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文檔簡介
1、實驗室常用緩沖液配置方案1)1 M Tris-HCI (pH7.4, 7.6, 8.0)組份濃度:1 M Tris-HCI配制量:1 L配制方法:1. 稱量121.1 g Tris置于1 L燒杯中。2. 加入約800 ml的去離子水,充分?jǐn)嚢枞芙狻?. 按下表量加入濃鹽酸調(diào)節(jié)所需要的pH值。PH值濃HCI7.4約 70mI7.6約 60mI8.0約 42mI4將溶液定容至1 L。5.咼溫咼壓火菌后,室溫保存。注意:應(yīng)使溶液冷卻至室溫后再調(diào)定pH值,因為Tris溶液的pH值隨溫度的變化差異很大,溫度每升高1C,溶液的pH值大約降低0.03個單位。2)10 河E Buffer (pH7.4, 7.
2、6, 8.0)組份濃度:100 mM Tris-HCI, 10 mM EDTA 配制量:1 L配制方法:1.量取下列溶液,置于 1 L燒杯中。1M Tris HCI Buffer ( PH7.4, 7.6, 8.0)100mI500mM EDTA(PH8.0)20mI2. 向燒杯中加入約 800 ml的去離子水,均勻混合。3. 將溶液定容至1 L后,高溫高壓滅菌。4. 室溫保存。3) 1.5 M Tris-HCI (pH8.8)組份濃度:1.5 M Tris-HCI配制量:1 L配制方法:1. 稱量181.7 g Tris置于1 L燒杯中。2. 加入約800 mI的去離子水,充分?jǐn)嚢枞芙狻?.
3、 用濃鹽酸調(diào)節(jié)pH值至8.8。4. 將溶液定容至1 L。5. 咼溫咼壓火菌后,室溫保存。注意:應(yīng)使溶液冷卻至室溫后再調(diào)定pH值,因為Tris溶液的pH值隨溫度的變化差異很大,溫度每升高1C,溶液的pH值大約降低0.03個單位。4) 3 M 醋酸鈉(pH5.2)組份濃度:3M醋酸鈉配制量:100ml配制方法:1稱量40.8g NaAc 3H2O (或者24.6g無水 NaAc)置于100-200ml燒杯中,加入月 40ml的去離子水?dāng)嚢枞芙?加入冰醋酸調(diào)節(jié) pH值至5.23加去離子水將溶液定容至100ml4咼溫咼壓火菌后,室溫保存。5)PBS Buffer組份濃度:137 mM NaCl, 2.
4、7 mM KCl, 10 mM Na2HPO4, 2 mM KH2PO4 配制量:1 L配制方法:1. 稱量下列試劑,置于 1 L燒杯中。NaCl8gKCl0.2gNa2HPO41.42gKH2PO40.27g2. 向燒杯中加入約 800 ml的去離子水,充分?jǐn)嚢枞芙狻?. 滴加濃鹽酸將pH值調(diào)節(jié)至7.4,然后加入去離子水將溶液定容至1 L。4. 咼溫咼壓火菌后,室溫保存。注意:上述PBS Buffer中無二價陽離子,如需要,可在配方中補(bǔ)充1 mM CaCI2和0.5 mMMgCI2。6) 10 M醋酸銨組份濃度:10 M醋酸銨配制量:100 ml配制方法:1. 稱量77.1 g醋酸銨置于10
5、0200 ml燒杯中,加入約30 ml的去離子水?dāng)嚢枞芙狻?. 加去離子水將溶液定容至100 ml。3. 使用0.22 mm濾膜過濾除菌。4. 密封瓶口于室溫保存。注意:醋酸銨受熱易分解,所以不能高溫高壓滅菌。7) 苯酚/氯仿/異戊醇(25 : 24 : 1)配制方法:1. 說明:從核酸樣品中除去蛋白質(zhì)時常常使用苯酚/氯仿/異戊醇(25 : 24 : 1)。氯仿可使蛋白質(zhì)變性并有助于液相與有機(jī)相的分離,而異戊醇則有助于消除抽提過程中出現(xiàn)的氣泡。2. 配制方法:將Tris-HCl平衡苯酚與等體積的氯仿/異戊醇(24 : 1)混合均勻后,移入棕色 玻璃瓶中4C保存。8) 10% (W/V) SDS
