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文檔簡介

第二章 沉 淀 法,沉淀法是分離純化生命大分子物質常用的一種經(jīng)典方法;其特點是:操作簡單,成本低廉 常見的方法有鹽析、有機溶劑沉淀、蛋白質沉淀、PEG沉淀、選擇性沉淀、結晶沉淀等,掌握沉淀法的基本原理及影響因素 掌握沉淀類型及其在制備蛋白質、核酸中作用原理 熟悉沉淀法在制備蛋白質和核酸過程中的實際運用,目 的,第一節(jié) 基本原理與沉淀類型,一、基本原理,根據(jù)同一溶劑中有效成分與雜質溶解度差異。選用某種溶液系統(tǒng),使所需有效成分出現(xiàn)最大溶解度,而雜質出現(xiàn)最小溶解度;或者相反,然后溶解度小者以沉淀的形式析出,達到有效成分與雜質分離的目的,根據(jù)蛋白質和核酸在組成、結構及性質等方面的明顯差異,所以從生物材料中提取制備這兩類物質,一般選用的試劑和操作方法也不完全相同,二、制備蛋白質,(一)鹽析法,1.原理,蛋白質在稀鹽溶液中,溶解度隨鹽濃度的增高而上升(鹽溶);但當鹽濃度增加到一定數(shù)值時,其溶解度有隨鹽濃度逐漸下降,直至蛋白質析出(鹽析),鹽析的內因是當鹽濃度達到一定程度時,水的活度降低,導致蛋白質分子表面電荷中和,水化膜相繼破壞,蛋白質分子聚集而析出沉淀,2.基本步驟,選擇一定濃度的鹽溶液,使部分雜質“鹽析”,有效成分“鹽溶”(025%的(NH4)2SO4) 離心分離上清 再調一定濃度鹽(2560%飽和鹽溶液),使有效成分“鹽析” 離心收集沉淀物,即為初步純化的有效成分,(1)鹽分級沉淀,鹽的選擇:在蛋白質鹽析時,常選用的鹽是(NH4)2SO4,(NH4)2SO4的優(yōu)點:溶解度大;對溫度不敏感;分離效果好(如有時一次可除去75%的雜蛋白); (NH4)2SO4本身有穩(wěn)定蛋白質結構的作用;價格低廉;廢液還可作肥料 缺點:與其他鹽一樣,若需進一步純化,需脫鹽處理, (NH4)2SO4鹽析,固體法,在大體積的粗提液中逐漸加入固體(NH4)2SO4,邊加邊攪拌,緩緩加入。在此過程中,溶液(NH4)2SO4的濃度不斷升高,水分子不斷與(NH4)2SO4結合,當加入的(NH4)2SO4達到鹽析點時,蛋白質就會沉淀出來,例:在尿素酶抽提液中加入(NH4)2SO4,當飽和度達為35%時,尿素酶基本留在溶液中;但當飽和度達到55%時,尿素酶幾乎全部沉淀 至于蛋白質溶液中加多少(NH4)2SO4使其飽和度符合蛋白質鹽析,可查表2-2,或用下列公式計算:,(20),(25 ),表示一升溶液中需加入的(NH4)2SO4的克數(shù),硫 酸 銨 對 尿 素 酶 的 沉 淀 作 用,調 整 硫 酸 銨 溶 液 飽 和 度 計 算 表,飽和溶液法,在pro溶液中加入預先調好的飽和(NH4)2SO4溶液,不同的飽和度所需的(NH4)2SO4的量用下式計算:,表示需加入(NH4)2SO4溶液的體積(ml),表示原來溶液的體積,表示始、終鹽的飽和度,表示需加入(NH4)2SO4溶液的飽和度,此法較固體法溫和,但不宜用于大體積樣品;否則引起樣品液體積增加,計算不準確。