MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控課件

轉(zhuǎn)錄后調(diào)控

——microRNA的研究進(jìn)展分子遺傳毒理實(shí)驗(yàn)室MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控Outlines引言miRNA簡(jiǎn)介miRNA功能miRNA的研究方法miRNAandSNPsMiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控

基因組轉(zhuǎn)錄組蛋白組ThestudyofproteinsexpressedbygenomesCompletionofthesequencingofthe1stdraftofhumangenomeindicatesthereareapproximately250,000proteinsinthehumangenomeOnly2-5%ofproteinsinhumangenomehavebeenidentifiedMiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控轉(zhuǎn)錄

transcriptions

轉(zhuǎn)錄是指DNA指導(dǎo)的RNA合成。反應(yīng)是以DNA為模板，在RNA聚合酶催化下，以四種三磷酸核苷（NTP）即ATP、GTP、CTP及UTP為原料，各種核苷酸之間的3′、5′磷酸二酯鍵相連進(jìn)行的聚合反應(yīng)。合成反應(yīng)的方向?yàn)?′→3′。轉(zhuǎn)錄作用過(guò)程可以分為三個(gè)階段：起始、延長(zhǎng)及終止。MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控轉(zhuǎn)錄后的調(diào)控regulations

—轉(zhuǎn)錄作用產(chǎn)生出的mRNA、tRNA、rRNA及小分子RNA的初級(jí)轉(zhuǎn)錄本全是前體RNA，而不是成熟的RNA，它們沒(méi)有生物學(xué)活性，還要在酶的作用下，進(jìn)行加工才能變?yōu)槌墒斓?，有活性的RNA。

—調(diào)控方式：

1.5′末端帽子的生成

2.3′末端多聚A尾的生成

3.剪接作用

4.RNA編輯

5.甲基化修飾

6.microRNAMiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控 UGA

帽狀結(jié)構(gòu) UAA定位信號(hào)多聚A尾5’m7GpppNmAUGUAGAAUAAApoly(A)3’5’非編碼區(qū)編碼區(qū)3’非編碼區(qū)真核生物mRNA的一般結(jié)構(gòu)structuresMiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控

一些基因組中蛋白編碼部分與非編碼部分的比例

生物基因組長(zhǎng)度蛋白編碼部分非編碼部分基因數(shù)（kbp）（％）（％）

真細(xì)菌

U.urelyticum7518812577E.coli4,63984164,000M.leprae3,26873272,584

古細(xì)菌

P.horikoshii1,73987131,636M.jannaschii1,66583171,599S.solfataricus2,99277232,610

真核生物

E.cuniculi2,90090102,000S.cerevisae12,00071295,651S.pombe12,46357434,824A.thaliana115,410297125,500C.elegans97,000277318,424D.melanogaster180,000138713,600H.sapiens3,000,0002

9824,500MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控CodingRNAmRNA中的編碼區(qū)（ORF)Non-codingRNA(ncRNA)

除ORF以外的所有RNA品種和片段RNA的分類(lèi)MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控

ncRNA的數(shù)量反轉(zhuǎn)座子基因占基因組的45％可變剪接占多外顯子基因的41－60％反向轉(zhuǎn)錄的占基因總數(shù)的10－20％最新估計(jì)的蛋白質(zhì)基因數(shù)為24500個(gè)，占基因組的約1.5%

MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控1998年109次香山會(huì)議中國(guó)科學(xué)家提出了RNA組計(jì)劃M(mǎn)iRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控PNAS,December19,2000vol97no.2614035-14037MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控RNomics的內(nèi)涵研究所有以RNA為終產(chǎn)物基因的時(shí)空表達(dá)譜和其生物學(xué)含義MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控歐美已啟動(dòng)以非編碼RNA為主要目標(biāo)的科學(xué)計(jì)劃

歐盟的“RNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)與健康和疾病”計(jì)劃（RNAinhealthanddisease“Ribonet”)

