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文檔簡介
《二輪大專題—PCR專題》
【命題角度1]PCR的基礎(chǔ)知識(shí)
1.PCR的基本要點(diǎn)(表解):
名稱及縮寫(1)▲、▲
目的(2)▲
原理(3)▲
前提(4)▲
(5)▲▲
(6)▲▲
反應(yīng)體系(7)▲▲
(8)▲▲
(9)▲、▲
(10)▲▲
反應(yīng)過程(11)▲▲
(12)▲▲
(13)▲長一中鏈:(14)▲
反應(yīng)結(jié)果中TO:(⑸▲
短~~^鏈:(16)▲
反應(yīng)設(shè)備(17)▲
PCR的操作要點(diǎn)(18)▲
2.PCR中圖解(3次循環(huán)):
殳性停
3
3.PCR過程中使用的酶具備三個(gè)特點(diǎn):
①(19)_▲
②(20)_▲
③(21)_▲
4.PCR中的引物:
來源(22)_▲
作用及要求(23)_▲
類型(24)_▲
朝向(25)_▲
變化(26)_▲
[例1]近十年來,PCR技術(shù)(多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))成為分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室里的一種常規(guī)手段,其原理是利用
DNA半保留復(fù)制,在試管中進(jìn)行DNA的人工復(fù)制(如圖),在很短的時(shí)間內(nèi),將DNA擴(kuò)增幾百萬倍
甚至幾十億倍,使實(shí)驗(yàn)所需要的遺傳物質(zhì)不再受限于活的生物體?;卮鹣铝袉栴}:
18*枚
juMSwT陣備至SST
DNA樣品單鏈DNA兩個(gè)完整的雙
引物與DNA游離脫輒核甘酸連
模板單鏈形成配蕤到DNA單鏈上鏈DNA什
對(duì)結(jié)構(gòu)
(1)加熱94℃目的是打開▲鍵,這一步稱為變性。
(2)當(dāng)溫度降低時(shí),引物與模板▲端結(jié)合,在DNA聚合酶的作用下,引物沿模板延伸,最終
合成兩個(gè)DNA分子,此過程中原料是▲。
(3)PCR技術(shù)的必要條件,除了模板、原料、ATP、酶以外,至少還需要三個(gè)條件,即:液體環(huán)
境、適宜的▲和▲,前者由PCR儀自動(dòng)調(diào)控,后者則靠▲來維持。
(4)DNA的復(fù)制需要引物,其主要原因是▲。退火溫度的設(shè)置跟引物有關(guān),若▲,退高溫度
可以高點(diǎn);若退火溫度太低,會(huì)造成▲,不但會(huì)造成非目標(biāo)DNA片段多,而且會(huì)出現(xiàn)無
序擴(kuò)增。
(5)如果PCR反應(yīng)得不到任何擴(kuò)增產(chǎn)物,則可以采取的改進(jìn)措施有上(填序號(hào):①升高退火
溫度②降低退火溫度③重新設(shè)計(jì)引物)。
[例2]1985年,穆利斯等人發(fā)明了PCR技術(shù)(即聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))。它是一項(xiàng)根據(jù)DNA雙鏈復(fù)制的原理,
在體外提供參與DNA復(fù)制的各種組分與反應(yīng)條件,對(duì)目的基因的核甘酸序列進(jìn)行大量復(fù)制的技術(shù)。
回答下列問題:
(1)PCR反應(yīng)體系的緩沖液一般需要添加」以激活酶。設(shè)定的PCR反應(yīng)程序?yàn)椋?4℃,5min;
94℃,30s;55℃,30s;72℃,Imin;30個(gè)循環(huán)。其中,設(shè)定94℃下5min的預(yù)變性處理,
目的是確?!?。
(2)PCR擴(kuò)增的產(chǎn)物常采用瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行鑒定。凝膠中的DNA分子通過染色,可以在▲下
