原核生物RNA的轉(zhuǎn)錄1課件

●基本概念；●原核生物轉(zhuǎn)錄起始、RNA聚合酶、啟動(dòng)子；轉(zhuǎn)錄的基本過(guò)程；●真核生物轉(zhuǎn)錄起始、RNA聚合酶、啟動(dòng)子；轉(zhuǎn)錄的基本過(guò)程；●真核生物轉(zhuǎn)錄后的加工；●原核生物與真核生物mRNA的特征比較；●RNA合成與DNA合成異同點(diǎn)；1.●基本概念；●原核生物轉(zhuǎn)錄起始、RNA聚合酶、啟動(dòng)子；轉(zhuǎn)第一節(jié)若干基本概念2.第一節(jié)若干基本概念2.

●基因表達(dá)的第一步；●以D.S.DNA中的一條單鏈作為轉(zhuǎn)錄的模板；●在依賴(lài)DNA的RNA聚合酶的作用下進(jìn)行的；●模板單鏈DNA的極性方向?yàn)?’→5’,而非模板單鏈DNA的極性方向與RNA鏈相同，均為5’→3’；(書(shū)寫(xiě)基因序列時(shí)，僅寫(xiě)非模板序列，可不注明極性方向)DNA3’---TACTCAT----5’RNA5’----AUGAGUA----3’5’---ATGAGTA----3’Non-template(sensestrand)template(antisensestrand)

●按A

U，CG配對(duì)的原則，合成RNA分子；3.●基因表達(dá)的第一步；●以D.S.D●RNA的轉(zhuǎn)錄包括promotion,elongation,termination三過(guò)程

●從啟動(dòng)子（promoter）到終止子（terminator）稱(chēng)為

轉(zhuǎn)錄單位

（transcriptionalunit）

●轉(zhuǎn)錄原點(diǎn)記為+1，其上游記為負(fù)值，下游記為正值

●原核生物中的轉(zhuǎn)錄單位多為polycistroninoperon

真核生物中的轉(zhuǎn)錄單位多為monocistron,Nooperon+1-10+10upstreamstartpointdownstream

位于起始位點(diǎn)之前的序列稱(chēng)為轉(zhuǎn)錄單位的上游(Upstream)，起始位點(diǎn)之后(在轉(zhuǎn)錄序列之內(nèi))的序列被稱(chēng)為下游(Downstream)。4.●RNA的轉(zhuǎn)錄包括promotion,elongat轉(zhuǎn)錄的不對(duì)稱(chēng)性：

在RNA的合成中，DNA的二條鏈中僅有一條鏈可作為轉(zhuǎn)錄的模板，稱(chēng)為轉(zhuǎn)錄的不對(duì)稱(chēng)性。編碼鏈與模板鏈與mRNA序列相同的那條DNA鏈稱(chēng)為編碼鏈；將另一條根據(jù)堿基互補(bǔ)原則指導(dǎo)mRNA合成的DNA鏈稱(chēng)為模板鏈。5.轉(zhuǎn)錄的不對(duì)稱(chēng)性：在RNA的合成中，DNA的二條鏈中僅有一模板鏈并非永遠(yuǎn)在同一條單鏈上轉(zhuǎn)錄方向5

