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文檔簡(jiǎn)介

1、SDS-PAGE一. 實(shí)驗(yàn)原理SDS 是一種陰離子表面活性劑,在蛋白質(zhì)溶液里加入 SDS 和巰基乙醇后,巰基乙醇能使蛋白 質(zhì)分子中的二硫鍵還原, SDS 能使蛋白質(zhì)的氫鍵、疏水鍵打開(kāi)并結(jié)合到蛋白質(zhì)分子上,形成蛋白 質(zhì)-SDS 復(fù)合物。在一定條件下,SDS 與大多數(shù)蛋白質(zhì)的結(jié)合比例為 1.4:1。由于十二烷基磺酸根 帶負(fù)電,使各種蛋白質(zhì)的 SDS-復(fù)合物都帶上相同密度的負(fù)電荷,它的量大大超過(guò)了蛋白質(zhì)原有的 電荷量,因而掩蓋了不同種類(lèi)蛋白質(zhì)間原有的電荷差別。SDS 與蛋白質(zhì)結(jié)合后,還引起了蛋白質(zhì)構(gòu)象的改變。蛋白質(zhì)-SDS 復(fù)合物的流體力學(xué)和光學(xué)性質(zhì)表明,它們?cè)谒芤褐械男螤?,近似于?茄煙形的長(zhǎng)橢

2、圓棒,不同蛋白質(zhì)的 SDS 復(fù)合物的短軸長(zhǎng)度都一樣,約為 1.8nm ,而長(zhǎng)軸則隨蛋白 質(zhì)的 Mr 成正比的變化?;谏鲜鲈?,蛋白質(zhì) -SDS 復(fù)合物在凝膠電泳中的遷移率,不再受蛋白 質(zhì)原有電荷和形狀的影響,而只與橢圓棒的長(zhǎng)度有關(guān), 也就是蛋白質(zhì) Mr 的函數(shù)。二. 試劑器材30%凝膠貯液(100mL):稱(chēng)取試劑Acr 29.2g和Bis 0.8g置于100mL燒杯中, 向燒杯中加入約60mL雙蒸 水,充分?jǐn)嚢枞芙夂蠹与p蒸水定容至 100mL,置于棕色瓶?jī)?nèi) 4C貯存,每過(guò) 1-2 個(gè)月應(yīng)重新配制;注意:丙稀酰胺具有很強(qiáng)的神經(jīng)毒性,并可通過(guò)皮膚吸收, 其作用有積累性,配制時(shí)應(yīng)戴手套和口罩等。分

3、離膠緩沖液(1.5 mol/L Tris-HCI,pH 8.8,100mL):稱(chēng)取 Tris 18.2g 溶于約 80mL 雙蒸水,用 6mol/L 的HCI 調(diào)整 pH 值至 8.8,加雙蒸水定容到 100mL,4C貯存;堆積膠緩沖液(0.5 M Tris-HCl,pH 6.8,100mL):稱(chēng)取 Tris 6.00 容于約 80mL 雙蒸水,用 1mol/L 的HCl 調(diào)整 pH 值至 6.8,加雙蒸水定容到 100mL,4C貯存;電泳緩沖液(1L):稱(chēng)取試劑 Tris 3.03g 和甘氨酸 14.40 置于 500mL 燒杯中, 向燒杯中加入約 400mL 雙蒸 水充分溶解,再加入 10

4、%SDS 溶液 1.0mL,以雙蒸水定容至 1L 伯然 pH 值為 8.3,無(wú)需再調(diào)),4C貯 存,可重復(fù)使用 5-6 次;2 勸卩樣緩沖液(10mL):取下列試劑置于 10mL 塑料離心管中0.5mol/L Tris-HCl 緩沖液(pH6.8)2.0mL10%SDS 溶 液4.0mL甘油2.0mL巰基乙醇2.0mL分離膠緩沖液(mL)10.0溴酚藍(lán)0.02g混勻后 1mL 分裝,-70C可貯存 6 個(gè)月;10%AP:稱(chēng)?。∟H4)2SO31.0 g,溶于 10.0mL 雙蒸水中,分裝成每份 1mL, -20C貯存;TEMED :分裝成每份 1mL,4C避光貯存;水飽和正丁醇 (100mL)

5、:在玻璃瓶中加入 50mL 雙蒸水和 50mL 正丁醇, 振搖。 上層相即水飽和正丁 醇,室溫下可長(zhǎng)期保存。染色液(100mL):稱(chēng)取考馬斯亮藍(lán) R-250 0.25g 加入雙蒸水 40.0mL、甲醇 50.0mL 和乙酸 10.0mL,攪拌溶解后濾紙過(guò)濾除去不溶顆粒;脫色液(1L):分別取甲醇 50mL 和乙酸 75mL,加雙蒸水 875mL 稀釋。其他器材:容量瓶(1L、100ml、10ml)、燒杯、離心管(15ml、1.5ml)、移液器、移液器吸頭、干燥器、渦旋振蕩器和廢液缸等。分離膠配方(100mL,4 塊膠)貯液分離膠中丙烯酰胺的終濃度(%)8.09.010.011.012.013.