被檢測(cè)出來。若電泳結(jié)果不止一條帶,可能的原因有▲(答出1條)。
(3)PCR技術(shù)可用于基因工程四個(gè)步驟中的▲以及目的基因的檢測(cè)、鑒定。
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【命題角度2]反轉(zhuǎn)錄PCR(RTPCR)
起點(diǎn)是單鏈RNA,想以之為模板,通過PCR擴(kuò)增得到大量的相應(yīng)的、特定的DNA片段,而PCR
新的挑戰(zhàn)
使用的熱穩(wěn)定的DNA聚合酶只能以DNA為模板
固有條件PCR擴(kuò)增儀、熱穩(wěn)定的DNA聚合酶、足量的dNTP、緩沖體系、M/+等陽離子
解決策略▲
[例1]以下是有關(guān)冠狀病毒的相關(guān)信息,請(qǐng)思考并回答:
(1)引起人類肺炎的某冠狀病毒(nCoV)是一市單鏈RNA病毒,其跨膜表面糖蛋白(GP)是該
病毒侵染宿主細(xì)胞的關(guān)鍵蛋白,科學(xué)家欲利目大腸桿菌作為受體菌批量生產(chǎn)GP以制備相關(guān)
疫苗,研發(fā)疫苗要在短時(shí)間內(nèi)大量快速生產(chǎn)采針可利用▲技術(shù)實(shí)現(xiàn)。從nCoV基因組中分
離出的nCoV—GP基因不能直接與質(zhì)粒重組,其原因是▲。
(2)為了使nCoVTJP基因和質(zhì)粒構(gòu)建----------------------------新電病毒的RNA
基因表達(dá)載體,必須經(jīng)過▲形成----------------------------新冠病毒的RNA
上再進(jìn)行擴(kuò)增兩個(gè)過程,示意圖C5----------------------------DNA.
如下。圖示過程中需要的酶有▲,<=)----------------------------DNA.
-------------------tZJ--------DNA
需要添加的原料為▲,如果圖中2
a---------------------------DNA.
共有N個(gè)箭頭(N>2),以DM1
----------------□-------DNA2
這條鏈為模板開始擴(kuò)增,共消耗CZJDNA.
;;
引物“I―I”▲個(gè),共產(chǎn)生由CD-------------------DNA
DNA,和DNAs兩條鏈組成的DNA分子
▲個(gè)。
(3)若第(2)問中實(shí)驗(yàn)操作沒有失誤,PCR反4任何擴(kuò)增產(chǎn)物,則可以采取的改進(jìn)
措施有▲(填序號(hào):①升高退火溫度,C.度,③重新設(shè)計(jì)引物),請(qǐng)說明選
擇以上改進(jìn)措施的原因▲。
[例2]我國公布的禁止進(jìn)境檢疫的有害生物煙草環(huán)斑病毒(TRSV)是RNA病毒。檢疫部門取煙草葉片進(jìn)
行該病毒的診斷和檢測(cè),將待測(cè)樣品利用RTPCR技術(shù)(逆轉(zhuǎn)錄PCR,具有靈敏度高、特異性強(qiáng)的
優(yōu)勢(shì))擴(kuò)增樣品。下圖1是RTPCR技術(shù)的過程示意圖,圖2是PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的電泳圖。請(qǐng)回答下
列問題:
一、待測(cè)樣品總RNA
圖2PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖
(1)圖1過程①表示利用RNA獲得cDNA,該過程需要▲酶的參與,過程②需要加入▲酶。
(2)待測(cè)樣品中RNA的提供者可能是▲和▲,也可能只是▲。
