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文檔簡介
1、常用蛋白還原劑1DTT中文名稱為二硫蘇糖醇( Dithiothreitol ,簡稱為 DTT ),是蘇糖醇的 C-1 及 C-4 位羥基 置換成巰基的化合物。 在生化反應(yīng)中用做還原劑, 保護(hù)蛋白質(zhì)或酶中的巰基不致氧化而失活。 也常用于還原蛋白質(zhì)分子中的二硫鍵等。DTT 是一種小分子有機(jī)還原劑,化學(xué)式為C4H10O2S2 。其還原狀態(tài)下為線性分子,被氧化后變?yōu)榘蜴I的六元環(huán)狀結(jié)構(gòu)。二硫蘇糖醇的名字衍生自蘇糖(一種四碳單糖) 。 DTT的異構(gòu)體為二硫赤糖醇(DTE ),即DTT的C3-差向異構(gòu)體。DTT 也常常被用于蛋白質(zhì)中二硫鍵的還原,可用于阻止蛋白質(zhì)中的半胱氨酸之間所形 成的蛋白質(zhì)分子內(nèi)或
2、分子間二硫鍵。但 DTT 往往無法還原包埋于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)內(nèi)部(溶劑不 可及) 的二硫鍵,這類二硫鍵的還原常常需要先將蛋白質(zhì)變性 (高溫加熱或加入變性劑,如 6M 鹽酸胍、 8M 尿素或 1% SDS) 。反之,根據(jù) DTT 存在情況下, 二硫鍵還原速度的不同, 可以判斷其包埋程度的深淺。2. B -巰基乙醇英文名稱: Mercaptoethanol,化學(xué)式:HOCH2CH2SH,分子量:78.13,是一種具有 特殊臭味的無色透明液體,易燃、易溶于水和醇、醚等多種有機(jī)溶劑。3 -巰基乙醇(又稱為2-巰基乙醇、1-硫代乙二醇、2-羥基乙硫醇、3 -硫醇代乙醇)是一 種有機(jī)化合物,其化學(xué)式為HOCH2
3、CH2SH,英文通用縮寫為 ME或3 -ME。它兼具乙二醇(HOCH2CH2OH )和乙二硫醇( HSCH2CH2SH )的官能團(tuán),為揮發(fā)性液體,具有較強(qiáng)烈的 刺激性氣味。 3 -ME 通常用于二硫鍵的還原,可以作為生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中的抗氧化劑。它被廣 泛使用的原因是它的羥基使它能夠溶解于水中, 并且降低它的揮發(fā)性。 由于具有較低的蒸汽 壓,它的難聞的情況比起惡臭的硫醇要好得多。2-巰基乙醇可以打開蛋白質(zhì)中存在的二硫鍵:cysS-Scys+2HOCH2CH2SH宀2cysSH+HOCH2CH2S-SCH2CH2OH ,二硫鍵被打開后可以使蛋白質(zhì)的四級或三級結(jié)構(gòu)被破壞。由于2-巰基乙醇能夠打開蛋白質(zhì)的
4、結(jié)構(gòu),它常常被用于蛋白質(zhì)分析。而 2-巰基乙醇也常常被用于保護(hù)蛋白質(zhì)中自由的半胱氨酸巰基之間不會錯誤形成二硫鍵。作為還原劑, 2-巰基乙醇常??梢耘c二硫蘇糖醇(DTT )或三(2-甲酰乙基)膦鹽酸鹽(TCEP)互換使用。2-巰基乙醇是少數(shù)幾種被發(fā)現(xiàn)可以延長小鼠壽命的化合物。在微克量級水平上,2-巰基乙醇被觀察到對實(shí)驗(yàn)鼠的生命具有多種可能的正面效應(yīng)。3. TCEP化學(xué)名稱:三(2-羧乙基)膦;英文名稱:Tris(2-carboxyethyl)phosphine (TCEP);分子量: 250.19。無色透明液體,不溶于脂肪烴,微溶于水,溶于醇、酮、酯、醚、苯、甲苯、二甲 苯等,能與氯仿及四氯化碳
