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關(guān)于酵母表達(dá)系統(tǒng)三酵母表達(dá)系統(tǒng)甲醇酵母表達(dá)系統(tǒng)釀酒酵母表達(dá)系統(tǒng)其它酵母表達(dá)系統(tǒng)第2頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天(一)釀酒酵母表達(dá)系統(tǒng)釀酒酵母分泌系統(tǒng)釀酒酵母系統(tǒng)啟動(dòng)子釀酒酵母表達(dá)系統(tǒng)存在的問(wèn)題釀酒酵母糖基化系統(tǒng)第3頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天1、釀酒酵母啟動(dòng)子UASURSTATA起始位點(diǎn)編碼序列mRNA40-120bp20-40bp100-1400bp1、轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn);4、URS:上游阻遏序列2、TATA盒:富含AT;5、DAS:下游激活序列3、UAS:上游激活序列;DAS第4頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天1)糖酵解途徑中關(guān)鍵酶的強(qiáng)啟動(dòng)子,受葡萄糖誘導(dǎo):甘油醛-3-磷酸脫氫酶基因GAPDH磷酸甘油激酶基因PKG乙醇脫氫酶基因ADH釀酒酵母表達(dá)系統(tǒng)常用啟動(dòng)子第5頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天2)半乳糖激酶啟動(dòng)子(GAL1)GAL1GAL7GAL10UASGAL4GAL80A、GAL1、GAL7和
GAL10基因連鎖在一起,獨(dú)立轉(zhuǎn)錄,共同調(diào)控B、GAL4產(chǎn)物與UAS結(jié)合,促進(jìn)轉(zhuǎn)錄;GAL80產(chǎn)物抑制GAL4產(chǎn)物的活性,阻遏轉(zhuǎn)錄C、野生型GAL4表達(dá)水平低,產(chǎn)物活性可被GLAL80產(chǎn)物完全抑制,半乳糖誘導(dǎo)效果差半乳糖誘導(dǎo)、葡萄糖抑制第6頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天2)半乳糖激酶啟動(dòng)子(GAL1)GAL1GAL7GAL10UASGAL4GAL80A、將GAL4的啟動(dòng)子換成GAL10的誘導(dǎo)型強(qiáng)啟動(dòng)子B、半乳糖誘導(dǎo)GAL4高表達(dá),不受GAL80產(chǎn)物抑制,激活GAL1等高效轉(zhuǎn)錄半乳糖誘導(dǎo)、葡萄糖抑制PromoterGAL10第7頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天3)pho4TS-PHO5啟動(dòng)子A、PHO5啟動(dòng)子在培養(yǎng)基缺磷酸鹽時(shí)啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄B、PHO4基因編碼產(chǎn)物是PHO5啟動(dòng)子的正調(diào)控因子C、pho4TS溫度敏感,35℃時(shí)失活,PHO5關(guān)閉D、pho4TS-PHO5啟動(dòng)子通過(guò)降溫(23℃)誘導(dǎo)表達(dá)低溫誘導(dǎo)、磷酸鹽抑制第8頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天釀酒酵母系統(tǒng)常用分泌信號(hào)肽來(lái)源:
性結(jié)合因子:MF-α
酸性磷酸酯酶:PHO5
蔗糖酶:SUC2
殺手毒素因子:KIL2、釀酒酵母分泌系統(tǒng)第9頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天*保守性低,大多異源宿主系統(tǒng)的信號(hào)肽不能互用*信號(hào)肽結(jié)構(gòu):
釀酒酵母信號(hào)肽特點(diǎn)正電荷區(qū)疏水區(qū)極性區(qū)Met目的蛋白信號(hào)肽剪切位點(diǎn)第10頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天*分泌效率高*在酵母系統(tǒng)具有通用性*88個(gè)殘基組成
MF-α信號(hào)肽Met目的蛋白-Lys-Arg-Glu-Ala-Glu-Ala-KEX2DAPDAPDAP:STE13編碼的二肽酶第11頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天糖基化位點(diǎn):Asn-X-Thr/Ser(X代表任何氨基酸)N-型糖基化:天門冬酰氨酸殘基上的酰胺氮進(jìn)行糖基化,對(duì)蛋白質(zhì)的折疊、穩(wěn)定性及活性較重要。O-型糖基化:蘇氨酸/絲氨酸上的羥基氧進(jìn)行糖基化