(3)圖1過程①需要加入引物P2,該引物是依據(jù)上的序列設(shè)計(jì)并生產(chǎn)的。過程②引物P2、P1
都需加入,理由是▲。
(4)已知圖2中電泳帶1是取自未感染的煙葉樣品電泳結(jié)果,電泳帶2是不同大小DNA的標(biāo)準(zhǔn)
參照,據(jù)圖分析可以得出的結(jié)論是上,理由是▲。
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【命題角度3]反向PCR(IPCR)
要通過PCR擴(kuò)增的不是已知序列的DNA片段,而是已知序列兩側(cè)的DNA片段,同向引物達(dá)不
新的挑戰(zhàn)
到擴(kuò)增的目的
固有條件PCR擴(kuò)增儀、熱穩(wěn)定的DNA聚合酶、足量的dNTP、緩沖體系、蛇2+等陽離子
解決策略▲
[例1](2020年江蘇)如果已知一小段DNA的序列,可采用PCR的方法,簡捷地分析出已知序列兩側(cè)
的序列,具體流程如圖(以EcoRI酶切為例)。請(qǐng)據(jù)圖回答問題:
染色體DNA
G:AATTC^I
I的切EcoRICTTAAiGJ
混合的DNA片段
、r未知序列己如序夕!r~[3'
未知序列b片段F
n連接|DNA連接酶
已知序列
PCR引物環(huán)狀DNA
用擴(kuò)增|hgDNA聚合?他
PCR產(chǎn)物
1\測(cè)序、分析|
y片段F的
完整序列
(1)步驟I用的EcoRI是一種▲酶,它通過識(shí)別特定的上切割特定位點(diǎn)。
(2)步驟H用的DNA連接酶催化相鄰核昔酸之間的3,一羥基與5—一磷酸間形成▲;PCR循
環(huán)中,升溫到95℃是為了獲得▲;TaqDNA聚合酶的作用是催化▲。
(3)若如表所列為已知的DNA序列和設(shè)計(jì)的一些PCR引物,步驟III選用的PCR引物必須是一上
(從引物①?③④中選擇,填編號(hào))。
DNA序列(出線處省略了部分核作腋序列)
已知5-AACFAKKGCTCAFGA........GCAATGC'G[AGCCTCJ—J*
憚列yiicjAiAciAuACitAiT........6GHA<XK\4Ms'
1)5-AACIATCX(X/TCAT(;A—3r
KR②5JAT(X;TA(;m—3'
引物.)5—;\C;A(?(iCTAC(;CATTGC-3'
①5'TCATGAGC(jCATAGTT-3’
(4)對(duì)PCR產(chǎn)物測(cè)序,經(jīng)分析得到了片段F的完整序列。下列DNA單鏈序列中(虛線處省略
了部分核昔酸序列),結(jié)果正確的是:▲。
A.5'—AACTATGCG..AGCCCTT—3,B.5'—AATTCCATG....CTGAATT—3Z
C.5'—GCAATGCGT..TCGGGAA—3'D.5'—TTGATACGC....CGAGTAC—3'
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【命題角度4】重疊延伸PCR
有2種已知(部分)序列的DNA片段,期望不再依靠限制酶切、DNA連接酶連的方式,而是
新的挑戰(zhàn)
在通過PCR擴(kuò)增2種DNA片段的過程中,能直接將二者連接起來,形成重組DNA片段
固有條件PCR擴(kuò)增儀、熱穩(wěn)定的DNA聚合酶、足量的dNTP、緩沖體系、Mg"等陽離子
解決策略
[例1]重疊延伸PCR技術(shù)是一種通過寡聚核甘酸鏈之間重疊的部分互相搭橋、互為模板,通過多次PCR
擴(kuò)增,從而獲得目的基因的方法。下圖是利用重疊延伸PCR技術(shù)擴(kuò)增某目的基因的過程。結(jié)合所
學(xué)知識(shí),分析下列問題:
引物1引物3
目的基因
第一勰面
一引物21油4
-引物I
階引物2引物3
段引物1
;;;;引物4
第
二引物2…,______引物4
階之%3|
段引物1
引物
第——r*-r........4
三
階
