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文檔簡介
1、2021/4/17,1,第 二 章,微 生 物 分 類 與 鑒 定,2021/4/17,2,主要內(nèi)容,一、微生物的分類單位 二、微生物的命名 三、微生物分類的依據(jù) 四、分類的方法 五、微生物的鑒定 六、微生物的常用分類系統(tǒng),2021/4/17,3,一、微生物的分類單位 1.微生物分類的目的:把各種微生物按照它們的親緣 關系分群歸類,排成條理清楚的系統(tǒng),以便于人們對微生物進行鑒定和交流。 2. 微生物分類的任務: 分類:通過收集大量描述有關個體的文獻資料,經(jīng)過歸納, 整理成一個科學的分類系統(tǒng)。 鑒定:通過詳細觀察和描述一個未知名稱純種微生物的各 種性狀特征,然后查找現(xiàn)成的分類系統(tǒng),以達到對 其知
2、類,辨名的目的。 命名:是為新發(fā)現(xiàn)的微生物確定新的學名。,2021/4/17,4,3. 通用分類單元,種以上的系統(tǒng)分類單元 界 Kingdom(拉:Regnum) 門 Phylum(拉:Phylum)或Division(拉:Divisio)亞門 綱 Class(拉:Classis)亞綱 超目 目 Order (拉:Ordo)亞目 科 Family (拉:Familia)亞科 族 亞族 屬 Genus(拉:Genus) 種 Species(拉:Species),2021/4/17,5,4. 種的概念,種是一個基本分類單位 定義:種是一大群表型特征高度相似、親緣關系極其接近、與同屬內(nèi)其他種有明顯差
3、異的菌株的總稱。 或定義 親緣關系較近的微生物有機體的集合,它們在進化發(fā)育階段上有一定的共同形態(tài)和生理特征?,F(xiàn)代分類學上規(guī)定種內(nèi)菌株的DNA同源性70% 。 模式種:在微生物中,一個種只能用該種內(nèi)的一個典型菌株作為具體標本,它就是該種的模式種。 新種: sp.nov.或nov. sp.,新被鑒定的種發(fā)表時應在其學名后標上sp.nov.的符號,新種發(fā)表前應將其模式菌株的培養(yǎng)物存放在一個永久性的保藏機構,并應允許人們從中取得。,2021/4/17,6,亞種(小種race)(subspecies):實驗室中獲得的微生物變異型稱為小種或亞種。 或定義 :一般指其某一穩(wěn)定的特征的種與模式種中不同的種,常
4、在種名、屬名的名詞后寫上subsp.然后再寫具體亞種的名詞。 變種(variety):從自然界分離到的微生物純種,如果與典型種之間存在某些特征的差別,而這些特征又是穩(wěn)定遺傳的,則可將這一純種稱為典型種的變種。如枯草芽孢桿菌的黑色變種(在酪氨酸培養(yǎng)基上產(chǎn)黑色素)。是亞種的同義詞(1975)已規(guī)定它在命名法中沒有地位。,5. 種以下的分類單元,2021/4/17,7,菌株(品系)(strain):表示任何由一個獨立分離的單細胞繁殖而成的純種群體極其一切后代。一種微生物的每一不同來源的純培養(yǎng)物或純分離物均可稱為某菌種的一個菌株。某一菌種內(nèi)的菌株數(shù)目幾乎是無數(shù)的。 菌株的名稱可用字母加編號表示,字母多
5、表示實驗室、產(chǎn)地或特征等的名稱,編號則表示序號等數(shù)字。例如,Bacillus subtilis AS1.398表示枯草芽孢桿菌的蛋白酶生產(chǎn)菌株?!癆S”為Academia Sinica(中國科學院)的縮寫。又如,Bifidobacterium bifidum ATCC 29521表示兩歧雙歧桿菌一個模式菌株?!癆TCC”為American Type Clutre Collection(美國典型菌種保藏中心)的縮寫。,2021/4/17,8,型(type or form):自然界存在的差異較小的同種微生 物的不同類型,稱為型。如結核分支桿菌依其寄主的 不同可分為人型、牛型和禽型。(菌株的同義詞
