![核酸合成 第1部分:合成寡核苷酸的生產(chǎn)和質(zhì)量控制要求-編制說明_第1頁(yè)](http://file4.renrendoc.com/view3/M02/13/2D/wKhkFmZdHOqAH1sZAAB-yH3Mo8o628.jpg)
![核酸合成 第1部分:合成寡核苷酸的生產(chǎn)和質(zhì)量控制要求-編制說明_第2頁(yè)](http://file4.renrendoc.com/view3/M02/13/2D/wKhkFmZdHOqAH1sZAAB-yH3Mo8o6282.jpg)
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文檔簡(jiǎn)介
《生物技術(shù)核酸合成第1部分:合成寡核苷酸的生產(chǎn)和質(zhì)量控制要求》
國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)編制說明
《生物技術(shù)核酸合成第1部分:合成寡核苷酸的生產(chǎn)和質(zhì)量控制要求》
標(biāo)準(zhǔn)起草組
2023年3月
1
一、工作簡(jiǎn)況
1任務(wù)來源
本項(xiàng)目根據(jù)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)化管理委員會(huì)于2022年4月22日下達(dá)的2022年第一批推薦性
國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)計(jì)劃的通知(國(guó)標(biāo)委綜合〔2022〕17號(hào)),本項(xiàng)目計(jì)劃編號(hào)為20220184-T-469,
名稱為生物技術(shù)核酸合成第1部分:合成寡核苷酸的生產(chǎn)和質(zhì)量控制要求,本標(biāo)準(zhǔn)等同
采用ISO20688-1:2020《生物技術(shù)核酸合成第1部分:合成寡核苷酸的生產(chǎn)和質(zhì)量控制
要求》。
本標(biāo)準(zhǔn)由全國(guó)生化檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)(SAC/TC387)提出并歸口。
本標(biāo)準(zhǔn)由_______________________等單位聯(lián)合起草。
2標(biāo)準(zhǔn)編制過程和主要工作過程
由核苷酸組成的單鏈線性生物聚合物被稱為“合成寡核苷酸”或“寡核苷酸”,是生
物技術(shù)必不可少的組成部分。廣泛用作聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增引物、微陣列、實(shí)時(shí)PCR
或下一代測(cè)序(NGS)捕獲探針技術(shù)中,同時(shí)是作為創(chuàng)建整個(gè)靶基因的輸入起始原料。
寡核苷酸質(zhì)量的好壞直接影響生物技術(shù)測(cè)量結(jié)果和試驗(yàn)進(jìn)程,寡核苷酸的生產(chǎn)質(zhì)量的
控制在寡核苷酸的合成中非常重要,直接決定寡核苷酸產(chǎn)品質(zhì)量的好壞。寡核苷酸的生產(chǎn)
必須對(duì)堿基數(shù)含量、分子量、堿基范圍、濃度和污染物進(jìn)行量化,以確保滿足最終的應(yīng)用
的質(zhì)量要求??紤]到寡核苷酸用于生物活性應(yīng)用,其質(zhì)量,特別是堿基序列和構(gòu)象,將影
響適應(yīng)性或功能,例如對(duì)同源結(jié)合位點(diǎn)的分子識(shí)別、化學(xué)行為。每個(gè)最終用途應(yīng)用有不同
的具體要求。本項(xiàng)目基于我國(guó)寡核苷酸合成的生產(chǎn)工藝、質(zhì)量控制、客戶需求等需求而建
立,擬研究建立通用的合成寡核苷酸的生產(chǎn)和質(zhì)量控制通用要求標(biāo)準(zhǔn),統(tǒng)一定義合成寡核
苷酸的常見質(zhì)量屬性,闡述寡核苷酸最終用途的量化和評(píng)估指標(biāo)。以幫助改進(jìn)寡核苷酸質(zhì)
量管理和提升寡核苷酸產(chǎn)品質(zhì)量水平,促進(jìn)和提升生物技術(shù)的測(cè)量水平,為生物安全檢測(cè)、
監(jiān)測(cè),產(chǎn)品符合性判定提供技術(shù)支撐,提高生物安全檢測(cè)監(jiān)測(cè)水平。
預(yù)研和起草階段:2022年4月,標(biāo)準(zhǔn)起草單位根據(jù)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)化管理委員會(huì)于2022年
4月22日下達(dá)的2022年第一批推薦性國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)計(jì)劃的通知(國(guó)標(biāo)委發(fā)〔2022〕17號(hào)文)
和全國(guó)生化檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)生檢標(biāo)〔2022〕16號(hào)文件《關(guān)于下達(dá)2022年第一批推
薦性國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)制修訂計(jì)劃的通知》立項(xiàng)文件的要求,成立了以中國(guó)測(cè)試技術(shù)研究院為牽
頭單位的標(biāo)準(zhǔn)起草工作組(以下簡(jiǎn)稱“工作組”),標(biāo)準(zhǔn)名稱《核酸合成第1部分:合成
3
寡核苷酸的生產(chǎn)和質(zhì)量控制要求》(計(jì)劃號(hào):20220184-T-469)。2022年5月,工作組按照
GB/T1.1-2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》、GB/T1.2-2020
《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第2部分:以ISO/IEC標(biāo)準(zhǔn)化文件為基礎(chǔ)的標(biāo)準(zhǔn)化文件起草規(guī)則》的
要求對(duì)ISO20688-1:2020標(biāo)準(zhǔn)的進(jìn)行翻譯校對(duì)工作。2023年3月,工作組在充分討論交
流的基礎(chǔ)上完成了標(biāo)準(zhǔn)初稿及編制說明的起草工作。2023年4月7日,完成了標(biāo)準(zhǔn)征求意
見稿及其編制說明。
二國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)編制原則和確定國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)主要內(nèi)容
