PubMed數(shù)據(jù)庫檢索系統(tǒng)

1、 PubMed數(shù)據(jù)庫的建立維護(hù)機(jī)構(gòu)：NCBI NLM 和NCBI的全稱和中文含義 PubMed的文獻(xiàn)收錄范圍 其對(duì)應(yīng)的光盤數(shù)據(jù)庫（MEDLINE）和印刷型 檢索工具的名稱（醫(yī)學(xué)索引、牙科文獻(xiàn)索引、 國際護(hù)理索引） PubMed檢索方式：主題詞檢索、自由詞檢索、 索引瀏覽檢索、字段限定檢索、邏輯組配檢索、 截詞檢索、強(qiáng)制檢索（短語） PubMed檢索功能界面：基本檢索、主題詞檢 索、期刊瀏覽、引文匹配（單篇引文和多篇引 文）、臨床咨詢。 PubMed不同檢索界面的使用，強(qiáng)調(diào)不同檢索 內(nèi)容在哪個(gè)界面使用。檢索式的組配檢索，檢 索式表達(dá)的內(nèi)容。 PubMed主題詞標(biāo)引所用詞表：MeSH PubMed

2、主題詞加權(quán)檢索的含義（主要主題詞） 和擴(kuò)展檢索的含義（主題詞及下位詞同時(shí)檢索） 檢索結(jié)果中題錄的著錄格式 INDEX MEDCUS MEDLINE (MADLARS on line) 美國國立醫(yī)學(xué)圖書館（National Library of Medicine, NLM）建立并維護(hù)的一個(gè)大型的醫(yī)學(xué)文 獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫。屬于MADLARS 檢索系統(tǒng)中使用頻率最 高的數(shù)據(jù)庫。 Medline 數(shù)據(jù)庫收錄了自1966年以來70多個(gè)國家 40多個(gè)語種的約4，300多種生物醫(yī)學(xué)期刊的題錄 及文摘，其中80%以上為英文文獻(xiàn)，75%-85%含 有文摘。 MEDLINE包括三種索引： 醫(yī)學(xué)索引（Index Medic

3、us）、 牙科文獻(xiàn)索引(Index to Dental Literature)、 國際護(hù)理索引(International Nursing Index)。 MEDLIN數(shù)據(jù)庫涉及內(nèi)容包括：基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨 床醫(yī)學(xué)、護(hù)理學(xué)、口腔科學(xué)、獸醫(yī)學(xué)、衛(wèi)生保健、 營養(yǎng)衛(wèi)生、職業(yè)衛(wèi)生、衛(wèi)生管理等。 MEDLARS MEDLARS （Medical Literature Analysis and Retrieval System），是美國國立醫(yī)學(xué)圖書館建 立的大型生物醫(yī)學(xué)信息檢索系統(tǒng)。于20世紀(jì)60年 代開始提供脫機(jī)檢索服務(wù)，70年代形成了第一個(gè) 聯(lián)機(jī)檢索數(shù)據(jù)庫MEDLARS ON-LINE，首先將 MEDLIN

4、E數(shù)據(jù)庫進(jìn)行了聯(lián)機(jī)檢索，并很快建立 了國際聯(lián)機(jī)檢索系統(tǒng)。 MEDLINE CD n MEDLINE WEB PubMed /pubmed 一、PubMed簡(jiǎn)介 （一） 數(shù)據(jù)庫建立和維護(hù) 美國國立醫(yī)學(xué)圖書館下屬的生物技 術(shù)信息中心（ National Center for Biotechnology Information , NCBI)建立 并維護(hù)。 文獻(xiàn)類型：期刊論文、綜述、以及與 其他數(shù)據(jù)資源鏈接。 特點(diǎn)：提供原文獲取服務(wù) （二）PubMed數(shù)據(jù)庫來源 1MEDLINE 主要收錄1966年至今的文獻(xiàn)。 文獻(xiàn)標(biāo)記中除了有PMID 號(hào)和MEDLINE UI號(hào) 外，還 注有PubMed- ind

5、exed for MEDLINE 的說明。 2 PreMEDLINE 主 要 保 存 處 于 加 工 階 段 的 文 獻(xiàn) （PubMedIn process） 3直接提供的其它文獻(xiàn)記錄 這部分文獻(xiàn)記錄中只有 PubMed識(shí)別碼PMID, 另外還有PubMed in process的說明。 這部分文獻(xiàn)記錄中只有 PubMed識(shí)別碼PMID,另 外還有PubMed - as supplied by publisher的說 明。 u PubMed檢索方式 PubMed主要提供以下幾種檢索方式： 1主題詞檢索。 2自由詞檢索。 3索引詞表檢索。 4字段限定檢索。 二、PubMed檢索功能 Author

