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文檔簡介
生物化學王境巖第三版課后習題答案
第1章糖類
1.環(huán)狀己醛糖有多少個可能的旋光異構體,為什么?[25=32]
解:考慮到Cl、C2、C3、C4及aB兩種構型,故總的旋光異構體為
2的4次方乘以2=32個。
2.含DT此喃半乳糖和D-毗喃葡萄糖的雙糖可能有多少個異構體(不
包括異頭物)含同樣殘基的糖蛋白上的二糖鏈將有多少個異構體[20;32]
解:一個單糖的C1可以與另一單糖的Cl、C2、C3、C4、C6形成糖首
鍵,于是a-D-毗喃半乳基-D-毗喃葡萄糖甘、B-D-毗喃半乳基-DT匕喃
葡萄糖甘、Q-DTI比喃葡萄糖基-DT此喃半乳糖甘、84>毗喃葡萄糖基力-
毗喃半乳糖昔各有5種,共5某4=20個異構體。
糖蛋白上的二糖鏈其中一個單糖的C1用于連接多肽,C2、C3、C4、
C6用于和另一單糖的C1形成糖苔鍵,算法同上,共有4某4二16個,考
慮到二糖與多肽相連時的異頭構象,異構體數(shù)目為16某2二32個。
3.寫出B-D-脫氧核糖、a-D-半乳糖、B-L-山梨糖和B-D-N-乙酰
神經(jīng)氨酸(唾液酸)的Ficher投影式,Haworth式和構象式。
4.寫出下面所示的(A).(B)兩個單糖的正規(guī)名稱(D/L,a/B,f/p),
指出(C).(D)兩個結構用RS系統(tǒng)表示的構型(R/S)
[A、a-D-f-Fru;B、a-L-p-Glc;C、R;D、S]
5.L7-葡萄糖的a和p異頭物的比旋[aD20]分別為+112.2°和+18.70°。
當a-D-毗喃葡糖晶體樣品溶于水時,比旋將由+112.2°降至平衡值
+52.70°o計算平衡混合液中a和B異頭物的比率。假設開鏈形式和聯(lián)
喃形式可忽略。[a異頭物的比率為36.5%,P異頭物為63.5%]解:設
a異頭物的比率為某,則有112.2某+18.7(1—某)=52.7,解得某=36.5%,
于是(1一某)=63.5%。6.將500mg糖原樣品用放射性粗化鉀(K14CN)處理,
被結合的14CN—正好是0.193nmol,另一500mg同一糖原樣品,用含
3%HCI的無水甲醇處理,使之形成還原末端的甲基葡糖昔。然后用高碘酸
處理這個還原端成為甲基葡糖昔的糖原,新產(chǎn)生的甲酸準確值是
347nmolo計算(a)糖原的平均相對分子質量.(b)分支的程度(分支
點%)[(a)2.59<106;(b)11.24%]解:(a)Mr=0.5/(0.1930-6)=2.59
某106
(b)347某10-6某163/0.5=11.3%7.D-葡萄糖在31℃水中平衡時,
QT此喃葡糖和BT此喃葡糖的相對摩爾含量分別為37.3%和62.796。計算
D-葡萄糖在31°C時由a異頭物轉變?yōu)镻異頭物的標準自由能變化。氣
體常數(shù)R為8.314J/molKo[△G0=-l.31kJ/mol]
解:AG0=-RTln(c2/cl)=-8.314某300某In(62.7/37.3)=-
1.30kJ/mol
8.竹子系熱帶禾本科植物,在最適條件下竹子生長的速度達0.3m/d
高,假定竹莖幾乎完全由纖維素纖維組成,纖維沿生長方向定位。計算每
秒鐘酶促加入生長著的纖維素鏈的單糖殘基數(shù)目。纖維素分子中每一葡萄
糖單位約長0.45nm。[7800殘基/]解:[0.3/(24某3600)]/0.45某10-
9=7800殘基/
9.經(jīng)還原可生成山梨醇(D-葡萄醇)的單糖有哪些[L-山梨糖;D-葡萄
糖;L-古洛糖;D-果糖]
10.寫出麥芽糖(a型)、纖維二糖(B型)、龍膽糖和水蘇糖的正規(guī)
(系統(tǒng))名稱的簡單形式,并指出其中哪些(個)是還原糖,哪些(個)是非
還原糖。解:麥芽糖(。型):Glca(l->4)Glc纖維二糖(B型):
GlcB(1-4)Glc龍膽糖:GlcB(1-6)G1
水蘇糖:Gala(l->6)Gala(l->6)Glc(al->P2)Fru
11.纖維素和糖原雖然在物理性質上有很大的不同,但這兩種多糖都
是『4連接的D-葡萄糖聚合物,相對分子質量也相當,是什么結構特點
造成它們在物理性質上的如此差別解釋它們各自性質的生物學優(yōu)點。
答:糖原是人和動物餐間以及肌肉劇烈運動時最易動用的葡萄糖貯庫。
纖維素是植物的結構多糖,是他們的細胞壁的主要組成成分。
12.革蘭氏陽性細菌和陰性細菌的細胞壁在化學組成上有什么異同肽
聚糖中的糖肽鍵和糖蛋白中的糖肽鍵是否有區(qū)別
答:肽聚糖:革蘭氏陽性細菌和陰性細菌共有;磷壁酸:革蘭氏陽性
細菌特有;脂多糖:革蘭氏陰性細菌特有。兩種糖肽鍵有區(qū)別:肽聚糖中
為NAM的C3羥基與D-Ala竣基相連;糖蛋白中是糖的C1羥基與多肽
Any-氨基N或Thr/Scr/Hyl/Hyp羥基0相連。
13.假設一個細胞表面糖蛋白的一個三糖單位在介導細胞與細胞粘著
中起關鍵作用。試設計一個簡單試驗以檢驗這一假設。[如果糖蛋白的這
個三糖單位在細胞相互作用中是關鍵的,則此三糖本身應是細胞粘著的競
爭性抑制劑]
14.糖蛋白中N-連接的聚糖鏈有哪些類型它們在結構上有什么共同
點和不同點
(2)高甘露糖型(high-mannoetype)此型N-糖鏈除核心五糖外只含a-
甘露糖殘基。(3)雜合型(hybridtype)此型糖鏈具有復雜型和高甘露糖型
這兩類糖鏈的結構元件。
15.舉出兩個例子說明糖蛋白寡糖鏈的生物學作用。
1.天然脂肪酸在結構上有哪些共同的特點
答:天然脂肪酸通常具有偶數(shù)碳原子,鏈長一般為12-22碳。脂肪酸
可分為飽和、單不飽和與多不飽和脂肪酸。不飽和脂肪酸的雙鍵位置,有
一個雙鍵幾乎總是處于C9-C10之間(A9),并且一般是順式的。
2.(a)由U油和三種不同的脂肪酸(如豆蔻酸、棕桐酸和硬脂酸)可形
成多少種不同的三酰甘油(包括簡單型和混合型在內)?(b)其中定量上不
同組成的三酰甘油可有多少種?[(a)27種;(b)10種]解:(a)33=27
種;(b)3某3+1=10種
3.(a)為什么飽和的18碳脂肪酸一一硬脂酸的熔點比18碳不飽和脂
肪酸一一油酸的熔點高?(b)干酪乳桿菌產(chǎn)生的乳杯菌酸(19碳脂肪酸)的
熔點更接近硬脂酸的熔點還是更接近油酸的熔點?為什么?