5、混溶,與醋酸纖維素、硝酸纖維素、醋酸丁酸纖維素、乙基纖維 素、聚氯乙烯、酚醛樹脂、聚丙烯酸酯等高聚物相容性好。TCEP 是一種非常有效的硫醇類還原劑, 廣泛用作蛋白質(zhì)化學(xué)及蛋白質(zhì)組學(xué)研究中二硫 鍵的定量還原劑。 該試劑在水溶液中的穩(wěn)定性和溶解性都很好。 在酸性、 堿性溶液中的穩(wěn)定 性也不錯。與其他類別的硫醇類還原劑如 DTT 相比, TCEP 不僅是一種高效的二硫鍵還原 劑,而且在某些巰基的交聯(lián)反應(yīng)中不需要除掉。 因而在蛋白質(zhì)化學(xué)及蛋白質(zhì)組學(xué)研究常常優(yōu) 先選擇 TCEP。TCEP 在很寬的 PH 值范圍內(nèi)都可以選擇性定量地還原哪怕水溶性很差的烷基類二硫化 合物。通常室溫下反應(yīng)不到 5 分鐘就可
6、以完成。 TCEP 沒有難聞的氣味,而且在空氣中不怕 氧化。補(bǔ)充:DTT , beta-巰基乙醇,TCEP等是巰基類還原劑。還原劑可以保護(hù)蛋白質(zhì)上自 由的巰基不被氧化, 從而避免蛋白質(zhì)的聚集或變性。 在結(jié)晶實(shí)驗(yàn)中, 一般使用的還原劑工作 濃度是 110 mM 。beta-巰基乙醇是上述三種還原劑中還原能力最差的一個,因?yàn)樗旧碇挥幸粋€巰基。它的效果一般只能維持 2 3天。因此,在實(shí)驗(yàn)中要每隔 2-3天補(bǔ)加一次beta毓基乙醇來維 持它的作用。由于 beta-巰基乙醇是揮發(fā)性的,因此,可以在池液中加入beta毓基乙醇,禾U用它的揮發(fā)擴(kuò)散到液滴中去。二硫蘇糖醇DTT有兩個巰基基團(tuán),其作用能維持 3
7、 7天。DTT的揮發(fā)性不像beta-巰 基乙醇那么強(qiáng), 所以使用時應(yīng)該直接加入到懸滴中去。 DTT 還可以通過微透析的方法加入。TCEP的還原能力比beta-巰基乙醇和DTT都強(qiáng),它的作用可以維持 2 3周。TCEP能 使結(jié)晶用的緩沖液酸化。與 DTT 類似, TCEP 需要直接加入到懸滴中,因此可以考慮微透 析法。beta-巰基乙醇,DTT,和TECP的作用機(jī)制可能不同。像其他添加劑一樣,如果你發(fā)現(xiàn) 一類物質(zhì)對樣品的穩(wěn)定性和結(jié)晶有禾,則可以去篩選這一類物質(zhì)中最適合你的樣品的一種。 我們建議是,最好這三種還原劑都嘗試一下,去發(fā)現(xiàn)最適合的。還原劑可以與金屬離子結(jié)合, 金屬離子其被還原, 而還原劑
8、的作用被抑制。 這就使得用 重金屬原子作同晶置換法遇到了麻煩??梢允褂?EDTA 來避免還原劑被金屬離子抑制。但 是,如果金屬離子是你的樣品蛋白維持活性所必須的,就要小心使用EDTA 了。堿性條件下,beta-巰基乙醇和TECP更穩(wěn)定,效果要好于 DTT。酸性條件下,TCEP的 穩(wěn)定性也要好過 DTT。DTT可以使Ni被還原,因此在用 Ni柱純化His標(biāo)簽的蛋白時要避免使用 DTT,而應(yīng) 該考慮beta-巰基乙醇和TECP。半胱氨酸也是一種還原劑。 在結(jié)晶實(shí)驗(yàn)中, 半胱氨酸局限性很明顯, 那是由于它容易形 成六角形的晶體。但是, 半胱氨酸是一種有效的添加劑, 能帶來明顯的效果,不過需要銘記 它