6、 組份濃度: 10 (W/V)SDS 配制量: 100ml 配制方法:1稱量10g高純度的SDS置于100-200ml燒杯中,加入約 80ml的去離子水,68C加入溶解2. 滴加濃鹽酸調(diào)節(jié) pH 值至 7.23將溶液定容至100ml后,室溫保存。9) 2 N NaOH 組份濃度: 2 N NaOH配制量: 100 ml配制方法:1. 量取80 ml去離子水置于100200 ml塑料燒杯中(NaOH溶解過程中大量放熱,有可能 使玻璃燒杯炸裂 ) 。2. 稱取8 g NaOH小心地逐漸加入到燒杯中,邊加邊攪拌。3待NaOH完全溶解后,用去離子水將溶液體積定容至100 ml。4. 將溶液轉(zhuǎn)移至塑料容
7、器中后,室溫保存。10) 2.5 N HCl組份濃度:2.5 N HCl配制量: 100 ml配制方法:1. 在78.4 ml的去離子水中加入 21.6 ml的濃鹽酸(11.6 N),均勻混合。2. 室溫保存。11) 5 M NaCl組份濃度: 5 M NaCl配制量: 1 L配制方法:1. 稱取 292.2 g NaCl 置于 1 L 燒杯中,加入約 800 ml 的去離子水后攪拌溶解。2. 加去離子水將溶液定容至 1 L 后,適量分成小份。3. 高溫高壓火菌后,4C保存。11 ) 20 (W/V) Glucose 組份濃度: 20 (W/V) Glucose配制量: 100 ml配制方法:
8、1. 稱取 20 g Glucose 置于 100200 ml 燒杯中,加入約 80 ml 的去離子水后,攪拌溶解。2. 加去離子水將溶液定容至 100 ml 。3. 高溫高壓火菌后,4C保存。12) Solution 1(質(zhì)粒提取用)組份濃度:25 mM Tris-HCI ( pH8.0), 10 mM EDTA, 50 mM Glucose 配制量:1 L配制方法:1. 量取下列溶液,置于1 L燒杯中。1M Tris-HCl (PH8.0)25ml0.5M EDTA ( PH8.0)20ml20% Glucose (1.11M )45mldH2O910ml2. 咼溫咼壓火菌后,4C保存。3
9、. 使用前每 50 ml 的 Solution I 中加入 2 ml 的 RNase A ( 20 mg/ml)。13) Solution 11(質(zhì)粒提取用)組份濃度:200mM NaOH , 1% (W/V)SDS 配制量:500ml配制方法:1量取下列溶液,置于 500ml燒杯中10% SDS 50ml2N NaOH 50ml2加滅菌水定容至 500ml,充分混勻3室溫保存,此溶液保存時間最好不要超過一個月 注意:SDS易產(chǎn)生氣泡,不要劇烈攪拌14) Solution 111(質(zhì)粒提取用)組份濃度:3 M KOAc, 5 M CH3COOH 配制量:500 ml配制方法:1.稱量下列試劑,
10、置于 500 ml燒杯中。KOAc147gCH3COOH57.5ml2. 加入300 ml去離子水后攪拌溶解。3. 加去離子水將溶液定容至 500 ml。4. 高溫高壓火菌后,4C保存。15) 0.5 M EDTA(pH8.0)組份濃度:0.5 M EDTA配制量:1 L配制方法:稱取 186.1 g Na2EDTA-2H2O,置于 1 L 燒杯中。2. 加入約800 ml的去離子水,充分?jǐn)嚢琛?. 用 NaOH 調(diào)節(jié) pH 值至 8.0 (約 20 g NaOH)。 注意: pH 值至 8.0 時, EDTA 才能完全溶解。4. 加去離子水將溶液定容至1 L 。5. 適量分成小份后,高溫高壓
