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文檔簡介

ICS11.220

B41DB32

江蘇省地方標準

DB32/T3683—2019

豬鏈球菌9型PCR檢測技術規(guī)程

TechnicalregulationforPCRdetectingStreptococcussuisSerotype9

2019-12-03發(fā)布2019-12-25實施

江蘇省市場監(jiān)督管理局發(fā)布

DB32/T3683—2019

豬鏈球菌9型PCR檢測技術規(guī)程

1范圍

本標準規(guī)定了豬鏈球菌9型PCR檢測技術所用的儀器設備和主要試劑、引物、方法步驟、結果判定、

廢棄物處理和防止污染的措施等要求。

本標準適用于豬鏈球菌9型的PCR檢測。

2規(guī)范性引用文件

下列文件對于本文件的應用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅注日期的版本適用于本文件。

凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。

GB/T6682分析實驗室用水規(guī)格和試驗方法

NY/T541獸醫(yī)診斷樣品采集、保存與運輸技術規(guī)范

《病死及病害動物無害化處理技術規(guī)范》(農醫(yī)發(fā)〔2017〕25號)

3術語和定義

下列術語和定義適用于本文件。

3.1

豬鏈球菌9型Streptococcussuisserotype9

屬于鏈球菌屬的一種細菌,根據(jù)其莢膜多糖抗原的差異,可分為1-31、33及1/2共33個血清型。豬

鏈球菌9型是豬鏈球菌的一個血清型,不僅對豬致病性很強,而且可以感染特定的人群,是一種人獸共

患病病原菌。

4儀器設備和主要試劑

4.1儀器設備

高速離心機、水浴鍋、PCR儀、核酸電泳儀、凝膠成像系統(tǒng)。

4.2主要試劑

生理鹽水、超純水、蛋白酶K、2×PCRMix、瓊脂糖(電泳級)、DNA分子量標準(DL2000Marker)。

5引物

5.1上游引物:5′-GGCTACATATAATGGAAGCCC-3′。

5.2下游引物:5′-CCGAAGTATCTGGGCTACTG-3′。

6方法步驟

6.1樣品處理

6.1.1病料樣品處理

1

DB32/T3683—2019

采用差速離心法,取約5g病料(肝或肺或腦組織),剪碎研磨,用5mL生理鹽水混懸,先2000

r/min離心2min,去除大組織塊,取上清液,后10000r/min離心5min,棄上清液,沉淀以200μL超

純水重懸,備用。

6.1.2待檢培養(yǎng)物樣品處理

取待檢液體培養(yǎng)物(純培養(yǎng)物或混合培養(yǎng)物)1mL10000r/min離心5min,棄上清,沉淀以200μL

超純水重懸,備用。陰性對照:THB培養(yǎng)基。陽性對照:豬鏈球菌9型標準菌株(22083)的THB培

養(yǎng)物。陰性、陽性對照也同樣處理,對每個樣品進行編號標記。

6.2DNA提取

取6.1獲得的樣品及對照,每200μL加入3μL蛋白酶K(20mg/mL),42℃作用1h,煮沸5min,

10000r/min離心5min,上清作為模板DNA。

6.3PCR擴增

6.3.1反應條件

按25μL體系進行,2×PCRMix12.5μL,上游引物(10pmol/μL)1.0μL,下游引物(10pmol/μL)

