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文檔簡(jiǎn)介
ICS07.080
A21
中華人民共和國(guó)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)
GB/TXXXXX—201X
微生物誘變育種致遺傳物質(zhì)損傷強(qiáng)度檢測(cè)
FACS-umu測(cè)試法
QuantificationofmicrobialDNAdamagecausedbymutagenesis
FACS-umu-test
(征求意見稿)
201X-XX-XX發(fā)布201X-XX-XX實(shí)施
國(guó)家市場(chǎng)監(jiān)督管理總局
發(fā)布
中國(guó)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)化管理委員會(huì)
1
GB/T××××—201×
GB/T××××—201×
微生物誘變育種致遺傳物質(zhì)損傷強(qiáng)度測(cè)定umu法
1范圍
本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了微生物誘變育種致遺傳物質(zhì)損傷強(qiáng)度測(cè)定umu法的原理、試劑或材料、儀器設(shè)備、
測(cè)定步驟和結(jié)果分析。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于物理誘變?cè)春突瘜W(xué)誘變?cè)丛斐傻奈⑸镞z傳物質(zhì)損傷測(cè)定。
2規(guī)范性引用文件
GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法
YY/T0588流式細(xì)胞儀
3術(shù)語(yǔ)與定義
下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本文件。
3.1
誘變mutagenesis
通過(guò)人為的措施誘導(dǎo)遺傳基因產(chǎn)生變異的過(guò)程。
注:常用的誘變方法包括物理誘變和化學(xué)誘變等。
3.2
遺傳物質(zhì)損傷DNAdamage
化學(xué)或物理誘變?cè)磳?duì)遺傳物質(zhì)分子結(jié)構(gòu)的改變。
3.2
遺傳物質(zhì)損傷強(qiáng)度DNAdamagestrength
當(dāng)細(xì)胞受到DNA損傷時(shí)會(huì)發(fā)生應(yīng)急修復(fù)(SOS修復(fù)),使其以突變?yōu)榇鷥r(jià)繼續(xù)存活下去。
4原理
在DNA發(fā)生損傷時(shí),細(xì)菌通過(guò)lexA和recA的共同作用,引起體內(nèi)的SOS響應(yīng)。DNA損傷程度
越高,SOS響應(yīng)越強(qiáng)。通過(guò)將SOS系統(tǒng)調(diào)控基因與指示基因相融合,檢測(cè)指示基因編碼蛋白活性或信
號(hào)強(qiáng)度,即可得到SOS基因的表達(dá)強(qiáng)度,表征DNA損傷強(qiáng)度和環(huán)境致癌物質(zhì)濃度。在umu測(cè)試中,
將編碼DNA聚合酶V中重要組分的umuC基因與編碼β-半乳糖苷酶的lacZ基因融合,導(dǎo)入到Salmonella
typhimurium中,通過(guò)顯色法檢測(cè)β-半乳糖苷酶活性來(lái)測(cè)定SOS誘導(dǎo)強(qiáng)度。然而,由于誘變過(guò)程會(huì)造成
細(xì)胞的死亡,死細(xì)胞會(huì)對(duì)測(cè)試誘變損傷能力的評(píng)估造成影響。為排除這一影響,F(xiàn)ACS-umu測(cè)試方法利
用流式細(xì)胞分選技術(shù)測(cè)定活細(xì)胞遺傳物質(zhì)損傷強(qiáng)度,其測(cè)試原理為:熒光素-2-β-D-半乳糖苷(FDG)
本身不具有熒光,其被β-半乳糖苷酶水解后的產(chǎn)物熒光素具有熒光。碘化丙啶(Propidiumiodide,PI)
1
GB/T××××—201×
是一種DNA熒光染料,只能進(jìn)入失去細(xì)胞膜選擇通透性的細(xì)胞,即死細(xì)胞中,因此可以用于區(qū)分活死
細(xì)胞。采用FDG作為β-半乳糖苷酶的熒光底物,利用PI作為死細(xì)胞染料,通過(guò)采用流式細(xì)胞儀測(cè)定誘
變后活細(xì)胞的β-半乳糖苷酶活性,從而得到活細(xì)胞的DNA損傷強(qiáng)度。
5試劑或材料
除非另有規(guī)定,僅使用分析純?cè)噭?/p>
5.1水:GB/T6682二級(jí)。
5.2菌種:鼠傷寒沙門氏菌(Salmonellatyphimurium),包含表達(dá)umuC’-’lacZ基因和氨芐青霉素
抗性基因的pSK1002質(zhì)粒。
5.3TGA培養(yǎng)基
稱取胰蛋白胨10g,氯化鈉5g,HEPES11.9g,加入980ml水溶解,pH調(diào)整為7.0±0.2,定溶
到1000ml。121℃,15min高壓滅菌。溶解2g葡萄糖在20ml去離子水中單獨(dú)滅菌。滅菌后按等比例混合
