《ubmed使用指南》課件

PubMed使用指南南京中醫(yī)藥大學(xué)文獻(xiàn)檢索教研室郝桂榮1精選課件ppt主要內(nèi)容一、PubMed概況二、PubMed數(shù)據(jù)來源三、PubMed主頁介紹四、PubMed檢索方法五、PubMed的檢索結(jié)果處理2精選課件pptPubMed概況美國國家醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)所屬的國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)開發(fā)的因特網(wǎng)生物醫(yī)學(xué)信息檢索系統(tǒng)。收錄的期刊最早追溯至1865年，收錄共70多個(gè)國家5400多種主要生物醫(yī)學(xué)期刊的書目索引和摘要，每年增加約60余萬條文獻(xiàn)記錄。PubMed的子集Medline收錄的文獻(xiàn)最早追溯至1902年。在全部記錄中有76%的文獻(xiàn)為英文；在2000年以來的記錄中90%的文獻(xiàn)為英文，共計(jì)收錄國內(nèi)出版的期刊170余種。1997年6月開始通過網(wǎng)絡(luò)途徑免費(fèi)向全球開放。3精選課件pptPubMed概況提供期刊全文的出版商網(wǎng)址的鏈接，并提供部分免費(fèi)全文。數(shù)據(jù)類型：期刊論文、綜述、以及與其他數(shù)據(jù)資源鏈接。特點(diǎn)：提供檢索詞自動轉(zhuǎn)換匹配操作簡便、快捷4精選課件pptPubMed數(shù)據(jù)來源MEDLINE5000余種生物醫(yī)學(xué)期刊，內(nèi)容涉及醫(yī)學(xué)、護(hù)理、牙科、獸醫(yī)、健康保健系統(tǒng)、前臨床醫(yī)學(xué)等學(xué)科。這些期刊來源于美國和世界上70多個(gè)國家和地區(qū)。文獻(xiàn)量達(dá)2千多萬條記錄，并回溯到1966年。記錄中用[indexedforMEDLINE]標(biāo)記PREMEDLINE，是一種由正在加工處理之中的文獻(xiàn)記錄組成的數(shù)據(jù)庫，這些記錄還未標(biāo)引主題詞，暫時(shí)放在些數(shù)據(jù)庫中。記錄中用[PubMed-inprocess]標(biāo)記表示。獲MeSH詞后，再加入MEDLINE。5精選課件pptPubMed數(shù)據(jù)來源RecordSuppledbyPublisher出版商直接向PubMed提供電子記錄。包括MEDLINE未收錄的部分記錄。記錄中用[PubMed-assuppliedbypublisher]標(biāo)記表示。另外這些記錄每天都向PREMEDLINE中傳送，則改為[PubMed-inprocess]。OldMedline1948-1965年間發(fā)表的200多萬篇文獻(xiàn)。沒有MeSH字段和摘要。記錄中用[PubMed-OLDMEDLINEforPre1966]標(biāo)記表示。6精選課件pptPubMed與MEDLINE的區(qū)別MEDLINE光盤數(shù)據(jù)庫包括《醫(yī)學(xué)索引》、《牙科文獻(xiàn)索引》和《國際護(hù)理學(xué)索引》。PubMed收錄了包括MEDLINE、PREMEDLINE、RecordSuppledbyPublisher，以及OLDMEDLINE四部分內(nèi)容。PubMed在MEDLINE數(shù)據(jù)標(biāo)引前的最新題錄。還收錄了部分生命科學(xué)相關(guān)文章的非醫(yī)學(xué)專業(yè)期刊（物理、天文、化學(xué)等）。PubMed提供電子原文鏈接（部分免費(fèi)）,更新及時(shí)：每周增添新的內(nèi)容。PubMed提供檢索詞自動轉(zhuǎn)換功能：能夠自動實(shí)現(xiàn)檢索詞的匹配與轉(zhuǎn)換。7精選課件pptPubMed主頁/pubmed/文獻(xiàn)匹配臨床咨詢特定主題咨詢期刊檢索主題檢索高級檢索檢索提問區(qū)8精選課件pptPubMed檢索機(jī)制自動轉(zhuǎn)換匹配功能(AutomaticTermMapping)短語檢索(PhraseSearching)9精選課件ppt對于輸入的檢索詞，PubMed先按一定的詞表順序進(jìn)行對照匹配和轉(zhuǎn)換，再進(jìn)行檢索。詞表匹配轉(zhuǎn)換順序是：MeSH表期刊刊名表短語表作者索引如果在以上4個(gè)表中都找不到相匹配的詞，PubMed將把短語分開，以單詞為單位，分別重復(fù)以上的過程，檢索時(shí)各個(gè)詞之間是AND邏輯關(guān)系。如果仍找不到相匹配的詞，則用單個(gè)詞在所有字段查找，各個(gè)詞之間也是AND邏輯關(guān)系。自動轉(zhuǎn)換匹配功能10精選課件ppt邏輯運(yùn)算符①邏輯“與”運(yùn)算AND：檢索式寫成AANDB，表示文獻(xiàn)中同時(shí)包含檢索詞A和檢索詞B的文獻(xiàn)才是命中文獻(xiàn)。

