美國國家醫(yī)學圖書館(NLM)所屬的國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)開發(fā)的因特網(wǎng)生物醫(yī)學信息檢索系統(tǒng)。收錄的期刊最早追溯至1865年，收錄共70多個國家5400多種主要生物醫(yī)學期刊的書目索引和摘要，每年增加約60余萬條文獻記錄。PubMed的子集Medline收錄的文獻最早追溯至1902年。在全部記錄中有76%的文獻為英文；在2000年以來的記錄中90%的文獻為英文，共計收錄國內(nèi)出版的期刊170余種。1997年6月開始通過網(wǎng)絡途徑免費向全球開放。3精選課件pptPubMed概況提供期刊全文的出版商網(wǎng)址的鏈接，并提供部分免費全文。數(shù)據(jù)類型：期刊論文、綜述、以及與其他數(shù)據(jù)資源鏈接。特點：提供檢索詞自動轉(zhuǎn)換匹配操作簡便、快捷4精選課件pptPubMed數(shù)據(jù)來源MEDLINE5000余種生物醫(yī)學期刊，內(nèi)容涉及醫(yī)學、護理、牙科、獸醫(yī)、健康保健系統(tǒng)、前臨床醫(yī)學等學科。這些期刊來源于美國和世界上70多個國家和地區(qū)。文獻量達2千多萬條記錄，并回溯到1966年。記錄中用[indexedforMEDLINE]標記PREMEDLINE，是一種由正在加工處理之中的文獻記錄組成的數(shù)據(jù)庫，這些記錄還未標引主題詞，暫時放在些數(shù)據(jù)庫中。記錄中用[PubMed-inprocess]標記表示。獲MeSH詞后，再加入MEDLINE。5精選課件pptPubMed數(shù)據(jù)來源RecordSuppledbyPublisher出版商直接向PubMed提供電子記錄。包括MEDLINE未收錄的部分記錄。記錄中用[PubMed-assuppliedbypublisher]標記表示。另外這些記錄每天都向PREMEDLINE中傳送，則改為[PubMed-inprocess]。OldMedline1948-1965年間發(fā)表的200多萬篇文獻。沒有MeSH字段和摘要。記錄中用[PubMed-OLDMEDLINEforPre1966]標記表示。6精選課件pptPubMed與MEDLINE的區(qū)別MEDLINE光盤數(shù)據(jù)庫包括《醫(yī)學索引》、《牙科文獻索引》和《國際護理學索引》。PubMed收錄了包括MEDLINE、PREMEDLINE、RecordSuppledbyPublisher，以及OLDMEDLINE四部分內(nèi)容。PubMed在MEDLINE數(shù)據(jù)標引前的最新題錄。還收錄了部分生命科學相關(guān)文章的非醫(yī)學專業(yè)期刊（物理、天文、化學等）。PubMed提供電子原文鏈接（部分免費）,更新及時：每周增添新的內(nèi)容。PubMed提供檢索詞自動轉(zhuǎn)換功能：能夠自動實現(xiàn)檢索詞的匹配與轉(zhuǎn)換。7精選課件pptPubMed主頁/pubmed/文獻匹配臨床咨詢特定主題咨詢期刊檢索主題檢索高級檢索檢索提問區(qū)8精選課件pptPubMed檢索機制自動轉(zhuǎn)換匹配功能(AutomaticTermMapping)短語檢索(PhraseSearching)9精選課件ppt對于輸入的檢索詞，PubMed先按一定的詞表順序進行對照匹配和轉(zhuǎn)換，再進行檢索。詞表匹配轉(zhuǎn)換順序是：MeSH表期刊刊名表短語表作者索引如果在以上4個表中都找不到相匹配的詞，PubMed將把短語分開，以單詞為單位，分別重復以上的過程，檢索時各個詞之間是AND邏輯關(guān)系。如果仍找不到相匹配的詞，則用單個詞在所有字段查找，各個詞之間也是AND邏輯關(guān)系。自動轉(zhuǎn)換匹配功能10精選課件ppt邏輯運算符①邏輯“與”運算AND：檢索式寫成AANDB，表示文獻中同時包含檢索詞A和檢索詞B的文獻才是命中文獻。

AIDSANDtherapy②邏輯“或”運算OR：檢索式寫成AORB，表示包含檢索詞A的文獻或者包含檢索詞B的文獻或者同時包含檢索詞A和B的文獻為命中文獻。

AIDSORAcquiredImmunodeficiencySyndrome③邏輯“非”運算NOT：檢索式寫成ANOTB，表示包含檢索詞A同時不包含檢索詞B的文獻為命中文獻。

HepatitisNOTAnimal11精選課件pptPubMed檢索方法基本檢索高級檢索主題檢索限定檢索臨床咨詢12精選課件ppt基本檢索默認檢索字段為主題、作者、期刊13精選課件ppt關(guān)鍵詞、詞(詞組)或短語：⑴輸入任意關(guān)鍵詞：livercancer、Lungcancer；⑵帶有雙引號””作為短語檢索：”cancertherapy”；⑶帶有連接號”-”作為一個詞組檢索：interleukin-6。

