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文檔簡(jiǎn)介

ICS13.100

C60DB32

江蘇省地方標(biāo)準(zhǔn)

DB32/T4007—2021

腫瘤高通量基因測(cè)序技術(shù)規(guī)范

Technicalregulationofnext-generationgenesequencingfortumors

2021-03-04發(fā)布2021-04-04實(shí)施

江蘇省市場(chǎng)監(jiān)督管理局發(fā)布

DB32/T4007-2021

前??言

本文件按照GB/T1.1-2020規(guī)則起草。

本文件由江蘇省衛(wèi)生健康委員會(huì)提出。

本文件由江蘇省衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)歸口。

本文件主要起草單位:江蘇省腫瘤醫(yī)院、江蘇吉諾思美精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)科技有限公司、南京世和基因生物

技術(shù)有限公司、華大生物科技有限公司。

本文件主要起草人:馮繼鋒、吳建中、井昶雯、馬蓉、曹海霞、王卓、劉思文、陳丹、張君瑩、吳

旸、張圓。

II

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腫瘤高通量基因測(cè)序技術(shù)規(guī)范

1范圍

本文件規(guī)定了腫瘤高通量基因測(cè)序適用人群、指標(biāo)要求及條件、測(cè)序流程、腫瘤高通道基因測(cè)序?qū)?/p>

驗(yàn)室質(zhì)量評(píng)價(jià)。

本文件適用于腫瘤患者的高通量基因測(cè)序檢測(cè)。

2規(guī)范性引用文件

下列文件中的內(nèi)容通過(guò)文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,

僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改版)適用于本

文件。

GB19489實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求

GB/T30989高通量基因測(cè)序技術(shù)規(guī)程

醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增管理辦法衛(wèi)辦醫(yī)政發(fā)〔2010〕194號(hào)

醫(yī)療器械監(jiān)督管理?xiàng)l例國(guó)務(wù)院令第276號(hào)

醫(yī)療器械注冊(cè)管理辦法國(guó)家食品藥品監(jiān)管總局令第4號(hào)

ISO15189醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量和能力的專用要求

3術(shù)語(yǔ)和定義

以下術(shù)語(yǔ)和定義適用于本文件。

3.1

高通量基因測(cè)序next-generationgenesequencing;NGS

區(qū)別于傳統(tǒng)的雙脫氧法測(cè)序,能夠一次并行對(duì)大量核酸分子進(jìn)行平行序列測(cè)定的技術(shù),通過(guò)一次測(cè)

序反應(yīng)能產(chǎn)出不低于100Mb的測(cè)序數(shù)據(jù)。

3.2

文庫(kù)library

通過(guò)生物來(lái)源的、人工合成的或者克隆技術(shù)等所得到的一個(gè)重建分子群,如基因組文庫(kù)、互補(bǔ)文庫(kù)、

噬菌體展示肽文庫(kù)等。

3.3

測(cè)序通量throughputofgenesequencing

單次測(cè)序可獲得序列信息的基因片段數(shù)量或可測(cè)定的脫氧核糖核酸和核糖核酸(以堿基表示)的數(shù)

量。

1

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3.4

有效通量validthroughput

單次測(cè)序質(zhì)量合格的基因片段數(shù)或堿基數(shù)。

3.5

測(cè)序準(zhǔn)確率accuracyofgenesequencing

對(duì)已知序列的基因進(jìn)行測(cè)序,計(jì)算正確的堿基數(shù)占可識(shí)別的堿基數(shù)比例。

3.6

測(cè)序深度depthofsequencing

待測(cè)樣本中某個(gè)指定的核苷酸被檢測(cè)的次數(shù)。

3.7

堿基識(shí)別質(zhì)量qualityofbasecalling

測(cè)序過(guò)程中從熒光信號(hào)或者其他信號(hào)轉(zhuǎn)換成序列,衡量堿基正確識(shí)別的概率。通常以數(shù)字值直接表

示。

4適用人群、指標(biāo)要求及條件

4.1適用人群

能獲取腫瘤細(xì)胞的腫瘤患者。

4.2測(cè)序設(shè)備使用條件

4.2.1環(huán)境溫度:(18±5)℃,24小時(shí)溫度變化不超過(guò)2℃,目標(biāo)溫度以各個(gè)儀器設(shè)備性能參數(shù)中的

要求而定。

4.2.2環(huán)境濕度:根據(jù)以各個(gè)儀器設(shè)備性能參數(shù)中的要求而定。

4.2.3工作電壓:220V。

4.2.4電源保護(hù):帶有不間斷1500W電源器。

4.2.5支撐平臺(tái):氣壓式緩沖系統(tǒng)的防震平臺(tái),防震效果達(dá)到1Hz級(jí)別。

4.3實(shí)驗(yàn)室要求

4.3.1資質(zhì)要求

開(kāi)展腫瘤高通量測(cè)序醫(yī)療機(jī)構(gòu)應(yīng)該具備國(guó)家級(jí)衛(wèi)生計(jì)生行政部門(mén)審批許可,并具備省級(jí)技術(shù)審核的

臨床基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室資質(zhì),相關(guān)工作開(kāi)展符合《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增管理辦法》的規(guī)定。

4.3.2設(shè)置要求

參照GB/T30989中規(guī)范性目錄B的要求。實(shí)驗(yàn)室的安全工作制度或安全標(biāo)準(zhǔn)操作程序,所有

操作符合GB19489中的要求。

2

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區(qū)域分區(qū)可分為:樣本前處理區(qū)、試劑儲(chǔ)存和準(zhǔn)備區(qū)、樣本制備區(qū)、文庫(kù)制備區(qū)、雜交捕獲區(qū)

/多重PCR區(qū)域(第一擴(kuò)增區(qū))、文庫(kù)擴(kuò)增區(qū)(第二擴(kuò)增區(qū))、文庫(kù)檢測(cè)與質(zhì)控區(qū)、測(cè)序區(qū)、數(shù)據(jù)存

貯區(qū)。

工作區(qū)空氣及人員流向需嚴(yán)格按照《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增管理辦法》配置。分區(qū)可根據(jù)實(shí)際

