醫(yī)學(xué)研究的數(shù)據(jù)管理與分析——第七章

1、第七章 EpiData軟件應(yīng)用Dbase, FoxBase，Visual FoxPro，Lotus23? ?456EpiData軟件概述 EpiData是一個關(guān)于數(shù)據(jù)錄入和管理的程序 目的:是教會普通用戶如何將一張調(diào)查表“計算機化”，使得數(shù)據(jù)輸入和管理工作變得容易。 基本設(shè)計思想:幫助用戶根據(jù)調(diào)查表信息建立數(shù)據(jù)庫供以后統(tǒng)計分析使用。 EpiData的基本功能:包括調(diào)查表文件的建立、數(shù)據(jù)的錄入、核對和數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)入、轉(zhuǎn)出等。使用該軟件可使數(shù)據(jù)錄入和管理變得形象、直觀、容易。一、EpiData的設(shè)計 設(shè)計者：丹麥的Jens M、Michael Bruus和英國的Mark Myatt 編程者：丹麥的Mi

2、chael Bruus 開發(fā)思路和原理：Epi Info 6.0二、軟件下載和登記注冊 下載地址：http:/www.epidata.dk/ download.htm三、版本信息 EpiData 1.5（2001年2月22日）；EpiData 2.1a（2002年） EpiData 3.02（2004）； EpiData 3.10（NOW）四、安裝和系統(tǒng)要求 可在Windows 95/98/NT/2000/XP版本操作系統(tǒng)下運行 3.02和3.10版直接安裝中文程序即可。7EpiData軟件概述uEpiData軟件安裝如同拷貝程序文檔一樣簡單。例如，它可以從U盤運行，并且占用內(nèi)存很?。?.5M

3、）。u由于捐助和志愿者的工作，軟件免費免費發(fā)布。8EpiData軟件概述EpiData程序下載與安裝 http:/www.epidata.dk/9EpiDataEpiData程序下載與安裝程序下載與安裝10數(shù)據(jù)分析EpiData程序下載與安裝11數(shù)據(jù)錄入EpiData 軟件 EpiData 軟件是在吸收 DOS版的Epi Info 6.0 軟件優(yōu)點基礎(chǔ)上開發(fā)研制的 Windows版軟件。12EpiData 軟件 它一方面吸收了Epi Info軟件的長處，同時又極具自身特色。 與 視窗版Epi Info軟件相比，占用空間小，更加簡單易學(xué)，且界面友好，可以很方便的對數(shù)據(jù)進行儲存、核對和管理等，13

4、Epidata軟件分為兩個模塊 EpiData Entry用于數(shù)據(jù)錄入與數(shù)據(jù)管理 EpiData Analysis用于基本的統(tǒng)計描述/分析與制圖。14用EpiData軟件進行數(shù)據(jù)錄入和管理，將產(chǎn)生三種基本的文件； 每種文件具有固定的后綴，在數(shù)據(jù)錄入和管理中發(fā)揮不同作用。（1）調(diào)查表文件：后綴為.QES。通過建立調(diào)查表文件，系統(tǒng)根據(jù)特定規(guī)則自動定義數(shù)據(jù)文件的結(jié)構(gòu)，包括變量名、變量類型和長度等，用于數(shù)據(jù)錄入。（2）數(shù)據(jù)文件：后綴為.REC。數(shù)據(jù)文件包含錄入的數(shù)據(jù)信息以及已經(jīng)定義好的編碼，用于數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析。（3）核對文件：后綴為.CHK。通過建立核對文件，系統(tǒng)將定義數(shù)據(jù)錄入的有效性規(guī)則。EpiDa

5、ta Entry 的文件組成15 EpiData數(shù)據(jù)管理和輸入流程數(shù)據(jù)管理和輸入流程 建立調(diào)查表文件創(chuàng)建數(shù)據(jù)庫建立核查文件錄入數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)庫管理輸出數(shù)據(jù)2007年8月0、設(shè)計“問卷”1.建立調(diào)查表文件*.QES2、創(chuàng)建數(shù)據(jù)庫*.QES*.REC3、建立核查文件*.QES*.REC*.CHKquestionnairerecordcheck4、錄入數(shù)據(jù)*.QES*.REC*.CHK2007年8月2007年8月EpiData 要求要求 理論上，EpiData程序?qū)︿浫氲挠涗洈?shù)沒有限制。而實際應(yīng)用中，記錄數(shù)最好不要超過200,000300,000。 在設(shè)計錄入界面時整個錄入界面不能超過999行。 對數(shù)值或