6、) 群(group):有些微生物的特征介于兩種微生物之間, 我們把這兩種微生物及其中間類型統(tǒng)稱為一個群。(沒 有分類地位非正式地指定一組具有某些共同性狀的生 物)如大腸菌群。 相(phase):自然界存在的微生物交互變異的一定階 段; 態(tài)(state):通常指微生物的菌落變異狀態(tài)。,2021/4/17,9,二、微生物的命名,1.學名(scientific name)按照國際細菌命名法規(guī)命名的、國際學術界公認并通用的正式名字。 命名的方法:國際法規(guī)命名,即林奈氏所創(chuàng)立的雙(三)名法。 雙名法的規(guī)則:學名=屬名+種名加詞+(首次定名人)+現(xiàn)名定名人和鮮明定名年份 由兩個拉丁字或希臘字或拉丁化了的其
7、它文字組成, 屬名(generic name)為名詞,單數(shù),開頭字母大寫,是該微生 物的主要特征。 種名加詞(specific epithet) (adj.) ,首字小寫,為形容詞,是該微 生物的次要特征。 在出版物中用斜體,書寫時在學名下劃橫線以表示斜體。,2021/4/17,10,例1大腸埃希氏桿菌(簡稱大腸桿菌): Eschericha coli (Migula)Castellani et Chalmers 1919 例2枯草芽孢桿菌(簡稱枯草桿菌): Bacillus subtilis (Ehrenberg)Cohn 1872 例3金黃色葡萄球菌: Staphylococcus aur
8、eus Rosenbach 1884 出現(xiàn)在分類學文獻中的學名,在此兩者之后往往還加上3項內(nèi)容,即首次定名人(正體字,用括號括住)、現(xiàn)名定名人(正體字)和現(xiàn)名定名年份,但一般情況下省去。,2021/4/17,11,林奈氏雙名法,屬名 十 種名加詞 十 (首次命名人) 現(xiàn)命 名人 十 首次命名年份 拉丁字或希臘字或拉丁化了的其他文字組成 首字母大寫 首字母不大寫 名詞 形容詞 主要特征 次要特征 斜體 斜體 (正體) 正體 正體 如Aspergillus niger 曲霉 黑色的 黑曲霉 Streptococcus 鏈條 球狀菌 鏈球菌 在出版物中用斜體,書寫時在學名下劃橫線以表示斜體。,202
9、1/4/17,12,林奈氏三名法: 當某種微生物是一個亞種或變種時,學名就應按三名法拼寫,即在雙名法學名后加寫subsp或var(排正體,用括號括住,可省略),再加亞種或變種的加詞(排斜體,不可省略)。 例1 蘇云金芽孢桿菌蠟螟亞種(或稱蠟螟蘇云金芽孢桿菌):Bacillus thuringiensis (subsp) galleria 例2 釀酒酵母橢圓變種(橢圓釀酒酵母):Saccharomyces cerevisiae (var) ellipsoideus,2021/4/17,13,當前后兩個或多個學名連在一起時,若它們的屬名相同,則相連的一個或幾個屬名可縮寫成一個、兩個或三個字母,并在
10、其后加上一個點。例如,Bacillus(芽孢桿菌屬)可縮寫成“B .”或“Bac .”。 在實際工作中,當菌種的最后鑒定尚未結束,此時其學名中的種名加詞可以先用“sp”(正體,species單數(shù)的縮寫)或“spp”(正體,species復數(shù)的縮寫)來代替。例如,“Bacillus sp.”可譯為“一種芽孢桿菌”,而“Bacillus spp.”則可譯為“若干種芽孢桿菌”或“一批芽孢桿菌”。,2021/4/17,14,2. 俗名(common name): 普通的、通俗的、地區(qū)性的名字,具有簡明和大眾化的優(yōu)點,但往往涵義不夠確切,易于重復,使用范圍局限。 如 綠膿桿菌: 銅綠假單孢菌Pseudo
