水產(chǎn)新品系評(píng)價(jià)技術(shù)規(guī)范編制說(shuō)明_第1頁(yè)
水產(chǎn)新品系評(píng)價(jià)技術(shù)規(guī)范編制說(shuō)明_第2頁(yè)
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《水產(chǎn)新品系評(píng)價(jià)技術(shù)規(guī)范》標(biāo)準(zhǔn)編制說(shuō)明一、工作概況(一)任務(wù)來(lái)源根據(jù)種業(yè)振興行動(dòng)等有關(guān)工作要求,本項(xiàng)目由全國(guó)水產(chǎn)技術(shù)推廣總站承擔(dān)。標(biāo)準(zhǔn)性質(zhì)為推薦性,屬于制定項(xiàng)目,主管部門(mén)為農(nóng)業(yè)農(nóng)村部,歸口單位為全國(guó)水產(chǎn)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)。(二)制定背景習(xí)近平總書(shū)記強(qiáng)調(diào),只有用自己的手攥緊中國(guó)種子,才能端穩(wěn)中國(guó)飯碗,才能實(shí)現(xiàn)糧食安全。黨的二十大報(bào)告也明確指出,要深入實(shí)施種業(yè)振興行動(dòng),確保中國(guó)人的飯碗牢牢端在自己手中。水產(chǎn)種業(yè)是推動(dòng)水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)健康發(fā)展的基礎(chǔ)性產(chǎn)業(yè),也是推動(dòng)我國(guó)水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)由世界大國(guó)向世界強(qiáng)國(guó)邁進(jìn)的戰(zhàn)略性核心產(chǎn)業(yè)。但我國(guó)水產(chǎn)種業(yè)起步較晚、基礎(chǔ)較為薄弱,與水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)高質(zhì)量發(fā)展和實(shí)現(xiàn)現(xiàn)代化的要求相比,還有不小的差距,部分養(yǎng)殖品種缺乏新品種或退化嚴(yán)重,大黃魚(yú)、南美白對(duì)蝦等因種質(zhì)退化病害多發(fā),鰻鱺人工育苗至今尚未突破。同時(shí),部分種源受制于人,100%大西洋鮭、90%以上虹鱒和50%以上鰻鱺的苗種都靠進(jìn)口。為推動(dòng)水產(chǎn)種業(yè)發(fā)展,近些年來(lái),國(guó)家實(shí)施了一系列水產(chǎn)育種項(xiàng)目,項(xiàng)目的考核指標(biāo)基本都包括培育水產(chǎn)新品種或水產(chǎn)新品系若干個(gè)。水產(chǎn)新品系是水產(chǎn)新品種培育過(guò)程中形成的階段性成果,具有某一性狀突出、遺傳相對(duì)穩(wěn)定的特點(diǎn),可用作育種材料繼續(xù)開(kāi)展選育,以獲得水產(chǎn)新品種。但截止目前,我國(guó)僅制定出臺(tái)了水產(chǎn)新品種審定技術(shù)規(guī)范,尚無(wú)水產(chǎn)新品系認(rèn)定辦法或標(biāo)準(zhǔn)。為推動(dòng)水產(chǎn)種業(yè)振興,迫切需要抓緊制定水產(chǎn)新品系認(rèn)定標(biāo)準(zhǔn)。為此,2024年,由全國(guó)水產(chǎn)技術(shù)推廣總站牽頭,聯(lián)合相關(guān)科研教學(xué)單位和技術(shù)推廣部門(mén),提出制定《水產(chǎn)新品系評(píng)價(jià)技術(shù)規(guī)范》推薦性行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)。(三)起草過(guò)程由全國(guó)水產(chǎn)技術(shù)推廣總站主持農(nóng)業(yè)農(nóng)村部水產(chǎn)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)《水產(chǎn)新品系評(píng)價(jià)技術(shù)規(guī)范》的制定工作。1.起草單位全國(guó)水產(chǎn)技術(shù)推廣總站、中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院淡水漁業(yè)研究中心、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)、浙江省淡水水產(chǎn)研究所、中國(guó)海洋大學(xué)、廈門(mén)大學(xué)、大連海洋大學(xué)、浙江省水產(chǎn)技術(shù)推廣總站、云南省水產(chǎn)技術(shù)推廣站、中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院黃海水產(chǎn)研究所、上海海洋大學(xué)、湖南師范大學(xué)、中國(guó)科學(xué)院水生生物研究所、福建省水產(chǎn)技術(shù)推廣總站。2.主要起草人及任務(wù)分工主要起草人:何建湘、董在杰、李明爽、夏蕓、朱文彬、王建波、張龍、徐鋼春、高澤霞、原居林、李琪、劉濤、張偉杰、丁雪燕、王云峰、張婉婷、欒生、白志毅、胡曉麗、陶敏、周莉、羅明坤、李水根。其中,何建湘負(fù)責(zé)項(xiàng)目全面管理、整體實(shí)施和標(biāo)準(zhǔn)內(nèi)容設(shè)計(jì)。修改定稿。董在杰、李明爽、夏蕓負(fù)責(zé)項(xiàng)目具體實(shí)施和標(biāo)準(zhǔn)術(shù)語(yǔ)和定義、目標(biāo)和總體原則、總體要求部分的起草、征求意見(jiàn)與修改工作。朱文彬、張龍、徐鋼春參與標(biāo)準(zhǔn)編制說(shuō)明的起草、征求意見(jiàn)與修改工作。高澤霞、陶敏、周莉參與魚(yú)類(lèi)部分的起草、征求意見(jiàn)與修改工作。原居林、欒生參與蝦蟹類(lèi)部分的起草、征求意見(jiàn)與修改工作。李琪、白志毅、胡曉麗參與貝類(lèi)部分的起草、征求意見(jiàn)與修改工作。劉濤參與藻類(lèi)部分的起草、征求意見(jiàn)與修改工作。張偉杰參與棘皮類(lèi)部分的起草、征求意見(jiàn)與修改工作。王建波、丁雪燕、王云峰、張婉婷、羅明坤、李水根參與標(biāo)準(zhǔn)制定研討、部分技術(shù)要求和參數(shù)在生產(chǎn)實(shí)踐中的驗(yàn)證及征求意見(jiàn)與修改工作。3.立項(xiàng)前的工作2021年7月,中央全面深化改革委員會(huì)第二十次會(huì)議審議通過(guò)了《種業(yè)振興行動(dòng)方案》,強(qiáng)調(diào)把種源安全提升到關(guān)系國(guó)家安全的戰(zhàn)略高度,集中力量破難題、補(bǔ)短板、強(qiáng)優(yōu)勢(shì)、控風(fēng)險(xiǎn)。圍繞種業(yè)科技自立自強(qiáng)、種源自主可控,各地各部門(mén)加快部署,全面實(shí)施種業(yè)振興行動(dòng)。各省投入財(cái)政資金,積極推進(jìn)種業(yè)發(fā)展,如:江蘇省種業(yè)振興“揭榜掛帥”項(xiàng)目立項(xiàng)重點(diǎn)支持蝦、蟹、貝藻類(lèi)、淡(海)水魚(yú)類(lèi)等攻關(guān);福建省實(shí)施水產(chǎn)種業(yè)創(chuàng)新與產(chǎn)業(yè)化工程建設(shè),開(kāi)展聯(lián)合育種與制種行動(dòng)等。