1、標(biāo)準(zhǔn)編制原則
本標(biāo)準(zhǔn)依據(jù)GB/T1.1-2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》
和GB/T1.2-2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第2部分:以ISO/IEC標(biāo)準(zhǔn)化文件為基礎(chǔ)的標(biāo)準(zhǔn)化文件
起草規(guī)則》的要求進(jìn)行編制。
本項(xiàng)目等同采用ISO20688-1:2020標(biāo)準(zhǔn),擬規(guī)定合成寡核苷酸(名義上最多250個(gè)堿基)
的生產(chǎn)和質(zhì)量控制的一般要求。給出合成寡核苷酸的一般質(zhì)量特性指標(biāo)以及評(píng)估質(zhì)量特性
指標(biāo)的常用方法。適用于寡核苷酸生產(chǎn)商的生產(chǎn)和質(zhì)量控制,采購(gòu)方對(duì)合成寡核苷酸質(zhì)量
驗(yàn)收也可參考使用:
主要內(nèi)容包括:1)寡核苷酸的一般質(zhì)量管理要求;2)寡核苷酸生產(chǎn)的設(shè)施設(shè)備和環(huán)
境條件控制要求;3)寡核苷酸的生產(chǎn)工藝的要求;4)寡核苷酸的質(zhì)量控制過程要求;5)
合成寡核苷酸附加要求。
2、確定國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)主要內(nèi)容
本標(biāo)準(zhǔn)全文分為11章和5個(gè)附錄。標(biāo)準(zhǔn)的主要內(nèi)容如表1所示:
表1本標(biāo)準(zhǔn)的主要內(nèi)容
章條名稱內(nèi)容簡(jiǎn)要
規(guī)定了合成寡核苷酸(通常最多250個(gè)堿基)的生產(chǎn)和質(zhì)量控
1范圍制的最低要求。還描述了合成寡核苷酸的一般質(zhì)量屬性以及評(píng)
估質(zhì)量屬性的常用方法。
2規(guī)范性引用文件無。
對(duì)有證標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)、性能、純度、標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)、寡核苷酸等術(shù)語(yǔ)進(jìn)
3術(shù)語(yǔ)和定義
行了定義。
寡核苷酸的設(shè)計(jì)和選
4不同用途的寡核苷酸合成的質(zhì)量和一致性要求不同。
擇
4
從寡核苷酸分級(jí)、質(zhì)量控制文件、質(zhì)量管理體系、人員和培訓(xùn)、
5一般質(zhì)量管理要求
安全控制方面對(duì)生產(chǎn)商做了要求。
規(guī)定來了生產(chǎn)者應(yīng)當(dāng)對(duì)可能影響合成寡核苷酸質(zhì)量的原料(包
6資源管理
括試劑、純水和輔助材料)進(jìn)行質(zhì)量控制。
7生產(chǎn)工藝要求合成寡核苷酸的過程及其要求。
合成的寡核苷酸應(yīng)選擇適當(dāng)?shù)姆椒▽?duì)其指標(biāo)進(jìn)行驗(yàn)證,如與預(yù)
8質(zhì)量控制過程要求期用途有關(guān)的特性、純度、雜質(zhì)、定量、其摩爾質(zhì)量和/或堿基
長(zhǎng)度、退火溫度、報(bào)告等。
合成寡核苷酸的附加
9合成RNA的一些附加要求。
要求
10附錄A規(guī)范性附錄,過程檢查表
裝置和設(shè)備清單及其控制標(biāo)準(zhǔn),適合生產(chǎn)合成寡核苷酸的設(shè)備
11附錄B
和儀器示例
12附錄C摩爾質(zhì)量和摩爾數(shù)的計(jì)算
13附錄D采用質(zhì)量分析法驗(yàn)證寡核苷酸序列
14附錄E采用經(jīng)過認(rèn)證的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)對(duì)測(cè)量?jī)x器的精度進(jìn)行控制-示例
3、主要技術(shù)差異
本項(xiàng)目等同采用ISO20688-1:2020《生物技術(shù)核酸合成第1部分:合成寡核苷酸的
生產(chǎn)和質(zhì)量控制要求》,與ISO20688-1:2020無技術(shù)差異。
4、標(biāo)準(zhǔn)解決的主要問題
隨著合成生物技術(shù)向工業(yè)領(lǐng)域的快速滲透,生物能源、生物化工和生物醫(yī)藥等應(yīng)用
領(lǐng)域均提出了日益迫切的大規(guī)模寡核苷酸合成需求。工業(yè)化寡核苷酸合成的完整流程從接
收序列開始到交付產(chǎn)品結(jié)束,是一個(gè)涉及生物信息學(xué)、化學(xué)、分子生物學(xué)、自動(dòng)化等多學(xué)
科的過程,由各個(gè)學(xué)科力量組成的團(tuán)隊(duì)需要齊心協(xié)力,將整個(gè)工作流程從小規(guī)模制備轉(zhuǎn)變
為工業(yè)高通量制造。
實(shí)現(xiàn)高通量并行和高質(zhì)量規(guī)?;a(chǎn)的基礎(chǔ)是標(biāo)準(zhǔn)化和自動(dòng)化。標(biāo)準(zhǔn)化涉及實(shí)驗(yàn)步
驟、試劑耗材、反應(yīng)條件等多個(gè)方面。本項(xiàng)目研究擬解決的關(guān)鍵問題是:為降低自動(dòng)化整
合門檻,需對(duì)生產(chǎn)流程進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化分解,分解為可定義、可管理、可獨(dú)立實(shí)施和控制、可
重復(fù)、小而明確的操作步驟。工業(yè)規(guī)模和實(shí)驗(yàn)室規(guī)模的寡核苷酸合成之間的差異,不僅僅
體現(xiàn)在高通量合成技術(shù)的迭代和高性能合成裝備的開發(fā)與應(yīng)用,更重要的是需要針對(duì)工藝
規(guī)范和標(biāo)準(zhǔn),對(duì)技術(shù)進(jìn)行合理的分解、整合和運(yùn)用,對(duì)每個(gè)操作步驟進(jìn)行調(diào)整,進(jìn)而達(dá)到
對(duì)合成寡核苷酸生產(chǎn)工藝和質(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn)化。
5
三、主要試驗(yàn)(或驗(yàn)證)情況
現(xiàn)今,絕大部分短鏈寡核苷酸是利用固相亞磷酰胺化學(xué)法進(jìn)行合成;其具體過程由4
步循環(huán)組成,分別為:脫保護(hù)、偶聯(lián)、氧化和蓋帽;如下圖所示每一個(gè)循環(huán)生成一個(gè)新的
寡核苷酸。
