黑龍江部分地區(qū)野鳥(niǎo)新城疫病毒分子流行病學(xué)調(diào)查及代表株全基因組序列分析的開(kāi)題報(bào)告

黑龍江部分地區(qū)野鳥(niǎo)新城疫病毒分子流行病學(xué)調(diào)查及代表株全基因組序列分析的開(kāi)題報(bào)告【選題背景】鳥(niǎo)類(lèi)病毒性疾病是鳥(niǎo)類(lèi)養(yǎng)殖業(yè)的重要制約因素之一，也是鳥(niǎo)類(lèi)野生種群健康的威脅。其中，新城疫病毒(NewcastleDiseaseVirus，NDV)是一種重要的禽類(lèi)病毒性疾病。NDV屬于基因單一、膜蛋白糖基化、帶有檸檬酸和硫辛酸去羧酶的RNA病毒，屬小亞目輪狀病毒科，與流感病毒類(lèi)型A相似。經(jīng)常感染鳥(niǎo)類(lèi)，導(dǎo)致高發(fā)，高病死率和重大經(jīng)濟(jì)損失。我國(guó)北方地區(qū)農(nóng)業(yè)以畜牧業(yè)為主，其中養(yǎng)殖業(yè)是當(dāng)?shù)仫暳瞎I(yè)的關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)因素。但是，由于自然條件和人類(lèi)活動(dòng)的影響，NDV感染的范圍和數(shù)量也在不斷增加。因此，從流行病學(xué)角度研究NDV在當(dāng)?shù)胤N群中的分布情況及其對(duì)當(dāng)?shù)亟?jīng)濟(jì)的影響至關(guān)重要?！具x題意義】近年來(lái)，NDV在我國(guó)黑龍江部分地區(qū)的野鳥(niǎo)中的感染率和病死率明顯上升，給當(dāng)?shù)伉B(niǎo)類(lèi)養(yǎng)殖業(yè)和野生鳥(niǎo)類(lèi)種群帶來(lái)了嚴(yán)重的威脅。然而，目前關(guān)于NDV在黑龍江野鳥(niǎo)中的流行情況及其相關(guān)流行病學(xué)機(jī)制的研究相對(duì)較少。因此，本研究旨在通過(guò)代表株全基因組序列肽鏈分析和野鳥(niǎo)新城疫病毒分子流行病學(xué)調(diào)查結(jié)合，全面了解NDV在當(dāng)?shù)匾傍B(niǎo)種群中的分布情況、感染機(jī)制及其對(duì)當(dāng)?shù)亟?jīng)濟(jì)的影響，為黑龍江地區(qū)野鳥(niǎo)NDV疫情的預(yù)防和控制提供科學(xué)依據(jù)。【預(yù)期目標(biāo)】1.采集黑龍江部分地區(qū)野鳥(niǎo)樣本，對(duì)NDV感染情況進(jìn)行流行病學(xué)調(diào)查，包括對(duì)NDV分布、感染率、病死率等因素的分析和控制措施的建議；2.對(duì)NDV分離株進(jìn)行全基因組分析和比對(duì)，分析毒株取源于野鳥(niǎo)種群還是人工飼養(yǎng)禽類(lèi)；3.比較分析不同年份和地區(qū)NDV株間的遺傳差異，探討其可能的毒性和毒力變異因素；4.研究NDV的受體、宿主與感染機(jī)制，為NDV快速檢測(cè)、防治提供科學(xué)依據(jù)?！狙芯糠椒ā?.樣品采集我們將對(duì)黑龍江部分地區(qū)野鳥(niǎo)樣本進(jìn)行采集，其中包括新城疫病毒感染的和未感染的鳥(niǎo)類(lèi)樣本，共計(jì)約100份。所有樣本將通過(guò)鷲鷹或其它抓鳥(niǎo)器抓捕，標(biāo)本標(biāo)準(zhǔn)化后送至實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行處理和分析。2.流行病學(xué)調(diào)查通過(guò)對(duì)野生鳥(niǎo)類(lèi)中NDV的感染率、傳播途徑、病死率等指標(biāo)進(jìn)行分析，探討NDV在當(dāng)?shù)匾吧B(niǎo)類(lèi)中的流行情況、種群分布和傳播特征。3.代表株全基因組測(cè)序?qū)⒏腥綨DV的野鳥(niǎo)樣本陳列稀釋?zhuān)⑼ㄟ^(guò)RT-PCR方法分離出NDV分離株。分離出的RNA樣本將通過(guò)外部引物PCR擴(kuò)增，然后采用IlluminaMiseq高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)其全基因組進(jìn)行測(cè)序和分析。4.生物信息學(xué)和分子進(jìn)化分析通過(guò)對(duì)NDV全基因組的序列比對(duì)、序列同源性分析和生物信息學(xué)預(yù)測(cè)等技術(shù)，深入研究NDV在黑龍江野鳥(niǎo)中的流行病學(xué)機(jī)制和遺傳變異情況，為掌握控制策略提供科學(xué)依據(jù)?！狙芯款A(yù)算】本研究的預(yù)算將包括實(shí)驗(yàn)材料費(fèi)用、實(shí)驗(yàn)室設(shè)備折舊費(fèi)用、研究人員工資和差旅費(fèi)用。預(yù)計(jì)總費(fèi)用為40萬(wàn)元，其中實(shí)驗(yàn)材料費(fèi)用占70%、實(shí)驗(yàn)室設(shè)備折舊費(fèi)用占20%、研究人員工資和差旅費(fèi)用占10%?！狙芯繒r(shí)間計(jì)劃】本研究預(yù)計(jì)在三年內(nèi)完成，具體的時(shí)間安排如下：第一年：研究計(jì)劃制定、采樣和全基因組測(cè)序，以及全基因組序列分析和提交。第二年：分子進(jìn)化分析、生物信息學(xué)分析和實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)和分析。第三年：論文撰寫(xiě)、研究成果匯報(bào)和宣傳推廣。【研究團(tuán)隊(duì)】本研究團(tuán)隊(duì)由黑龍江省畜牧水產(chǎn)科學(xué)研究所和東北農(nóng)