全國(guó)水產(chǎn)技術(shù)推廣總站借助全國(guó)水產(chǎn)原種和良種審定委員會(huì)平臺(tái),對(duì)各省的種業(yè)相關(guān)項(xiàng)目進(jìn)行跟蹤和指導(dǎo),掌握了標(biāo)準(zhǔn)在科學(xué)性和適用性上存在的問(wèn)題、最新科研成果和轉(zhuǎn)化應(yīng)用、生產(chǎn)和產(chǎn)業(yè)發(fā)展實(shí)際等情況,為制定本文件奠定了理論和技術(shù)基礎(chǔ)。4.立項(xiàng)后的工作(1)編制起草階段。計(jì)劃下達(dá)前,全國(guó)水產(chǎn)技術(shù)推廣總站即組織中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院淡水漁業(yè)研究中心、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)等相關(guān)科研教學(xué)單位專(zhuān)家開(kāi)展研討活動(dòng),正式啟動(dòng)文件編制工作,明確文件編制思路、主要內(nèi)容和結(jié)構(gòu)以及分工安排,成立文件編制組,并邀請(qǐng)全國(guó)水產(chǎn)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)專(zhuān)家作輔導(dǎo)。編制組廣泛開(kāi)展調(diào)研和資料收集整理分析,并廣泛收集了相關(guān)國(guó)家、行業(yè)和地方標(biāo)準(zhǔn)以及法律法規(guī)、學(xué)術(shù)論文、論著、統(tǒng)計(jì)年鑒、調(diào)研報(bào)告等資料,進(jìn)行了系統(tǒng)整理分析。在此基礎(chǔ)上,編制組起草了草案初稿。(2)征求意見(jiàn)階段。本標(biāo)準(zhǔn)初稿起草完成后,根據(jù)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)起草的相關(guān)要求,于7月向國(guó)內(nèi)相關(guān)的5家單位進(jìn)行了小范圍征求意見(jiàn),經(jīng)修改后于2024年10月21日和11月7日分別組織了12位專(zhuān)家進(jìn)行現(xiàn)場(chǎng)集中研討。集中研討后擬正式開(kāi)展征求意見(jiàn)工作。(3)送審階段。二、標(biāo)準(zhǔn)編制原則、主要內(nèi)容及確定依據(jù)(一)編制原則本文件嚴(yán)格按照GB/T1.1-2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定進(jìn)行起草。起草過(guò)程中,力爭(zhēng)深入貫徹黨中央、國(guó)務(wù)院關(guān)于“打好種業(yè)翻身仗”決策部署、全面實(shí)施種業(yè)振興行動(dòng),提高種業(yè)創(chuàng)新能力,促進(jìn)核心種源供給安全。標(biāo)準(zhǔn)編制的原則是以著眼當(dāng)前重點(diǎn)開(kāi)展的水產(chǎn)新品系評(píng)價(jià)工作為主,兼顧前瞻性工作要求。將重點(diǎn)內(nèi)容確定在魚(yú)類(lèi)、蝦蟹類(lèi)、貝類(lèi)、藻類(lèi)、棘皮和龜鱉類(lèi)等方面,其他較少審定的種類(lèi)也可參照本標(biāo)準(zhǔn)執(zhí)行。一是先進(jìn)性原則。本文件制定過(guò)程中,一方面是著重做好水產(chǎn)種業(yè)綠色和高質(zhì)量發(fā)展,體現(xiàn)水產(chǎn)品種優(yōu)良的遺傳特性、先進(jìn)的育種技術(shù)和先進(jìn)的養(yǎng)殖技術(shù)。另一方面,本標(biāo)準(zhǔn)的主要技術(shù)和參數(shù)均基于長(zhǎng)期系統(tǒng)的科學(xué)試驗(yàn)結(jié)果和生產(chǎn)實(shí)踐驗(yàn)證,確保審定的新品系具有較高的技術(shù)含量和市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)力。二是廣泛性原則。我國(guó)水產(chǎn)養(yǎng)殖品種眾多,不同品種的繁育技術(shù)、養(yǎng)殖技術(shù)、養(yǎng)殖模式和管理等方面差異顯著。水產(chǎn)品種可以來(lái)自不同的地區(qū),包括國(guó)內(nèi)不同省份以及國(guó)外。不同地域的水產(chǎn)資源具有各自的特點(diǎn)和優(yōu)勢(shì),通過(guò)廣泛收集和篩選,可以發(fā)現(xiàn)具有潛在價(jià)值的品種,培育水產(chǎn)新品系。水產(chǎn)品種性狀廣泛,包括生長(zhǎng)性狀、抗逆性狀、品質(zhì)性狀等。水產(chǎn)新品系評(píng)價(jià)中遵循廣泛性原則,可以確保審定的新品系具有廣泛的適應(yīng)性、優(yōu)良的性狀和實(shí)際應(yīng)用價(jià)值,為水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的可持續(xù)發(fā)展提供有力支持。(二)主要內(nèi)容及確定依據(jù)本標(biāo)準(zhǔn)對(duì)魚(yú)類(lèi)、蝦蟹類(lèi)、貝類(lèi)、藻類(lèi)、棘皮類(lèi)和龜鱉類(lèi)等水產(chǎn)新品系的審定提出關(guān)鍵技術(shù)指標(biāo)和要求。主要依據(jù)為《水產(chǎn)原、良種審定辦法》的相關(guān)規(guī)定和全國(guó)水產(chǎn)原種和良種審定委員會(huì)自1996年以來(lái)實(shí)際審定工作經(jīng)驗(yàn)總結(jié)。1.術(shù)語(yǔ)和定義。參考作物、畜禽的新品系描述,對(duì)水產(chǎn)新品系進(jìn)行了定義,指出其是具有特定遺傳性狀且相對(duì)穩(wěn)定并可繁殖的群體,可作為育種材料培育成水產(chǎn)新品種。2.培育方案。以現(xiàn)代遺傳學(xué)和動(dòng)物育種學(xué)等理論為指導(dǎo),根據(jù)水產(chǎn)養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)需求和條件,制定明確的育種方案。水產(chǎn)新品系的育種方案參考了水產(chǎn)新品種的育種方案,依據(jù)SCT1116《水產(chǎn)新品種審定技術(shù)規(guī)范》,制定了水產(chǎn)新品系的培育目標(biāo)、培育手段、性狀指標(biāo)和繁育體系的要求。3.表型特征和性能指標(biāo)。魚(yú)類(lèi)、蝦蟹類(lèi)、貝類(lèi)、藻類(lèi)、棘皮類(lèi)和龜鱉類(lèi)等表型特征所包含的內(nèi)容和適宜養(yǎng)殖條件下生產(chǎn)性能的指標(biāo),與經(jīng)濟(jì)效益密切相關(guān)。水產(chǎn)新品系至少有一個(gè)明顯區(qū)別于原種和已有品種的指標(biāo)。4.遺傳背景分析。可采用微衛(wèi)星、SNP等分子標(biāo)記技術(shù)分析育種群體的遺傳背景,評(píng)估遺傳多樣性、遺傳距離及遺傳分化等信息。根據(jù)已有的實(shí)驗(yàn)結(jié)果和實(shí)踐經(jīng)驗(yàn),提出運(yùn)用分子標(biāo)記進(jìn)行群體遺傳結(jié)構(gòu)分析所需的樣本數(shù)和標(biāo)記數(shù)指標(biāo)。5.檔案。水產(chǎn)新品系的育種檔案管理參考了水產(chǎn)新品種,依據(jù)SCT1116《水產(chǎn)新品種審定技術(shù)規(guī)范》,制定了建立品系材料、系譜檔案及培育過(guò)程檔案的要求和指標(biāo)。6.小試養(yǎng)殖。