---目的基因
段
(1)在引物1、引物2組成的反應(yīng)系統(tǒng)中,經(jīng)第一階段形成圖示雙鏈DNA至少要經(jīng)過上次循環(huán)。
(2)若在引物1和引物2組成的反應(yīng)系統(tǒng)和引物3、引物4組成的反應(yīng)系統(tǒng)中均復(fù)制一次,共產(chǎn)
生▲種雙鏈DNA分子。
(3)第二階段中引物2與引物3部分堿基的▲關(guān)系使得兩DNA能成功“搭橋”連接起來。
(4)在第一階段獲得兩種具有重疊片段DNA的過程中,必須將引物1、2和引物3、4置于不同
反應(yīng)系統(tǒng)中,這是因?yàn)椤?/p>
(5)第三階段進(jìn)行重疊延伸時(shí),是否需要額外添加引物▲,原因是▲。
【命題角度5]利用PCR在目的基因兩側(cè)添加適宜的限制酶識(shí)別序列
通過PCR擴(kuò)增得到的目的DNA片段兩側(cè)沒有限制酶識(shí)別序列,不便于用限制酶進(jìn)一步處理;
新的挑戰(zhàn)希望在PCR擴(kuò)增目的DNA片段時(shí)直接在兩側(cè)添加期望的限制酶識(shí)別序列,便于進(jìn)一步用相應(yīng)
的限制酶切割,產(chǎn)生期望的黏性末端
固有條件PCR擴(kuò)增儀、熱穩(wěn)定的DNA聚合酶、足量的dNTP、緩沖體系、Mg"等陽離子
解決策略▲
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【命題角度6]利用PCR對(duì)目的基因進(jìn)行定點(diǎn)誘變
PCR擴(kuò)增目的DNA片段時(shí),不再完全忠實(shí)于模板DNA,而是能夠?qū)δ骋晃稽c(diǎn)的堿基對(duì)進(jìn)行替
新的挑戰(zhàn)
換/增添/刪除,使目的DNA片段發(fā)生定點(diǎn)突變
固有條件PCR擴(kuò)增儀、熱穩(wěn)定的DNA聚合酶、足量的dNTP、緩沖體系、蛇2+等陽離子
解決策略▲
【例1]通過設(shè)計(jì)引物,運(yùn)用PCR技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)目的基因的定點(diǎn)誘變。如圖為基因工程中獲取突變基因
的過程,其中引物1序列中含有一個(gè)堿基T不能與目的基因片段配對(duì),但不影響引物與模板
鏈的整體配對(duì),反應(yīng)體系中引物1和引物2的5,端分別設(shè)計(jì)增加限制酶a和限制酶b的識(shí)
別位點(diǎn)。有關(guān)敘述不正確的是:
MaT
引物]__________________
"G二?引物2
第I輪PCR瑜
TT|/①
引物1?L-I---------------------------/
-丁------------Q引物2
(第2輪PCR第b
引削斗二二;二二二二中黑
人?酹h
t
A.引物中設(shè)計(jì)兩種限制酶識(shí)別位點(diǎn)有利于目的基因定向插入
B.復(fù)性溫度過高會(huì)導(dǎo)致引物不能與模板牢固結(jié)合,PCR擴(kuò)增效率下降
C.第3輪PCR,引物1能與圖中②結(jié)合并且形成兩條鏈等長的突變基因
D.第3輪PCR結(jié)束后,含突變堿基對(duì)且兩條鏈等長的DNA占1/2
【例2]大引物PCR定點(diǎn)突變常用來研究蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)改變導(dǎo)致的功能變化。單核甘酸的定點(diǎn)誘變僅需進(jìn)行
兩輪PCR反應(yīng)即可獲得,第一輪加誘變引物和側(cè)翼引物,第一輪產(chǎn)物作第二輪PCR擴(kuò)增的大引物,
過程如圖所示。下列敘述不正確的是:
誘變引物
第一輪PCR,,一
PCR產(chǎn)物而作大引物
-??