6、字符串編碼進行解釋的文字長度最多80 個字符。 編碼長度最多為30 個字符。25EpiDataEpiData Entry Entry 的特點的特點 調(diào)查表設(shè)計便捷調(diào)查表設(shè)計便捷 數(shù)據(jù)核查功能強大且實現(xiàn)簡便數(shù)據(jù)核查功能強大且實現(xiàn)簡便 與調(diào)查表形式一致的可視數(shù)據(jù)錄入界面與調(diào)查表形式一致的可視數(shù)據(jù)錄入界面 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換功能強大數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換功能強大 26EpiData Analysis的特點的特點EpiData Analysis 用于對EpiData Entry生成的數(shù)據(jù)文件進行初步整理和分析，如，描述性統(tǒng)計（Describe）、頻數(shù)分析(Freq)、平均數(shù)分析(Means)、列聯(lián)表分析(TablesEpiT

7、ables)、相關(guān)分析(Correlate)、回歸分析(Regress)、秩和檢驗（kwallis）等。可以繪制統(tǒng)計圖形，如，散點圖（Scatter diagram）、 線圖 （Line graph）、 直方圖 （Histogram）、直條圖（Bar graph）、 箱式圖（Box plot）、餅圖 （Pie graph）等。27EpiData主界面簡介主界面簡介 菜單欄工具欄按鈕欄工作區(qū)狀態(tài)欄29編輯過程工具條工具欄數(shù)據(jù)表預(yù)覽粘貼字段編輯器編碼編輯器30Epidata使用前的準(zhǔn)備Epidata語言設(shè)置解決編碼器調(diào)查表中亂碼問題“生成變量名”選項設(shè)置相關(guān)文件默認打開程序Epidata正式開始使

8、用調(diào)查表文件的建立數(shù)據(jù)文件： 原始數(shù)據(jù) 文件結(jié)構(gòu)（庫結(jié)構(gòu)） 字段名 字段類型 字段長度 調(diào)查表信息 數(shù)據(jù)文件371.建立調(diào)查表文件（1）新建調(diào)查表文件NEWNew. QES file建立調(diào)查表文件有以下三種方法：建立調(diào)查表文件有以下三種方法：第一種：在菜單中，點擊 “文件”（File）“生成調(diào)查表文件QES文件”第二種：在工作欄的工作流程中，點擊“1. 打開文件”（1.Define Data）“建立新QES文件”第三種：在按鈕欄中，點擊 ,這時窗口中會在工作區(qū)顯示一個空白的文檔，你可以在此文檔中鍵入調(diào)查表內(nèi)容和框架，編輯完成后，將調(diào)查表文件保存，文件的擴展名統(tǒng)一為.QES。391.建立調(diào)查表文

9、件（2）保存調(diào)查表文件Save1.建立調(diào)查表文件（2）保存調(diào)查表文件1.建立調(diào)查表文件（3）調(diào)查表中文件結(jié)構(gòu)調(diào)查表中文件結(jié)構(gòu)43 文件結(jié)構(gòu)文件結(jié)構(gòu): 字段名字段名 字段類型字段類型 字段長度字段長度 文件名文件名假定現(xiàn)有一調(diào)查表如下，如何建立.QES文件？調(diào)查表調(diào)查表姓名：姓名：_性別：（性別：（1）男）男 （2）女）女身高：身高：_._ CM出生日期：出生日期：_年年_月月_日日44如果按原調(diào)查表格式直接建立數(shù)據(jù)如果按原調(diào)查表格式直接建立數(shù)據(jù)庫，結(jié)果會怎樣？庫，結(jié)果會怎樣？45必須定義字段名和字段類型必須定義字段名和字段類型字段類型字段類型字段編碼字段編碼自動ID號數(shù)字# # .#文本_加密