圖片來源:THERAPEUTICOLIGONUCLEOTIDES,IMPURITIES,DEGRADANTS,ANDTHEIRCHARACTERIZATIONBY
MASSSPECTROMETRY
本項(xiàng)目等同采用ISO20688-1:2020標(biāo)準(zhǔn),擬規(guī)定合成寡核苷酸(名義上最多250個(gè)堿
基)的生產(chǎn)和質(zhì)量控制的一般要求。給出合成寡核苷酸的一般質(zhì)量特性指標(biāo)以及評(píng)估質(zhì)量
特性指標(biāo)的常用方法。適用于寡核苷酸生產(chǎn)商的生產(chǎn)和質(zhì)量控制,采購(gòu)方對(duì)合成寡核苷酸
質(zhì)量驗(yàn)收也可參考使用。本標(biāo)準(zhǔn)與現(xiàn)行相關(guān)法律、法規(guī)、規(guī)章及相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)協(xié)調(diào)一致。本項(xiàng)
目與現(xiàn)行有效的標(biāo)準(zhǔn)沒有沖突,配套使用。項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)對(duì)主要技術(shù)指標(biāo)進(jìn)行了試驗(yàn)驗(yàn)證,以
下列出了部分技術(shù)指標(biāo)的試驗(yàn)驗(yàn)證結(jié)果。
3.1應(yīng)用于編碼化合物、二代測(cè)序建庫(kù)等領(lǐng)域,長(zhǎng)度范圍在9nt–17nt的單鏈DNA的驗(yàn)
證
主要驗(yàn)證指標(biāo)包括:總量、堿基準(zhǔn)確度、純度等指標(biāo)。
3.1.1關(guān)鍵指標(biāo)概述
鑒于DNA編碼化合物庫(kù)的市場(chǎng)需求與標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范的不匹配,項(xiàng)目組在前期的研究基礎(chǔ)
上,結(jié)合對(duì)輝瑞、羅氏、GSK、阿斯利康、先導(dǎo)藥業(yè)、華大基因等在內(nèi)的全球領(lǐng)先的應(yīng)用
公司,通用生物、先導(dǎo)藥業(yè)、金唯智、百力格等磷酸化標(biāo)記核酸合成公司調(diào)研研討。主要
6
內(nèi)容論據(jù)如下:
3.1.1.1磷酸化標(biāo)記核酸的總量檢測(cè)
5’磷酸化標(biāo)記核酸上下鏈,可通過堿基互補(bǔ)原則在高溫下變性形成雙鏈,上下鏈比例
對(duì)雙鏈的形成至關(guān)重要。若上下鏈濃度差異較大,會(huì)導(dǎo)致剩余單鏈無法互補(bǔ)配對(duì),雙鏈濃
度較低;因此,對(duì)5’磷酸化標(biāo)記核酸進(jìn)行總量檢測(cè)具有重要意義。然而,合成的磷酸化標(biāo)
記核酸重量極輕難以稱量。因核酸在260nm處存在特征吸收峰,利用朗伯比爾定律可對(duì)
合成的磷酸化標(biāo)記核酸進(jìn)行濃度測(cè)定。
3.1.1.2磷酸化標(biāo)記核酸的相對(duì)分子質(zhì)量的檢測(cè)
定制序列的磷酸化標(biāo)記核酸,用于構(gòu)建DNA編碼化合物庫(kù),在高通量測(cè)序技術(shù)下快
速高效篩選出先導(dǎo)化合物。近十年來,通過化學(xué)合成來獲得高通量磷酸化標(biāo)記核酸成為主
流手段;因此,合成的定制的磷酸化標(biāo)記核酸序列的堿基準(zhǔn)確度、堿基缺失率是DNA編
碼化合物庫(kù)的基礎(chǔ)。采用ESI源電離噴霧技術(shù)的液質(zhì)聯(lián)用儀可通過質(zhì)核比分離測(cè)得定制序
列的相對(duì)分子量,從而快速、高效、準(zhǔn)確地判斷定制的磷酸化標(biāo)記核酸序列的堿基準(zhǔn)確度、
堿基缺失率。
1)相對(duì)分子質(zhì)量的理論計(jì)算:
H2G2-00865-1的序列為ATCAACACGGT,5'為磷酸化標(biāo)記,其分子量計(jì)算如下:
M=(#dA×313.20)+(#dC×289.17)+(#dG×329.9)+(#dT×304.18)+Pho-62
=(4×313.20)+(3×289.17)+(2×329.9)+(2×304.18)+80-62=3408.47
2)質(zhì)譜測(cè)定相對(duì)分子質(zhì)量
采用ESI源電離噴霧技術(shù),負(fù)離子模式將樣品轉(zhuǎn)化為運(yùn)動(dòng)的帶電氣態(tài)離子碎皮,按質(zhì)
荷比(m/z)大小分離記錄,通過換算測(cè)得相對(duì)分子質(zhì)量。
流動(dòng)相配制參照取2μL1mmol/L磷酸化標(biāo)記引物原液+100μL水,置于進(jìn)樣器中,設(shè)
置盡量20μL。點(diǎn)擊儀器開始按鈕進(jìn)行自動(dòng)檢測(cè),并通過質(zhì)譜分析軟件對(duì)目標(biāo)引物分子量測(cè)
量結(jié)果進(jìn)行分析,檢測(cè)結(jié)果如表2:
表2磷酸化標(biāo)記核酸質(zhì)譜數(shù)據(jù)
序理論分子實(shí)測(cè)分子平均分子
樣本名稱序列5'修飾相對(duì)誤差
號(hào)量量量
A1H2G2-00865-1ATCAACACGGTPho3408.473406.30.064%
3405.5±
A2H2G2-00865-1ATCAACACGGTPho3408.473405.90.075%
0.80
A3H2G2-00865-1ATCAACACGGTPho3408.473404.40.120%
示例:H2G2-00865-1(DSL級(jí))的MASS結(jié)果如下:
7
結(jié)論:質(zhì)譜實(shí)測(cè)相對(duì)分子質(zhì)量與理論相對(duì)分子質(zhì)量的相對(duì)誤差(DSL級(jí))≤0.05%,
符合標(biāo)準(zhǔn)要求。
3.1.1.3磷酸化標(biāo)記核酸的純度檢測(cè)
對(duì)于定制序列的磷酸化標(biāo)記核酸而言,相對(duì)分子量檢測(cè)是定性檢測(cè),用于判斷堿基準(zhǔn)
確度;而純度檢測(cè)是定量檢測(cè),用于判斷合成的磷酸化標(biāo)記核酸中含有百分之幾的目標(biāo)序
列。因此,磷酸化標(biāo)記核酸的純度檢測(cè)也是DNA編碼化合物庫(kù)建庫(kù)實(shí)驗(yàn)的重要因素???/p>
采用高效液相色譜儀、毛細(xì)管電泳/平板電泳、質(zhì)譜、測(cè)序等方法對(duì)磷酸化標(biāo)記核酸的純度
進(jìn)行檢測(cè),可有效判斷并控制磷酸化標(biāo)記核酸的純度,為DNA編碼化合物庫(kù)建庫(kù)實(shí)驗(yàn)建
立前提條件。
