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文檔簡(jiǎn)介

第五章酶的生物合成與調(diào)節(jié)機(jī)理

遺傳信息傳遞的中心法則轉(zhuǎn)錄傳遞給RNA,再由RNA蛋白質(zhì)翻譯轉(zhuǎn)錄逆轉(zhuǎn)錄復(fù)制復(fù)制DNARNA

第一節(jié)RNA的生物合成第二節(jié)蛋白質(zhì)的生物合成第三節(jié)酶生物合成的調(diào)節(jié)第四節(jié)酶活性的調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄傳遞給RNA,再由RNA

第一節(jié)RNA的生物合成

--轉(zhuǎn)錄(transcription)定義:以DNA為模板,以核苷三磷酸為底物,在RNA聚合酶(轉(zhuǎn)錄酶)的作用下,生成RNA分子的過程。.轉(zhuǎn)錄模板

啟動(dòng)子(promotor)

終止子(terminator)模板鏈(templatestrand)反意義鏈(antisensestrand)編碼鏈(codingstrand)有意義鏈(sensestrand)DNA5′5′3′3′反意義鏈:指導(dǎo)轉(zhuǎn)錄作用的一條DNA鏈有意義鏈:無轉(zhuǎn)錄功能的一條DNA鏈.TCGAGTACAGCTCATGCGAGUACGCAURNA聚合酶有意義鏈反意義鏈RNAPPi5’5’3’GTPUTPCTPATPUTPRNA在DNA模板上的生物合成3’3’5’RNA的轉(zhuǎn)錄過程(三步)1.起始2.延長(zhǎng)3.終止

原核生物的RNA聚合酶(DDRP)

E.coli的RNA聚合酶是由四種亞基組成的五聚體(

2

起始因子RNA合成過程起始雙鏈DNA局部解開磷酸二酯鍵形成終止階段解鏈區(qū)到達(dá)基因終點(diǎn)延長(zhǎng)階段5

3

RNA

啟動(dòng)子(promotor)

終止子(terminator)5

RNA聚合酶

5

3

5

3

5

5

3

離開RNA鏈的延伸圖解3′5′RNA-DNA雜交螺旋聚合酶的移動(dòng)方向新生RNA復(fù)鏈解鏈有義鏈模板鏈(反義鏈)延長(zhǎng)部位定義:以mRNA為模板,以氨基酸為底物,在核糖體上通過各種tRNA、酶和輔助因子的作用,合成多肽鏈的過程。第二節(jié)蛋白質(zhì)的生物合成

--翻譯(translation)

酪5’5’3’AUGGUUUACACA酪氨酰-tRNA反密碼mRNA密碼與反密碼的堿基配對(duì)AUGACA5’蛋蘇UGUGUU3’受位(A位)給位(P位)大亞基小亞基蛋白質(zhì)的合成過程

(大腸桿菌)氨基酸的活化肽鏈合成的起始肽鏈的延伸肽鏈合成的終止與釋放氨基酸的活化與轉(zhuǎn)運(yùn)反應(yīng)式:AA+tRNA+ATP氨酰-tRNA合成酶氨酰-tRNA+AMP+PPi

對(duì)于E.coli而言,肽鏈合成時(shí)的第一個(gè)氨基酸都是甲酰甲硫氨酸(fMet)。在核糖體上合成多肽(三階段)1、起始階段2、延伸階段3、終止階段肽鏈合成的起始階段1.mRNA與小亞基結(jié)合:形成30S-mRNA-IF3復(fù)合物2.AUG與蛋氨酰-tRNA結(jié)合:

30S-mRNA-IF3

fMet-tRNA-IF2-GTP

fMet-tRNA正好位于mRNA的起始密碼子上(AUG)。3.大小亞基結(jié)合IF130S起始復(fù)合物AUGACA5’3’AUGACA5’3’UACUACAUGACA5’3’小亞基mRNA蛋氨酰tRNAGTP大亞基GDP+Pi受位給位蛋蛋肽鏈合成的起始階段肽鏈合成的延伸階段1.進(jìn)位:氨基酰-tRNA進(jìn)入受位;2.轉(zhuǎn)肽:形成肽鍵,在轉(zhuǎn)肽酶作用下,給位與受位結(jié)合;3.移位:核蛋白體向3’端移動(dòng)一個(gè)密碼子的位置,空出受位,不斷地進(jìn)位、轉(zhuǎn)肽、移位,使肽鏈延長(zhǎng)。AUGACA5’3’UAC蛋蘇UGUAUGACA5’UAC蛋蘇UGUGUUAUGACA5’UAC蛋蘇UGUGUUAUGACA5’蛋蘇UGUGUU3’3’3’GTPGDP+PiGDP+PiGTP起始復(fù)合體進(jìn)位轉(zhuǎn)肽移位Mg+K+肽鏈合成的終止階段1.出現(xiàn)終止密碼并與終止因子結(jié)合;2.肽鍵水解,多肽釋放;3.tRNA,mRNA,大小亞基解離.