3

3

5

模板鏈編碼鏈編碼鏈模板鏈轉(zhuǎn)錄方向6.模板鏈并非永遠(yuǎn)在同一條單鏈上轉(zhuǎn)錄方向53模板鏈編碼鏈編碼第二節(jié)原核生物的轉(zhuǎn)錄一、原核生物轉(zhuǎn)錄的分子基礎(chǔ)；二、轉(zhuǎn)錄的起始，延伸；三、轉(zhuǎn)錄的終止；四、轉(zhuǎn)錄的抗終止。7.第二節(jié)原核生物的轉(zhuǎn)錄一、原核生物轉(zhuǎn)錄的分子基礎(chǔ)；二、轉(zhuǎn)錄一、原核生物轉(zhuǎn)錄的分子基礎(chǔ)：（一）、RNA聚合酶：1、E.coli的聚合酶負(fù)責(zé)所有mRNA、rRNA和tRNA的合成。一個(gè)E.coli細(xì)胞中約有7000個(gè)RNA聚合酶分子。任意時(shí)刻大概有2000~5000RNA聚合酶在合成RNA；2、E.coli的全酶是一個(gè)質(zhì)量約465kD的分子，由兩個(gè)α、β、β’、ω亞基及一個(gè)σ因子所組成。其中，α、β、β’、ω亞基構(gòu)成了核心酶，加上σ因子之后便構(gòu)成了全酶。即：全酶=核心酶+σ因子8.一、原核生物轉(zhuǎn)錄的分子基礎(chǔ)：（一）、RNA聚合酶：1、E.9.9.（1）α亞基的功能：當(dāng)噬菌體T4感染E.coli時(shí)，宿主α亞基被糖基化修飾。修飾導(dǎo)致了原來(lái)被全酶所識(shí)別的啟動(dòng)子親和力下降，這就提示：3、各亞基的功能：α亞基在啟動(dòng)子識(shí)別中起作用。10.（1）α亞基的功能：3、各亞基的功能：α亞基在啟動(dòng)子識(shí)別中α亞基的作用：位于前端的α因子使雙鏈解鏈為單鏈；

位于尾端的α因子使單鏈新聚合為雙鏈。核心酶的組建順序：因子α+α→2α+β→+β’11.α亞基的作用：位于前端的α因子使雙鏈解鏈為單鏈；（2）δ亞基：★重復(fù)使用(Reusable)★使Holo-enzyme識(shí)別啟動(dòng)子,并與模板鏈結(jié)合

★修飾RNApol構(gòu)型，降低全酶與DNA的非特異性結(jié)合力增強(qiáng)全酶與啟動(dòng)子位點(diǎn)的特異性結(jié)合力RNA鏈合成達(dá)8~9個(gè)堿基時(shí)，σ因子釋放，離開(kāi)核心酶，由核心酶負(fù)責(zé)延伸。σ因子能夠保證細(xì)菌RNA聚合酶穩(wěn)定地結(jié)合到某個(gè)特異的、唯一的DNA啟動(dòng)子上。12.（2）δ亞基：★重復(fù)使用(Reusable)★使Ho例如：正常情況下負(fù)責(zé)大多數(shù)基因轉(zhuǎn)錄的是σ70

。但σ32和σE在環(huán)境變化（熱激）時(shí)被表達(dá)。σ28用于正常生長(zhǎng)時(shí)鞭毛基因的表達(dá)。在大腸桿菌中，存在多種σ因子。不同的σ因子可以識(shí)別不同的啟動(dòng)子序列，從而可以啟動(dòng)不同基因的表達(dá)；13.例如：正常情況下負(fù)責(zé)大多數(shù)基因轉(zhuǎn)錄的是σ70。在大腸桿

大腸桿菌的熱激應(yīng)答基因的表達(dá)的調(diào)控是通過(guò)σ32實(shí)現(xiàn)的。溫度升高時(shí)σ32數(shù)量增加，而溫度恢復(fù),σ32活性降低來(lái)完成誘導(dǎo)。σ32合成的基本信號(hào)是溫度增加導(dǎo)致未折疊蛋白質(zhì)(部分變性蛋白質(zhì))在細(xì)胞內(nèi)累積。

另一組熱調(diào)控基因的表達(dá)是由σE

因子控制，它負(fù)責(zé)對(duì)比σ32更劇烈的溫度變化應(yīng)答。它是由熱變性蛋白質(zhì)的積聚所誘導(dǎo)的。

大腸桿菌細(xì)胞含有少量σ54

，當(dāng)培養(yǎng)基中缺乏氮時(shí)被激活。在這些情況下，基因被開(kāi)啟以便利用可替代氮源。14.大腸桿菌的熱激應(yīng)答基因的表達(dá)的調(diào)控是通過(guò)σ32實(shí)現(xiàn)的。溫度β因子：★促進(jìn)RNApol+NTP→RNAelongation；★完成NTP之間的磷酸脂鍵的連接；★與Rho(ρ)因子競(jìng)爭(zhēng)RNA3’-end。15.β因子：★促進(jìn)RNApol+NTP→Rβ’

