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DB21TechnicalRegulationsofSSRanalysisinQuercusmon遼寧省市場(chǎng)監(jiān)督管理局發(fā)布I I高旭、李昀峰、扈延伍、曹穎、劉金義、龐家舉、許家銘、翟金鳳、),I1蒙古櫟SSR分析技術(shù)規(guī)程4儀器設(shè)備及試劑2-20℃預(yù)冷,用自來(lái)水、蒸餾水先后沖洗葉面,再用濾紙吸干水分。),看不清沉淀,10000g離心10min,再收集沉淀。g)加入1mL~1.5mL70%無(wú)水乙醇浸泡洗滌沉淀,輕搖幾分鐘,糖凝膠上電泳15min~20min,穩(wěn)壓90V,電泳緩沖液為1×TBE,325nm紫外燈下觀察,照相,檢測(cè)提取DNA的質(zhì)量。按照GB/T28663),將長(zhǎng)板玻璃板平鋪于通風(fēng)櫥內(nèi),邊條擦拭干凈后置于長(zhǎng)板玻璃板兩側(cè),隨后用短板玻璃板整齊地壓蓋住,確認(rèn)邊條與兩玻璃板均對(duì)齊后,將其配制1%的瓊脂糖凝膠,煮沸后用膠頭滴管吸取,沿底邊從左至右緩緩灌注入封膠框中,避免出現(xiàn)氣泡,待瓊脂糖凝膠完全漫過(guò)玻璃板底部,停止灌注,放置于待凝膠完全凝固后,將裝有凝膠的玻璃板輕輕從制膠板上取下,灌膠口向內(nèi)用夾子固定在電泳槽上,使用1×TBE緩沖溶液灌注電泳儀的上下兩槽,使下槽溶液漫過(guò)封膠框,上槽溶液漫過(guò)灌膠孔。垂照,電泳在200V穩(wěn)壓,電流100mA條件下進(jìn)行,電泳時(shí)間約為1.54電泳結(jié)束,關(guān)閉電源,將上槽中1×TBE緩沖液放出,取下固定的夾子,去掉下部瓊脂糖,取下玻璃板。將玻璃板水平放置,用起膠鏟沿灌膠口一側(cè)邊緣將玻璃板緩慢撬起,將緊貼有凝膠的玻璃板放入裝有雙蒸水的洗膠盤(pán)中輕輕搖晃,待凝膠與玻璃板完全分離后,取出玻璃板,放凈雙蒸水。計(jì)算檢測(cè)樣品間的遺傳相似性水平。采用非加權(quán)組平均法(unweightedpair-groupmethodwitharithmeticmeans,UPGMA)進(jìn)行聚類(lèi)分析;繪制聚Nij——第i個(gè)樣品和第j個(gè)樣品共有的擴(kuò)增條帶數(shù)。對(duì)6-FAM和HEX熒光標(biāo)記的PCR產(chǎn)物用超純水稀釋30倍(注:不同熒光標(biāo)記的擴(kuò)增產(chǎn)物他的最適稀釋度通過(guò)預(yù)實(shí)驗(yàn)確定)。分別取等體積的上述2種稀釋液混合,從中吸取1μL加入到基因分析儀專(zhuān)用965SSR廣泛分布于蒙古櫟基因組中,不同蒙古櫟種源或家系間每個(gè)SSR位點(diǎn)重復(fù)單位的數(shù)量可能不6PCR儀、基因分析儀、凝膠成像系統(tǒng)、水平電泳槽及配套的制膠配件、垂直電泳槽及配套的制件、臺(tái)式低溫高速冷凍離心機(jī)、超微量紫外/可見(jiàn)分光光度計(jì)、高壓滅菌鍋、液氮罐、超低溫冰箱、高M(jìn)arker、丙烯酰胺、過(guò)硫酸銨(APS)、四甲基乙二胺(括FAX、HEX熒光標(biāo)記DNA片段)、D7退火溫度(℃)N1010265N1014482N1105306N1110207N1345390N12361N1247890N1457047N4544558N45298408D.1.10.5mol/LEDTA-二鈉(p將24.22g三羥甲基氨基甲烷溶解于160mL水中,用濃鹽酸(HCl)調(diào)節(jié)pH至8.0,用超純水定容至將58.44g氯化鈉(NaCl)溶于160mL水中,定容至200mL,高壓滅mmol/LEDTA(0.5mol/L,pH8.0)和1.稱(chēng)取80g氫氧化鈉(NaOH先用1606×DNALordingBuffer,其中含0.05%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))溴酚藍(lán)、液的比例,混勻DN
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