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臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析科研技能 單元課 02針對(duì)特定科研技能的專項(xiàng)突破科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析經(jīng)典三表簡(jiǎn)介基線與單因素分析多因素回歸分析暴露因素統(tǒng)計(jì)圖制作課程目錄1435文獻(xiàn)案例數(shù)據(jù)解讀2解
螺
旋 | 陪
伴
醫(yī)
生
科
研
成
長(zhǎng)科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析基線資料表展示研究對(duì)象的基本情況,指各組的人口學(xué)和臨床基線特征。數(shù)據(jù)來(lái)源于病史詢問(wèn)、體格檢查、檢驗(yàn)數(shù)據(jù)和診斷結(jié)果;所測(cè)定的資料數(shù)據(jù)不僅限于自然數(shù)值,也可以是按不同因素分類后的等級(jí)。單因素分析比較單個(gè)變量對(duì)研究因素的影響是否具有顯著意義。多因素回歸分析研究1個(gè)因變量對(duì)多個(gè)自變量的依賴程度、分析變量之間的關(guān)聯(lián)性并進(jìn)行預(yù)測(cè)、預(yù)報(bào)的基本方法。經(jīng)典三表簡(jiǎn)介臨床相關(guān)性研究中的經(jīng)典“三表”
是指:基線資料表,單因素分析表和多因素分析表,它們通常組隊(duì)出現(xiàn),構(gòu)成統(tǒng)計(jì)分析的標(biāo)準(zhǔn)套路。01科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析經(jīng)典三表簡(jiǎn)介基線與單因素分析多因素回歸分析暴露因素統(tǒng)計(jì)圖制作課程目錄1435文獻(xiàn)案例數(shù)據(jù)解讀2解
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長(zhǎng)科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析目的:證明脂肪細(xì)胞因子(脂聯(lián)素、瘦素)水平與腹主動(dòng)脈鈣化有關(guān)研究類型:病例對(duì)照(時(shí)間:橫斷面)研究對(duì)象:慢性腎病患者(CKD)(日本、腎透析)暴露因素:脂聯(lián)素、瘦素水平結(jié)局指標(biāo):腹主動(dòng)脈鈣化(AAC)入選患者納入標(biāo)準(zhǔn):男性、因CKD腎透析排除標(biāo)準(zhǔn):急性疾病、感染或惡性腫瘤共101例:糖尿病腎病(42)、慢性腎小球腎炎(35)、腎硬化(11)、多囊腎病(2)、其他(7)、未知疾?。?)收集數(shù)據(jù):實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)數(shù)據(jù)/體檢數(shù)據(jù)/AAC診斷統(tǒng)計(jì)分析按結(jié)局指標(biāo)分組:55例AAC、46例非AAC表1:基線資料表(組間基線數(shù)據(jù)比較)圖2:暴露因素(目標(biāo)暴露因素組間差異比較)表3:多因素分析(Logistic回歸驗(yàn)證暴露因素與結(jié)局指標(biāo)的獨(dú)立相關(guān)性)文中其實(shí)把基線資料表和單因素分析合并在表1了,圖1是對(duì)感興趣的單因素進(jìn)行作圖分析。本單元課最后有酸談學(xué)社
01
“功能基因研究套路”
中文獻(xiàn)案例的“三表”制作演示內(nèi)容彩蛋。案例概覽文獻(xiàn):PMID:28743977The
association
ofserum
adiponectin
withabdominal
aorticcalcificationin
Japanese
male
hemodialysis
patients:
a
cross-sectionalobservational
study.
Sci
Rep.
2017
Jul.研究?jī)?nèi)容 研究過(guò)程 結(jié)果展示02科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析納入研究的因素按結(jié)局指標(biāo)分為3組:全部;沒(méi)有AAC(腹主動(dòng)脈鈣化);有AACp值:有AAC和沒(méi)有AAC兩組間是否有顯著性差異從表中數(shù)據(jù)可以看出,結(jié)果的表現(xiàn)形式有3種①
個(gè)數(shù)
[比例]②
均值±SD③
中位數(shù)(?分位
-
?分位;也可以是最小值-最大值)為什么呢?這是數(shù)據(jù)類型和屬性決定的①
計(jì)數(shù)(分類)變量數(shù)據(jù),統(tǒng)計(jì)個(gè)數(shù)和比例②
連續(xù)變量,服從正態(tài)分布,統(tǒng)計(jì)均值和SD③
連續(xù)變量,非正態(tài)分布,統(tǒng)計(jì)中位數(shù)和分位數(shù)基線與單因素分析數(shù)據(jù)解讀03科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析暴露因素統(tǒng)計(jì)圖解讀脂聯(lián)素水平與AAC的關(guān)系瘦素水平與AAC的關(guān)系最大值?分位數(shù)中位數(shù)?
