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編號 內(nèi)蒙古大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院生物系基因工程實(shí)驗(yàn)室本科基因工程實(shí)驗(yàn)論文開題報(bào)告論文題目:堿性磷酸酶基因表達(dá)載體的構(gòu)建及在大腸桿菌中的表達(dá)學(xué)生姓名: 年 級: 專 業(yè): 指導(dǎo)教師: 二一三年八月十二日學(xué)生姓名論文題目開題時(shí)間項(xiàng)目來源本科生基因工程大實(shí)驗(yàn)課一、立論依據(jù)項(xiàng)目的研究意義,國內(nèi)外研究現(xiàn)狀及發(fā)展趨勢分析,主要參考文獻(xiàn)及出處:堿性磷酸酶 (alkaline phosphatase, ALP, ALKP) (EC 3.1.3.1)屬磷酸單脂酶族,底物專一性較低,廣泛應(yīng)用于表位連鎖圖譜,探針標(biāo)記測序和免疫組織化學(xué)等領(lǐng)域。分子生物學(xué)中,ALP分解寡聚核甘酸的末端單酯化磷酸,是常用的遺傳工程酶。1產(chǎn)堿性磷酸酶的生物有很多,從細(xì)菌到高等哺乳動物均有分布。人血液中的堿性磷酸酶含量是重要的指標(biāo)之一,其檢驗(yàn)結(jié)果及異位表達(dá)對癌癥等許多疾病有著指導(dǎo)意義。2,3目前商業(yè)堿性磷酸酶主要來源于動物(小牛腸堿性磷酸酶)、植物(麥芽)和微生物(細(xì)菌堿性磷酸酶)(Bacterial alkaline phosphatase, BAP)。在革蘭氏陰性細(xì)菌中,BAP表達(dá)于細(xì)胞膜外的周質(zhì)空間。相比表達(dá)于胞內(nèi)使其更機(jī)動和高效。BAP的功能已基本揭示,簡單來說BAP是細(xì)菌產(chǎn)生攝取應(yīng)用的自由磷酸基團(tuán)的一種方式,4被大量的實(shí)驗(yàn)證據(jù)所支持。然而,缺乏BAP的E. coli 仍然能夠存活,所以應(yīng)該還存在相關(guān)的替代機(jī)制。5目前,對BAP的研究熱點(diǎn)主要由于其海洋有機(jī)磷利用的酶特性等集中于海洋微生物領(lǐng)域。海洋細(xì)菌堿性磷酸酶的亞細(xì)胞研究揭示了其相關(guān)合成基因及表達(dá)特性對于海洋有機(jī)磷循環(huán)及海洋生物多樣性的貢獻(xiàn)。研究人員證實(shí)了3733種BAP序列(包括 PhoA, PhoD, and PhoX ),包含胞質(zhì)分泌及胞外位于不同支載結(jié)構(gòu)。大量的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)支持了細(xì)菌于海洋表面部分光耦合的磷攝取機(jī)制。6鑒于磷對于海洋維持初級產(chǎn)能的重要性,并且考慮到其最主要的來源之一有機(jī)磷分解,海洋生物BAP的分子生物學(xué)研究也是熱點(diǎn)之一。相關(guān)的酶動力學(xué)研究表明,與藻青菌相關(guān)的堿性磷酸酶來說,鈣對于維持其基本活性是必須的。有假說稱其與浮游植物可能是鋅-P共限制的,一些海洋細(xì)菌的BAP可選形式即PhoX是于此相關(guān)的。7此外,分子研究表明,移除BAP的3磷酸集團(tuán)能夠促進(jìn)碰撞誘導(dǎo)解離時(shí)RNase消化產(chǎn)物分析對的寡核苷酸覆蓋。8另外,ALP于哺乳動物的分子酶動力學(xué)研究與海洋BAP也取得了相應(yīng)的結(jié)果。外生堿性磷酸酶處理補(bǔ)充了結(jié)腸炎的內(nèi)生酶保護(hù)機(jī)制以及抑制了細(xì)菌對大鼠的轉(zhuǎn)座。為AP抵制細(xì)菌轉(zhuǎn)座作用補(bǔ)充了證據(jù)。9本研究對BAP進(jìn)行克隆及表達(dá)研究,能夠?yàn)檫M(jìn)一步的科研研究提供原料,具有一定的經(jīng)濟(jì)價(jià)值,并無較大科研價(jià)值。參考文獻(xiàn): 1.Tams, L., Huttov, J., Mistrk, I., Kogan, G. (2002) Eect of Carboxymethyl Chitin-Glucan on the Activity of Some Hydrolytic Enzymes in Maize Plants. Chem. Pap. 56 (5): 326-329.2.Stolbach, L. L., Krant, M. J., Fishman, W. H. (1969) Ectopic Production of an Alkaline Phosphatase Isoenzyme in Patients with Cancer. N Engl J Med. 281:757-762.3.Diener, H.C., Bogousslavsky, J., Brass, L. M. (2004) Aspirin and clopidogrel com- pared with clopidogrel alone after recent ischaemic stroke or transient ischaemic attack in high-risk patients (MATCH): ran- domised, double-blind, placebo-controlled trial. Lancet. 364:331-733.4.Horiuchi, T., Horiuchi, S., Mizuno, D. (1959). A Possible Negative Feedback Phenomenon controlling Formation of Alkaline Phosphomonoesterase in Escherichia coli. Nature. 