1.0μL,模板DNA2.0μL,超純水8.5μL。按如下條件進行PCR反應。95℃5min,然后進入循環(huán)94℃

30sec,55℃30sec,72℃30sec,35個循環(huán),于72℃延伸10min,4℃保存。

6.3.2電泳

將PCR反應產物于1.2%瓊脂糖凝膠進行電泳,電壓為120V,時間30min。

6.3.3結果觀察

用凝膠成像系統(tǒng)觀察結果,并進行拍照。

7結果判定

7.1檢測結果成立條件

陽性對照的PCR產物電泳后在389bp的位置上出現(xiàn)一條特異性條帶,陰性對照PCR產物電泳后沒有

條帶(見附錄A),檢測結果成立;否則,結果不成立。

7.2結果判定

7.2.1在檢測結果成立的前提下,如果檢測樣品中PCR產物電泳后在389bp的位置上出現(xiàn)一條特異性條

帶,判為陽性,即該樣品為豬鏈球菌9型核酸陽性。

7.2.2在檢測結果成立的前提下,如果檢測樣品中PCR產物電泳后在389bp的位置上未出現(xiàn)一條特異性

條帶,判為陰性,即該樣品為豬鏈球菌9型核酸陰性。

7.2.3如果陽性對照無相應的目的條帶,可能是存在操作失誤,該檢測需要重復進行;如果陰性對照有

相應的目的條帶,可能是陰性對照存在污染或是操作失誤,該檢測需要重復進行。

8廢棄物處理和防止污染的措施

檢測過程中的廢棄物,應做好無害化處理。檢測過程中防止交叉污染的措施見附錄B。

2

DB32/T3683—2019

附錄A

(資料性附錄)

豬鏈球菌9型PCR產物電泳圖

M12

2000bp——

1000bp——

750bp——

500bp——

——389bp

250bp——

100bp——

M——DNA分子量標準(DL2000Marker);

1——陽性對照;

2——陰性對照。

圖A.1豬鏈球菌9型PCR產物電泳圖

3

DB32/T3683—2019

附錄B

(規(guī)范性附錄)

檢測過程中防止交叉污染的措施

B.1抽樣和制樣過程

抽樣和制樣工具,應清洗干凈,121℃,15min~20min滅菌,一套清潔工具限于一個樣品使用。

存放樣品的容器應該經過清洗、滅菌,或為一次性滅菌容器。

B.2檢測過程

B.2.1PCR實驗室應分為樣品制備區(qū)、前PCR區(qū)、PCR區(qū)、后PCR區(qū)。將模板提取、PCR反應液配制、

PCR循環(huán)擴增及PCR產物的鑒定等步驟分區(qū)或分室進行。實驗室的運作應從“凈區(qū)”到“臟區(qū)”單方向進

行。

B.2.2實驗過程中,應穿實驗服和戴手套,手套要經常更換。各區(qū)要有專用實驗服,經常清洗。

B.2.3各區(qū)所有的試劑、器材(尤其是移液器)、儀器都應專用,不得帶出該區(qū)。

B.2.4所有溶液、水、耗材和器具要121℃,15min~20min滅菌,避免核酸和(或)核酸酶污染。每種

溶液應使用高質量的成分和超純水。所有試劑應該以大體積配制,然后分裝成僅夠一次使用的量進行貯

存。

B.2.5裝有DNA模板或引物的離心管打開之前,要簡短離心,離心管不能用力崩開,以免產生氣溶膠。

B.2.6前PCR區(qū)中,在PCR操作箱中加人PCR反應各組分。

B.2.7實驗前后,實驗室用紫外線消毒以破壞殘留的DNA。

_________________________

4

DB32/T3683—2019

前言

本標準按照GB/T1.1—2009給出的規(guī)則起草。

本標準由江蘇省農業(yè)科學院提出并歸口。

本標準起草單位:江蘇省農業(yè)科學院。

本標準主要起草人:倪艷秀、何孔旺、周俊明、祝昊丹、呂立新、俞正玉、王丹丹、張雪寒、溫立

斌、李彬。

I

DB32/T3683—2019

豬鏈球菌9型PCR檢測技術規(guī)程

1范圍

本標準規(guī)定了豬鏈球菌9型PCR檢測技術所用的儀器設備和主要試劑、引物、方法步驟、結果判定、

廢棄物處理和防止污染的措施等要求。

本標準適用于豬鏈球菌9型的PCR檢測。

2規(guī)范性引用文件

下列文件對于本文件的應用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅注日期的版本適用于本文件。

凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。

GB/T6682分析實驗室用水規(guī)格和試驗方法

NY/T541獸醫(yī)診斷樣品采集、保存與運輸技術規(guī)范

《病死及病害動物無害化處理技術規(guī)范》(農醫(yī)發(fā)〔2017〕25號)