答:(a)油酸有一個a9順式雙鍵,有序性校差;而硬脂酸有序性高,
故熔點也高;(b)硬脂酸。因為熔點隨鏈長的增加而增加。
4.從植物種子中提取出1g油脂,把它等分為兩份,分別用于測定該油
脂的皂化值和碘值。測定皂化值的一份樣品消耗K0H65mg,測定碘值的一
份樣品消耗I2510mg,試計算該油脂的平均相對分子質量和碘值。
[1292;102]解:Mr=(3某56某1000)/(2某65)=1292
I2值二0.51某100/0.5=102(100g油脂鹵化時吸收I2的克數(shù))
5,某油脂的碘值為68,皂化值為210。計算每個油脂分子平均含多
少個雙健。[2個]解:100g油脂的物質的量二(210某100)/(3某56某
1000)=0.125mol平均雙鍵數(shù)二(68/254)/0.125處2個
6.(a)解釋與脂質過氧化育關的幾個術語:自由基、活性氧、自由基
鏈反應和抗氧化劑;(b)為什么PUFA容易發(fā)生脂質過氧化答:(a)
自由基:自由基也稱游離基,是指含有奇數(shù)價電子并因此在一個軌道
上具有一個未(不)成對
電子(unpairedelectron)的原子或原子團。
活性氧:氧或含氧的高反應活性分子,如0-2、OH、H202、一02(單
線態(tài)氧)等統(tǒng)稱為活性氧。
自由基鏈反應:自由基化學性質活潑,能發(fā)生抽氫、歧化、化合、取
代、加成等多種反應,但是自由基反應的最大特點是傾向于進行鏈「式」
反應(chainreaction),鏈反應一般包括3個階段:引發(fā)、增長和終止???/p>
氧化劑:凡具有還原性而能抑制靶分子自動氧化即抑制自由基鏈反應的物
質稱為抗氧化劑(antio某idant)
(b)多不飽和脂肪酸(PUFA)中的雙鍵具有潛在的還原性,容易發(fā)生
過氧化作用。
8.寫出下列化合物的名稱:
(a)在低pH時,攜帶一個正凈電荷的甘油磷脂;(b)在中性pH時攜帶
負凈電荷的甘油磷脂;(c)在中性pH時,凈電荷為零的甘油磷脂。
答:(a)磷脂酰膽堿、磷脂酰乙醇胺;(b)磷脂酰絲氨酸、磷脂酰肌醇、
磷脂酰甘油,T;雙磷脂酰甘油(心磷脂),-2;(c)磷脂酰膽堿、磷脂
酰乙醇胺。
9.給定下列分子成分:廿油、脂肪酸、磷酸、長鏈醇和糖。試問(a)
哪兩個成分在蠟和鞘脂脂中都存在(b)哪兩個成分在脂肪和磷脂酰膽堿中
都存在(c)哪些(個)成分只在神經(jīng)節(jié)背脂而不在脂肪中存在[(a)脂肪酸,
長鏈醇;(b)甘油,脂肪酸;(c)糖,長鏈醇]
10.指出下列膜脂的親水成分和疏水成分:(d)磷脂酰乙醇胺;(b)鞘磷
脂;(c)半乳糖基腦昔脂;(d)神經(jīng)節(jié)背脂;(c)膽固醇。
答:3)乙醇胺;脂肪酸
(b)磷酰膽堿或磷酰乙醇胺;脂肪酸和煌鏈(c)半乳糖;脂肪酸和燃鏈
(d)連有唾液酸的寡糖鏈;脂肪酸和煌鏈(e)C3羥基;留核和C17烷
煌側鏈
11.(a)造成類固醇化合物種類很多的原因是什么(b)人和動物體內膽
固醇可轉變?yōu)槟男┚哂兄匾硪饬x的類固醇物質
答:(a)①環(huán)上的雙鍵數(shù)日和位置不同;②取代基的種類、數(shù)目、位置
和取向(a8)不同;③環(huán)和環(huán)稠合的構型(順反異構)不同。
(b)動物中從膽固醇衍生來的類固醇包括5類激素:雄激素、雌激素、
孕酮、糖皮質激素和鹽皮質激素,維生素D和膽汁酸。
12.膽酸是人膽汁中發(fā)現(xiàn)的A-B順式類固醇(圖2T8)請按圖2-15所
求椅式構象畫出膽酸的構象式,并以直立鍵或平伏鍵標出C3,C7和C12
上3個羥基。
13.一種血漿脂蛋白的密度為L08g/cm3,載脂蛋白的平均密度為
1.35g/cm3,脂質的平均密度為0.90g/cm3o問該脂蛋白中載脂蛋白和脂質
的質量分數(shù)是多少?[48.6%載脂蛋白,51.4%脂質]
解:設教脂蛋白的體積分數(shù)是某,則有1.35某+0.90(1一某)=1.08,解得某
=0.4于是質量分數(shù)為(0.4某1.35量分.4某1.35+(1-0.4)某0.90]=0.5
14.一種低密度脂蛋白(LDL含apoB-100(M為500000)和總膽固醇(假設
平均Mr為590)的質量分數(shù)分別為25%和50%,試汁算apoB-100與總膽固
醇的摩爾比[1:1695]解:設摩爾比為1/某,則有500000/590某=25/50,解
得某=1695
15.用化學方法把鞘磷脂與磷脂酰膽堿區(qū)分開來。
第3章氨基酸習題
1.寫出下列氨基酸的單字母和三字母的縮寫符號:精氨酸、天冬氨酸、
谷氨酰氨、谷氨酸、苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸。[見表3-1]表3T氨基
酸的簡寫符號名稱三字母符號單字母符號名稱
三字母符號單字母符號
丙氨酸(alanine)AlaA亮氨酸(leucine)LeuL精氨酸(arginine)ArgR
賴氨酸(lyine)LyK
天冬酰氨(aparagine)AnN甲硫氨酸(蛋氨酸)(methionine)Met天冬氨
酸(aparticacid)ApD苯丙氨酸(phenylalanine)半胱氨酸(cyteine)CyC脯
氨酸(praline)ProP谷氨酰氨(glutamine)GlnQ絲氨酸(erine)谷氨酸
(glutamicacid)GluE蘇氨酸(threonine)廿氨酸(glycine)GlyG色氨酸
(tryptophan)Trp組氨酸(hitidine)HiH酪氨酸(tyroine)Tyr異亮氨酸
(ioleucine)Ilel綴氨酸(valine)An和/或ApA某BGln和/或GluGIZ
SerS
ThrTWYValV
PheF
M