不能達到預期的目的,透吸法,將裝有pro溶液的透吸袋放入一定濃度大體積鹽溶液中,利用半透膜透吸改變pro溶液中的鹽濃度 由于此法的鹽濃度是以連續(xù)狀態(tài)變化的,可避免局部鹽濃度過高而產生的不良影響;所以分離效果好 但透吸袋體積有限,鹽析速度緩慢,(NH4)2SO4消耗多等原因,致使此法僅用于要求較精確、樣品體積小的試驗過程中,難于放大,(2)制作鹽析曲線,用鹽析法沉淀分離pro樣品是,(NH4)2SO4的“鹽析”濃度很關鍵,所需的濃度范圍要通過具體試驗確定: 取一定體積已測含量的pro或酶的待分離溶液,調pH至穩(wěn)定范圍 分610次加入不同量的(NH4)2SO4至出現(xiàn)渾濁時,分離上清;如此反復610次,分別收集每次的沉淀 根據(jù)每次沉淀的pro或酶的量和相應的(NH4)2SO4濃度之間作圖,即得鹽析曲線(如圖2-1) 參照表2-3的分級試驗方法,再根據(jù)所用生物材料來源的難易程度,以及對有效成分純度和得率的要求,先找出有利于提高純化倍數(shù)或得率的大致框架,然后經(jīng)過反復試驗就能確定最佳鹽析范圍(即(NH4)2SO4 的濃度范圍) 但若生物材料來源容易,主要考慮提高純化倍數(shù),得率高低可視為次要因數(shù),若材料來源困難,則主要考慮得率,典 型 鹽 析 曲 線,由表可知,若生物材料來源容易,主要是考慮提高純化倍數(shù)時,選擇48%65%鹽飽和分級范圍,酶的純化倍數(shù)可達3.0,而得率僅為75%;若生物材料來源較困難,主要是考慮提高收得率時,則選擇45%70%甚至45%75%鹽飽和分級范圍,酶的收得率可達80%以上,而純化倍數(shù)將2.4,(3)影響鹽析的因素,鹽析常數(shù)(Ks),每種pro在溶液中的溶解度和該溶液的鹽濃度之間存在如下關系 S表示有效成分在水中的溶解度; M表示摩爾濃度; Ks表示有效成分在特定條件下的恒定值,Ks值越大,則意味著有效成分溶解度降低的速度隨著鹽濃度的增加而快速降低;因此,對一種有效成分而言, Ks值越大,分級范圍就越窄,鹽析效果就越好。 Ks還受pro本身的性質、溶液的pH、溫度及鹽的種類等因素的影響,在pH7.0溶液中幾種蛋白質的和KS常數(shù) (溶解度S以mg/ml表示),鹽分級范圍的差異性,在pro分離過程中,若每一種pro的Ks都很大,分離效果不一定好。因為鹽析效果還與鹽析范圍的差異性有關 各pro的Ks大 + 鹽析范圍差異明顯,則分離效果好; 如圖2-2中AC 各pro的Ks大 + 鹽析范圍差異較小,則分離效果不好;如圖2-2中AB, pH和鹽濃度,有效成分的溶解度會受到pH和鹽濃度的顯著影響 例:兔肌磷酸甘油醛脫氫酶( pI約8.5)可溶于pH6.0,3.2mmol/L的(NH4)SO4溶液中,但若調節(jié)pH.,則立即產生沉淀這說明選擇適當pH的鹽溶液可提高鹽析的效果,一般來說,在分級鹽析過程中,第一次鹽析時(除去雜質),pH應偏離有效成分的pI值,而接近雜質的pI值;而在第二次鹽析時(沉淀有效成分),pH應調節(jié)至接近有效成分的pI值,蛋白質的純度和濃度,蛋白質存在的形式(均一的還是混合的)和濃度不同,鹽析范圍和溶解度也不一樣。在混合的pro溶液中,不同分子間的相互作用會發(fā)生共沉淀作用。 Pro濃度越高,這種現(xiàn)象越明顯,鹽析分離效果則越差;因此,一般控制樣品液Pro濃度在0.22%之間為宜,其他,在進行鹽析沉淀時,有時需在溶液中加1mmol/L的EDTA-Na2鹽,以除去沉淀劑中帶入的金屬離子。