因子；★強(qiáng)堿性亞基★促使RNA聚合酶與

有義鏈（sensestrand）的結(jié)合

16.β’因子；★強(qiáng)堿性亞基★促使RNA聚合酶與16總結(jié)：HoloEnzyme含有的功能位點(diǎn)

★sensestrandDNAbindingpoint(β’)★DNA/RNAhybridsite(β)★D.S.DNAunwindingpoint(α)★D.S.DNArewindingpoint(α)17.總結(jié)：HoloEnzyme含有的功能位點(diǎn)★s原核生物RNApol(Core)的結(jié)構(gòu)與功能EnzymeMovementDNAcodingstrand(β’)Rewindingpoint(α)Unwindingpoint(α)RNAbindingsiteRNA/DNAhybrid(β)DNAtemplatestrand10-17bp

18.原核生物RNApol(Core)的結(jié)構(gòu)與功能Enzyme總結(jié)：大腸桿菌RNA聚合酶的組成分析亞基基因相對(duì)分子量亞基數(shù)組分功能αrpoA365002核心酶核心酶組裝，啟動(dòng)子識(shí)別。解螺旋及重新螺旋βrpoB1510001核心酶β和β'共同形成RNA合成的活性中心β'rpoC1550001核心酶ω？110001核心酶？σrpoD700001σ因子存在多種σ因子，用于識(shí)別不同的啟動(dòng)子19.總結(jié)：大腸桿菌RNA聚合酶的組成分析亞基基因相對(duì)分子量亞基數(shù)RNA聚合酶與DNA聚合酶的區(qū)別RNA聚合酶DNA聚合酶大小(M)大，4.8×105dol小，1.09×105dol引物無(wú)有產(chǎn)物較短，游離較長(zhǎng)，與模板以氫鍵相連作用方式一條鏈的某一段兩條鏈同時(shí)進(jìn)行外切酶活性無(wú)5’3’，3’5’校對(duì)合成能力無(wú)有修復(fù)能力無(wú)有20.RNA聚合酶與DNA聚合酶的區(qū)別RNA聚合酶DNA聚合酶大?。ǘ?、啟動(dòng)子1、啟動(dòng)子的發(fā)現(xiàn)方法：PromoterregionidentifiedbyDNAasemethod

RNApolymerase(noNTP)DNAsequencing

DNase

digestionDNA+dissolve21.（二）、啟動(dòng)子1、啟動(dòng)子的發(fā)現(xiàn)方法：Promoterreg大腸桿菌RNA聚合酶全酶所識(shí)別的啟動(dòng)子區(qū)22.大腸桿菌RNA聚合酶全酶所識(shí)別的啟動(dòng)子區(qū)22.

通過(guò)比較不同基因的啟動(dòng)子序列，發(fā)現(xiàn)細(xì)菌具有四個(gè)保守位點(diǎn)：起始位點(diǎn)、-10區(qū)、-35區(qū)以及-10和-35區(qū)之間間隔距離。2、原核生物啟動(dòng)子的特點(diǎn)：（1）、起始位點(diǎn)通常(>90%)都是嘌呤堿基。該堿基左右兩側(cè)的堿基通常是C（左側(cè)），T（右側(cè)），即：組成CAT序列。啟動(dòng)子定義：指能被RNA聚合酶全酶識(shí)別、結(jié)合并啟動(dòng)基因轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。23.通過(guò)比較不同基因的啟動(dòng)子序列，發(fā)現(xiàn)細(xì)菌具有四個(gè)保守位點(diǎn)：（2）、在起始位點(diǎn)上游，在幾乎所有的啟動(dòng)子中都可以發(fā)現(xiàn)一個(gè)6bp的區(qū)域。六聚物的中心通常靠近起始點(diǎn)上游的10bp。該區(qū)稱(chēng)為－10區(qū)。它的同源序列為T(mén)ATAAT。