3術語和定義

下列術語和定義適用于本文件。

3.1

豬鏈球菌9型Streptococcussuisserotype9

屬于鏈球菌屬的一種細菌,根據(jù)其莢膜多糖抗原的差異,可分為1-31、33及1/2共33個血清型。豬

鏈球菌9型是豬鏈球菌的一個血清型,不僅對豬致病性很強,而且可以感染特定的人群,是一種人獸共

患病病原菌。

4儀器設備和主要試劑

4.1儀器設備

高速離心機、水浴鍋、PCR儀、核酸電泳儀、凝膠成像系統(tǒng)。

4.2主要試劑

生理鹽水、超純水、蛋白酶K、2×PCRMix、瓊脂糖(電泳級)、DNA分子量標準(DL2000Marker)。

5引物

5.1上游引物:5′-GGCTACATATAATGGAAGCCC-3′。

5.2下游引物:5′-CCGAAGTATCTGGGCTACTG-3′。

6方法步驟

6.1樣品處理

6.1.1病料樣品處理

1

DB32/T3683—2019

采用差速離心法,取約5g病料(肝或肺或腦組織),剪碎研磨,用5mL生理鹽水混懸,先2000

r/min離心2min,去除大組織塊,取上清液,后10000r/min離心5min,棄上清液,沉淀以200μL超

純水重懸,備用。

6.1.2待檢培養(yǎng)物樣品處理

取待檢液體培養(yǎng)物(純培養(yǎng)物或混合培養(yǎng)物)1mL10000r/min離心5min,棄上清,沉淀以200μL

超純水重懸,備用。陰性對照:THB培養(yǎng)基。陽性對照:豬鏈球菌9型標準菌株(22083)的THB培

養(yǎng)物。陰性、陽性對照也同樣處理,對每個樣品進行編號標記。

6.2DNA提取

取6.1獲得的樣品及對照,每200μL加入3μL蛋白酶K(20mg/mL),42℃作用1h,煮沸5min,

10000r/min離心5min,上清作為模板DNA。

6.3PCR擴增

6.3.1反應條件

按25μL體系進行,2×PCRMix12.5μL,上游引物(10pmol/μL)1.0μL,下游引物(10pmol/μL)

1.0μL,模板DNA2.0μL,超純水8.5μL。按如下條件進行PCR反應。95℃5min,然后進入循環(huán)94℃

30sec,55℃30sec,72℃30sec,35個循環(huán),于72℃延伸10min,4℃保存。

6.3.2電泳

將PCR反應產物于1.2%瓊脂糖凝膠進行電泳,電壓為120V,時間30min。

6.3.3結果觀察

用凝膠成像系統(tǒng)觀察結果,并進行拍照。

7結果判定

7.1檢測結果成立條件

陽性對照的PCR產物電泳后在389bp的位置上出現(xiàn)一條特異性條帶,陰性對照PCR產物電泳后沒有

條帶(見附錄A),檢測結果成立;否則,結果不成立。

7.2結果判定

7.2.1在檢測結果成立的前提下,如果檢測樣品中PCR產物電泳后在389bp的位置上出現(xiàn)一條特異性條

帶,判為陽性,即該樣品為豬鏈球菌9型核酸陽性。

7.2.2在檢測結果成立的前提下,如果檢測樣品中PCR產物電泳后在389bp的位置上未出現(xiàn)一條特異性

條帶,判為陰性,即該樣品為豬鏈球菌9型核酸陰性。

7.2.3如果陽性對照無相應的目的條帶,可能是存在操作失誤,該檢測需要重復進行;如果陰性對照有

相應的目的條帶,可能是陰性對照存在污染或是操作失誤,該檢測需要重復進行。

8廢棄物處理和防止污染的措施

檢測過程中的廢棄物,應做好無害化處理。檢測過程中防止交叉污染的措施見附錄B。

2

DB32/T3683—2019

附錄A

(資料性附錄)

豬鏈球菌9型PCR產物電泳圖

M12

2000bp——

1000bp——

750bp——

500bp——

——389bp

250bp——

100bp——

M——DNA分子量標準(DL2000Marker);

1——陽性對照;

2——陰性對照。

圖A.1豬鏈球菌9型PCR產物電泳圖

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