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第3章基因的本質(zhì)第4節(jié)基因是有遺傳效應(yīng)的dna片段【知識擴(kuò)展】基因概念之演變基因(gene)是遺傳學(xué)家約翰遜(wjohannsen)在1909年提出來的。他用基因這一名詞來表示遺傳的獨立單位,相當(dāng)于孟德爾在豌豆試驗中提出的遺傳因子。 在遺傳學(xué)發(fā)展的早期階段,基因僅僅是1個邏輯推理的概念,而不是一種已經(jīng)證實了的物質(zhì)和結(jié)構(gòu)。由于科學(xué)研究水平的不斷提高,從淺入深,由宏觀到微觀,基因的概念也在不斷的修正和發(fā)展。從遺傳學(xué)史的角度看,基因概念大致分以下幾個階段:孟德爾的遺傳因子階段;摩爾根的基因階段;順反子階段和現(xiàn)代基因階段。一、孟德爾的遺傳因子階段19世紀(jì)60年代初,孟德爾對具有不同形態(tài)的豌豆作雜交實驗,在解釋實驗中每種性狀的遺傳行為時,用a代表紅花,a代表白花,表明生物的某種性狀是由遺傳因子負(fù)責(zé)傳遞的,遺傳下來的不是具體的性狀,而是遺傳因子。遺傳因子是顆粒性的,在體細(xì)胞內(nèi)成雙存在,在生殖細(xì)胞內(nèi)成單存在。孟德爾所說的“遺傳因子”是代表決定某個性狀遺傳的抽象符號。孟德爾在闡明遺傳因子在世代中傳遞規(guī)律時,就已經(jīng)認(rèn)識到了基因的兩個基本屬性:基因是世代相傳的,基因是決定遺傳性表達(dá)的?,F(xiàn)在所說的“基因是生物體傳遞遺傳信息和表達(dá)遺傳信息的基本物質(zhì)單位”,實際上就是孟德爾所闡明的基因觀。二、摩爾根的基因階段1909年,丹麥遺傳學(xué)家約翰遜創(chuàng)造了“基因”這一術(shù)語,用來表達(dá)孟德爾的遺傳因子,但還只是提出了遺傳因子的符號,沒有提出基因的物質(zhì)概念。摩爾根對果蠅的研究結(jié)果表明,1條染色體上有很多基因,一些性狀的遺傳行為之所以不符合孟德爾的獨立分配定律,就是因為代表這些性狀的基因位于同一條染色體上,彼此連鎖而不易分離。這樣,代表特定性狀的特定基因與某一條特定染色體上的特定位置聯(lián)系起來?;虿辉偈浅橄蟮姆?,而是在染色體上占有一定空間的實體,從而賦予基因以物質(zhì)的內(nèi)涵。三、順反子階段早期的基因概念是把基因作為決定性狀的最小單位、突變的最小單位和重組的最小單位,后來,這種“三位一體”的概念不斷受到新發(fā)現(xiàn)的挑戰(zhàn)。20世紀(jì)50年代以后,隨著分子遺傳學(xué)的發(fā)展,1953年在沃森和克里克提出dna的雙螺旋結(jié)構(gòu)以后,人們普遍認(rèn)為基因是dna的片段,確定了基因的化學(xué)本質(zhì)。1957年,本澤爾(seymour benzer)以t4噬菌體為材料,在dna分子水平上研究基因內(nèi)部的精細(xì)結(jié)構(gòu),提出了順反子(cistron)概念。順反子是1個遺傳功能單位,1個順反子決定1條多肽鏈。能產(chǎn)生1條多肽鏈的是1個順反子,順反子也就是基因的同義詞。1個順反子可以包含一系列突變單位突變子。突變子是dna中構(gòu)成1個或若干個核苷酸。由于基因內(nèi)的各個突變子之間有一定距離,所以彼此之間能發(fā)生重組,重組頻率與突變子之間的距離成正比。重組子代表1個空間單位,有起點和終點,可以是若干個密碼子的重組,也可以是單個核苷酸的互換。