6、014.015.016.017.018.0凝膠貯液(mL)26.6730.0033.3336.6740.0043.3346.6750.0053.3356.6760.00分離膠緩沖液(mL)25雙蒸水(mL)46.5343.2039.8736.5333.2029.8726.5323.2019.8716.5313.2010%SDS (mL)1.010%AP (mL)0.75TEMED (mL)0.05 (抽氣后添加)堆積膠配方(40mL,4 塊膠)堆積膠中丙烯酰胺的終濃度()貯液3.04.05.0凝膠貯液(mL)4.005.366.66將凝膠浸泡在染色液中,置于搖床上染色4hr,染色液可回收重復(fù)利

7、用雙蒸水(mL)25.3624.0022.7010%SDS(mL)0.410%AP(mL)0.2TEMED(mL)0.04 (抽氣后添加)三操作步驟樣品處理:在密封的螺蓋微量離心管中, 用 2X加樣緩沖液按 1:1 稀釋蛋白質(zhì)樣品溶液, 于 100C煮沸 3- 5min,分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)品也經(jīng)上述處理。凝膠制備:將玻璃板用蒸餾水清洗干凈,再用 75%的酒精去脂,干燥后固定在灌膠支架上;配制 12%的分離膠,加入 TEMED 前抽真空 10min 以除去丙烯酰胺溶液中的空氣;加入TEMED 后輕輕振蕩混勻,迅速注入安裝好的玻璃板的間隙中,給堆積膠留出約1cm 的空間。在丙烯酰胺溶液上覆蓋一層水飽和的

8、正丁醇,以防止空氣擴(kuò)散到凝膠中抑制聚合作用,并保證凝膠 表面水平;在室溫條件下,凝膠應(yīng)在 30min-50min 內(nèi)聚合完成。凝膠聚合后凝膠和上層液相之間 可見(jiàn)折射率的變化;倒掉覆蓋層并用蒸餾水清洗凝膠頂部數(shù)次,并用濾紙條吸凈殘留的蒸餾水,注意勿破壞凝膠 表面;制備堆積膠并迅速注入分離膠上,立即插入干凈的梳子,不要混入氣泡,以一定的角度將 梳子插入堆積膠能減少氣泡的產(chǎn)生。堆積膠聚合后小心移去梳子,避免破壞加樣孔,用蒸餾水小 心清洗加樣孔,以除去未聚合的丙烯酰胺。加樣:將凝膠固定在電泳裝置上,電泳上槽內(nèi)加入電泳緩沖液沒(méi)過(guò)加樣孔,并檢查有無(wú)滲漏。傾斜整個(gè)裝置以趕走凝膠下面可能留有的氣泡;按預(yù)定順序

9、加樣,每孔加入20 L,在對(duì)照孔中加入分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)品 6-7 L,如有空置的加樣孔,加入等體積的 1X加樣緩沖液。電泳:將電泳裝置與電源相連,正極接下槽、負(fù)極接上槽進(jìn)行電泳,樣品在堆積膠階段電壓為80V,而在分離膠階段電壓調(diào)整為 120V。直到溴酚藍(lán)到達(dá)分離膠的底部后,關(guān)閉電源,斷開(kāi)電 極。從電泳裝置上卸下玻璃板,用小鏟子剝下凝膠后切除一角以標(biāo)注凝膠方位。染色:脫色:染色結(jié)束后,將凝膠浸泡在脫色液中,置于搖床上脫色過(guò)夜,其間更換脫色液3 次.記錄:將顯示蛋白條帶的凝膠用凝膠成像儀拍照,記錄試驗(yàn)結(jié)果,并根據(jù)分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)品計(jì)算目標(biāo) 蛋白的分子量。四.注意事項(xiàng):SDS 與蛋白質(zhì)的結(jié)合按質(zhì)量成比例,蛋白質(zhì)含量不可以超標(biāo),否則SDS 結(jié)合量不足。用 SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳法測(cè)定蛋白質(zhì)相對(duì)分子量時(shí),必須同時(shí)作標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn),并且SDS-PAGE 測(cè)定分子量有 10%誤差。有些蛋白質(zhì)由亞基(如血紅蛋白)或兩條以上肽鏈(a-胰凝乳蛋白酶)組成的,它們?cè)趲€基乙醇和SDS 的作用下解離成亞基或多條單肽鏈。因此,對(duì)于這一類(lèi)蛋白質(zhì), SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳法 測(cè)定的只是它們的

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