采用液相色譜-質(zhì)譜法,ESI源電離噴霧技術(shù),負(fù)離子模式將樣品轉(zhuǎn)化為運(yùn)動(dòng)的帶電氣
態(tài)離子碎片,按質(zhì)荷比(m/z)大小分離并記錄。計(jì)算目標(biāo)峰面積占所有峰面積的比值得
出純度,見表3。
表3磷酸化標(biāo)記核酸質(zhì)譜數(shù)據(jù)
序號(hào)樣本名稱理論分子量實(shí)測(cè)分子量相對(duì)誤差質(zhì)譜純度
A1H2G2-00865-13408.473406.30.064%94.34%
A2H2G2-00865-13408.473405.90.075%94.27%
A3H2G2-00865-13408.473404.40.120%94.31%
示例:H2G2-00865-1(DSL級(jí))的MASS結(jié)果如下:
8
結(jié)論:質(zhì)譜純度(DSL級(jí))>85%,符合指標(biāo)要求。
3.1.2關(guān)鍵指標(biāo)、方法和要求的建立
根據(jù)市場(chǎng)需求及與相關(guān)利益方的討論,在前期研究和相關(guān)利益方廣泛調(diào)研溝通的基礎(chǔ)
上,經(jīng)過反復(fù)討論研究,對(duì)能體現(xiàn)磷酸化標(biāo)記核酸的技術(shù)參數(shù)和指標(biāo)、表征檢測(cè)方法及相
關(guān)要求進(jìn)行了確定。項(xiàng)目擬綜合紫外可見分光光度、高效液相色譜法、液質(zhì)聯(lián)用法、基因
測(cè)序法等多種生化檢測(cè)方法,各方法均為現(xiàn)行主流方法,項(xiàng)目組對(duì)各方法進(jìn)行方法學(xué)研究,
表4列出了經(jīng)討論研究后的磷酸化標(biāo)記核酸的檢測(cè)方法、技術(shù)參數(shù)和技術(shù)要求。
表4磷酸化標(biāo)記核酸測(cè)定指標(biāo)及技術(shù)要求
待測(cè)樣品指標(biāo)測(cè)定方法/儀器要求
總量(mmol/L)紫外分光光度計(jì)1.00mmol/L±0.15mmol/L
LC-MS偏差≤0.05%
堿基準(zhǔn)確度
基因測(cè)序儀與定制序列一致
OD260/OD280:1.7~1.9
紫外吸收強(qiáng)度紫外分光光度計(jì)
OD/OD>1.7
純度260230
HPLC純度HPLC儀≥85%
磷酸化標(biāo)記
相對(duì)分子質(zhì)量LC-MS≥85%
核酸
堿基缺失完全匹配度基因測(cè)序<5%
率相對(duì)分子質(zhì)量LC-MS偏差≤0.05%
紫外吸收強(qiáng)度分光光度計(jì)±15%(不含等于)
上下鏈濃
質(zhì)譜峰強(qiáng)度比LC-MS>20%
度差
化合物間濃度差紫外分光光度計(jì)偏差≤25%
脫磷酸化
相對(duì)分子質(zhì)量LC-MS偏差<5%
產(chǎn)物
3.2應(yīng)用于基因擴(kuò)增、文庫(kù)構(gòu)建等領(lǐng)域,長(zhǎng)度范圍原則上在2個(gè)至30個(gè)核苷酸的引物探針
的驗(yàn)證
3.2.1廠家調(diào)研
通過查閱國(guó)內(nèi)外標(biāo)準(zhǔn)、產(chǎn)品說明書、分析報(bào)告(COA報(bào)告)以及對(duì)實(shí)際樣品檢測(cè)分
9
析,對(duì)引物、探針以及相關(guān)試劑盒等的參數(shù)和指標(biāo)進(jìn)行了調(diào)研。發(fā)現(xiàn)各個(gè)廠家合成的引物
探針的各參數(shù)相差不大,基本要通過質(zhì)譜檢測(cè)。但國(guó)內(nèi)對(duì)引物探針還沒有一個(gè)公認(rèn)的統(tǒng)一
評(píng)價(jià)方法,尚無技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)可以依據(jù),對(duì)指標(biāo)要求尚不明確,各生產(chǎn)商根據(jù)生產(chǎn)、經(jīng)營(yíng)和品
牌宣傳的需要,在參數(shù)和指標(biāo)上各成系統(tǒng),對(duì)特異性等關(guān)鍵指標(biāo)并未進(jìn)行標(biāo)識(shí)。國(guó)內(nèi)外有
許多公司如華大基因、上海生工、TAKARA、Invitrogen公司等都能合成引物探針,有一
套比較完善、嚴(yán)格的產(chǎn)品質(zhì)量監(jiān)控體系,會(huì)給用戶出具合成報(bào)告單,報(bào)告中會(huì)明確列出各
項(xiàng)指標(biāo)參數(shù)。但各合成商隨產(chǎn)品的說明書中規(guī)定的參數(shù)也不統(tǒng)一,使得產(chǎn)品質(zhì)量狀況參差
不齊,缺乏一個(gè)統(tǒng)一判定標(biāo)準(zhǔn),因此,為了規(guī)范引物探針的質(zhì)量以及維護(hù)市場(chǎng)秩序很有必
要制定引物探針測(cè)定相關(guān)的通用標(biāo)準(zhǔn)。
3.2.2引物探針質(zhì)量指標(biāo)的建立
項(xiàng)目組查閱了國(guó)內(nèi)外標(biāo)準(zhǔn)、企業(yè)標(biāo)準(zhǔn)、分析報(bào)告(COA報(bào)告),分別咨詢了上海生工、
寶生物、invitrogen公司、金唯智、華大基因等主要引物探針合成商,并進(jìn)行了有效溝通交
流,對(duì)各個(gè)廠商合成的報(bào)告單、產(chǎn)品說明書、質(zhì)檢報(bào)告中引物探針的參數(shù)和指標(biāo)及相關(guān)信
息進(jìn)行了匯總整理研究,合成產(chǎn)品的合成報(bào)告單上信息包括30余種,各廠商標(biāo)注都不同,
知名廠商和部分小廠商標(biāo)注信息差異較大,詳見表5。除上海生工發(fā)布了企業(yè)標(biāo)準(zhǔn)以外,
未見統(tǒng)一的國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)或規(guī)范。從匯總整理研究結(jié)果可知,引物探針信息大致可以分為四類:
一是基本信息,二是技術(shù)信息,三是特殊信息,四是其他信息。基本信息包括:OrderNo.、
LotNo.、Date、PrimerName等;技術(shù)信息包括:Sequence(5′to3′)、Purification、質(zhì)譜報(bào)
告等;特殊信息主要指修飾信息;其他信息是個(gè)別廠商標(biāo)注的一些相關(guān)信息。項(xiàng)目組根據(jù)
使用說明書和咨詢交流結(jié)果,同時(shí)對(duì)實(shí)際樣品檢測(cè)分析,綜合實(shí)驗(yàn)效果,研究確立了核酸
引物探針質(zhì)量控制技術(shù)關(guān)鍵指標(biāo)參數(shù),包括Sequence(5′to3′)、Purification、Modification