根據(jù)水產(chǎn)新品種審定的經(jīng)驗(yàn)和實(shí)踐經(jīng)驗(yàn),制定了進(jìn)行水產(chǎn)新品系小試的周期、試驗(yàn)點(diǎn)數(shù)量的技術(shù)要求。7.評(píng)價(jià)方法。在相同養(yǎng)殖試驗(yàn)條件下,進(jìn)行對(duì)比試驗(yàn),采用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法,逐代計(jì)算培育群體目標(biāo)性狀的遺傳進(jìn)展,評(píng)估每個(gè)世代的育種效果、目標(biāo)性狀的一致性與均勻度以及遺傳穩(wěn)定性。根據(jù)水產(chǎn)新品種審定的經(jīng)驗(yàn)和實(shí)踐經(jīng)驗(yàn),提出評(píng)估計(jì)算育種群體目標(biāo)性狀遺傳進(jìn)展的技術(shù)要求。8.判定規(guī)則。根據(jù)水產(chǎn)新品種審定的經(jīng)驗(yàn)、生產(chǎn)實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)以及養(yǎng)殖對(duì)比試驗(yàn)等,水產(chǎn)品種在經(jīng)過(guò)2個(gè)世代定向培育后,目標(biāo)性狀改良5%以上,群體的遺傳穩(wěn)定性可達(dá)到70%以上,因此,參照實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)制定了水產(chǎn)新品系培育世代、表型特征和性能、遺傳穩(wěn)定性、群體規(guī)模、小試養(yǎng)殖規(guī)模以及育種檔案等的技術(shù)要求和指標(biāo)。三、主要試驗(yàn)(驗(yàn)證)的分析、綜述報(bào)告以及預(yù)期的經(jīng)濟(jì)、社會(huì)和生態(tài)效益(一)水產(chǎn)新品系連續(xù)選育代數(shù)的確定1.魚(yú)類(lèi)上海海洋大學(xué)通過(guò)養(yǎng)殖桶養(yǎng)殖與同池混養(yǎng)相結(jié)合的方式對(duì)草魚(yú)(Ctenopharyngodonidellus)F1代與F2代群體的生長(zhǎng)性狀進(jìn)行了對(duì)比,分析了草魚(yú)2代選育進(jìn)展,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,在整個(gè)450日齡,F(xiàn)2代群體的體質(zhì)量顯著高于F1代群體(除30日齡);F2代群體線(xiàn)性回歸方程的斜率(a值)比F1代群體大,反映出F2代群體日增重更大;在150日齡,F(xiàn)2代群體的瞬時(shí)增重率(SGR)、相對(duì)增重率(RGR)和絕對(duì)增重率(AGR)分別比F1代群體高0.91%、4.92%和14.77%;在450日齡,F(xiàn)2代群體以上3種參數(shù)分別比F1代群體高0.36%、2.70%和12.38%;F2代群體平均體重變異系數(shù)相比F1代群體降低了16.54%。以上結(jié)果表明,經(jīng)過(guò)選育之后,草魚(yú)F2代群體相比F1代群體,其生長(zhǎng)速度更快、規(guī)格更整齊。廣西壯族自治區(qū)水產(chǎn)科學(xué)研究院為提高全州禾花鯉(Cyprinuscarpiovar.Quanzhounensis)養(yǎng)殖群體的生長(zhǎng)速度,采用家系選育方法對(duì)其開(kāi)展了連續(xù)2世代的選育,測(cè)量了G0、G1和G2代121個(gè)家系共3699尾個(gè)體的體質(zhì)量和體長(zhǎng)指標(biāo),利用混合線(xiàn)性模型估計(jì)體質(zhì)量和體長(zhǎng)性狀的遺傳力、表型相關(guān)和遺傳相關(guān),并通過(guò)基于目標(biāo)性狀育種值和最小二乘值估計(jì)的方法評(píng)估了G0—G2代的選擇進(jìn)展。結(jié)果顯示,禾花鯉體質(zhì)量變異系數(shù)為0.50~0.72,體長(zhǎng)性狀變異系數(shù)為0.18~0.22。體長(zhǎng)和體質(zhì)量的遺傳力估計(jì)值分別為0.132(P<0.01)和0.122(P<0.01),遺傳相關(guān)和表型相關(guān)分別為0.921(P<0.01)和0.995(P<0.01)。采用目標(biāo)性狀最小二乘值和目標(biāo)性狀育種值估計(jì)的體質(zhì)量性狀選擇反應(yīng)為12.82%和15.45%,體長(zhǎng)性狀選擇反應(yīng)為2.76%和6.60%。表明禾花鯉體質(zhì)量在完成2個(gè)世代的家系選育后獲得了有效遺傳進(jìn)展。上海海洋大學(xué)對(duì)團(tuán)頭魴(Megalobramaamblycephala)和翹嘴鲌(Culteralburnus)回交F2、雜交F2及原始親本共5個(gè)群體的生長(zhǎng)性能進(jìn)行測(cè)定。在3個(gè)同樣大小的水泥池中,每個(gè)水泥池放入5種相同年齡、規(guī)格的魚(yú)苗各50尾,經(jīng)過(guò)90天的養(yǎng)殖,BC1-F2群體的平均終末體重為45.70±3.42克,比其他4個(gè)群體提高18.2%~203.3%,表現(xiàn)出顯著的生長(zhǎng)優(yōu)勢(shì)。中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院淡水漁業(yè)研究中心評(píng)價(jià)了黃河鯉新品系G3代選育進(jìn)展情況,從80個(gè)家系中隨機(jī)挑選48個(gè)黃河鯉新品系家系,其中對(duì)照系9個(gè)和選育系39個(gè),每個(gè)家系5尾魚(yú),個(gè)體標(biāo)記后將試驗(yàn)魚(yú)混合,等量分為8個(gè)組,其中4個(gè)組為養(yǎng)殖對(duì)照組,另4個(gè)組為處理組,分別飼喂未添加和添加高糖類(lèi)飼料,8周后比較黃河鯉新品系G3代選育效果。結(jié)果表明:是否添加高糖類(lèi)飼料對(duì)黃河鯉新品系無(wú)顯著影響;相對(duì)于對(duì)照系,選育系體重增加20.84%。選育系比對(duì)照系生長(zhǎng)速度顯著加快,且不改變肌肉脂肪酸組分。選育系多不飽和脂肪酸含量顯著增加,增加幅度達(dá)8.9%。2.蝦蟹類(lèi)上海海洋大學(xué)以河蟹未選育群體作為對(duì)照組,比較了“長(zhǎng)蕩湖1號(hào)”偶數(shù)年群體(偶數(shù)年繁殖孵化)選育第二代(G2)的選育效果,結(jié)果顯示:選育品系在扣蟹、成蟹養(yǎng)殖階段的最終平均體質(zhì)量均高于對(duì)照組(P<0.05),其中,在扣蟹階段,選育品系G2代的平均體質(zhì)量為6.57±0.69克,對(duì)照系為5.51±0.59克,提高19.2%;在成蟹階段,選育品系G2代的平均體質(zhì)量為192.59±10.77克,對(duì)照系為154.08±18.57克,提高25.0%。常熟市水產(chǎn)技術(shù)推廣站開(kāi)展了“太湖1號(hào)”青蝦F2代與對(duì)照青蝦主養(yǎng)的生長(zhǎng)對(duì)比試驗(yàn),經(jīng)過(guò)兩個(gè)多月的飼養(yǎng),“太湖1號(hào)”F2代青蝦及對(duì)照青蝦末重分別為2.98克和2.49克,“太湖1號(hào)”青蝦F2代的生長(zhǎng)速度比對(duì)照組提高19.7%。3.貝類(lèi)廣東海洋大學(xué)比較了馬氏珠母貝選育系F2與對(duì)照群體早期生長(zhǎng)差別,在第8、14、21和35天,選系F2的平均殼長(zhǎng)顯著大于對(duì)照組(P<0.05)。