如果是后者,重組子也就是突變子。四、現(xiàn)代基因階段1操縱子 從分子水平來看,基因就是dna分子上的一個個片段,經(jīng)過轉(zhuǎn)錄和翻譯能合成1條完整的多肽鏈。可是,通過近年來的研究,認(rèn)為這個結(jié)論并不全面,因為有些基因,如rrna和trna基因只有轉(zhuǎn)錄功能而沒有翻譯功能。另外,還有一類基因,其本身并不進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,但可以對鄰近的結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)起控制作用,如啟動基因和操縱基因。從功能上講,能編碼多肽鏈的基因稱為結(jié)構(gòu)基因;啟動基因、操縱基因和編碼阻遏蛋白、激活蛋白的調(diào)節(jié)基因?qū)儆谡{(diào)控基因。操縱基因與其控制下的一系列結(jié)構(gòu)基因組成1個功能單位,稱為操縱子。2移動基因 移動基因指dna能在有機(jī)體的染色體組內(nèi)從1個地方跳到另一個地方,它們能從1個位點切除,然后插入同一或不同染色體上的另一個位置。移動基因機(jī)構(gòu)簡單,由幾個促進(jìn)移位的基因組成?;虻奶鴦幽軌虍a(chǎn)生突變和染色體重排,進(jìn)而影響其他基因的表達(dá)。 業(yè)已證明,相當(dāng)一部分已知的自發(fā)突變是移動基因所致,而且,移動基因不僅能在個體的染色體組內(nèi)移動,并能在個體間甚至種間移動,因此是1個重要的進(jìn)化因素。移動基因的發(fā)現(xiàn)動搖了基因在染色體上有一固定位置的傳統(tǒng)觀念。3斷裂基因 過去人們一直認(rèn)為,基因的遺傳密碼子是連續(xù)不斷地并列在一起,形成1條沒有間隔的完整基因?qū)嶓w。但后來通過對真核蛋白質(zhì)編碼基因結(jié)構(gòu)的分析發(fā)現(xiàn),在它們的核苷酸序列中間插入有與編碼無關(guān)的dna間隔區(qū),使1個基因分隔成不連續(xù)的若干區(qū)段。這種編碼序列不連續(xù)的間斷基因被稱為斷裂基因。不連續(xù)的斷裂基因的表達(dá)程序是:先轉(zhuǎn)錄為初級轉(zhuǎn)錄物,即核內(nèi)不均一rna,又叫前體rna;然后經(jīng)過刪除和連接,除去無關(guān)的dna間隔序列的轉(zhuǎn)錄物,便形成了成熟的mrna分子,它從細(xì)胞核中輸送到細(xì)胞質(zhì),再轉(zhuǎn)譯為相應(yīng)的多肽鏈。4假基因 1977年,gjacp根據(jù)對非洲爪蟾5s rrna基因簇的研究,提出了假基因的概念,現(xiàn)已在大多數(shù)真核生物中發(fā)現(xiàn)了假基因。這是一種核苷酸序列同其相應(yīng)的正常功能基因基本相同,但卻不能合成出功能蛋白質(zhì)的失活基因。5重疊基因 長期以來,在人們的觀念中一直認(rèn)為同一段dna序列內(nèi),是不可能存在重疊的讀碼結(jié)構(gòu)的。但是,隨著dna核著酸序列測定技術(shù)的發(fā)展,人們已經(jīng)在一些噬菌體和動物病毒中發(fā)現(xiàn),不同基因的核苷酸序列有時是可以共用的。也就是說,它們的核苷酸序列是彼此重疊的,這樣的2個基因被稱為重疊基因。它修正了關(guān)于各個基因的多核苷酸鏈?zhǔn)潜舜朔至?、互不重疊的傳統(tǒng)觀念。