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DB34DB34/T3283—2018副豬嗜血桿菌的分子分型MLST方法MultilocussequencetypingdetectionmethodforHaemophilusparasuis2018-12-29發(fā)布2019-01-29實(shí)施安徽省市場監(jiān)督管理局發(fā)布I14.4dNTP:dATP、dTTP),24.115×TBE電泳緩沖液:445mmo物。引物在使用前按照引物合成時的既定濃3后使用Lasergene7.1對序列進(jìn)行ClustalV分析,將上下游序列整合后得到完整序列,為減小誤差首尾的幾個堿基不計(jì)算入序列測定結(jié)果。最后將測序結(jié)果上傳至MLST網(wǎng)站()進(jìn)行在線數(shù)據(jù)分析,得到的結(jié)果與MLST數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對。將所得到的副豬嗜血桿菌7個管家基因核酸擴(kuò)增片段DNA序列進(jìn)行MLST分析,獲得菌株所對應(yīng)的等位基因圖譜,確定副豬嗜血桿菌分離株的序),),4ATP合成酶β鏈基因(βchainofATPsynthase)蘋果酸脫氫酶基因(malatedehyd6-磷酸葡萄糖脫氫酶基因(6-phosphogluco3-磷酸甘油醛脫氫酶基因(glyceraldehyde-3-phosphatedeh延胡索酸還原酶基因(fumaratereduCGTCCATATAGTGAATTTCTCTAATACTTTGTTTGAGT5將所得到的副豬嗜血桿菌7個管家基因核酸擴(kuò)增片段DNA序列進(jìn)行MLST分析,獲得菌株所對應(yīng)的等位基因圖譜,確定副豬嗜血桿菌分離株的序列型(Sequence國際菌株的資料進(jìn)行比較。在確定STs的基礎(chǔ)上應(yīng)用eBURST程序?qū)⒕攴譃楦鱾€譜系組(clonal
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