11、滅菌。6. 室溫保存。16) 1 M DTT 組份濃度: 1 M DTT 配制量: 20 ml 配制方法:1. 稱取 3.09 g DTT ,加入到 50 ml 塑料離心管內(nèi)。2. 加20 ml的0.01 M NaOAc (pH5.2),溶解后使用 0.22 mm濾器過濾除菌。3. 適量分成小份后,-20 C保存。17) 10 mM ATP組份濃度: 10 mM ATP配制量: 20 ml配制方法:1. 稱取121 mg Na2ATP 3H2O,加入到50 ml塑料離心管內(nèi)。2. 力口 20 ml 的 25 mM Tris-HCI (pH8.0),攪拌溶解。3. 適量分成小份后,-20 C保存
12、。一.常用貯液與溶液1mol/L亞精胺(Spermidine):溶解2.55g亞精胺于足量的水中,使終體積為10ml。分裝成小份貯存于-20 C。1mol/L精胺(Spermine):溶解3.48g精胺于足量的水中,使終體積為10ml。分裝成小份貯存于-20 C。10mol/L乙酸胺(ammonium acetate):將77.1g乙酸胺溶解于水中,加水定容至1L后,用0.22um 孔徑的濾膜過濾除菌。10mg/ml牛血清蛋白(BSA ):加100mg的牛血清蛋白(組分V或分子生物學(xué)試劑級,無DNA酶)于 9.5ml 水中(為減少變性,須將蛋白加入水中,而不是將水加入蛋白) ,蓋好蓋后,輕輕搖
13、動,直至牛血清蛋白完全溶 解為止。不要渦旋混合。加水定容到10ml,然后分裝成小份貯存于-20Co1mol/L二硫蘇糖醇(DTT ):在二硫蘇糖醇5g的原裝瓶中加32.4ml水,分成小份貯存于-20 C。 或轉(zhuǎn)移 100mg 的二硫蘇糖醇至微量離心管,加 0.65ml 的水配制成 1mol/L 二硫蘇糖醇溶液。8mol/L乙酸鉀(potassium acetate):溶解78.5g乙酸鉀于足量的水中,加水定容到100ml。1mol/L氯化鉀(KCl):溶解7.46g氯化鉀于足量的水中,加水定容到100ml。3mol/L乙酸鈉(sodium acetate):溶解40.8g的三水乙酸鈉于約 90
14、ml水中,用冰乙酸調(diào)溶液 的 pH 至 5.2,再加水定容到 100ml。0.5mol/L EDTA:配制等摩爾的 Na2EDTA和NaOH溶液(0.5mol/L ),混合后形成 EDTA的三 鈉鹽。或稱取 186.1g的Na2EDTA 2H2O和20g的NaOH,并溶于水中,定容至 1L。1mol/L HEPES :將 23.8gHEPES 溶于約 90ml 的水中,用 NaOH 調(diào) pH (6.8-8.2),然后用水 定容至 100ml 。1mol/L HCl :加 8.6ml 的濃鹽酸至 91.4ml 的水中。25mg/ml IPGT :溶解250mg的IPGT (異丙基硫代-0D-半乳
15、糖苷)于10ml水中,分成小份 貯存于-20 C。1mol/LMgCI2:溶解20.3g MgCI2 6H2O于足量的水中,定容到100ml。100mmol/L PMSF :溶解174mg的PMSF (苯甲基磺酰氟) 于足量的異丙醇中, 定容到10ml。 分成小份并用鋁箔將裝液管包裹或貯存于-20Co20mg/ml蛋白酶 K (proteinase K):將200mg的蛋白酶 L加入到9.5ml水中,輕輕搖動,直 至蛋白酶K完全溶解。不要渦旋混合。加水定容到10ml,然后分裝成小份貯存于-20Co10mg/mlRnase (無 DNase) (DNase free RNase):溶解 10mg