由此可見,隨著生物科學(xué)的不斷發(fā)展,人們對基因概念的理解也不斷深入。在世界科學(xué)技術(shù)日新月異的今天,生物科學(xué)將會有更多新的突破性進(jìn)展,基因的概念不可避免的將會被賦予新的內(nèi)容。對基因認(rèn)識的進(jìn)一步深化(1)基因的順反子概念(黑方塊表示變位點)1955年,美國分子生物學(xué)家本澤(benzer)通過對大腸桿菌的噬菌體 的 區(qū)基因的深入研究,揭示了基因內(nèi)部的精細(xì)結(jié)構(gòu)。提出了基因的順反子(cistron)概念。他發(fā)現(xiàn),在一個基因內(nèi)部,可以發(fā)生若干不同位點的突變,倘若在一個基因內(nèi)部發(fā)生兩個以上位點的突變,其順式和反式結(jié)構(gòu)的表型效應(yīng)是不同的。如上圖所示,順式是野生型,反式卻是突變型。所以,基因就是一個順反子?;騼?nèi)部這些不同位點之間還可以發(fā)生交換和重組。所以,一個基因不是一個突變單位,也不是一個重組單位。本澤分別把它們稱為突變子(muton)和重組子(recon)。顯然,一個突變子或重組子可小到一個核苷酸對?;虻捻樂醋痈拍顩_破了傳統(tǒng)的“功能、交換、突變”三位一體的基因概念,糾正了長期以來認(rèn)為基因是不能再分的最小單位的錯誤看法,使人們對基因的認(rèn)識有了顯著的提高。(2)有結(jié)構(gòu)基因與調(diào)控基因的劃分,還有重造基因和斷裂基因的發(fā)現(xiàn)過去人們曾經(jīng)認(rèn)為,基因像念珠一樣,一個接一個地排列在染色體上,是互不重迭的;基因是一個連續(xù)的核苷酸序列,是不能間斷的。重迭基因和斷裂基因的發(fā)現(xiàn),刷新了這些陳舊的看法,使人們對基因的結(jié)構(gòu)與功能的認(rèn)識又提高到一個新高度。什么是基因現(xiàn)在,基因已經(jīng)成為一個家喻戶曉的名詞,但是,你是否能準(zhǔn)確地說出什么是基因呢?本義從基因研究的發(fā)展歷史談?wù)剬虻睦斫狻R?、基因概念的發(fā)展1909年, wl約翰遜首次提出了基因(gene)這一名詞,用來表示gj孟德爾在豌豆雜交試驗中所證實的遺傳因子。1910年,美國遺傳學(xué)家th摩爾根通過果蠅雜文實驗證明基因在染色體上呈線性排列,并確立了遺傳的連鎖和互換規(guī)律,進(jìn)而在1926年發(fā)表了其代表作基因論。這時,人們認(rèn)為“基因是染色體上的遺傳功能單位”。1928年f格里菲斯的肺炎雙球菌轉(zhuǎn)化實驗,以及1944年() t艾弗里的dna轉(zhuǎn)化實驗,首次證明dna是遺傳物質(zhì),從而揭開了基因的化學(xué)本質(zhì)。1941年,gw比德爾和el塔圖姆根據(jù)脈孢霉生化突變型的研究提出了“一個基因一種酶”的假說,認(rèn)為基因與酶蛋白之間存在一一對應(yīng)的關(guān)系。到1957年,s本澤爾進(jìn)一步提出了“一個順反子一條多肽鏈”的論斷。順反子是基因的同義語,所以也說“一個基因一條多肽鏈”。這比“一個基因一種酶”的假說更為準(zhǔn)確,因為有些蛋白質(zhì)并不具有酶的性質(zhì),而且酶和蛋白質(zhì)分子既可由一條肽鏈構(gòu)成,也可由兩種以上的肽鏈構(gòu)成。1966年,“一個基因一條多肽鏈”的生物學(xué)過程得到充分證明,并于1967年發(fā)表了全套的遺傳密碼表,初步揭開了基因表達(dá)之謎。