AIDSANDtherapy②邏輯“或”運(yùn)算OR：檢索式寫成AORB，表示包含檢索詞A的文獻(xiàn)或者包含檢索詞B的文獻(xiàn)或者同時(shí)包含檢索詞A和B的文獻(xiàn)為命中文獻(xiàn)。

AIDSORAcquiredImmunodeficiencySyndrome③邏輯“非”運(yùn)算NOT：檢索式寫成ANOTB，表示包含檢索詞A同時(shí)不包含檢索詞B的文獻(xiàn)為命中文獻(xiàn)。

HepatitisNOTAnimal11精選課件pptPubMed檢索方法基本檢索高級檢索主題檢索限定檢索臨床咨詢12精選課件ppt基本檢索默認(rèn)檢索字段為主題、作者、期刊13精選課件ppt關(guān)鍵詞、詞(詞組)或短語：⑴輸入任意關(guān)鍵詞：livercancer、Lungcancer；⑵帶有雙引號””作為短語檢索：”cancertherapy”；⑶帶有連接號”-”作為一個(gè)詞組檢索：interleukin-6。

(4)一個(gè)或多個(gè)檢索詞(系統(tǒng)默認(rèn)空格為AND檢索）

如：placentagrowthoxygengenbacevo限制檢索字段：如livercancer[ti]通配符(?)，如:“en?oblast作者,姓在前,名首字母在后：SmithJ、僅知道作者姓，則必須加上字段標(biāo)識，如：Smith[au]2002年以后的文獻(xiàn)若文中有作者全稱可用全稱檢索如：JoshuaLederberg基本檢索14精選課件ppt期刊刊名：⑴可用期刊全稱：GENETHERAPY[TA]；

⑵可用期刊簡稱：JAMA[TA]；(TheJournaloftheAmericanMedicalAssociation)截詞檢索：treat*復(fù)雜表達(dá)式(運(yùn)算符須大寫）：livercancerANDtherapy帶有摘要文獻(xiàn)的檢索：livercancerANDhasabstract基本檢索15精選課件pptPubMed記錄字段說明文摘第一著者單位地址出版商提供文獻(xiàn)識別號著者群版權(quán)說明參考評論文獻(xiàn)合著者文獻(xiàn)參考評論定稿版校樣版輸入日期輸入完成日期電子出版日期16精選課件ppt電子出版日期文獻(xiàn)出版日期數(shù)據(jù)加入PubMed日期文獻(xiàn)勘誤參考文獻(xiàn)勘誤全部著者姓名全部調(diào)研者姓名作為文章主題的著者全稱文獻(xiàn)相關(guān)注釋基金編號基因符號期編號資助調(diào)研者資助調(diào)研單位國際標(biāo)準(zhǔn)期刊號美國立醫(yī)學(xué)圖書館識別號期刊全稱17精選課件ppt最后修訂日期規(guī)范詞表詞規(guī)范詞確立日期系統(tǒng)組織的文摘版權(quán)擁有者題錄提供機(jī)構(gòu)的識別號病史相關(guān)與原始記錄其他關(guān)鍵詞提供其他關(guān)鍵詞的機(jī)構(gòu)數(shù)據(jù)提供者機(jī)構(gòu)文章總頁數(shù)出版商提供數(shù)據(jù)時(shí)間期刊出版國數(shù)據(jù)庫文獻(xiàn)編號18精選課件ppt作為主題詞的個(gè)人姓名出版狀態(tài)文獻(xiàn)類型出版模式（紙張或電子）參考文獻(xiàn)數(shù)已撤回的文獻(xiàn)酶或化學(xué)物質(zhì)代碼正在撤消中的文章初版文獻(xiàn)修訂和再版的文章子專題文檔太空署提供的數(shù)據(jù)二次文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫以及文章討論的分子序列訪問號原文來源引用了病例的文獻(xiàn)內(nèi)部處理代碼19精選課件ppt也可稱為強(qiáng)迫詞組檢索，即，如果要將短語作為一個(gè)詞組進(jìn)行檢索，可用雙引號“”將其引起來。如：“drugtherapy”作為詞組進(jìn)行檢索的詞，系統(tǒng)不進(jìn)行自動轉(zhuǎn)換匹配，也不進(jìn)行MeSH詞的擴(kuò)檢。短語檢索20精選課件ppt采用字段限制方式進(jìn)行檢索，其規(guī)則是：檢索詞1[字段標(biāo)識]邏輯運(yùn)算符檢索詞2[字段標(biāo)識]如：查找作者為crick在1993年發(fā)表的有關(guān)DNA方面的文獻(xiàn)檢索式：crick[au]AND1993[dp]ANDDNA字段限制檢索21精選課件ppt分析該檢索課題，包含兩個(gè)方面：肝癌：livercancer；治療：therapy兩個(gè)主題之間的邏輯關(guān)系是AND，即livercancerANDtherapy