AUGUAA5’UACAUGUAA5’UAC3’3’終終AUGUAA5’UAC3’終5’3’UAC終肽鏈第三節(jié)酶生物合成的調(diào)節(jié)定義:通過調(diào)節(jié)酶合成的量來控制微生物代謝速度的調(diào)節(jié)機(jī)制,是在基因轉(zhuǎn)錄水平上進(jìn)行的。意義:通過阻止酶的過量合成,節(jié)約生物合成的原料和能量。操縱子——基因表達(dá)的協(xié)同單位操縱子結(jié)構(gòu)基因(編碼蛋白質(zhì),structuralgene,S)控制部位操縱基因(operatorgene,O)啟動(dòng)子(promotorgene,P)(一)基因調(diào)控理論

JacobandMonod的操縱子學(xué)說(operontheory)

基因操縱子調(diào)節(jié)系統(tǒng)示意圖

調(diào)節(jié)基因

啟動(dòng)基因操縱基因結(jié)構(gòu)基因

DNA

轉(zhuǎn)錄

(-)

RNA聚合酶(+)轉(zhuǎn)錄

翻譯

mRNA

翻譯

阻遏蛋白

蛋白質(zhì)

誘導(dǎo)劑

控制區(qū)信息區(qū)操縱子

調(diào)節(jié)基因(regulatorgene):

可產(chǎn)生一種組成型調(diào)節(jié)蛋白(regulatoryprotein)

(一種變構(gòu)蛋白),通過與效應(yīng)物(effector)(包括誘導(dǎo)物和輔阻遏物)的特異結(jié)合而發(fā)生變構(gòu)作用,從而改變它與操縱基因的結(jié)合力。調(diào)節(jié)基因常位于調(diào)控區(qū)的上游。

cAMP-CRP復(fù)合物的作用示意圖

啟動(dòng)基因(promotorgene)(啟動(dòng)子):有兩個(gè)位點(diǎn):

(1)RNA聚合酶的結(jié)合位點(diǎn)(2)cAMP-CAP的結(jié)合位點(diǎn)。CAP:分解代謝產(chǎn)物基因活化蛋白(catabolitegeneactivatorprotein),又稱環(huán)腺苷酸受體蛋白(cAMPreceptorprotein,CRP)。

只有cAMP-CRP復(fù)合物結(jié)合到啟動(dòng)子的位點(diǎn)上,RNA聚合酶才能結(jié)合到其在啟動(dòng)子的位點(diǎn)上,酶的合成才能開始。

操縱基因(Operatergene):

位于啟動(dòng)基因和結(jié)構(gòu)基因之間的一段堿基順序,能特異性地與調(diào)節(jié)基因產(chǎn)生的變構(gòu)蛋白結(jié)合,操縱酶合成的時(shí)機(jī)與速度。結(jié)構(gòu)基因(Structuralgene):

決定某一多肽的DNA模板,與酶有各自的對(duì)應(yīng)關(guān)系,其中的遺傳信息可轉(zhuǎn)錄為mRNA,再翻譯為蛋白質(zhì)。(二)酶合成調(diào)節(jié)的類型

1.誘導(dǎo)

(induction)

組成酶:細(xì)胞固有的酶類。誘導(dǎo)酶:是細(xì)胞為適應(yīng)外來底物或其結(jié)構(gòu)類似物而臨時(shí)合成的一類酶。

2.阻遏

(repression)

分解代謝物阻遏(cataboliterepression)

反饋?zhàn)瓒?feedbackrepression)(三)酶合成的調(diào)節(jié)機(jī)制

1.酶合成的誘導(dǎo)加進(jìn)某種物質(zhì),使酶生物合成開始或加速進(jìn)行。酶合成誘導(dǎo)的現(xiàn)象:

已知分解利用乳糖的酶有:

-半乳糖苷酶;

-半乳糖苷透過酶;硫代半乳糖苷轉(zhuǎn)乙酰酶。實(shí)驗(yàn):(1)大腸桿菌生長(zhǎng)在葡萄糖培養(yǎng)基上時(shí),細(xì)胞內(nèi)無上述三種酶合成;(2)大腸桿菌生長(zhǎng)在乳糖培養(yǎng)基上時(shí),細(xì)胞內(nèi)有上述三種酶合成;(3)表明菌體生物合成的經(jīng)濟(jì)原則:需要時(shí)才合成。調(diào)節(jié)基因操縱基因乳糖結(jié)構(gòu)基因PLacZLacYLacamRNA阻遏蛋白(有活性)基因關(guān)閉啟動(dòng)子ORPLacZLacYLaca調(diào)節(jié)基因操縱基因乳糖結(jié)構(gòu)基因啟動(dòng)子ORmRNAZmRNAYmRNAa阻遏蛋白(無活性)基因表達(dá)mRNAA、乳糖操縱子的結(jié)構(gòu)