原來,生物的遺傳信息以核苷酸堿基(atgc)的不同排列貯存干dna分子中,每3個堿基編碼一條多肽鏈中的一個氨基酸。在基因表達(dá)時,dna中的遺傳信息先被轉(zhuǎn)錄成mrna(信使rna),mrna中每3個堿基組成一個密碼子,決定一種氨基酸。然后由mrna中的核苷堿酸基(augc)的排列順序指導(dǎo)多肽鏈的合成。遺傳信息的這種“dnarna蛋白質(zhì)”表達(dá)方式稱為中心法則。一個基因的dna雙鏈中,只有一條鏈可以用做轉(zhuǎn)錄的模板。關(guān)于這兩條鏈的稱呼有點混亂。以前的文獻(xiàn)稱模板鏈為編碼或有意義鏈。非模板鏈為無意義鏈,近年來則反過來稱模板鏈為反意義鏈(因其堿基序列與mrna互補)而非模板鏈為有意義鏈(因其堿基序列與mrna相同),又稱編碼鏈。一般所說的dna堿基序列是指有意義鏈,即編碼鏈,方向為5 3。遺傳密碼和密碼子一般是指mrna中的堿基序列,有時也指dna中編碼鏈的堿基序列。1953年jd沃森和fhc克里克提出了著名的dna分子結(jié)構(gòu)的雙螺旋模型。1973年誕生了重組dna技術(shù),即基因工程。此后,隨著分子生物學(xué)的迅速發(fā)展,人們對基因的認(rèn)識不斷深化。其中最重要的發(fā)現(xiàn)是:1重疊基因 1977年f桑格等在噬菌體 x174中發(fā)現(xiàn)重疊基因,即某一段核苷酸序列同時為兩個基因編碼。后來在其它病毒以及細(xì)菌和果蠅等生物中也發(fā)現(xiàn)了重疊基因,一段dna序列為兩個或三個基因所共用,或者一個小基因位于一個大基因之內(nèi)。重疊基因是生物體合理而又經(jīng)濟(jì)地利用自身dna的一種絕妙方式,它的發(fā)現(xiàn)打破了基因是彼此分離的傳統(tǒng)觀念。2斷裂基因 1977年mt道爾等首次發(fā)現(xiàn)卵清蛋白基因是不連續(xù)的,在基因內(nèi)部插入了7個沒有編碼意義的dna片段?,F(xiàn)已查明,原核生物的基因一般是連續(xù)的,在一個基因的內(nèi)部沒有不編碼的dna序列。而真核生物的絕大多數(shù)基因都是不連續(xù)的斷裂基因,無編碼意義的插入片段稱為內(nèi)含子,有編碼意義的基因片段稱為外顯子。在基因表達(dá)時,內(nèi)含子與外顯子被一起轉(zhuǎn)錄成mrna前體,然后通過加工除掉與內(nèi)含子對應(yīng)的序列,再把與外顯子對應(yīng)的序列拼接起來,形成成熟的mrna分子,最后翻譯成多肽鏈。內(nèi)含子把一個基因分成幾個部分,打破了基因是一個不容分割的功能單位的傳統(tǒng)觀念。3移動基因 50年代初b麥克林托克在玉米的染色體中發(fā)現(xiàn)了可以改變自身位置的基因,她稱之為“解離因子”。解離因子可以在同一個雜色體內(nèi)或不同的染色體間移動,當(dāng)它移動到新的位置以后,可以引起染色體斷裂,使玉米籽粒出現(xiàn)色斑。后來,在其它生物中也發(fā)現(xiàn)了可以改變自身位置的移動基因,其中最常見的是細(xì)菌轉(zhuǎn)座子。轉(zhuǎn)座子除了含有與改變自身位過有關(guān)的基因以外,還攜帶與插入功能無關(guān)的基因,如耐藥基因、毒素基因和代謝基因等。4多個基因編碼一條多肽鏈 1979年s那卡尼施等發(fā)現(xiàn)并非一條肽鏈都由一個基因編碼,例如有些病毒可以由一段dna序列轉(zhuǎn)錄出一條mrna分子,然后翻譯出一條多肽鏈,最后這條多肽鏈被切割成多個有生物功能的肽鏈。