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文檔簡介

驅(qū)動基因及非編碼RNA

在胃癌研究及臨床中的應(yīng)用束永前江蘇省人民醫(yī)院南京醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院2024年6月14日目錄晚期胃癌化療藥物氟脲嘧啶類:5-Fu、卡培他濱、S-1紫杉醇類:紫杉醇、多西紫杉醇鉑類:順鉑、奧沙利鉑拓?fù)洚悩?gòu)酶I抑制劑:伊立替康蒽環(huán)類:表柔比星化療藥物常見biomarker藥物Biomarker臨床意義氟脲嘧啶類胸苷磷酸化酶(TP)TP的高表達(dá)與5-Fu和卡培他濱的療效呈正相關(guān)TP的表達(dá)水平與腫塊微血管密度呈正相關(guān),提示TP高表達(dá)是可能預(yù)后不良的原因之一胸苷酸合成酶(TS)TS表達(dá)與Lauren分型有一定相關(guān)性。TS在腸型胃癌表達(dá)高于彌漫型胃癌,而TS高表達(dá)與以5-FU為主化療敏感性下降有關(guān),TS低表達(dá)患者的5年生存率和對含5-FU化療方案的效果要優(yōu)于TS高表達(dá)者。Miszczaletal.JExpclinCancer.Res,2008

Meropoletal.JClinOncol,2006

Ichikawaetal.IntJCancer.2006化療藥物常見biomarker藥物Biomarker臨床意義鉑類核苷酸切除修復(fù)交叉互補基因1(ERCC1)ERCC1參與鉑類化療耐藥發(fā)生,其表達(dá)水平與多種腫瘤鉑類化療療效和生存期呈負(fù)相關(guān)。

一項研究表明ERCC1預(yù)測鉑類耐藥的準(zhǔn)確度達(dá)82.5%。紫杉醇類β-微管蛋白IIIβ-tubulinIII在36.4%的胃癌患者中表達(dá)陽性,并且β-tubulinIII表達(dá)水平與紫杉醇療效及患者預(yù)后呈負(fù)相關(guān)。

TP高表達(dá)和β-tubulinIII低表達(dá)的胃癌患者對卡培他濱聯(lián)合紫杉醇療效明顯提高,可以達(dá)到80%以上,OS也明顯延長。LuM,GaoJ,WangXC,ShenL.ChinJCancerRes.2011;Uranoetal.IntJOncol.2006

Pandaetal.JMedChem.2011;Hirakawaetal.CancerChemotherPharmacol.2013Challenge胃癌化療敏感性的biomarker研究多為回顧性研究尚無大型前瞻性研究加以驗證上述biomarker的有效性一項肺癌biomarker指導(dǎo)下化療前瞻性研究結(jié)果為陰性胃癌異質(zhì)性強,信號通路復(fù)雜,靠1-2種biomaker預(yù)測一類藥物敏感性不可靠胃癌的分型胃癌組織學(xué)分型與分子生物學(xué)

WHO 乳頭狀腺癌管狀腺癌粘液腺癌低分化腺癌印戒細(xì)胞癌Lauren腸型未分化彌漫型MattiV,etal.BestPractice&ResearchClinicalGastroenterology2006;20(4):651-674.胃癌組織學(xué)分型與分子生物學(xué)MattiV,etal.BestPractice&ResearchClinicalGastroenterology2006;20(4):651-674.彌漫型胃癌遺傳,10%-20%基因錯誤腸型胃癌后天,80%-90%基因錯誤正常“遺傳易感性”CHD1遺傳突變幽門螺旋桿菌胃炎非萎縮性淺表萎縮性胃炎腸化生表達(dá):CDX1/2COX-2hTERT腺瘤增生甲基化:CHD1,DAP-K,HRASLS,LOX,MGMT,p14,RAB-β擴增:c-MET,K-SAM突變:CHD1,TP53表達(dá):hTERTCIMP/微衛(wèi)星不穩(wěn)定性甲基化:p16,COX-2,GSTP1,hMLH1,RASSF1A,RUNX3,TFF1擴增:Her2突變:K-RAS,TP53雜合性缺失:APC,MCC,TP53突變:APC,TP53甲基化:APC,CDH1,DAP-KhMLH1,p14,THBS1,TIMP3表達(dá):EGFR,TNF-α不同Lauren分型對化療敏感性不同藥物彌漫型腸型可能機制順鉑1獲益①順鉑對低分化組織抑制作用更強②BRCA1高表達(dá),抑制順鉑毒性作用,導(dǎo)致耐藥奧沙利鉑2獲益腸型胃癌Bax表達(dá)率高于彌漫型,Bax高表達(dá)的患者對含奧沙利鉑化療方案更敏感伊立替康3獲益BRCA1低表達(dá)的胃癌對伊立替康非常敏感,彌漫型胃癌中50%以上BRCA1基因甲基化失活紫杉醇類4獲益紫杉醇類藥物敏感性主要與TUBB3等基因相關(guān),但彌漫型胃癌中TUBB3表達(dá)情況尚不清楚氟脲嘧啶類5不清楚不清楚氟脲嘧啶類藥物與TS及DPD密切相關(guān)低分化胃癌DPD↑和TS↓表達(dá)高低尚有爭論1.WasaburoK,etal.LancetOncol2008;9:215–221.;2.SeongHyunJeong,DigDisSci(2011)56:131–138

3.Shen,etal.JournalofTranslationalMedicine2013;11:73;4.YasunoriE,etal.SurgToday2008;38(11):1013-1020.