分位數(shù)最小值中位數(shù)(?分位
-?分位)其實(shí)該圖的結(jié)果在基線資料表中已有顯示(前一頁(yè)表格的最下面兩行),這里只是用“圖”的方式再展現(xiàn)一下。04科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析因素3種回歸模型:①不納入瘦素;②不納入脂聯(lián)素;③全部納入。95%置信區(qū)間的含義:如最后一行,脂聯(lián)素在模型1的95%CI是1.13-84.36,表示脂聯(lián)素每升高1μg/ml
,病人患AAC的風(fēng)險(xiǎn)升高,升高的區(qū)間范圍有95%的概率落在1.13-84.36之間,這是統(tǒng)計(jì)分析的不確定性概率決定的。①Without
leptin ②Without
adiponectin ③All
subjectsOR:odds
ratio,即優(yōu)勢(shì)比,代表該因素對(duì)結(jié)局的影響程度。如最后一行,脂聯(lián)素在模型1的OR值是9.76,表示脂聯(lián)素每升高1μg/ml,病人患AAC的風(fēng)險(xiǎn)提高8.76倍(9.76-1),即是原來(lái)的9.76倍。R
2
:回歸平方和與總離差平方和的比值,R平方介于0~1之間,越接近1,模型越精確,回歸擬合效果越好,一般認(rèn)為超過(guò)0.8的模型擬合優(yōu)度比較高;這里的p值表示回歸模型是否顯著,理論上,p<0.05表示該模型具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,但在臨床研究中價(jià)值不大,一般不需要給出。p-value:p值,這里指該因素對(duì)結(jié)局的影響的顯著性。如模型1中的脂聯(lián)素,p<0.05,表示脂聯(lián)素的水平升高增加AAC的風(fēng)險(xiǎn),
是獨(dú)立風(fēng)險(xiǎn)因素。05多因素分析數(shù)據(jù)解讀科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析經(jīng)典三表簡(jiǎn)介基線與單因素分析多因素回歸分析暴露因素統(tǒng)計(jì)圖制作課程目錄1435文獻(xiàn)案例數(shù)據(jù)解讀2解
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醫(yī)
生
科
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長(zhǎng)科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析基線資料數(shù)據(jù)導(dǎo)入1
用excel整理收集到的基線資料注意,此為虛構(gòu)的示例數(shù)據(jù),非前述示例文章的原始數(shù)據(jù)由于SPSS在讀取excel數(shù)據(jù)時(shí),漢字的兼容性并不是很好,建議先將非數(shù)字信息轉(zhuǎn)換成數(shù)字格式,如性別,男女,可用數(shù)字1代表男;
數(shù)字2代表女,轉(zhuǎn)換方法見(jiàn)
“彩蛋”
內(nèi)容。如果先不轉(zhuǎn)換,則導(dǎo)入SPSS后進(jìn)行“賦值”亦可,賦值操作步驟后續(xù)有介紹。06科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析2
雙擊SPSS軟件圖標(biāo),
打開(kāi)SPSS軟件3點(diǎn)擊上方菜單欄“文件”,在選項(xiàng)“打開(kāi)”右方菜單欄中選擇數(shù)據(jù)4在彈出窗口中,文件類型選擇Excel,然后找到記錄基線資料的excel存放目錄,
“文件類型”下來(lái)菜單中選擇excel,選擇該excel文件,點(diǎn)擊“打開(kāi)”這里要注意,用SPSS讀取excel數(shù)據(jù)的時(shí)候,該excel文件要關(guān)掉,否則容易報(bào)錯(cuò)。在打開(kāi)數(shù)據(jù)的窗口中,“文件類型”要選擇excel,才能看到excel的文件,否則只能看到默認(rèn)的sav類型的文件基線資料數(shù)據(jù)導(dǎo)入本教程使用的是23.0版本07科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析6稍等片刻等程序運(yùn)行完畢,即可看到,excel的數(shù)據(jù)已導(dǎo)入到SPSS中。輸出窗口中會(huì)顯示程序運(yùn)行結(jié)果(這里不用管)5在彈出窗口中勾選“從第一行數(shù)據(jù)讀取變量名”。我們?cè)趀xcel整理數(shù)據(jù)時(shí)第一行是變量名,這樣直接讀入可以省去在SPSS里手動(dòng)編輯變量名?!肮ぷ鞅怼碧幙梢赃x擇提取所選excel文件里的哪個(gè)sheet,默認(rèn)是第一個(gè)。確認(rèn)信息無(wú)誤后,點(diǎn)擊“確認(rèn)”?;€資料數(shù)據(jù)導(dǎo)入08科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析7 在表格底部,選擇“變量視圖”,查看變量名的屬性8 SPSS在提取數(shù)據(jù)時(shí)會(huì)自動(dòng)對(duì)變量的屬性定義。我們可以手動(dòng)修改或添加信息。一般需要修改的有“值”和“測(cè)量”兩項(xiàng)名義變量:即無(wú)序分類變量,是指所分類別或?qū)傩灾g無(wú)程度和順序的差別。