美國(guó)國(guó)家人類(lèi)基因研究所提出“DNA百科全書(shū)”計(jì)劃

(EncyclopediaofDNAelements)。

中國(guó)的“調(diào)控RNA與人類(lèi)疾病”973計(jì)劃（屈良鵠）

中國(guó)的“表觀遺傳學(xué)”973計(jì)劃（裴鋼）

MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控

(I)

MicroRNA簡(jiǎn)介

(1)長(zhǎng)度為21nt左右核苷酸的內(nèi)源性單鏈小分子RNA；(2)存在65nt左右的發(fā)夾結(jié)構(gòu)前體；(3)基因座位在蛋白質(zhì)基因間隔區(qū)；(4)其DNA序列在近源物種間高度保守。miRNA具有十分重要的調(diào)控功能，它們主要參與基因轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)控。能夠通過(guò)與靶mRNA特異性的堿基配對(duì)引起靶mRNA的降解（植物中較為常見(jiàn)）或者抑制其翻譯（動(dòng)物中較為常見(jiàn)），從而影響了靶mRNA的表達(dá)。目前發(fā)現(xiàn)miRNA是一個(gè)龐大的小分子調(diào)控RNA家族，廣泛存在于各種動(dòng)植物中，參與細(xì)胞增殖和分化、細(xì)胞凋亡、胚胎發(fā)育、形態(tài)建成以及疾病發(fā)生等一系列重要的生命過(guò)程。

最近發(fā)現(xiàn)一系列與腫瘤發(fā)生相關(guān)的和人類(lèi)病毒編碼的miRNA，揭示miRNA在哺乳動(dòng)物基因表達(dá)調(diào)控中具有重要作用。MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控microRNA的發(fā)現(xiàn)與發(fā)展

1993年，Dr.VictorR.Ambros在線蟲(chóng)中發(fā)現(xiàn)了第一個(gè)miRNAlin4，與線蟲(chóng)的發(fā)育相關(guān)。Cell75:843(1993)

2001年，在線蟲(chóng)、果蠅和人cDNA文庫(kù)中鑒定出96種與lin-4和let-7相似的長(zhǎng)度約為21～22nt的非編碼小分子RNA。Science294:853-864(2001)

microRNA首先在線蟲(chóng)中發(fā)現(xiàn)，9年后發(fā)現(xiàn)在多種生物中發(fā)揮基因調(diào)控作用，引起科學(xué)界廣泛關(guān)注。

Nature420:732(2002)

2002年，MicroRNA贏得Science雜志評(píng)選的十大科技突破第一名。

Science298:2296(2002)

至2005年9月，在動(dòng)物、植物、病毒中已鑒定出miRNA共2909個(gè)MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控小鼠

(245)大猩猩

(86)水稻

(173)人細(xì)胞巨化病毒

(9)雞

(122)秀麗線蟲(chóng)

(114)黑腹果蠅

(78)EpsteinBarrvirus

(5)人類(lèi)

(321)家犬

(6)擬南芥

(117)爪蟾

(7)斑馬魚(yú)

(362)哺乳動(dòng)物植物脊椎動(dòng)物病毒部分已發(fā)現(xiàn)的microRNANature431(7006):350-355,2004.MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控計(jì)算機(jī)預(yù)測(cè)各種生物中miRNA基因的數(shù)目計(jì)算機(jī)預(yù)測(cè)各種生物中miRNA靶基因的數(shù)目SomemajorcomputationalapproachesusedtoidentifyanimalmiRNAgenesnameSpeciesNumberofgenesRef.MiRscanC.elegans120GenesDev,2003Human180-255Science,2003MiRseekerDrosophila110GenomeBiol,2003MIRFINDERA.thaliana91-95PNAS,GenomeBiol,2004PhylogeneticshadowingHuman976Cell,2005SummaryofmajorprogramsfortheidentificationofanimalmiRNAtargetsNameSpeciesNumberoftargetRef.TargetScan,TargetScanSVertebrates442Cell,2003PatScanA.thaliana19newMolCell,2004ConservedSeedPairingHuman30%humangenomeCell,2005Motifsin3’UTRHuman5000humangeneNature,2005PicTarVertebrates200/everymiRNANaturegenetics,2005MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控miRNAs的重要特點(diǎn):