貝齡/d選育系F2對(duì)照組891.13±4.49a88.25±4.96b14131.41±22.12a118.19±19.53b21212.63±17.75a176.73±39.91b35695.00±215.37a550.29±231.18b4.藻類(lèi)集美大學(xué)以人工雜交選育的壇紫菜新品系(Z-17)的F2、F3和對(duì)照組(YSX-3)的葉狀體及絲狀體為材料,進(jìn)行高溫、低氮磷實(shí)驗(yàn),測(cè)定藻體的生長(zhǎng)、4種色素含量及不同剪收次數(shù)后藻體厚度的變化等經(jīng)濟(jì)性狀。結(jié)果表明:(1)在高溫29℃下,F(xiàn)2和F3葉狀體耐高溫時(shí)間長(zhǎng),其平均增長(zhǎng)率分別為11.70%、11.55%;(2)在低氮磷條件下,F(xiàn)2適應(yīng)性較強(qiáng),F(xiàn)3次之;(3)4種色素蛋白含量中,F(xiàn)2總藻膽蛋白含量最高為89.12mg/g,葉綠素含量高達(dá)6.29mg/g。5.棘皮類(lèi)大連海洋大學(xué)以家系選育的中間球海膽F2和未經(jīng)選育對(duì)照組為材料,進(jìn)行生長(zhǎng)和性腺品質(zhì)對(duì)比試驗(yàn),結(jié)果表明,F(xiàn)2選育家系平均體重為43.61±14.07g,較未經(jīng)選育對(duì)照組(36.85±15.18g)提高18.33%;平均性腺重為4.07±2.05g,較未經(jīng)選育對(duì)照組(3.44±2.28g)提高18.25%;平均性腺指數(shù)為11.26±4.87%,較未經(jīng)選育對(duì)照組(9.29±4.49%)提高21.11%。6.龜鱉類(lèi)中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)院長(zhǎng)江所以群體選育的黃河水系中華鱉F2代和未經(jīng)過(guò)選育的黃河水系中華鱉進(jìn)行生長(zhǎng)速度等性狀的對(duì)比試驗(yàn)。結(jié)果表明,選育的F2代稚鱉平均體重為486.6±41.7g,成活率為90.09%;未選育的中華鱉平均體重448.1±92.5g,成活率為86.05%。選育組比對(duì)照組生長(zhǎng)速度提高了8.59%,成活率提高了4.04%。浙江省水產(chǎn)技術(shù)推廣總站(浙江省水產(chǎn)引種育種中心)以中華鱉日本品系(品種登記號(hào)GS03-001-2007)為母本和清溪烏鱉(品種登記號(hào)GS01-003-2008)為父本進(jìn)行雜交育種得到中華鱉“浙新花鱉”,進(jìn)行生長(zhǎng)速度等性狀的對(duì)比試驗(yàn)。結(jié)果表明,中華鱉“浙新花鱉”的平均體重165.71±52.21g,中華鱉日本品系的平均體重135.63±39.07g,清溪烏鱉的平均體重107.69±49.61g;中華鱉“浙新花鱉”平均增重率較母本中華鱉日本品系提高了17.90%,較父本清溪烏鱉提高了32.28%。綜上所述,魚(yú)類(lèi)、蝦蟹類(lèi)、貝類(lèi)、藻類(lèi)、棘皮類(lèi)和龜鱉類(lèi)經(jīng)過(guò)連續(xù)2代選育,主要性狀普遍都能提高5%以上,因此本文件關(guān)于水產(chǎn)新品系的基本條件“至少經(jīng)過(guò)2個(gè)世代的連續(xù)選育”符合育種實(shí)踐。(二)水產(chǎn)新品系遺傳背景分析方法的確定1.魚(yú)類(lèi)上海海洋大學(xué)利用自主開(kāi)發(fā)的12個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記,對(duì)來(lái)自于長(zhǎng)江水系4個(gè)野生群體(湖北石首、湖南湘江、江蘇邗江、浙江嘉興)和1個(gè)養(yǎng)殖群體(江蘇吳江)青魚(yú)(Mylopharyngodonpiceus)進(jìn)行遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)分析。遺傳多樣性分析結(jié)果顯示這12個(gè)位點(diǎn)多態(tài)信息含量(PIC)介于0.660~0.923,表明這12個(gè)位點(diǎn)均具有高度多態(tài)性(PIC>0.5)。5個(gè)群體的平均等位基因數(shù)(Na)介于7.917~11.667,平均有效等位基因數(shù)(Ne)介于4.837~6.035;平均觀(guān)測(cè)雜合度介于0.713~0.861,平均期望雜合度介于0.749~0.819;平均多態(tài)信息含量介于0.711~0.788,表明這5個(gè)群體均具有較高的遺傳多樣性。遺傳距離分析結(jié)果表明4個(gè)野生群體之間遺傳距離較近,養(yǎng)殖群體與這4個(gè)野生群體遺傳距離均較遠(yuǎn)。UPGMA系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)顯示,湘江群體和石首群體首先聚為一支,然后與邗江群體和嘉興群體聚為一支,最后與吳江養(yǎng)殖群體聚為一支。這12個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)具有較為豐富的遺傳多樣性特征,可以用于青魚(yú)不同群體的種質(zhì)資源的評(píng)估和遺傳多樣性的分析。天津市水產(chǎn)研究所用13對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)5個(gè)黃顙魚(yú)群體進(jìn)行遺傳多樣性研究。結(jié)果表明,13個(gè)位點(diǎn)在5個(gè)群體中平均有效等位基因數(shù)Ne為4.50~4.90個(gè),平均觀(guān)測(cè)雜合度Ho為0.45~0.47,平均期望雜合度He為0.49~0.52,平均多態(tài)信息含量PIC為0.47~0.49。平衡估算顯示,58個(gè)單群體單基因座檢測(cè)數(shù)據(jù)中,13.80%表現(xiàn)為顯著的遺傳不平衡(P<0.05),21.14%表現(xiàn)為極顯著的遺傳不平衡(P<0.01);對(duì)各基因座進(jìn)行的多群體檢測(cè)發(fā)現(xiàn),有7個(gè)基因座出現(xiàn)了極顯著的遺傳不平衡性。各位點(diǎn)上群體間遺傳分化系數(shù)FST平均值為0.0511,其中C和D群體間的FST最?。?.0245),C和E群體間FST最大(0.1463)。各位點(diǎn)上群體內(nèi)基因流Nm平均值為4.6425,其中C和E群體間Nm最小(1.4589),C和Y群體間最大(18.1189)。群體間相似度分析顯示,C與Y遺傳相似度最高,相似系數(shù)I為0.9738(遺傳距離Ds為0.0265);C與E遺傳相似系數(shù)最低,為0.8741(遺傳距離Ds為0.1345)。聚類(lèi)分析顯示,C和Y首先聚類(lèi)為1個(gè)分支,再依次與D、W聚在一起,最后與E聚類(lèi),與地理分布呈一定相關(guān)性。研究結(jié)果表明5個(gè)群體的遺傳多態(tài)性居中,可以作為種質(zhì)資源開(kāi)發(fā)的材料。南昌大學(xué)利用13個(gè)微衛(wèi)星分子標(biāo)記研究了我國(guó)重慶、江西永豐、江西新干三個(gè)胭脂魚(yú)(Myxocyprinusasiaticus)繁殖基地子一代群體的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)。