可被總結(jié)為如下形式：T(80)A(95)T(45)A(60)A(50)T(96)，其中，數(shù)字表示堿基出現(xiàn)最大頻率的百分?jǐn)?shù)。該區(qū)又稱(chēng)為PribnowBox。

-10序列中開(kāi)始的高度保守的TA和最后一個(gè)幾乎完全保守的T是最重要的堿基。24.（2）、在起始位點(diǎn)上游，在幾乎所有的啟動(dòng)子中都可以發(fā)現(xiàn)一個(gè)6（3）、TTGACA區(qū)：大腸桿菌啟動(dòng)子中另外一個(gè)保守區(qū)是以起始位點(diǎn)上游-35bp為中心的，稱(chēng)-35區(qū)。其共有序列為T(mén)TGACA，各堿基出現(xiàn)的頻率為：T(82)T(84)G(78)A(65)C(54)A(45)。其中括號(hào)數(shù)字表示該堿基出現(xiàn)的頻率。該區(qū)又稱(chēng)為SextamaBox

。25.（3）、TTGACA區(qū)：大腸桿菌啟動(dòng)子中另外一個(gè)保守區(qū)是以起（4）、在90%啟動(dòng)子中，-35和-10區(qū)之間的分隔距離在16到18bp之間，其中最適距離為17bp，這個(gè)距離對(duì)于啟動(dòng)子啟動(dòng)基因表達(dá)效率是最佳的。個(gè)別例外的可以小于15或者大于20bp。盡管間隔區(qū)的真實(shí)序列并不重要，但間隔距離大小可以保持兩個(gè)區(qū)恰當(dāng)?shù)木嚯x，從而使兩個(gè)區(qū)適合于RNA聚合酶的幾何結(jié)構(gòu)，所以可以增加啟動(dòng)子的啟動(dòng)效率。26.（4）、在90%啟動(dòng)子中，-35和-10區(qū)之間的分隔距離原核生物啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu)：27.原核生物啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu)：27.典型啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu)-35-10轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)TTGACA16-19bpTATAAT5-9bp28.典型啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu)28.3、SextamaBox與PribnowBox的功能：（2）、-10區(qū)序列的突變不影響轉(zhuǎn)錄閉合復(fù)合體的形成，但是其向轉(zhuǎn)錄開(kāi)放復(fù)合體的轉(zhuǎn)變變慢。（1）、兩個(gè)區(qū)功能的研究方法：利用堿基突變來(lái)驗(yàn)證序列功能。該結(jié)果表明，-10區(qū)序列組成了啟動(dòng)子的“解旋域”(Unwindingdomain)。29.3、SextamaBox與PribnowBox的功能：（3）、-35區(qū)序列的突變使轉(zhuǎn)錄閉合復(fù)合體的形成速度減慢，但并不抑制其轉(zhuǎn)變?yōu)檗D(zhuǎn)錄開(kāi)放復(fù)合體。因此-35區(qū)序列的功能是為RNA聚合酶的識(shí)別提供信號(hào)，因此，可以將-35區(qū)序列看作是“識(shí)別域”(Recognitiondomain)。30.（3）、-35區(qū)序列的突變使轉(zhuǎn)錄閉合復(fù)合體的形成速度減（4）、

SextamaBox與PribnowBox間距17bp,有利于RNApol啟動(dòng)17bp的間距較17bp的序列特異性對(duì)轉(zhuǎn)錄更為重要（5）、SextamaBoxorPribnowBoxmut.→

轉(zhuǎn)錄率下降100XSextamaBoxandPribnowBoxmut.→

轉(zhuǎn)錄率下降1000X31.（4）、

SextamaBox與PribnowBox4、Promoter與δfactor間的作用●二者結(jié)合的專(zhuān)效性決定了某個(gè)啟動(dòng)子是strongpromoter還是weakpromoter32.4、Promoter與δfactor間的作用●二者結(jié)合★與標(biāo)準(zhǔn)啟動(dòng)子序列同源性愈高