10、字段大寫文本邏輯（是/否）日期自動插入日期聲音提示46調(diào)用字段編輯器：第一種方法：直接按CTRL-Q鍵。第二種方法：在編輯器工具條上點擊字段編輯器圖標(biāo)。手工輸入或使用字段編輯器471.建立調(diào)查表文件（4）定義字段名定義字段名變量名第一個字符一定為字母（變量名第一個字符一定為字母（A-Z）之后可含字母（之后可含字母（A-Z)和數(shù)字（和數(shù)字（09）變量名最多變量名最多10個字符個字符變量名不能是中文變量名不能是中文姓名姓名_性別性別#變量標(biāo)簽變量標(biāo)簽字段名字段名變量編碼變量編碼定義字段名（定義字段名（Field NamesField Names） 以調(diào)查表中字段的第一個詞命名（First word

11、 in question is field names） 使用 內(nèi)的內(nèi)容自動添加字段名（Automatic field names）49定義字段名（定義字段名（Field NamesField Names） “文件”（File）“選項”（Option）“生成REC文件”（Create data file） 在“如何生成字段名”（How to generate field names）中選擇字段的命名方式。50用輸入字段左面的文本的第一個單詞作為輸入字段名。如果這個單詞超過8個字符就使用前8個字符作為字段名。 例如：v1 Enter age of patient # “v1”。 又如：Enter

12、 age of patient # “Enter” 如果一個字段名已被使用，再出現(xiàn)時會增加一個數(shù)字作為字段名。 例如：在一個調(diào)查表中有下列行： v1 Enter age of patient # “v1” v1 Height of patient # “v2”以調(diào)查表的第一個詞作為字段名以調(diào)查表的第一個詞作為字段名51“更新問題為實際文件名更新問題為實際文件名”如果未勾選如果未勾選52預(yù)覽顯示的并非預(yù)覽顯示的并非真實的字段名真實的字段名如如“姓名姓名”, 真實的字真實的字段名是段名是FIELD15354EpiData將根據(jù)字段的“問題”（即輸入字段左面的文本）自動產(chǎn)生一個字段名，字段名是以英文

13、字母（A-Z）開始，最長8個英文字符。其它國際字符將被跳過。字段名的產(chǎn)生從字段“問題”字母開始。使用使用 的內(nèi)容自動添加字段名的內(nèi)容自動添加字段名What did you doWhat did you do？_55在普通文本中優(yōu)先選擇“ ”括進的文本。如果問題是my firstfield?那末字段名將為MYFIELD；如果問題是“姓名name？”，產(chǎn)生的字段名為name。通用常見單詞不予考慮（即What？ Who？If？etc.）。What did you do？產(chǎn)生的字段名為YOUDO。如果字段前沒有“問題”文本，字段名就取前一個字段名再加上一個數(shù)字。如果前一個字段名是dMY字段，那末下一個

14、字段（如果沒有“問題”文本）就是dMY1。如果前一個字段是dV31，則下一個字段名就是dV32。如果不存在前一個字段名則使用隱含字段名FIELD1。如果第一個字符是數(shù)字則在第一個字符前插入一個字母N。例如 3 little mice？產(chǎn)生的字段名為N3LITTLE。自動添加字段名基本規(guī)則自動添加字段名基本規(guī)則56按 命名規(guī)則修改調(diào)查表，然后預(yù)覽生成REC文件57別忘了修改別忘了修改“選項選項”，否則否則會是這樣的581.建立調(diào)查表文件（5）字段）字段類型變量編碼類型變量編碼Field Pick List變量標(biāo)簽變量標(biāo)簽字段名字段名變量編碼變量編碼字段類型介紹字段類型介紹數(shù)值型字段：#，#.#