如血型(O、A、B、AB);性別(男、女)等標(biāo)度變量:即連續(xù)變量,是指一定區(qū)間內(nèi)可以任意取值的變量,其數(shù)值是可以連續(xù)不斷的有序變量:是指各類別之間有程度的差別。如免疫組化檢測(cè)蛋白表達(dá)水平結(jié)果按-,-+,+,++,+++分類基線資料數(shù)據(jù)導(dǎo)入09科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析基線資料數(shù)據(jù)導(dǎo)入9 “值”的屬性修改(即前面所述“賦值”)。如“性別”的值,前面說(shuō)了,1代表男性,2代表女性,可以點(diǎn)擊在“值”對(duì)應(yīng)“性別”的格子,出現(xiàn)“…”按鈕后點(diǎn)擊這個(gè)按鈕進(jìn)行設(shè)置,設(shè)置好之后,“數(shù)據(jù)視圖”中的數(shù)值可以通過(guò)“值標(biāo)簽”按鈕在數(shù)字和文本值之間轉(zhuǎn)化(僅僅是便于數(shù)據(jù)理解)。彈出窗口中填寫(xiě)值和標(biāo)簽,點(diǎn)擊“添加”,然后“確定”點(diǎn)擊“值標(biāo)簽”按鈕10科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析10“測(cè)量”的屬性修改?!皽y(cè)量”定義的是數(shù)據(jù)的類型。SPSS在讀取excel數(shù)據(jù)時(shí)會(huì)自動(dòng)分辨數(shù)據(jù)的類型,但不一定正確。如“病程”是一個(gè)連續(xù)變量,數(shù)據(jù)類型應(yīng)該是“標(biāo)度”而不是“名義”(分類變量),這時(shí)我們需要手動(dòng)修改過(guò)來(lái)。有時(shí)候出于統(tǒng)計(jì)需求,“名義”有時(shí)候也需要調(diào)整為“標(biāo)度”,比如“名義”類型的變量不能作為非參數(shù)檢驗(yàn)里的檢驗(yàn)字段,在做非參檢驗(yàn)時(shí),如果想要把“名義”變量帶入(如性別),則需要把“名義”改為“標(biāo)度”或“有序”。選中對(duì)應(yīng)的格子,就會(huì)出現(xiàn)下拉菜單,選擇正確的類型即可性別:1=男性;2=女性戶籍:1=城市;2=城鎮(zhèn);3=農(nóng)村文化水平:1=小學(xué)或小學(xué)以下;2=初中;3=高中;4=本科或等同于本科;5=碩士;6=博士或以上AAC事件:0=沒(méi)有發(fā)生;1=發(fā)生基線資料數(shù)據(jù)導(dǎo)入11科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析1打開(kāi)excel軟件,在第一行和第一列分別填入相應(yīng)的數(shù)據(jù)標(biāo)題2選擇數(shù)據(jù)區(qū)域(B1:E13),點(diǎn)擊格式居中(格式調(diào)整可以等復(fù)制到word再做)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作12科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析對(duì)于連續(xù)變量,根據(jù)數(shù)據(jù)是否服從正態(tài)分布來(lái)確定其描述方式。服從正態(tài)分布,可用均值±SD;不服從正態(tài)分布,用中位數(shù)(?分位
-
?分位)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(連續(xù)變量-單組統(tǒng)計(jì))點(diǎn)擊頂部菜單欄分析→描述統(tǒng)計(jì)→探索1 2彈出窗口中,選中所有連續(xù)變量(“標(biāo)度”),點(diǎn)擊最上面的箭頭,放入“因變量列表”543213這里若是加入分組變量,如“因子列表”加入AAC事件,即可分別判斷AAC事件0和1兩組的數(shù)據(jù)是否符合正態(tài)分布,結(jié)果會(huì)跟未分組前有差異,甚至可能出現(xiàn)一組服從正態(tài)分布另一組不符合的情況。這種情況,建議跟分組前選擇一致的檢驗(yàn)方法。4點(diǎn)擊右方“圖”按鈕,勾選“含檢驗(yàn)的正態(tài)圖”,點(diǎn)擊“繼續(xù)”5點(diǎn)擊“確定”3點(diǎn)擊右方“統(tǒng)計(jì)”按鈕,勾選“百分位數(shù)”(“描述”默認(rèn)已勾選),點(diǎn)擊“繼續(xù)”科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析這里有兩種檢驗(yàn)方式的結(jié)果。一般認(rèn)為,柯?tīng)柲曷宸?斯米諾夫適合大樣本分析,夏皮洛-威爾克適合小樣本分析。大小樣本的定義說(shuō)法不一,有人為200以下是小樣本,也有人認(rèn)為2000以下是小樣本。判斷是否服從正態(tài)分布的方法是看“顯著性”的值,<0.05表示不服從
正態(tài)分布。可以看到,⑴⑸⑹⑻是符合正態(tài)分布的,其他是非正態(tài)分布。因此,⑴⑸⑹⑻用均值描述,⑵⑶⑷⑺用分位數(shù)描述。⑴⑵⑶⑷⑸⑹⑺⑻⑴⑵⑶⑷⑸⑹⑺⑻數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(連續(xù)變量-單組統(tǒng)計(jì))6