第二輪PCR|
A.第一輪PCR過程中退火所用的溫度與第二輪PCR退火的溫度不一樣
B.PCR擴(kuò)增的定點(diǎn)誘變產(chǎn)物通常需要連接到載體分子上才能表達(dá)出相應(yīng)的性狀,該定點(diǎn)誘變產(chǎn)物
需具備啟動(dòng)子、終止子等結(jié)構(gòu)才能進(jìn)行轉(zhuǎn)錄和翻譯
C.第二輪PCR所用的引物是第一輪PCR的產(chǎn)物DNA的兩條鏈
D.將某功能蛋白的第17位Cys(UGU)改造成Ser(UCU),屬于蛋白質(zhì)工程
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[例3]蘿卜的蛋白A具有廣泛的抗植物病菌作用,而且對(duì)人體沒有影響。我國科學(xué)家欲獲得高效表達(dá)蛋
白A的轉(zhuǎn)基因大腸桿菌作為微生物農(nóng)藥,做了相關(guān)研究。請(qǐng)回答下列問題:
(1)研究者將重組質(zhì)粒置于經(jīng)上處理的大腸桿菌細(xì)胞懸液中,獲得轉(zhuǎn)基因大腸桿菌。
(2)檢測(cè)發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)入的蛋白A基因在大腸桿菌細(xì)胞中表達(dá)效率很低,研究者推測(cè)不同生物對(duì)密
碼子具有不同的偏好,因而設(shè)計(jì)了與蛋白A基因結(jié)合的兩對(duì)引物(引物B和C中都替換了
一個(gè)堿基),并按圖中方式依次進(jìn)行4次PCR擴(kuò)增,以得到新的蛋白A基因。
引物B引物D
y3-A-S了—%
¥:蛋白A基因—_
5'=^<-V—;、
引物A引物C
圖1
s-----------------------------------r
IPCR3
y八---------y
、-------v------------------$
新的蛋白A基因
注?圖中7V為堿基序列變化點(diǎn),
①這是一種定點(diǎn)的▲技術(shù)。
②圖2所示的4次PCR應(yīng)該分別如何選擇圖1中所示的引物?請(qǐng)?zhí)顚懸韵卤砀?若選用該
引物劃“,若不選用該引物則劃“X”)▲。
引物A引物B引物c引物D
PCRi▲▲▲▲
▲▲▲▲
PCR2
▲▲▲▲
PCR3
▲▲▲▲
PCR4
(3)研究者進(jìn)一步將含有新蛋白A基因的重組質(zhì)粒和▲分別導(dǎo)入大腸桿菌,提取培養(yǎng)液中的
蛋白質(zhì),用▲方法檢測(cè)并比較三組受體菌蛋白A的表達(dá)產(chǎn)物,判斷新蛋白A基因表達(dá)效
率是否提高。為檢測(cè)表達(dá)產(chǎn)物的生物活性,研究者將上述各組表達(dá)產(chǎn)物加入到長滿了植物
病菌的培養(yǎng)基上,培養(yǎng)一段時(shí)間后,比較▲的大小,以確定表達(dá)產(chǎn)物的生物活性大小。
(4)作為微生物農(nóng)藥,使用時(shí)常噴灑蛋白A基因的發(fā)酵產(chǎn)物而不是轉(zhuǎn)蛋白A基因的大腸桿菌,
其優(yōu)點(diǎn)是▲。
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【命題角度7】巢式PCR
目的DNA片段在全部DNA中所占的比例太低,通過PCR對(duì)其擴(kuò)增時(shí),當(dāng)引物特異性過強(qiáng)或過
新的挑戰(zhàn)弱時(shí),都很難擴(kuò)增出足量的目的DNA片段,期望通過PCR能夠精準(zhǔn)又大量的擴(kuò)增出目的DNA
片段