183:1529-1530.5.Wanner, B. L., Patrick L. (1980). Mutants Affected in Alkaline Phosphatase Expression: Evidence for Multiple Positive Regulators of the Phosphate Regulon in Escherzchza Coli. Genetics 96 (2): 353-366.6.Luo, H.W., Bennera, R., Long, R.A., and Hu, J.J. (2009) Subcellular localization of marine bacterial alkaline phosphatases. Proc Natl Acad Sci 106: 21219-21223.7.Kathuria, S., Martiny, A. C. (2012) Prevalence of a calcium-based alkaline phosphatase associated with the marine cyanobacterium Prochlorococcus and other ocean bacteria. Env Microbiol. 13:4-83.8. Krivos, K. L., Addepalli, B., Limbach, P. A. (2011) Removal of 3-phosphate group by bacterial alkaline phosphatase improves oligonucleotide sequence coverage of RNase digestion products analyzed by collision-induced dissociation mass spectrometry. Rapid Commun Mass Spectrom. 25:3609-3616.9. Martinez-Moya, P., Ortega-Gonzalez, M., Gonzalez, R., Anzola, A., Ocon, B., Hernandez-Chirlaque, C., et al. (2012). Exogenous alkaline phosphatase treatment complements endogenous enzyme protection in colonic inflammation and reduces bacterial translocation in rats. Pharmacol Res. 66:144-153.二、實(shí)驗(yàn)方案1 實(shí)驗(yàn)內(nèi)容和實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo),擬解決的關(guān)鍵問題: 實(shí)驗(yàn)內(nèi)容:包括質(zhì)粒提取、PCR擴(kuò)增、轉(zhuǎn)化大腸桿菌、凝膠回收、感受態(tài)制備、IPTG誘導(dǎo)、SDS-PAGE鑒定等。 關(guān)鍵問題:IPTG誘導(dǎo)量及誘導(dǎo)時(shí)間的優(yōu)化; 超聲破碎的方案優(yōu)化。2. 實(shí)驗(yàn)思路、方法、技術(shù)路線、實(shí)驗(yàn)方案及可行性分析: 實(shí)驗(yàn)思路:依據(jù)技術(shù)路線完成試驗(yàn)。 實(shí)驗(yàn)方法: 實(shí)驗(yàn)室常用技術(shù)。 技術(shù)路線: 實(shí)驗(yàn)方案:詳細(xì)方案已于講義給出。 可行性分析:實(shí)驗(yàn)室相關(guān)技術(shù)成熟,實(shí)驗(yàn)人員熟悉相關(guān)的實(shí)驗(yàn)內(nèi)容以及方法,實(shí)驗(yàn)的可行性很高。3. 實(shí)驗(yàn)進(jìn)度(10天之內(nèi)): 前一夜搖菌。 第一天: 1 提取pET-His, pCDNA-BAP; 2 瓊脂糖凝膠電泳鑒定pET-His, pCDNA-BAP; 3 以pCDNA-BAP為模版擴(kuò)增目的基因片段。 4 酶切pET-His。 第二天 1 凝膠回收酶切片段; 2 PCR產(chǎn)物連接; 3 轉(zhuǎn)化E. coli; 4 搖菌。 第三天 1 IPTG誘導(dǎo)表達(dá); 2 提BAP蛋白; 3 SDS-PAGE鑒定。4. 預(yù)期實(shí)驗(yàn)成果: 1 獲得目的產(chǎn)物BAP; 2 成功構(gòu)建BAP表達(dá)載體; 3 撰寫實(shí)驗(yàn)報(bào)告。5. 曾參與與本實(shí)驗(yàn)有關(guān)的學(xué)習(xí)和研究工作積累以及已取得的工作成績:(學(xué)過基因工程課程、讀過相關(guān)的文獻(xiàn)、寫過有關(guān)的綜述、參加過相關(guān)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)或研究課題、獲得學(xué)術(shù)獎勵情況等)1學(xué)習(xí)基因工程,期末測評93;讀過分子克隆,GENE IX等文獻(xiàn); 2于 生物技術(shù)通報(bào)(C) 發(fā)表綜述 蛋白質(zhì)組學(xué)在研究細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)中的應(yīng)用,第一作者;于 J. Anim. Sci. (SCI) 接收論文 Molecular Characterization and Expression Analysis of ELOVL1 Gene in the Cashmere Goat (Capra hircus) ,第一作者;于 Dna Cell Bio.l接收改稿 Connecting mTORC1 signaling to SREBP1 activation thorough lipids synthesis in mammals,第三作者;3按時(shí)間排序:參與國家創(chuàng)新基金 絨山羊成纖維細(xì)胞中超表達(dá)轉(zhuǎn)錄因子Krox20對IGFBP5啟動子活性的影響 完成3種細(xì)胞組成型表達(dá)檢測;參與內(nèi)蒙古自然科學(xué)基金項(xiàng)目No. 2011MS0521完成免疫組化工作;主
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