結(jié)果顯示,13個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)均呈現(xiàn)多態(tài)性,等位基因數(shù)目為8~17個(gè),多態(tài)信息含量為0.35~0.84,Shannon多樣性指數(shù)為1.61~1.64,觀(guān)測(cè)雜合度為0.1081~0.8255,期望雜合度為0.3846~0.8568,Hard-Weinberg遺傳偏離指數(shù)(D)為-0.7189~0.0725,表明三個(gè)養(yǎng)殖群體遺傳多樣性均較高。從群體間的遺傳結(jié)構(gòu)看,三個(gè)養(yǎng)殖群體間存在遺傳分化,其中江西新干胭脂魚(yú)養(yǎng)殖群體內(nèi)具有顯著的遺傳分化。上海海洋大學(xué)利用體質(zhì)量QTL區(qū)間中的2個(gè)SNP標(biāo)記在3個(gè)青魚(yú)(Mylopharyngodonpiceus)群體中進(jìn)行驗(yàn)證,目的是為了檢測(cè)通過(guò)QTL定位得到的SNP是否存在并能應(yīng)用于其他地理群體。利用對(duì)分子標(biāo)記的側(cè)翼序列進(jìn)行基因型組成分析、遺傳多樣性分析及中性檢驗(yàn)等方法,對(duì)3個(gè)群體的2個(gè)SNP側(cè)翼序列進(jìn)行分析。遺傳多樣性結(jié)果顯示,snp8107的擴(kuò)展片段的單倍型多樣性(Hd)在邗江群體、湘江群體和石首群體中分別為0.782、0.515和0.497;各位點(diǎn)的觀(guān)測(cè)雜合度(H0)為0.067~0.533,平均為0.239;期望雜合度(He)為0.127~0.506,平均為0.306;多態(tài)信息含量(PIC)為0.117~0.374,平均為0.246。中性檢驗(yàn)顯示3個(gè)群體在歷史上可能發(fā)生過(guò)瓶頸效應(yīng)導(dǎo)致稀有等位基因丟失的現(xiàn)象,結(jié)合遺傳多樣性結(jié)果推測(cè),邗江群體在經(jīng)歷瓶頸效應(yīng)后保留下來(lái)的稀有等位基因更多,最終得出結(jié)論邗江群體是適合進(jìn)行遺傳改良的最優(yōu)群體。江蘇省淡水水產(chǎn)研究所為研究黃顙魚(yú)(Pelteobagrusfulvidraco)MSTN基因的多態(tài)性與體重之間的相關(guān)性,對(duì)100條六月齡黃顙魚(yú)肌肉生長(zhǎng)抑制素基因(MSTN)的全序列進(jìn)行測(cè)序,獲得了8個(gè)多態(tài)性較高的SNP位點(diǎn)。結(jié)果表明,其中有7個(gè)位點(diǎn)分布于非編碼區(qū),1個(gè)位點(diǎn)位于編碼區(qū),但位于編碼區(qū)的核苷酸突變?yōu)橥煌蛔?。得出這8個(gè)SNP位點(diǎn)中有3個(gè)位點(diǎn)的基因型與黃顙魚(yú)的體重有顯著的相關(guān)性:IJ與體重呈正相關(guān)性,而NN和OP與黃顙魚(yú)體重呈負(fù)相關(guān)性。在黃顙魚(yú)育種過(guò)程中,可以嘗試?yán)眠@三個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行分子標(biāo)記輔助選育。2.蝦蟹類(lèi)天津市水產(chǎn)研究所采用12對(duì)微衛(wèi)星引物,分析渤海灣5個(gè)海域口蝦蛄自然群體的遺傳多樣性。研究結(jié)果表明,5個(gè)群體的等位基因數(shù)為3~16,平均有效等位基因數(shù)為2.9063~3.4102,平均觀(guān)測(cè)雜合度為0.5004~0.5342,平均期望雜合度為0.5310~0.5491,平均多態(tài)信息含量為0.5422~0.6038;哈代溫伯格平衡檢驗(yàn)表明,5個(gè)群體81.67%位點(diǎn)處于平衡狀態(tài)。天津群體與唐山群體的遺傳距離最遠(yuǎn),相似度最低。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)結(jié)果顯示,秦皇島群體與唐山群體聚在一起,昌黎群體與黃驊群體聚在一起,而后又與天津群體聚在一起。綜上所述,5個(gè)群體遺傳多樣性水平較高,具有一定的育種潛力,可以作為良好的育種材料。湖州師范學(xué)院利用16對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)來(lái)自泰國(guó)(CP)、緬甸(MN)、孟加拉(BD)和中國(guó)(MP和DP)的共5個(gè)羅氏沼蝦群體進(jìn)行了遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)的分析。結(jié)果顯示,16個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)均具有較高的多態(tài)性,平均等位基因數(shù)(Na)、期望雜合度(He)、Shannon信息指數(shù)(I)和多態(tài)信息含量(PIC)分別為17.563、0.8316、2.1662和0.7328。5個(gè)群體的期望雜合度(He)介于0.7025~0.8594,多態(tài)信息含量(PIC)介于0.6538~0.8048,表明所有群體均具有高度遺傳多樣性,遺傳多樣性水平CP>MP>BD>MN>DP。遺傳分化指數(shù)(Fst)值介于0.03430~0.17333,表明所有群體間均有不同程度的遺傳分化。16個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的Fst值均大于0.05,均值為0.0977,與群體間有遺傳分化相符。AMOVA分析顯示群體間變異占總變異的6.22%,群體內(nèi)個(gè)體間的變異占總變異的40.72%,個(gè)體內(nèi)部的遺傳變異占總變異的53.07%?;贜ei氏遺傳距離構(gòu)建的UPGMA系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)顯示,MN群體首先與MP群體聚為一類(lèi),再與DP群體聚為一類(lèi),之后再與BD群體聚為一類(lèi),最后與CP群體聚為一類(lèi),表明中國(guó)群體與泰國(guó)群體親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。遺傳結(jié)構(gòu)分析顯示,參試樣本被劃分為5個(gè)理論群體,除MP群體中個(gè)體遺傳結(jié)構(gòu)混雜外,其余群體中個(gè)體遺傳結(jié)構(gòu)相對(duì)獨(dú)立。研究為羅氏沼蝦種質(zhì)資源的開(kāi)發(fā)利用和優(yōu)良品種的選育提供了參考數(shù)據(jù)。安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院水產(chǎn)研究所采用10對(duì)微衛(wèi)星引物對(duì)安徽省日本沼蝦(Macrobrachiumnipponense)6個(gè)野生群體(女山湖NSH、巢湖CH、姑溪河GXH、南漪湖NYH、長(zhǎng)江東至段CJ、升金湖SJH)和4個(gè)養(yǎng)殖群體(滁州CZ、太湖1號(hào)F2TH1H、當(dāng)涂DT、養(yǎng)賢YX)的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析。結(jié)果顯示:所選用的10對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記均表現(xiàn)為高度多態(tài)性(PIC>0.5),各群體均具有較高的遺傳多樣性水平(期望雜合度He=0.795~0.876)。分子方差分析(AMOVA)顯示,遺傳變異有3.64%來(lái)自群體之間,96.36%來(lái)自于群體內(nèi)部。