16、 的胰蛋白 RNA 酶于 1ml 的 10mmol/L的乙酸鈉水溶液中(pH 5.0) o溶解后于水浴中煮沸 15min,使DNA酶失活。用 1mol/L的Tris HCl調(diào)pH至7.5,于-20 C貯存。(配制過程中要戴手套)5mol/L氯化鈉(NaCl):溶解29.2g氯化鈉于足量的水中,定容至100ml。10N氫氧化鈉(NaOH ):溶解400g氫氧化鈉顆粒于約 0.9L水的燒杯中(磁力攪拌器攪拌), 氫氧化鈉完全溶解后用水定容至1L o10% SDS(十二烷基硫酸鈉):稱取100gSDS慢慢轉(zhuǎn)移到約含 0.9L的水的燒杯中,用磁力攪 拌器攪拌直至完全溶解。用水定容至1L o2mol/L
17、山梨(糖)醇(Sorbitol ):溶解36.4g山梨(糖)醇于足量水中使終體積為100ml。100%三氯乙酸(TCA ):在裝有500gTCA的試劑瓶中加入100ml水,用磁力攪拌器攪拌直 至完全溶解。(稀釋液應(yīng)在臨用前配制)2.5% X gal (5-溴-4-氯-3-吲哚一3半乳糖苷):溶解25mg的X gal于1ml的二甲基甲酰 胺(DMF ),用鋁箔包裹裝液管,貯存于 -20Co100 Denhardt 試劑(Denhardts regent)成分及終濃度配制100ml溶液各成分的用量2 %聚蔗糖(Ficoll , 400 型)2%聚乙烯吡咯烷酮(PVP-40)2% BSA (組分 V
18、)水2g2g2g加水至總體積為100ml依照上表稱取各組分,溶于水中定容。過濾除菌及雜質(zhì),分裝成小份于-20 C貯存。10 標(biāo)準(zhǔn)DNA連接酶緩沖液(standard DNA ligase buffer )(粘端、平端連接)成分及終濃度配制10ml溶液各成分的用量0.5mol/L Tris-HCl100mmol/L MgCl2100mmol/L DTT2mmol/L ATP5mmol/L鹽酸亞精胺(可選)0.5mg/ml BSA (組分 V)(可選) 水5ml 1mol/L 貯液1ml 1mol/L 貯液1ml 1mol/L 貯液200ul 100 mmol/L 貯液 50ul 1 mmol/L
19、 貯液 0.5ml 10 mg/mL 貯液 2.25ml將配制好的緩沖液分裝成小份,貯存于-20 C o100 mmol/L dNTP 溶液(dNTP solutions )可以購買到100mmol/L純dNTPs貯液,-80C可貯存至少 6個月。10mmol/L dNTP 混合液成分及終濃度配制20ul溶液各成分的用量10mmol/L dATP2ul 100 mmol/L dATP 貯液10mmol/L dCTP2ul 100 mmol/L dCTP 貯液10mmol/L dGTP10mmol/L dTTP 水2ul 100 mmol/L dGTP 貯液2ul 100 mmol/L dTTP
20、 貯液 12ul20% PEG 8000/2.5M NaCI成分及終濃度配制10ml溶液各成分的用量質(zhì)量濃度為20%聚乙二醇2.5mol/L氯化鈉水20g50ml 5 mol/L 氯化鈉 或14.6g固體氯化 鈉補(bǔ)足100ml加聚乙二醇于含有氯化鈉的燒杯中,加水至終體積100ml,用磁力攪拌器攪拌溶解。20 SSC成分及終濃度配制1L溶液各成分的用量300mmol/L檸檬酸三鈉(二 水)3mol/L氯化鈉水88.2g175.3g 補(bǔ)足1L溶解檸檬酸三鈉(二水)和氯化鈉于約0.9L水中,加幾滴10N NaOH溶液調(diào)pH為7.0,用水補(bǔ)足體積至1L。DEPC (焦碳酸二乙酯)處理水加100ul D