等18個(gè)指標(biāo),詳見表6。
表5主要引物探針合成廠商合成報(bào)告單信息一覽表
序信息上海華大成都
報(bào)告信息上海生工invitrogen金唯智寶生物
號(hào)類別基康基因擎科
1OrderNo.√√√√√√√
2LotNo.√√√√√√√
3Date√√√√√√
基本
4PrimerName√√√√√√√
信息
5PrimerLength√√√√√
6OD′s√√√√√√
7ug′s/OD√√√
10
8ug′s√√√√√
9nmoles/OD√√√√
10nmoles√√√√
MW(ug/umole)/
11√√√√√√√
(g/mole)
12Package√√√√√√
13保存信息√√√√
14Sequence(5′to3′)√√√√√√√
15%GC√√√√√√√
16Tm√√√√√√
技術(shù)
17Tm(1MNa+)√
信息
18Tm(50mMNa+)√
19Purification√√√√√√
20配制方法及相應(yīng)濃度√√√√√√
21Modification√√√√√√
22ModificationMW√
23特殊AggregateMW√√
信息MillimolarExtincion
24√
Coeff.(OD/umoles)
25CouplingEff.√√
26ODperVial√
ScaleofSynthesis
27其他√√
(nmole)
信息
28Basecomposition√
29nmoles/tube√
表6核酸引物探針關(guān)鍵指標(biāo)一覽表
序號(hào)指標(biāo)類型關(guān)鍵指標(biāo)測(cè)試方法
1OrderNo./
2LotNo./
3Date/
4基本指標(biāo)PrimerName/
5PrimerLength直接計(jì)算
6OD's分光光度法
7ug's根據(jù)OD數(shù)計(jì)算得出
11
8nmoles根據(jù)質(zhì)量數(shù)和相對(duì)分子量計(jì)算得出
9MW(ug/umole)/(g/mole)公式計(jì)算得出,MS測(cè)定驗(yàn)證
10Package/
11保存信息/
12Sequence(5'-3')根據(jù)訂單和相對(duì)分子量推算
13%GC根據(jù)序列計(jì)算得出
14技術(shù)指標(biāo)Tm根據(jù)公式計(jì)算得出或檢測(cè)Na+濃度推算得出
15PurificationPAGE,HPLC測(cè)定
16配制方法及相應(yīng)濃度/
17特殊指標(biāo)Modification吸收光譜法測(cè)定
18其他指標(biāo)補(bǔ)充指標(biāo)/
3.2.3引物探針質(zhì)量指標(biāo)的驗(yàn)證
3.2.3.1引物探針的相對(duì)分子質(zhì)量的檢測(cè)
1)相對(duì)分子質(zhì)量的理論計(jì)算:
MON863上游引物序列為GTAGGATCGGAAAGCTTGGTAC,其分子量計(jì)算如下:
M=(#dA×313.20)+(#dC×289.17)+(#dG×329.2)+(#dT×304.18)-62+1
=(6×313.20)+(3×289.17)+(8×329.2)+(5×304.18)-62+1=6840.21
MON863探針序列為TGAACACCCATCCGAACAAGTAGGGTCA,5'修飾6-FAM,3'修飾BHQ1,其
分子量計(jì)算如下:
M=(#dA×313.20)+(#dC×289.17)+(#dG×329.2)+(#dT×304.18)+(6-FAM)+BHQ1-62+1
=(10×313.20)+(8×289.17)+(6×329.2)+(4×304.18)+537.5+554.60-62+1=9668.38
2)質(zhì)譜測(cè)定相對(duì)分子質(zhì)量
采用ESI源電離噴霧技術(shù),負(fù)離子模式下將樣品轉(zhuǎn)化為運(yùn)動(dòng)的帶電氣態(tài)離子碎片,與
磁場(chǎng)中按質(zhì)核比(m/z)大小分離并記錄,通過換算測(cè)得相對(duì)分子量。測(cè)定條件如下:流
動(dòng)相配制參見表7。
表7流動(dòng)相A、流動(dòng)相B配制
流動(dòng)相A0.075%HFIPA0.0375%DIEA10μmol/LEDTA
990mL一級(jí)水
(以1L計(jì)算)(750μL)(375μL)10mL
流動(dòng)相B0.075%HFIPA0.0375%DIEA10μmol/LEDTA800mLACN
(以1L計(jì)算)(750μL)(375μL)10mL一級(jí)水190mL
柱溫:40℃;
色譜柱:XBridgeOligonucleotideBEHC18Column,130?,2.5μm,4.6mmX50mm;
12
流速:0.3mL/min;
梯度洗脫:流動(dòng)相B從5%到30%,15min;
質(zhì)譜條件:采用Agilent1200-G6210液質(zhì)聯(lián)用飛行時(shí)間質(zhì)譜儀(TOF);
毛細(xì)管電壓:4000V;
霧化氣壓力:40psi;
霧化氣溫度:350℃;
碎裂電壓:150V;
霧化氣:氮?dú)狻?/p>
3)測(cè)定結(jié)果
根據(jù)實(shí)驗(yàn)要求及引物探針合成原理,測(cè)得的引物探針相對(duì)分子量(MW)與定制序列
MW值作比較,相對(duì)誤差在0.05%內(nèi)視為合格產(chǎn)品。即采用測(cè)得的相對(duì)分子量與理論的相
對(duì)分子量相對(duì)誤差應(yīng)小于等于0.05%。有修飾基團(tuán)的應(yīng)考慮修飾基團(tuán)相對(duì)分子量。
檢測(cè)結(jié)果如表8,質(zhì)譜圖見圖1-2:
表8引物探針質(zhì)譜數(shù)據(jù)
理論分實(shí)測(cè)分相對(duì)誤
序號(hào)樣本名稱序列修飾
子量子量差
MON863
A1GTAGGATCGGAAAGCTTGGTAC/6840.216836.50.05%
-F
MON863TGAACACCCATCCGAACAAGTAG5'6-FAM,
A29668.389665.10.03%
-PGGTCA3'BHQ1
13
圖1引物MON863-F的質(zhì)譜圖
圖2探針MON863-P的質(zhì)譜圖
結(jié)論:質(zhì)譜實(shí)測(cè)相對(duì)分子質(zhì)量與理論相對(duì)分子質(zhì)量的相對(duì)誤差≤0.05%,符合標(biāo)準(zhǔn)要
求。
3.2.3.2引物探針的PCR擴(kuò)增結(jié)果
使用合成的引物探針MON863(FAM-BHQ1)進(jìn)行qPCR擴(kuò)增,制作標(biāo)準(zhǔn)曲線。從圖
3和圖4中可以看出,擴(kuò)增效率在95%以上,線性R2=1.000,合成的引物探針符合要求。