時(shí)序特異性與組織特異性斑馬魚(yú)胚胎發(fā)育過(guò)程中90種miRNAs的表達(dá)譜(microarray)。miRNAs在受精后早期一直到卵裂開(kāi)始(12hpf)并不表達(dá)，受精后一天陸續(xù)表達(dá)，直到器官發(fā)生基本完成（96hpf)，大多數(shù)miRNAs的表達(dá)達(dá)到最高峰。Science309(5732):310-311,2005.哺乳動(dòng)物miRNAs的組織特異性Nat.Rev.Genet.5(7):522-31,2004.MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控(II)miRNA的表達(dá)及作用機(jī)制

Lin-4和let-7，由前體加工而來(lái)；成熟分子通過(guò)與各自靶基因lin-14和lin-41mRNA3’UTR不完全反義互補(bǔ),抑制lin-14和lin-41mRNA的翻譯。

2001年，發(fā)現(xiàn)RNAi中siRNA的成熟酶Dicer也是lin-4和let-7形成所必需，提示RNAi和miRNA途徑存在交叉。

2002年，發(fā)現(xiàn)擬南芥的miRNA-39與靶基因mRNAs完全互補(bǔ)，并導(dǎo)致mRNAs在互補(bǔ)區(qū)中間切斷。提示miRNA功能只取決于它與靶mRNA3’UTR之間的互補(bǔ)程度。

2003年，發(fā)現(xiàn)pre-rRNA(核糖體RNA)的形成過(guò)程中的一類(lèi)RNaseIII類(lèi)核酸酶Drosha負(fù)責(zé)pri-miRNAs的加工。

2003年，發(fā)現(xiàn)pre-miRNA的出核運(yùn)輸依賴(lài)于Exportin-5。

2004年，發(fā)現(xiàn)pri-miRNAs末端有poly(A)尾；注入alphaamanitin(蠅蕈素)使人類(lèi)細(xì)胞的pri-miRNAs水平劇減。提示miRNAs基因由RNApolymeraseII轉(zhuǎn)錄。MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控1.miRNA基因在染色體上的分布MolecularCell

16(6),2004

MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控Nat.Rev.Genet.5(7):522-31,2004.2.miRNAs的發(fā)生和作用機(jī)制模型MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控2.miRNAs的發(fā)生和作用機(jī)制模型(1)

核內(nèi)由RNApolymeraseII轉(zhuǎn)錄pri-miRNAs，由Drosha加工為pre-miRNAs；(2)

pre-miRNAs由Exportin-5在Ran-GTP存在下轉(zhuǎn)運(yùn)出核；(3)

細(xì)胞質(zhì)中由Dicer剪切加工,后解鏈成熟為

miRNAs；(4)

miRNAs與多種蛋白結(jié)合，形成RNA介導(dǎo)的沉默復(fù)合體(RISC)，作用于靶基mRNA的3’UTR，如果miRNA與3’UTR存在完全互補(bǔ)，則導(dǎo)致mRNA切斷降解，如果互補(bǔ)程度不高,則引起靶mRNA翻譯抑制。Nat.Rev.Genet.5(7):522-31,2004.MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控Cell118(1),2004