15、；僅接受數(shù)字和空格，不輸按空格處理，分析時作缺失值處理，以“.”顯示。數(shù)字位數(shù)由“#”個數(shù)決定，小數(shù)位數(shù)由小數(shù)點右邊的“#”個數(shù)確定。最長可達14位，小數(shù)點按1個字符計算。60文本型字段：包括三種。一種是常用的文本（或下劃線、或底線）型字段：_；該型字段由連續(xù)下劃線來定義，長度由下劃線字符個數(shù)決定，最大值為80，空白字段（字段內(nèi)容空缺）時，數(shù)據(jù)管理時將按缺失值處理。另一種為大寫文本型字段：。61日期型字段：包括兩種。一種為常用日期字段：、，分美式、英式兩種，輸入時即進行合法性檢驗；只需輸入日期，系統(tǒng)自動插入斜杠。另一種為自動日期型字段：、 ；儲存或修改數(shù)據(jù)時該字段自動輸入系統(tǒng)日期，如系統(tǒng)日期正

16、確，也即當(dāng)天日期。62自動ID號型字段：；這是一種專用字段，用作記錄識別號，文件的第一個記錄為1，以后記錄自動賦值順次較前增加1，并自動保證編號的唯一性。輸入數(shù)據(jù)時光標(biāo)跳過此字段。如需使第一個記錄號大于1，則可在“文件”菜單“選擇項”中的“高級設(shè)置”中設(shè)置。邏輯型字段（即布爾函數(shù)型字段）：；只接受Y、N、空格或回車鍵。后兩者作缺失值處理。Y、N字符輸入后即轉(zhuǎn)為大寫字母。63制作調(diào)查表文件可用EpiData編輯器進行。也可用Word或其它文本編輯器編寫。注意，必須以純文本格式存盤，文件后綴名必須是“.qes”。也可在其它文本編輯器編寫，再粘貼到EpiData編輯器窗口。如何編寫調(diào)查表文件64編寫

17、調(diào)查表文件注意事項（一）編寫過程中及時保存文件，文件類型為編寫過程中及時保存文件，文件類型為.qes.qes文件文件。系統(tǒng)只會根據(jù)系統(tǒng)只會根據(jù)“特殊符號特殊符號”來定義一個輸入字段（包括類型和來定義一個輸入字段（包括類型和長度），并根據(jù)符號前的字符給字段命名。建議在編寫過程中利長度），并根據(jù)符號前的字符給字段命名。建議在編寫過程中利用用“字段快速清單字段快速清單”插入插入“特殊符號特殊符號”，即：選擇字段類型，定，即：選擇字段類型，定義好長度后，按義好長度后，按“插入插入”圖標(biāo)，可避免由于圖標(biāo)，可避免由于“特殊符號特殊符號”輸入錯輸入錯誤而不能產(chǎn)生有效的輸入字段。誤而不能產(chǎn)生有效的輸入字段。調(diào)

18、查表用中文編寫時，可用調(diào)查表用中文編寫時，可用定界符（定界符（“”）將字段名定義為英將字段名定義為英文字符（英文字母或英文字母阿拉伯?dāng)?shù)字），有利于數(shù)據(jù)庫的文字符（英文字母或英文字母阿拉伯?dāng)?shù)字），有利于數(shù)據(jù)庫的管理和其他軟件的統(tǒng)計分析。注意：管理和其他軟件的統(tǒng)計分析。注意：“”必須為半角型，而不能必須為半角型，而不能是全角型是全角型(“ (“”) )。65盡可能把字段定義盡可能把字段定義數(shù)值型數(shù)值型，有利于統(tǒng)計分析。如糖尿病史，有利于統(tǒng)計分析。如糖尿病史“dmhis”dmhis”可定義為數(shù)值型字段，可定義為數(shù)值型字段，“1”1”表示表示“有有”，“0”0”表示表示“無無”。調(diào)查表文件調(diào)查表文件格