→啟動(dòng)強(qiáng)度愈大

與標(biāo)準(zhǔn)啟動(dòng)子序列同源性愈低→啟動(dòng)強(qiáng)度愈小

若與標(biāo)準(zhǔn)啟動(dòng)子序列差異很大→則由另一種δ因子啟動(dòng)E.coli;4δfactor→recognition4promotersBacillus;10δfactor→recognition10promoters33.★與標(biāo)準(zhǔn)啟動(dòng)子序列同源性愈高→啟動(dòng)強(qiáng)度愈大與標(biāo)二、原核生物基因轉(zhuǎn)錄的起始過(guò)程：1、全酶結(jié)合到啟動(dòng)子序列上，形成一個(gè)閉合(Closed)的二元復(fù)合物而開(kāi)始反應(yīng)；2、與酶結(jié)合的一小段DNA序列的“溶解”導(dǎo)致了閉合復(fù)合體轉(zhuǎn)變?yōu)殚_(kāi)放(Open)復(fù)合體。對(duì)于強(qiáng)啟動(dòng)子來(lái)說(shuō)，閉合復(fù)合體向開(kāi)放二元復(fù)合物的轉(zhuǎn)變是不可逆轉(zhuǎn)的。（一）、轉(zhuǎn)錄的起始：34.二、原核生物基因轉(zhuǎn)錄的起始過(guò)程：1、全酶結(jié)合到啟動(dòng)子序列上，3、第三步是最開(kāi)始的兩個(gè)核苷酸之間的連接。在它們之間會(huì)形成一個(gè)磷酸二酯鍵，這樣，所產(chǎn)生的三元復(fù)合物(Ternarycomplex)就包括RNA、DNA、聚合酶。4、當(dāng)起始過(guò)程完成后，聚合酶釋放出σ因子而轉(zhuǎn)變?yōu)楹诵拿?，后者和DNA、新生RNA組成延伸三元復(fù)合物。

接下來(lái)加入的前九個(gè)核苷酸，聚合酶是一直不移動(dòng)的，產(chǎn)生一條短RNA鏈，直到九個(gè)堿基為止。九個(gè)堿基中的任何一個(gè)加入后，聚合酶都有釋放RNA的可能性，導(dǎo)致流產(chǎn)起始(Abortiveinitiation)。但流產(chǎn)起始之后聚合酶又開(kāi)始合成第一個(gè)堿基。流產(chǎn)起始常常產(chǎn)生一系列短的寡聚核苷酸(2~9個(gè)堿基)。35.3、第三步是最開(kāi)始的兩個(gè)核苷酸之間的連接。在它們之間會(huì)形成一總結(jié)：轉(zhuǎn)錄的起始轉(zhuǎn)錄延伸之前，RNA聚合酶要經(jīng)過(guò)數(shù)個(gè)步驟。閉合二元復(fù)合物轉(zhuǎn)化為開(kāi)放二元復(fù)合物，開(kāi)放二元復(fù)合物再轉(zhuǎn)化為三元復(fù)合物。36.總結(jié)：轉(zhuǎn)錄的起始轉(zhuǎn)錄延伸之前，RNA聚合酶要經(jīng)過(guò)數(shù)個(gè)步驟。閉（二）、起始過(guò)程中的RNA聚合酶的形態(tài)變化：1、當(dāng)RNA聚合酶全酶最初結(jié)合到DNA上時(shí)，它覆蓋了從-55到+20大約75～80bp的長(zhǎng)度。37.（二）、起始過(guò)程中的RNA聚合酶的形態(tài)變化：1、當(dāng)RNA聚合2、伴隨σ因子的失去，聚合酶與-55到-35