2、計算賴氨酸的Ea-NH3+20%被解離時的溶液PH。[9.9]解:
pH=pKa+lg20%pKa=10.53(見表3-3,P133)pH=10.53+lg20%=9.83
3、計算谷氨酸的Y-COOH三分之二被解離時的溶液pH。[4.6]解:
pH=pKa+1g2/3pKa=4.25
pH=4.25+0.176=4.426
4、計算下列物質0.3mol/L溶液的pH:(a)亮氨酸鹽酸鹽;(b)亮氨
酸鈉鹽;(c)等電亮氨酸。[(a)約1.46,(b)約11.5,(c)約6.05]
5、根據(jù)表3-3中氨基酸的pKa值,計算下列氨基酸的pl值:丙氨酸、
半胱氨酸、谷氨酸和精氨酸。[pl:6.02;5.02;3.22;10.76]解:pl=1/2
(pKal+pKa2)
pl(Ala)=1/2(2.34+9,69)=6.02pl(Cy)=1/2(1.71+10.78)=5.02
pl(Glu)=1/2(2.19+4,25)=3.22pl(AIa)=1/2(9.04+12.48)=10.76
6、向1L1mol/L的處于等電點的甘氨酸溶液加入0.3molHCI,問所得溶液
的pH是多少?如果加入0.3molNa0H以代替HCI時,pH將是多少?[pH:
2.71;9.23]解:pH1=pKa1+1g(7/3)=2.71pH2=pKa2+1g(3/7)=9.23
7、將丙氨酸溶液(400ml)調節(jié)到pH8.0,然后向該溶液中加入過量
的甲醛,當所得溶液用堿反滴定至Ph8.0時,消耗0.2mol/LNa0H溶液
250mlo問起始溶液中丙氨酸的含量為多少克?[4.45g]
8、計算0.25mol/L的組氨酸溶液在pH6.4時各種離子形式的濃度
(mol/L)o[Hi2+為1.78某10-4,Hi+為0.071,HiO為2.8某10-4]
解:由pH=pK1+lg(Hi2+/10-6.4)=pKr+lg(Hi+/Hi2+)=pK2+1g
(HiO/Hi+)得Hi2+為1.78某10-4,Hi+為0.071,HiO為2.8某10-4
9、說明用含一個結晶水的固體組氨酸鹽酸鹽(相對分子質量二209.6;
咪嘎基pKa=6.0)和Imol/LKOH配制lLpH6.5的0.2mol/L組氨酸鹽緩沖
液的方法[取組氨酸鹽酸鹽41.92g(0.2mo1),加入352mlimol/LKOH,用水
稀釋至1L]
10、為什么氨基酸的荀三酮反應液能用測壓法定量氨基酸?
11、L-亮氨酸溶液(3.0g/50ml6mol/LHCl)在20cm旋光管中測得的
旋光度為+1.810。計算L-亮氨酸在6mol/LHCl中的比旋([a])o
[[a]=+15,Io]
12、標出異亮氨酸的4個光學異構體的(R,S)構型名稱。[參考圖
3-15]
13、甘氨酸在溶劑A中的溶解度為在溶劑B中的4倍,苯丙氨酸在溶
劑A中的溶解度為溶劑B中的兩倍。利用在溶劑A和B之間的逆流分溶方
法將甘氨酸和苯丙氨酸分開。在起始溶液中甘氨酸含量為lOOmg,苯丙氨
酸為81mg,試回答下列問題:(1)利用由4個分溶管組成的逆流分溶系統(tǒng)
時,甘氨酸和苯丙氨酸各在哪一號分溶管中含量最高?(2)在這樣的管
中每種氨基酸各為多少毫克?[(1)第4管和第3管;(2)
51.2mgGly+24mgPhe和38.4mgG1y+36mgPhe]
解:根據(jù)逆流分溶原理,可得:
對于Gly:Kd=CA/CB=4=q(動相)/p(靜相)p+q=1=(1/5+4/5)4個分溶管分
溶3次:(1/5+4/5)3=1/125+2/125+48/125+64/125對于Phe:
Kd=CA/CB=2=q(動相)/p(靜相)p+q=1=(1/3+2/3)4個分溶管分溶3次:
(1/3+2/3)3=1/27+6/27+12/27+8/27
故利用4個分溶管組成的分溶系統(tǒng)中,甘氨酸和苯丙氨酸各在4管和
第3管中含量最高,其中:
第4管:Gly:64/125100=51.2mgPhe:8/27某81=241ng
第3管:Gly:48/125某100=38.4mgPhe:12/27某81=36mg
14、指出在正丁醇:醋酸:水的系統(tǒng)中進行紙層析時,下列混合物中
氨基酸的相對遷移率[假定水相的pH為4.5):
(1)He,Ly;(2)Phe,Ser(3)Ala,Vai,Leu;(4)Pro,Vai(5)Glu,Ap;(6)Tyr,Al
a,Ser,Hi.
[Ile>ly;Phe,>Ser;Leu>Val>Ala,;Val>Pro;Glu>Ap;
Tyr>Ala>Ser^Hi]W:根據(jù)P151圖3-25可得結果。
15.將含有天冬氨酸(pl=2.98)、甘氨酸(p「5.97)、亮氨酸(pl=6.53)
和賴氨酸(pT=5.98)的檸檬酸緩沖液,加到預先同樣緩沖液平衡過的強陽
離交換樹脂中,隨后用愛緩沖液析脫此柱,并分別收集洗出液,這5種氨
基酸將按什么次序洗脫下來?[Ap,Thr,Gly,Leu,Ly]
解:在pH3左右,氨基酸與陽離子交換樹脂之間的靜電吸引的大小次
序是減刑氨基酸(A2+)>中性氨基酸(A+)>酸性氨基酸(AO)o因此氨基酸的
洗出順序大體上是酸性氨基酸、中性氨基酸,最后是堿性氨基酸,由于氨
基酸和樹脂之間還存在疏水相互作用,所以其洗脫順序為:
Ap,Thr,Gly,Leu,Ly。
第4章蛋白質的共價結構習題
1.如果一個相對分子質量為12000的蛋白質,含10種氨基酸,并假
設每種氨基酸在該蛋白質分子中的數(shù)目相等,問這種蛋白質有多少種可能
的排列順序?[10100]解:1012000/120=10100
2、有一個A肽,經(jīng)酸解分析得知為Ly、Hi、Ap、Glu2、Ala以及
VaKTyr和兩個NH3分子組成。當A肽與FDNB試劑反應后得DNP-Ap;當
用竣肽酶處理后得游離綴氨酸。如果我們在實驗中將A肽用胰蛋白酶降解
