湖北海棠遺傳多樣性的SSR分析的開題報(bào)告

湖北海棠遺傳多樣性的SSR分析的開題報(bào)告摘要：海棠（RosachinensisJacq.）是一種廣泛種植和廣泛應(yīng)用于園林景觀和食用的植物。本研究旨在通過SSR（簡單序列重復(fù)）分子標(biāo)記方法探究湖北海棠群體的遺傳多樣性。我們將收集湖北地區(qū)的19個海棠樣品，使用5對SSR引物對其進(jìn)行擴(kuò)增PCR反應(yīng)，將擴(kuò)增產(chǎn)物分離、純化，并進(jìn)行聚丙烯酰胺凝膠電泳分離，然后通過相對電泳遷移距離計(jì)算其Alleles頻率和遺傳距離，最后采用聚類分析和主成分分析方法對其進(jìn)行遺傳多樣性分析。通過本研究，我們期望可以對湖北地區(qū)海棠遺傳多樣性、基因定位和遺傳改良提供數(shù)據(jù)支持，同時為湖北海棠種植和保護(hù)提供科學(xué)依據(jù)。關(guān)鍵詞：海棠，遺傳多樣性，SSR分子標(biāo)記，聚類分析，主成分分析一、研究背景與意義海棠（RosachinensisJacq.）是薔薇科落葉灌木，樹高可達(dá)2-3米。具有栽培易性強(qiáng)、觀賞性好、花色豐富的特點(diǎn)，并且果實(shí)可作為保健食品或藥材使用。湖北是海棠的主要產(chǎn)區(qū)之一，也是海棠的原產(chǎn)地之一，但是近年來，由于環(huán)境污染、病蟲害、過度開采等原因，海棠的生長環(huán)境和種質(zhì)資源受到了較大的威脅。因此，對湖北地區(qū)海棠的遺傳多樣性進(jìn)行研究和保護(hù)具有重要意義。SSR分子標(biāo)記技術(shù)是目前應(yīng)用最廣泛的分子標(biāo)記方法之一，由于其具有高多態(tài)性、遺傳穩(wěn)定性和復(fù)制性等優(yōu)點(diǎn)，被廣泛應(yīng)用于植物遺傳多樣性分析、基因定位和遺傳改良等領(lǐng)域。本研究旨在通過SSR分子標(biāo)記方法探究湖北海棠群體的遺傳多樣性、基因變異和遺傳演化情況，為湖北海棠種植和保護(hù)提供數(shù)據(jù)支持，同時為海棠的遺傳改良和繁殖提供科學(xué)依據(jù)。二、研究內(nèi)容和方法（一）研究內(nèi)容：1.采集湖北地區(qū)海棠樣品，構(gòu)建海棠SSR擴(kuò)增反應(yīng)系統(tǒng)，進(jìn)行PCR擴(kuò)增，利用聚丙烯酰胺凝膠電泳方法分離PCR產(chǎn)物。2.使用相對電泳遷移距離計(jì)算海棠樣品的Alleles頻率和遺傳距離。3.采用聚類分析和主成分分析方法對海棠樣品進(jìn)行群體遺傳多樣性分析。（二）研究方法：1.購買海棠樣品并進(jìn)行標(biāo)本鑒定。2.DNA提取和PCR擴(kuò)增：采用CTAB法提取海棠DNA，并根據(jù)已有的SSR分子標(biāo)記文獻(xiàn)，選擇5對適合海棠的引物對其進(jìn)行擴(kuò)增PCR反應(yīng)。3.擴(kuò)增產(chǎn)物的分離和純化：采用聚丙烯酰胺凝膠電泳方法分離PCR產(chǎn)物，并通過瓊脂糖凝膠純化方法提取PCR產(chǎn)物。4.相對電泳遷移距離計(jì)算：使用相對電泳遷移距離計(jì)算海棠樣品的Alleles頻率和遺傳距離。5.遺傳多樣性分析：使用聚類分析和主成分分析方法對海棠樣品進(jìn)行群體遺傳多樣性分析。三、預(yù)期結(jié)果通過對湖北地區(qū)海棠群體的SSR分子標(biāo)記分析，我們可以得出該群體的遺傳多樣性、基因變異和遺傳演化情況，為湖北海棠種植和保護(hù)提供科學(xué)依據(jù)，也為海棠的遺傳改良和繁殖提供數(shù)據(jù)支持。四、研究時間和經(jīng)費(fèi)計(jì)劃本研究預(yù)計(jì)于2022年開始進(jìn)行，歷時12個月。其中，第1-3月用于樣品采集和樣品DNA提取和PCR擴(kuò)增；第4-9月用于擴(kuò)增產(chǎn)物的分離、純化和相對電泳遷移距離計(jì)算；第10-12月