的結(jié)合也失去，僅剩下約60bp的DNA被聚合酶所覆蓋。

這說(shuō)明：?jiǎn)?dòng)子的上游部分僅參與RNA聚合酶的起始識(shí)別，起始以后便不再起作用。38.2、伴隨σ因子的失去，聚合酶與-55到-35的結(jié)合也失去，3、當(dāng)RNA鏈延伸到15～20

個(gè)堿基時(shí)，酶會(huì)發(fā)生進(jìn)一步的形態(tài)變化，轉(zhuǎn)變成負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄延伸的復(fù)合體，僅覆蓋30～40bp長(zhǎng)度。39.3、當(dāng)RNA鏈延伸到15～20個(gè)堿基時(shí)，酶會(huì)發(fā)生進(jìn)一步的RNA聚合酶首先與-55到+20之間的區(qū)域接觸，當(dāng)σ因子解離下來(lái)后，核心酶與-30左右的序列結(jié)合。接著核心酶向前移動(dòng)，結(jié)構(gòu)逐漸致密并最終形成延伸復(fù)合物?？偨Y(jié)：轉(zhuǎn)錄起始過(guò)程中復(fù)合物的變化象蠕蟲(chóng)一樣移動(dòng)40.RNA聚合酶首先與-55到+20之間的區(qū)域接觸，當(dāng)σ因子解三、轉(zhuǎn)錄的延伸：σ因子釋放后，進(jìn)入鏈的延長(zhǎng)階段1、RNA合成在一個(gè)“轉(zhuǎn)錄泡(Bubble)”中進(jìn)行，在轉(zhuǎn)錄泡中，DNA被瞬間分離成單鏈，其中一條被作為RNA合成的模板。當(dāng)RNA聚合酶沿DNA移動(dòng)時(shí)，空泡也隨之移動(dòng)。41.三、轉(zhuǎn)錄的延伸：1、RNA合成在一個(gè)“轉(zhuǎn)錄泡(BubblRNA鏈的延伸3′5′RNA-DNA雜交螺旋聚合酶的移動(dòng)方向新生RNA復(fù)鏈解鏈有義鏈模板鏈（反義鏈）延長(zhǎng)部位DNA42.RNA鏈的延伸3′5′RNA-DNA雜交螺旋聚合酶的RNA鏈的合成方向5′→3′

各種結(jié)果表明，RNA-DNA雜交區(qū)的長(zhǎng)度在3~9

個(gè)堿基對(duì)之間。43.RNA鏈的合成方向5′→3′各種結(jié)果表明，RNA-DNA所有核苷酸的合成都是從游離核苷酸的5￠-三磷酸基團(tuán)與RNA鏈末端的3￠-OH之間的縮合反應(yīng)。新加入核苷酸失去末端的兩個(gè)磷酸基(γ和β)；其α磷酸基與RNA鏈形成磷酸二酯鍵。這個(gè)反應(yīng)發(fā)生在催化位點(diǎn)。2、磷酸二酯鍵的形成：44.所有核苷酸的合成都是從游離核苷酸的5￠-三磷酸基團(tuán)與RNA鏈37℃時(shí)反應(yīng)速度約為每秒40個(gè)核苷酸(細(xì)菌RNA聚合酶)；這與翻譯的速度(每秒15個(gè)氨基酸)大致相同，RNA聚合酶控制著下一個(gè)核苷酸的加入。該酶可能僅當(dāng)一個(gè)核苷酸與模板形成氫鍵互補(bǔ)配對(duì)時(shí)才允許磷酸二酯鍵的形成。如果該核苷酸與模板不匹配，則將其去除，接著另一個(gè)核苷酸加入。3、延伸的速度：4、核苷酸加入的控制：45.37℃時(shí)反應(yīng)速度約為每秒40個(gè)核苷酸(細(xì)菌RNA聚合酶四、細(xì)菌RNA轉(zhuǎn)錄的終止：1、一旦RNA聚合酶開(kāi)始轉(zhuǎn)錄，酶就沿模板向前移動(dòng)合成RNA，直到遇到一個(gè)終止子(Terminator)，聚合酶停止向正在生長(zhǎng)的RNA鏈添加核苷酸，釋放合成的RNA產(chǎn)物，從DNA模板上解離。