時,得到兩種肽,其中一種(Ly^Ap>Glu>Ala、Tyr)在pH6.4時,凈
電荷為零,另一種(Hi、Glu以及Vai)可給除DNP-另,在pH6.4時,帶
正電荷。此外,A肽用糜蛋白酶降解時,也得到兩種肽,其中一種1Ap、
Ala、Tyr)在pH6.4時全中性,另一種(Ly、Hi、Glu2以及Vai)在
pH6.4時帶正電荷。問A肽的氨基酸序列如何?[An-Ala-Tyr-Glu-Ly-Hi-
Gin-Vai]解:1、N-末端分析:FDNB法得:Ap-;2、C-末端分析:竣肽前
法得:-Vai;
3、胰蛋白醐只斷裂賴氨酸或精氨酸殘基的竣基形成的肽鍵,得到的
是以Arg和Ly為C-末端殘基的肽斷。酸水解使An-Ap+NH4+,由已知條
件(Ly>Ap>Glu、Ala^Tyr)可得:An-()-()-()-Ly-()-()-Vai;4、
FDNB法分析N-末端得DNP-Hi,酸水解使Glr)fGlu+NH4+由已知條件(Hi、
Glu、Vai)可得:An-()-()-()-Ly-Hi-Gln-Val;
5、糜蛋白酶斷裂Phe、Trp和Tyr等疏水氨基酸殘基的較基端肽鍵。
由題,得到的一條肽(Ap.Ala.Tyr)結合(3)、(4)可得該肽的氨基
酸序列為:An-A1a-Tyr-G1u-Ly-Hi-G1n-Va1
3^某多肽的氨基酸序列如下:Glu-Val-Ly-An-Cy-Phe-Arg-Trp-Ap-
Leu-Gly-Ser-Leu-Glu-Ala-Thr-Cy-Arg-Hi-Met-Ap-Gln-Cy-Tyr-Pro-Gly-
Glu_Glu-Lyo(1)如用胰蛋白酶處理,此多肽將產(chǎn)生幾個肽?并解釋原
因(假設沒有二硫鍵存在);(2)在pH7.5時,此多肽的凈電荷是多少
單位?說明理由(假設pKa值:a-C001I4.0;a-NH3+6.0;Glu和Ap側
鏈基
4.0;Ly和Arg側鏈基H.0;Hi側鏈基7.5;Cy側鏈基9.0;Tyr側
鏈基11.0);(3)如何判斷此多肽是否含有二硫鍵?假如有二硫鍵存在,
請設計實驗確定5,17和23位上的Cy哪兩個參與形成?[(1)4個肽;
(2)-2.5單位;(3)如果多肽中無二硫鍵存在,經(jīng)胰蛋白酶水解后應
得4個肽段;如果存在一個二硫鍵應得3個肽段并且個肽段所帶電荷不同,
因此可用離子交換層析、電泳等方法將肽段分開,鑒定出含二硫鍵的肽段,
測定其氨基酸順序,便可確定二硫鍵的位置]
4、今有一個七肽,經(jīng)分析它的氨基酸組成是:Ly、Pro、Arg>Phe>
Ala.Tyr和Ser。此肽未經(jīng)糜蛋白酶處理時,與FDNB反應不產(chǎn)生a-
DNP-氨基酸。經(jīng)糜蛋白酶作用后,此肽斷裂城兩個肽段,其氨基酸組成分
別為Ala、Tyr、Ser和Pro、Phe、Ly、Argo這兩個肽段分別與FDNB反
應,可分別產(chǎn)生DNP-Ser和DNP-Ly。此肽與胰蛋白酶反應能生成兩個肽
段,它們的氨基酸組成分別是Arg、Pro和Phe、Tyr>Ly>Ser>Ala。試
問此七肽的一級結構怎樣?[它是一個環(huán)肽,序列為:-Phe-Ser-Ala-Tyr-
Ly-Pro-Arg-]解:(1)此肽未經(jīng)糜蛋白酶處理時,與FDNB反應不產(chǎn)生
a-DNP-氨基酸,說明此肽不含游離末端NH2,即此肽為一環(huán)肽;
(2)糜蛋白酶斷裂Phe、Trp和Tyr等疏水氨基酸殘基的羊爰基端肽鍵,
由已知兩肽段氨基酸組成(Ala、Tyr>Ser和Pro、Phe>Ly、Arg)可得:
-()-()-Tyr-^0-()-()-()-Phe-;(3)由(2)得的兩肽段分別與FDNB反
應,分別產(chǎn)生DNP-Ser和DNP-Ly可知該兩肽段的2末端分別為-Ser-和-
Ly-,結合(2)可得:-Ser-Ala-Tyr-和-Ly-()-()-Phe-;(4)胰蛋白酶
專一斷裂Arg或Ly殘基的竣基參與形成的肽鍵,由題生成的兩肽段氨基
酸組成(Arg、Pro和Phe、Tyr>Ly、Ser、Ala)可得:-Pro-Arg-和-()-
0-0-0-Ly;綜合(2)、(3)、(4)可得此肽一級結構為:-Ly-Pro-
Arg-Phe-Ser-A1a-Tyr-
5、三肽Ly-Ly-Ly的pl值必定大于它的任何一個個別基團的pKa值,
這種說法是否正確?為什么?[正確,因為此三肽處于等電點時,七解離
集團所處的狀態(tài)是C-末端COO-(pKa=3.0),N末端NH2(pKa^8.0),3
個側鏈3(1/3e-NH3+)(pKa=10.53),因此pl>最大的pKa值(10.53)]
6、一個多肽可還原為兩個肽段,它們的序列如下:鏈
為
A1a-Cy-Phe-Pro-Ly-Arg-Trp-Cy-Arg-Arg-
Val-Cy;鏈2為Cy-Tyr-Cy-Phe-Cy。當用嗜熱菌蛋白酶消化原多肽
(具有完整的二硫鍵)時可用下列各肽:(1)(Ala、Cy2、Vai);(2)
(Arg、Ly、Phe>Pro);(3)(Arg2、Cy2、Trp>Tyr);(4)(Cy2、
Phe)o試指出在該天然多肽中二硫鍵的位置。(結構如下圖)S-SAla-Cy-
Phe-Pro-Ly-Arg-Trp-Cy-Arg-Arg-Val_Cy
S
S
Cy-Tyr-Cy-Phe-Cy
s-s
解:嗜熱菌蛋白酶作用專一性較差,根據(jù)題中已知條件:(1)消化
原多肽得到(Ala、Cy2.Vai),說明鏈1在2位Cy后及11位Vai前發(fā)
生
斷裂,2位Cy與12位Cy之間有二硫鍵;
(2)由鏈1序列可得該肽段序列為:-Phe-Pro-Ly-Arg-;(3)由
(1)(2)可知該肽段(Arg2、Cy2、Trp.Tyr)中必有一Cy來自鏈2,另