待程序運(yùn)行結(jié)束,在彈出的:“輸出1”窗口里會(huì)顯示程序運(yùn)行的結(jié)果,包括描述和正態(tài)性檢驗(yàn)結(jié)果及作圖。14科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析1還是在“輸出1”窗口里,在“正態(tài)性”檢驗(yàn)的上方,找到“百分位數(shù)”的結(jié)果。把⑵⑶⑷⑺項(xiàng)的分位數(shù)以中位數(shù)(25%分位數(shù)
–
75%分位數(shù))格式摘錄到excel里??梢钥吹絊PSS這里用了2種方法計(jì)算百分位數(shù)。當(dāng)數(shù)據(jù)量較大,且基本無(wú)重復(fù)值時(shí),兩法的結(jié)果相同。反之,上面的加權(quán)平均法應(yīng)當(dāng)比下面的圖基樞紐(Tukey法)更加準(zhǔn)確(總之選上面)。2⑵⑶⑷⑺SPSS計(jì)算出來(lái)的結(jié)果有幾位小數(shù);在填入excel時(shí),小數(shù)的位數(shù)與原始數(shù)據(jù)保持一致即可,四舍五入。數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(連續(xù)變量-單組統(tǒng)計(jì))分位數(shù)結(jié)果填寫(xiě)15科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析3如果想以中位數(shù)(最小值-最大值)的格式展示結(jié)果,可在“百分位數(shù)”結(jié)果上方找到“描述”的結(jié)果,里面有分組數(shù)據(jù)的最大值和最小值,也有中位數(shù)。73
(48-108)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(連續(xù)變量-單組統(tǒng)計(jì))16科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析1從上面的結(jié)果也可以看到,雖然我們沒(méi)有特意去計(jì)算均值和標(biāo)準(zhǔn)差,但SPSS已給出了結(jié)果。把前面分析符合正態(tài)分布的⑴⑸⑹⑻項(xiàng)的結(jié)果以均值±標(biāo)準(zhǔn)差的格式摘錄到excel里。2平均值及標(biāo)準(zhǔn)差結(jié)果填寫(xiě)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(連續(xù)變量-單組統(tǒng)計(jì))17科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析1頂部主菜單欄中選擇“插入”如何在excel中輸入“±”符號(hào)?子菜單欄的最右方選擇“符號(hào)”23彈出窗口里,“子集”選擇“拉丁語(yǔ)-1
增補(bǔ)”,然后在下方找到“±”,選中,點(diǎn)擊下方“插入”按鈕有些版本的excel,“±”是在“數(shù)學(xué)運(yùn)算符”的子集里。搜狗輸入法可通過(guò)鍵入“jiajian”來(lái)實(shí)現(xiàn)輸入“±”。數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(連續(xù)變量-單組統(tǒng)計(jì))18科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析點(diǎn)擊頂部菜單欄分析→描述統(tǒng)計(jì)→探索。1 2彈出窗口中,由于此前已統(tǒng)計(jì)過(guò)total的數(shù)據(jù),因此這里因變量已選擇好;只需選擇“AAC事件”,點(diǎn)擊中間的“→“符號(hào),放入“因子列表”。4
點(diǎn)擊“確定”。43
點(diǎn)擊右方“統(tǒng)計(jì)”按鈕,確認(rèn)“描述”和“百分位數(shù)”
已勾選,點(diǎn)擊“繼續(xù)”。3前面計(jì)算了“total”的分位數(shù),下面計(jì)算根據(jù)“without
AAC”和“with
AAC”分組的分位數(shù)2數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(連續(xù)變量-分組統(tǒng)計(jì))19科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析5在自動(dòng)跳出的“輸出1”窗口里,找到本次分析的“百分位數(shù)”的結(jié)果。與前述同樣的,把⑵⑶⑷⑺項(xiàng)的分位數(shù)以中位數(shù)(25%分位數(shù)
–
75%分位數(shù))的格式摘錄到excel里。6⑵⑶⑷⑺數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(連續(xù)變量-分組統(tǒng)計(jì))20科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析7在“百分位數(shù)”的結(jié)果的上面找到“描述”的結(jié)果。把前述的⑴⑸⑹⑻項(xiàng)以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差的格式摘錄到excel里。8數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(連續(xù)變量-分組統(tǒng)計(jì))21科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析1點(diǎn)擊“分析”→“比較平均值”→“獨(dú)立樣本T檢驗(yàn)”。比較符合正態(tài)分布的兩組連續(xù)變量數(shù)據(jù)是否具有顯著性差異2將符合正態(tài)分布的數(shù)據(jù)放入“檢驗(yàn)變量”;將AAC事件放入“分組變量”。如果樣本是配對(duì)的,則選擇“成對(duì)樣本T檢驗(yàn)”3選中分組變量里的AAC事件,點(diǎn)擊“定義組”按鈕,在彈出窗口里的組1和組2分別填寫(xiě)0和1,點(diǎn)擊“繼續(xù)”。T檢驗(yàn)僅用于比較兩組數(shù)據(jù),本例中AAC