另外,加(NH4)2SO4沉淀的時間要控制好,過長或過短都不宜,一般控制在2h左右,(4)脫鹽,常用方法:凝膠過濾法和透析法,透析操作的注意事項: 透析袋處理:市售透析袋要D.W洗凈,檢查無漏洞時再用。若用來去除某些易被金屬離子或水解酶破壞的樣品中的鹽時,透析袋應用含EDTA-Na2的NaHCO3溶液中煮沸10min;并經(jīng)D.W煮沸、漂洗后再用 透析液的選擇:透析液一般為低離子強度的中性緩沖液。對含有輔基的酶透析時,宜在透析液中加入適量的輔基或保護輔基的試劑。為防止微生物的生長,透析應在4進行或在透析液中添加0.02%的NaN3,(二)有機溶劑沉淀法,1.原理,與鹽溶液一樣具有脫水作用,使Pro表面的水化膜破壞 降低溶劑系統(tǒng)的介電常數(shù),即降低極性(而蛋白質為水溶性物質),2.常用有機溶劑:MeOH、EtOH、Me2CO等 3.有機溶劑的使用量:,V表示加入有機溶劑的體積; V0表示蛋白溶液的原始體積 S1表示蛋白溶液中有機溶劑的濃度(體積百分濃度) S2表示蛋白溶液中欲達到的有機溶劑濃度(體積百分濃度) C表示有機溶劑的濃度(如無水EtOH ,則C=100,95% EtOH ,則C=95),4.注意事項:,中性鹽作用。即在有機溶劑沉淀時,加入適量中性鹽,一方面可增加Pro在有機溶劑中的溶解度,另一方面可防止Pro變性(0.05);提高分級效果 低溫下操作。因為有機溶劑加入水溶劑中會放熱,若不注意降溫,容易導致Pro變性 多價陽離子作用。有些Pro能和多價陽離子(如Zn+、Cu+等)結合形成復合物,致使Pro在有機溶劑中溶解度降低,這對在高濃度溶劑中才能沉淀的Pro特別有益。如在某些Pro溶液中加入0.0050.02mmol/L的Zn+,就可節(jié)省大量有機溶劑, 使Pro有效得沉淀出來,(三)蛋白質沉淀法,1.堿性蛋白質(多價陽離子的堿性蛋白質),如:魚精蛋白,既能有效得沉淀核酸,又能沉淀Pro 應用:魚精蛋白加入到部分純化的酵母PFK溶液時,溶液中的酶蛋白便會吸附到魚精蛋白核酸沉淀物上;將沉淀物用0.1mol/L磷酸緩沖液洗脫,收集的PFK純度提高了9倍 從深紅螺菌中分離PEP羥基激酶時,加魚精蛋白處理,可除去其中3/4的雜蛋白,而酶蛋白仍然保留在溶液中 缺點:多價陽離子的堿性蛋白質不可再利用,且其水溶液pH23,要小心調中性后才能應用,2.凝集素,目前研究得比較清楚的是植物血球凝集素,如伴刀豆蛋白,它是一種特殊的蛋白質,主要對糖蛋白糖鏈末端序列有特異、明顯的凝集力 例:伴刀豆蛋白對含有G、甘露糖等分子的糖蛋白能發(fā)生特異凝集沉淀作用,通過離心可把糖蛋白與一般蛋白質分離開,獲得的凝集素-糖蛋白復合物用單糖作抑制劑即可解離 優(yōu)點:條件溫和,專一性強,3.重金屬,重金屬(Pb2+、Hg2+)也能與蛋白質沉淀,純化Pro。但由于重金屬易使Pro變性,故應用時要控制在較溫和的條件下進行,并及時除去重金屬,(四)PEG沉淀法,此法應用較廣,屬于非離子型聚合物引起的Pro沉淀作用;沉淀條件溫和,不易引起Pro變性,且沉淀較完全 如用20%PEG-6000或57%PEG-400可使-葡萄糖苷酶80%發(fā)生沉淀,(五)選擇性沉淀,利用目的Pro與雜Pro在不同物理化學環(huán)境下的穩(wěn)定性不同(如溫度、酸堿度、有機溶劑等),用選擇性沉淀法,使雜Pro變性沉淀,而目的Pro存在于溶液中或發(fā)生可逆性沉淀,從而使目的Pro得到純化,例:酵母干粉抽提液升溫至55,20min后迅速冷卻,離心除去熱變性的Pro,上清液中為對熱穩(wěn)定的醇脫氫酶 