基本檢索舉例：肝癌的治療22精選課件ppt基本檢索舉例：肝癌的治療輸入：livercancerANDtherapy23精選課件ppt“肝癌的治療”的基本檢索結(jié)果24精選課件ppt高級檢索高級檢索25精選課件ppt高級檢索26精選課件ppt分析該檢索課題，包含兩個(gè)方面：作者為：馬大龍（madl）；作者單位為：北京大學(xué)（pekinguniversity）。

舉例：北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)27精選課件ppt舉例：北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)輸入：madl輸入：pekinguniversity28精選課件ppt舉例：北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)29精選課件ppt主題檢索根據(jù)medline數(shù)據(jù)主題標(biāo)引的規(guī)范性，利用主題詞進(jìn)行的研究，對提高查全率、查準(zhǔn)率會有相當(dāng)?shù)膸椭｜c(diǎn)擊MeSHDatabase打開主題檢索界面30精選課件ppt主題檢索31精選課件ppt主題檢索舉例

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)分析該檢索課題，有兩個(gè)概念：長春新堿（Vincristine）、白血?。╨eukemia）：對長春新堿來說是利用其治療疾病，故其應(yīng)組配副主題詞“治療應(yīng)用（therapeuticuse）”；對白血病來說是利用藥物來治療，故其應(yīng)組配副主題詞“藥物療法（drugtherapy）”。同時(shí)這兩個(gè)概念之間是AND的關(guān)系。32精選課件ppt第1步：檢索長春新堿/治療應(yīng)用主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn)33精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第1步：檢索長春新堿/治療應(yīng)用34精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)副主題詞主題詞注釋第1步：檢索長春新堿/治療應(yīng)用35精選課件ppt選擇加權(quán)檢索或擴(kuò)展檢索入口詞36精選課件ppt在樹狀結(jié)構(gòu)中的位置主題詞樹形結(jié)構(gòu)表：顯示該詞的學(xué)科隸屬關(guān)系37精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第1步：檢索長春新堿/治療應(yīng)用38精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第1步：檢索長春新堿/治療應(yīng)用39精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第2步：檢索白血病/藥物療法40精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn)第2步：檢索白血病/藥物療法41精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第2步：檢索白血病/藥物療法42精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn)第2步：檢索白血病/藥物療法43精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第2步：檢索白血病/藥物療法44精選課件ppt我們通過兩個(gè)主題檢索分別得到了：“長春新堿/治療應(yīng)用”的檢索結(jié)果“白血病/藥物療法”的檢索結(jié)果下面我們要把這兩個(gè)檢索結(jié)果用AND組合起來，就需要用到檢索史主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn)45精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第3步：將兩者組合起來進(jìn)行邏輯與運(yùn)算46精選課件ppt主題檢索舉例：