情況合并,但是在前處理和建庫(kù)時(shí),血液樣本與組織樣本分開(kāi)。

4.4設(shè)備試劑要求

4.4.1設(shè)備包括:高通量基因測(cè)序儀、DNA提取相關(guān)設(shè)備、PCR儀等,設(shè)備的種類、數(shù)量與試劑開(kāi)

展的項(xiàng)目與檢測(cè)標(biāo)本的數(shù)量相匹配。

4.4.2檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室應(yīng)該做好儀器設(shè)備維護(hù)及保養(yǎng),建立儀器設(shè)備標(biāo)簽管理、檔案管理,按設(shè)備要求定

期進(jìn)行計(jì)量校準(zhǔn)及維護(hù)管理。

4.4.3開(kāi)展高通量基因測(cè)序的診斷機(jī)構(gòu)和醫(yī)院需嚴(yán)格按照《醫(yī)療器械監(jiān)督管理?xiàng)l例》和《醫(yī)療器械注

冊(cè)管理辦法》使用國(guó)家食品藥品管理總局(CFDA)獲批注冊(cè)的設(shè)備和試劑開(kāi)展高通量基因測(cè)序工作。

4.4.4涉及實(shí)驗(yàn)室自配試劑(LDT),需有嚴(yán)格的試劑制備標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程(SOP),需經(jīng)過(guò)臨床實(shí)驗(yàn)

室自建項(xiàng)目驗(yàn)證合格才可使用。LDT基于不同樣本類型的性能驗(yàn)證的指標(biāo)包括:精密度(批內(nèi)、批間)、

準(zhǔn)確度、分析靈敏度、分析特異性、可測(cè)量范圍、樣本穩(wěn)定性、試劑穩(wěn)定性、攜帶污染、參考范圍、臨

床診斷靈敏度、臨床診斷特異性。

4.5檢測(cè)項(xiàng)目管控

4.5.1檢測(cè)項(xiàng)目驗(yàn)證因素包括:建庫(kù)方法、測(cè)序平臺(tái)和分析工具以及不同的突變類型(包括單堿基突

變(singlenucleotidevariant,SNV)、小片段插入或者缺失(ins,del)、基因拷貝數(shù)變異(copynumber

variations,CNV)、染色體結(jié)構(gòu)變異(structuralvariation,SV))以及不同的樣本類型(如FFPE組織、

新鮮組織、全血、胸水等)。

4.5.2驗(yàn)證參數(shù)包括:目標(biāo)區(qū)域測(cè)序(panel)的準(zhǔn)確性、精確性、敏感性、特異性。

4.6人員要求

4.6.1高通量測(cè)序檢測(cè)技術(shù)人員需具備臨床病理學(xué)、分子生物學(xué)的相關(guān)專業(yè)大專以上學(xué)歷,需接受省

級(jí)衛(wèi)生計(jì)生行政部門(mén)組織的高通量基因測(cè)序技術(shù)培訓(xùn),或者省級(jí)衛(wèi)生計(jì)生行政部門(mén)頒發(fā)的培訓(xùn)合格證

書(shū);需具有臨檢中心《臨床基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室技術(shù)人員培訓(xùn)合格證》。

4.6.2數(shù)據(jù)分析人員需具有臨床醫(yī)學(xué)、分子生物學(xué)或遺傳學(xué)知識(shí)背景并經(jīng)生物信息學(xué)培訓(xùn)。

4.6.3實(shí)驗(yàn)室需依照《醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量和能力的專用要求》(ISO15189)進(jìn)行內(nèi)部人員周期性培訓(xùn)和

考核機(jī)制并制定文件化程序,保留相關(guān)記錄。

5測(cè)序流程

5.1測(cè)序前準(zhǔn)備

5.1.1醫(yī)師須自覺(jué)維護(hù)患者的權(quán)利,尊重患者的知情同意權(quán)和選擇權(quán),保護(hù)患者隱私。

5.1.2全面客觀宣教高通量測(cè)序在腫瘤中的應(yīng)用價(jià)值,優(yōu)缺點(diǎn)及可供選擇的高通量測(cè)序方案等。

5.1.3告知要點(diǎn)主要包括:

a)檢出率、假陽(yáng)性率。

b)該檢測(cè)有失敗的風(fēng)險(xiǎn),可能會(huì)重新檢測(cè),檢測(cè)周期變長(zhǎng)。

3

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c)告知該檢測(cè)的局限性。

d)檢測(cè)的種類、費(fèi)用和技術(shù)流程。

5.2標(biāo)本采集

5.2.1樣本類型

新鮮組織

在顯微鏡下確認(rèn)腫瘤細(xì)胞所占比例應(yīng)≥30%,壞死細(xì)胞所占比例應(yīng)≤10%,相關(guān)的病理檢測(cè)結(jié)果

保存?zhèn)洳椤颖静杉罅⒓捶湃胍旱耆鋬觯?80℃低溫保存,干冰運(yùn)輸。

石蠟組織/切片組織

10%中性福爾馬林固定手術(shù)標(biāo)本,按病理學(xué)操作規(guī)范進(jìn)行取材。5~10張石蠟包埋標(biāo)本切片,厚

度為5μm~10μm,用載玻片片盒或者離心管保存,常溫保存、運(yùn)輸。其中一片進(jìn)行HE染色,確認(rèn)腫

瘤細(xì)胞含量?;顧z材料的固定時(shí)間一般是24小時(shí)以內(nèi)。

體液

體液中的腫瘤細(xì)胞用于基因檢測(cè)時(shí),需確認(rèn)腫瘤細(xì)胞,穿刺獲得胸腹水樣本提交給細(xì)胞病理檢查之

后,剩余液體冷藏/冷凍保存,或在含有細(xì)胞成分的離心沉淀中加入含有蛋白質(zhì)變性劑的緩沖液室溫保

存。

外周血

采集外周血提取血漿游離DNA進(jìn)行檢測(cè),取樣時(shí)需使用一次性密閉EDTA抗凝真空采血管,采集

6ml~10ml全血,冷藏運(yùn)輸,6小時(shí)內(nèi)分離血漿,提取游離DNA,保存到-80℃冰箱中,并避免反復(fù)凍融。

如外周血需長(zhǎng)時(shí)間運(yùn)輸,建議用商品化的游離DNA樣本保存管,在常溫條件下,cfDNA在全血中可穩(wěn)