3、釀酒酵母糖基化系統(tǒng)第12頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天*過(guò)糖基化(超糖基化修飾):
N型或O型糖基的外鏈進(jìn)一步形成龐大的、由甘露糖組成的、復(fù)雜分支結(jié)構(gòu)的現(xiàn)象。增加了免疫原性、對(duì)活性與藥代穩(wěn)定性均有影響。*糖鏈組成O型糖鏈僅由甘露糖組成、而哺乳細(xì)胞的還含唾液酸基團(tuán)釀酒酵母糖基化特點(diǎn)第13頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天1)表達(dá)水平普遍不高
A、表達(dá)載體傳代不穩(wěn)定(YEp、YRp)
B、所采用的強(qiáng)啟動(dòng)子調(diào)控不嚴(yán)謹(jǐn)
C、不能利用簡(jiǎn)單的無(wú)機(jī)培養(yǎng)基進(jìn)行高密度發(fā)酵2)分泌表達(dá)產(chǎn)物過(guò)糖基化4、釀酒酵母表達(dá)系統(tǒng)的缺陷第14頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天(二)甲醇酵母表達(dá)系統(tǒng)甲醇酵母與甲醇氧化酶啟動(dòng)子甲醇酵母表達(dá)系統(tǒng)的應(yīng)用甲醇酵母表達(dá)系統(tǒng)操作原理甲醇酵母系統(tǒng)高效表達(dá)影響因素與對(duì)策甲醇酵母表達(dá)系統(tǒng)的優(yōu)缺點(diǎn)第15頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天1、甲醇酵母與甲醇氧化酶啟動(dòng)子甲醇酵母(methylotrophicyeast)
指可利用甲醇作單一碳源的一類酵母。
畢赤酵母(Pichiapastoris)
漢森酵母(Hansenulaploymorpha)
假絲酵母(Candiaboidinii)
第16頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天1、甲醇酵母與甲醇氧化酶啟動(dòng)子甲醇氧化酶A、甲醇代謝關(guān)鍵酶,占可溶蛋白的30%以上
B、名稱和拷貝數(shù)不同畢赤酵母/假絲酵母漢森酵母
醇氧化酶甲醇氧化酶alcoholoxidase,AOXmethanoloxidase,MOXAOX1、AOX2MOX第17頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天1、甲醇酵母與甲醇氧化酶啟動(dòng)子AOX1與AOX2*畢赤酵母和假絲酵母基因組存在二個(gè)AOX基因AOX1、AOX2*AOX1與AOX2基因97%同源*AOX1占主導(dǎo)地位,負(fù)責(zé)AOX99%以上活性第18頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天1、甲醇酵母與甲醇氧化酶啟動(dòng)子甲醇氧化酶啟動(dòng)子A、目前已發(fā)現(xiàn)的、最強(qiáng)的真核啟動(dòng)子B、嚴(yán)謹(jǐn)調(diào)控型啟動(dòng)子AOX1:葡萄糖和甘油脫阻遏、甲醇誘導(dǎo)MOX:葡萄糖阻遏、甘油脫阻遏、甲醇誘導(dǎo)
第19頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天2、甲醇酵母表達(dá)系統(tǒng)的優(yōu)缺點(diǎn)A、表達(dá)水平高(最高水平的系統(tǒng))B、產(chǎn)物可翻譯后修飾:糖基化、磷酸化、酰脂化C、過(guò)糖基化程度比釀酒酵母少(8-15個(gè)vs100-150個(gè)甘露糖)D、產(chǎn)物可正確折疊和高效分泌(最高分泌表達(dá)系統(tǒng))E、可利用簡(jiǎn)單無(wú)機(jī)鹽培養(yǎng)基高密度發(fā)酵,生物量大。F、實(shí)驗(yàn)室和工業(yè)操作簡(jiǎn)單G、不能滿足結(jié)構(gòu)要求嚴(yán)格的糖基化
第20頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天3、甲醇酵母表達(dá)系統(tǒng)操作原理宿主株與標(biāo)記基因甲醇酵母系統(tǒng)的整合事件胞內(nèi)表達(dá)與分泌表達(dá)第21頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天甲醇酵母系統(tǒng)宿主二大宿主系統(tǒng)主要特點(diǎn)項(xiàng)目畢赤酵母漢森酵母最適溫度30℃37℃最適pH值4.54.5甘油阻遏是否糖基化部分過(guò)度較正常高密度發(fā)酵100g/L100g/L第22頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天甲醇酵母系統(tǒng)宿主二大宿主系統(tǒng)主要選擇標(biāo)記宿主
選擇標(biāo)記畢赤酵母