9、的局限性。如果預(yù)期到蛋白會被氧化, 從制備樣品開始就要加入還原劑, 并且在整個流程中要不斷 補(bǔ)加保證其效果。在懸滴法中, 可以在池液里加入還原劑,禾用還原劑的揮發(fā)擴(kuò)散,保證懸 滴中還原性的環(huán)境。在確定還原劑和樣品比例時, 需要考慮樣品上自由巰基的數(shù)目和樣品濃度。 自由巰基數(shù) 目越多,樣品濃度越高,還原劑的用量就越大。含砷化合物與還原劑不能共用。 二甲胂和 二甲胂酸鈉是結(jié)晶中常使用的含砷化合物, 它們不能與還原劑共同使用。 其他不能與還原劑一起使用的物質(zhì)還包括: 硝酸銨,過氧化氫, 高氯酸鉀, 硝酸鈉。 在使用某種物質(zhì)之前, 應(yīng)該先查閱 Material Safety Data Sheet (M
10、SDS) 。 4.SDSSDS 是一種陰離子去污劑,它能破壞蛋白質(zhì)分子之間以及其它物質(zhì)分子之間的非共價 鍵。在強(qiáng)還原劑如巰基乙醇或二硫蘇糖醇的存在下,蛋白質(zhì)分子內(nèi)的二硫鍵被打開并解聚成多肽鏈。解聚后的蛋白質(zhì)分子與SDS充分結(jié)合形成帶負(fù)電荷的蛋白質(zhì) -SDS復(fù)合物,復(fù)合物所帶的負(fù)電荷大大超過了蛋白質(zhì)分子原有的電荷量,這就消除了不同蛋白質(zhì)分子之間原有的 電荷差異,蛋白質(zhì) -SDS 復(fù)合物在溶液中的形狀像一個長橢圓棒。 SDS-PAGE 不僅可以分離 鑒定蛋白質(zhì),而且可以根據(jù)遷移率大小測定蛋白質(zhì)亞基的分子量。DTT 和巰基乙醇相比,作用相似,但 DTT 的刺激性氣味要小很多,毒性也比巰基乙醇 低很多
11、。而且 DTT 比巰基乙醇的濃度低 7 倍時,兩者效果相近。但 DTT 價格略高一些。 DTT 有兩個巰基集團(tuán),巰基乙醇只有一個巰基集團(tuán)。常用蛋白變性劑鹽酸胍和尿素尿素和鹽酸胍在高濃度 (48 mol/L) 水溶液時能斷裂氫鍵, 從而使蛋白質(zhì)發(fā)生不同程度的 變性。 同事,還可以通過增大疏水基酸性殘基在水相中的溶解度, 降低疏水相互作用。 在室 溫下 46 mol/L 尿素和 34 mol/L 鹽酸胍,可使球狀蛋白質(zhì)從天然狀態(tài)轉(zhuǎn)變至變性狀態(tài)的中 點(diǎn),通常增加變性劑濃度可提高變性程度,通常 8 mol/L 尿素的變性能力強(qiáng)。一些球狀蛋白 質(zhì),甚至在 8 mol/L 尿素溶液中也不能完全變性,然而在
12、 8 mol/L 鹽酸胍溶液中,他們一般 以無規(guī)則卷曲 (完全變性 ) 構(gòu)象狀態(tài)存在。尿素和鹽酸胍引起的變性包括兩種機(jī)制:1、變性蛋白質(zhì)能與尿素和鹽酸胍優(yōu)先結(jié)合,形成變性蛋白質(zhì)-變性齊愎合物,當(dāng)復(fù)合物被除去,從而引起Nt D反應(yīng)平衡向右移動。隨著變性劑濃度的著呢國家, 天然狀態(tài)的蛋白質(zhì)不斷轉(zhuǎn)變?yōu)閺?fù)合物, 最終導(dǎo)致蛋白質(zhì)完全變性。 然而, 由于變性齊與變性蛋白的結(jié)合是非常弱的。 因此, 只有高濃度的變性齊才能引起蛋白 質(zhì)完全變性; 2、尿素與鹽酸胍對誰說氨基酸殘基的增溶作用。因?yàn)槟蛩睾望}酸胍都具有形 成氫鍵的能力, 當(dāng)他們在高濃度時, 可以破壞水的氫鍵結(jié)構(gòu), 結(jié)果尿素和鹽酸胍就成為非極 性殘基的較
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