11、monas aeruginosa 白念菌: 白色假絲酵母Candida albicans 金葡萄: 金黃色葡萄球菌Staphylococcus aureus,2021/4/17,15,三、微生物分類的依據(jù),1. 經(jīng)典分類鑒定依據(jù): 形 態(tài) 特 征:個體形態(tài)(形狀、大小、染色反應等)、群體形態(tài)(菌落特征、在半固體或液體中培養(yǎng)特點等); 生理生化特征:酶、代謝產(chǎn)物(種類、產(chǎn)量、顯色反應等) 、營養(yǎng)要求(能源、碳源、氮源和生長因子等)、細胞壁成分等的測定 生態(tài)特征:微生物間各種相互關系的利用,生長溫度、對氧的要求、宿主的種類等; 遺傳特征:DNA同源性分析 G+C的含量(mol%值) 生活史特點;
12、血清學反應; phage的敏感性; 其它:全細胞蛋白的分析、多位點酶的分析等,2021/4/17,16,生理生化反應特征: 1)、利用營養(yǎng)物質(zhì)的能力:包括對各種碳源、氮源的利用能 力,能量的來源,對生長因子種類和數(shù)量的要求等。 2)、代謝產(chǎn)物的種類和特性:主要測定微生物在生長過程中 產(chǎn)生的某類特殊的生成物。例如在細菌鑒定時常測定被檢 測菌是否產(chǎn)生H2S、吲哚、醇、有機酸,能否還原硝酸鹽 能否使牛奶凝固、胨化等等。 由此產(chǎn)生的生化試驗主要有:糖發(fā)酵實驗、甲基紅試驗(methyl red test,簡稱MR試驗)、乙酰甲基甲醇試驗(VP試驗)、靛基質(zhì)試驗(吲哚試驗)、硫化氫試驗、硝酸鹽還原試驗、過
13、氧化氫酶試驗和氰化鉀生化試驗等。,2021/4/17,17,2. 現(xiàn)代分類依據(jù): 進化的測量指征: 20世紀70年代以前,討論進化主要涉及高等生物,有關微生物進化很少提及。 進化指征的選擇: 形態(tài)學特征: 微生物可利用的形態(tài)特征少;形態(tài)特征在不同類群中進化速度差異大,不準確。 分析和比較生物大分子的結構特征。 以 蛋白質(zhì)、DNA、RNA作為主要指征。,2021/4/17,18, 微生物遺傳型的鑒定: A:DNA堿基比例的測定主要是(G+C)mol%值 B:核酸分子雜交DNA-DNA和DNA-RNA雜交 C:16SrRNA寡核苷酸編目分析 D:氨基酸序列和蛋白質(zhì)分析 F :遺傳重組 真核生物以能
14、否進行有性生殖定義物種。 原核生物發(fā)生轉化、轉導、結合的物種間存在廣泛的染色 體同源性。,2021/4/17,19, 細胞化學成分鑒定: A:細胞壁的化學組成 B:全細胞水解液的糖型: C:磷酸類脂的成分分析: D:枝菌酸的分析: E:醌類的分析: F:氣相色譜技術的應用: 現(xiàn)代分子生物學和免疫學技術的采用 DNA探針、PCR、DNA芯片、酶聯(lián)免疫吸附測定(ELISA) 免疫熒光技術:放射免疫技術;全自動免疫診斷系統(tǒng),2021/4/17,20,核酸探針技術原理:兩條不同來源的核酸鏈如果具有互補的堿基序列,就能夠特異性的結合而成為分子雜交鏈。據(jù)此,將己知核苷酸序列DNA片段用同位素或其他方法標記
15、,加入己變性的被檢DNA樣品中,在一定條件下即可與該樣品中有同源序列的DNA區(qū)段形成雜交雙鏈,從而達到鑒定樣品中DNA的目的,這種能認識到特異性核苷酸序列有標記的單鏈叫DNA分子核酸探針或基因探針。制備核酸探針要注意兩個關鍵性的問題:要選擇特異性強而又無交叉反應的核酸(DNA或RNA)片段,可通過核酸重組和克隆以及人工合成、PCR擴增等技術獲得;其次是標記物,當前常用同位素(32P、125I、 35S等)、光生物素及地高辛(digoxigenin)標記。,2021/4/17,21,核酸探針技術已被用于檢驗食品中一些常見的病原菌。如產(chǎn)腸毒素性大腸桿菌(ETEC)是引起人和動物腹瀉的主要病原之一,
16、在常規(guī)食品的大腸桿菌檢測時,產(chǎn)耐熱腸毒素(ST)的大腸桿菌常用乳鼠試驗來鑒定,該方法操作復雜、耗時多,不適于進行大樣本的檢測,并且 所用增菌方法還常常導致質(zhì)粒相關毒力的喪失。核酸 探針技術特異、敏感而又沒有放射性,且因不需要進行 復雜的增菌和獲得純培養(yǎng)而節(jié)省了時間,減少了由質(zhì)粒 決定的毒力喪失的機會,從而提高了檢測的準確性。 另外在沙門氏菌的檢測中,核酸探針技術也已被廣泛使用。,2021/4/17,22,PCR(Polymerase Chain Reaction)即聚合酶鏈式反應,又稱為無細胞克隆系統(tǒng),是1985年由Mullis創(chuàng)建的一項DNA體外擴增技術。 PCR的全過程由變性(denatu