定保存7天。

5.2.2采樣質(zhì)量評(píng)價(jià)

評(píng)價(jià)內(nèi)容

細(xì)胞組成、腫瘤細(xì)胞的數(shù)量,是否按照要求進(jìn)行處理與運(yùn)輸。

評(píng)價(jià)方法

.1包括肉眼觀察、顯微鏡下觀察和濃度分析等。

.2需經(jīng)病理醫(yī)師審閱,取一張切片HE染色后顯微鏡下觀察,確保腫瘤細(xì)胞存在,并記錄腫

瘤組織含量,標(biāo)注腫瘤細(xì)胞密集區(qū)域。腫瘤細(xì)胞比例在20%以上。

5.2.3樣本采集中的防污染

樣本采集需采用一次性材料。

采集中需注意防止污染,防止混入操作者的毛發(fā)、表皮細(xì)胞、痰液等。

玻璃器皿需高壓滅菌,以使可能存在的DNase失活。

制備不同患者病理切片樣本時(shí),需更換新刀片。

提取RNA樣品,需采用RNase抑制劑措施和無(wú)RNase材料。

4

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5.2.4樣本運(yùn)送和保存

采用唯一編號(hào)對(duì)樣本進(jìn)行編號(hào)。該編號(hào)應(yīng)當(dāng)與檢測(cè)報(bào)告中的樣本編號(hào)一致。

實(shí)驗(yàn)室應(yīng)建立詳細(xì)的樣本運(yùn)送標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程,對(duì)臨床醫(yī)生提供樣本采集手冊(cè),要求物流人員填

寫(xiě)相關(guān)運(yùn)送記錄表,確保運(yùn)送過(guò)程中樣本的安全性和過(guò)程的可控性。

樣本運(yùn)送和保存:用于DNA擴(kuò)增檢測(cè)的EDTA抗凝全血樣本及RNA檢測(cè)的樣本,需穩(wěn)定化

處理常溫運(yùn)送,或速凍后,置干冰中運(yùn)送。

5.2.5樣本提取

新鮮和凍存的手術(shù)組織樣本

采用常規(guī)的商品化DNA提取試劑盒。

活檢樣本

推薦使用能提取石蠟包埋組織微量DNA的試劑盒。

RNA提取

胍鹽提取結(jié)合酚-氯仿抽提,石蠟樣本或活檢樣本可使用商品化RNA提取試劑盒。細(xì)胞或組織的徹

底勻漿

5.2.6核酸純度評(píng)價(jià)

可用凝膠電泳將樣本的核酸提取物與核酸標(biāo)準(zhǔn)品比較測(cè)定;

a)DNA濃度控制在50ng/ul~100ng/ul,總量20μg~40μg或以上;A260/280在1.8~2.0

之間;

b)RNA溶于無(wú)RNase的純水中,建議濃度在100ng/ul以上,總量達(dá)30μg以上。

5.3測(cè)序流程

5.3.1文庫(kù)制備

文庫(kù)制備方法主要有雜交捕獲和擴(kuò)增子建庫(kù),應(yīng)對(duì)檢測(cè)基因、區(qū)域或突變熱點(diǎn)進(jìn)行描述,并建

立實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)SOP。

上機(jī)測(cè)序前需對(duì)文庫(kù)進(jìn)行質(zhì)量分析。每個(gè)檢測(cè)項(xiàng)目應(yīng)設(shè)定其文庫(kù)質(zhì)量的要求,明確接受或拒絕

的標(biāo)準(zhǔn)。

5.3.2測(cè)序儀上機(jī)檢測(cè)

測(cè)序主要有檢測(cè)氫離子釋放和熒光信號(hào)兩大技術(shù)平臺(tái)。

測(cè)序時(shí)根據(jù)檢測(cè)樣本量和質(zhì)量要求確定適當(dāng)?shù)男酒?,以保證測(cè)序質(zhì)量和靶區(qū)覆蓋深度。

錄入樣本編號(hào)、檢測(cè)內(nèi)容、設(shè)定參數(shù)等信息,按儀器操作流程進(jìn)行測(cè)序。

5.4生物信息分析

5.4.1分為兩個(gè)主要步驟:一是對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)控分析及過(guò)濾;二是對(duì)通過(guò)質(zhì)控的序列進(jìn)行變異位

點(diǎn)鑒定分析并注釋。

5

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5.4.2所用各種生物信息分析軟件,均需通過(guò)適量標(biāo)準(zhǔn)品測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行驗(yàn)證,證明所用軟件及參數(shù)可

達(dá)到臨床報(bào)告的要求。

5.4.3所有數(shù)據(jù)分析的軟件均需版本號(hào),版本更新后需要在SOP中進(jìn)行更新。

5.5檢測(cè)報(bào)告內(nèi)容

5.5.1檢測(cè)報(bào)告內(nèi)容

檢測(cè)報(bào)告內(nèi)容包括:

a)患者姓名、年齡、住院號(hào)、病區(qū)床號(hào)、送檢單位及送檢日期、臨床診斷等基本信息。

b)樣本編號(hào)、樣本種類、采樣日期和接收日期、樣本處理過(guò)程。

c)檢測(cè)項(xiàng)目、檢測(cè)方法、檢測(cè)設(shè)備、檢測(cè)結(jié)果及報(bào)告版本號(hào)。

c)檢測(cè)者、審核者及檢測(cè)時(shí)間。

5.5.2突變位點(diǎn)命名

基因突變命名

.1人類基因組突變學(xué)會(huì)(HGVS)已建立系統(tǒng)的基因突變命名方法。具體基因突變命名方法

可查閱網(wǎng)站/mutnomen/index.html。以最新版本為準(zhǔn)。

.2描述某一序列改變時(shí),前綴表明其參考序列類型。例如“g.”表示基因組序列,“c.”表示cDNA

序列,“m.”表示線粒體DNA序列,“r.”表示RNA序列,“p.”表示蛋白序列。

.3在數(shù)據(jù)庫(kù)中的收錄號(hào)以及版本號(hào)應(yīng)在實(shí)驗(yàn)報(bào)告中列出。

參考序列

.1序列參考美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心(NCBI)收錄的參考序列編碼。

.2前綴“NM_”表示為mRNA序列,“NP_”表示多肽序列,“NG_”表示基因組序列。

.3基因組參考序列應(yīng)列出完整基因序列,包括5'以及3'非編碼區(qū)(UTR)。

.4應(yīng)選擇合適的轉(zhuǎn)錄體,如最常見(jiàn)的轉(zhuǎn)錄體,或已知的最大轉(zhuǎn)錄體,或具有組織特異性的編輯

轉(zhuǎn)錄體,且明確起始轉(zhuǎn)錄點(diǎn)。

.5當(dāng)某一參考序列具有多種轉(zhuǎn)錄方式時(shí),選擇NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)里注釋最全面的版本。

DNA序列變異術(shù)語(yǔ)

.1DNA核苷酸用大寫(xiě)字母A(腺嘌呤)、C(胞嘧啶)、G(鳥(niǎo)嘌呤)以及T(胸腺嘧啶)來(lái)

表示。

.2用正鏈表示DNA序列。

.3當(dāng)DNA序列改變時(shí),以相應(yīng)核苷酸所在位置及相應(yīng)字母來(lái)描述?!?gt;”符號(hào)表示“從某一變化

至另一”。

.4在描述突變方式時(shí),數(shù)字、字母、箭頭、上標(biāo)以及下標(biāo)之間不應(yīng)出現(xiàn)空格。

RNA序列變異術(shù)語(yǔ)

.1RNA序列以小寫(xiě)字母a(腺嘌呤)、c(胞嘧啶)、g(鳥(niǎo)嘌呤)、u(尿嘧啶)進(jìn)行描述。

.2RNA序列改變描述方式與DNA相類似。

6

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蛋白質(zhì)序列變異術(shù)語(yǔ)

蛋白質(zhì)序列改變通常以單個(gè)字母或三個(gè)字母(第一個(gè)字母大寫(xiě))來(lái)描述。

錯(cuò)義突變及無(wú)義變異術(shù)語(yǔ)

.1由于三聯(lián)體密碼子的簡(jiǎn)并性,多個(gè)位點(diǎn)核苷酸的改變可能不影響最終氨基酸序列。因此,應(yīng)

分別從DNA水平和氨基酸水平描述突變。

.2從DNA水平對(duì)某一突變位點(diǎn)的描述方式包括堿基位點(diǎn),正常堿基,“>”符號(hào),突變堿基。

例如,某一蛋白第551號(hào)氨基酸殘基由G(甘氨酸)突變?yōu)镈(天冬氨酸),從DNA水平描述即c.1652G>A。

.3在氨基酸水平,由于錯(cuò)義突變的產(chǎn)物以氨基酸殘基位點(diǎn)以及表示氨基酸的單字母或三聯(lián)體密

碼子來(lái)描述。表示方法是野生型的氨基酸、位點(diǎn)、突變氨基酸,三者之間不要有空格。無(wú)義突變表示方

法與之相類似。

.4“X”符號(hào)代表終止密碼子。

缺失和插入術(shù)語(yǔ)

缺失和插入突變分別用前綴“del”和“ins”來(lái)表示,并注明突變位點(diǎn)以及堿基?!癲elins”則表示該段序

列缺失的同時(shí)有片段插入。

移碼突變術(shù)語(yǔ)

移碼突變用“fs”符號(hào)表示。

堿基重復(fù)序列

重復(fù)突變用“dup”符號(hào)表示。

0其他

對(duì)于其他突變,可參考HGVS建議的命名規(guī)則。

5.5.3報(bào)告臨床意義的解讀和批注

對(duì)于腫瘤體細(xì)胞突變,根據(jù)突變的類型和已有的報(bào)道及指南,基因變異提倡分級(jí)的處理方式。

A級(jí):美國(guó)食品藥品管理局FDA或CFDA批準(zhǔn)的用藥治療靶點(diǎn);寫(xiě)入中外診療指南有明確診斷/治療

/預(yù)后意義的變異。在報(bào)告中注釋該變異位點(diǎn)的臨床診斷/治療/預(yù)后意義的權(quán)威指南來(lái)源。

B級(jí):尚未進(jìn)入診療指南,但已經(jīng)寫(xiě)入該領(lǐng)域的專家共識(shí)的變異位點(diǎn)。注釋時(shí)要批注研究報(bào)道及專

家共識(shí)的來(lái)源,明確其藥物及其臨床意義、正在開(kāi)展的狀態(tài)等信息。

C級(jí):FDA或CFDA批準(zhǔn)用于其他腫瘤可預(yù)測(cè)療效的基因變異,或者正在進(jìn)行中的臨床試驗(yàn)變異位

點(diǎn)。注釋時(shí)要批注用于其他腫瘤的權(quán)威指南,研究文獻(xiàn)及臨床試驗(yàn)正在開(kāi)展的狀態(tài)等信息。

D級(jí):處于學(xué)術(shù)爭(zhēng)議或臨床意義不明確的基因變異。同一實(shí)驗(yàn)室應(yīng)該有統(tǒng)一的政策用來(lái)應(yīng)對(duì)檢測(cè)過(guò)

程中出現(xiàn)的臨床意義不明變異情況。

5.6檢測(cè)報(bào)告的審核發(fā)放

5.6.1規(guī)定相關(guān)檢測(cè)報(bào)告的周期;

5.6.2最終報(bào)告應(yīng)由具備高級(jí)職稱人員審核;

5.6.3檢測(cè)報(bào)告應(yīng)當(dāng)以書(shū)面報(bào)告形式告知受檢者,應(yīng)通知受檢者或其家屬獲取該報(bào)告的地點(diǎn)和時(shí)間。

7

DB32/T4007-2021

5.7資料與標(biāo)本的保存

5.7.1腫瘤高通量基因測(cè)序患者相關(guān)資料以及相關(guān)的數(shù)據(jù)信息均應(yīng)當(dāng)在醫(yī)療機(jī)構(gòu)保存3年以上。