B、乳糖酶的誘導(dǎo)

乳糖阻遏蛋白(有活性)誘導(dǎo)

2.末端產(chǎn)物阻遏

由某代謝途徑末端產(chǎn)物的過量累積引起的阻遏。

酶合成阻遏的現(xiàn)象:

實(shí)驗(yàn):

(1)大腸桿菌生長(zhǎng)在無機(jī)鹽和葡萄糖的培養(yǎng)基上時(shí),檢測(cè)到細(xì)胞內(nèi)有色氨酸合成酶的存在;

(2)在上述培養(yǎng)基中加入色氨酸,檢測(cè)發(fā)現(xiàn)細(xì)胞內(nèi)色氨酸合成酶的活性降低,直至消失。

(3)表明色氨酸的存在阻止了色氨酸合成酶的合成,體現(xiàn)了菌體生長(zhǎng)的經(jīng)濟(jì)原則:不需要就不合成。色氨酸操縱子——酶的阻遏調(diào)節(jié)基因操縱基因結(jié)構(gòu)基因mRNA酶蛋白阻遏蛋白不能與操縱基因結(jié)合,結(jié)構(gòu)基因表達(dá)調(diào)節(jié)基因操縱基因結(jié)構(gòu)基因輔阻遏物代謝產(chǎn)物與阻遏蛋白結(jié)合,使之構(gòu)象發(fā)生變化與操縱基因結(jié)合,結(jié)構(gòu)基因不能表達(dá)酶的誘導(dǎo)和阻遏操縱子模型B.有活性阻遏蛋白加誘導(dǎo)劑A.有活性阻遏蛋白C.無活性阻遏蛋白D.無活性阻遏蛋白加輔阻遏劑操縱基因啟動(dòng)基因調(diào)節(jié)基因結(jié)構(gòu)基因阻遏蛋白(有活性)阻遏蛋白阻擋操縱基因結(jié)構(gòu)基因不表達(dá)誘導(dǎo)物誘導(dǎo)物與阻遏蛋白結(jié)合,使阻遏蛋白不能起到阻擋操縱基因的作用,結(jié)構(gòu)基因可以表達(dá)酶蛋白mRNA阻遏蛋白不能跟操縱基因結(jié)合,結(jié)構(gòu)基因可以表達(dá)阻遏蛋白(無活性)酶蛋白mRNA代謝產(chǎn)物與阻遏蛋白結(jié)合,從而使阻遏蛋白能夠阻擋操縱基因,結(jié)構(gòu)基因不表達(dá)代謝產(chǎn)物調(diào)控方式阻遏蛋白添加物與操縱基因結(jié)合阻遏效應(yīng)舉例酶的誘導(dǎo)有活性-+不轉(zhuǎn)錄,繼而不翻譯誘導(dǎo)物-轉(zhuǎn)錄,繼而翻譯乳糖操縱子酶的阻遏無活性-阻遏物+不轉(zhuǎn)錄,繼而不翻譯色氨酸操縱子酶合成的誘導(dǎo)與阻遏操縱子模型調(diào)控作用對(duì)比3.分解代謝物阻遏指細(xì)胞內(nèi)同時(shí)有兩種分解底物(碳源或氮源)存在時(shí),利用快的那種分解底物會(huì)阻遏利用慢的底物的有關(guān)酶合成的現(xiàn)象。分解代謝物的阻遏作用,并非由于快速利用的甲碳源本身直接作用的結(jié)果,而是通過甲碳源(或氮源等)在其分解過程中所產(chǎn)生的中間代謝物所引起的阻遏作用。分解代謝物阻遏現(xiàn)象:

實(shí)驗(yàn):細(xì)菌在含有葡萄糖和乳糖的培養(yǎng)基上生長(zhǎng),優(yōu)先利用葡萄糖。待葡萄糖耗盡后才開始利用乳糖,產(chǎn)生了兩個(gè)對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期中間隔開一個(gè)生長(zhǎng)延滯期的“二次生長(zhǎng)現(xiàn)象”(diauxie或biphasicgrowth)。這一現(xiàn)象又稱葡萄糖效應(yīng),產(chǎn)生的原因是由于葡萄糖降解物阻遏了分解乳糖酶系的合成。此調(diào)節(jié)基因的產(chǎn)物是環(huán)腺苷酸受體蛋白(CRP),亦稱降解物基因活化蛋白(CAP)。分解代謝物阻遏RLacZLacYLacamRNAmRNAZmRNAYmRNAa基因表達(dá)CAP基因結(jié)構(gòu)基因TCAPOCAP結(jié)合部位