14
圖3qPCR擴(kuò)增曲線
圖4qPCR擴(kuò)增標(biāo)準(zhǔn)曲線
15
四、標(biāo)準(zhǔn)中涉及專利的情況
本標(biāo)準(zhǔn)不涉及專利問題。
五、預(yù)期達(dá)到的社會(huì)效益、對(duì)產(chǎn)業(yè)發(fā)展的作用等情況
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)技術(shù)、基因芯片技術(shù)等已經(jīng)被廣泛運(yùn)用于生物學(xué)各個(gè)基礎(chǔ)研究
領(lǐng)域和輔助臨床診斷。其中,PCR技術(shù)是各生物實(shí)驗(yàn)室的通用基礎(chǔ)技術(shù),特別是熒光定量
PCR技術(shù)廣泛應(yīng)用于轉(zhuǎn)基因檢測(cè)、物種鑒定等;基于核酸雜交技術(shù)的基因芯片平臺(tái),具有
通量高和應(yīng)用群體大的特點(diǎn),已形成巨大的生物產(chǎn)業(yè),成為近20年來生物學(xué)領(lǐng)域的最強(qiáng)
有力研究工具之一;核酸捕獲芯片可快速捕獲人類全外顯子區(qū)域或其他數(shù)M長(zhǎng)度堿基,其
正與高通量測(cè)序技術(shù)結(jié)合繼續(xù)推動(dòng)著生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的發(fā)展;SNP芯片,特別是人類SNP
芯片已成為全基因組關(guān)聯(lián)分析研究糖尿病腫瘤等復(fù)雜疾病致病基因強(qiáng)大工具。因此,PCR
技術(shù)和基因芯片技術(shù)等分子技術(shù)的作用和重要性是毋庸置疑的。
寡核苷酸是用于PCR反應(yīng)、測(cè)序、基因芯片等技術(shù)的關(guān)鍵、核心物質(zhì),其質(zhì)量的好壞
直接影響實(shí)驗(yàn)和診斷結(jié)果。雖然,目前可通過基于多序列比對(duì)方式來設(shè)計(jì)合適的候選寡核
苷酸,能夠減少引物與模板DNA的錯(cuò)誤匹配,提高反應(yīng)的有效性。但應(yīng)用廣泛的染色體
定位,組織原位雜交,Northern雜交,Southern雜交等技術(shù),由于單個(gè)樣品操作數(shù)目少,
初始樣品多樣化,目標(biāo)片段特性多樣化等原因,目前市場(chǎng)上只有引物探針試劑盒產(chǎn)品,沒
有關(guān)于寡核苷酸質(zhì)量評(píng)價(jià)和檢測(cè)方法相關(guān)標(biāo)準(zhǔn),更未形成合成寡核苷酸的工藝要求,也未
產(chǎn)生成熟的標(biāo)準(zhǔn)化產(chǎn)業(yè)模式。而已形成巨大生物產(chǎn)業(yè)的基因平臺(tái),精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)產(chǎn)業(yè),基本被
幾個(gè)大的國(guó)外公司壟斷,各公司都有自己的質(zhì)量評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)和檢測(cè)方法,尚處于無標(biāo)可依狀
態(tài)。寡核苷酸生產(chǎn)和質(zhì)量控制的研究有利于提高寡核苷酸質(zhì)量,促進(jìn)分子診斷原料國(guó)產(chǎn)化
和標(biāo)準(zhǔn)化進(jìn)程,促進(jìn)生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)發(fā)展,在國(guó)際市場(chǎng)具有一定的競(jìng)爭(zhēng)力。
六、采用國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)和國(guó)外先進(jìn)標(biāo)準(zhǔn)的程度,以及與國(guó)際、國(guó)外同類標(biāo)準(zhǔn)水平
的對(duì)比情況,或與測(cè)試的國(guó)外樣品、樣機(jī)的有關(guān)數(shù)據(jù)對(duì)比情況
本標(biāo)準(zhǔn)等同采用ISO20688-1:2020《生物技術(shù)核酸合成第1部分:合成寡核苷酸的
生產(chǎn)和質(zhì)量控制要求》,與ISO20688-1:2020無技術(shù)差異。
16
七、在標(biāo)準(zhǔn)體系中的位置,與現(xiàn)行相關(guān)法律、法規(guī)及標(biāo)準(zhǔn),特別是強(qiáng)制性標(biāo)
準(zhǔn)的協(xié)調(diào)性
本專業(yè)領(lǐng)域的標(biāo)準(zhǔn)體系框架如圖:
本標(biāo)準(zhǔn)屬于生化檢測(cè)專用方法標(biāo)準(zhǔn)中33-00的生物分析方法類的33-01核酸檢測(cè)小
類。
本標(biāo)準(zhǔn)與現(xiàn)行相關(guān)法律、法規(guī)、規(guī)章及相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)協(xié)調(diào)一致。
本標(biāo)準(zhǔn)與現(xiàn)行有效的標(biāo)準(zhǔn)沒有沖突,配套使用。
八、重大分歧意見的處理經(jīng)過和依據(jù)
無重大分歧意見。
17
九、標(biāo)準(zhǔn)性質(zhì)的建議
建議本標(biāo)準(zhǔn)為推薦性國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)。
十、貫徹國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)的要求和措施建議(包括組織措施、技術(shù)措施、過渡辦法
等內(nèi)容)
1)首先應(yīng)在實(shí)施前保證標(biāo)準(zhǔn)文本的充足供應(yīng),使每個(gè)寡核苷酸生產(chǎn)廠商、研究單位
以及檢測(cè)機(jī)構(gòu)等都能及時(shí)獲得本標(biāo)準(zhǔn)文本,這是保證新標(biāo)準(zhǔn)貫徹實(shí)施的基礎(chǔ)。
2)本次制定的標(biāo)準(zhǔn),不僅與寡核苷酸相關(guān)產(chǎn)品研制企業(yè)有關(guān),而且與研究院所、檢
測(cè)機(jī)構(gòu)、醫(yī)藥生產(chǎn)等相關(guān)。對(duì)于標(biāo)準(zhǔn)使用過程中容易出現(xiàn)的疑問,起草單位有義務(wù)進(jìn)行
必要的解釋。
3)可以針對(duì)標(biāo)準(zhǔn)使用的不同對(duì)象,如生產(chǎn)企業(yè)、質(zhì)量監(jiān)管等相關(guān)部門,有側(cè)重點(diǎn)地
