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文檔簡介
1、第四章 分子生物學的研究方法,一、重組DNA技術,理論上三大發(fā)現(xiàn) 技術上三大發(fā)明,遺傳物質是DNA DNA雙螺旋結構 遺傳信息傳遞方式,工具酶 載體 轉錄酶,1973年 以DNA重組實驗成功為標志,現(xiàn)代分子生物學,跨越天然物種屏障 定向創(chuàng)造新物種,工具酶 基因 載體 受體細胞,必要條件,操作過程 獲得外源基因(目的基因/目的片段) 與載體進行體外重組形成重組體(重組子) 將重組體導入(轉化/轉導/轉染)受體細胞 細胞擴增和篩選含有重組體的受體細胞(宿主細胞/寄主細胞) 培養(yǎng)含有重組體的細胞(陽性克?。z測表達產物,分、 切、 接、 轉、 篩 + 檢,工具酶,限制性內切酶,連接酶,修飾酶,DNA
2、聚合酶 DNA Polymerase,逆轉錄酶 Reverse Transcriptase,T4多核苷酸酶 T4 Polymerase Kinase,堿性磷酸酶 Alkalinephosphatase,活性定義 限制酶的一個活性單位(1U),原則上是在50l的反應液中,37的溫度條件下,經(jīng)過1小時反應,將1gDNA完全分解所需要的酶量。,特點 識別部位序列一般為4、5或6個核苷酸序列; 呈雙重軸對稱。,限制性內切酶,性質 切斷識別部位或其附近特定部位后,產生兩種末端,即平齊末端和粘性末端(5突出端和3突出端)。,Pst I,CTGCAG GACGTC,EcoR I,3突出,5突出,特殊的限制酶
3、 同裂酶isoschizomer 指來源不同,但有相同識別序列的限制性內切酶。 同尾酶isocaudamer 指識別序列不同,但切割DNA后可以產生相同粘端的限制性內切酶。,DNA連接酶可以催化單鏈DNA的連接嗎? DNA連接酶可以催化缺少核苷酸的切口的連接嗎?,連接酶,主要連接酶的功能特點,載體和插入片段具有相同的粘性末端 容易連接成環(huán)狀的重組DNA分子 可能出現(xiàn)問題: 載體自身環(huán)化,造成假陽性背景克隆; 插入片段可雙向插入; 插入片段可多拷貝插入。 當DNA片段兩端為非同源的粘性末端 可實現(xiàn)定向克隆,連接效率高,簡捷,粘性末端連接,可在連接前,用堿性磷酸酶將載體DNA5端去磷酸化,這樣只有
4、載體和插入片段之間才能發(fā)生連接;,利用磷酸酶防止載體DNA的重新環(huán)化,。,質粒載體的定向克隆,E.coli. DNA聚合酶I E.coli. DNA聚合酶I大片段 (Klenow fragment) T4噬菌體DNA聚合酶 T7噬菌體DNA聚合酶 耐高溫DNA聚合酶: Taq DNA聚合酶,DNA Polymerase,Reverse Transcriptase,Alkalinephosphatase,T4 Polymerase Kinase,細菌堿性磷酸酶BAP 牛小腸堿性磷酸酶CIP,修飾酶,載體(vector)是能夠攜帶外源DNA進入宿主細胞進行擴增和表達的DNA,它們一般是通過改造質粒
5、、噬菌體或病毒等構建而成的。,載 體,質粒,噬菌體,病毒,組合載體,種 類,能在宿主細胞中獨立復制; 具有多種限制酶的單一切點(多克隆位點)以便外源DNA插入; 具有篩選標記,以區(qū)別陽性與陰性重組分子; 分子較小,便于體外基因操作,同時載體DNA與宿主DNA便于分離; 表達載體:具有與宿主細胞相適應的啟動子、增強子、加尾信號等基因表達元件。,必要條件,具備條件,分類,克隆載體:以繁殖DNA為目的的載體,通常分子較小,自我復制能力強,拷貝數(shù)高。如pBR322、pUC、M13等。,穿梭載體:帶有兩種復制原點,在原核細胞和真核細胞中都能繁殖的載體,通常用于真核基因的克隆。,表達載體:以獲得基因表達產
6、物為目的的載體,通常要具有強啟動子、結構穩(wěn)定、拷貝數(shù)高和能在宿主細胞中高效表達等特點。,克隆載體的特性 復制起始:在受體細胞中獨立復制 多克隆位點:含多個限制性核酸內切酶單一切點 多選擇標記:抗藥性,其他遺傳標記 分子量?。耗苋菁{的外源DNA片段盡可能大,常用克隆載體 質粒 噬菌體 Cosmid Phagemid 真核病毒 YAC, BAC,分類,松弛型*獨立復制,拷貝數(shù)高, 10-200個拷貝/細胞,例如pUC載體可達700個/細胞 嚴緊型受受體染色體DNA復制控制,拷貝數(shù)低,1-幾個拷貝/細胞,例如pSC101,天然型 人工型*,可轉移型 不可轉移型*,氯霉素擴增氯霉素可抑制染色體DNA復制,但質粒復制不受影響,
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