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轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合模體
TranscriptionFactorBindingMotifs(TFBMs)
2021.12.18T參考文獻(xiàn):High-resolutiongenome-widemappingofHIF-bindingsitesbyChIP-seq.Blood.2011Jun9;117(23):e207-17.doi:10.1182背景轉(zhuǎn)錄因子(Transcription
Factor,
TF);人類(lèi)基因組中可編碼2000+個(gè)TFs;轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)(Transcription
Factor
Binding
Site,
TFBS);轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合模體(
Transcription
Factor
Binding
Motif,
TFBM);Motif
可以用多種方法、模型去表示。TopsequencelogoListofthetop25DNAbindingmotifsforTnT3參考文獻(xiàn):TroponinT3associateswithDNAconsensussequencethatoverlapswithp53bindingmotifs.ExpGerontol.
2018Jul15;108:35-40.doi:10.1016/j.exger.bits用一段序列來(lái)描述所有序列的堿基組成,稱(chēng)之為一致性序列。參考文獻(xiàn):High-resolutiongenome-widemappingofHIF-bindingsitesbyChIP-seq.Blood.20
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