進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)的培訓(xùn)和宣貫,以保證標(biāo)準(zhǔn)的有效貫徹執(zhí)行。
4)建議本標(biāo)準(zhǔn)批準(zhǔn)發(fā)布即實(shí)施。
十一、廢止現(xiàn)行有關(guān)標(biāo)準(zhǔn)的建議
無。
十二、其他應(yīng)予說明的事項(xiàng)。
無。
《核酸靶序列定量qPCR法和dPCR法的性能評(píng)價(jià)要求》標(biāo)準(zhǔn)起草組
2023年4月
18
目錄
一、工作簡(jiǎn)況3
二國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)編制原則和確定國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)主要內(nèi)容4
三、主要試驗(yàn)(或驗(yàn)證)情況;5
四、標(biāo)準(zhǔn)中涉及專利的情況16
五、預(yù)期達(dá)到的社會(huì)效益、對(duì)產(chǎn)業(yè)發(fā)展的作用等情況16
六、采用國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)和國(guó)外先進(jìn)標(biāo)準(zhǔn)的程度,以及與國(guó)際、國(guó)外同類標(biāo)準(zhǔn)水平的對(duì)比情況,或與測(cè)試的國(guó)
外樣品、樣機(jī)的有關(guān)數(shù)據(jù)對(duì)比情況16
七、在標(biāo)準(zhǔn)體系中的位置,與現(xiàn)行相關(guān)法律、法規(guī)及標(biāo)準(zhǔn),特別是強(qiáng)制性標(biāo)準(zhǔn)的協(xié)調(diào)性17
八、重大分歧意見的處理經(jīng)過和依據(jù)17
九、標(biāo)準(zhǔn)性質(zhì)的建議18
十、貫徹國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)的要求和措施建議(包括組織措施、技術(shù)措施、過渡辦法等內(nèi)容)18
十一、廢止現(xiàn)行有關(guān)標(biāo)準(zhǔn)的建議18
十二、其他應(yīng)予說明的事項(xiàng)。18
2
一、工作簡(jiǎn)況
1任務(wù)來源
本項(xiàng)目根據(jù)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)化管理委員會(huì)于2022年4月22日下達(dá)的2022年第一批推薦性
國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)計(jì)劃的通知(國(guó)標(biāo)委綜合〔2022〕17號(hào)),本項(xiàng)目計(jì)劃編號(hào)為20220184-T-469,
名稱為生物技術(shù)核酸合成第1部分:合成寡核苷酸的生產(chǎn)和質(zhì)量控制要求,本標(biāo)準(zhǔn)等同
采用ISO20688-1:2020《生物技術(shù)核酸合成第1部分:合成寡核苷酸的生產(chǎn)和質(zhì)量控制
要求》。
本標(biāo)準(zhǔn)由全國(guó)生化檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)(SAC/TC387)提出并歸口。
本標(biāo)準(zhǔn)由_______________________等單位聯(lián)合起草。
2標(biāo)準(zhǔn)編制過程和主要工作過程
由核苷酸組成的單鏈線性生物聚合物被稱為“合成寡核苷酸”或“寡核苷酸”,是生
物技術(shù)必不可少的組成部分。廣泛用作聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增引物、微陣列、實(shí)時(shí)PCR
或下一代測(cè)序(NGS)捕獲探針技術(shù)中,同時(shí)是作為創(chuàng)建整個(gè)靶基因的輸入起始原料。
寡核苷酸質(zhì)量的好壞直接影響生物技術(shù)測(cè)量結(jié)果和試驗(yàn)進(jìn)程,寡核苷酸的生產(chǎn)質(zhì)量的
控制在寡核苷酸的合成中非常重要,直接決定寡核苷酸產(chǎn)品質(zhì)量的好壞。寡核苷酸的生產(chǎn)
必須對(duì)堿基數(shù)含量、分子量、堿基范圍、濃度和污染物進(jìn)行量化,以確保滿足最終的應(yīng)用
的質(zhì)量要求。考慮到寡核苷酸用于生物活性應(yīng)用,其質(zhì)量,特別是堿基序列和構(gòu)象,將影
響適應(yīng)性或功能,例如對(duì)同源結(jié)合位點(diǎn)的分子識(shí)別、化學(xué)行為。每個(gè)最終用途應(yīng)用有不同
的具體要求。本項(xiàng)目基于我國(guó)寡核苷酸合成的生產(chǎn)工藝、質(zhì)量控制、客戶需求等需求而建
立,擬研究建立通用的合成寡核苷酸的生產(chǎn)和質(zhì)量控制通用要求標(biāo)準(zhǔn),統(tǒng)一定義合成寡核
苷酸的常見質(zhì)量屬性,闡述寡核苷酸最終用途的量化和評(píng)估指標(biāo)。以幫助改進(jìn)寡核苷酸質(zhì)
量管理和提升寡核苷酸產(chǎn)品質(zhì)量水平,促進(jìn)和提升生物技術(shù)的測(cè)量水平,為生物安全檢測(cè)、
監(jiān)測(cè),產(chǎn)品符合性判定提供技術(shù)支撐,提高生物安全檢測(cè)監(jiān)測(cè)水平。
預(yù)研和起草階段:2022年4月,標(biāo)準(zhǔn)起草單位根據(jù)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)化管理委員會(huì)于2022年
4月22日下達(dá)的2022年第一批推薦性國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)計(jì)劃的通知(國(guó)標(biāo)委發(fā)〔2022〕17號(hào)文)
和全國(guó)生化檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)生檢標(biāo)〔2022〕16號(hào)文件《關(guān)于下達(dá)2022年第一批推
薦性國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)制修訂計(jì)劃的通知》立項(xiàng)文件的要求,成立了以中國(guó)測(cè)試技術(shù)研究院為牽