19、式盡可能和原調(diào)查表一致格式盡可能和原調(diào)查表一致，有利于直觀錄入數(shù)據(jù)。，有利于直觀錄入數(shù)據(jù)。如果用其他文本編輯器編寫如果用其他文本編輯器編寫.qes.qes文件，在運行文件，在運行EpiDataEpiData后，打開后，打開該該.qes.qes文件即可編輯。文件即可編輯。調(diào)查表文件的編寫是否符合要求，可通過調(diào)查表文件的編寫是否符合要求，可通過“數(shù)據(jù)表預(yù)覽數(shù)據(jù)表預(yù)覽”來查看。來查看。編寫調(diào)查表文件注意事項（二）662.創(chuàng)建數(shù)據(jù)文件Make Data FileMake Data File數(shù)據(jù)文件的產(chǎn)生和修改 主菜單主菜單選擇數(shù)據(jù)導(dǎo)入選擇數(shù)據(jù)導(dǎo)入/ /導(dǎo)出菜單導(dǎo)出菜單“根據(jù)根據(jù)QESQES文件生成文件

20、生成RECREC文件文件”在工作過程工具條按第二個按鈕在工作過程工具條按第二個按鈕“生成生成RECREC文文件件”在編輯器菜單在編輯器菜單RECREC文件菜單文件菜單選擇選擇“生成生成RECREC文件文件”68生成生成RECREC文件文件6970 請大家根據(jù)EPIDATA建立調(diào)查表庫data.qes,生成數(shù)據(jù)庫，保存為data.rec71調(diào)查表調(diào)查表姓名：姓名：_性別：（性別：（1）男）男 （2）女）女身高：身高：_._ CM出生日期：出生日期：_年年_月月_日日數(shù)據(jù)文件結(jié)構(gòu)的修改72調(diào)查表結(jié)構(gòu)重新修改后怎么辦？調(diào)查表結(jié)構(gòu)重新修改后怎么辦？ 數(shù)據(jù)庫建立后，錄入了一部分?jǐn)?shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)漏掉數(shù)據(jù)庫建立后

21、，錄入了一部分?jǐn)?shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)漏掉了一個字段，于是重新修改調(diào)查表，這里可以了一個字段，于是重新修改調(diào)查表，這里可以根據(jù)修改后的根據(jù)修改后的QES文件更新文件更新REC文件。文件。732007年8月3.建立核查文件Add/Revise核對文件的建立 核對文件核對文件：CHECKCHECK文件或文件或 .CHK.CHK文件文件 n 范圍范圍/ /合法值（合法值（Range/LegalRange/Legal）n 跳轉(zhuǎn)（跳轉(zhuǎn)（JumpsJumps）n 必須輸入（必須輸入（MustEnterMustEnter）n 重復(fù)輸入（重復(fù)輸入（RepeatRepeat）7677光標(biāo)懸停，會提示你命令格式78錄入錯誤時，

22、軟件會彈出警告793.建立核查文件必須錄入必須錄入3.建立核查文件必須錄入必須錄入只允許錄入只允許錄入1，2，9或或1 2 9，9表示缺失值表示缺失值1，2，9或或1 2 93.建立核查文件只允許錄入只允許錄入1，2，9或或1 2 9，9表示缺失值表示缺失值正確：正確： 12，9 錯誤：錯誤： 9 ，12如選擇如選擇2（否（否）（不吸（不吸煙），煙），則跳轉(zhuǎn)到則跳轉(zhuǎn)到A11（飲（飲酒）酒）必須錄入必須錄入3.建立核查文件必須錄入必須錄入只允許錄入只允許錄入1，2，9或或1 2 9，9表示缺失值表示缺失值如選擇如選擇2（否（否）（不吸煙），（不吸煙），則跳轉(zhuǎn)到則跳轉(zhuǎn)到A11（飲酒），選（飲酒），

23、選擇擇9，則跳轉(zhuǎn)到，則跳轉(zhuǎn)到A19（調(diào)查員（調(diào)查員姓名）姓名）2A11,9A193.建立核查文件不管選擇什么，錄入完畢后，直接跳轉(zhuǎn)到A19（調(diào)查員姓名）3.建立核查文件3.建立核查文件3.建立核查文件3.建立核查文件3.建立核查文件2007年8月3.建立核查文件4.錄入數(shù)據(jù)OpenEnter Data選擇要錄入的數(shù)據(jù)庫（選擇要錄入的數(shù)據(jù)庫（.REC）4.錄入數(shù)據(jù)變量間轉(zhuǎn)換變量間轉(zhuǎn)換uEnteru、uTab、Shift+TabuCtrl+Home、uCtrl+Endu鼠標(biāo)鼠標(biāo)4.錄入數(shù)據(jù)4.錄入數(shù)據(jù)查找記錄查找記錄Go to record已知記錄號已知記錄號4.錄入數(shù)據(jù)查找記錄查找記錄Find