有多少個功能肽鏈產(chǎn)生,對應(yīng)的dna序列就應(yīng)當(dāng)含有多少個基因。這種多個基因編碼一條多肽鏈的現(xiàn)象,不符合“一個基因決定一條多肽鏈”的普遍原則,使基因的定義更加復(fù)雜化。5隱蔽基因 一般來說,用做翻譯模板的mrna分子應(yīng)該與其編碼基因有對應(yīng)關(guān)系,也就是說它的核苷酸堿基應(yīng)與基因的核苷酸堿基互補,而且數(shù)量相等,對真核基因來說應(yīng)與外顯子序列相對應(yīng)。但是,自1985年以來,在某些病毒、植物和動物中發(fā)現(xiàn),mrna前體在成熟過程中發(fā)生了堿基的增加、缺失或智換,mrna與基因之間失去了一一對應(yīng)的關(guān)系。這一現(xiàn)象首先在原生動物錐蟲中發(fā)現(xiàn),并稱之為rna編輯。這種需要編輯才能正常表達(dá)的基因稱為隱蔽基因。隱蔽基因的發(fā)現(xiàn)使對基因的準(zhǔn)確定義更加困難。6不編碼蛋白質(zhì)的基因在蛋白質(zhì)合成過程中需要兩類rna分子的參與,一類是核糖體rna簡稱rrna,它是核糖體的組成部分。另一類是轉(zhuǎn)運rna簡稱trna其功能是把氨基酸搬運到核糖體會成多肽鏈的位點上。原核生物的rrna有3種,真核生物的rrna有4種。trna有幾十種。編碼這兩類rna分子的dna序列稱為rna基因,或者分別稱為rrna基因和trna基因。這樣看來,把基因定義為編碼一條多肽鏈的dna序列顯然不夠全面。二、基因的分子生物學(xué)定義在初中生物學(xué)課本中,把基因定義為“染色體遺傳物質(zhì)中決定生物性狀的小單位”。高中生物學(xué)課本則把基因定義為“有遺傳效應(yīng)的dna片段”。在最具權(quán)威的2000年版中國大百科全書中,基因的定義是“含特定遺傳信息的核苷酸序列,是遺傳信息的最小功能單位”。在最近幾年出版的外文版和部分中文版的分子生物學(xué)和分子遺傳學(xué)書籍中又給出了新的答案。從上述基因研究的最新進(jìn)展可以看出,基因不僅在功能上多種多樣,在結(jié)構(gòu)上也是五花八門,因此,給它下一個非常準(zhǔn)確和永遠(yuǎn)適用的定義是相當(dāng)困難的。根據(jù)目前所掌握的知識,從分子生物學(xué)的角度,可以把基因定義為“能夠表達(dá)出一個有功能的多肽鏈或功能rna分子的核酸序列”。這里,“rna分子”是指rrna和trna?!昂怂嵝蛄小敝饕竏na,對于rna病毒來說則指染色體rna。這個定義較確切地表述了基因的本質(zhì)和功能,已經(jīng)被絕大多數(shù)學(xué)者所接受。筆者認(rèn)為,這個定義能夠為中學(xué)生所理解,特別是高中學(xué)生。根據(jù)上述定義不轉(zhuǎn)錄的dna序列就不應(yīng)稱其為基因。實際上應(yīng)稱它們?yōu)閱訁^(qū)和操縱區(qū)。前者是基因轉(zhuǎn)錄時rna聚合酶與基因上游區(qū)結(jié)合并起始轉(zhuǎn)錄的dna區(qū)段,后者是與阻遏蛋白或激活蛋白結(jié)合從而調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄活性的dna區(qū)段,它們都不編碼

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