兩個(gè)溶液,無(wú)菌條件下每升冷卻的TGA培養(yǎng)基中加入50mg氨芐青霉素。改溶液可以在-20℃保存4周。
5.410×TGA培養(yǎng)基
包含10倍濃度的TGA溶液,可以在4℃保存14天。
5.5熒光素-2-β-D-吡喃半乳糖苷(Fluoresceindi-β-D-galactopyranoside,F(xiàn)DG)溶液
在10ml含體積比為1%DMSO和1%乙醇的水中溶解13.13mgFDG,F(xiàn)DG終濃度為2mM,分裝后保存在-20℃
冰箱中。使用前在37℃預(yù)熱15min以上。
5.6碘化丙啶(Propidiumiodide,PI)溶液
在10mlPBS溶液中溶解6.68mgPI,配成濃度為1mM的PI溶液。用移液槍吸取10ul濃度為1mM的PI
儲(chǔ)備液,溶于10mlPBS溶液中,配成濃度1uM的PI溶液,作為PI工作液。于4℃保存,使用前在冰上放
置預(yù)冷。
6儀器設(shè)備
6.1恒溫水浴鍋(37±1)℃;
6.2pH計(jì);0.1;
6.3電子天平;0.01;
6.4高速離心機(jī);
6.5流式細(xì)胞儀;
6.6恒溫震蕩搖床,溫度可實(shí)現(xiàn)(28±1)℃和(37±1)℃,轉(zhuǎn)速在125r/min到150r/min;
7測(cè)定步驟
7.1測(cè)試菌過(guò)夜培養(yǎng)物制備
2
GB/T××××—201×
在三角瓶中裝入20mlTGA培養(yǎng)基用透氣無(wú)菌瓶塞封口,滅菌儲(chǔ)存;融化凍存的測(cè)試菌,在凍存管
中加入1mlTGA培養(yǎng)基,3000g離心凍存管中的測(cè)試菌10min,丟棄上清液,用1mLTGA培養(yǎng)基重懸測(cè)
試菌,用0.5ml測(cè)試菌重懸液接種到含TGA培養(yǎng)基的三角瓶中,在(37±1)℃搖動(dòng)培養(yǎng)過(guò)夜(不超過(guò)12
h)。
7.2誘變測(cè)試微生物樣品制備
用新鮮的TGA培養(yǎng)基(37℃)將過(guò)夜培養(yǎng)的測(cè)試菌稀釋10倍。繼續(xù)在37±1)℃搖動(dòng)培養(yǎng)1.5天。在
(600±20)nm用1cm比色皿檢測(cè)光密度,以TGA培養(yǎng)基作為空白對(duì)照,誘變測(cè)試微生物樣品應(yīng)處于對(duì)數(shù)
生長(zhǎng)期。
7.3誘變
7.3.1化學(xué)誘變
根據(jù)測(cè)試需求,宜通過(guò)文獻(xiàn)等資料或設(shè)置預(yù)實(shí)驗(yàn),確定化學(xué)誘變劑的種類和濃度。
將10ul不同濃度的化學(xué)誘變劑加入到1ml誘變樣品(9.2)中,置于1.5ml的EP管,在37±1℃,200
r/min震蕩培養(yǎng)箱中培養(yǎng)2h。對(duì)照為在1mlTGA培養(yǎng)基中加入10ulDMSO。
7.3.2物理誘變
根據(jù)測(cè)試需求,宜通過(guò)文獻(xiàn)等資料或設(shè)置預(yù)實(shí)驗(yàn),確定物理誘變條件。
取100ul接種物(9.2)進(jìn)行物理誘變處理,對(duì)照為沒(méi)有進(jìn)行物理誘變處理的樣品。處理后的樣品
和對(duì)照轉(zhuǎn)移到1.5mlEP管中,在37±1℃,200r/min震蕩培養(yǎng)箱中培養(yǎng)2h。
7.4FDG和PI染色
取化學(xué)或物理誘變后的測(cè)試樣品50l置于1.5ml的EP管中,在37℃預(yù)熱5min,加入37℃預(yù)熱的
FDG溶液50ul,迅速溫和混勻后,置于37℃水浴中2min,使FDG滲透進(jìn)入細(xì)胞。之后迅速加入500l
的PI溶液,將混合液放置于冰上反應(yīng)1h,在進(jìn)行流式細(xì)胞測(cè)定前一直置于冰上。
7.5流式細(xì)胞儀測(cè)定
使用流式細(xì)胞儀對(duì)染色后樣品進(jìn)行流式分析。采用激發(fā)波長(zhǎng)為488nm,對(duì)于FDG水解產(chǎn)物熒光素的
熒光強(qiáng)度測(cè)定接收波長(zhǎng)為525±30nm(FL-1通道),PI染色熒光測(cè)定接收波長(zhǎng)為670nm(FL-2通道)。
測(cè)定細(xì)胞總數(shù)為5000到10000個(gè)細(xì)胞。
8結(jié)果分析
8.1閾值設(shè)定
通過(guò)前向角散射光FSC和側(cè)向角散射光SSC圈出目標(biāo)菌體,以去除多細(xì)胞粘連對(duì)結(jié)果的影響。通過(guò)
單獨(dú)的PI染色,測(cè)定FL-1通道和FL-2通道的熒光值,其FL-1通道熒光值作為背景值,即為FDG染色陰性
細(xì)胞。通過(guò)單獨(dú)的FDG染色,測(cè)定FL-1通道和FL-2通道的熒光值,其FL-2通道熒光值作為背景值,即為
3
GB/T××××—201×
PI染色陰性細(xì)胞。對(duì)于FDG和PI同時(shí)染色的樣品,選取FDG染色和PI染色陽(yáng)性為目標(biāo)細(xì)胞群,用于后續(xù)
數(shù)據(jù)處理。
8.2結(jié)果計(jì)算
按照式(1)進(jìn)行計(jì)算:
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