(4)一個或多個檢索詞(系統(tǒng)默認空格為AND檢索）

如：placentagrowthoxygengenbacevo限制檢索字段：如livercancer[ti]通配符(?)，如:“en?oblast作者,姓在前,名首字母在后：SmithJ、僅知道作者姓，則必須加上字段標識，如：Smith[au]2002年以后的文獻若文中有作者全稱可用全稱檢索如：JoshuaLederberg基本檢索14精選課件ppt期刊刊名：⑴可用期刊全稱：GENETHERAPY[TA]；

⑵可用期刊簡稱：JAMA[TA]；(TheJournaloftheAmericanMedicalAssociation)截詞檢索：treat*復雜表達式(運算符須大寫）：livercancerANDtherapy帶有摘要文獻的檢索：livercancerANDhasabstract基本檢索15精選課件pptPubMed記錄字段說明文摘第一著者單位地址出版商提供文獻識別號著者群版權(quán)說明參考評論文獻合著者文獻參考評論定稿版校樣版輸入日期輸入完成日期電子出版日期16精選課件ppt電子出版日期文獻出版日期數(shù)據(jù)加入PubMed日期文獻勘誤參考文獻勘誤全部著者姓名全部調(diào)研者姓名作為文章主題的著者全稱文獻相關(guān)注釋基金編號基因符號期編號資助調(diào)研者資助調(diào)研單位國際標準期刊號美國立醫(yī)學圖書館識別號期刊全稱17精選課件ppt最后修訂日期規(guī)范詞表詞規(guī)范詞確立日期系統(tǒng)組織的文摘版權(quán)擁有者題錄提供機構(gòu)的識別號病史相關(guān)與原始記錄其他關(guān)鍵詞提供其他關(guān)鍵詞的機構(gòu)數(shù)據(jù)提供者機構(gòu)文章總頁數(shù)出版商提供數(shù)據(jù)時間期刊出版國數(shù)據(jù)庫文獻編號18精選課件ppt作為主題詞的個人姓名出版狀態(tài)文獻類型出版模式（紙張或電子）參考文獻數(shù)已撤回的文獻酶或化學物質(zhì)代碼正在撤消中的文章初版文獻修訂和再版的文章子專題文檔太空署提供的數(shù)據(jù)二次文獻數(shù)據(jù)庫以及文章討論的分子序列訪問號原文來源引用了病例的文獻內(nèi)部處理代碼19精選課件ppt也可稱為強迫詞組檢索，即，如果要將短語作為一個詞組進行檢索，可用雙引號“”將其引起來。如：“drugtherapy”作為詞組進行檢索的詞，系統(tǒng)不進行自動轉(zhuǎn)換匹配，也不進行MeSH詞的擴檢。短語檢索20精選課件ppt采用字段限制方式進行檢索，其規(guī)則是：檢索詞1[字段標識]邏輯運算符檢索詞2[字段標識]如：查找作者為crick在1993年發(fā)表的有關(guān)DNA方面的文獻檢索式：crick[au]AND1993[dp]ANDDNA字段限制檢索21精選課件ppt分析該檢索課題，包含兩個方面：肝癌：livercancer；治療：therapy兩個主題之間的邏輯關(guān)系是AND，即livercancerANDtherapy

基本檢索舉例：肝癌的治療22精選課件ppt基本檢索舉例：肝癌的治療輸入：livercancerANDtherapy23精選課件ppt“肝癌的治療”的基本檢索結(jié)果24精選課件ppt高級檢索高級檢索25精選課件ppt高級檢索26精選課件ppt分析該檢索課題，包含兩個方面：作者為：馬大龍（madl）；作者單位為：北京大學（pekinguniversity）。

舉例：北京大學醫(yī)學部馬大龍教授發(fā)表的文獻27精選課件ppt舉例：北京大學醫(yī)學部馬大龍教授發(fā)表的文獻輸入：madl輸入：pekinguniversity28精選課件ppt舉例：北京大學醫(yī)學部馬大龍教授發(fā)表的文獻29精選課件ppt主題檢索根據(jù)medline數(shù)據(jù)主題標引的規(guī)范性，利用主題詞進行的研究，對提高查全率、查準率會有相當?shù)膸椭?。點擊MeSHDatabase打開主題檢索界面30精選課件ppt主題檢索31精選課件ppt主題檢索舉例