終止子：是RNA聚合酶停止RNA轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。終止過(guò)程需要所有維持RNA-DNA雜交的氫鍵斷裂，然后DNA重新形成雙螺旋。46.四、細(xì)菌RNA轉(zhuǎn)錄的終止：1、一旦RNA聚合酶開(kāi)始轉(zhuǎn)錄，2、根據(jù)體外實(shí)驗(yàn)中RNA聚合酶是否需要輔助蛋白質(zhì)參與終止，可將E.coli中的終止子分為兩種類(lèi)型：

在體外，沒(méi)有任何其它因子參與，核心酶也能在某些位點(diǎn)終止轉(zhuǎn)錄，這些位點(diǎn)被稱(chēng)為“內(nèi)源性終止子(Intrinsicterminator)”?！唉岩蜃右蕾?lài)型終止子”：體外需要ρ因子的輔助；突變實(shí)驗(yàn)顯示體內(nèi)該因子參與了終止過(guò)程。47.2、根據(jù)體外實(shí)驗(yàn)中RNA聚合酶是否需要輔助蛋白質(zhì)參與終止，（1）、內(nèi)源性終止子：A、終止子的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)：內(nèi)源性終止子有兩個(gè)明顯的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)：一個(gè)二級(jí)結(jié)構(gòu)中的發(fā)夾結(jié)構(gòu)和轉(zhuǎn)錄單位最末端的連續(xù)約6個(gè)U殘基的區(qū)段。這兩個(gè)特點(diǎn)都是終止所必需的。發(fā)夾的基底部通常包含一個(gè)富含G:C區(qū)。發(fā)夾和U區(qū)段的典型距離為7~9個(gè)堿基。有時(shí)U區(qū)段可以插有其它堿基。48.（1）、內(nèi)源性終止子：內(nèi)源性終止子有兩個(gè)明顯的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)：終止子內(nèi)部包含能夠形成7-20bp長(zhǎng)度發(fā)夾結(jié)構(gòu)區(qū)。莖環(huán)結(jié)構(gòu)有富含尿嘧啶核苷酸的G-C區(qū)。內(nèi)源性終止子的結(jié)構(gòu)49.終止子內(nèi)部包含能夠形成7-20bp長(zhǎng)度發(fā)夾結(jié)構(gòu)區(qū)。莖環(huán)結(jié)構(gòu)有B、內(nèi)源性終止子終止的機(jī)理：

RNA聚合酶遇到發(fā)夾結(jié)構(gòu)時(shí)，RNA轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物合成速度會(huì)減慢(或者是暫停)；

正確位置的一段U殘基是RNA聚合酶遇到發(fā)夾而暫停時(shí)從模板解離下來(lái)所必需的。

rU:dA(RNA-DNA雜交)是一個(gè)不常見(jiàn)的弱堿基配對(duì)結(jié)構(gòu)，對(duì)它的破壞所需能量最少。當(dāng)聚合酶暫停時(shí)，RNA-DNA雜交鏈從終止區(qū)的弱鍵rU:dA處解開(kāi)。50.B、內(nèi)源性終止子終止的機(jī)理：RNA聚合酶遇到發(fā)夾結(jié)構(gòu)時(shí)，R

ρ-依賴(lài)型終止作用所需的序列長(zhǎng)50~90個(gè)堿基，該區(qū)域的共同特征是RNA富含C殘基而G殘基很少?？梢栽谛潞铣傻腞NA中形成松散的發(fā)卡結(jié)構(gòu)。一個(gè)ρ-依賴(lài)型終止子的終止效率隨“富C/少G”區(qū)域的長(zhǎng)度而增加。A、終止子序列特征：（2）、ρ-依賴(lài)型終止子：51.ρ-依賴(lài)型終止作用所需的序列長(zhǎng)50~90