遺傳分化和遺傳距離分析顯示,群體間遺傳分化屬于中低水平(Fst<0.15),NSH和TH1H之間的遺傳分化最小(Fst=0.0028),遺傳距離最近(D=0.0398),而SJH和CZ之間的遺傳分化最大(Fst=0.1144),遺傳距離最遠(yuǎn)(D=0.2260)?;谌后w間Nei’s遺傳距離構(gòu)建的UPGMA系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)顯示,NSH和TH1H遺傳關(guān)系最近。綜上所述,10個(gè)群體遺傳多樣性水平較高,各群體間遺傳分化屬于中低水平。安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院水產(chǎn)研究利用10對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記分析了江蘇和安徽6個(gè)中華絨螯蟹(Eriocheirsinensis)養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)。結(jié)果顯示,所有群體的遺傳多樣性水平都較高且相近(等位基因數(shù)Na=16.0~18.4,有效等位基因數(shù)Ne=10.1~12.4,觀(guān)測(cè)雜合度Ho=0.759~0.836,期望雜合度He=0.897~0.916,多態(tài)信息含量PIC=0.870~0.892)。群體間遺傳距離Dn(0.154~0.277)、遺傳分化系數(shù)Fst(0.001~0.011)均較小,分子方差分析(AMOVA)結(jié)果中群體間遺傳變異僅占0.47%,一致表明群體間不存在顯著遺傳分化。群體間系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)顯示,6個(gè)養(yǎng)殖群體具有共同的祖先型,高淳群體與其他群體親緣關(guān)系最遠(yuǎn),結(jié)合其高的遺傳多樣性水平,高淳群體可作為選育基礎(chǔ)群之一。Structure遺傳結(jié)構(gòu)分析顯示,每個(gè)養(yǎng)殖群體的遺傳組成多樣且比例近似,結(jié)合近交系數(shù)和瓶頸效應(yīng)分析表明,中華絨螯蟹養(yǎng)殖群體存在較大程度的外源種質(zhì)混雜。綜上,蘇皖地區(qū)中華絨螯蟹養(yǎng)殖群體遺傳多樣性仍然較高,具有潛在的開(kāi)發(fā)與利用價(jià)值。上海海洋大學(xué)利用羅氏沼蝦性腺組織轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果,參考NCBI數(shù)據(jù)庫(kù),選取60個(gè)SNP位點(diǎn),以馬來(lái)西亞野生群體(MW)為樣本,采用直接測(cè)序技術(shù)進(jìn)行位點(diǎn)多態(tài)性檢測(cè),得到25個(gè)(41.7%)具有二態(tài)性等位基因位點(diǎn)。并對(duì)羅氏沼蝦上海(SH)、浙江(ZJ)、馬來(lái)西亞養(yǎng)殖群體(MF)、生長(zhǎng)快速品系選育群體(BG)及MW群體5個(gè)群體的150尾個(gè)體進(jìn)行遺傳多樣性分析,其觀(guān)測(cè)雜合度Ho和期望雜合度He的分布范圍分別為0.18~0.30和0.28~0.37,平均多態(tài)性信息含量依次為0.29、0.24、0.21、0.26和0.33,表現(xiàn)為中低等多態(tài)水平;群體間的遺傳相似性系數(shù)和遺傳距離變化范圍分別為0.659~0.968和0.032~0.417,MF群體和BG群體遺傳相似系數(shù)最小、遺傳距離最大,SH群體和ZJ群體遺傳相似系數(shù)最大、遺傳距離最?。贿z傳分化指數(shù)和基因流的范圍分別為0.045~0.363和0.440~5.293,MF群體和MW群體之間出現(xiàn)最高值,SH群體和ZJ群體出現(xiàn)最低值,SH群體和ZJ群體基因流最高,MF群體和MW群體最低;AMOVA分子方差分析顯示,遺傳變異主要來(lái)源于群體內(nèi),群體間的變異為26.33%。5個(gè)群體近交系數(shù)為0.151~0.342,3個(gè)養(yǎng)殖群體的平均近交系數(shù)均高于野生群體,對(duì)25個(gè)位點(diǎn)在5個(gè)群體中的基因型進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,有9個(gè)位點(diǎn)處的BG群體的基因型與其他3個(gè)養(yǎng)殖群體基因型分離方向相反,14個(gè)位點(diǎn)處3個(gè)養(yǎng)殖群體中雜合個(gè)體頻數(shù)較MW群體低。研究結(jié)果為進(jìn)一步開(kāi)展羅氏沼蝦遺傳育種研究及保護(hù)政策的制定提供了參考。中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院黃海水產(chǎn)研究所基于三疣梭子蟹(Portunustrituberculatus)比較轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù),篩選出生長(zhǎng)相關(guān)候選基因片段19條,利用該基因序列設(shè)計(jì)引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到總長(zhǎng)為17387bp的DNA片段;通過(guò)直接測(cè)序法發(fā)現(xiàn)74個(gè)SNP位點(diǎn),分布頻率為0.43/100bp,其中轉(zhuǎn)換突變的比例為80%,顛換突變的比例為20%,轉(zhuǎn)換的比例遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于顛換,符合“transitionbias”原理。C/T(G/A)突變所占比例為60%,G/T(C/A)突變占20%,A/T突變占9.33%,G/C突變占10.67%,C/T(G/A)突變所占比例最大。內(nèi)含子上突變發(fā)生的頻率為1.34/100bp,外顯子上僅為0.17/100bp,說(shuō)明外顯子上的堿基更加保守。通過(guò)飛行質(zhì)譜法,在三疣梭子蟹生長(zhǎng)性狀分離群體中成功分型了10個(gè)SNP位點(diǎn);通過(guò)卡方檢驗(yàn)和多元方差分析的方法進(jìn)行性狀關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)3個(gè)SNP位點(diǎn)與生長(zhǎng)性狀顯著相關(guān)(P<0.05),并且comp58070-R31位點(diǎn)與生長(zhǎng)性狀極顯著相關(guān)(P<0.01);一般線(xiàn)性模型的多元方差分析顯示,comp58070-R31位點(diǎn)與體重、全甲寬、甲寬3個(gè)性狀極顯著相關(guān)(P<0.01),與體長(zhǎng)、體高2個(gè)性狀為顯著相關(guān)(P<0.05);comp46623-F49位點(diǎn)與甲寬顯著相關(guān)(P=0.05);comp49193-R333位點(diǎn)與甲寬顯著相關(guān)(P<0.05)。通過(guò)對(duì)SNP位點(diǎn)的多態(tài)性分析發(fā)現(xiàn),三疣梭子蟹SNP標(biāo)記觀(guān)測(cè)雜合度(Ho)范圍為0.1628~0.8333,期望雜合度(He)范圍為0.1896~0.5912,并且顯示SNP標(biāo)記的信息量低于微衛(wèi)星標(biāo)記。3.貝類(lèi)廣東海洋大學(xué)利用13對(duì)微衛(wèi)星引物進(jìn)行馬氏珠母貝(Pinctadamartensii)家系遺傳結(jié)構(gòu)和系譜鑒別分析。