5.7.2實(shí)驗(yàn)室應(yīng)當(dāng)建立完整質(zhì)量文件體系,包括質(zhì)量手冊(cè)、程序文件及標(biāo)準(zhǔn)操作程序(SOP)文件體

系,以保證檢測(cè)各環(huán)節(jié)的標(biāo)準(zhǔn)、有序進(jìn)行,確保檢測(cè)結(jié)果的真實(shí)性、準(zhǔn)確性和可重復(fù)性。

6質(zhì)量評(píng)價(jià)

6.1質(zhì)控品的使用管理

6.1.1腫瘤高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)室應(yīng)該包括陰性質(zhì)控品、陽(yáng)性質(zhì)控品及空白對(duì)照。

6.1.2若無(wú)適用于高通量測(cè)序檢測(cè)的第三方商業(yè)化陰陽(yáng)性質(zhì)控品,各實(shí)驗(yàn)室可在遵循法律法規(guī)的要求

前提下,通過(guò)以下途徑獲得:使用試劑盒自帶的陰陽(yáng)性質(zhì)控品、使用已知突變的患者組織作為陽(yáng)性質(zhì)控

品或使用正常體細(xì)胞DNA作為陰性質(zhì)控品。

6.2室內(nèi)質(zhì)量控制

6.2.1一般室內(nèi)質(zhì)量控制要求

通常情況下在檢測(cè)中一次檢測(cè)至少添加一個(gè)陽(yáng)性質(zhì)控、一個(gè)陰性質(zhì)控或者一個(gè)空白對(duì)照質(zhì)控與常規(guī)

標(biāo)本同時(shí)檢測(cè),并設(shè)定質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn),保留質(zhì)控記錄。

6.2.2定期針對(duì)檢驗(yàn)質(zhì)量的內(nèi)部評(píng)價(jià)

檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室應(yīng)有計(jì)劃地采用留樣復(fù)測(cè)、相同樣本的人員比對(duì)、不同方法相同樣本比對(duì)、設(shè)備期間核

查等方式定期對(duì)檢測(cè)系統(tǒng)的穩(wěn)定性、儀器設(shè)備、新進(jìn)人員等環(huán)節(jié)進(jìn)行內(nèi)部質(zhì)控。

6.2.3生物信息分析流程質(zhì)量管理

實(shí)驗(yàn)室應(yīng)建立生物信息學(xué)程序的書(shū)面質(zhì)量管理計(jì)劃文件。需包含每次運(yùn)行時(shí)監(jiān)測(cè)和評(píng)估運(yùn)行性

能的指標(biāo)和質(zhì)控參數(shù),以及定期監(jiān)測(cè)的指標(biāo)和質(zhì)控參數(shù)。

指標(biāo)和質(zhì)控參數(shù)可包括但不限于標(biāo)準(zhǔn)品的突變類型及百分比。

實(shí)驗(yàn)室需要建立一個(gè)異常記錄文檔,用來(lái)記錄偏離高通量測(cè)序生物信息分析標(biāo)準(zhǔn)分析流程的檢

測(cè)。

6.2.4應(yīng)對(duì)方案和替代方法

各個(gè)質(zhì)量控制步驟中如出現(xiàn)異?;蚴。瑢?shí)驗(yàn)室應(yīng)有應(yīng)對(duì)措施或備選方案;對(duì)于測(cè)序結(jié)果質(zhì)量差或

有問(wèn)題的區(qū)域應(yīng)建立替代方法。

6.3室間質(zhì)量評(píng)價(jià)

開(kāi)展腫瘤高通量基因測(cè)序的實(shí)驗(yàn)室應(yīng)每年參加由衛(wèi)生部臨檢中心組織的室間質(zhì)量評(píng)價(jià)活動(dòng)。室間質(zhì)

量評(píng)價(jià)結(jié)果不合格的應(yīng)該分析原因,并采取相應(yīng)的預(yù)防/糾正措施。

—————————————

8

DB32/T4007-2021

目??次

前言.....................................................................................................................................................................II

1范圍...................................................................................................................................................................1

2規(guī)范性引用文件...............................................................................................................................................1

3術(shù)語(yǔ)和定義.......................................................................................................................................................1

4適用人群、指標(biāo)要求及條件...........................................................................................................................2

5測(cè)序流程...........................................................................................................................................................3

6質(zhì)量評(píng)價(jià)...........................................................................................................................................................8

I

DB32/T4007-2021

腫瘤高通量基因測(cè)序技術(shù)規(guī)范

1范圍

本文件規(guī)定了腫瘤高通量基因測(cè)序適用人群、指標(biāo)要求及條件、測(cè)序流程、腫瘤高通道基因測(cè)序?qū)?/p>

驗(yàn)室質(zhì)量評(píng)價(jià)。

本文件適用于腫瘤患者的高通量基因測(cè)序檢測(cè)。

2規(guī)范性引用文件

下列文件中的內(nèi)容通過(guò)文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,

僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改版)適用于本

文件。

GB19489實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求

GB/T30989高通量基因測(cè)序技術(shù)規(guī)程

醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增管理辦法衛(wèi)辦醫(yī)政發(fā)〔2010〕194號(hào)

醫(yī)療器械監(jiān)督管理?xiàng)l例國(guó)務(wù)院令第276號(hào)

醫(yī)療器械注冊(cè)管理辦法國(guó)家食品藥品監(jiān)管總局令第4號(hào)

ISO15189醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量和能力的專用要求

3術(shù)語(yǔ)和定義

以下術(shù)語(yǔ)和定義適用于本文件。

3.1

高通量基因測(cè)序next-generationgenesequencing;NGS

區(qū)別于傳統(tǒng)的雙脫氧法測(cè)序,能夠一次并行對(duì)大量核酸分子進(jìn)行平行序列測(cè)定的技術(shù),通過(guò)一次測(cè)