his4、G418、Zeocin、Cu++漢森酵母leu2、his3、ura3、G418第23頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天甲醇酵母系統(tǒng)宿主畢赤酵母系統(tǒng)主要宿主株宿主株
特點(diǎn)Y11430野生型、Mut+GS115his4-、Mut+KM71his4-、aox1::ARG4(AOX1-)、Muts
SMD1168his4-
、胞外蛋白酶缺陷,高分泌MC1003his4-、AOX1-、AOX2-,甲醇不生長(zhǎng)第24頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天甲醇酵母系統(tǒng)的整合事件YRp型載體:漢森系統(tǒng)傳代不穩(wěn)定,傳代過(guò)程同源或非同源重組,高選擇壓力迫使高拷貝數(shù)整合,可達(dá)100拷貝。YIp型載體:A、在靶序列處線性化載體DNA,誘導(dǎo)同源重組B、有“插入”和“取代”二類整合模式C、主要為單拷貝整合,1-10%為多拷貝整合
第25頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天畢赤酵母系統(tǒng)模式表達(dá)載體第26頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天1)AOX1位點(diǎn)插入宿主株:GS115、KM71可插入位點(diǎn):5’AOX13’AOX1TT轉(zhuǎn)化子:GS115:His+Mut+KM71:His+Muts第27頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天2)His4位點(diǎn)插入轉(zhuǎn)化子:GS115:His+Mut+KM71:His+Muts宿主株:GS115、KM71可插入位點(diǎn):5’His43’His4第28頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天3)多基因插入事件(串聯(lián)整合)宿主株:GS115、KM71可插入位點(diǎn):5’AOX13’AOX1TT轉(zhuǎn)化子:GS115:His+Mut+KM71:His+Muts第29頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天4)基因取代(GS115,AOX1+)轉(zhuǎn)化子:His4+Muts第30頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天漢森酵母系統(tǒng)的高拷貝整合型表達(dá)載體高拷貝整合元件:A、高度重復(fù)序列:rDNA
提供多個(gè)整合位點(diǎn)B、缺陷型標(biāo)記基因:Leu2d
提高選擇壓力C、抗性標(biāo)記;neo
提高選擇壓力
第31頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天甲醇酵母系統(tǒng)胞內(nèi)表達(dá)載體表達(dá)載體類型需要帶入ATG單位點(diǎn)第32頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天甲醇酵母系統(tǒng)胞內(nèi)表達(dá)載體表達(dá)載體類型需要帶入ATG多位點(diǎn)第33頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天甲醇酵母系統(tǒng)分泌表達(dá)載體信號(hào)肽:PHO1第34頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天甲醇酵母系統(tǒng)分泌表達(dá)載體信號(hào)肽:MFα第35頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天甲醇酵母系統(tǒng)分泌表達(dá)載體信號(hào)肽:MFα標(biāo)記:Kan第36頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天4、甲醇酵母系統(tǒng)高效表達(dá)影響因素與對(duì)策載體穩(wěn)定性基因劑量整合位點(diǎn)甲醇利用表型mRNA5’端AT含量分泌信號(hào)表達(dá)產(chǎn)物穩(wěn)定性第37頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天1)載體穩(wěn)定性同拷貝數(shù)時(shí),整合型的比自主復(fù)制型的表達(dá)水平高YRp型載體的穩(wěn)定化:
選擇—非選擇培養(yǎng)交替數(shù)十代可得穩(wěn)定的整合子,但費(fèi)時(shí),整合位點(diǎn)不確定。采用YIp型載體:
更易實(shí)現(xiàn)整合、整合位點(diǎn)清楚第38頁(yè),共43頁(yè),2024年2月25日,星期天
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