結(jié)果顯示,(1)13個(gè)微衛(wèi)星引物在4個(gè)家系中共檢測(cè)到39個(gè)等位基因,每個(gè)位點(diǎn)的等位基因數(shù)為2~5,4個(gè)家系的平均觀(guān)測(cè)雜合度(Ho)為0.531~0.597,平均期望雜合度(He)為0.474~0.507;(2)根據(jù)子代基因型成功地推斷出4個(gè)家系的親本基因型,據(jù)此鑒別各個(gè)家系;用UPGMA法對(duì)120個(gè)樣本進(jìn)行聚類(lèi)分析,98.3%的同一家系的子代個(gè)體能夠聚到一起,分類(lèi)結(jié)果與系譜來(lái)源基本一致。結(jié)果說(shuō)明,這4個(gè)家系具有較高的遺傳多樣性和家系間具有明顯的遺傳分化;微衛(wèi)星標(biāo)記能有效地為馬氏珠母貝群體的系譜分析提供技術(shù)支持。廣東海洋大學(xué)利用微衛(wèi)星分子標(biāo)記技術(shù),對(duì)馬氏珠母貝(Pinctadamartensii)F8代黑殼色普通養(yǎng)殖群體和黑殼色選育群體2個(gè)群體共78個(gè)個(gè)體的遺傳多樣性進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,10個(gè)SSR位點(diǎn)共擴(kuò)增出34個(gè)等位基因,各位點(diǎn)的等位基因數(shù)為2~6個(gè),平均等位基因數(shù)為3.4個(gè),黑殼色普通養(yǎng)殖群體和黑殼色選育群體等位基因數(shù)(Na)分別為3.3和3.2,有效等位基因數(shù)(Ne)分別為1.9935和1.9310;香農(nóng)多樣性指數(shù)(I)為0.8013和0.7464;觀(guān)測(cè)雜合度(Ho)分別為0.3300和0.2867;期望雜合度(He)分別為0.4698和0.4343;多態(tài)信息含量(PIC)分別為0.403和0.377。Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn),2個(gè)群體分別有6個(gè)、7個(gè)位點(diǎn)偏離平衡(P<0.05),其中在4個(gè)相同位點(diǎn)中偏離平衡,且均表現(xiàn)為雜合子缺失(Ho<He)。兩群體的遺傳分化指數(shù)(Fst)、近交系數(shù)(Fis)、基因流(Nm)分別為0.0372、0.3090和6.4717。研究結(jié)果顯示:經(jīng)過(guò)連續(xù)的繼代選育,馬氏珠母貝黑殼色選育群體仍然保持適中的遺傳多樣性,具備作為選育材料的潛力。中國(guó)科學(xué)院南海海洋研究所運(yùn)用多元性形態(tài)學(xué)和SNP標(biāo)記對(duì)馬氏珠母貝母本深圳群體、父本海南群體和其雜交子代F1的外部形態(tài)和分子遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),3個(gè)群體的綜合判別率為72%,F(xiàn)1和母本群體的形態(tài)差異最小,父本群體與母本、F1的形態(tài)差異較大。采用HRM法(highresolutionmelting)應(yīng)用4個(gè)SNP位點(diǎn)對(duì)這3個(gè)群體進(jìn)行分型,3個(gè)群體的平均觀(guān)測(cè)雜合度Ho和期望雜合度He分別為0.2110~0.2879和0.3317~0.4685,F(xiàn)1的雜合度高于兩個(gè)親本;平均多態(tài)信息含量PIC值為0.2643~0.3556,呈現(xiàn)中等程度遺傳多樣性。F1與母本之間的基因流Nm最大(7.7701),遺傳距離最小(0.0546),親緣關(guān)系最近;兩個(gè)親本之間的Nm最小(1.9662),遺傳距離最大(0.1759)。rs8位點(diǎn)可以判別兩個(gè)親本群體,可作為特異性的標(biāo)記。該結(jié)果可以為馬氏珠母貝群體遺傳結(jié)構(gòu)鑒別、育種群體管理提供指導(dǎo)。中國(guó)科學(xué)院南海海洋研究所利用13個(gè)源自轉(zhuǎn)錄組序列的SNP標(biāo)記對(duì)3個(gè)馬氏珠母貝家系進(jìn)行遺傳多態(tài)性分析及聚類(lèi)分析。結(jié)果顯示,家系1#、3#、6#的平均期望雜合度(He)分別為0.3078、0.3189和0.3827;平均觀(guān)測(cè)雜合度(Ho)分別為0.3422、0.3410和0.3942;平均多態(tài)信息含量(PIC)分別為0.2435、0.2479和0.2977。結(jié)果表明,3個(gè)馬氏珠母貝家系具低度或中度遺傳多態(tài)性,為馬氏珠母貝內(nèi)SNP應(yīng)用于遺傳多態(tài)性分析等提供了基礎(chǔ)。利用SNP標(biāo)記對(duì)3個(gè)家系進(jìn)行聚類(lèi)分析,發(fā)現(xiàn)半同胞家系1#和3#在家系及個(gè)體聚類(lèi)中均先聚在一起,然后再與親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的家系6#聚在一起。新開(kāi)發(fā)的SNP標(biāo)記能較準(zhǔn)確地對(duì)家系及個(gè)體進(jìn)行聚類(lèi),為SNP標(biāo)記應(yīng)用于馬氏珠母貝遺傳關(guān)系分析提供了研究基礎(chǔ)。4.藻類(lèi)中國(guó)海洋大學(xué)采用近緣物種轉(zhuǎn)移法分析了15個(gè)海帶微衛(wèi)星引物在裙帶菜中的應(yīng)用情況。對(duì)38個(gè)裙帶菜個(gè)體進(jìn)行多樣性分析,結(jié)果顯示:標(biāo)記SSR002和SSR115不能擴(kuò)增裙帶菜基因組,位點(diǎn)SSR194能擴(kuò)增,但不具有多態(tài)性,其他12個(gè)標(biāo)記均能擴(kuò)增裙帶菜DNA,且都具有檢出多態(tài)性,其中9個(gè)符合哈迪-溫伯格平衡。這9個(gè)海帶微衛(wèi)星標(biāo)記檢出的等位基因數(shù)為34個(gè),從3~5個(gè)不等,平均每個(gè)位點(diǎn)擴(kuò)增得到3.8個(gè)等位基因。觀(guān)測(cè)雜合度(Ho)、期望雜合度(He)及多態(tài)性信息含量值(PIC)的范圍分別為0.238~1.000、0.500~0.692、0.413~0.780,9個(gè)位點(diǎn)提供的多態(tài)性較高,適用于裙帶菜遺傳學(xué)研究。汕頭大學(xué)利用68對(duì)微衛(wèi)星引物對(duì)壇紫菜(Porphyrahaitanensis)、半葉紫菜(P.katadai)、條斑紫菜(P.yezoensis)、少精紫菜(P.oligospermatangia)和皺紫菜(P.crispata)5個(gè)紫菜屬物種的絲狀體進(jìn)行初步的遺傳分析,共篩選出20對(duì)高多態(tài)性適用引物,在10份紫菜絲狀體樣品擴(kuò)增位點(diǎn)的多態(tài)性比例為95.24%,每對(duì)引物可擴(kuò)增的等位基因位點(diǎn)數(shù)為1.22~4.05,平均為2.37;各樣品之間的遺傳多樣性指數(shù)為0.2546~0.8994;不同物種的遺傳距離為0.1060~1.4066,同一物種的絲狀體材料優(yōu)先聚類(lèi)為一支,表明篩選出的微衛(wèi)星引物具有良好的遺傳分辨能力。中國(guó)海洋大學(xué)分離了鼠尾藻14個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記并用這些標(biāo)記分析了鼠尾藻青島群體遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)。