17、re)、退火(annealing)和延伸(extension)三步組成的若干個循環(huán),每步之間通過溫度的改變來實現(xiàn)轉換。其基本原理是在體外對一特定的雙鏈DNA片段(或稱靶DNA)進行高效擴增。首先將靶DNA雙鏈加熱變性為單鏈,然后加入兩段人工合成的與靶DNA兩端鄰近序列互補的寡核苷酸片段作為引物(primer),即左端引物和右端引物,該對引物與互補的DNA單鏈堿基互補結合后,在有DNA多聚酶和四種dNTPs底物存在的情況下,引物沿模板DNA鏈(靶DNA單鏈)按5 3方向延伸,自動合成新的DNA雙鏈。新合成的DNA雙鏈又可作為擴增的模板,繼續(xù)重復以上的DNA多聚酶鏈反應。在擴增初期,靶DNA分子呈
18、幾何級數(shù)2n (n為循環(huán)次數(shù))增加,隨著循環(huán)次數(shù)增多、模板DNA的不斷增加以及酶分子的逐漸消耗,擴增效率則下降,DNA分子呈線性(1+ x )n(x為DNA分子的實際增長率)增加,經(jīng)過25-35次循環(huán),可將靶DNA序列擴增100萬200萬拷貝。,2021/4/17,23,PCR技術有快速、特異、敏感等特點,因而該技術在食品中致病菌的檢測方面具有很大的應用潛力。如對食品中單核細胞增多癥李氏桿菌的檢測,過去一直缺乏簡單快速的分離鑒定技術,克隆培養(yǎng)的標準方法往往需要3-4周的時間才能得出結果;免疫學技術(如ELISA等)檢測時也存在著特異性、敏感性差等問題。采用PCR技術對食品中李氏桿菌的溶血O-基
19、因進行擴增,結果可在12h內(nèi)完成整個檢測過程,且樣品中只需要含有550個細菌即可被檢出。又如PCR技術能快速地檢出肉食品中的沙門氏菌,檢測的敏感性和特異性均為100%,保證了檢測的準確性。PCR還可用于多種病原微生物的同時檢測或鑒定,它是在同一PCR反應管中同時加上多種病原微生物的特異性引物,進行PCR擴增。可用于同時檢測多種病原體或鑒定出是那一型病原體感染。,2021/4/17,24,基因芯片(gene chip)又稱DNA微陣列(DNA microarray),是指將許多特定的寡居核苷酸片斷或基因片段作為探針,有規(guī)律的排列固定于支持物上形成的DNA分子陣列。芯片與待測的熒光標記樣品的基因按
20、堿基配對原理進行雜交后,在通過激光共聚焦熒光監(jiān)測系統(tǒng)等對其表面進行掃描即可獲取樣品分子的數(shù)量和序列信息。它主要是基于近年來的一種全新的DNA測序方法之一雜交測序法應運而生的。由于該技術同時將大量的探針固定于支持物上,所以可以一次性對大量序列進行檢測和基因分析,解決了傳統(tǒng)的核酸印跡雜交(southern blot 和 northern blot等)操作復雜,操作序列數(shù)量少等缺點?;蛐酒夹g的突出特點在于其高度的并行性、多樣化、微型化和自動化,以及靈敏、高效和低成本等優(yōu)點。,2021/4/17,25,免疫熒光技術,2021/4/17,26,酶聯(lián)免疫吸附測定,2021/4/17,27,四、分類的方
21、法,1. 經(jīng)典分類法:采用雙歧法整理實驗結果 2. 數(shù)值分類法:測定100項以上的各種性狀,利用計算機進行菌株的相互比較,并得出總的相似值。一般認為同種微生物菌株之間的相似值80%。 3. 遺傳分類法:DNA雜交; G+C含量的測定 DNA分子中鳥嘌呤(G)和胞嘧啶(C)所占的摩爾百分比值,即(G+C)mol%=(G+C/A+T+G+C) 100% (熱變性法、浮力密度法等) 。,2021/4/17,28,分類學上目前主要采用較為間接的比較方法核酸分子雜交,來比較不同微生物DNA堿基排列順序的相似性進行微生物的分類鑒定。核酸雜交的具體測定方法很多,按雜交反應的環(huán)境可分為液相雜交和固相雜交兩大類