序反應(yīng)能產(chǎn)出不低于100Mb的測(cè)序數(shù)據(jù)。

3.2

文庫(kù)library

通過(guò)生物來(lái)源的、人工合成的或者克隆技術(shù)等所得到的一個(gè)重建分子群,如基因組文庫(kù)、互補(bǔ)文庫(kù)、

噬菌體展示肽文庫(kù)等。

3.3

測(cè)序通量throughputofgenesequencing

單次測(cè)序可獲得序列信息的基因片段數(shù)量或可測(cè)定的脫氧核糖核酸和核糖核酸(以堿基表示)的數(shù)

量。

1

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3.4

有效通量validthroughput

單次測(cè)序質(zhì)量合格的基因片段數(shù)或堿基數(shù)。

3.5

測(cè)序準(zhǔn)確率accuracyofgenesequencing

對(duì)已知序列的基因進(jìn)行測(cè)序,計(jì)算正確的堿基數(shù)占可識(shí)別的堿基數(shù)比例。

3.6

測(cè)序深度depthofsequencing

待測(cè)樣本中某個(gè)指定的核苷酸被檢測(cè)的次數(shù)。

3.7

堿基識(shí)別質(zhì)量qualityofbasecalling

測(cè)序過(guò)程中從熒光信號(hào)或者其他信號(hào)轉(zhuǎn)換成序列,衡量堿基正確識(shí)別的概率。通常以數(shù)字值直接表

示。

4適用人群、指標(biāo)要求及條件

4.1適用人群

能獲取腫瘤細(xì)胞的腫瘤患者。

4.2測(cè)序設(shè)備使用條件

4.2.1環(huán)境溫度:(18±5)℃,24小時(shí)溫度變化不超過(guò)2℃,目標(biāo)溫度以各個(gè)儀器設(shè)備性能參數(shù)中的

要求而定。

4.2.2環(huán)境濕度:根據(jù)以各個(gè)儀器設(shè)備性能參數(shù)中的要求而定。

4.2.3工作電壓:220V。

4.2.4電源保護(hù):帶有不間斷1500W電源器。

4.2.5支撐平臺(tái):氣壓式緩沖系統(tǒng)的防震平臺(tái),防震效果達(dá)到1Hz級(jí)別。

4.3實(shí)驗(yàn)室要求

4.3.1資質(zhì)要求

開(kāi)展腫瘤高通量測(cè)序醫(yī)療機(jī)構(gòu)應(yīng)該具備國(guó)家級(jí)衛(wèi)生計(jì)生行政部門(mén)審批許可,并具備省級(jí)技術(shù)審核的

臨床基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室資質(zhì),相關(guān)工作開(kāi)展符合《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增管理辦法》的規(guī)定。

4.3.2設(shè)置要求

參照GB/T30989中規(guī)范性目錄B的要求。實(shí)驗(yàn)室的安全工作制度或安全標(biāo)準(zhǔn)操作程序,所有

操作符合GB19489中的要求。

2

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區(qū)域分區(qū)可分為:樣本前處理區(qū)、試劑儲(chǔ)存和準(zhǔn)備區(qū)、樣本制備區(qū)、文庫(kù)制備區(qū)、雜交捕獲區(qū)

/多重PCR區(qū)域(第一擴(kuò)增區(qū))、文庫(kù)擴(kuò)增區(qū)(第二擴(kuò)增區(qū))、文庫(kù)檢測(cè)與質(zhì)控區(qū)、測(cè)序區(qū)、數(shù)據(jù)存

貯區(qū)。

工作區(qū)空氣及人員流向需嚴(yán)格按照《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增管理辦法》配置。分區(qū)可根據(jù)實(shí)際

情況合并,但是在前處理和建庫(kù)時(shí),血液樣本與組織樣本分開(kāi)。

4.4設(shè)備試劑要求

4.4.1設(shè)備包括:高通量基因測(cè)序儀、DNA提取相關(guān)設(shè)備、PCR儀等,設(shè)備的種類、數(shù)量與試劑開(kāi)

展的項(xiàng)目與檢測(cè)標(biāo)本的數(shù)量相匹配。

4.4.2檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室應(yīng)該做好儀器設(shè)備維護(hù)及保養(yǎng),建立儀器設(shè)備標(biāo)簽管理、檔案管理,按設(shè)備要求定

期進(jìn)行計(jì)量校準(zhǔn)及維護(hù)管理。

4.4.3開(kāi)展高通量基因測(cè)序的診斷機(jī)構(gòu)和醫(yī)院需嚴(yán)格按照《醫(yī)療器械監(jiān)督管理?xiàng)l例》和《醫(yī)療器械注

冊(cè)管理辦法》使用國(guó)家食品藥品管理總局(CFDA)獲批注冊(cè)的設(shè)備和試劑開(kāi)展高通量基因測(cè)序工作。

4.4.4涉及實(shí)驗(yàn)室自配試劑(LDT),需有嚴(yán)格的試劑制備標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程(SOP),需經(jīng)過(guò)臨床實(shí)驗(yàn)

室自建項(xiàng)目驗(yàn)證合格才可使用。LDT基于不同樣本類型的性能驗(yàn)證的指標(biāo)包括:精密度(批內(nèi)、批間)、

準(zhǔn)確度、分析靈敏度、分析特異性、可測(cè)量范圍、樣本穩(wěn)定性、試劑穩(wěn)定性、攜帶污染、參考范圍、臨

床診斷靈敏度、臨床診斷特異性。

4.5檢測(cè)項(xiàng)目管控

4.5.1檢測(cè)項(xiàng)目驗(yàn)證因素包括:建庫(kù)方法、測(cè)序平臺(tái)和分析工具以及不同的突變類型(包括單堿基突

變(singlenucleotidevariant,SNV)、小片段插入或者缺失(ins,del)、基因拷貝數(shù)變異(copynumber

variations,CNV)、染色體結(jié)構(gòu)變異(structuralvariation,SV))以及不同的樣本類型(如FFPE組織、

新鮮組織、全血、胸水等)。

4.5.2驗(yàn)證參數(shù)包括:目標(biāo)區(qū)域測(cè)序(panel)的準(zhǔn)確性、精確性、敏感性、特異性。

4.6人員要求

4.6.1高通量測(cè)序檢測(cè)技術(shù)人員需具備臨床病理學(xué)、分子生物學(xué)的相關(guān)專業(yè)大專以上學(xué)歷,需接受省