24、Record 不知道記錄號不知道記錄號 按某種條件查找按某種條件查找4.錄入數(shù)據(jù)查找記錄查找記錄最多可在最多可在10個不同的變個不同的變量上設(shè)置搜量上設(shè)置搜尋條件尋條件4.錄入數(shù)據(jù)查找記錄查找記錄允許設(shè)置的條件允許設(shè)置的條件等于等于小于小于大于大于 不等于不等于 以此結(jié)束以此結(jié)束*abcd以此開始以此開始abcd*包含包含*abcd*4.錄入數(shù)據(jù)查找記錄查找記錄4.錄入數(shù)據(jù)查找記錄查找記錄Find Again以相同的搜以相同的搜索條件繼續(xù)索條件繼續(xù)查找滿足條查找滿足條件的下一條件的下一條記錄記錄4.錄入數(shù)據(jù)查找變量查找變量Find Field4.錄入數(shù)據(jù)關(guān)閉錄入表格關(guān)閉錄入表格Close Fo

25、rm記錄刪除 此處僅是在記錄加上刪除標(biāo)記， 徹底刪除需至“工具”清理REC文件”點擊點擊103雙錄入核對 double entry 為了確保錄入質(zhì)量，可以采用雙人錄入法進行核對。 首先利用工具-復(fù)制REC文件結(jié)構(gòu)，復(fù)制已建立好的數(shù)據(jù)庫（包括CHK文件），另存為一新庫，但已錄入的數(shù)據(jù)不會被復(fù)制。104雙錄入核對 double entry 如需要，可不復(fù)制字符型變量 因為家庭住址、工作單位等很少有人愿意錄入兩次。105兩次錄入的一致性檢驗 雙軌錄入完成后可進行一致檢驗 比較兩次錄入不同的地方 注意選擇兩數(shù)據(jù)庫中的匹配字段用于比較106107108雙錄入實時校驗 先點擊工具-準(zhǔn)備雙錄入實時校驗109

26、雙錄入實時校驗u指定第1 次已錄入的REC文件u創(chuàng)建1新的REC文件，用于雙錄入110雙錄入實時校驗111應(yīng)注意錄入調(diào)查表的順序顯示數(shù)據(jù)112瀏覽數(shù)據(jù)庫其它一些常用功能 打印調(diào)查表（在數(shù)據(jù)錄入窗體下）文件-打印數(shù)據(jù)表113將數(shù)據(jù)庫存檔 工具-創(chuàng)建壓縮文件 可以將指定目錄下所有文件、僅EPIDATA文件或單個文件壓縮、打包和保存。（ZIP） 需要的時候再利用“工具-解壓縮文件”解壓縮114描述數(shù)據(jù)115簡單描述和分析數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)文件的導(dǎo)出和導(dǎo)入 116117數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)出數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)出118轉(zhuǎn)為dbase文件119方法 1 *.REC *.SPSS120121122123數(shù)據(jù)庫的縱向追加與橫向合并 124數(shù)據(jù)庫的縱向追加（頭-尾）一般用于追加記錄，如同學(xué)甲錄了50份，同學(xué)乙錄入了60份，現(xiàn)將兩數(shù)據(jù)庫合并成個庫，共110份記錄。注意選項125數(shù)據(jù)庫的橫向合并 （肩-肩）如一份調(diào)查表包括兩部分，同學(xué)甲錄了Part 1，同學(xué)乙錄入Part 2，現(xiàn)將兩數(shù)據(jù)庫合并成個庫，包含Part 1和Part 2。選擇關(guān)鍵字段用于匹配，一般用記錄號NO作為關(guān)鍵字段，注意需保證