事件是個(gè)二分類,只有0和1兩組;因此若是這里的“AAC事件”有多于2組數(shù)據(jù),通過(guò)“定義組”可以選擇比較哪兩組數(shù)據(jù)。這里填寫(xiě)0和1表示比較的是0和1這兩組。4點(diǎn)擊“確定”。4數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(連續(xù)變量的p值)22科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析5
待程序運(yùn)行完,在輸出窗口中可以看到檢驗(yàn)的結(jié)果。顯著性:判斷數(shù)據(jù)是否具有方差齊性。顯著性>0.05時(shí),認(rèn)為數(shù)據(jù)具有方差齊性,檢驗(yàn)的p值選擇上方(假定等方差)的數(shù)據(jù);若方差不齊,則選擇下方(不假定等方差)的p值。顯著性(雙尾):即獨(dú)立樣本T檢驗(yàn)p值。我們可以看到,這里4個(gè)因素的顯著性都>0.05,表明這些數(shù)據(jù)具有方差齊性,因此,我們選擇上方(假定等方差)的顯著性(雙尾)。方差齊性分析6
把p值填到對(duì)應(yīng)的位置上。SPSS計(jì)算的p值有3位小數(shù),可根據(jù)需要四舍五入,取舍小數(shù)位。2.9數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(連續(xù)變量的p值)23科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析1點(diǎn)擊“分析”→“非參數(shù)檢驗(yàn)”→“獨(dú)立樣本”。比較不符合正態(tài)分布的兩組連續(xù)變量數(shù)據(jù)是否具有顯著性差異2在彈出窗口中,點(diǎn)擊“字段”,將不符合正態(tài)分布的數(shù)據(jù)放入“檢驗(yàn)字段”;將AAC事件放入“組”,點(diǎn)擊“運(yùn)行”。如果樣本是配對(duì)的,則選擇“相關(guān)樣本”。點(diǎn)擊“設(shè)置”還能選擇檢驗(yàn)方法,默認(rèn)是“根據(jù)數(shù)據(jù)自動(dòng)選擇檢驗(yàn)”,這里我們選擇默認(rèn)。24當(dāng)“字段”添加入“檢驗(yàn)字段”后這里自動(dòng)選擇“使用自定義字段分配”數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(連續(xù)變量的p值)科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析3
待程序運(yùn)行完,在輸出窗口中可以看到檢驗(yàn)的結(jié)果?!帮@著性”即為p值,<0.05表示有顯著性差異?!皺z驗(yàn)”欄里標(biāo)明了所用的檢驗(yàn)方法。4
把數(shù)據(jù)錄入到excel表格里。252.9數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(連續(xù)變量的p值)科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析1點(diǎn)擊“分析”
→“描述統(tǒng)計(jì)”→“頻率”。2在彈出窗口中,將“AAC事件”放入“變量”;點(diǎn)擊下方“確定”按鈕?;颊哳l數(shù)統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(分類變量)26科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析3待程序運(yùn)行完,在輸出窗口中可以看到頻率的統(tǒng)計(jì)結(jié)果4把數(shù)據(jù)錄入到表格里數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(分類變量)27科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析1點(diǎn)擊“分析”
→“描述統(tǒng)計(jì)”→“交叉表”。2在彈出窗口中,將分類變量的數(shù)據(jù)放入“行”;將AAC事件放入“列”;點(diǎn)擊右方“統(tǒng)計(jì)”按鈕。勾選“卡方”,點(diǎn)擊“繼續(xù)”。3點(diǎn)擊“確定”。44按AAC分組對(duì)各因素進(jìn)行統(tǒng)計(jì)顯著性差異采用卡方檢驗(yàn)??ǚ綑z驗(yàn)適用于結(jié)局事件是分類變量的統(tǒng)計(jì)。28數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(分類變量)科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析5待程序運(yùn)行完,在輸出窗口中可以看到統(tǒng)計(jì)的結(jié)果。6