長春新堿（Vincristine）治療白血病（leukemia）的文獻分析該檢索課題，有兩個概念：長春新堿（Vincristine）、白血?。╨eukemia）：對長春新堿來說是利用其治療疾病，故其應組配副主題詞“治療應用（therapeuticuse）”；對白血病來說是利用藥物來治療，故其應組配副主題詞“藥物療法（drugtherapy）”。同時這兩個概念之間是AND的關(guān)系。32精選課件ppt第1步：檢索長春新堿/治療應用主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻33精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻第1步：檢索長春新堿/治療應用34精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻副主題詞主題詞注釋第1步：檢索長春新堿/治療應用35精選課件ppt選擇加權(quán)檢索或擴展檢索入口詞36精選課件ppt在樹狀結(jié)構(gòu)中的位置主題詞樹形結(jié)構(gòu)表：顯示該詞的學科隸屬關(guān)系37精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻第1步：檢索長春新堿/治療應用38精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻第1步：檢索長春新堿/治療應用39精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻第2步：檢索白血病/藥物療法40精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻第2步：檢索白血病/藥物療法41精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻第2步：檢索白血病/藥物療法42精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻第2步：檢索白血病/藥物療法43精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻第2步：檢索白血病/藥物療法44精選課件ppt我們通過兩個主題檢索分別得到了：“長春新堿/治療應用”的檢索結(jié)果“白血病/藥物療法”的檢索結(jié)果下面我們要把這兩個檢索結(jié)果用AND組合起來，就需要用到檢索史主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血病（leukemia）的文獻45精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻第3步：將兩者組合起來進行邏輯與運算46精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻47精選課件ppt總結(jié)第一步：主題分析英文轉(zhuǎn)換點擊MeSHDatabase進入Mesh界面,依次輸入檢索詞點擊search第二步：選定該主題詞主題詞輪排表點擊該主題詞主題詞細節(jié)屏第三步：主題詞細節(jié)屏（主題詞詞義注釋、副主題詞、加權(quán)或不擴展、入口詞、曾用詞、樹狀結(jié)構(gòu)）選擇合適的副主題詞選擇加權(quán)或不擴展addtosearchbuilder第四步：點擊searchPubMed檢索結(jié)果48精選課件ppt總結(jié)第五步：第二個主題詞步驟同上第二個檢索結(jié)果history

邏輯組配（大寫）（ANDORNOT）最后結(jié)果第六步：選擇限定條件（字段、文獻類型、年齡、時間、語種、人類或動物、性別）檢索結(jié)果49精選課件pptPubmed主題詞檢索的功能理解詞義和收入詞表的時間限定副主題詞，提高查準率。加權(quán)檢索，提高查準率。了解樹形結(jié)構(gòu),擴展檢索，提高查全率了解同義詞，提高查全率。50精選課件ppt主題檢索中醫(yī)藥治療胃癌的文獻第1步：中草藥/全部副主題詞第2步：藥用植物/全部副主題詞第3步：植物提取物/全部副主題詞51精選課件ppt52精選課件ppt第4步：胃腫瘤/全部副主題詞53精選課件ppt第4步：胃腫瘤/全部副主題詞54精選課件ppt第5步：組合檢索歷史55精選課件ppt56精選課件ppt總結(jié)1、中醫(yī)藥治療疾病的主題檢索方法第一步：#1explode疾病/allsubheadings第二步：#2Drugs,ChineseHerbal/allsubheadings第三步：#3explodePlants,Medicinal/allsubheadings第四步：#4explodePlantExtracts/allsubheadings第五步：#1AND(#2OR#3OR#4)57精選課件ppt總結(jié)2、針灸治療疾病的主題詞檢索方法第一步：#1explode疾病/allsubheadings第二步：#2Acupuncture/allsubheadings第三步：#3explodeAcupunctureTherapy/allsubheadings第四步：#4Moxibustion/allsubheadings第五步：#1AND(#2OR#3OR#4)58精選課件ppt限定檢索性別選擇年齡選擇語種選擇文獻類型出版物子集期刊年代選擇59精選課件ppt臨床咨詢和系統(tǒng)評價可以使用戶方便快捷地檢索到有關(guān)臨床方面的文獻，如臨床疾病的診斷、治療、病因和預后等；也可以用它來檢索臨床實踐過程中遇到的一些具體問題，如系統(tǒng)性綜述、元分析、臨床試驗、循證醫(yī)學、實踐指導以及有關(guān)遺傳學方面的問題等。

60精選課件ppt臨床咨詢和系統(tǒng)評價臨床咨詢系統(tǒng)評價檢索醫(yī)學遺傳學研究方面的文獻61精選課件ppt結(jié)果的顯示、打印、保存顯示保存、打印62精選課件ppt結(jié)果顯示顯示格式：系統(tǒng)提供的顯示格式很多，一般較常用的有以下3種：（1）Summary：為默認顯示格式。顯示的信息包括文獻的標題、著者、出處、PMID、綜述出版類型、非英文文獻的原文語種等。（2）Abstract：顯示信息除了文獻標題、著者、出處等基本信息外，還包括摘要信息，以便用戶了解文獻詳細內(nèi)容。63精選課件ppt（3）MEDLINE：以MEDLINE數(shù)據(jù)庫的記錄格式來顯示檢索結(jié)果。字段內(nèi)容主要包括PMID、題目、摘要、作者、作者地址、語種、出版類型、出處、MeSH、文獻ID、出版狀態(tài)等。結(jié)果顯示64精選課件ppt結(jié)果顯示出處SO篇名TI作者AU文獻類型(狀態(tài))Summary65精選課件ppt結(jié)果顯示顯示設置顯示數(shù)量排序模式66精選課件ppt保存記錄在“se