開(kāi)發(fā)的14個(gè)標(biāo)記在青島群體中共檢測(cè)到45個(gè)等位基因,各標(biāo)記位點(diǎn)等位基因數(shù)在2和6之間,平均3.2個(gè),平均有效等位基因2.1個(gè),群體香農(nóng)信息指數(shù)、觀(guān)測(cè)雜合度、基因多樣性指數(shù)、多態(tài)信息含量分別為0.799、0.449、0.466和0.406。青島鼠尾藻種群體遺傳多態(tài)性中等偏高。青島4個(gè)鼠尾藻采集點(diǎn)的56個(gè)鼠尾藻個(gè)體在聚類(lèi)圖上無(wú)明顯聚群和譜系。開(kāi)發(fā)的標(biāo)記將促進(jìn)鼠尾藻遺傳資源評(píng)價(jià)、保護(hù)和開(kāi)發(fā)利用。暨南大學(xué)應(yīng)用12個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)9株來(lái)自歐洲和中國(guó)等不同海域的塔瑪亞歷山大藻(Alexandriumtamarense)進(jìn)行了遺傳多樣性分析,探討了不同地理藻株之間的遺傳分化程度和基因流水平,分析了我國(guó)沿海塔瑪亞歷山大藻的遺傳多樣性。結(jié)果表明:9株塔瑪亞歷山大藻共檢測(cè)出26個(gè)等位基因,其中9個(gè)位點(diǎn)具有多態(tài)性,多態(tài)比率75%。有效等位基因數(shù)1.3243~3.2667,平均為1.8774。塔瑪亞歷山大藻種內(nèi)基因多樣性為0.3630。9株塔瑪亞歷山大藻大致可以分為3個(gè)進(jìn)化支,進(jìn)化支與藻株的地理位置相關(guān)聯(lián)。其中,中國(guó)海域的塔瑪亞歷山大藻至少可分為2個(gè)進(jìn)化支。不同地理分布的塔瑪亞歷山大藻的遺傳分化水平較高,達(dá)0.7522。種群間的基因流估算水平較低,提示3個(gè)種群間可能不存在基因交流。山東東方海洋科技股份有限公司采用微衛(wèi)星引物對(duì)煙威沿海3個(gè)大葉藻居群進(jìn)行了遺傳多樣性研究。17條引物在63株大葉藻中均呈多態(tài),共檢測(cè)到120個(gè)等位基因,每個(gè)位點(diǎn)平均等位基因數(shù)為7,平均有效等位基因?yàn)?.30,平均期望雜合度為0.4743,平均觀(guān)測(cè)雜合度為0.4128,平均Nei’s基因多樣性為0.4700。威海榮成褚島居群的遺傳多樣性最高,煙臺(tái)雨岱山居群次之,煙臺(tái)擔(dān)子島居群最低。從遺傳分化系數(shù)的數(shù)值來(lái)看,3個(gè)大葉藻居群間屬于中度分化,兩兩居群間的基因流均大于1。說(shuō)明居群間有較強(qiáng)的基因流,其遺傳分化可能是由歷史大海藻場(chǎng)的遺留小生段居群產(chǎn)生。AMOVA分析顯示89.51%的變異存在于居群之內(nèi),而只有10.49%的總變異存在于居群之間。UPGMA法進(jìn)行的聚類(lèi)分析結(jié)果與群體間的遺傳距離遠(yuǎn)近相一致。煙臺(tái)雨岱山大葉藻居群遺傳多樣性較低,說(shuō)明本地大葉藻對(duì)環(huán)境變化的適應(yīng)能力和進(jìn)化潛力均較低,需要保護(hù)和修復(fù);煙臺(tái)擔(dān)子島大葉藻居群遺傳多樣性也低,與當(dāng)?shù)氐牡踪|(zhì)環(huán)境不適合大葉藻生長(zhǎng)有關(guān);威海榮成褚島大葉藻居群遺傳多樣性及群體變異程度均較高,可以為煙威沿海地區(qū)需要修復(fù)的大葉藻海草場(chǎng)提供移植修復(fù)或種子補(bǔ)充的材料。5.棘皮類(lèi)大連海洋大學(xué)利用15個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)對(duì)1個(gè)家系選育群體(FP)、1個(gè)群體選育群體(IP)和1個(gè)未經(jīng)選育的普通養(yǎng)殖群體(CP)共3個(gè)不同群體中間球海膽(Strongylocentrotusintermedius)的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行了研究。結(jié)果表明:顯示,15個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)共檢測(cè)出112個(gè)等位基因,3個(gè)群體的平均觀(guān)測(cè)等位基因數(shù)(Na)分別為5.077、5.133、6.133個(gè),平均有效等位基因(Ne)分別為2.816、2.873、3.638個(gè),平均觀(guān)測(cè)雜合度(Ho)分別為0.522、0.441、0.501,平均期望雜合度(He)分別為0.595、0.599、0.667,平均多態(tài)信息含量(PIC)分別為0.546、0.543、0.623。家系選育群體(FP)He與Ho的差值(0.073)低于IP(0.158)和CP(0.166),平均固定指數(shù)(F)(0.115)低于IP(0.248)和CP(0.246)。3個(gè)群體間遺傳分化系數(shù)(Fst)介于0.018~0.176,為中低等程度的遺傳分化;分子方差分析(AMOVA)結(jié)果表明,3個(gè)群體的遺傳變異主要源于個(gè)體間。主成分分析(PCoA)和聚類(lèi)進(jìn)化樹(shù)均顯示3個(gè)群體之間的親緣關(guān)系較近,其中IP群體遺傳分化程度最高。研究表明,3個(gè)中間球海膽群體均具有較高的遺傳多樣性,多代家系選育和群體選育均未明顯降低群體的遺傳多樣性,家系選育更有利于保持群體的雜合度和控制群體的近交水平,群體選育則會(huì)提升群體的遺傳分化程度。6.龜鱉類(lèi)浙江省水產(chǎn)技術(shù)推廣總站利用9對(duì)中華鱉微衛(wèi)星標(biāo)記(SSR),對(duì)中華鱉日本品系、清溪烏鱉及中華鱉“浙新花鱉”進(jìn)行遺傳多樣性分析。研究結(jié)果表明,3個(gè)群體90個(gè)個(gè)體觀(guān)測(cè)到的等位基因數(shù)Ne為241個(gè),其中有效等位基因數(shù)Ne為130個(gè),平均等位基因數(shù)Ne為14.56~20.22個(gè),平均有效等位基因數(shù)Ne為9.51~11.58個(gè)。3個(gè)群體的期望雜合度He為0.8436~0.9688,總平均值0.9218,觀(guān)測(cè)雜合度Ho為0.1000~0.9222,總平均值0.5131,平均多態(tài)性信息含量PIC為0.8582~0.8953。其中中華鱉“浙新花鱉”的期望雜合度Ho為0.9186,高于清溪烏鱉的0.9046,也高于中華鱉日本品系的0.8869。這些結(jié)果表明中華鱉“浙新花鱉”具有較為豐富的遺傳多樣性,還具有很大的選育潛力。中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所為研究中華鱉(Pelodiscussinensis)GHSR基因的多態(tài)性與生長(zhǎng)之間的相關(guān)性,對(duì)10只極大個(gè)體和10只極小個(gè)體的中華鱉生長(zhǎng)素受體基因GHSR的全序列進(jìn)行測(cè)序,獲得了14個(gè)多態(tài)性較高的SNP位點(diǎn)(C289T、G501T、T738C、G776T、A841G、T885C、T2960C、A2987T、G3390A、A3857C、G4718A、T4820C、A4850C、T4979C),并在120只中華鱉中進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果表明,所有SNP位點(diǎn)均符合Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P>0.05)。方差分析結(jié)果顯示,C289T位點(diǎn)

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