級(jí)衛(wèi)生計(jì)生行政部門(mén)組織的高通量基因測(cè)序技術(shù)培訓(xùn),或者省級(jí)衛(wèi)生計(jì)生行政部門(mén)頒發(fā)的培訓(xùn)合格證

書(shū);需具有臨檢中心《臨床基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室技術(shù)人員培訓(xùn)合格證》。

4.6.2數(shù)據(jù)分析人員需具有臨床醫(yī)學(xué)、分子生物學(xué)或遺傳學(xué)知識(shí)背景并經(jīng)生物信息學(xué)培訓(xùn)。

4.6.3實(shí)驗(yàn)室需依照《醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量和能力的專用要求》(ISO15189)進(jìn)行內(nèi)部人員周期性培訓(xùn)和

考核機(jī)制并制定文件化程序,保留相關(guān)記錄。

5測(cè)序流程

5.1測(cè)序前準(zhǔn)備

5.1.1醫(yī)師須自覺(jué)維護(hù)患者的權(quán)利,尊重患者的知情同意權(quán)和選擇權(quán),保護(hù)患者隱私。

5.1.2全面客觀宣教高通量測(cè)序在腫瘤中的應(yīng)用價(jià)值,優(yōu)缺點(diǎn)及可供選擇的高通量測(cè)序方案等。

5.1.3告知要點(diǎn)主要包括:

a)檢出率、假陽(yáng)性率。

b)該檢測(cè)有失敗的風(fēng)險(xiǎn),可能會(huì)重新檢測(cè),檢測(cè)周期變長(zhǎng)。

3

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c)告知該檢測(cè)的局限性。

d)檢測(cè)的種類、費(fèi)用和技術(shù)流程。

5.2標(biāo)本采集

5.2.1樣本類型

新鮮組織

在顯微鏡下確認(rèn)腫瘤細(xì)胞所占比例應(yīng)≥30%,壞死細(xì)胞所占比例應(yīng)≤10%,相關(guān)的病理檢測(cè)結(jié)果

保存?zhèn)洳?。樣本采集后立即放入液氮完全冷凍?80℃低溫保存,干冰運(yùn)輸。

石蠟組織/切片組織

10%中性福爾馬林固定手術(shù)標(biāo)本,按病理學(xué)操作規(guī)范進(jìn)行取材。5~10張石蠟包埋標(biāo)本切片,厚

度為5μm~10μm,用載玻片片盒或者離心管保存,常溫保存、運(yùn)輸。其中一片進(jìn)行HE染色,確認(rèn)腫

瘤細(xì)胞含量。活檢材料的固定時(shí)間一般是24小時(shí)以內(nèi)。

體液

體液中的腫瘤細(xì)胞用于基因檢測(cè)時(shí),需確認(rèn)腫瘤細(xì)胞,穿刺獲得胸腹水樣本提交給細(xì)胞病理檢查之

后,剩余液體冷藏/冷凍保存,或在含有細(xì)胞成分的離心沉淀中加入含有蛋白質(zhì)變性劑的緩沖液室溫保

存。

外周血

采集外周血提取血漿游離DNA進(jìn)行檢測(cè),取樣時(shí)需使用一次性密閉EDTA抗凝真空采血管,采集

6ml~10ml全血,冷藏運(yùn)輸,6小時(shí)內(nèi)分離血漿,提取游離DNA,保存到-80℃冰箱中,并避免反復(fù)凍融。

如外周血需長(zhǎng)時(shí)間運(yùn)輸,建議用商品化的游離DNA樣本保存管,在常溫條件下,cfDNA在全血中可穩(wěn)

定保存7天。

5.2.2采樣質(zhì)量評(píng)價(jià)

評(píng)價(jià)內(nèi)容

細(xì)胞組成、腫瘤細(xì)胞的數(shù)量,是否按照要求進(jìn)行處理與運(yùn)輸。

評(píng)價(jià)方法

.1包括肉眼觀察、顯微鏡下觀察和濃度分析等。

.2需經(jīng)病理醫(yī)師審閱,取一張切片HE染色后顯微鏡下觀察,確保腫瘤細(xì)胞存在,并記錄腫

瘤組織含量,標(biāo)注腫瘤細(xì)胞密集區(qū)域。腫瘤細(xì)胞比例在20%以上。

5.2.3樣本采集中的防污染

樣本采集需采用一次性材料。

采集中需注意防止污染,防止混入操作者的毛發(fā)、表皮細(xì)胞、痰液等。

玻璃器皿需高壓滅菌,以使可能存在的DNase失活。

制備不同患者病理切片樣本時(shí),需更換新刀片。

提取RNA樣品,需采用RNase抑制劑措施和無(wú)RNase材料。

4

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5.2.4樣本運(yùn)送和保存

采用唯一編號(hào)對(duì)樣本進(jìn)行編號(hào)。該編號(hào)應(yīng)當(dāng)與檢測(cè)報(bào)告中的樣本編號(hào)一致。

實(shí)驗(yàn)室應(yīng)建立詳細(xì)的樣本運(yùn)送標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程,對(duì)臨床醫(yī)生提供樣本采集手冊(cè),要求物流人員填

寫(xiě)相關(guān)運(yùn)送記錄表,確保運(yùn)送過(guò)程中樣本的安全性和過(guò)程的可控性。

樣本運(yùn)送和保存:用于DNA擴(kuò)增檢測(cè)的EDTA抗凝全血樣本及RNA檢測(cè)的樣本,需穩(wěn)定化

處理常溫運(yùn)送,或速凍后,置干冰中運(yùn)送。

5.2.5樣本提取

新鮮和凍存的手術(shù)組織樣本

采用常規(guī)的商品化DNA提取試劑盒。

活檢樣本

推薦使用能提取石蠟包埋組織微量DNA的試劑盒。

RNA提取

胍鹽提取結(jié)合酚-氯仿抽提,石蠟樣本或活檢樣本可使用商品化RNA提取試劑盒。細(xì)胞或組織的徹

底勻漿

5.2.6核酸純度評(píng)價(jià)