一Cy為鏈1中8位Cy,即鏈1中8位Cy與鏈2中的一個Cy有二硫鍵;
(4)嗜熱菌蛋白弱能水解Tyr、Phe等疏水氨基酸殘基,故此肽
(Cy2、Phe)來自鏈2,結合(3)中含Tyr,可知(3)中形成的二硫鍵
為鏈18位Cy與鏈2中3位Cy與鏈2中3位Cy之間;(4)中(Cy2、
Phe)說明鏈2中1位Cy與5位Cy中有二硫鍵。綜合(1)、(2)、
(3)、(4)可得結果。
7、一個十肽的氨基酸分析表明其水解液中存在下列產(chǎn)物:
NH4+ApGluTyrArgMetProLySerPhe并觀察下列事實:(1)用芋交肽酶A
和B處理該十肽無效;(2)胰蛋白酶處理產(chǎn)生兩個四肽和游離的Ly;
(3)梭菌蛋白酶處理產(chǎn)生一個四肽和一個六肽;(4)澳化氫處理產(chǎn)生一
個八肽和一個二肽,用單字母符號表示其序列為NP;(5)胰凝乳蛋白酶
處理產(chǎn)生兩個三肽和一個四肽,N-末端的胰凝乳蛋白酶水解肽段在中性
pH時攜帶-1凈電荷,在pH12時攜帶-3凈電荷;(6)一輪Edman降解給
出下面的PTH衍生物:
寫出該十肽的氨基酸序列。[Ser-Glu-Tyr-Arg-Ly-Ly-Phe-Met-An-
Pro]
解:(1)用竣肽酶A和B處理十肽無效說明該十肽C-末端殘基為一
Pro;(2)胰蛋白酶專一斷裂Ly或Arg殘基的殷基參與形成的肽鍵,該
十肽在胰蛋白酶處理后產(chǎn)生了兩個四肽和有利的Ly,說明十肽中含Ly-或
-Arg—Ly-Ly-或-Arg-Ly-Ly-Arg-Ly-四種可能的肽段,且水解位置在4
與5、5與6或4與5、8與9、9與10之間;
(3)梭菌蛋白酶專一裂解Arg殘基的竣基端肽鍵,處理該十肽后,
產(chǎn)生一個四肽和一個六肽,則可知該十肽第四位為-Arg-;
(4)濱化鼠只斷裂由Met殘基的竣基參加形成的肽鍵,處理該十肽
后產(chǎn)生一個八肽和一個二肽,說明該十肽第八位或第二位為-Met-;用單
字母表示二肽為NP,EP-An-Pro-,故該十肽第八位為-Met-;
(5)胰凝乳蛋白酶斷裂Phe、Trp和Tyr等疏水氨基酸殘基的竣基端
肽鍵,處理該十肽后,產(chǎn)生兩個三肽和一個四肽,說明該十肽第三位、第
六位或第七位為Trp或Phe;(6)一輪Edman降解分析N-末端,根據(jù)其
反應規(guī)律,可得2末端氨基酸殘疾結構式為:-NH-CH(-CH20H)-C(=0)-,
還原為-NH-CH(-CH20H)-C00H-,可知此為Ser;結合(1)、(2)、
(3)、(4)、(5)、(6)可知該十肽的氨基酸序列為:
Sei-Glu_Tyi-Aig-Ly-Ly-Phe-MeL-Aii-Pio
8、一個四肽,經(jīng)胰蛋白酶水解得兩個片段,一個片段在280mn附近
有強的光吸收,并且Pauly反應和坂口反應(檢測胭基的)呈陽性。另一
片段用澳化鼠處理釋放出一個與黃三酮反應呈黃色的氨基酸。寫出此四肽
的氨基酸序列。[YRMP]
解:胰蛋白酶酶專一水解Ly和Arg殘基的竣基參與形成的肽鍵,故
該四肽中含Ly或Arg;一肽段在280nm附近有強光吸收且Pauly反應和
坂口反應(檢測胭基的)呈陽性,說明該肽段含Tyr和Arg;浪化鼠專一
斷裂Met殘基的竣基參加形成的肽鍵,又因生成了與苛三酮反應呈黃色的
氨基酸,故該肽段為-Met-Pro-;所以該四肽的氨基酸組成為Tyr-Arg-
Met-Pro,即YRMP。
10、敘述用Mernfield固相化學方法合成二肽Ly-Ala。如果你打算
向Ly-Ala加入一個亮氨酸殘基使成三肽,可能會掉進什么樣的“陷坑”?
解:(1)用BOC保護Ala氨基端,然后將其竣基掛接在樹脂上;(2)
除去N端保護,將用BOC保護的Arg用縮合劑DDC與Ala相連;
(3)將把樹脂懸浮在無水三氟乙酸中,通人干燥的HBr,使肽與樹
脂脫離,同時保護基也被切除。
若打算向Ly-Ala加入一個亮氨酸殘基使成三肽,可能的坑為:Leu
可能接在Arg的非a-氨基上。
第5章蛋白質的三維結構
習題
1.(1)計算一個含有78個氨基酸的a螺旋的軸長。(2)此多肽的
a螺旋完全伸展時多長?[11.7nm;28.08nm]解:(1)考慮到a螺旋中
每3.6個氨基酸殘基上升0.54阿,故該a螺旋的軸長為:78某
0.54/3.6=11.7nm
(2)考慮到完全伸展時每個氨基酸殘基約占0.36nm,故此時長為:78
某0.36=28.08nm
2.某一蛋白質的多肽鏈除一些區(qū)段為a螺旋構想外,其他區(qū)段均為
(3折疊片構象。該蛋白質相對分子質量為240000,多肽鏈外形的長度為
5.06某10-5頌。試計算:a螺旋占該多肽鏈的百分數(shù)。(假設B折疊
構象中每氨基酸殘疾的長度為0.35nm)[59%]
解:一般來講氨基酸的平均分子量為120Da,此蛋白質的分子量為
240000Da,所以氨基酸殘基數(shù)為240000+120=2000個。設有某個氨基酸
殘基呈0螺旋結構,則:某0.15+(2000-某)某0.35=5.06某10-5某
107=506nm
解之得某二970,Q螺旋的長度為970某0.15=145.5,故螺旋占
該蛋白質分子的百分比為:145.5/536某10096=29%
3.雖然在真空中氫鍵鍵能約為20kj/mol,但在折疊的蛋白質中它對
蛋白質的穩(wěn)定焰貢獻卻要小得多(<5kj/mol)o試解釋這種差別的原因。
[在伸展的蛋白質中大多數(shù)氫鍵的供體和接納體都與水形成氫鍵。這就是
氫鍵能量對穩(wěn)定焰貢獻小的原因。]
4.多聚甘氨酸是一個簡單的多肽,能形成一個具有4)-80°地=+120°
的螺旋,根據(jù)拉氏構象圖(圖5T3),描述該螺旋的(a)手性;(b)
每圈的堿基數(shù)。[(a)左手;(b)3.0]解:據(jù)P206圖5-13拉氏構象圖,