21、EPC于100ml水中,使DEPC的體積分?jǐn)?shù)為 0.1%。在37C溫浴至少12h,然后 在15 psi條件下高壓滅菌 20min,以使殘余的 DEPC失活。DEPC會與胺起反應(yīng),不可用 DEPC處理Tris緩沖液。甲酰胺(deionized formamide )直接購買或加 Dowex XG8混合樹脂于裝有甲酰胺的玻璃燒杯中,用磁力攪拌器輕輕攪拌1h,可去除甲酰胺中的離子。經(jīng)Whatman 1號濾紙過濾除去樹脂后分成小份,充氮氣于-80 C貯存(防止氧化)。磷酸緩沖液(phosphate buffer)按照下表所給定的體積,混合1 mol/L的磷酸二氫鈉(單堿)和1mol/L磷酸氫二鈉(雙堿
22、)貯液,獲得所需 pH的磷酸緩沖液。配制 1 mol/L的磷酸二氫鈉(NaH2PO4 H2O)貯液: 溶解138g于足量水中,使終體積為1L;1mol/L磷酸氫二鈉(Na2HPO4 )貯液:溶解142g于足量水中使終體積為 1L。1mol/L磷酸二氫鈉(ml)1mol/L磷酸氫二鈉(ml)最終pH值8771236.08501506.18151856.27752256.37352656.46853156.56253756.65654356.75104906.84505506.93906107.03306707.12807207.2TE (用于懸浮和貯存 DNA )成分及終濃度配制100ml溶液各
23、成分的用量10mmol/L Tris HCl1mmol/L EDTA水1ml 1mol/L Tris-HCl ( pH7.4-8.0 , 25 C)200ul 0.5 mol/L EDTA ( pH 8.0 )98.8mlTris 緩沖液(Tris-HCI buffer )將121g的Tris堿溶解于約0.9L水中,再根據(jù)所要求的pH (25C下)加一定量的濃鹽酸(11.6N),用水調(diào)整終體積至 1L。濃鹽酸的體積(ml)pH8.69.0148.8218.628.58.4388.2468.0567.8667.671.37.4767.2二.電泳緩沖液、染料和凝膠加樣液 電泳緩沖液50 XTris
24、-乙酸(TAE)緩沖液成分及終濃度配制1L溶液各成分的用量2mol/L Tris 堿 1mol/L乙酸100 mmol/L EDTA 水242g57.1 ml 的冰乙酸(17.4 mol/L )200ml 的 0.5 mol/L EDTA ( pH 8.0) 補(bǔ)足1L5 XTris-硼酸(TBE)緩沖液成分及終濃度配制1L溶液各成分的用量445 mmol/L Tris 堿445 mmol/L硼酸鹽10 mmol/L EDTA水54g27.5g硼酸20 ml 的 0.5 mol/L EDTA ( pH 8.0) 補(bǔ)足1L染料1%溴酚藍(lán)(bromophenol blue )加1g水溶性鈉型溴酚藍(lán)于
25、100ml水中,攪拌或渦旋混合直到完全溶解。1%二甲苯青 FF (xyle ne cyan ole FF )溶解1g二甲苯青FF于足量水中,定容到 100ml。10mg/ml 的溴化乙錠(ethidium bromide )小心稱取1g溴化乙錠,轉(zhuǎn)移到廣口瓶中,加100ml水,用磁力攪拌器攪拌直到完全溶解。用鋁箔包裹裝液管,于 4C貯存。凝膠上樣液(gel loading solutions )6 堿性凝膠上樣液(室溫貯存)成分及終濃度配制10ml溶液各成分用量0.3 N氫氧化鈉6 mmol/L EDTA18%聚蔗糖(400型)0.15 %溴甲酚綠0.25 %二甲苯青FF水300ul 10N氫