固有條件PCR擴(kuò)增儀、熱穩(wěn)定的DNA聚合酶、足量的dNTP、緩沖體系、Mg2+等陽離子
解決策略▲
【例1]家畜胚胎的性別鑒定技術(shù)對(duì)畜牧業(yè)的發(fā)展具有重要意義。巢式PCR擴(kuò)增反應(yīng)在兩次PCR反應(yīng)中使
用兩組不同引物,先使用外引物對(duì)目標(biāo)區(qū)域DNA片段進(jìn)行第一次PCR擴(kuò)增,產(chǎn)生中間產(chǎn)物,然后
使用內(nèi)引物對(duì)中間產(chǎn)物進(jìn)行第二次PCR擴(kuò)增,產(chǎn)生目標(biāo)產(chǎn)物。下圖是式PCR工作原理示意圖,請(qǐng)
回答:
模板2、、、、、、、、=X、、、g、、、-、、、、za、aa、、、zz、=
,」|使用外引物城祗?欠PCR擴(kuò)增
中間產(chǎn)物
[使用內(nèi)引?進(jìn)行第二次PCR擴(kuò)增
目標(biāo)產(chǎn)物,,
'巢式PCRI作原理示意圖’
(1)巢式PCR反應(yīng)體系中需要加入模板、上、上、引物、Mg"、緩沖液等。
(2)相比于常規(guī)PCR獲得的產(chǎn)物而言,巢式PCR獲得的產(chǎn)物特異性,,原因是如果利用外引
物擴(kuò)增產(chǎn)生了錯(cuò)誤片段,再利用內(nèi)引物擴(kuò)增在錯(cuò)誤片段上進(jìn)行引物配對(duì)并擴(kuò)增的概率上。
(3)巢式PCR通常在一個(gè)試管中進(jìn)行第一階段反應(yīng),然后將中間產(chǎn)物等轉(zhuǎn)移到第二試管中進(jìn)行
第二階段反應(yīng),不在同一試管完成的主要原因是▲。
(4)科研人員利用多重巢式PCR技術(shù)同時(shí)擴(kuò)增Y染色體上雄性決定基因(SRY)和常染色體上的
酪蛋白基因(CSN1S1),進(jìn)行早期胚胎的性別鑒定,并將鑒定后的胚胎進(jìn)行移植。下表是
主要實(shí)驗(yàn)步驟,請(qǐng)完成下表:
實(shí)驗(yàn)?zāi)康姆椒ú襟E要點(diǎn)
胚胎樣品DNA提取選取囊胚的①▲細(xì)胞提取DNA
PCR引物的設(shè)計(jì)和合成根據(jù)牛的SRY和CSN1S1基因序列設(shè)計(jì)合成②▲對(duì)引物
PCR過程預(yù)變性f③▲退火f延伸
觀察擴(kuò)增結(jié)果電泳分析
受體牛④▲處理對(duì)受體牛注射前列腺素
胚胎移植將篩選出的胚胎移植到受體牛的子宮內(nèi)
(5)電泳結(jié)果如下圖所示,1?5號(hào)為取自不同胚胎的DNA樣品進(jìn)行巢式PCR的產(chǎn)物。A和B條
帶中代表CSN1S1的是▲??梢源_定1?5號(hào)中▲號(hào)胚胎為雌性。
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A*
B*八一,
(6)牛胚胎性別的鑒定除了可以利用PCR外,下列方法也可行的有▲。
①差速離心法②核酸探針雜交法
③染色體核型分析法④H-Y抗血清免疫學(xué)法(H-Y抗原編碼基因位于Y染色體上)
【命題角度8]不對(duì)稱PCR
新的挑戰(zhàn)通過PCR較快的得到單鏈DNA
固有條件PCR擴(kuò)增儀、熱穩(wěn)定的DNA聚合酶、足量的dNTP、緩沖體系、姐2+等陽離子
解決策略▲
[例1]PCR技術(shù)應(yīng)用非常廣泛,可用于擴(kuò)增目的基因,制作探針,引入定點(diǎn)突變,定量檢測(cè)DNA等。
完成下列有關(guān)PCR技術(shù)和相關(guān)應(yīng)用的問題:
(1)PCR技術(shù)可用于基因工程四個(gè)基本步驟中的▲步驟。
(2)在影響擴(kuò)增反應(yīng)的各種因素中,引物的設(shè)計(jì)最為重要,引物的3,端應(yīng)采用簡并密碼較少的
氨基酸的對(duì)應(yīng)核甘酸序列,否則會(huì)導(dǎo)致擴(kuò)增的非特異性序列數(shù)量上。
(3)在正常變性和退火之后研究某TaqDNA聚合酶的催化效率,得到了下列表格:
22℃37℃55℃70℃78℃83℃
子鏈延伸速率(個(gè)核甘酸.秒\酶分子為0.251.522602500
83℃下沒有產(chǎn)物的原因是上。
(4)PCR反應(yīng)后期,由于▲等原因,反應(yīng)速率會(huì)降低。
(5)PCR過程中,溫度的控制至關(guān)重要,變性溫度過低會(huì)因?yàn)椤?最終都會(huì)導(dǎo)致反應(yīng)效率降
低。退火溫度過高則會(huì)因▲導(dǎo)致目標(biāo)產(chǎn)物的量▲。
(6)不對(duì)稱PCR是利用不等量的一對(duì)引物來產(chǎn)生大量單鏈DNA的方法。這兩種引物分別為限制
性引物與非限制性引物,其最佳比例一般為1:50~1:100,在PCR反應(yīng)的最初10~15個(gè)
循環(huán)中,其擴(kuò)增產(chǎn)物最初主要是雙鏈DNA,但當(dāng)限制性引物消耗完后,非限制性引物引導(dǎo)
的PCR就會(huì)產(chǎn)生大量的單鏈DNA。假設(shè)反應(yīng)體系中原來有a個(gè)模板DNA,最初10個(gè)循環(huán)
擴(kuò)增產(chǎn)生雙鏈DNA,后20個(gè)循環(huán)均只擴(kuò)增一條鏈,則需要限制性引物▲個(gè),需要非限制
性引物上個(gè)。因?yàn)殡p鏈DNA和單鏈DNA的▲不同,可通過電泳方法將其分離。
【命題角度9】實(shí)時(shí)熒光定量PCR
傳統(tǒng)的PCR只有等擴(kuò)增結(jié)束后,才能進(jìn)一步檢測(cè)目的DNA片段的產(chǎn)量;期望能夠不等PCR擴(kuò)
新的挑戰(zhàn)
增結(jié)束,在PCR進(jìn)行的過程中,就能定量判斷擴(kuò)增的進(jìn)程,定量判斷目的DNA片段的數(shù)量
固有條件PCR擴(kuò)增儀、熱穩(wěn)定的DNA聚合酶、足量的dNTP、緩沖體系、Mg"等陽離子
解決策略▲
第9頁共12頁
[例1]實(shí)時(shí)熒光定量PCR簡稱qPCR,靈敏度高特異性好,是目前檢測(cè)微小殘留病變的常用方法。將熒光
標(biāo)記的Taqman探針與待測(cè)樣本DNA混合,當(dāng)探針完整時(shí),不產(chǎn)生熒光。在PCR過程中,與目的
基因結(jié)合的探針被TaqDNA聚合酶水解,R與Q分離后,R發(fā)出的熒光可被檢測(cè)到在特定光激發(fā)下
發(fā)出熒光(如圖所示),隨著循環(huán)次數(shù)的增加,熒光信號(hào)強(qiáng)度增加,通過實(shí)時(shí)檢測(cè)熒光信號(hào)強(qiáng)度,
可得Ct值(該值與待測(cè)樣本中目的基因的個(gè)數(shù)呈負(fù)相關(guān))。下列相關(guān)敘述錯(cuò)誤的是:
引物1?@
3’--------------------------------------y
5,-------------------------------------3*
施引物2
用
31----------------------5,
5,------------------31
注:R表示熒光基因,Q表示淬滅基因.