假單胞菌培養(yǎng)液中加 HCl 調pH至4.0,得到堿性脂酶的沉淀,(六)結晶沉淀法,操作:,將欲結晶的物質溶解于適當溶劑中,加入適量的鹽(如2040% (NH4)2SO4 )或有機溶劑(如EtOH、MeOH等),使其溶解度降低至接近飽和的臨界濃度或剛剛開始出現(xiàn)沉淀 調節(jié)pH至等電點附近,控制溫度4左右,使溶解度進一步降低 放置一段時間(陳化),即可得到結晶沉淀,對于難結晶的物質,有時采用加入少量“晶種”引子,或進行適當攪拌,或在容器 壁上用玻棒磨檫等方法,可加速結晶,三、制備核酸,從生物材料(如動物組織、線粒體、葉綠體,以及微生物中的真菌、細菌和病毒等)中分離出的DNA或RNA,往往是以DNA- Pro(DNP)或RNA- Pro(RNP)復合物的形式存在的,所以制備核酸樣品時,首先需使復合物解聚,釋放出核酸,除去Pro,然后用沉淀法得到核酸,(一)DNP/RNP復合物的解聚,在破細胞溶液中,加入適量的陰離子去污劑SDS或十二烷基肌氨酸鈉、脫氧膽酸鈉DOC、聚氧乙基十六烷基酚醚、TWeen等,使DNP/RNP解聚釋放出核酸 加入適量醋酸鉀溶液沉淀SDS-pro和SDS-K+等,然后離心除去沉淀 分離上清,即為初步純化的核酸制品,1.加去污劑,2.加有機溶劑,用有機溶劑反復處理抽提液,直至處理液經(jīng)離心后,水相-有機相界面交接出無變性的pro為止 注意有機溶劑的祛除一般用乙醚提取,再在低溫蒸餾除凈乙醚,3.蛋白酶處理,用蛋白水解酶除去復合物中的pro組分,此法條件溫和,一般不會造成對核酸的破壞 常用的pro水解酶有:溶菌酶、蛋白酶K、蛋白酶E等,(二)消除多糖等雜質,1.多糖,抽提前用“饑餓法”可減少生物材料中貯存多糖(如淀粉、糖原等)的含量 混雜于核酸提取液中的多糖類雜質,一般用異丙醇、十六烷基三甲基溴化銨(CTAB,適用于酸性多糖)等選擇性沉淀劑除去;此外,也可用等體積2.5mol/L磷酸緩沖液和等體積乙二醇甲醚處理,經(jīng)離心,多糖位于中部,核酸位于上層乙二醇甲醚中,2.DNA與RNA的分離,鹽析法 DNA:易溶于12mol/LNaCl溶液,難溶于0.14 mol/LNaCl溶液 原理 RNA:易溶于0.14 mol/LNaCl溶液,難溶于12mol/LNaCl溶液 例:從小牛胸腺提取DNA:用0.14 mol/LNaCl溶液反復洗滌、絞碎、離心;結果RNA存在于溶液,DNA存在于沉淀中 酶水解法 在提取DNA時,用RNase水解RNA, RNase中混有的DNase用100熱 處理15min 在提取RNA時,用DNase水解DNA, DNase中混有的RNase,在Ca2+存在條件下,加蛋白酶K作用或加碘乙酸鈉處理,使RNase破壞,(三)核酸沉淀,在核酸溶液中加入某些有機溶劑或非離子型聚合物試劑時,核酸會被有效地沉淀,1.有機溶劑沉淀法,乙醇鹽溶液 操作:在核酸溶液(0.1l/ml)中加入0.1mol/L NaCl 和2倍量體積(DNA)或2.5倍體積(RNA)的冷無水乙醇,就可將核酸沉淀出來 注意:沉淀時間與溫度、核酸分子大小、濃度有關,DNA1kb時,室溫數(shù)分鐘,高速離心即可(16000rpm15min) DNA1k

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