把數(shù)據(jù)錄入到excel表格里??ǚ綑z驗(yàn)結(jié)果里提供了多種方法的檢驗(yàn)結(jié)果,一般可根據(jù)以下規(guī)則選擇:當(dāng)樣本量>40且事件的頻數(shù)不為0時(shí),選擇第一個(gè),皮爾遜卡方檢驗(yàn);當(dāng)樣本量<40或事件的頻數(shù)有可能為0時(shí),選擇第四個(gè),費(fèi)希爾精確檢驗(yàn)。顯著性即為p值時(shí)間頻數(shù)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(分類變量)29科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析7輸出窗口中往下拉,找到其他兩個(gè)因素的統(tǒng)計(jì)結(jié)果,把數(shù)據(jù)填入表格里。數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(分類變量)30科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析8計(jì)算百分比:
①/②*100%=③,以此類推。將數(shù)據(jù)填入excel表格。②①③①’①’’③’③’’數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(分類變量)31科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析Excel里選中整個(gè)表格,復(fù)制到word里。1
打開(kāi)word,鍵入表格標(biāo)題。 2數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(格式調(diào)整)臨床研究中,表格一般用三線表的格式展現(xiàn)。32科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(格式調(diào)整)3
Word里,選中表格的第一行,在頂部菜單欄里選擇“設(shè)計(jì)”→“邊框”,分別點(diǎn)擊一下“下框線”和“上框線”。33科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析3Word里,選中表格的最下面一行,在頂部菜單欄里選擇“設(shè)計(jì)”→“邊框”,點(diǎn)擊“下框線”。數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析表格制作(格式調(diào)整)至此,文獻(xiàn)案例中的表1完成制作。34科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析經(jīng)典三表簡(jiǎn)介基線與單因素分析多因素回歸分析暴露因素統(tǒng)計(jì)圖制作課程目錄1435文獻(xiàn)案例數(shù)據(jù)解讀2解
螺
旋 | 陪
伴
醫(yī)
生
科
研
成
長(zhǎng)科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析1打開(kāi)GraphPad
Prism軟件。暴露因素的數(shù)據(jù),其實(shí)在前述基線與單因素分析表中已顯示,作圖是為了更直觀地反應(yīng)組間數(shù)據(jù)的差異;前面操作中SPSS里也給出了箱線圖,但是不太好看,本教程用GraphPad
Prism軟件重作。2點(diǎn)擊左邊菜單里的“Column”,右方點(diǎn)擊箱線圖,點(diǎn)擊下方“Create”按鈕。3在打開(kāi)的頁(yè)面頂端,輸入組別名稱。暴露因素統(tǒng)計(jì)圖制作(以脂聯(lián)素為例)35科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析4打開(kāi)excel數(shù)據(jù)表,選中第一行,點(diǎn)擊頂部菜單欄“開(kāi)始”,右方子菜單欄里選擇“排序和篩選”→“篩選”。暴露因素統(tǒng)計(jì)圖制作(以脂聯(lián)素為例)36科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析5
點(diǎn)擊AAC事件單元格里的三角箭頭,勾掉“1”,即只選擇“0”的數(shù)據(jù),點(diǎn)擊確定。6
選擇“AAC事件”為0時(shí)對(duì)應(yīng)的“脂聯(lián)素”的數(shù)據(jù),復(fù)制到GraphPad
Prism里。暴露因素統(tǒng)計(jì)圖制作(以脂聯(lián)素為例)37科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析7同樣操作,把“AAC事件”為“1”時(shí)對(duì)應(yīng)的
“脂聯(lián)素”的數(shù)據(jù),復(fù)制到GraphPad
Prism里。8點(diǎn)擊左邊導(dǎo)航欄“Graphs”下的“Data
1”或點(diǎn)擊下方graphs視圖按鈕,即可在右邊頁(yè)面里看到生成的箱線圖。or暴露因素統(tǒng)計(jì)圖制作(以脂聯(lián)素為例)38科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析9