26、氧化鈉120ul 0.5mol/L EDTA (pH8.0)1.8g15mg25mg 補(bǔ)足到10ml6 聚蔗糖凝膠上樣液(室溫貯存)成分及終濃度配制10ml溶液各成分用量0.15 %溴酚藍(lán)0.15 %二甲苯青FF5 mmol/L EDTA15%聚蔗糖(400型) 水1.5ml 1 %溴酚藍(lán)1.5ml 1 %二甲苯青 FF100ul 0.5mol/L EDTA (pH8.0)1.5g 補(bǔ)足到10ml6 x溴酚藍(lán)/二甲苯青/聚蔗糖凝膠上樣液(室溫貯存)成分及終濃度配制10ml溶液各成分用量0.25 %溴酚藍(lán)0.25 %二甲苯青FF15%聚蔗糖(400型) 水2.5ml 1 %溴酚藍(lán)2.5ml 1
27、%二甲苯青 FF1.5g 補(bǔ)足到10ml6 甘油凝膠上樣液(4 C貯存)成分及終濃度配制10ml溶液各成分用量0.15 %溴酚藍(lán)0.15 %二甲苯青FF5 mmol/L EDTA50%甘油水1.5ml 1 %溴酚藍(lán)1.5ml 1 %二甲苯青 FF100ul 0.5mol/L EDTA (pH8.0)3ml3.9ml6 蔗糖凝膠上樣液(室溫貯存)成分及終濃度配制10ml溶液各成分用量0.15 %溴酚藍(lán)0.15 %二甲苯青FF5 mmol/L EDTA40 %聚蔗糖 水1.5ml 1 %溴酚藍(lán)1.5ml 1 %二甲苯青 FF100ul 0.5mol/L EDTA (pH8.0)4g 補(bǔ)足到10ml
28、10 十二烷基硫酸鈉/甘油凝膠上樣液(室溫貯存)成分及終濃度配制10ml溶液各成分用量0.2 %溴酚藍(lán)0.2 %二甲苯青FF200 mmol/L EDTA0.1 % SDS50%甘油20mg20mg4ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)100ul 10 % SDS5ml水補(bǔ)足到10ml二.常用培養(yǎng)基I D拉關(guān)苴LB培養(yǎng)基將下列組分溶解在 0.9L水中:蛋白胨10g酵母提取物5g氯化鈉10g如果需要用1N NaOH (1ml)調(diào)整pH至7.0,再補(bǔ)足水至1L。注:瓊脂平板需添加瓊脂 粉12g/L,上層瓊脂平板添加瓊脂粉 7g/L。SOB培 養(yǎng)基將下列組分溶解在 0.9L水中:蛋白胨20
29、g酵母提取物5g氯化鈉0.5g1 mol/L氯化鉀2.5ml用水補(bǔ)足體積到1L。分成100ml的小份,高壓滅菌。培養(yǎng)基冷卻到室溫后,再在每 100ml 的小份中加1ml滅過菌的1mol/L氯化鎂。SOC培 養(yǎng)基成分、方法同SOB培養(yǎng)基的配制,只是在培養(yǎng)基冷卻到室溫后,除了在每100ml的小份中加1ml滅過菌的1mol/L氯化鎂外,再加2ml滅菌的1mol/L葡萄糖(18g葡萄糖溶于足夠水 中,再用水補(bǔ)足到 100ml,用0.22um的濾膜過濾除菌)。TB 培養(yǎng)基將下列組分溶解在 0.9L水中:蛋白胨12g酵母提取物24g甘油4ml各組分溶解后高壓滅菌。冷卻到 60C,再加100ml滅菌的170mmol/L KH2PO4/0.72 mol/L K2HPO4的溶液(2.31g的KH2PO4和12.54gK2HPO4溶在足量的水中, 使終體積為100ml。 高壓滅菌或用0.22um的濾膜過濾除菌)。2 YT 培 養(yǎng)基將下列組分溶解在 0.9L水中:蛋白胨16g酵母提取物10g氯化鈉4ml如果需要用1N NaOH (1ml)調(diào)整pH至7.0,再補(bǔ)足水至1L。注:瓊脂平板需添加瓊脂 粉12g/L,上層瓊脂平板添加瓊脂粉7g/L。YPD培 養(yǎng)基將下列組分溶解在 0.9L水中:蛋白胨20g酵母
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