A.每個(gè)模板DNA分子含有2個(gè)游離的磷酸基團(tuán)
B.在反應(yīng)過程中,無需ATP為新鏈的合成提供能量
C.做qPCR之前,需要先根據(jù)目的基因的核甘酸序列合成引物和Taqman探針
D.熒光信號(hào)達(dá)到設(shè)定的閾值時(shí),經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)越少,說明含有的病變的概率越小
【例2】“實(shí)時(shí)熒光定量RT—PCR”是新冠疫情防控的一把利刃,通常在1?2h內(nèi)即可得到檢測(cè)結(jié)果。TaqMan
探針是實(shí)時(shí)熒光定量RT—PCR技術(shù)中一種常用探針(如圖1),其5末端連接熒光基團(tuán)(R),3
末端連接淬滅劑(Q)o當(dāng)探針完整時(shí),R發(fā)出的熒光信號(hào)被Q吸收而不發(fā)熒光。在PCR擴(kuò)增過程
中,當(dāng)Taq酶遇到探針時(shí)會(huì)使探針?biāo)舛尫懦鲇坞x的R和Q,R發(fā)出的熒光信號(hào)被相應(yīng)儀器檢
測(cè)到,熒光信號(hào)的累積與PCR產(chǎn)物數(shù)量完全同步(如圖2)。請(qǐng)據(jù)圖回答:
病毒樣品RNA-
I
MMa做針雙鏈DNA一
@弓瞅探針與模慳顯二
熒光基因(SB淬滅劑?引物2
帆延佛解解匕二.T還九
圖]
Tao胸切割探針期Q1’7一
和聚合越EL?⑥
圖2
(1)結(jié)合圖1和圖2分析,“熒光RT—PCR技術(shù)”所用的試劑盒中通常都應(yīng)該含有▲酶、▲
酶、TaqMan探針、引物、dNTP、Mg2\緩沖劑系等。這種分子層面的熒光RT—PCR檢測(cè)具有
特異性和靈敏性都很高的特點(diǎn),主要與試劑盒中的▲、▲有關(guān)。
(2)根據(jù)TaqMan探針功能分析,探針中堿基序列的設(shè)計(jì)應(yīng)主要依據(jù)工。新冠病毒(nCoV-2019)
是冠狀病毒大家庭中的新的一員,其堿基序列與引起SARS的冠狀病毒堿基序列有79.5%的
相似性,與流感病毒堿基相似度也較高,因此在設(shè)計(jì)TaqMan探針時(shí)應(yīng)篩選出nCoV-2019
特有序列,以避免▲(填“假陰性”或“假陽性”)的出現(xiàn)。
(3)根據(jù)圖1和圖2,Taq酶的除了能催化DNA子鏈的延伸,還能▲。
(4)若每分子探針?biāo)忉尫诺腞基團(tuán)熒光強(qiáng)度為定值a,則反應(yīng)體系中某時(shí)刻熒光信號(hào)強(qiáng)度(Rn)
主要與▲、▲有關(guān)。在檢測(cè)過程中,隨著PCR的進(jìn)行,反應(yīng)產(chǎn)物不斷累積,“雜交雙
鏈”熒光信號(hào)的強(qiáng)度也等比例增加,加了保證檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性,一般要達(dá)到或超過閾值
時(shí)才確診??赏ㄟ^熒光強(qiáng)度的變化監(jiān)測(cè)產(chǎn)生量的變化從而得到一條熒光擴(kuò)增曲線圖(如右
圖)。“平臺(tái)期”出現(xiàn)的最可能的原因是試劑盒中上等有限,超出一定的循環(huán)數(shù)后,熒
光標(biāo)記的“雜交雙鏈”不再增加。
,呼臺(tái)期T
(
屈
配
米指數(shù)擴(kuò)增階號(hào)
胭
C
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