5.WataruICHIKAWA,etal.Int.J.Cancer2004;112:967–973胃癌分子分型EB病毒(EBV)感染型胃癌微衛(wèi)星不穩(wěn)定(MSI)型胃癌基因組穩(wěn)定(GS)型胃癌染色體不穩(wěn)定(CIN)型胃癌CancerGenomeAtlasResearchNetwork.Nature.2014CancerGenomeAtlasResearchNetwork.Nature.2014胃癌四種分子分型的臨床特征分型好發(fā)部位Lauren分型性別其他EB病毒感染型胃底或胃體男性微衛(wèi)星不穩(wěn)定型胃竇或幽門女性初診年齡偏高(中位年齡72歲)基因組穩(wěn)定型胃竇或幽門彌漫型男性初診年齡偏低(中位年齡59歲)染色體不穩(wěn)定型胃食管交界處腸型男性CancerGenomeAtlasResearchNetwork.Nature.2014胃癌四種分子分型的分子特征分型特征EB病毒感染型約9%,表現(xiàn)為PI3K3CA基因高頻突變和DNA極度甲基化(p16ink4A沉默),以及JAK2、PDL-1/2擴增和ARID1A、BCOR頻發(fā)突變。微衛(wèi)星不穩(wěn)定型約22%,表現(xiàn)為突變率高,包括編碼靶向致癌信號蛋白的基因突變,有胃型CIMP、MHL1超甲基化。基因組穩(wěn)定型約20%,多為彌漫型,RHOA基因突變或RHO家族GTP酶活化蛋白基因融合現(xiàn)象染色體不穩(wěn)定型約50%,多為腸型,顯著的異倍體性和受體酪氨酸激酶激活CancerGenomeAtlasResearchNetwork.Nature.2014常見位點體細(xì)胞拷貝數(shù)和突變情況CancerGenomeAtlasResearchNetwork.Nature.2014常見位點體細(xì)胞拷貝數(shù)和突變情況CIN型胃癌:存在可靶向的RTK基因擴增。VEGFA基因擴增多見,抗血管生成作用明顯。靶向VEGFR2的抗體ramucirumab對此型胃癌可顯示出抗腫瘤作用,而其療效是否由VEGFA基因擴增決定則有待驗證。MSI型胃癌:未發(fā)現(xiàn)MSI型結(jié)直腸癌中的BRAFV600E基因突變,取而代之的則是可靶向的PIK3CA、ERBB3、ERBB2和EGFR基因突變。EBV型胃癌:DNA超甲基化(如CIMP),且PIK3CA基因突變頻率高,

PI3K抑制劑在EBV型胃癌中的療效將成為研究重點。此外,此型胃癌中PD-L1/2水平升高,提示PD-L1/2拮抗劑可成為此類患者的治療新選擇。GS型胃癌:CDH1、ARID1A、RHOA基因突變或RHO家族GTP酶活化蛋白基因融合現(xiàn)象(CLDN18-ARHGAP融合)。GTP酶中的RHO家族有調(diào)節(jié)肌球蛋白動力及包括黏附、增殖和生存在內(nèi)的細(xì)胞行為。RHOA信號通路與腫瘤細(xì)胞侵襲和轉(zhuǎn)移密切相關(guān),因而此型胃癌將關(guān)注轉(zhuǎn)移相關(guān)研究。CancerGenomeAtlasResearchNetwork.Nature.2014不同亞型中驅(qū)動基因表達(dá)率CancerGenomeAtlasResearchNetwork.Nature.2014四亞型主要特征CancerGenomeAtlasResearchNetwork.Nature.2014胃癌靶向治療NatRevClinOncol.

2013Nov;10(11):643-55.

小結(jié)以腫瘤分子表達(dá)為特征的分子病理分型與個體化治療密切相關(guān)。分型的不斷發(fā)展,將對胃癌治療的藥物選擇更有指導(dǎo)價值。分子分型將指導(dǎo)個體化治療和靶向藥物臨床試驗。非編碼RNA的定義及分類ncRNAlncRNA(長鏈非編碼RNA)miRNApiRNA….tRNA…真核生物轉(zhuǎn)錄組及非編碼RNA的概況非編碼RNA在不同物種表達(dá)RatioofnoncodingDNAingenomelowhighComplexfungiProkaryotesUrochordateSimpleeukaryotesInvertebratesPlantsVertebratesVertebratesCiona(urochordate)InvertebratesPlantsComplexfungi(Neurospora)Simpleeukaryotes(yeasts,plasmodium,Dictyostelium)ProkaryotesLanderE.Nature,2001TaftRandMattickJ.Bioessays,2007ncRNA可能是基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的重要元件GO分析pathwayproteinncRNA?ncRNAMiRNA在胃癌診斷中的價值ZhuX,etal.DigDisSci,2013合并敏感性:0.78(95%CI0.71–0.85),合并特異性0.89(95%CI0.82–0.94),合并的AUC:0.91.Mir21文獻(xiàn)報道最多循環(huán)血液的microRNA可以作為檢測胃癌的重要診斷指標(biāo)對已報道m(xù)ir21的ROC曲線進(jìn)行Meta分析循環(huán)血液中mir21可作為胃癌的biomaker