=6-80。*=+120。時可知該螺旋為左手性,每圈殘基數(shù)
為3.0o
5.a螺旋的穩(wěn)定性不僅取決于肽鏈間的氫鍵形成,而且還取決于肽
鏈的氨基酸側鏈的性質。試預測在室溫下的溶液中下列多聚氨基酸那些種
將形成a螺旋,那些種形成其他的有規(guī)則的結構,那些種不能形成有規(guī)
則的結構?并說明理由。(1)多聚亮氨酸,pH=7.0;(2)多聚異亮氨酸,
pH=7.0;(3)多聚精氨酸,pH=7.0;(4)多聚精氨酸,pH=13;(5)多
聚谷氨酸,pH=l.5;(6)多聚蘇氨酸,pH=7.0;(7)多聚脯氨酸,
pl1=7.0;[(1)(4)和(5)能形成a螺旋;(2)(3)和(6)不能形
成有規(guī)則的結構;(7)有規(guī)則,但不是a螺旋]
6.多聚甘氨酸的右手或左手a螺旋中哪一個比較穩(wěn)定?為什么?[因
為甘氨酸是在Q-碳原子上呈對稱的特殊氨基酸,因此可以預料多聚甘氨
酸的左右手a螺旋(他們是對映體)在能量上是相當?shù)?,因而也是同?/p>
穩(wěn)定的。]
[(a)W=2200=1.61某1060;(b)AS折疊=1.15kj/(Kmol)(c)
AH折疊100某(-5kj/mol)=-500kj/mol;注意,這里我們沒有考慮在
螺旋末端處某些氫鍵不能形成這一事實,但考慮與否差別很小。(d)AG
折疊二T57.3kj/mol.由于在25℃時AG折疊〈0,因此折疊的蛋白質是穩(wěn)
定的。]
8.兩個多肽鏈A和B,有著相似的三級結構。但是在正常情況下A是
以單體形式存在的,而B是以四聚體(B4)形式存在的,問A和B的氨基
酸組成可能有什么差另[在亞基-亞基相互作用中疏水相互作用經(jīng)常起主
要作用,參與四聚體B4的亞基-亞基相互作月的表面可能比單體A的對應
表面具有較多的疏水殘基。]
9.下面的序列是一個球狀蛋白質的一部分。利用表5-6中的數(shù)據(jù)和
Chou-Faman的經(jīng)驗規(guī)則,預測此區(qū)域的二級結構。
RRPVVLMAACLRPVVFITYGDGGTYYHWYH
[殘基4-11是一個Q螺旋,殘基14T9和24-30是8折疊片。殘基
20-23很可能形成3轉角]
10.從熱力學考慮,完全暴露在水環(huán)境中和完全埋藏在蛋白質分子非
極性內部的兩種多肽片段,哪一種更容易形成a螺旋?為什么?[埋藏在
蛋白質的非極性內部時更容易形成a螺旋。因為在水環(huán)境中多肽對穩(wěn)定
焰(AH折疊)的貢獻要小些。]
11.一種酶相對分子質量為300000,在酸性環(huán)境中可解離成兩個不同
組分,其中一個組分的相對分子質量為100000,另一個為50000。大的組
分占總蛋白質的三分之二,具有催化活性。用B-筑基乙醇(能還原二硫
橋)處理時,大的失去催化能力,并且它的沉降速度減小,但沉降圖案上
只呈現(xiàn)一個峰(參見第7章)。關于該酶的結構作出什么結論?[此酶含
4個亞基,兩個無活性亞基的相對分子質量為50000,兩個催化亞基的相
對分子質量為100000,每個催化亞基是由兩條無活性的多肽鏈(相對分
子質量為50000)組成。彼此間由二硫鍵交聯(lián)在一起。]
12.今有一種植物的毒素蛋白,直接用SDS凝膠電泳分析(見第7章)
時,它的區(qū)帶位于肌紅蛋白(相對分子質量為16900)和B-乳球蛋白
(相對分子質量37100)兩種蛋白之間,當這個毒素蛋白用筑基乙醇
和碘乙酸處理后,在SDS凝膠電泳中仍得到一條區(qū)帶,但其位置靠近標記
蛋白細胞素(相對分子質量為13370),進一步實驗表明,該毒素蛋白與
FDNB反應并酸水解后,釋放出游離的DNP-Gly和DNP-Tyr。關于此蛋白的
結構,你能做出什么結論?[該毒素蛋白由兩條不同的多肽鏈通過鏈間二
硫鍵交聯(lián)而成,每條多肽鏈的相對分子質量各在13000左右。]
13.一種蛋白質是由相同亞基組成的四聚體。(a)對該分子說出兩各
種可能的對稱性。穩(wěn)定締合的是哪種類型的相互作用(同種或異和D?
(b)假設四聚體,如血紅蛋白,是由兩個相同的單位(每個單位含a和
B兩種鏈)組成的。問它的最高對稱性是什么?[(a)C4和D2,C4是通
過異種相互作用締合在一起,D2是通過同種相互作用締合在一起,(b)
C2因為每個aP二聚體是一個不對稱的原聚體]
14.證明一個多階段裝配過程比一個單階段裝配過程更容易控制蛋白
質的質量??紤]一個多聚體酶復合物的合成,此復合物含6個相同的二聚
體,每個二聚體由一個多肽A和一個B組成,多肽A和B的長度分別為
300個和700個氨基酸殘基。假設從氨基酸合成多肽鏈,多肽鏈組成二聚
體,再從二聚體聚集成多聚體酶,在這一建造過程中每次操作的錯誤頻率
為10-8,假設氨基酸序列沒有錯誤的話,多肽的折疊總是正確的,并假
設在每一裝配階段剔除有缺陷的亞結構效率為100%,試比較在下列情況
下有缺陷復合物的頻率:(1)該復合物以一條6000個氨基酸連續(xù)的多肽
鏈一步合成,鏈內含有6個多肽A和6個多肽Bo(2)該復合物分3個
階段形成:第一階段,多肽A和B的合成;第二階段,AB二聚體的形成;
第三階段,6個AB二聚體裝配成復合物。
[(1)有缺陷復合物的平均頻率是6000某10-8=6某10-5]
[(2)由于有缺陷的二聚體可被剔除,因此有缺陷復合物的平均率只
是最后階段的操作次數(shù)(5次操作裝配6個亞基)乘以錯誤頻率,即:5
某10-8。因此它比一步合成所產(chǎn)生的缺陷頻率約低1000倍。]
第6章蛋白質結構與功能的關系
1.蛋白質A和B各有一個配體某的結合部位,前者的解離常數(shù)Kd為10-
6mol/L,后者Kd為10-9mol/Lo(a)哪個蛋白質對配體某的親和力更高?