長春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)47精選課件ppt總結(jié)第一步：主題分析英文轉(zhuǎn)換點(diǎn)擊MeSHDatabase進(jìn)入Mesh界面,依次輸入檢索詞點(diǎn)擊search第二步：選定該主題詞主題詞輪排表點(diǎn)擊該主題詞主題詞細(xì)節(jié)屏第三步：主題詞細(xì)節(jié)屏（主題詞詞義注釋、副主題詞、加權(quán)或不擴(kuò)展、入口詞、曾用詞、樹狀結(jié)構(gòu)）選擇合適的副主題詞選擇加權(quán)或不擴(kuò)展addtosearchbuilder第四步：點(diǎn)擊searchPubMed檢索結(jié)果48精選課件ppt總結(jié)第五步：第二個(gè)主題詞步驟同上第二個(gè)檢索結(jié)果history

邏輯組配（大寫）（ANDORNOT）最后結(jié)果第六步：選擇限定條件（字段、文獻(xiàn)類型、年齡、時(shí)間、語種、人類或動物、性別）檢索結(jié)果49精選課件pptPubmed主題詞檢索的功能理解詞義和收入詞表的時(shí)間限定副主題詞，提高查準(zhǔn)率。加權(quán)檢索，提高查準(zhǔn)率。了解樹形結(jié)構(gòu),擴(kuò)展檢索，提高查全率了解同義詞，提高查全率。50精選課件ppt主題檢索中醫(yī)藥治療胃癌的文獻(xiàn)第1步：中草藥/全部副主題詞第2步：藥用植物/全部副主題詞第3步：植物提取物/全部副主題詞51精選課件ppt52精選課件ppt第4步：胃腫瘤/全部副主題詞53精選課件ppt第4步：胃腫瘤/全部副主題詞54精選課件ppt第5步：組合檢索歷史55精選課件ppt56精選課件ppt總結(jié)1、中醫(yī)藥治療疾病的主題檢索方法第一步：#1explode疾病/allsubheadings第二步：#2Drugs,ChineseHerbal/allsubheadings第三步：#3explodePlants,Medicinal/allsubheadings第四步：#4explodePlantExtracts/allsubheadings第五步：#1AND(#2OR#3OR#4)57精選課件ppt總結(jié)2、針灸治療疾病的主題詞檢索方法第一步：#1explode疾病/allsubheadings第二步：#2Acupuncture/allsubheadings第三步：#3explodeAcupunctureTherapy/allsubheadings第四步：#4Moxibustion/allsubheadings第五步：#1AND(#2OR#3OR#4)58精選課件ppt限定檢索性別選擇年齡選擇語種選擇文獻(xiàn)類型出版物子集期刊年代選擇59精選課件ppt臨床咨詢和系統(tǒng)評價(jià)可以使用戶方便快捷地檢索到有關(guān)臨床方面的文獻(xiàn)，如臨床疾病的診斷、治療、病因和預(yù)后等；也可以用它來檢索臨床實(shí)踐過程中遇到的一些具體問題，如系統(tǒng)性綜述、元分析、臨床試驗(yàn)、循證醫(yī)學(xué)、實(shí)踐指導(dǎo)以及有關(guān)遺傳學(xué)方面的問題等。

60精選課件ppt臨床咨詢和系統(tǒng)評價(jià)臨床咨詢系統(tǒng)評價(jià)檢索醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)研究方面的文獻(xiàn)61精選課件ppt結(jié)果的顯示、打印、保存顯示保存、打印62精選課件ppt結(jié)果顯示顯示格式：系統(tǒng)提供的顯示格式很多，一般較常用的有以下3種：（1）Summary：為默認(rèn)顯示格式。顯示的信息包括文獻(xiàn)的標(biāo)題、著者、出處、PMID、綜述出版類型、非英文文獻(xiàn)的原文語種等。（2）Abstract：顯示信息除了文獻(xiàn)標(biāo)題、著者、出處等基本信息外，還包括摘要信息，以便用戶了解文獻(xiàn)詳細(xì)內(nèi)容。63精選課件ppt（3）MEDLINE：以MEDLINE數(shù)據(jù)庫的記錄格式來顯示檢索結(jié)果。字段內(nèi)容主要包括PMID、題目、摘要、作者、作者地址、語種、出版類型、出處、MeSH、文獻(xiàn)ID、出版狀態(tài)等。結(jié)果顯示64精選課件ppt結(jié)果顯示出處SO篇名TI作者AU文獻(xiàn)類型(狀態(tài))Summary65精選課件ppt結(jié)果顯示顯示設(shè)置顯示數(shù)量排序模式66精選課件ppt保存記錄在“se