可用凝膠電泳將樣本的核酸提取物與核酸標(biāo)準(zhǔn)品比較測(cè)定;

a)DNA濃度控制在50ng/ul~100ng/ul,總量20μg~40μg或以上;A260/280在1.8~2.0

之間;

b)RNA溶于無(wú)RNase的純水中,建議濃度在100ng/ul以上,總量達(dá)30μg以上。

5.3測(cè)序流程

5.3.1文庫(kù)制備

文庫(kù)制備方法主要有雜交捕獲和擴(kuò)增子建庫(kù),應(yīng)對(duì)檢測(cè)基因、區(qū)域或突變熱點(diǎn)進(jìn)行描述,并建

立實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)SOP。

上機(jī)測(cè)序前需對(duì)文庫(kù)進(jìn)行質(zhì)量分析。每個(gè)檢測(cè)項(xiàng)目應(yīng)設(shè)定其文庫(kù)質(zhì)量的要求,明確接受或拒絕

的標(biāo)準(zhǔn)。

5.3.2測(cè)序儀上機(jī)檢測(cè)

測(cè)序主要有檢測(cè)氫離子釋放和熒光信號(hào)兩大技術(shù)平臺(tái)。

測(cè)序時(shí)根據(jù)檢測(cè)樣本量和質(zhì)量要求確定適當(dāng)?shù)男酒员WC測(cè)序質(zhì)量和靶區(qū)覆蓋深度。

錄入樣本編號(hào)、檢測(cè)內(nèi)容、設(shè)定參數(shù)等信息,按儀器操作流程進(jìn)行測(cè)序。

5.4生物信息分析

5.4.1分為兩個(gè)主要步驟:一是對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)控分析及過(guò)濾;二是對(duì)通過(guò)質(zhì)控的序列進(jìn)行變異位

點(diǎn)鑒定分析并注釋。

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5.4.2所用各種生物信息分析軟件,均需通過(guò)適量標(biāo)準(zhǔn)品測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行驗(yàn)證,證明所用軟件及參數(shù)可

達(dá)到臨床報(bào)告的要求。

5.4.3所有數(shù)據(jù)分析的軟件均需版本號(hào),版本更新后需要在SOP中進(jìn)行更新。

5.5檢測(cè)報(bào)告內(nèi)容

5.5.1檢測(cè)報(bào)告內(nèi)容

檢測(cè)報(bào)告內(nèi)容包括:

a)患者姓名、年齡、住院號(hào)、病區(qū)床號(hào)、送檢單位及送檢日期、臨床診斷等基本信息。

b)樣本編號(hào)、樣本種類、采樣日期和接收日期、樣本處理過(guò)程。

c)檢測(cè)項(xiàng)目、檢測(cè)方法、檢測(cè)設(shè)備、檢測(cè)結(jié)果及報(bào)告版本號(hào)。

c)檢測(cè)者、審核者及檢測(cè)時(shí)間。

5.5.2突變位點(diǎn)命名

基因突變命名

.1人類基因組突變學(xué)會(huì)(HGVS)已建立系統(tǒng)的基因突變命名方法。具體基因突變命名方法

可查閱網(wǎng)站/mutnomen/index.html。以最新版本為準(zhǔn)。

.2描述某一序列改變時(shí),前綴表明其參考序列類型。例如“g.”表示基因組序列,“c.”表示cDNA

序列,“m.”表示線粒體DNA序列,“r.”表示RNA序列,“p.”表示蛋白序列。

.3在數(shù)據(jù)庫(kù)中的收錄號(hào)以及版本號(hào)應(yīng)在實(shí)驗(yàn)報(bào)告中列出。

參考序列

.1序列參考美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心(NCBI)收錄的參考序列編碼。

.2前綴“NM_”表示為mRNA序列,“NP_”表示多肽序列,“NG_”表示基因組序列。

.3基因組參考序列應(yīng)列出完整基因序列,包括5'以及3'非編碼區(qū)(UTR)。

.4應(yīng)選擇合適的轉(zhuǎn)錄體,如最常見(jiàn)的轉(zhuǎn)錄體,或已知的最大轉(zhuǎn)錄體,或具有組織特異性的編輯

轉(zhuǎn)錄體,且明確起始轉(zhuǎn)錄點(diǎn)。

.5當(dāng)某一參考序列具有多種轉(zhuǎn)錄方式時(shí),選擇NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)里注釋最全面的版本。

DNA序列變異術(shù)語(yǔ)

.1DNA核苷酸用大寫(xiě)字母A(腺嘌呤)、C(胞嘧啶)、G(鳥(niǎo)嘌呤)以及T(胸腺嘧啶)來(lái)

表示。

.2用正鏈表示DNA序列。

.3當(dāng)DNA序列改變時(shí),以相應(yīng)核苷酸所在位置及相應(yīng)字母來(lái)描述?!?gt;”符號(hào)表示“從某一變化

至另一”。

.4在描述突變方式時(shí),數(shù)字、字母、箭頭、上標(biāo)以及下標(biāo)之間不應(yīng)出現(xiàn)空格。

RNA序列變異術(shù)語(yǔ)

.1RNA序列以小寫(xiě)字母a(腺嘌呤)、c(胞嘧啶)、g(鳥(niǎo)嘌呤)、u(尿嘧啶)進(jìn)行描述。

.2RNA序列改變描述方式與DNA相類似。

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蛋白質(zhì)序列變異術(shù)語(yǔ)

蛋白質(zhì)序列改變通常以單個(gè)字母或三個(gè)字母(第一個(gè)字母大寫(xiě))來(lái)描述。

錯(cuò)義突變及無(wú)義變異術(shù)語(yǔ)

.1由于三聯(lián)體密碼子的簡(jiǎn)并性,多個(gè)位點(diǎn)核苷酸的改變可能不影響最終氨基酸序列。因此,應(yīng)

分別從DNA水平和氨基酸水平描述突變。

.2從DNA水平對(duì)某一突變位點(diǎn)的描述方式包括堿基位點(diǎn),正常堿基,“>”符號(hào),突變堿基。

例如,某一蛋白第

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