(b)將這兩個蛋白質的Kd轉換為結合常數(shù)Ka。([)蛋白質B;(b)
蛋白質A的Ka=106(moI/L)-1,蛋白質B的Ka=109(mol/L)-1
2.下列變化對肌紅蛋白和血紅蛋白的()2親和力有什么影響?(a)血
漿的pH從7.4降到7.2;(b)肺中C02分壓從45torr(屏息)降到
15torr(正常);(c)BPG水平從4.5mmol/L(海平面)增至7.5mmol
(高空)。[對肌紅蛋白:(a)無;(b)無;(c)無。對血紅蛋白:
(a)降低;(b)增加;(c)降低]
3.在37℃,pH7.4,C02分壓40torr和BPG正常勝利水平(4.5mmoI/L血)
條件下,人全血的氧結合測定給出下列數(shù)據(jù):P(02)%飽和度(=100某Y)
10.610
19.53027.45037.57050.48577.396
92.398
(a)根據(jù)這些數(shù)據(jù),繪制氧結合曲線;估算在(1)lOOtorrp(02)
(肺中)和(2)30torrp(02)(靜脈血中)下血的氧百分飽和度。
(b)肺中[lOOtor加(02)]結合的氧有百分之多少輸送給組織
[30torrp(02)]?(c)
如果在毛細血管中pH降到7.0,利用圖677數(shù)據(jù)重新估算(b)部
分。
[(a)(1)98%,(2)58%;(b)約40版(c)約50%]解:(a)
圖略,從圖中克知分別為98%和58%;
(b)98%-58%=40%,故約40加
(c)當pH降到7.0時,據(jù)圖6-17可知:96%-46%=50%o
4.如果已知P50和n,可利用方程(6-15)Y/(1-Y)=[p(02)/P50]n計
算Y(血紅蛋白氧分數(shù)飽和度)。設P50=26torr,n=2.8,計算肺(這里
P(02)=100torr)中的Y和毛細血管(這里p(02)=40torr)中的Y。
在這些條件下輸氧效率(Y肺-Y毛細血管=AY)是多少?除"1.0外,重
復上面計算。比較"2.8和『1.0時的AY值。并說出協(xié)同氧結合對血紅
蛋白輸氧效率的影響。["2.8時,Y肺二0.98,Y毛細血管=0.77,所以,
△Y=0.21,n=1.0時,Y肺=0.79,Y毛細血管=0.61,所以,AY=0.18,
兩AY之差0.21-0.18R.03,差值似乎不大,但在代謝活躍的組織中p
(02)<40torr,因此潛在輸氧效率不小,參見圖675]解:Y肺/(1-Y
肺)=[100/26]2.8Y肺=0.98Y毛/(1-Y毛)=[40/26]2.8Y毛
=0.77AY=0.98-0.77=0.21
當n=1.0時,同理,Y肺R.79Y毛二0.61AY=0.18
5.如果不采取措施,貯存相當時間的血,2.3-BPG的含量會下降。如
果這樣的血用于輸血可能會產(chǎn)生什么后果?[貯存過時的紅血球經(jīng)酵解途
徑代謝BPG。BPG濃度下降,Hb對02的親和力增加,致使不能給組織供
氧。接受這種BPG濃度低的輸血,病人可能被窒息、。]
6.HbA能抑制IlbS形成細長纖維和紅細胞在脫氧后的鐮刀狀化。為什
么HbA具有這一效應?[去氧HbA含有一個互補部位,因而它能加到去氧
HbS纖維上。這樣的纖維不能繼續(xù)延長,因為末端的去氧HbA分子缺少
“粘性”區(qū)。]
7.一個單克隆抗體與G-肌動蛋白結合但不與F-肌動蛋白結合,這對
于抗體識別抗原表位能告訴你什么?[該表位可能是當G-肌動蛋白聚合成
F-肌動蛋白時被埋藏的那部分結構。]
8.假設一個Fab-半抗原復合體的解離常數(shù)在25℃和pH7時為5某
10-7mol/Lo(a)結合的標準自由能(25℃和pH7時)是多少?(b)此
Fab的親和力結合常數(shù)是多少?(c)從該復合體中釋放半抗原的速度常
數(shù)為120ST。結合的速度常數(shù)是多少?此說明在結合半抗原時抗體中的
結構變化是大還是???[(a)AGOz=35.9kJ/mol;(b)Ka=2某106mol-
1L;(c)結合速度常數(shù)k=2某108moi-IS-IL,此值接近于小分子與蛋白
質相遇(結合)的擴散控制限制(108至109mo『lSTL)]
解:(a)△GOx=-RTlnKa=-8.31某298某ln2000000=-35.9kJ/n)ol
(b)Ka=l/Keq=l/5某10-7=2某106mol-lL
9.抗原與抗體的結合方式與血紅蛋白的氧結合相似。假設抗原是一價,
抗體是n價,即抗體分子有n個結合部位,且各結合部位的結合常數(shù)Ka
值是相同的,則可證明當游離抗原濃度為[L]時,結合到抗體上的抗原濃
度[Lp]與抗體的總濃度[Pr]之比值:N=[Lp]/[Pr]=(nKa[L])/(l+Ka[L]),N
實際上表示被一個抗體分子結合的抗原分子平均數(shù)。(a)證明上面的方
程可重排為N/[L]=Kan-KaN
此方程式稱Scatchard方程,方程表明,N/[□對N作圖將是一條直
線。
(b)根據(jù)Scatchard方程,利用下列數(shù)據(jù)作圖求出抗體-抗原反應的n和
Ka值。[L]moI/LN1.43某10-52.57某10-56.00某10-51.68某10-4
0.5
0.771.201.68
3.70某10-41.85
[(a)第一個方程兩邊各乘(l+Ka[L]),然后兩邊各除以[L],并重
排第2個方程;(b)根據(jù)第二方程,N/[L]對N作圖的斜率是-Ka,
N/[L]=O時的截距給出no利用數(shù)據(jù)作圖得Ka=2.2某10-4mol/L,n=2.lo
因為結合部位數(shù)目只可能是整數(shù),所以n=2]
10?一個典型的松弛肌節(jié)中細絲長約2口用,粗絲長約為1.5口%(a)
估算在松弛和收縮時粗絲和細絲的重疊情況。
(b)一次循環(huán)中肌球蛋白沿細絲滑行“一步”移動約7.5nm,問一
次收縮中每個肌動蛋白纖維需要進行多少個步?[(a)約0.75nm,(b)
約67步]解:(a)根據(jù)P281圖6-35A所示,當松弛時重疊總長度為:
(1+1)-(3-1.5)=0.5nm0.5/2=0.25nm當收縮時重疊總長度為:
(1+1)-(2-1.5)=1.5Uml.5/2=0.75um(b)(3-2)+2某
103+7.5"67步
第7章蛋白質的分離、純化和表征
1.測得一種血紅素蛋白質含0.426%鐵,計算最低相對分子質量。一
種純酶按重量計算含亮氨酸1.65%和異亮氨酸2.48%,問其最低相對分子
質量是多少?[13110;15870]解:(1)蛋白質Mr=55.8+0.426%=13100
(2)亮氨酸和異亮氨酸的分子質量都是131Da,根據(jù)兩種氨基酸的
含量來看,異亮氨酸:亮氨酸=2.48%:1.65爐3:2,所以在此蛋白質中的
亮氨酸至少有兩個,異亮氨酸至少有三個,那么:蛋白質Mr=2某(131-
18)/1.65%=13697Da
2.超速離心機的轉速為58000r/min時,(1)計算角速度川,以
rad/表示;(2)計算距旋轉中心6.2cm處的離心加速度a;(3)此離心
加速度相當丁重力加速度加”的多少倍?[(1)3=6070.7-d/(2)