22、。經(jīng)典的方法是固相濾膜法,它需要放射性同位素。目前最常用的方法則是復性速率法,它不需要放射性同位素,操作簡便,并有較好的重復性。 通過核酸雜交技術可以明確界定細菌種,1987年國際系統(tǒng)細菌委員會規(guī)定,DNA相關性在70%以上,雜交分子的熱解鏈溫度相差小于5作為種的界限。此外對于新菌種或表型性狀差別很小而難以肯定的菌株做出較可靠的判定,并可以修正其他方法的分類和鑒定錯誤。例如,在沙門氏菌屬,在運用了核酸雜交方法后,改變了該屬原來一個血清型一個種的分類狀況。,2021/4/17,29,G+C mol % DNA分子含有四種堿基:腺嘌呤(A)、鳥嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)。雙鏈DNA堿
23、基配對規(guī)律是:A-T和C-G,然而不同的有機體(G+C):(A+T)的摩爾百分比卻各不相同,但不同的有機體的G+C mol %均有較穩(wěn)定的值。該值的含義為:(G+C)/(G+C+A+T)100%。目前,雖然還沒有一個統(tǒng)一的界定各級分類單元的G+C 含量標準,但大量數(shù)據(jù)表明:同一個種內(nèi)的不同菌株的G+C mol %差別應在4%5%以下,同屬不同種的G+C mol %差別應在10%15%以下。因此G+C mol %的測定已成為微生物分類鑒定工作的一個重要部分。測定G+C mol %的方法很多,常用的有熱變性溫度法、浮力密度法和高效液相色譜法。在細菌的分類中,由于熱變性溫度法操作簡單、重復性好而最為
24、常用。,2021/4/17,30,G+C含量的測定 DNA分子中鳥嘌呤(G)和胞嘧 啶(C)所占的摩爾百分比值,即 (G+C)mol%=(G+C/A+T+G+C) 100% (熱變性法、浮力密度法等),2021/4/17,31,數(shù)值分類法,即統(tǒng)計分類法,在200年前M. Adanson(1727-1806,法國植物學家)發(fā)表的分類原理基礎上結合現(xiàn)代計算機技術發(fā)展而來的。 主要觀點: 在一個分類群中,其所含信息量越大,即分類所依據(jù)的性狀越多,其分類效果也越好; 順序建立自然分類單元時,每個性狀都是等權的; 任何兩分類實體間的整體相似性,都是由每一對的相似性計算而來的;能夠由類群間相似性的差異識別
25、不同的分類實體; 如果給予有關進化途徑和機制的某些假定,可以從組群的分類學結構或從性狀相關上作出種系發(fā)生的推論; 分類學應作為一門經(jīng)驗科學來看待和實踐; 數(shù)值分類學是以表象相似性為基礎的。,2021/4/17,32,數(shù)值分類的基本步驟,計算兩菌株間的相似系數(shù) Ssm = SJ = 列出相似度矩陣 將矩陣圖轉換成樹狀圖,a+d a+b+c+d,a a+b+c,2021/4/17,33,2021/4/17,34,五、微生物的鑒定,1. 主要步驟:純化、測定一系列必要的指標、查找權威性鑒定手冊 2. 鑒定技術的不同水平: 細胞的形態(tài)和習性:形態(tài)特征、運動、酶反應、營養(yǎng)要求及生長條件等 細胞組分水平:
26、細胞壁成分、氨基酸庫、脂類、醌類、光合色素等的分析 蛋白質(zhì)水平:氨基酸序列分析、凝膠電泳和血清學反應等 基因或DNA水平:核酸分子雜交(DNA探針. PCR)、(G+C)mol%、轉化和轉導、16S rRNA寡核苷酸族分分析、DNA或RNA核苷酸序列分析等,2021/4/17,35,16S rRNA特點: Woese C.R 之所以于1997年 選擇細菌的核糖體小亞基16SrRNA 核苷酸序列作為研究原核生物系統(tǒng)發(fā)育的工具,是因其具備如下特點: 16SrRNA存在于所有生物中并執(zhí)行相同的功能合成蛋白質(zhì)。 進化相對保守,分子序列變化緩慢,能跨越整個生命進化過程具有生物分子計時器特點,素有細菌“活