3.RNaseIII的作用特點(diǎn)PLoSBiology3(7),2005MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控○第一種以線蟲(chóng)lin-4為代表，作用時(shí)與靶基因不完全互補(bǔ)結(jié)合，進(jìn)而阻遏翻譯而不影響mRNA的穩(wěn)定性，這種miRNA是目前發(fā)現(xiàn)最多的種類(lèi)。○第二種以擬南芥miR-171為代表，作用時(shí)與靶標(biāo)基因完全互補(bǔ)結(jié)合，作用方式和功能與siRNA非常類(lèi)似，最后切割靶mRNA，這說(shuō)明某些miRNA和siRNA一樣參與了機(jī)體內(nèi)一些特異性mRNA的剪切過(guò)程。○第三種以let-7為代表，它具有以上兩種作用模式，當(dāng)與靶基因完全互補(bǔ)結(jié)合時(shí)，直接靶向切割mRNA，如果蠅和Hela細(xì)胞中l(wèi)et-7直接介導(dǎo)RISC分裂切割靶mRNA；當(dāng)與靶標(biāo)基因不完全互補(bǔ)結(jié)合時(shí)，起調(diào)節(jié)基因表達(dá)的作用，如線蟲(chóng)中的let-7與靶mRNA3′端非翻譯區(qū)不完全配對(duì)結(jié)合后，阻遏調(diào)節(jié)基因的翻譯?！鸬谒姆N作用時(shí)與靶基因3’非翻譯區(qū)結(jié)合，進(jìn)而影響mRNA的穩(wěn)定性。4.miRNA對(duì)靶基因的作用模式MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控(III)miRNA

的功能★

隨著越來(lái)越多miRNA的發(fā)現(xiàn)，除了lin-4和let-7在線蟲(chóng)的發(fā)育過(guò)程中的時(shí)序控制作用外，人們發(fā)現(xiàn)其它生物的多種多樣的生物學(xué)現(xiàn)象和生理過(guò)程與之息息相關(guān)。特別是在胚胎發(fā)育、細(xì)胞分化，以及腫瘤發(fā)生方面尤為突出。MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控Nature426(6968):845-849,2003.Nature430(7001):785-789,2004.1.miRNAs在線蟲(chóng)嗅覺(jué)神經(jīng)細(xì)胞分化過(guò)程中的作用線蟲(chóng)嗅覺(jué)感受器(ASE)功能上都是不對(duì)稱(chēng)的，左側(cè)和右側(cè)分別感受不同的化學(xué)信號(hào)。功能的不對(duì)稱(chēng)是由于gcy-7只在左側(cè)表達(dá)，而gcy-5只在右側(cè)的表達(dá).

(gcy:guanylyl環(huán)化酶受體)gcy不對(duì)稱(chēng)表達(dá)是由mir-273，lsy-6的不對(duì)稱(chēng)表達(dá)決定MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控Cell121(7):1097-1108,2005.反義抑制miR-9細(xì)胞不能分裂,表皮不能形成。反義抑制miR-6的果蠅胚胎大量細(xì)胞凋亡(抗caspase-3的抗體染色)miR-9antisensemiR-9antisenseWTWTMiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控miR-1Hand2proteinHand2mRNAProliferation/growthtimeNature436(7048):214-220,2005.2.miRNAs在小鼠心臟發(fā)育中的作用miR-1在心臟形態(tài)建成中的作用示意圖發(fā)育晚期的小鼠心臟剖面圖示過(guò)表達(dá)miR-1抑制正常的細(xì)胞增殖，使心肌壁薄而松MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控Neuron46(3):363-367,2005.3.1miRNAs在胚胎干細(xì)胞發(fā)育分化中的作用模式圖proliferation

stemcellmaintenancedifferentiationcell-typespecificmiRNA在特異的時(shí)間表達(dá)，通過(guò)關(guān)閉特異蛋白質(zhì)基因的表達(dá)，促進(jìn)胚胎發(fā)育過(guò)程中一些事件的適時(shí)啟動(dòng)或關(guān)閉，保證正常的發(fā)育的進(jìn)行。

MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控3.2miRNA調(diào)控造血干細(xì)胞的分化3種miRNA控制造血干細(xì)胞向淋巴細(xì)胞的分化過(guò)程miR142SmiR223Science303(5654):83-86,2004.MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控Northern雜交確定了miR-375在INS-1細(xì)胞的表達(dá)miR-375在部分糖尿病模型NOD小鼠的異常高表達(dá)（陽(yáng)性率>60%）反義2’-O-甲基化寡核苷酸技術(shù)，特異性抑制miR-375不同濃度葡萄糖刺激經(jīng)2’-O-me-eGFP(375)處理后INS-1細(xì)胞胰島素的分泌立論依據(jù)——實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)Mtpn在INS-1細(xì)胞、正常小鼠和NOD小鼠的差異表達(dá)MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控4.miRNA基因異常與腫瘤發(fā)生相關(guān)人類(lèi)52％的miRNAs定位在染色體的脆性位點(diǎn)(FRAs)61個(gè)miRs和FRAs定位在同一染色體帶(紅色星表示),紅色箭頭表示癌癥病例中觀察到的頻率較高的FRAs.PNAS101(9):2999-3004,2004.人核型圖顯示113個(gè)FRAs和186miRs的位置關(guān)系MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控某些定位在染色體的脆性位點(diǎn)(FRAs)的miRNAs與腫瘤的發(fā)生有關(guān)PNAS101(9):2999-3004,2004.MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控Nature435(7043):834-838,2005.microarray顯示腫瘤和正常組織中129種miRNA的表達(dá)水平

眾多腫瘤miRNA整體表達(dá)水平下降MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控let-7與肺癌的關(guān)系正常肺組織中l(wèi)et-7非常豐富；但肺癌中l(wèi)et-7表達(dá)水平普遍下降人RAS是let-7的靶基因。體外證實(shí)let-7抑制肺癌細(xì)胞系的增殖。肺癌組織中l(wèi)et-7表達(dá)不足，RAS過(guò)度表達(dá)，癌細(xì)胞增殖迅速.Cell120(5):635-647,2005.N.Engl.J.Med.352(23):2446-2448,2005.MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控Nature435(7043):828-833,2005.淋巴癌中miR-17-92簇的表達(dá)水平轉(zhuǎn)miR-17-92簇小鼠迅速誘發(fā)全身癌變，小鼠死亡加快normalmiR-17-92簇可能是一種新的癌基因MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控NatureMed11(7):713-714,2005.a：miRNA過(guò)度表達(dá)，抑制了抑癌基因的正常表達(dá)；b：miRNA表達(dá)過(guò)少或缺失，不能有效抑制癌基因。abmicroRNAs通過(guò)對(duì)抑癌基因和/或癌基因的調(diào)控與腫瘤的發(fā)生相關(guān)

MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控動(dòng)物中miRNA的功能miRNA靶基因功能品種lin-4lin-14線蟲(chóng)幼蟲(chóng)發(fā)育時(shí)間控制線蟲(chóng)

lin-28線蟲(chóng)幼蟲(chóng)發(fā)育時(shí)間控制線蟲(chóng)Let-7lin-41線蟲(chóng)幼蟲(chóng)發(fā)育時(shí)間控制線蟲(chóng)

Lin-57/hbl-1線蟲(chóng)幼蟲(chóng)發(fā)育時(shí)間控制線蟲(chóng)Lsy-6cog-1控制左右神經(jīng)對(duì)稱(chēng)性線蟲(chóng)miR-273die-1控制左右神經(jīng)對(duì)稱(chēng)性線蟲(chóng)Bantamhid通過(guò)刺激細(xì)胞分化和阻止凋亡，調(diào)控果蠅組織生長(zhǎng)果蠅miR-14?影響果蠅脂肪代謝和阻止凋亡果蠅miR-181?控制小鼠造血作用小鼠miR-196aHOXB8剪切靶mRNA小鼠miR-375Mtpn調(diào)控胰島素分泌

人mir-143ERK5脂肪細(xì)胞；

人MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控(IV)miRNA的研究方法●

miRNA的尋找技術(shù)●

miRNA的檢測(cè)技術(shù)●

miRNA功能的研究技術(shù)MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控1.miRNA基因的尋找○克隆構(gòu)建smallRNA庫(kù)，進(jìn)行篩選○