6、 address AD Author AU Language LA Journal Title TA EC/RN Number RN MeSH Major Topic MAJR MeSH Subheadings SH MeSH Terms MH Publication Type PT Text Words TW Title TI Title/Abstract TIAB 5組配檢索。 注意：布爾組配符號(hào)ANDAND、OROR、NOT NOT 需 大寫，順序自左到右。 6.6.截詞檢索 transplanttransplant* * 7 7. 強(qiáng)制檢索 短語檢索 “l(fā)iver cancerlive

7、r cancer” u PubMed引文和期刊全文查詢功能 由于PubMed與生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)出版商聯(lián)合，使其作為 檢索引用文獻(xiàn)以及鏈接這些出版商站點(diǎn)，獲取全文數(shù)據(jù)的 一種工具。 1. 1. 引文鏈接 2. 2. 全文鏈接 有收費(fèi)全文、免費(fèi)全文兩種形式。 免費(fèi)全文：出版商直接提供； PMCPMC（PubMed CenterPubMed Center）中心提供 1、基本檢索功能 包括簡(jiǎn)單檢索界面和高級(jí)檢索界面 2、PubMed Tools Single Citation Matcher 單篇引文匹配 Batch Citation Matcher 批引文匹配 Clinical Queries 臨床咨詢

8、 Topic-Specific Queries 特殊主題咨詢 3、More Resources MeSH Database 主題詞數(shù)據(jù)庫 Journals Database 期刊數(shù)據(jù)庫 Clinical Trials 臨床實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)庫 （一）PubMed主要檢索功能 簡(jiǎn)單檢索、高級(jí)檢索、限定檢索 四、PubMed檢索 u PubMed的自動(dòng)轉(zhuǎn)換 PubMed提供詞語的自動(dòng)轉(zhuǎn)換（Automatic Term Mapping）功能。在基本檢索狀態(tài)下，如果 輸入的檢索詞是不加限制的，PubMed利用該功 能，實(shí)現(xiàn)MeSH、刊名、短語的轉(zhuǎn)換和著者的自 動(dòng)轉(zhuǎn)換。通過“Search Details”可查看轉(zhuǎn)

9、換結(jié)果。 轉(zhuǎn)換詞表： MeSH轉(zhuǎn)換表 刊名轉(zhuǎn)換表 短語列表 著者索引表 1. 簡(jiǎn)單檢索（ Go） 簡(jiǎn)單檢索界面允許實(shí)現(xiàn)檢索詞的邏輯組配、截詞 ( (* *) ) 和短語等檢索, ,但邏輯組配需用大寫（ANDAND；OROR； NOTNOT）。 1、bad breath 2、bad breath causes 3、“bad breath” 4、lung cancer AND smok* 輸入作者的姓（last name)和名(first initial)，中 間不用標(biāo)點(diǎn)符號(hào)。 例：alving c 結(jié)果包括Alving CR Alving CJ 等 在該界面，可以進(jìn)行字段檢索、索引檢索；并提 供

10、察看檢索歷史等功能。 Preview ：顯示所輸入檢索式的檢索記錄數(shù)（檢 索歷史 ）； 限定字段 檢索歷史 索引檢索 直接顯示檢索結(jié)果數(shù)量 舉例：檢索近5年嬰幼兒“巨細(xì)胞病毒感染與 聽力損傷”方面文獻(xiàn)。（ cytomegalovirus、 Hearing loss ） 字段限定為“題目摘要” 索引詞表檢索（Index）。 Index：即利用數(shù)據(jù)庫中索引詞表進(jìn)行檢索。 該界面可以對(duì)不同的字段進(jìn)行索引和檢索，并 提供邏輯組配檢索功能。 1、Add to History 功能演示：endometriosis 2、Index：downs syndrom(e) downs syndrom(e) down

11、 syndrom(e) 3、p16 和p53在肝癌中的表達(dá) 對(duì)檢索結(jié)果的限定條件 可以進(jìn)行出版時(shí)間、語種、文獻(xiàn)類型、年齡、 性別等方面的限定，以進(jìn)一步縮小檢索范圍。 進(jìn)行限制后只能檢索medlinemedline中的內(nèi)容，“in in process” and “supplied by publisher”process” and “supplied by publisher”因 還沒有進(jìn)行字段制作，不能檢索到。 一旦勾選了某種限定條件，對(duì)后面的檢索 詞語一直限定，除非取消。 查找近兩年有關(guān)子宮內(nèi)膜異位癥的 綜述文獻(xiàn)。（ endometriosis endometriosis限定在題目摘要字段