27、化石”之稱。 分子中含有進化帶度不同的區(qū)域,可用于進化程度不同的生物之間的系統(tǒng)發(fā)育研究。 16S rRNA非常適合作為研究生物進化和系統(tǒng)發(fā)育的工具。 微生物的16S rRNA可從樣品中直接提取,分析、比較其序列,進而確定其家族樹中位置,克服了傳統(tǒng)微生物學只能研究“可培養(yǎng)”微生物。(許多古細菌目前還不能人工培養(yǎng),也是依據(jù)這種方法分類的。),2021/4/17,36,雙滴蟲(假滴蟲屬),-,生物總系統(tǒng)發(fā)育樹 (根據(jù)16S rRNA 序列比較繪制,引自布氏微生物學 2000),2021/4/17,37,微生物的快速鑒定和自動化分析技術,1.微量生化系統(tǒng)檢測 如商品化的API系統(tǒng) (API-20)、E
28、nterotube等鑒定系統(tǒng)。 2. 快速、自動化微生物檢測儀器和設備: 阻抗測定儀、放射測量儀、微量量熱計、生物發(fā)光測定儀、藥敏測定儀、自動微生物檢測儀。,2021/4/17,38,API系統(tǒng)(Analytab Products Inc),酶作用物和指示劑,(用蒸餾水制備),(塑料板上有20個小杯,于3520、24h 取出觀察顏色, 據(jù)廠方提供的圖表判定 菌株的屬種。) API20E用于腸道菌檢驗; API20A鑒定厭氧菌; API20C鑒定酵母菌 ; API zym鑒定鏈球菌放線菌和胨球菌等。 API50鑒定API20E不能鑒定的菌株。,2021/4/17,39,2021/4/17,40,
29、Enterotube系統(tǒng),分別裝有不同酶作用物和指示劑,該裝置可做下列15種試驗:葡萄糖產(chǎn)酸產(chǎn)氣,賴氨酸和鳥氨酸脫羧酶,硫化氫,靛基質(zhì),乳糖和衛(wèi)矛醇發(fā)酵,苯丙氨酸脫氨酶,尿素酶和檸檬酸鹽,側金盞花醇、阿拉伯糖、山梨醇和V.P試驗等試驗。查閱專門設計的結果判定表。,2021/4/17,41,2021/4/17,42,六、微生物的常用分類系統(tǒng),細菌: 伯杰氏細菌鑒定手冊(第八、第九版)、 伯杰氏系統(tǒng)細菌學手冊(第一版)。普雷沃(法)“細菌分類”。 放線菌:中國科學院微生物研究所編著的放線菌目分科、分屬檢索表??死骼锬峥煞颍ㄇ疤K聯(lián))“細菌放線菌分類手冊”。瓦克斯曼(美)“放線菌分類”。 真菌:Sm
30、ith、 Alexopoulos 、 Ainsworth的分類系統(tǒng),2021/4/17,43,伯杰氏細菌分類系統(tǒng) 伯杰氏細菌鑒定手冊是細菌分類系統(tǒng)的綜合和標準,由美國細菌學家協(xié)會(現(xiàn)稱美國微生物學會)發(fā)起編寫的,最初指定David H.Bergey作為編委會主席,在1923年出版了手冊的第一版,相繼在1925、1930、1934、1939、1948、1957、1994年出版了第二至第九版,成為國際上細菌學家普遍接受和采用。,2021/4/17,44,1994年出版的伯杰氏細菌鑒定手冊第九版幾乎是伯杰氏系統(tǒng)細菌學手冊的縮寫本,除了對細菌各屬關鍵表觀特征描述外,屬內(nèi)種的鑒定特征以表格的形式出現(xiàn)。對
31、于鑒定工作十分方便。鑒定手冊包括35群細菌。,2021/4/17,45,1984-1989年陸續(xù)出版的四卷冊伯杰氏系統(tǒng)細菌學手冊第一版,在著重于表觀特征描述的基礎上,結合化學分類、數(shù)值分類特別是DNA相關性分析,及16S rRNA寡核苷酸編目在生物種群間的親緣關系研究中的應用作了詳細的闡述,體現(xiàn)了細菌分類的研究從表觀向系統(tǒng)發(fā)育體系的發(fā)展。除此,還附有每個菌群的生態(tài)、分離、保藏及鑒定的方法。,2021/4/17,46,原核生物的多相分類,多相分類(polyphasic taxonomy)的概念最初由Colwell 于1970年提出,指利用微生物多種不同的信息,包括表型的、基因型的和系統(tǒng)發(fā)育的信息,綜合起來研究微生物分類和
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