電腦模擬進(jìn)行同源性搜索MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控MicroRNA基因確認(rèn)的基本原則A.能夠通過(guò)與特定大小的總RNA樣品雜交得到～22nt的產(chǎn)物（即需要Northern雜交或引物延伸反應(yīng)驗(yàn)證表達(dá)）

B.所得的序列是從特定大小的（～22nt）的小分子RNA庫(kù)中克隆到的，并且必需與克隆的來(lái)源物種的基因組序列完全匹配C.經(jīng)過(guò)前體的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)，有發(fā)夾狀的二級(jí)結(jié)構(gòu)，并且成熟的miRNA序列在發(fā)夾的一條臂上D.成熟的miRNA序列與預(yù)測(cè)的二級(jí)結(jié)構(gòu)在不同物種間有保守性E.在Dicer突變的系統(tǒng)中，前體的積累增多▲

理想的：A+D+E▲

充分的：A+D▲

必要的：A+CorB+DRNA9:277-279,2003MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控

克隆建庫(kù)尋找新的miRNA基因MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控克隆到的miRNAs經(jīng)過(guò)雜交驗(yàn)證其表達(dá)

MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控Science299，2003

電腦進(jìn)行同源性比對(duì)尋找新的miRNA基因MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控2.miRNA的檢測(cè)技術(shù)○芯片技術(shù)Microarray○

原位雜交○其它方法MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控應(yīng)用芯片技術(shù)高通量的檢測(cè)不同樣品中多種miRNA的表達(dá)量的差異NAR33(2)，2005

MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控NAR33(2)，2005

MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控Science309(5732):310-311,2005.原位雜交技術(shù)可以方便的檢測(cè)miRNA的時(shí)空表達(dá)的差異神經(jīng)系統(tǒng)肝臟肌肉血管和心臟側(cè)線和感官系統(tǒng)前腎MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控3.miRNA的功能的研究方法○高表達(dá)miRNA（轉(zhuǎn)基因）○

在體內(nèi)抑制miRNAs的表達(dá)MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控PLoSBIOLOGY

2(4):E98,2004

通過(guò)對(duì)miRNA的合成及功能行使過(guò)程所必需的蛋白復(fù)合物進(jìn)行抑制從而降低miRNA的表達(dá)在體內(nèi)使miRNA的表達(dá)量下調(diào)2‘-O-甲基修飾的與let7互補(bǔ)的寡核苷酸的導(dǎo)入可以使let7喪失功能，是由于這種帶修飾的寡核苷酸的結(jié)合封閉了RISK復(fù)合體MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控Nature423,2003針對(duì)miRNA的前體的發(fā)夾結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)siRNA降低miRNA的表達(dá)量MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控Curr.Opin.Chem.Biol.7(4):516-523,2003.

1.染色體重塑

2.DNA甲基化

3.轉(zhuǎn)錄

4.RNA加工

5.RNA穩(wěn)定性

6.RNA轉(zhuǎn)運(yùn)

7.RNA定位

8.翻譯

9.蛋白質(zhì)活性10.miRNA穩(wěn)定性miRNAs可能參與各種基因表達(dá)過(guò)程的調(diào)控MiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控(V)miRNAandSNPsMiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控FunctionalanalysisofSNPsPromoterIntronExon2Exon15’UTR3’UTRFunctionsofdifferentelementsabove:Promoter:Transcription5’UTR:TranscriptionandtranslationCodingregion:Functionandactivityofenzymes;TranslationefficiencyIntron:Alternativesplicing3’UTR:mRNAStability,mRNAlocationandtranslationMiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控AssociationstudyofMDM2234bladdercancercases,253controls.5outof18tagSNPsarepositive(P<0.05).OnefascinatingpositiveSNPinthe3’UTR460T>C(P=0.01).mRNA:5’UTRCodingregion3’UTRMiRNA與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控microRNAtargetpredict