RNA聚合酶TcAMP-CAPP葡萄糖分解代謝產(chǎn)物腺苷酸環(huán)化酶磷酸二酯酶ATPcAMP5'-AMP抑制激活葡萄糖降解物與cAMP的關(guān)系cAMPCAP:降解物基因活化蛋白(catabolicgeneactivationprotein)降低cAMP濃度使CAP呈失活狀態(tài)第四節(jié)酶活性的調(diào)節(jié)激活劑與抑制劑對(duì)酶活的調(diào)節(jié)可逆共價(jià)修飾的活性調(diào)節(jié)別構(gòu)酶的活性調(diào)節(jié)代謝途徑中酶活的反饋調(diào)節(jié)激活劑無機(jī)離子小分子有機(jī)物金屬離子:K+、Na+

、Mg+、Zn+、Fe+、Ca+陰離子:Cl-(唾液淀粉酶)氫離子螯合劑EDTA,解除重金屬對(duì)酶的抑制還原劑:半胱氨酸、谷氨甘肽具蛋白質(zhì)性質(zhì)的大分子物質(zhì),可激活無活性的酶原一,激活劑與抑制劑對(duì)酶活的調(diào)凡是能提高酶反應(yīng)活性的物質(zhì)都稱為激活劑激活劑:

注意區(qū)分酶的激活劑和輔助因子:

輔助因子是酶的組成部分,一旦失去酶就完全喪失活性;而激活劑并非酶的組分,即使沒有酶也有活性,它們的存在能提高酶活性。激活劑特別是無機(jī)離子激活劑對(duì)酶的作用有以下特點(diǎn):1、選擇性一種激活劑對(duì)某種酶有激活作用,對(duì)另一種酶可能有抑制作用。2、存在拮抗現(xiàn)象例如Na+能抑制K+對(duì)酶的激活,Ca2+能抑制Mg2+對(duì)酶的激活。3、可相互替代例如Mg2+對(duì)激酶的激活作用可被Mn2+所取代。4、濃度的影響有的激活劑在低濃度范圍內(nèi)對(duì)酶有激活作用,濃度過高反而起抑制作用。抑制劑:某些物質(zhì),它們并不引起酶蛋白變性,但能使酶分子上某些必需基團(tuán)(主要指酶活性中心的一些基團(tuán))發(fā)生變化,因而引起酶活力下降,甚至喪失,致使酶反應(yīng)速度降低,能引起這種作用的物質(zhì)稱為抑制劑??赡嬉种品锤?jìng)爭(zhēng)性抑制非競(jìng)爭(zhēng)性抑制競(jìng)爭(zhēng)性抑制不可逆抑制1.化學(xué)修飾的概念酶蛋白肽鏈上某些殘基在酶的催化下發(fā)生可逆的共價(jià)修飾(covalentmodification),從而引起酶活性改變,這種調(diào)節(jié)稱為酶的化學(xué)修飾。二,可逆共價(jià)修飾的活性調(diào)節(jié)2.化學(xué)修飾的主要方式磷酸化---去磷酸乙?;?--脫乙酰甲基化---去甲基腺苷化---脫腺苷

SH與–S—S–互變酶的磷酸化與脫磷酸化-OHThrSerTyr酶蛋白H2OPi磷蛋白磷酸酶ATPADP蛋白激酶ThrSerTyr-O-PO32-磷酸化的酶蛋白3.化學(xué)修飾的特點(diǎn)①酶蛋白的共價(jià)修飾是可逆的酶促反應(yīng),在不同酶的作用下,酶蛋白的活性狀態(tài)可互相轉(zhuǎn)變。催化互變反應(yīng)的酶在體內(nèi)可受調(diào)節(jié)因素如激素的調(diào)控。②具有放大效應(yīng),效率較變構(gòu)調(diào)節(jié)高。③磷酸化與脫磷酸是最常見的方式。

同一個(gè)酶可以同時(shí)受變構(gòu)調(diào)節(jié)和化學(xué)修飾調(diào)節(jié)。1.變構(gòu)調(diào)節(jié)的概念小分子化合物與酶分子活性中心以外的某一部位特異結(jié)合,引起酶蛋白分子構(gòu)象變化,從而改變酶的活性,這種調(diào)節(jié)稱為酶的變構(gòu)調(diào)節(jié)或別構(gòu)調(diào)節(jié)。三,別構(gòu)酶的活性調(diào)節(jié)被調(diào)節(jié)的酶稱為變構(gòu)酶或別構(gòu)酶(allostericenzyme)使酶發(fā)生變構(gòu)效應(yīng)的物質(zhì),稱為變構(gòu)效應(yīng)劑(allosteric

effector)

?變構(gòu)激活劑

allosteric

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