a=2.284某108cm/2;(3)a=233061g]解:(1)3=58000某
2n/60=6070.7rad/
(2)a=(6070.7)2某6.2=2.284某108cm/2(3)2.285M
106/9.8=233061
3.一種蛋白質的偏微比容為0.707cm2/g,當溫度校正為20℃,溶劑校
正為水時擴散系數(shù)(D20.W)為13.1某10-7cm2/,沉降系數(shù)(S20.W)為
2.05So20℃時水的密度為0.998g/cm3,根據(jù)斯維德貝格公式計算該蛋白
質的相對分子質量。[13000]
解:Mr=(RTS)/[D(l-vp)]=8.314某(273+20)某2.05/[13.1某
10-7(1-0.707某0.998)]=13000
4.一個層析柱中固定相體積(V)為流動相體積(Vm)的1/5。假設
某化合物的分配系數(shù),(a)Kd=l;(b)Kd=50o計算該化合物的有效分
配系數(shù)(Keff),也稱容量因子(capacity)o[(a)Keff=0.2;
(h)Keff=10]
5.指出從分子排阻層析柱上洗脫下列蛋白質時的順序。分離蛋白質的
范圍是5000到400000;肌紅蛋白、過氧化氫酶、細胞色素C、肌球蛋白、
胰凝乳蛋白酶原和血清清蛋白(它們的Mr見表7-4)。[肌球蛋白、過氧
化氫酶、血清清蛋白、胰凝乳蛋白酶原、肌紅蛋白、細胞色素C]
6.由第5題所述的,從分子排阻層析柱上洗脫細胞色素C、乳球
蛋白、未知蛋白和血清紅蛋白時;其洗脫體積分別為118、58、37和
24ml,問未知蛋白的Mr是多少?假定所有蛋白質都是球形的,并且都處
于柱的分級分離范圍。[52000]
7.在下面指出的pH下,下述蛋白質在電場中相哪個方向移動,即向
正極、負極還是不動?(根據(jù)表7-2的數(shù)據(jù)判斷。)(1)血清蛋白,
pH5.0;(2)B-乳球蛋白,pH5.0和7.0;(3)胰凝乳蛋白酶原,pH5.0、
9.1和11。[(1)正極;(2)負極、正極;(3)負極、不動、正極]解:
(1)卵清蛋白pl=4.6,pH=5.0>4.6帶負電,向正極移動;(2)乳球
蛋白pl=5.2,pH=5.0<5.2帶正電,向負極移動;pH=7.0>5.2帶負電,向
正極移動;(3)胰凝乳蛋白酶原pl=9.1,pH=5.0<9.1帶正電,向負極移
動;pH=9.l=pl凈電荷為零,不移動;pH=ll〉9.1帶負電,向正極移動;
8.(1)當Ala、Ser>Phe、Leu、Arg>Ap和Hi的混合物在pH3.9進
行紙電泳時,哪些氨基酸移向正極?哪些氨基酸移向負極?(2)紙電泳
時,帶有相同電荷的氨基酸常有少許分開,例如Gly可與Leu分開,試說
明為什么?(3)設Ala、Vai、Glu、Ly和Thr的混合物pH為6.0,試指
出紙電泳后氨基酸的分離情況。
PI值:Ala:6.02Ser:5.68Phe:5.48Leu:5.98Arg:10.76Ap:
2.9711i:7.59[(1)Ala、Ser、Phe和Leu以及Arg和Hi向負極,Ap移
向正極;(2)電泳時,具有相同電荷的較大分子比較小分子移動得慢,
因為電荷/質量之比較小,因而引起每單位質量遷移的驅動力也較小。(3)
Glu移向正極,Ly移向負極,Vai、Ala和Thr則留在原點。]
9.凝膠過濾層析和凝膠電泳中的分子篩效應有什么不同?為什么?
答:凝膠過濾層析中每一個凝膠珠相當于一個分子篩,故小分子所經(jīng)
過的路徑長,落在大分子后面;而凝膠電泳中整塊膠板相當于一個分子篩,
故大分子受到的阻力大而遷移慢,落在小分子后面。
10.配制一系列牛血清清蛋白(BSA)稀釋液,每一種溶液取0.1ml進
行Bradford法測定。
0.3某10-510.414.522.533.840.54.16.411.522.633.80.5某10-51.0某
10-53.。某10-5
9.0某10-5解:(1)無抑制劑時:V=Vma某[S]/(Km+[S]),將表中數(shù)據(jù)
代人此式可得Km=1,1某10-5moIL-1,Vma某=45.1umoILTmin-1
對表中數(shù)據(jù)用V對[S]作圖,求Km值,可判斷有抑制劑時,Km值明顯增
大,故該抑制劑應為競爭性抑制劑。據(jù)V=Vma某[S]/(Km(1+[l]/Ki)+[S])
以及Vma某不變的性質可得,此時Vma某=45.1umolLTmin-1,Km=3.1
某10-5molL-1,Ki=1.10MlO-3molL-1
9.同上。
10.從速率對底物濃度作圖9-31中,求出下列參數(shù)(反應混合物中酶
量為10-3umol)o(1)Km;(2)Vma某;(3)kcat/Km;(4)轉換數(shù)。
[Km:5某10-4moiLT;Vma某:6>molL-lmin-1;kcat/Km:2某105mol-
1L-1;轉換數(shù):100T]解:丫1^某二代@1田甘=1<3缶]=1<3止5]
11.下面的敘述哪一個是正確的?胰凝乳蛋白酶的轉換數(shù)100T,DNA
聚合酉每是15-1。(1)(2)(3)
胰凝乳蛋白酶結合底物比DNA聚合酶有更高的親和性。胰凝乳蛋白酶
反映速率比DNA聚合酶反映速率更大。
在特別的酶濃度和飽和底物水平下胰凝乳蛋白酶反應速率比DNA聚合
酶在相同條
件下更低。
(4)在飽和底物水平下,兩種酶的反應速率,假若DNA聚合醯反應
速率的6.7倍則與胰凝乳蛋白酶相等。答:(4)正確。原因:K=K-1/K1
為能與底物親和性的度量;只有在飽和底物水平下,才有Kcat二Vma某
/[E]。
12,今有一酶反應,它符合M今haeli-Menten動力學,其Km為1某
10-6molL-lo底物濃度為0.lmolLT時,反應初速度為0.1umolLTmin-
lo試問:底物濃度分別為10-2molLT、10-3molL-1和10-6molL-1時的
反應初速率是多少?[1某10-7molL-lmin-l,5某10-8molL-lmin-l]
解:VKm=1M10-6molL-1,[S]=0.1moIL-1,/.V=Vma^=0.1umolL-
1min-1將題中數(shù)據(jù)代入米氏方程:V=Vma某⑻/(Km+[S])得:設匡]=某
KmV=Vma某某Km/((某+1)Km)=某/(某+1)Vma某=/(1+1/某)Vma某
V1=0.1V2=0.09998V3=1/2Vma某二。05
13.假設2某10-4molL-1的[I]抑制了一個酶催化反應的75%,計算
這個非競爭性抑制劑的Ki?[6.66某10-5molL-l]
解:i%=(1-a)某100%=(1-Vi/Vo)某
10096=75%Vi/Vo=l/4-Vo=4Vi①再根據(jù)無抑制劑時的米氏方程:Vo=Vma某
[S]/(Km+[S])②加入非競爭性抑制劑后:V=VZma某
[S]/((Km+[S])(l+[I]/Ki))(§),此時Vma某變小,Km不變。
由①②③得:Ki=2某10-4/(4V'ma某/Vma某7)加入抵制劑時,Vzma
某二Vma某,/.Ki=6.66某10-5moIL-1
14.如果Km為2.9某10-4m
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