12、） 查找近10年發(fā)表在“Obstetrics and gynecology”雜志上的有關(guān)子宮內(nèi)膜異位癥的 臨床試驗(yàn)文獻(xiàn)。 History檢索史 回顧檢索歷史 察看檢索過的所有檢索式 重新編輯組合檢索式進(jìn)行新的檢索 1、在基本檢索界面分別輸入下列詞語并點(diǎn) 擊“Details”察看結(jié)果： bad breath，bad breath causes，“bad breath”，lung cancer AND smok* 2、檢索“p16 在肝癌中的表達(dá)”方面的文 獻(xiàn) 限定 人類，五年，免費(fèi)全文，英文中文 限定和索引綜合應(yīng)用： 嬰幼兒巨細(xì)胞病毒感染與聽力損傷。 （ cytomegalovirus、 Hea

13、ring loss ） 檢索PubMed收錄青島大學(xué)醫(yī)學(xué)院2000年以來 所發(fā)表的文獻(xiàn)。 進(jìn)入方式： 1、在高級(jí)檢索的最下方“More Resources”有鏈 接： 2、在主頁面中“More Resources”有鏈接： 利用MEDLINE主題詞/副主題詞檢索,并可提 供多個(gè)主題詞之間的邏輯組配檢索。 注意： PubMed中的MeSH檢索將查不到references in process 或 the publisher supplied references 中的記錄，因?yàn)檫@些記錄還未標(biāo) 引MeSH詞。 主題詞檢索有時(shí)會(huì)漏檢最新出版、發(fā)表的文獻(xiàn)。 為查找到有關(guān)某一主題的相關(guān)文獻(xiàn)，需要同時(shí) 需

14、采用自由詞和主題詞結(jié)合檢索. 使用該功能可選擇規(guī)范化主題詞、副主題詞、 查看詞義注釋、瀏覽樹狀結(jié)構(gòu)表等 ，可執(zhí)行 主題詞檢索，可以提高檢索效率。 在MeSH Database的檢索框中，輸入檢索詞， 如果不是MeSH詞，系統(tǒng)將提供同義或近義 MeSH給于選擇，同時(shí)顯示MeSH樹。 舉例 P16和P53在肝癌中的表達(dá) （三）臨床咨詢。 是一個(gè)關(guān)于臨床治療、診斷、病因 和預(yù)后四個(gè)方面的臨床文獻(xiàn)查詢界面。 舉例：檢索癲癇(epilepsy)的治療方面的文獻(xiàn)。 （四） 期刊瀏覽檢索。 查詢特定期刊及特定期刊論文的檢索界面。 u點(diǎn)擊主頁面的Journals database按扭。系統(tǒng)轉(zhuǎn)到 期刊數(shù)據(jù)庫首頁

15、界面。 u期刊數(shù)據(jù)庫，可通過刊名全稱、刊名簡(jiǎn)稱 Medline縮寫格式、ISSN號(hào)、刊名中的單個(gè)或 若干個(gè)詞來查找特定的期刊。 u點(diǎn)擊界面中部的links to full-text web sites將列 出與PubMed有全文鏈接的期刊刊名，按字順排 列?？刹檎移诳械奈墨I(xiàn)。 1、基本檢索界面下，刊名可輸入全稱；或 MEDLINE認(rèn)可的標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式；以及ISSN。 如 Molecular biology of the cell 2、利用“Journals database” 3、利用“single citation matcher” 1. 在高級(jí)檢索界面 science 限定字段 Journ

16、al 2. 在期刊檢索界面 science選中 send to search boxsearch 3. 在期刊名字的右邊的 Links 按鈕 點(diǎn)擊 PubMed檢索該刊中的文獻(xiàn) （五）引文匹配 提供通過已知的文獻(xiàn)線索，查詢特定文獻(xiàn)的摘 要、作者、文獻(xiàn)題目等信息。包括單篇引文匹配和 成匹引文匹配兩個(gè)界面。 檢索Tang BK在Biochemical Pharmacology 雜志第29卷第14期上發(fā)表的文章 。 要求： 用單篇引文匹配檢索。 1、期刊檢索 查找在“Adv Cancer Res” 雜志上發(fā)表的文章。 2、引文匹配檢索：要求寫出其他合著者和找到 全文。 Brown BK, et al. Monoclonal antibodies to hosphatidylinositol phosphate neutralize human immunodeficiency virus type 1: role of phosphate-binding subsites. J Virol.