選擇箱線圖上方的“Data1”和X軸標(biāo)題“XTitle”,刪掉。點(diǎn)擊“YTitle”,輸入“Adiponectin
(μg/ml)”。10
用文本工具標(biāo)記相應(yīng)的數(shù)據(jù)。GraphPad
Prism軟件作圖教程,敬請(qǐng)關(guān)注后續(xù)的解螺旋單元課。暴露因素統(tǒng)計(jì)圖制作(以脂聯(lián)素為例)39科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析經(jīng)典三表簡(jiǎn)介基線與單因素分析多因素回歸分析暴露因素統(tǒng)計(jì)圖制作課程目錄1435文獻(xiàn)案例數(shù)據(jù)解讀2解
螺
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科
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成
長(zhǎng)科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析多因素Logistic回歸分析1
Excel里先建立好表格框架。40科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析2頂部菜單欄點(diǎn)擊“分析”→“回歸”→“二元Logistic…”。3將“AAC事件”放入因變量;將除了“瘦素”以外的其他變量放入?yún)f(xié)變量;點(diǎn)擊右邊“選項(xiàng)”按鈕。二元Logistic回歸是最常用的回歸分析,要求結(jié)局事件是個(gè)二分變量,如此處,AAC是否發(fā)生就是一個(gè)二分變量。如果結(jié)局事件是個(gè)多元變量,如治療效果分為差,中,好,則可以選擇多元Logistic回歸。這里協(xié)變量的選擇,若是改為除脂聯(lián)素以外的所有變量,即為Model
2;若將所有變量都帶入,即為Model
3。多因素Logistic回歸分析(Model
1)41科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析4
在彈出窗口中勾選“Exp(B)的置信區(qū)間”,默認(rèn)是95%,點(diǎn)擊“繼續(xù)”。Exp(B)即為OR值。5
點(diǎn)擊“確定”按鈕。多因素Logistic回歸分析(Model
1)42科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析6程序運(yùn)行結(jié)束,在輸出窗口里找到最下面的“方程中的變量”結(jié)果。p值 ?
OR7把數(shù)據(jù)填入excel表格里。95%
CI最底下顯示了本次回歸中輸入的變量參數(shù)。多因素Logistic回歸分析(Model
1)43科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析2 在輸出窗口里找到“方程中的變量”,將數(shù)據(jù)填入excel表格里。1
同樣,頂部菜單欄點(diǎn)擊“分析”→“回歸”→“二元Logistic…”,在彈出的窗口里,將“AAC事件”放入因變量;將除了“脂聯(lián)素”以外的其他變量放入?yún)f(xié)變量;點(diǎn)擊右邊“選項(xiàng)”按鈕,確認(rèn)“Exp(B)的置信區(qū)間”已勾選,點(diǎn)擊繼續(xù),點(diǎn)擊確定。多因素Logistic回歸分析(Model
2)44科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析2 在輸出窗口里找到“方程中的變量”,將數(shù)據(jù)填入excel表格里。1
同樣,頂部菜單欄點(diǎn)擊“分析”→“回歸”→“二元Logistic…”,在彈出的窗口里,將“AAC事件”放入因變量;將所有其他變量放入?yún)f(xié)變量;點(diǎn)擊右邊“選項(xiàng)”按鈕,確認(rèn)“Exp(B)的置信區(qū)間”已勾選,點(diǎn)擊繼續(xù),點(diǎn)擊確定。多因素Logistic回歸分析(Model
3)45科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析多因素Logistic回歸分析(制表)1
將excel表格復(fù)制到word里,按之前介紹的步驟,制作成標(biāo)準(zhǔn)的三線表形式。46科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析單個(gè)研究因素對(duì)多個(gè)變量的依賴程度多因素分析小結(jié):
臨床相關(guān)性研究經(jīng)典“三表”統(tǒng)計(jì)分析解決的具體問(wèn)題1 2基線資料表 單因素分析展現(xiàn)臨床數(shù)據(jù)的特征
單個(gè)變量對(duì)單個(gè)研究因素的意義課程彩蛋酸談學(xué)社
“功能基因研究套路”
文獻(xiàn)案例中的“三表”制作演示樣本中檢測(cè)某分子表達(dá),結(jié)合病理資料進(jìn)行單因素、多因素分析是常見(jiàn)的數(shù)據(jù)套路千聊直播配套語(yǔ)音教學(xué)內(nèi)容僅用臨床樣本檢測(cè)如何批量發(fā)多篇SCI?473科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析2016
Jan
26.PMID:
26565812基線資料表單因素卡方分析COX回歸分析本文有腫瘤研究常見(jiàn)的臨床相關(guān)性研究數(shù)據(jù)形式Spearman相關(guān)性分析48科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析原始數(shù)據(jù)可先在Excel中進(jìn)行二分類或者數(shù)字形式的轉(zhuǎn)換,轉(zhuǎn)換后可在標(biāo)題欄用“批注”(選中標(biāo)題單元格右鍵選擇
“編輯批注”)的形式說(shuō)明一下含義(方便數(shù)據(jù)理解)。二分類也可以在SPSS中進(jìn)行(隨后有介紹)原始數(shù)據(jù)(虛擬,非文獻(xiàn)原始數(shù)據(jù))轉(zhuǎn)換數(shù)據(jù)基線資料表(Table
1)49科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析Excel中對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行二分類轉(zhuǎn)換1在所要轉(zhuǎn)換的數(shù)據(jù)列右方插入一列,寫(xiě)上標(biāo)題。2在第一個(gè)數(shù)據(jù)單元格里輸入公式”=IF(A2<60,0,1)”,
往下填充公式即可。公式解讀:當(dāng)A2的值<60時(shí),返回“0”,否則(即A2>=60時(shí)),返回“1”。3同樣的操作,把CISD2的表達(dá)分成高低組。公式:”=IF(M2<3,0,1)”請(qǐng)注意,公式里的標(biāo)點(diǎn)都是半角格式(即英文輸入法里的標(biāo)點(diǎn))基線資料表(Table
1)50科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析Excel中對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)字形式轉(zhuǎn)換1選中需轉(zhuǎn)換的列2頂部“開(kāi)始”菜單欄下選擇“查找和選擇”子菜單,點(diǎn)擊“替換”3彈出窗口中輸入需要替換的內(nèi)容(如“IV期”)和要替換成的內(nèi)容(“4”),點(diǎn)擊“全部替換”。然后再次選擇“查找和選擇”子菜單,點(diǎn)擊“替換”,同樣操作,把III期、II期、I期分別替換成3、2、1。需要替換的內(nèi)容需要替換成的內(nèi)容這里替換時(shí),先后順序要注意IV期到I期的次序進(jìn)行。否則,如果先替換“I期”,則“II期”會(huì)被替換為“I1”,因?yàn)椤癐I期”里也包含里“I期”的字符。基線資料表(Table
1)51科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析SPSS中對(duì)變量進(jìn)行二分類轉(zhuǎn)化步驟21 主菜單“轉(zhuǎn)換”里選擇“重新編碼為不同變量”。把需要轉(zhuǎn)化的變量,如Age放入“數(shù)字變量→輸出變量”里;在 3右邊“輸出變量”里填入轉(zhuǎn)換后變量的名稱;點(diǎn)擊下方“舊值和新值”。彈出窗口里,選擇“范圍”,把分組標(biāo)準(zhǔn)填入。如Age需要按是否大于60歲劃分組,則可填0到59.1,在“新值”里填寫(xiě)0,下方點(diǎn)擊“添加”,建立<60時(shí)變量值轉(zhuǎn)化為0的命令;同理,建立>=60時(shí)變量值轉(zhuǎn)化為1的命令;點(diǎn)擊“繼續(xù)”。4 點(diǎn)擊“變化量”按鈕,然后再點(diǎn)擊“確定”。44注意,“輸出變量”的名稱里不能有空格基線資料表(Table
1)52科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析基線資料表(Table
1)4 程序運(yùn)行完后,數(shù)據(jù)的最右邊會(huì)出現(xiàn)一個(gè)新轉(zhuǎn)換的列;“變量視圖”里,最底下也會(huì)出現(xiàn)相應(yīng)的變量屬性行。53科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析1選擇“分析”→“描述統(tǒng)計(jì)”→“頻率”;彈出窗口里把需要統(tǒng)計(jì)的變量放到“變量”里,點(diǎn)擊確定。這里需要注意Age和CISD2的表達(dá)要選擇二分類后的變量2把輸出窗口里的結(jié)果填寫(xiě)到Excel表里。Table
1.
基線資料表完成?;€資料表(Table
1)54科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析1選擇“分析”→“描述統(tǒng)計(jì)”→“交叉表”;彈出窗口里把CISD2表達(dá)二分類變量(分組變量)放到“列”里,其他需要統(tǒng)計(jì)的變量放到“行”里。2點(diǎn)擊“統(tǒng)計(jì)”按鈕,彈出窗口里選中“卡方”,點(diǎn)擊繼續(xù),點(diǎn)擊確定。單因素卡方分析(Table
2)55科研技能
單元課臨床相關(guān)性研究經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析單因素卡方分析(Table
2)3
將輸出結(jié)果填寫(xiě)到Excel表里。Table2.
單因素分析表完成。單因素分析表體現(xiàn)了CISD2表達(dá)高低與疾病臨床病理特征之間的相關(guān)性56科研技能
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