頭單位的標(biāo)準(zhǔn)起草工作組(以下簡(jiǎn)稱“工作組”),標(biāo)準(zhǔn)名稱《核酸合成第1部分:合成
3
寡核苷酸的生產(chǎn)和質(zhì)量控制要求》(計(jì)劃號(hào):20220184-T-469)。2022年5月,工作組按照
GB/T1.1-2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》、GB/T1.2-2020
《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第2部分:以ISO/IEC標(biāo)準(zhǔn)化文件為基礎(chǔ)的標(biāo)準(zhǔn)化文件起草規(guī)則》的
要求對(duì)ISO20688-1:2020標(biāo)準(zhǔn)的進(jìn)行翻譯校對(duì)工作。2023年3月,工作組在充分討論交
流的基礎(chǔ)上完成了標(biāo)準(zhǔn)初稿及編制說明的起草工作。2023年4月7日,完成了標(biāo)準(zhǔn)征求意
見稿及其編制說明。
二國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)編制原則和確定國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)主要內(nèi)容
1、標(biāo)準(zhǔn)編制原則
本標(biāo)準(zhǔn)依據(jù)GB/T1.1-2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》
和GB/T1.2-2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第2部分:以ISO/IEC標(biāo)準(zhǔn)化文件為基礎(chǔ)的標(biāo)準(zhǔn)化文件
起草規(guī)則》的要求進(jìn)行編制。
本項(xiàng)目等同采用ISO20688-1:2020標(biāo)準(zhǔn),擬規(guī)定合成寡核苷酸(名義上最多250個(gè)堿基)
的生產(chǎn)和質(zhì)量控制的一般要求。給出合成寡核苷酸的一般質(zhì)量特性指標(biāo)以及評(píng)估質(zhì)量特性
指標(biāo)的常用方法。適用于寡核苷酸生產(chǎn)商的生產(chǎn)和質(zhì)量控制,采購(gòu)方對(duì)合成寡核苷酸質(zhì)量
驗(yàn)收也可參考使用:
主要內(nèi)容包括:1)寡核苷酸的一般質(zhì)量管理要求;2)寡核苷酸生產(chǎn)的設(shè)施設(shè)備和環(huán)
境條件控制要求;3)寡核苷酸的生產(chǎn)工藝的要求;4)寡核苷酸的質(zhì)量控制過程要求;5)
合成寡核苷酸附加要求。
2、確定國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)主要內(nèi)容
本標(biāo)準(zhǔn)全文分為11章和5個(gè)附錄。標(biāo)準(zhǔn)的主要內(nèi)容如表1所示:
表1本標(biāo)準(zhǔn)的主要內(nèi)容
章條名稱內(nèi)容簡(jiǎn)要
規(guī)定了合成寡核苷酸(通常最多250個(gè)堿基)的生產(chǎn)和質(zhì)量控
1范圍制的最低要求。還描述了合成寡核苷酸的一般質(zhì)量屬性以及評(píng)
估質(zhì)量屬性的常用方法。
2規(guī)范性引用文件無。
對(duì)有證標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)、性能、純度、標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)、寡核苷酸等術(shù)語(yǔ)進(jìn)
3術(shù)語(yǔ)和定義
行了定義。
寡核苷酸的設(shè)計(jì)和選
4不同用途的寡核苷酸合成的質(zhì)量和一致性要求不同。
擇
4
從寡核苷酸分級(jí)、質(zhì)量控制文件、質(zhì)量管理體系、人員和培訓(xùn)、
5一般質(zhì)量管理要求
安全控制方面對(duì)生產(chǎn)商做了要求。
規(guī)定來了生產(chǎn)者應(yīng)當(dāng)對(duì)可能影響合成寡核苷酸質(zhì)量的原料(包
6資源管理
括試劑、純水和輔助材料)進(jìn)行質(zhì)量控制。
7生產(chǎn)工藝要求合成寡核苷酸的過程及其要求。
合成的寡核苷酸應(yīng)選擇適當(dāng)?shù)姆椒▽?duì)其指標(biāo)進(jìn)行驗(yàn)證,如與預(yù)
8質(zhì)量控制過程要求期用途有關(guān)的特性、純度、雜質(zhì)、定量、其摩爾質(zhì)量和/或堿基
長(zhǎng)度、退火溫度、報(bào)告等。
合成寡核苷酸的附加
9合成RNA的一些附加要求。
要求
10附錄A規(guī)范性附錄,過程檢查表
裝置和設(shè)備清單及其控制標(biāo)準(zhǔn),適合生產(chǎn)合成寡核苷酸的設(shè)備
11附錄B
和儀器示例
12附錄C摩爾質(zhì)量和摩爾數(shù)的計(jì)算
13附錄D采用質(zhì)量分析法驗(yàn)證寡核苷酸序列
14附錄E采用經(jīng)過認(rèn)證的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)對(duì)測(cè)量?jī)x器的精度進(jìn)行控制-示例
3、主要技術(shù)差異
本項(xiàng)目等同采用ISO20688-1:2020《生物技術(shù)核酸合成第1部分:合成寡核苷酸的
生產(chǎn)和質(zhì)量控制要求》,與ISO20688-1:2020無技術(shù)差異。
4、標(biāo)準(zhǔn)解決的主要問題
隨著合成生物技術(shù)向工業(yè)領(lǐng)域的快速滲透,生物能源、生物化工和生物醫(yī)藥等應(yīng)用
領(lǐng)域均提出了日益迫切的大規(guī)模寡核苷酸合成需求。工業(yè)化寡核苷酸合成的完整流程從接
收序列開始到交付產(chǎn)品結(jié)束,是一個(gè)涉及生物信息學(xué)、化學(xué)、分子生物學(xué)、自動(dòng)化等多學(xué)
科的過程,由各個(gè)學(xué)科力量組成的團(tuán)隊(duì)需要齊心協(xié)力,將整個(gè)工作流程從小規(guī)模制備轉(zhuǎn)變
為工業(yè)高通量制造。
實(shí)現(xiàn)高通量并行和高質(zhì)量規(guī)?;a(chǎn)的基礎(chǔ)是標(biāo)準(zhǔn)化和自動(dòng)化。標(biāo)準(zhǔn)化涉及實(shí)驗(yàn)步
驟、試劑耗材、反應(yīng)條件等多個(gè)方面。本項(xiàng)目研究擬解決的關(guān)鍵
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