MiRNA在胃癌治療中的價值Hummeletal.EJC2010miR15b,miR16的上調(diào)可以增加多藥耐藥的胃癌細(xì)胞對長春新堿、阿霉素、順鉑及依托泊苷的敏感性。上調(diào)mir34a可以增強P53突變的胃癌細(xì)胞對阿霉素、鉑類、吉西他濱、紫杉醇的化療敏感性。

LncRNA在胃癌中的診斷價值Songetal.JournalofTranslationalMedicine2013lncRNA芯片ROC曲線顯示H19的曲線下面積為0.613;UC001為0.751;兩者的聯(lián)合為0.761.說明H19和UC001對胃癌的診斷有一定的輔助作用

LncRNA在胃癌中的預(yù)后價值Sunetal.TumorBiol.(2014)35:1065-1073MEG3癌組織表達(dá)下調(diào)MEG3表達(dá)高低與腫瘤大小相關(guān)MEG3表達(dá)高低與病人分期相關(guān)MEG3表達(dá)高低與病人預(yù)后相關(guān)科研新成果我們鑒定了兩條與胃癌發(fā)生發(fā)展相關(guān)的長非編碼RNA:第一條:TINCR(與胃癌細(xì)胞增殖及凋亡相關(guān))第二條:FENDRR(與胃癌的侵襲轉(zhuǎn)移相關(guān))SP1-inducedupregulationofthelongnoncodingRNATINCRregulatescellproliferationandapoptosisbyaffectingKLF2mRNAstabilityingastriccancer束永前等.Oncogene.2015Mar2.doi:10.1038本研究顯示:1.胃癌組織及細(xì)胞中TINCR的表達(dá)出現(xiàn)明顯的上調(diào),且TINCR的表達(dá)水平與胃癌病人的臨床分期,腫瘤的轉(zhuǎn)移及術(shù)后生存期存在明顯的相關(guān)性2.癌組織中TINCR的表達(dá)上調(diào)與轉(zhuǎn)錄因子SP1的激活相關(guān)3.TINCR能促進(jìn)胃癌細(xì)胞的增殖并抑制凋亡4.TINCR可以通過調(diào)控KLF2mRNA的穩(wěn)定性影響KLF2,P21及P15的表達(dá)。TINCR在胃癌組織及細(xì)胞系中的表達(dá)和其啟動子結(jié)合位點分析T在癌組織和細(xì)胞系表達(dá)上調(diào)T啟動子與轉(zhuǎn)錄因子SP1結(jié)合位點驗證TINCR與病理分期的關(guān)系TINCR在胃癌中的預(yù)后和診斷價值T表達(dá)高的病人預(yù)后較差T高表達(dá)病人中位DFS:21月T低表達(dá)病人中位DFS:29.7月TINCR的ROC曲線靈敏度:0.65特異度:0.782曲線下面積=0.701TINCR對BGC923和SGC7901增殖和凋亡的影響MTT實驗克隆形成實驗細(xì)胞周期實驗流式細(xì)胞儀實驗WB實驗TINCR通過影響KLF2,P21,P15表達(dá)調(diào)節(jié)細(xì)胞周期和凋亡RNA轉(zhuǎn)錄組測序KEGG數(shù)據(jù)庫GO數(shù)據(jù)庫qPCR實驗qPCR實驗WB實驗TINCR與胞漿蛋白STAU1相互作用形成復(fù)合物影響KLF2mRNA的穩(wěn)定性和表達(dá)RNAIP實驗Pulldown實驗KLF2對胃癌細(xì)胞系的增殖和凋亡的影響及其機制MTT實驗克隆形成實驗流式細(xì)胞儀實驗動物實驗WBqChIPqChIP胃癌組織及細(xì)胞系中KLF2表達(dá)水平RT-PCRqPCRIHCKLF2與臨床分期KLF2與預(yù)后KLF2與TINCR相關(guān)性動物實驗驗證TINCR的功能和KLF2,P21及P15的表達(dá)Decreasedexpressionofthelongnon-codingRNAFENDRRisassociatedwithpoorprognosisingastriccancerandFENDRRregulatesgastriccancercellmetastasisbyaffectingfibronectin1expression.束永前等.JHematolOncol.2014Aug29;7:63.本研究顯示:1.胃癌組織及細(xì)胞中FENDRR的表達(dá)出現(xiàn)明顯的下調(diào),且FENDRR的表達(dá)水平與胃癌病人的臨床分期,腫瘤的轉(zhuǎn)移及術(shù)后

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